3FFKB

Crystal structure of human gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
365
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Ca2+ binding by domain 2 plays a critical role in the activation and stabilization of gelsolin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords plasma gelsolin
total genus 112
structure length 365
sequence length 366
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ffkB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ffkB04
1NGAA 4RWTA 3DWLA 1BOTO 1XUPO 3IDHA 4M7YA 5EOYA 4WYBA 5E26A 4M63C 2Q1NA 2FF3B 2P9SB 3VF6A 5KPTA 5LY3A 1NGIA 2A6AA 3KZBA 3O5BA 5AQOA 3ZEUA 4H0VB 4BG8A 3CQXA 3TPQA 4H5NA 4PKHA 3LDQA 2E1ZA 3EZWA 5EXWA 2QWQA 2F9TA 3HI0A 4J8FA 3A8YA 3VEZA 3O8MA 2BTFA 4B1WB 4BRLA 3O6WA 3MDQA 3VERA 4WQ5C 1TUUA 4A2AA 3HTVA 2OANA 1NWKA 3DXMA 3I33A 5AR0A 2CH6A 2GELA 3VF4A 2YJFA 4BG9A 3CJ7A 3UB5A 4CZFA 1YAGA 4BRMA 3HSCA 3L4IA 4EAHD 1BU6O 5EVZA 5BRHA 1LOTB 3BUZB 3WQTA 1KXPA 4XEIA 3CJCA 2Q0RA 4O5FA 2QWLA 3VGKA 3S41A 5AQSA 5AFUA 3H1QA 4BVPA 3RSEA 5AQIA 1C0GA 5BREA 4CBXA 4FWNA 4K42A 4IJNA 4CZJA 4QS9A 2PAVA 2ZWHA 3VEWA 4BC4A 2WUSA 4XH5A 1XQSC 4I6MB 3AY9A 4ISEA 2ZGYA 2A5XA 3H46O 5AQUA 4CI6A 2UYTA 1NGDA 2P9LA 2P9PB 3EN9A 4B9QA 4CZEA 1GLJO 3O08A 1NGJA 5AQHA 1NGCA 3WUHA 1ZXOA 4GNIA 4BC3A 4L3QA 4BREA 3KVGA 5F1XA 5AZJB 3KHYA 3EKUA 4CZGA 1NLVA 4ISFA 2ITMA 2I7PA 3F9MA 1WOQA 2P9SA 4CZMA 2FF6A 5BPLA 4BRHA 1IG8A 4FWSA 3SMPA 4FWKA 2V51B 1S22A 3W3DA 1GLCG 3MN6A 4FL9A 4BC2A 2GEMA 3VEVA 1BUPA 1GLAG 3SK3A 5CE3A 1YXQA 4GY2B 5F0XA 3D2FB 3IMXA 4BRAA 5I9EB 1T6CA 4KBOA 2A40A 3FZHA 3QFPA 4FWPA 5FPDA 1Q18A 1QQMA 3ZETB 2P9UB 4RCHA 2ASPA 3A5LC 3CIPA 3OHRA 5LJWA 4BGBA 3J8AA 3WXLA 5KQ8A 3D2EB 3B8AX 1U2VB 4BGAA 1YVNA 3VEXA 5JICA 2A3ZA 3DXKB 4DB3A 4FSVA 4BQLA 5BRDA 1KAYA 4BRPA 3A0IX 5AQGA 1XC3A 2E2QA 3UKRA 2J4RA 2VWBA 5E84A 4BVOA 3EKSA 3VENA 5ADXA 2YHXA 4K41A 2QWMA 2P9KB 3VPZA 3VF2A 3CJ1A 1MA9B 4DCHA 4CZHA 2ASMA 5LJVA 4Z94A 3H3OB 4DQ8A 2D1KA 1BWFO 1E4FT 1NGHA 2V7ZA 3AARA 1OKJA 