3FFKB

Crystal structure of human gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
365
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords plasma gelsolin
publication title Ca2+ binding by domain 2 plays a critical role in the activation and stabilization of gelsolin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 112
structure length 365
sequence length 366
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ffkB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ffkB04
1GLAG 3WXJA 3S41A 4CD3A 4BG8A 3CI5A 4BVPA 5AQVA 1V4TA 4FOIA 1BUPA 4BRIA 2E2PA 2IVPA 2QWRA 4A61A 1Z6RA 1SZ2A 3AARA 3O4WA 3O8MA 4BRDA 4BC2A 2A42A 5AZIB 1MWMA 3CJ9A 1T44A 4FL9A 1HPMA 4FWPA 3QFPA 3L6QA 3O08A 4JAXA 4EFHA 1GLJO 3UKUA 2P9LB 4BRAA 5AQKA 1ATNA 1DKGD 3LDOA 2PAVA 4CZIA 3C7NB 4CD1A 2Q0UA 5EVZA 4M7XA 3ATUA 3SMPA 1BA0A 2W41A 1XQSC 2HF3A 4CZJA 1D4XA 4B1VA 2WUSA 1WOQA 3DAWA 1YXQA 1MA9B 2HMPA 3A5NC 3R6MA 4PKHA 2HOEA 5FPMA 3L4IA 4BROA 1E4FT 2P9IB 2Q36A 3GBTA 4H5RA 3U4LA 3BF1A 3DJCA 1XC3A 4IWVA 3FGUA 1XUPO 4MO5A 5AQHA 3LM9A 4XH5A 5AQGA 3QDKA 4H0PA 2QWQA 2CGLA 5LJVA 1EQYA 1WUAA 2UYTA 3W3DA 2D1KA 3VEOA 4I6MB 1NM1A 4IJAA 5AQLA 2VCPA 3M1FA 3H46O 1IJJA 5B8HA 1S22A 1U2VB 4MO4A 3JXUA 3WEEB 2P9NB 2QWPA 2P9UB 2E20A 3DXKB 4BRMA 4RCHA 4PKGA 3VEVA 4FOEA 4EIAA 2A40A 3VENA 1X9JA 4CZLA 2P9KA 4CZFA 3M6GA 2Q1NA 4J8FA 1NGFA 3VGLA 4H0VB 4IXCA 3ZX2A 4BGAA 2ZGYA 2PBDA 2AA4A 4O5FA 1HJOA 4PL8A 3O80A 5AQNA 4JD2A 3AY9A 1MWKA 4FWKA 3WXIA 1QQOA 4FPBA 4B1ZA 1MDUB 4FWOA 5ADXH 3CJBA 1NLVA 1ATSA 4B1YB 2KHOA 4K41A 5CE3A 3CJ1A 1S3XA 4ISEA 4NB4A 4H0XB 2GEMA 3FZLA 2QWLA 4K25A 4KBOA 3ZX3A 5JMVA 2ITMA 3H3OB 1HKCA 4H0YB 3VF6A 3MN7A 3VESA 3MN6A 2YJEA 2A41A 2A5XA 2HF4A 5AR0A 3ATVA 3TPQA 1LCUA 4BG9A 4CBUA 2FF6A 2A6AA 3IMXA 4B1XB 3HZ6A 4CI6A 1BG3A 1TUUA 3D2FB 3C0BA 2OANA 5LY3A 5AQSA 3I8BA 4DB3A 5AZIA 4O8KA 2GELA 1QZ5A 1NGDA 2FSNA 1BU6O 3SLCA 4WQ4C 4FWLA 2IVOA 3W0LA 3ENOA 4A2AA 2E2NA 1SQKA 3ZETB 4YDUA 5AQUA 2P9LA 3VPZA 4H0TB 3SMSA 5ADXA 2A3ZA 3LDPA 5F2RA 