3FFKB

Crystal structure of human gelsolin domains g1-g3 bound to actin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
365
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Ca2+ binding by domain 2 plays a critical role in the activation and stabilization of gelsolin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
molecule keywords plasma gelsolin
total genus 112
structure length 365
sequence length 366
chains with identical sequence E
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ffkB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ffkB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ffkB04
2Q0RA 1NGGA 1XQSC 1Z6RA 3VPZA 4B1VA 3FR0A 3A5MC 3VEYA 2IVOA 4BG8A 1RDWX 5BRDA 3UKRA 2P9UB 3VEWA 4CBUA 1NWKA 3DXMB 5AQHA 5AZIA 1TUUA 2CGLA 4I6MA 3IDHA 4CZKA 3EZWA 1CZAN 2QWMA 4M7XA 2QM1A 5FPDA 5AFUA 3VENA 5LJWA 2AP1A 3FGUA 3HTVA 3LDQA 2BTFA 2FSJA 3O6WA 5JLFA 1BOTO 1GLBG 4ISGA 2EWSA 1Y64A 1K8KA 3ENOA 4JD2A 3VESA 3DXKB 4B1YB 1U2VA 3CHWA 1YAGA 3SLCA 3R9PA 4B1WB 4BC5A 3ZX0A 3FZKA 4CBXA 3FFKB 3HSCA 3W0LA 3TU5A 5AQOA 1ATNA 1BO5O 3A0IX 2FSNA 3DXMA 4FOIA 3VF6A 3H1VX 4FWPA 4PL8A 5BPMA 5EVZA 1QHAA 3G25A 1K8KB 4JD2B 3U4LA 2P9KA 3QICA 4ISFA 5E84A 3BF3A 4RWTA 5F0XA 4FOEA 1GLCG 2QWOA 1NGAA 3GOIA 4BC4A 1NLVA 3EN9A 3HBTA 4L3QA 1SQKA 5BN9A 3VERA 5AQZA 3WXIA 2P9SB 2A42A 2P9NB 4H0YB 2P9LB 5AQTA 4H5NA 5BPNA 5AR0A 3B8AX 1ATSA 3VF2A 3UKUB 3U8XA 3O1BA 4BC3A 5AQWA 2QWLA 2IVPA 3ATUA 3M1FA 2GEMA 4BVOA 2ITMA 5E26A 1TUYA 4JN4A 4BRFA 1IG8A 4B9QA 3WT0A 2ZWHA 1T6CA 1U6ZA 1HUXA 1T44A 1NGJA 1GLDG 3C0BA 3VGMA 3L4IA 4BRPA 3SJHA 2D1KA 1GLAG 1DEJA 3AY9A 3H45C 4H5VA 3FLCO 3VGKA 4CZEA 2YI1A 3QDKA 3MN6A 5JLHA 4C23A 2FXUA 3SMPA 4BR0A 5BN8A 5EOYA 3HM8A 3L6QA 3H3OB 3S41A 4IJAA 3D2FB 4WQ4A 4BVPA 3TPQA 3U9DA 2E88A 3CETA 3O08A 5AQQA 5F1XA 3OHRA 3ZX3A 3LL3A 4XEIA 1KAZA 1QQMA 4CJ7A 3IMXA 2CH6A 4JNEA 5AQXA 4A62A 4BR5A 4PKHA 3FZMA 3GDQA 3ZEUA 1BG3A 1HPMA 1HLUA 2HF3A 1MWMA 2QWQA 1HJOA 3O80A 4H0PA 2NRHA 4BC2A 4FO0A 3CJ9A 4HWIA 5AZJB 3DAWA 5EXWA 1MA9B 1JCEA 4DQ8A 3H46O 