3WXKA 2FSNA 3R6MA 4IWVA 1HPMA 2NZTA 4BR2A 2P9IB 4BC5A 4CD3A 3ZX3A 1R59O 3LDPA 3QBXA 4FOIA 5B8HA 1GLBG 3GBTA 5AQYA 3VEOA 4BRIA 4B1XB 3AAQA 1V4SA 4YDUA 3U4LA 2QM1A 3JS6A 4B1UB 1V4TA 4WQ4C 2V52B 4FO0A 1BA0A 2H3GX 4Y0WA 4QS8A 4IZ9A 3LDNA 2QWRA 3GE1A 3G25A 1IJJA 2Q36A 3VESA 1NGFA 4A62A 3DJCA 1HKBA 2E88A 2Q0UA 3D2FA 3ZX0A 4LC9B 3QB0A 1QHAA 4JNEA 4HWIA 5EY4A 1MDUB 1RGIA 1ZBSA 1HX1A 1NGEA 2F9WA 1MWKA 1S3XA 3ZETA 3L6QA 2P9UA 4FWQA 3H45C 4BRFA 4BRDA 3CJ9A 3MN7A 3HM8A 2EWSA 1U2VA 2HOEA 3CETA 1GLEG 2E2NA 3HBTA 1HUXA 1E4GT 4EFHA 4IJAA 3UKUA 3ID8A 1MWMA 4EHTA 4CZLA 4JD2B 3FZLA 3JXUA 3P4IA 4BRNA 1DEJA 5JMVA 1HKCA 3ULEB 3VEYA 4MLEA 1JCFA 2QWPA 2P9KA 3WEEB 1GLLO 1T44A 1ATSA 1GLFO 2KHOA 5KQDA 4CBWA 5AQTA 3MN5A 3FZKA 1TYQB 2QWOA 2P9IA 3ZEUB 3EL2A 1QZ6A 1X3MA 3BP8A 1HLUA 1QQOA 2FXUA 3BEXA 3CHWA 5KPZA 5JLHA 3O80A 4FWOA 4BRCA 4QS7A 1NMDA 3O4WA 4FWRA 3L0QA 3H6EA 5AQJA 3D7EO 3HZ6A 1ATNA 1DKGD 2E1YA 2FLOA 1D4XA 5EX5A 2E8AA 3C7NB 4O8KA 3SJHA 1TUYA 4CZKA 1BDGA 2D0OA 1NM1A 1LCUA 2IVPA 3DXMB 2I7NA 2VCPA 2DPNA 4F9OA 5AQKA 4WQ5A 1X3NA 3GG4A 3WXJA 4FWMA 2YCHA 4EIAA 1K8KB 3IUCA 3GDQA 5AQMA 2IVNA 5AQWA 1ATRA 2BUPA 4ISGA 5AQVA 4BRGA 5KPRA 2ZGZA 3M3ZA 4H5TA 4M7XA 1NGGA 3M6GA 3LM2A 3AAPA 3LDLA 4AM7A 2YHYA 1BA1A 5FPEA 3WXIA 4DHYA 4I6MA 2VYPA 2HMPA 3WT0A 3SMSA 3A5MC 1KAXA 3QDKA 4JD2A 2P9PA 3R9PA 1G99A 4B1ZA 1RDWX 1CZAN 4NO7A 5AZIB 4C23A 2AP1A 2P9NB 4IXCA 4H0YB 3ATUA 3CJBA 1SAZA 1Z05A 5AFUH 3R8EA 2GTDA 2HF4A 4MLHA 3WEEA 5AZJA 5BPMA 3A5OC 4H03B 4H5RA 1DGKN 2YHWA 2YJEA 1C0FA 1GLDG 2GUPA 3QICA 2Q2RA 1TYQA 1Y64A 1SZ2A 1YUWA 4JN4A 5AQPA 4CD1A 2E20A 4H0TB 1NGBA 1X9JA 2HF3A 2FSKA 5FPNA 3VETA 1WUAA 4K43A 2IIRA 4JHDB 2V7YA 2A42A 5FPMA 3ZX2A 4H0XB 3SLCA 5ELZA 5AQZA 3IFRA 4FPAA 4H0OA 5AQRA 3TU5A 2CGLA 3WQUA 3C7NA 2YI1A 5JLFA 3CJAA 3MK6A 4B1YB 4A2BA 4CBUA 1NBWA 1BO5O 5F2RA 2QXLA 3D2EA 3O1BA 1EQYA 1H1VA 1SQKA 4K25A 3DXKA 1BG3A 1T6DA 2W41A 1K8KA 3LM9A 4PKIA 3FE1A 5BN9A 1J6ZA 3C0BA 3QFUA 1KAZA 4A61A 3GOIA 2PBDA 1RFQA 4H0PA 4PL7A 2CGKA 2NRHA 1HJOA 3MN9A 