3FFKB

Crystal structure of human gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
365
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ca2+ binding by domain 2 plays a critical role in the activation and stabilization of gelsolin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords plasma gelsolin
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 112
structure length 365
sequence length 366
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ffkB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ffkB04
3IMXA 1YXQA 1HLUA 1D4XA 1NGDA 4Y0WA 4K43A 3UKUA 1Q18A 3EZWA 2QXLA 2A6AA 4CZGA 3RSEA 2GEMA 3SLCA 1NGAA 4FWRA 3MK6A 4XH4A 3UKUB 1HKGA 1HPMA 4H0TB 3R8EA 2QWLA 2P9IA 1RGIA 4ISFA 3RSEB 3A0IX 4CZJA 2WUSA 1NLVA 3U4LA 5AQQA 4BG9A 2UYTA 3VEXA 2P9IB 2Q0UA 3QDKA 2Q36A 5EVZA 1OKJA 2FSKA 2QW9A 3DJCA 4CZFA 3CQXA 2P9LA 4RWTA 4MO4A 3QFUA 4FO0A 1NGBA 3O8MA 1NGEA 4BG8A 3DWLA 1JCFA 3VF4A 5I9EB 4FWLA 2P9LB 1BUPA 4BROA 1BG3A 1WOQA 1R59O 4B9QA 5ADXA 1V4TA 2PAVA 3J8AA 3HSCA 4B1YB 4F9OA 1V4SA 5AQNA 1XQSC 2GWKA 1QQOA 1NGIA 2QWQA 3L0QA 4BC3A 1XC3A 4BGAA 4EAHD 2V52B 3L4IA 2F9WA 4FWQA 4O8KA 2V51B 3AAPA 3M3ZA 4DCHA 5BREA 2YJEA 2P9PA 4BR2A 2CGKA 4FSVA 2V7ZA 4JAXA 5JMVA 4GY2B 4FPAA 5F1XA 2ZGYA 3VEYA 4ISGA 4BQLA 4FWPA 1HUXA 2P9PB 3MCPA 2FSNA 4BC5A 5LJWA 2QWRA 2VCPA 5AQFA 2ASPA 1E4GT 5AFUH 3ATVA 4CJ7A 1TUYA 1K8KA 1HX1A 5AQGA 3FZLA 2ZGZA 4FOEA 5BPLA 1NGGA 4RCHA 2CH6A 1K8KB 3QMLA 1GLJO 3OHRA 3HI0A 2E1YA 3HZ6A 4IZ9A 5EOYA 1T6DA 1DEJA 3GDQA 3H45C 3UE5A 5AQZA 3A5MC 1KXPA 3MN5A 3VF2A 3CJ9A 3MN7A 3HBTA 3LDQA 1ATSA 3BUZB 1T44A 3CQYA 2VWBA 4FWOA 3JXUA 2IVPA 2QWNA 1NGJA 3QB0A 4K42A 4PKHA 3VF6A 3U9DA 4QS9A 4XH5A 1ZBSA 1NGHA 2P9UA 1C0FA 3R9PA 5AQHA 5ELZA 3SMPA 3KHYA 1E4FT 2QWOA 3D7EO 1NGFA 2P9UB 3CJ7A 3TPQA 4BC4A 2Q31A 1ZXOA 3GBTA 3LL3A 4CZLA 3M1FA 1MDUB 3FFKB 4H5RA 3U9ZA 1S22A 3R6MA 5AQWA 5BRFA 1GLDG 3GE1A 4BC2A 4MLEA 2OANA 3BP8A 3F9MA 4WQ5A 4B1UB 4H03B 5F0XA 4A62A 4H0VB 1QZ6A 3FGUA 1YVNA 4CD3A 4IWVA 5AQOA 4DB3A 4BRNA 4YDUA 5BN9A 