3C7NA 5FPDA 2Q2RA 3BP8A 3KVGA 5BN8A 4FWSA 2CGJA 2F9TA 1C0FA 2E88A 3HM8A 5TKYA 3U8XA 4GY2B 2BUPA 5BR9A 3F9MA 4Z94A 1ATRA 1OKJA 2V7YA 1YAGA 1RDWX 3DXMA 2I7PA 2QM1A 1JCGA 4HWIA 1K8KB 2V7ZA 4DCHA 1JCFA 1QHAA 3BUZB 3UKRB 3UB5A 3I33A 2GTDA 3EO3A 1NGEA 2FSJA 3O1BA 1GLEG 1DEJA 5AQXA 4H5NA 4DQ8A 4DHYA 4FWRA 4BRFA 5BREA 4BRGA 2QWMA 3A5MC 3CJ7A 3H1VX 2ZGZA 1DGKN 1CZAN 4CBXA 2FSKA 4CZGA 2IIRA 3VGKA 5AQOA 1TUYA 4FWQA 4JHDA 3WEEA 2P9NA 1U6ZA 3UKUB 4BREA 4BVOA 2P9UA 3QB0A 2Q31A 2W40A 1BO5O 2NRHA 5AQIA 5EOYA 3WUHA 3CQXA 1NGGA 3MN5A 2E2OA 3KZBA 3H6EA 1NGIA 4MLEA 3HBTA 3TU5A 5AQTA 3VETA 5AQRA 4BRKA 3CJAA 3AAQA 4IJNA 3DWLA 3FZFA 3M3ZA 4RTFD 1YUWA 1GLFO 1TYQA 2YHYA 3D2EA 5LJWA 5BN9A 4L3QA 3LM2A 5AQMA 3HSCA 1Q18A 4K43A 3CETA 4B1WB 2DPNA 2V51B 1BOTO 4M7YA 3ULEB 5E84A 4B9QA 3R8EA 1ESVA 4GNIA 4PL7A 1KAXA 1ZXOA 3O5BA 2ASOA 3A5OC 3ZEUB 1T6CA 1X3MA 5KPTA 2GWKA 2P9SA 5AQQA 4BRLA 2D4WA 3WXLA 1GLBG 4EAHD 3CHWA 3A5LC 4EHTA 3WXKA 1HUXA 4BQZA 2P9PB 2VWBA 2FF3B 2AP1A 5AQWA 4FO0A 2I7NA 4CJ7A 3VF2A 5AFUH 2E1YA 3GDQA 2CH6A 5I9EB 5AQYA 1JCEA 3WQUA 4BC4A 5KPRA 2BTFA 2P9KB 3FLCO 3ZETA 1HKGA 1H1VA 4A2BA 3HTVA 5AZJB 4H5TA 3IFRA 2YHXA 3MN9A 1HLUA 3FR0A 4H5VA 3QFUA 2Q97A 3MMVA 1KXPA 1IG8A 1ZBSA 3MCPA 3B8AX 3FE1A 5EXWA 3R9PA 4E1JA 2H3GX 1G99A 1ZC6A 4JNEA 3L0QA 4IO8A 4C23A 4CBWA 1Y64A 3GG4A 5ELZA 1J6ZA 4A62A 1BA1A 2V52B 5JICA 3AAPA 3VERA 3GL1A 3D7EO 3MK6A 2YI1A 3RSEB 4WYBA 1QQNA 3BEXA 2CGKA 3ID8A 5AFUA 3FFKB 4XEIA 2ZWHA 1GLLO 1NGCA 2P9IA 2NZTA 1V4SA 3VGMA 4FWMA 1RGIA 4BC3A 5BRHA 5BPMA 4JN4A 3LDNA 5BPLA 4H5WA 3QBWA 3EL2A 3QMLA 4M63C 3A0IX 3G25A 3KHYA 4K42A 4MLHA 2E1ZA 3FZMA 4EHUA 2FLOA 2YJFA 1BWFO 3OHRA 2Q0RA 2QXLA 3CIPA 4FWNA 4WQ5C 4BR4A 4CZMA 4I6MA 2VYPA 4FSVA 4HTLA 2CH5A 5BPNA 1U2VA 1QZ6A 3QBXA 3DXKA 3DXMB 3EKUA 4BR7A 4BRNA 2D0OA 4PKIA 2GUPA 4BR5A 1NWKA 1HX1A 4H0OA 4FPAA 5KQ8A 2FXUA 1GLCG 4H03B 4ISFA 2IVNA 1HKBA 3LDLA 4LC9B 5BRDA 3FZHA 4BC5A 4YDUC 1NGBA 4XH1A 3LDQA 2YCHA 3ULEA 1C0GA 2E8AA 4QS8A 3EZWA 3GE1A 4BR2A 1BDGA 4Y0WA 4BR9A 3ZEUA 2F9WA 