1Z6RA 3UKRB 2GWKA 3UE5A 3U9ZA 4BROA 5AQNA 5TKYA 3VGLA 1U6ZA 4BR5A 4PL8A 4H5WA 4NB4A 3QBWA 1ESVA 4YDUC 2ZF5O 2CGJA 2QW9A 3O1WA 5AZIA 4B1VA 4MO5A 5BPNA 2P9NA 3FZFA 3U8XA 3BF3A 3MMVA 3H3NO 3CI5A 4IO8A 5AQQA 5ADXH 3LL3A 5BN8A 5BR9A 4BRKA 1P8ZA 3ENHA 2E2PA 3CERA 3MCPA 1JCGA 2A41A 1HKGA 4BR4A 3FFKB 4CJ7A 3FLCO 2D4WA 2Q97A 4EHUA 3W0LA 1QZ5A 4FOEA 2FSJA 3A5NC 3CQYA 2ASOA 2Q31A 4JHDA 4JAXA 4WQ4A 4BR9A 3VGMA 2D0PA 3EO3A 3FGUA 4BRQA 4FPBA 1ZC6A 3FZMA 3VOVA 3H1VX 3ENOA 5AQXA 4CZIA 4PKGA 3LDOA 5AQFA 3DAWA 2W40A 3FR0A 4H5VA 2QWNA 3RSEB 4XH1A 3U9DA 3ATVA 4XH4A 1JCEA 1QQNA 4FWLA 3M1FA 2AA4A 2GWJA 2CH5A 4BR0A 3UKUB 4E1JA 3QMLA 4AM6A 5AQLA 4RTFD 3BF1A 5BRFA 2IVOA 2P9LB 4BR7A 4MO4A 3ULEA 3GL1A 4BQZA 4HTLA 3I8BA 2NLXA 2E2OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S1WA 1TKXA 2D0CA 4RWTA 3CCSN 1BL3A 4KH5A 5CYQA 1BOTO 1XUPO 4DSJA 4M7YA 5EOYA 4JKCA 1CZBA 3TAEA 2FF3B 3VF6A 4B9LA 4JK9A 4B9UA 1NGIA 4B3RK 1WAJA 3AVGA 4BG8A 3I0RA 3TPQA 4FJLA 5EXWA 3HI0A 4J8FA 3A8YA 2Y1JA 4DU3A 1Q81O 1W9HA 3NVMA 2G8HA 3MDQA 4WQ5C 4V19S 2X6NA 2ZD1A 3PSIA 1HQEA 2ZM6K 4BDPA 3I33A 5J2MA 3VF4A 3E66A 4GVMA 4OGEA 1CXQA 3WNFA 1P90A 2Z1IA 1KFDA 1KVCA 3CJ7A 3QNNA 3UB5A 2D0BA 3L2UA 1BU6O 4CFCA 3WQTA 1FJGK 2Q0RA 4O5FA 3VGKA 1ZYQA 1L3VA 1QSSA 4BDZA 1EWRA 3SYZA 1T7PA 1TV6A 4CJ5A 2BANA 4CZJA 1IO2A 5GAGP 3G4SN 3VEWA 4XH5A 1XQSC 3ZT1A 3AY9A 3J7YP 3H46O 3V81A 4K8ZA 2UYTA 4KO0A 3KK2A 3CFRA 1VQ8N 4ILGB 4B9QA 3CG7A 2E5LK 4TSXA 4CJEA 4NLBA 4B9TA 1NGJA 1JL1A 1ZXOA 1RBRA 3AVAA 3HPHA 4B3SK 4NCAA 1OH5A 5AZJB 3CCMN 4ILHA 3F5TA 2I7PA 1I94K 1WOQA 3HSTB 4CZMA 2OA8A 2FF6A 2YKNA 2QKBA 4BRHA 3AO3A 3SMPA 4DR5K 1YTUA 1S22A 2YNFA 1GLCG 1FKOA 4B9VA 4BC2A 2B4JA 4A5BA 1FXXA 5CE3A 5F0XA 3SBGA 3VQBA 3IMXA 1NK7A 3SQ0A 5I9EB 4KBOA 2A40A 4FWPA 5FPDA 2XHBA 3P38A 4BY9C 2P9UB 5HRNA 4FW1A 2UUBK 3THXB 1QTMA 2P1JA 5LJWA 3LP2A 3WXLA 3D2EB 1U2VB 4IBNA 4BGAA 4E1MA 4KB0A 3VEXA 5JICA 5JVGL 1RT3A 1WSEA 4FLXA 4DB3A 4DWIA 3VN5A 1EWQA 4YFUA 4KREA 1RBUA 5E84A 3ZYYX 3NH2A 5ADXA 4K41A 2P9KB 