3FFKB

Crystal structure of human gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
365
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ca2+ binding by domain 2 plays a critical role in the activation and stabilization of gelsolin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords plasma gelsolin
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 365
sequence length 366
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ffkB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ffkB04
4Y0WA 2HMPA 4BRKA 3VEWA 1NGJA 3O5BA 2FXUA 1ATRA 4DHYA 4WQ4C 1KAZA 1GLAG 1NLVA 5BPLA 2A5XA 1YUWA 5LJVA 3J8AA 3CJ9A 4DB3A 4M7XA 5JLHA 3HZ6A 3A5LC 2E2PA 4K43A 5F0XA 1BA1A 1NGFA 1Y64A 3AAPA 2FLOA 4M63C 1QQMA 1ZBSA 2E20A 2P9IB 3DXMB 4CZEA 1T6DA 3DAWA 2CGJA 3MK6A 3O80A 4XH4A 2Q36A 3TU5A 3WQUA 3CJCA 5EVZA 4BR9A 1R59O 3ULEB 4EIAA 4JNEA 5BREA 4BRIA 5EX5A 4MLEA 1HKGA 1KAXA 3L4IA 1BG3A 1TUUA 4B1ZA 5JICA 4BR0A 3GOIA 2D0PA 2Q97A 4HTLA 4IJAA 3UKRA 3O08A 4BGBA 3VGMA 4B1XB 1BO5O 1QZ6A 3C0BA 3FE1A 5AZIB 3DXMA 4CJ7A 5E84A 1MWMA 3SJHA 4BR7A 4PKGA 1H1VA 3ULEA 2I7NA 1V4TA 2HF3A 2IVNA 3VF6A 3WXJA 3O6WA 2J4RA 3JXUA 4RCHA 4JAXA 2PAVA 1LCUA 2WUSA 1RGIA 2W40A 5AQPA 3ATUA 1NGHA 1X3NA 4CD1A 2UYTA 4QS9A 5BR9A 3HM8A 1U2VA 1NWKA 5AZIA 3GL1A 4XH5A 2GUPA 3A8YA 3GDQA 1K8KA 5EXWA 3QDKA 3CJBA 3FZHA 3H46O 2P9KB 4CZJA 5FPMA 1HLUA 3AARA 3EO3A 4FWRA 2E8AA 1WUAA 4K42A 3ZX3A 4IZ9A 3A0IX 3DXKA 2CH6A 5AQFA 5AFUH 2YHXA 5ADXH 1ZXOA 4CZLA 3S41A 5LY3A 4IJNA 5B8HA 3CHWA 3RSEB 3CQYA 2P9KA 2ASOA 2P9PB 3ZEUA 1X3MA 2P9UB 3CQXA 1T6CA 1LOTB 4BVPA 2HF4A 3U9ZA 4B1VA 5BRHA 3CJ1A 4BRHA 1V4SA 3O4WA 2GTDA 3EKUA 2GWJA 4QS7A 1BDGA 4A2AA 5EY4A 1NGGA 2FSJA 1KAYA 3A5MC 1BOTO 3AY9A 4H0VB 3IMXA 5KQDA 2ZGZA 3HTVA 3BP8A 3BUZB 5BN8A 4J8FA 4BR2A 4DQ8A 3VERA 4CBWA 4BRCA 3CERA 1XC3A 3EL2A 3I8BA 2IIRA 3ATVA 4CZGA 3B8AX 3LDNA 2QWLA 4ISGA 1NGIA 3VESA 2D4WA 4JD2A 4FSVA 4B1WB 4FWMA 4BRGA 4MO5A 1TYQB 3ZX2A 3D7EO 1RDWX 4C23A 3UKRB 3H1VX 3LDLA 2P9SA 4GY2B 1HKCA 1BWFO 1JCGA 4BRAA 