3BF3A 3SJHA 5F0XA 3IDHA 3WQTA 4CZKA 4QS9A 4CZEA 1YVNA 3EKSA 4WQ4A 1NGAA 4XH4A 4JHDB 3VEZA 1Z05A 2ZF5O 4F9OA 1T6DA 5KQDA 2P9PA 2QWNA 3O6WA 3U9ZA 2D0PA 5E26A 3H45C 1RFQA 4BRQA 5JLFA 2EWSA 1NGJA 3HI0A 5JLHA 5AQFA 4BRPA 1R59O 5EX5A 3CERA 5AZJA 3VEYA 1P8ZA 5FPEA 3A8YA 3D2FA 4RWTA 4QS7A 1GLDG 2QWOA 1TYQB 2J4RA 3ENHA 4BRHA 1KAYA 5EY4A 3D2EB 5BRFA 2ASMA 3WT0A 4B1UB 4CZHA 2GWJA 3JS6A 3SK3A 3GOIA 3H1QA 2QW9A 3VOVA 3VEWA 4BQLA 4JD2B 3CJCA 3VEXA 3ZX0A 1NMDA 3H3NO 3VF4A 3UE5A 1X3NA 4AM6A 3U9DA 4IZ9A 3CQYA 2P9SB 4BGBA 4WQ5A 5FPNA 3P4IA 1E4GT 3FZKA 1NGHA 2ASPA 3RSEA 1SAZA 5AQZA 5AQPA 3IUCA 1NBWA 5F1XA 2NLXA 1KAZA 4BR0A 3MDQA 2YHWA 3LL3A 4AM7A 4NO7A 2E2QA 1QQMA 1K8KA 3O1WA 4ISGA 4BRCA 3EN9A 1LOTB 5AQJA 5KPZA 3QICA 3J8AA 3UKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3S41A 4CD3A 4BG8A 2PYLA 4I2QA 5AQVA 4BVPA 3G6EN 1NJYA 2IC3A 1V4TA 1KC8O 2QWRA 3D0PA 5FRMA 4J2AA 1SZ2A 3O4QA 1QSYA 3O8MA 4AH9A 4BC2A 3LDSA 2VWJA 3TSQA 1T44A 4DLGA 4FLWA 4FJNA 3AGKA 1OH8A 1XI1A 4EFHA 1GLJO 5AQKA 3LANA 1CZ9A 3AA2A 4NYNA 4CD1A 4IFEA 1FKPA 4JKCA 1JLGA 3ISNC 5CYMA 2E5LK 3P31A 1NKBA 4JI1K 4KAZA 1XQSC 4CZJA 1U45A 4B1VA 4BWMA 2O8FB 4DV2K 1WOQA 1MA9B 2HMPA 4E7KA 3K5LA 4PKHA 4DFMA 4KHYA 4OVLA 4DV1K 2NRRA 5HRNA 3L4IA 3QLHA 3LALA 2YKNA 4CIGA 1RT1A 4H5RA 3V9ZA 1VSMA 2E6MA 3BF1A 3DJCA 3CCLN 3FGUA 1XUPO 2VG6A 4XH5A 3V9XA 1YI2N 2CGLA 4FZXC 3I0SA 4I7FA 1IKVA 1WUAA 1C1CA 2UYTA 3W3DA 4I6MB 4IJAA 5AQLA 4JKAA 4FM0A 4Z4GA 2UXCK 3M1FA 4IOCL 5B8HA 2FC0A 4MO4A 3T7ZA 2P9NB 2XRIA 3E9LA 2P9UB 3C6UA 3NGIA 3L2WA 2E20A 2D0CA 1TK0A 3PX4A 2O8EB 1KRPA 4F3OA 1NNEA 3SUQA 4DTUA 2WOMA 4FOEA 5D3GA 1X9JA 4CZLA 4CZFA 1NJIO 3ZT1A 5AJ3K 4KV8A 4PQUA 3CPWM 3TAFA 1RTHA 5J2PA 4R5PA 4IG3A 1SL2A 1G15A 4DSEA 2KHOA 4K41A 1N36K 1HPZA 1S3XA 4ISEA 4GV3A 4EP5A 5JS1A 4O0JA 3NMUA 4MQ3A 4YOXA 2BE2A 2IS3A 2X74A 5JMVA 2P5OA 4H0YB 4M45A 4LFAK 4DTXA 4IFYA 3NE6A 1OH6A 4WF9L 1LCUA 4CGFA 4CHYA 2G8HA 2A6AA 5I3UA 1L3SA 4H4MA 3OY9A 4A59A 3HZ6A 4CI6A 3AVIA 3D2FB 2HHIA 5M1KA 5AQSA 2E4LA 4DB3A 3IKMA 