4BRAA 4FWKA 1TUUA 3O1WA 4BRCA 5LJVA 4B1XB 1BU6O 3MN6A 1BWFO 1NGCA 3ZETB 3P4IA 3KZBA 1XUPO 4IO8A 3DXKB 4M63C 2E20A 1J6ZA 4BRKA 4H0YB 1SQKA 2E2QA 4BVOA 5AZJA 3A5LC 5BPNA 3MDQA 2I7PA 5AQMA 1LCUA 3FR0A 3O5BA 3IDHA 5AZJB 4BR0A 5KPTA 2EWSA 4PKGA 3H3NO 3EO3A 1JCGA 3LDPA 3QBWA 2J4RA 3CERA 3BEXA 3D2FA 5KPRA 2NZTA 2YCHA 2NRHA 4KBOA 1NBWA 3M6GA 3ULEB 4BR5A 5AFUA 4A2BA 1DKGD 3D2FB 4BR9A 4JD2A 3H1QA 3WUHA 4PL7A 3CETA 5KQ8A 4BGBA 4BRFA 1H1VA 4JD2B 2A3ZA 2NLXA 5AQTA 1MWMA 2E2PA 4Z94A 2QWMA 1QZ5A 1YAGA 2AP1A 3I8BA 4AM6A 1RFQA 2Q97A 4WQ4A 4CBXA 2F9TA 4H0XB 5KQDA 5AQYA 2FXUA 4H0PA 1BO5O 3ID8A 3VETA 4BQZA 3W3DA 2QM1A 2V7YA 1HKBA 2HF3A 4B1VA 3O1BA 5CE3A 2E2NA 3QBXA 3IFRA 4JN4A 4WQ5C 2YJFA 4FWNA 4H5VA 5EX5A 3QICA 4XH1A 3LDOA 4FPBA 1MWKA 1BDGA 4YDUC 2IVNA 3S41A 3VGLA 5F2RA 2E2OA 2P9SA 4CZMA 4H5WA 5JLHA 2A40A 3MN9A 2YHYA 2P9SB 3GG4A 5TKYA 1KAXA 3KVGA 5E84A 3WXKA 1ATNA 3CI5A 5AQXA 3WXIA 4B1WB 3SMSA 2IIRA 2P9KA 1BA1A 4IJNA 3O08A 4FWMA 3VGMA 3SK3A 4WYBA 4HTLA 2GUPA 2KHOA 2P9KB 3ZX0A 4HWIA 4FL9A 4BRIA 3CIPA 1WUAA 3WQTA 5FPNA 2W41A 3H3OB 3H46O 2H3GX 2Q2RA 4JHDB 1MA9B 4MLHA 2HMPA 3EKSA 5LY3A 2I7NA 3WXLA 4EIAA 3FZMA 4CBUA 2GTDA 5JLFA 3O4WA 1QHAA 4PL8A 3L6QA 2A42A 3VPZA 1SAZA 1T6CA 3QFPA 1X9JA 1X3MA 1NM1A 1QQNA 3SJHA 3FZHA 3ZETA 4WQ4C 3DXMA 3DXKA 1ATRA 1BOTO 4BRLA 1IJJA 2W40A 5BN8A 5AQJA 1G99A 3VEZA 1ESVA 3CJBA 3DXMB 4H5TA 4LC9B 1BA0A 3LM9A 4RTFD 1TYQB 1U6ZA 3AAQA 5AZIB 3I33A 3IUCA 2Q1NA 3EN9A 3LM2A 4DQ8A 3CJ1A 3U8XA 4BR4A 4NO7A 4BREA 5AQRA 4NB4A 1GLAG 5JICA 2BUPA 1RDWX 4BRGA 3UKRA 3FLCO 4GNIA 3VEVA 3ULEA 3VOVA 3WEEA 3WT0A 4B1ZA 5FPMA 1GLBG 5AQIA 3UKRB 2CGJA 1Y64A 3LDNA 3EKUA 3VERA 5BPMA 3VENA 3JS6A 3B8AX 3LDLA 3WEEB 2PBDA 3G25A 2AA4A 5BRDA 3DAWA 3H6EA 4FOIA 2FSJA 1JCEA 3A5OC 2YHWA 4QS7A 4EFHA 5EXWA 3ZX3A 1U2VA 2GELA 2ZF5O 2DPNA 3VGKA 1P8ZA 5BR9A 3FZKA 2Q0RA 1C0GA 1U2VB 3AY9A 5FPEA 2BTFA 2FF3B 2VYPA 5E26A 4O5FA 3BF1A 4H5NA 1GLEG 4BRPA 1GLFO 4BRQA 3VESA 1GLCG 3WXJA 2YI1A 5KPZA 4K41A 3ZEUA 2CH5A 4M7XA 3TU5A 4I6MA 3ENHA 3H1VX 3ATUA 3BF3A 