1XUPO 2Q31A 1TUYA 1X9JA 4FWSA 2KHOA 4H0PA 4L3QA 1SZ2A 3MN7A 4NO7A 1GLJO 4CZKA 5AQNA 3HSCA 1DKGD 1P8ZA 3SMSA 3QBXA 4CZMA 1TYQA 3R6MA 1YAGA 1NGCA 3F9MA 2A40A 4HWIA 1XQSC 2Q0UA 3MN5A 4MO4A 2QWQA 3D2EB 3WEEB 1U2VB 3I33A 4H0TB 1U6ZA 1BUPA 4BR4A 4JN4A 3HBTA 3IUCA 1E4GT 3QB0A 4EHUA 1K8KB 1S3XA 4BRLA 3KHYA 5ELZA 3A5OC 3VENA 3G25A 4XH1A 5ADXA 4BQZA 5AFUA 2BUPA 5AQYA 3JS6A 3L6QA 2IVOA 5AQXA 1YXQA 2QWOA 3H3OB 4A62A 3QFPA 3DXKB 1D4XA 4H0XB 5AQUA 1MA9B 3MN9A 3IDHA 1HUXA 3D2EA 1NMDA 3WEEA 3LM2A 2BTFA 4AM6A 4BC5A 3VEXA 5BRFA 4FL9A 3UE5A 4WQ5A 3MN6A 2GWKA 4KBOA 4FPBA 2CGLA 2D0OA 3ZEUB 3R8EA 3DWLA 4F9OA 1ATSA 4I6MB 5BN9A 4BROA 3UKUA 4CZFA 2Q0RA 4K25A 4O5FA 4ISEA 4YDUA 5AQSA 3FZLA 2E2QA 1SAZA 2P9LA 5AQGA 3VETA 2VWBA 4EHTA 4O8KA 5EOYA 3ENHA 3O1BA 3VGKA 4BG9A 2GEMA 3FZFA 2QWMA 1GLEG 5KPZA 3WUHA 4FWQA 5AQZA 4PKIA 4I6MA 1QHAA 1DGKN 2QXLA 1OKJA 1IJJA 3CJAA 3M3ZA 4BRNA 3U8XA 3M1FA 3SK3A 3HI0A 3H3NO 2CH5A 3DJCA 3LDOA 3FFKB 3FR0A 3P4IA 4EAHD 4ISFA 1HX1A 1GLCG 4JD2B 3FLCO 3A5NC 5F2RA 3W3DA 4JHDB 4BQLA 1BU6O 3ENOA 2P9SB 4A2BA 2YHYA 1NGEA 2DPNA 2QW9A 2ASPA 1GLFO 4BRFA 2FSKA 2AP1A 4BRDA 2A3ZA 2QWNA 3U9DA 4RTFD 4B1UB 4FPAA 5AQHA 2E1ZA 2OANA 5AR0A 4XEIA 2H3GX 1C0GA 2F9TA 2ZF5O 5AQIA 5FPEA 4QS8A 2EWSA 4FWNA 5AZJB 4JHDA 3ZX0A 3MDQA 3SMPA 5E26A 2P9NB 2YJEA 1RFQA 4K41A 1GLDG 5AQJA 3VEOA 3ZETA 2Q2RA 5AQQA 2E1YA 5JMVA 4MLHA 4WQ5C 3WXLA 2AA4A 2YHWA 4H0YB 5AQOA 3VEVA 2FF6A 1NGAA 2QM1A 1YVNA 3M6GA 4FWPA 2GELA 1C0FA 4Z94A 5AZJA 5AQKA 1Z6RA 4H5TA 4YDUC 1S22A 2A6AA 3SLCA 5KPTA 1ZC6A 2P9NA 2F9WA 5AQRA 3VOVA 3C7NA 3WQTA 4PKHA 2YJFA 1T44A 5JLFA 4H5RA 3FZKA 4CD3A 3L0QA 5TKYA 4H5VA 1EQYA 2E2NA 5FPDA 5AQVA 4BG8A 4PL7A 3FGUA 2ZWHA 3LM9A 3LDPA 4H03B 3IFRA 3UKUB 2E88A 5BPMA 5AQMA 4BRMA 4M7YA 1NGDA 2FSNA 3WT0A 1MWKA 4WYBA 3GE1A 3O1WA 3GBTA 2P9LB 5LJWA 4NB4A 4LC9B 1NM1A 1MDUB 3VF4A 4BR5A 5KQ8A 2P9IA 3VGLA 2PBDA 2IVPA 4IXCA 3UB5A 4BGAA 1QZ5A 4WQ4A 4FWOA 3VF2A 2NRHA 4A61A 2ZGYA 3EKSA 4H5WA 3MMVA 1NGBA 4GNIA 2A42A 5KPRA 1WOQA 1DEJA 2W41A 1QQNA 2VYPA 3QFUA 4FOEA 