3SK3A 2GWKA 5KQ8A 2PAVA 5EX5A 4FSVA 2Q31A 3O1WA 2P9IB 3VETA 3QFPA 4BRQA 2QWPA 3MK6A 4PKGA 1ZBSA 4K43A 4FWSA 4CI6A 4BRNA 3O5BA 3C7NA 2FSKA 3ZETB 3F9MA 4MLHA 3RSEB 3IFRA 2P9UA 3UKRB 1QZ6A 3MN7A 4H5RA 1SZ2A 5AQKA 3CJCA 2UYTA 4BG9A 3VEXA 5BREA 4BQZA 1P8ZA 2F9TA 4EHTA 4ISEA 4NO7A 2J4RA 3CQXA 2BUPA 1GLJO 4I6MB 3W3DA 5EY4A 3MMVA 2P9PA 2Q2RA 1LCUA 3LDPA 3A5OC 5AQIA 3VEOA 2E2PA 1C0GA 1IJJA 1V4SA 4XH1A 3H6EA 3R6MA 3I8BA 1RFQA 2QXLA 3WUHA 3ZETA 4B1UB 2NZTA 3FZFA 2VCPA 4Y0WA 2QWRA 2V52B 3ENHA 4FWMA 2W41A 3CJBA 3L0QA 3VGLA 2PBDA 3P4IA 4CZIA 5CE3A 1NGDA 2P9LA 1Z05A 5AQSA 2E2QA 1DGKN 2FF6A 2KHOA 3WQUA 3FE1A 3LDLA 2E20A 4GNIA 3ID8A 2IIRA 1KAYA 4CBWA 4QS9A 1BA1A 4YDUC 2Q97A 3HI0A 4FPAA 4KBOA 2E2OA 3CERA 2YHYA 3WXKA 3SMSA 1J6ZA 5F2RA 5AQJA 5AQLA 5LY3A 3CJ7A 4BR4A 2VWBA 4H0TB 4M63C 4WYBA 5JICA 3AAPA 1E4GT 4BROA 4BRLA 4H5TA 4BQLA 4O8KA 1YXQA 5AQYA 2ASMA 1ZC6A 3M3ZA 2P9SA 3A5LC 4H5WA 4WQ5A 5FPNA 1S22A 5BPLA 3LDNA 3VEZA 2FF3B 3QBWA 5BRHA 3BUZB 1HKGA 2OANA 3KVGA 3VF4A 2HF4A 3A5NC 1YVNA 3CQYA 4B1XB 4H0VB 4CZJA 1ZXOA 4FWKA 5KQDA 1BUPA 3QMLA 4DHYA 3H1QA 5ADXA 4EFHA 4A61A 5TKYA 4EHUA 3C7NB 4LC9B 3EL2A 2ZGYA 1NMDA 3CJAA 2A3ZA 4QS8A 4H0OA 2E8AA 1GLEG 1KXPA 3QFUA 2W40A 3D2FA 2VYPA 5FPMA 1LOTB 3CIPA 2F9WA 1JCFA 3O4WA 3BEXA 2ASOA 3UE5A 4A2AA 2V7ZA 2D0OA 2YJFA 4JHDA 4K42A 4BGBA 3WEEB 1YUWA 2NLXA 1NM1A 3HZ6A 4WQ5C 4H0XB 1WUAA 2DPNA 5AQNA 2V7YA 5ELZA 3WXLA 3CJ1A 4HTLA 3BF1A 2QWNA 2YCHA 3CI5A 1H1VA 1ESVA 1NGCA 4FWOA 4MO4A 5AQMA 2P9KB 2GWJA 1U2VB 4FL9A 3VOVA 1XUPO 5B8HA 2CH5A 4BRIA 5AQUA 2A40A 4FWNA 4XH4A 2V51B 5KPZA 4IWVA 3JXUA 1HKBA 1SAZA 5BRFA 2GELA 4BR7A 2P9IA 4M7YA 3DJCA 1TYQB 3MCPA 1TYQA 4H03B 3LM9A 2E1YA 1T6DA 3KZBA 3WEEA 4K25A 5AFUH 3GBTA 3KHYA 4E1JA 3BP8A 2YHXA 4BRGA 5LJVA 1NGFA 1BWFO 4XH5A 1E4FT 4CZGA 2E1ZA 2YJEA 3A8YA 4BRDA 2ASPA 3LDOA 3U9ZA 3WQTA 3RSEA 2GUPA 4NB4A 3ATVA 2AA4A 2E2NA 2H3GX 4RCHA 3LM2A 1WOQA 1NGIA 4BRKA 4MO5A 1QQOA 1QZ5A 5AZIB 1BU6O 5AQRA 3EKSA 4IO8A 2FLOA 5AQGA 2P9PB 1D4XA 2GTDA 4J8FA 4Z94A 1NGEA 2ZF5O 4BRCA 3ZX2A 2Q0UA 2A41A 4BR2A 3WXJA 