2FF6A 3ZX2A 4CZKA 5ADXH 3ZEUB 3WQUA 4AM7A 4A2AA 3GOIA 2CGLA 1KAZA 3CJAA 4I6MB 5AQKA 4CD1A 5AQVA 1KAYA 4A61A 4EHUA 1GLLO 3GL1A 4CZEA 4CI6A 4CZIA 1SZ2A 4J8FA 1ZC6A 4BRHA 2ASMA 1Z6RA 5AQLA 5EY4A 3UB5A 3AARA 3D2EA 4IXCA 2ITMA 2ASOA 3O80A 3CHWA 4BVPA 4L3QA 4BRDA 3EL2A 2A41A 1EQYA 3D2EB 3HTVA 2E88A 3C7NA 4IJAA 3C0BA 4QS8A 3A8YA 3FZFA 5AQSA 5FPDA 2GWJA 3CJCA 5AQPA 1HJOA 2HOEA 3C7NB 4JHDA 5BRHA 3VEWA 1NMDA 1S3XA 1QQMA 2P9NA 4E1JA 2D0PA 4ISEA 4BR7A 2D0OA 5AQUA 1CZAN 2ZWHA 4H0OA 4MO5A 2P9NB 1Z05A 2D1KA 2D4WA 4DHYA 2IVOA 3O6WA 4C23A 1IG8A 4M7YA 4BRMA 4K25A 4CZHA 4FWSA 5AR0A 1HKCA 2E8AA 5B8HA 3MMVA 2E1ZA 2FLOA 4JNEA 3ENOA 1DGKN 4XEIA 3W0LA 1X3NA 2YHXA 3VEOA 2QWPA 1LOTB 3A5NC 4PKIA 3FE1A 1TYQA 2HF4A 5AZIA 3HM8A 1NWKA 4EHTA 2A5XA 4CBWA 1YUWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W97L 1YJNN 3DRPA 3EZWA 1C0MA 3LP0A 2Y1IA 4FYDA 3MK6A 3UKUB 4CW7B 1HKGA 1ZBLA 1XWLA 4DKWA 2QWLA 1SUQA 4ISFA 3RSEB 4DTOA 1NJIO 5AJ3K 3NAEA 2WUSA 2ZJPL 4C8OA 2XY5A 2C1GA 5EVZA 1W0HA 3CCQN 4M3RA 4EP4A 4M45A 3IAYA 4E72A 3CQXA 1VQ5N 4KPYA 4E3SA 4JKHA 4MO4A 3ISNC 4BG8A 3VF4A 5I9EB 3RMDA 4FWLA 1ITGA 3D0PA 3SBTA 3TANA 1WOQA 4B3RK 1A5VA 4B9QA 3RVCA 1T03A 3K57A 5AQNA 2HHSA 1KVBA 3KLHA 3QNOA 1QQOA 2YX6A 1TV6A 1XC3A 4EZ6A 3S9HA 2V52B 1U04A 2V51B 3AAPA 3M3ZA 4CF1A 4DSJA 2P9PA 3OVNA 2KZMA 4BR2A 4FSVA 1TKTA 3OJUA 5GAEP 3P31A 1ZBIA 2ZGYA 1EWQA 1WAJA 4FWPA 4BQLA 1RNHA 2FSNA 4YOXA 4BC5A 2QWRA 4FVUA 5AQFA 1E4GT 4LSNA 3ATVA 1GOCA 1QTMA 2G8IA 3AA2A 3FZLA 4IOXA 4DTJA 4DFJA 3VMFB 4LF4K 4FM0A 1Q82O 3OHRA 4F2SA 1OH5A 4M3YA 3PO5A 2O8DA 4DV4K 1NU0A 4DU3A 4JI8K 2KZZA 3GDQA 1VQNN 5AQZA 3ITHA 3QIPA 5FDLA 3ZSRA 4BACA 4LF9K 5C25A 1UA1A 1VQ7N 2IDOA 3KD1E 4B8CA 1IKWA 3SQ4A 2IAJA 1WBDA 3QB0A 3RMCA 4KTZA 4IFVA 4QS9A 5KTQA 5HRRA 5D3GA 5MLCQ 4U7BA 3R9PA 5AQHA 4HUEA 5ELZA 1NKBA 1MU2A 1VHXA 3CJ7A 1WNSA 4WFNL 4CEQA 3FFKB 3SNNA 5J2MA 1S22A 2WC9A 1VQ8N 3R6MA 5BRFA 4M41A 1VRTA 3ZT4A 4B9SA 4CJ5A 4MLEA 1CXUA 1BGXT 2OANA 2ZQBA 4GW6A 1RBRA 1QZ6A 4W5NA 4FJ5A 5AQOA 4DB3A 4GVMA 4BRNA 