3DLRA 4CGGA 1RBTA 3H3OB 5HROA 1C0UA 1RTIA 1G15A 4ICLA 3AARA 1OKJA 3CF5L 1NK5A 4X62K 4DTPA 1HPMA 2NZTA 4BR2A 2AJQA 4CD3A 3BDPA 2ETJA 3ZX3A 4GVEA 4JKAA 5B8HA 3VEOA 3RRHA 4N41A 4YDUA 4FJHA 5LMUK 3SNNA 2ZJPL 4FJGA 5KGXA 4OKEA 2HHQA 4JRPA 2JWLA 1DLOA 2QWRA 3TABA 3GE1A 2WC9A 4CJFA 3SUNA 1YTAA 1HPZA 3VESA 4A62A 3MX2A 3DJCA 1HKBA 2NRTA 2Q0UA 3D2FA 3ZX0A 3LZIA 4HWIA 5EY4A 5HRPA 2XRIA 2OTJN 4LF7K 3L6QA 3F2KA 1ITGA 4CJUA 2OCEA 3KJVA 4YOXA 1YJ9N 3CJ9A 4DR6K 3TAQA 2EWSA 1GLEG 2E2NA 3CETA 1VQPN 3HL8A 4X64K 4BDYA 4CEOA 1D8YA 4KI6A 3JXUA 3MXMA 4BRNA 4CE9A 5J2PA 3ULEB 4F8RA 1Z25A 4MLEA 2ITGA 3NHGA 1O13A 1HNVA 3OBWA 4DFJA 1JLCA 4CEQA 1GLLO 1RT1A 1ATSA 3TSUA 4F3TA 3SUPA 1YHQN 1TYQB 4CJTA 2P9IA 5GAEP 1XMOK 3ENBA 1QQOA 2FXUA 4JLHA 5KPZA 5JLHA 4FWOA 4FK0A 3VA3A 1Q7YO 4CF0A 4HCBA 4J2EA 1BISA 3CCRN 3D7EO 3KLEA 4FLVA 5KI6A 2EX3A 1WSIA 2E8AA 3C7NB 4O8KA 4XIUA 3SV4A 1U4BA 5C42A 1BDGA 1CZ9A 1LCUA 2IVPA 2I7NA 3PX4A 2DPNA 4J2AA 4WQ5A 2FBXA 1X3NA 4FWMA 1RT4A 3GDQA 4E7HA 5AQMA 3LWLA 1VSJA 4CEAA 3C95A 4CIGA 3PY8A 5AQVA 4PY5A 3M3ZA 4LD0A 4H5TA 3P1GA 2NUBA 3LM2A 1RBSA 2IOCA 3AAPA 3K9KA 4AM7A 4CJ3A 4F2SA 3SUOA 4DUYK 5HBMA 3SJJA 1KAXA 4C8NA 2KLAA 2RKIA 4C23A 3QERA 3CXCM 3MAQA 4N56A 3CJBA 5FRMA 2YNHA 4MLHA 1KCFA 1DT9A 4H5RA 4CJ4A 3OY9A 2RPIA 3ID6A 1TAUA 1SZ2A 2KFZA 3NGZA 3O3FA 2E20A 4H0TB 3LANA 1LAVA 1U49A 3QEWA 2HF3A 4DMNA 2ZE2A 1K9MO 4CJKA 1WUAA 1JLGA 3VTHA 3LPTA 2V7YA 3CD6N 2PYJA 2KKZA 3ZX2A 4H0XB 1I3AA 3SLCA 3HP9A 4DR3K 1B9DA 3DOLA 3IFRA 3IKMA 4H0OA 3D0PA 4NCBA 5AQRA 4DTOA 3CCLN 3CJAA 4CFDA 3MK6A 4B1YB 4LFCK 1NBWA 1BO5O 4DU4A 3PV8A 3O3HA 5BR8K 4K25A 4JI0K 1O1WA 3FE1A 2Y1IA 3C0BA 3QFUA 1KAZA 4A61A 1MU2A 3GOIA 5C12A 1SKSA 2PBDA 4DTUA 5M1NA 1W0HA 3DI6A 4DFKA 4W5NA 3PO5A 3TARA 2O4IA 1S9GA 4JKGB 3ZSWA 2G8FA 3DLHA 4KHNA 3AA2A 4BROA 5KRTA 1Q9YA 1VSLA 4DV0K 4BE0A 4OO1J 4YOUA 2WOMA 3R1XA 1JJ2M 2QW9A 1Q9XA 5EU7A 3HRGA 4O44A 5AZIA 3ULDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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