1KAXA 3MDQA 3ULEA 4CZMA 1MDUB 4IXCA 4IZ9A 1C0FA 1X3MA 4CZHA 5KPTA 4FWRA 4WQ4C 4CZLA 3FZLA 1OKJA 3GL1A 4BRHA 4DCHA 2P9NA 1Q18A 2CGKA 4FWQA 2A5XA 3ZEUB 4MLEA 1EQYA 2CGJA 3AARA 1NGBA 4BR9A 3I33A 1ATRA 4FPBA 1HX1A 1R59O 3GG4A 5AZJA 2IVNA 5JMVA 4IJNA 4GY2B 2ZGZA 3UB5A 3JS6A 1GLFO 4K41A 4AM7A 4JHDB 4QS7A 2I7NA 1S3XA 1BA0A 3EO3A 3EKUA 3MN9A 3ULEB 4BRMA 1X3NA 3QBXA 4YDUA 4CD3A 4BREA 5I9EB 4A2BA 1DKGD 1QQNA 3O8MA 1MWKA 2HOEA 3J8AA 4F9OA 2D0PA 5AQFA 4PL7A 1BDGA 2I7PA 4EIAA 2QW9A 1GLLO 1JCGA 1V4TA 4FWLA 3UKUA 5AQVA 1RGIA 3M6GA 4PKIA 3D2EA 3D2EB 4O5FA 1NBWA 3R8EA 2Q36A 1X9JA 5AQPA 3VEVA 4DB3A 3AAQA 5FPEA 4CZFA 1NGHA 3GE1A 4BGAA 2D4WA 1XC3A 3MN5A 1HKCA 4RTFD 4AM6A 3D7EO 1G99A 4EAHD 2WUSA 3IUCA 5BR9A 5ADXH 3DWLA 4CD1A 3H3NO 5KPRA 4BRAA 2Q1NA 4B1ZA 3FZHA 2YHWA 2A6AA 3DXKA 3QB0A 2HMPA 4JAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK4A 1Z6RA 4HUEA 2VWKA 4B1VA 3VEYA 4BG8A 1RDWX 4YY3K 2P9UB 4CBUA 3RVCA 4FLZA 3K9KA 3HL8A 3KK7A 1VQ6N 3V1QA 3VENA 3UIQA 1C1CA 2NRRA 3BDPA 2HBKA 3MX2A 3FGUA 4M3RA 1VSJA 3ENOA 4JD2A 4ZTJA 1Q7YO 4CF0A 1BI4A 4FYDA 2HHVA 3AO2A 3PSFA 1A5XA 1WSGA 3TWHA 3TU5A 4DTJA 4CJ3A 3HJFA 1ATNA 1BO5O 4A5BA 1U45A 3BZCA 2FSNA 3DXMA 4B9VA 4Z4EA 3AVMA 2WONA 4PL8A 4YOWA 5GAHP 5BPMA 5EVZA 4Z4HA 3K9JA 3U4LA 4KH4A 2P9KA 4ILGB 4AHVA 2QWOA 2VQFK 3GOIA 1RT4A 3V81A 1RDAA 3NH0A 3WXIA 5AQZA 2A42A 2P9NB 2P9LB 3AVAA 2NUBA 5HP1A 1C0MA 4H4OA 3QNOA 1ATSA 3UKUB 3U8XA 1W9HA 4N76A 3ZSXA 5AQWA 1RBTA 2IVPA 2YNHA 2ITMA 3RTVA 1TK0A 2ZM6K 4NXMK 4JI1K 1HR0K 4C1NK 1RBVA 1KFDA 4B9TA 4CEAA 5KI6A 4G9ZA 4DR2K 2HHSA 4DV0K 1T44A 3BZKA 3C0BA 1DEJA 2RKIA 3AY9A 3SAGA 4FJJA 3L8BA 2YI1A 3QDKA 3MN6A 4I9QA 4C23A 3SMPA 2HVIA 3SV3A 3V9ZA 3SUOA 4M3YA 4E1NA 4IJAA 2DFEA 5GINA 3RWUA 4E7HA 1VQKN 1Q81O 2YV0X 1O1WA 3CETA 4CJFA 3C6TA 2HHWA 5HLFA 2O8CA 2O8CB 3O08A 4B3OA 4DS4A 1VQ9N 4XEIA 5MLCQ 1J5EK 4CJ7A 5E41A 2IGIA 3LAKA 2CH6A 5AQXA 4IFYA 3CPEA 3OJSA 4KHUA 4B8CA 1HLUA 4CJ5A 1HJOA 2NRHA 4OKJA 4HWIA 1HRHA 1VSFA 4KH6A 1RCHA 2P5OA 1MA9B 1JCEA 1ZYQA 4QCLA 3CFRA 3NFAA 1Z26A 2PAVA 5EX5A 