2W00A 3OY9A 4BRCA 4CJWA 4B9UA 1BU6O 5E41A 3SUPA 3TTCA 3I55N 3HVRA 3ZETB 3NF7A 1T05A 3KZBA 5HP1A 1L5UA 3DXKB 4GV9A 2B5JA 3K9JA 3THYB 3A5LC 5AQMA 3QESA 3IDHA 2FC0A 3OS0A 4NCGA 4BR0A 4N76A 5HRPA 1VK0A 3EO3A 3QBWA 1YF5L 2ZE2A 3AO1A 4DR4K 4KHNA 2NZTA 2YCHA 1VQPN 4O0IA 3AVHA 4KBOA 2Y1JA 5AFUA 4DV7K 1DKGD 3FFIA 4WCEL 3L2RA 1S1VA 3OYBA 3U3GA 3WUHA 1HPZA 2HHWA 5KQ8A 3RWUA 4ID1A 1H1VA 4KHSA 3QLHA 4LF8K 4JD2B 2Z1HA 2A3ZA 2NLXA 5M1FA 5AQTA 4B8AB 2E2PA 2HNZA 2ITGA 1QZ5A 1YAGA 2AP1A 3RR8A 3OYKA 4C8NA 3OYEA 1RFQA 1LAWA 4CEDA 5AQYA 1SKWA 1BO5O 3ID8A 3NGIA 3AO5A 4JYAK 3ULDA 3ZSVA 3O1BA 1VSFA 4FLUA 5CZ2A 3QEPA 3IFRA 1Q9YA 4JN4A 2YJFA 3ID6A 4I2PA 1NKEA 1CZ9A 2UUBK 1HYVA 1C1CA 3SUNA 1CZBA 3BGRA 5EX5A 3QICA 4TSXA 4LF6K 3LDOA 4LD0A 4IOCL 3ZSOA 1YTUA 2E2OA 2P9SA 3LALA 4CZMA 2F7TA 1TL1A 1HJRA 1LW2A 3MEDA 3MN9A 1LV5A 1KAXA 3O9QA 1IG9A 3KVGA 4ELVA 4E7HA 3WXIA 1E3MA 3SMSA 4CF2A 4CJSA 4E1MA 4WYBA 4QAGA 1ASWA 1L3VA 4HWIA 3QEWA 4FL9A 1IKYA 2Q3SA 2E5LK 4A5AA 2UUAK 4CIEA 1QHTA 1QSSA 5FPNA 3C65A 1KFSA 4CE9A 2ATQA 1RBSA 4MLHA 1YITN 4EIAA 2RHKA 3CCEN 3RRHA 1S5JA 4CBUA 2GTDA 3CM5A 1VRUA 1QHAA 4DF8A 3WNGA 1T6CA 4CHYA 4E89A 1X9JA 4JK9A 1NM1A 1C0TA 3C6UA 4JKCA 5M1KA 3FZHA 3SUOA 1GOAA 4V19S 4BRLA 1IJJA 3E1YA 2PY5A 1G99A 3SQ0A 3CJBA 3LM9A 2OPPA 1TYQB 2ZD1A 3I33A 1F21A 1UA0A 3IUCA 2F8SA 4NO7A 3NBPA 1L3SA 3IS9A 1GLAG 2O8CA 3O9RA 3T1AA 4BRGA 3CF5L 2DFEA 4GNIA 3D45A 3ULEA 4IEEA 3WEEA 2YV0X 4B1ZA 2YNGA 1GLBG 2CGJA 3KKSA 3R3LA 4IBNA 3B8AX 4B9MA 3F2KA 2PBDA 4LF7K 1QSLA 3LPUA 3A5OC 5BR8K 1WSHA 1Q81O 4JK8A 1U2VB 3LZJA 3TAMA 2FF3B 1JLAA 4OPKA 4BRPA 2UXDK 4OVLA 1WBBA 1GLCG 3SV3A 3WXJA 4R79A 1ZBFA 2IGIA 3ZEUA 3ZT1A 1LW0A 3H1VX 2F96A 3IKMA 3CG7A 1YI2N 1VSDA 2NUBA 2QKBA 4A2AA 3GOIA 1TVRA 1WSFA 3HL8A 3MEEA 4OKEA 4B3MK 5AQVA 2HBLA 3ZT0A 4M3UA 1KAYA 1GLLO 3GL1A 1BI4A 1EETA 4CZIA 3L2WA 4J8FA 4KB1A 1BHLA 1U48A 1JL1A 3NDKA 2RKIA 4E7LA 4CIGA 3KWGA 3O9TA 4QOZB 1J9AA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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