4GKKK 4O8KA 1QZ5A 3AVNA 3V1QA 4CESA 3W0LA 4A2AA 4U7BA 4B9MA 4FK4A 3ZETB 4PHTX 3E9OA 1RTJA 2P9LA 4H0TB 3SMSA 3DRSA 1JXBA 5F2RA 3ZSXA 5FPDA 1XHXA 2Q2RA 1Q86O 2E88A 1N8RO 3U8XA 1DTTA 4Z94A 1ATRA 1OKJA 2V7YA 1YAGA 1VK0A 4KTWA 1SV5A 4LSLA 2HBMA 2ZD1A 3P39A 1JCGA 1JL1A 3V1OA 3QEXA 3OS0A 1KVCA 3CD6N 3OYMA 4DHYA 1N5YA 3CFOA 3BDPA 3NDKA 3RMBA 3H1VX 2ZGZA 1DGKN 1S5JA 1W97L 2G8UA 1CXQA 2UUAK 4M3RA 4DQQA 4CK3A 1HNZK 5AQOA 1SKSA 3L3UA 1C6VA 1TUYA 4HUGA 3JYTA 4JHDA 2NUBA 3CMEN 4KHUA 4BREA 5DM7L 3OYGA 3K0SA 3HPHA 3DOLA 1BO5O 1RDAA 3OTOK 5AQIA 1KFDA 3CQXA 2E2OA 3CYMA 1VQKN 1J54A 1N33K 3TU5A 4KHSA 3VETA 4BRKA 5AQRA 4N5SA 1ZBLA 2DFFA 3DWLA 3LP3A 1NOYA 2Z1HA 3K9JA 4DV4K 5LJWA 3FFIA 4FVMA 3HSCA 1X9SA 4IOAL 4K43A 4F4KA 4FLTA 2WBNA 1CZBA 1BOTO 5KI6A 4DTNA 4B9QA 4GNIA 4PL7A 4YOTA 4JI0K 3NBPA 4ZTFA 2ASOA 3ZEUB 5KPTA 2P9SA 4PWDA 1HNIA 1L3UA 3AVAA 3AO1A 3L2VA 3PIPL 3HL8A 4PUOA 1GOBA 4DQIA 1WSEA 3ASMA 2W6LA 3L3VA 1OVQA 4WFBL 3WXKA 4E7JA 3V81A 5J1EA 4C8LA 1VRTA 2OCEA 1CXUA 3CM6A 3ZT2A 3J80O 1VQMN 4FO0A 4OPHA 4CGDA 1S1TA 4CJ7A 4FYDA 3I0RA 4M3ZA 1VQ8N 1TVRA 2C1GA 2E1YA 5I9EB 5FRNA 5AQYA 3LWMA 2GBZA 4CJUA 2BANA 4FM2A 4BC4A 5KPRA 3RRGA 4W5RA 1WN7A 3HTVA 3WNEA 4XJXA 3RMDA 3IFRA 2YHXA 3MXMA 3HVRA 1HLUA 3FR0A 4H5VA 1ZYQA 1QHTA 2Q97A 3MMVA 4CF0A 4JV5K 5GIOA 3U3GA 4M3YA 3SPZA 4WCEL 3B8AX 3MEEA 3D6RA 4KI4A 5LMUK 1KLNA 2H3GX 4LF7K 1G99A 2YNHA 3TAQA 1B9FA 1EWRA 3GG4A 3HPGA 3MCAB 4EP4A 4B8AB 1BCMA 3AAPA 3SPYA 2A1RA 3O3HA 4WYBA 1J53A 4KHPK 3K57A 2QA4N 1C0TA 3FFKB 2BDPA 2ZWHA 2OPPA 4DF8A 1GLLO 4M41A 1NGCA 1TV6A 2YV0X 3PIOL 2JWLA 4BC3A 1T05A 5BRHA 2A1SA 3SBTA 3LDNA 3QMLA 1EWQA 4DQSA 3SQ1A 3G25A 3VQ4A 3KHYA 5H1SQ 1J5EK 1QVFM 2FLOA 4CJPA 1SKWA 4CHZA 4FJHA 4DSIA 4BR4A 4DLEA 3RRHA 3VA0A 3E66A 4DV6K 2CH5A 2DY4A 5HLFA 1TK5A 3I55N 3EKUA 3CMAN 2GUPA 3OYCA 3SUOA 1X9MA 2PZSA 1NWKA 5KQ8A 1GLCG 1S1XA 3AVKA 4B3RK 1TKZA 4W5NA 1KTQA 4LC9B 1S9GA 4XH1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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