1KLMA 1B9FA 2Q31A 2KKZA 3VETA 4BRQA 4KHNA 2QWPA 3MK6A 4LF6K 4LF7K 4PKGA 4K43A 3OYDA 4A59A 3CC4N 4BRNA 3O5BA 4JRPA 3DLEA 4HVJA 3P83D 3RSEB 1KCFA 3DLHA 3IFRA 3Q7CA 3UKRB 3MN7A 1Q82O 1YVUA 5BREA 4DTMA 1FW6A 4BQZA 1P8ZA 2VG7A 4EHTA 4ISEA 4DQQA 4DV7K 4IFVA 2J4RA 3CQXA 3KD1E 2O4IA 1NK5A 4ID1A 1OVQA 4U7BA 3MMVA 4HCBA 2P9PA 2Q2RA 3LDPA 1IJJA 4YOXA 4CHOA 1C1AA 1KSPA 2BGGA 3ZETA 3MECA 3RMAA 1VQ7N 4JLHA 3FZFA 3T3FA 1XI1A 2HHQA 1NG9A 4Y0WA 4DQIA 2WC9A 1LW2A 3ENHA 2KTQA 4FWMA 3IS9A 3WNGA 2XHBA 3L0QA 3VGLA 3DMJA 4LH4A 3ZT2A 5CE3A 3DRSA 1DGKN 1BGXT 3WQUA 2E20A 3SQ2A 4CJSA 4GNIA 2QA4N 3ID8A 4CEZA 1KAYA 1CLQA 3HI0A 1QS4A 1QTMA 4N47A 1L3TA 1N6QA 3RMBA 4FPAA 1NK7A 3WXKA 4JI5K 3NGYA 3K5NA 5LY3A 4BR4A 5CHIA 3ZLJA 3FFIA 3AAPA 3LZIA 1E4GT 3DYAA 4M42A 4B9MA 4LFAK 4BQLA 1RT5A 2A1SA 3KLEA 1TK8A 1ZC6A 3OYHA 4GMJB 2UUBK 1Y97A 3A5LC 4WQ5A 1N34K 4FJHA 3R3LA 5JVGL 4CHZA 3KWIA 1YJWN 3THWA 3THWB 1HKGA 3V9WA 4CEFA 1LWEA 3K59A 2G8FA 2HVHA 4CK2A 2IAJA 3AO5A 3J7AP 3SPYA 3F73A 1C0UA 4EFHA 4HTUA 4Z4GA 1FKOA 1VQON 1J5OA 1HYVA 4KKOA 4LC9B 3OYAA 3JSMA 2RE2A 4NXNK 1VQ5N 3SAFA 4FW1A 4H0OA 1RBUA 2HBLA 3D0PA 2O8EB 2O8EA 2W40A 2VYPA 5FPMA 1LOTB 5BR8K 4ELUA 1T03A 1DLOA 1JCFA 3PLAA 5GIOA 4JI0K 3UE5A 1FKPA 4A2AA 2G8WA 3G4SN 2ITGA 1YUWA 1NJXA 1NM1A 3VQCA 4DKWA 4H0XB 3ZT0A 4FM0A 5J2MA 1HYSA 3I0SA 5ELZA 4HTLA 2QWNA 4MO4A 5IT9O 5AQMA 3G6EN 3Q7BA 4FJ7A 2GWJA 1U2VB 3VOVA 3CQ8A 3ZT4A 2OCEA 4EP4A 1Z25A 4DTUA 3QEWA 1N8RO 1NJYA 2V51B 4IWVA 1XMOK 4CGJA 1RT1A 3V9UA 3WXMB 3ALYA 1CZ9A 3DOKA 4BR7A 4DLGA 3MCPA 3T1AA 3P39A 3LM9A 2E1YA 1B9DA 3WEEA 3TABA 2UXCK 3AVLA 4IBNA 1ZBIA 1RBSA 3E9PA 1L5UA 2HNDA 1RT7A 2E1ZA 3OS1A 3KWGA 1VQ4N 4LF4K 1DTTA 4KHQA 1JLFA 1UOCA 3P31A 4CJQA 3AO1A 3QETA 4MFBA 3TAFA 3L4QA 4WFAL 3ATVA 4B08A 1JLCA 3T1HK 4KHPK 3V4IA 5C0YA 4O8UA 4GV9A 4W5OA 3AV9A 1QQOA 5AQRA 3VMFB 5AQGA 2FLOA 5C15A 4WE1A 1D4XA 4DQRA 1T8EA 4BRCA 1EWRA 2ZF5O 2BDPA 3ZX2A 3TAMA 4CJTA 4LFCK 1KAXA 1BISA 1RT2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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