1BA0A 1Q18A 1HPMA 2Q1NA 2QWRA 4CZIA 5I9EB 3H45C 4BC2A 3CIPA 1IG8A 5CE3A 3W0LA 4BRPA 3BF1A 4FOIA 2D1KA 2V51B 3VEYA 1ATNA 4CBXA 4CI6A 1E4FT 3KZBA 1GLLO 3TPQA 3MCPA 1G99A 3H6EA 3VEZA 3D2FB 5AQLA 1HKBA 4IWVA 2V7YA 5F1XA 2FF3B 1QQOA 2V7ZA 2V52B 3U4LA 4E1JA 4PL8A 3BEXA 4FWLA 3OHRA 1GLBG 3WXKA 4CZHA 5AQTA 1ESVA 3R9PA 4AM7A 3BF3A 2HOEA 1JCEA 4BREA 3CI5A 3QBWA 3VPZA 5BRDA 2E2OA 4IO8A 1J6ZA 1KXPA 3FZMA 3D2FA 2I7PA 5AQWA 3H1QA 4FWKA 4FO0A 2YCHA 3AAQA 3ZETB 2QWPA 2VCPA 3QMLA 4EFHA 2YI1A 5FPNA 1CZAN 3EN9A 4H5NA 3WXIA 4BC4A 5BPNA 4DCHA 1NBWA 3O8MA 4H0OA 4BVOA 2CGKA 1Z05A 3QICA 3LDQA 3KVGA 2ITMA 4BRQA 4CBUA 4B1YB 2NLXA 3EZWA 3CETA 1SQKA 3GG4A 3RSEA 2P9PA 3ID8A 2P9UA 4RWTA 2ASMA 1HJOA 4B9QA 3C7NB 3LL3A 3CJ7A 1JCFA 4BC3A 2NZTA 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SCXA 3OJSA 3JYTA 4Y0WA 3OY9A 3THVA 2QA4N 2OA8A 1TL3A 3AO4A 3O5BA 3NFAA 1O13A 3DRSA 4WQ4C 1NLVA 3ZSXA 2D0CA 4FW1A 3SYZA 2A5XA 2RN2A 1J54A 3VN5A 4J2BA 1NU0A 3DOKA 4M7XA 5JLHA 3VQCA 3LALA 1BA1A 4OPHA 3T19A 2E20A 2P9IB 3OYAA 3CQ8A 3O80A 4PA1A 2YNGA 3AVMA 3THWB 3TU5A 4K8ZA 5BREA 1VQON 3QEWA 1JLGA 4FJMA 1KAXA 4E7JA 1IH7A 3T3FA 4OPKA 4FJNA 4FJKA 5JICA 5GIOA 3VQEA 2O8BA 4FZXC 4HTLA 4IJAA 3OA9A 3DRRA 4BGBA 2WTUA 1WSGA 1QZ6A 4A59A 3DXMA 1RT4A 4JKAA 4DR6K 1HYZA 1YJNN 4CEQA 2HHXA 4J2EA 2I7NA 3QNNA 3AGRA 2HNDA 2UUCK 3O6WA 3JXUA 4RCHA 1Q8IA 2WUSA 1BIUA 3QEXA 1P90A 1YJWN 1JJ2M 1C1BA 4PUOA 3HM8A 1Q9XA 4N56A 1W2BM 4KREA 3VTIA 3A8YA 3GDQA 1K8KA 5EXWA 3H46O 2QI2A 3WXMB 5FPMA 3MXJA 3SNNA 3PX6A 2AJQA 1WUAA 4XJXA 4Z4HA 2BGGA 3A0IX 1NJYA 1VSDA 4DR3K 4DFJA 3ZSVA 4OVLA 1W0HA 1RBVA 3SQ0A 1VRUA 3CHWA 3KKSA 1XWLA 1WBBA 4BECA 4JKHA 4BVPA 1HJRA 2GV9A 1RBTA 2DFHA 1F21A 3B6OA 1BDGA 1W97L 4A2AA 2B6AA 1NGGA 2VG5A 4ZHRA 4LF4K 3CD6N 3KK3A 3MCAB 1OVYA 4EZ6A 4W5NA 3QNOA 5JVHL 3MEDA 4BACA 1HQUA 4BR2A 1WSJA 3VERA 4CBWA 4BRCA 3CERA 4DQPA 1XC3A 3ATVA 4CZGA 3M5RA 3TAMA 1NGIA 4ILHA 5KTQA 2D4WA 1NJIO 1OH7A 4JD2A 3J7YP 3EEQA 1XHZA 3ZSQA 4BRGA 2O8BB 1TYQB 3I55N 4O55A 1K9MO 1RDWX 4C23A 4FLZA 1VQ7N 3LDLA 4GY2B 4M3ZA 3P31A 4E89A 3O3FA 1RDBA 1TUYA 2Q31A 1NK6A 3F73A 4H0PA 5CYMA 3MN7A 1RTJA 1Q7YO 3KWGA 4JI0K 4CZKA 5AQNA 4FLTA 3E9OA 1UA1A 2A1RA 5JS2A 5M1PA 1REVA 2Q0UA 3MN5A 3KK1A 2QWQA 3VQAA 3I33A 1BI4A 3IUCA 2ATQA 1E4GT 3VQBA 4F2RA 4EHUA 4WCEL 1K8KB 1VQKN 4GV9A 1IBMK 3R1XA 3IS9A 1JXEA 1NK0A 3VENA 3G25A 4BQZA 3AA4A 4G1QA 1N34K 1SKWA 3QFPA 1ZYQA 1HNZK 4IO9L 1MA9B 3D2EA 3WEEA 4Y1CA 1M90O 4BC5A 5BRFA 4FL9A 3JSMA 4CESA 4B9TA 4FPBA 4FJXA 3DWLA 4CJ3A 1ATSA 3EE9A 2ZM6K 3OTOK 3VETA 2VWBA 4JKEA 2WONA 5EOYA 3SQ1A 1D9DA 4B9SA 4CIEA 1N5YA 5D3GA 4DUZK 1ZBUA 3WUHA 3L8BA 2VWKA 4FWQA 1NK7A 5HRPA 4I6MA 5FLXO 1QHAA 1DGKN 2VQFK 2DY4A 1EXQA 3CJAA 3M3ZA 4JI4K 3PSFA 3DOLA 4B3RK 3S3NA 1L3TA 3G0ZA 1NMNA 4JD2B 3A5NC 3M8QA 5LMNK 3TAPA 4BQLA 1BU6O 3TSPA 5JENA 4DTNA 4DUYK 2YHAA 3NF7A 1NGEA 4B3OA 3OYIA 1LV5A 3IG1A 3U9DA 5T7BA 2IDOA 3QEPA 1KLMA 1LWCA 1BQNA 2OANA 5AR0A 5AQIA 3AVKA 5FPEA 1WAFA 4QS8A 4PQUA 3V1OA 3L2QA 5AZJB 2OTLN 4JHDA 4NYNA 3VTHA 4CJTA 1RFQA 4CEFA 1GLDG 5AQJA 2IC3A 3ZETA 2Q2RA 2E1YA 4KH4A 4MLHA 4WQ5C 2Z1JA 1B9FA 2OYQA 2YHWA 4E19A 3NGZA 4H0YB 1HRHA 4DQQA 3MECA 2QM1A 1NGAA 4B9VA 2QK9A 1YTAA 4CFAA 5GAEP 4PHTX 2HHWA 1Z6RA 4F3OA 4I9LA 3V6DA 2P9NA 3IKMA 1L3UA 1S1XA 3WQTA 3NVMA 5JLFA 3L2RA 1TAUA 4DTMA 4O0JA 5FPDA 4H4MA 4NLBA 1RBSA 3LDPA 4H03B 3ZSYA 2E88A 4M7YA 1SUQA 3MX5A 3SUPA 3RR8A 3GE1A 3GBTA 4O44A 1RT2A 5LJWA 3V1RA 4DR2K 1MDUB 4H8KA 3VGLA 1N8RO 3BZKA 4BGAA 3U3YA 5CHIA 3K58A 1J5EK 3SBTA 2DTUA 2NRHA 3F2KA 4ID5A 1DEJA 2W41A 1QQNA 3QFUA 4FOEA 3HXMA 4CGGA 2QWRA 4B9LA 3KLEA 2NRRA 3BZCA 3CIPA 3V4IA 5CE3A 3W0LA 3ZSOA 4FOIA 4CBXA 1QSLA 1RCHA 2HBLA 1GLLO 3K2PA 2F96A 1G99A 3H6EA 4DTOA 3TAEA 5TKWA 1XNRK 1R0AA 3ZT2A 1WSIA 4HUFA 4PL8A 4CF9A 3SAHA 1QSYA 4FWLA 2Y1IA 1VQ5N 1ZBFA 1GLBG 2JWLA 3WXKA 3HSTB 4A57A 4CZHA 5M1KA 4BDPA 1ESVA 3L3UA 3BF3A 1JCEA 5BRDA 3J7AP 4PWDA 4J2DA 4KRFA 2BE2A 1U47A 4C8NA 1A5VA 4FWKA 4AHSA 1HNXK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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