3FOKA

Crystal structure of cgl0159 from corynebacterium glutamicum (brevibacterium flavum). northeast structural genomics target cgr115
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
297
structure length
295
Chain Sequence
PPIISPESFEALRRMRAAEPTMVAERFKQRRKRELLGEDGKLFIVAADHPARGALAVGDNETAMANRYELLERMAIALSRPGVDGVLGTPDIIDDLAALGLLDDKIVVGSMNRGGLRGASFEMDDRYTGYNVSSMVDRGVDFAKTLVRINLSDAGTAPTLEATAHAVNEAAAAQLPIMLEPFMSNWVNGKVVNDLSTDAVIQSVAIAAGLGNDSSYTWMKLPVVEEMERVMESTTMPTLLLGGEGGPDATFASWEHALTLPGVRGLTVGRTLLYPQDGDVAAAVDTAARLVHTDI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Corynebacterium glutamicum
publication title Crystal Structure of Cgl0159 From Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium flavum). Northeast Structural Genomics Target CgR115
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein Cgl0159
total genus 82
structure length 295
sequence length 297
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3fokA00
2WSRA 1TO3A 2WQPA 4NUWA 4GJ1A 4N6EA 4JX4A 2ZTKA 3G3DA 3GB6A 3LCLA 3M43A 4NQ1A 3G1SA 3M6YA 3LRMA 4NJJA 1IGSA 4XUGA 2CLEA 1G4EA 1P4CA 3CIXA 1BWLA 5KITA 4CCCA 1K8YA 3QRHA 3VE9A 4A3UA 2E6YA 3KVMA 3FLUA 5AC7A 3GAYA 4UTTC 1KW1A 4RKAA 4UFJA 3W71A 3W7PA 2B4GA 4LS0A 3BV4A 1XCFA 3FEMA 1EUAA 4FXSA 1I45A 1FCUA 4HPJA 4Y96A 5K7JA 4MPQA 2QCFA 2CLOA 3P5YA 1YXYA 1VCGA 1I2QA 3BGJA 4O17A 3O6YX 1HTIA 3IIVA 4O1CA 3GNDA 3BW4A 3L65A 2TSYA 2VOMA 4NZJA 4CCEA 3PBUA 1KFKA 1XUUA 4GC4A 4GE8A 3P8IA 2GVLA 2ABBA 4HNTA 1LM1A 3M7WA 5CZSA 1QAPA 4WD0A 3DKLA 2A0NA 1OYAA 1XM3A 2CZEA 5D30A 4Z1BA 1AL8A 1YXDA 1EP3A 2B7PA 2OT1A 4BI7A 2RDTA 2YFNA 4CLMA 3LHUA 2R14A 5HUPA 1CX9A 3B0PA 1LBLA 3L5AA 1VPXA 3MHUA 3NPVA 1TREA 2WSYA 1X6UA 2O7SA 5CGQA 2NZLA 4RZ5A 1EA0A 4R53A 1PVNA 4O0KA 2EHHA 2QDGA 2EPHA 4RJEA 1DQXA 2E6DA 3A21A 4ZZ9A 1FWTA 2PRMA 1RVGA 1FUYA 3NPXA 4N9DA 3GDKA 4CQ9A 1JULA 1G6CA 5EL1A 4TR9A 3G0SA 1ZAHA 3BARA 3VCRA 5KZDA 2W6RA 3P62A 5FF4A 3C2FA 4BI6A 4UTKA 2GJNA 1XXXA 4UTLA 2QCCA 2Y7EA 3W7HA 4FB7A 4O13A 2J9XA 3TIMA 1JCNA 2QJIA 3P7YA 5HJLA 1ZHAA 3PULA 4FX8A 3NXFA 3MI2A 3T40A 3MWAA 1GVOA 1GPWA 4LS2A 1W3TA 4O18A 3W7NA 1SZNA 1MZHA 1OFPA 2WNZA 1LORA 1WDWA 2YFOA 4PEKA 3SIZA 3NL3A 5F4SA 5DLCA 1XL9A 2YX0A 1QO5A 2E6AA 2G5WA 4LU0A 1VLWA 3B06A 2TPSA 1SSDA 5DBUA 3NZRA 3TQVA 3QJAA 1EIXA 5T26A 1DKWA 3LRKA 3G18A 3DH7A 3N2XA 3C2OA 3GIYA 3W1QA 1KLZA 2Y63A 2QKFA 3TH6A 3SZ8A 3W7LA 4OBTA 2TMDA 4O16A 1QMLA 4EIVA 1SO5A 4IJBA 4AWUA 3GNNA 1TQXA 5D2XA 3A22A 2C1HA 4O52A 3TAOA 3W84A 4O57A 2QUTA 3DFPA 4QNEA 1LOSA 4UNKA 2WKJA 5LHFA 1W1ZA 3RU6A 3G1DA 2ZTJA 3NL5A 4WJEA 3EX1A 3B05A 1X7FA 4XKYA 1Z48A 3N3MA 1JR1A 3HPZA 2CLKA 4R33A 2YSWA 5D2WA 3TCEA 1GYNA 1Q3NA 3NA8A 4NJKA 2E1DA 3WK0A 1YTDA 5D33A 1KFCA 2DZSA 3HPSA 4YCOA 5K2ZA 1OFAA 3L2IA 4LTSA 4LC8A 3RF9A 3Q2DA 1LCOA 5AN7A 1OF8A 2QDHA 1EP2A 1X8FA 3TROA 4O19A 3WK2A 3U6WA 1F6PA 4UTWC 1PS9A 3BGGA 5HQEA 1G4TA 3HGSA 5FF2A 3W1RA 3M5YA 4M19A 4L4LA 3DFTA 3A24A 3EWXA 1VYSX 1R30A 4MVAA 5CSRA 1GZGA 3UY7A 1FBAA 1UJPA 1OFQA 2VFFA 3GAKA 4JX5A 4R34A 4UIOA 4OT7A 5EA9A 4Q32A 2GQAA 1H62A 2C6QA 3PBVA 2HTMA 4UTIA 3S1WA 1FQ0A 5G2HA 3UYCA 3H55A 5F2IA 3SSJA 1ZCOA 4AHPA 4S2BA 3S42A 3DBPA 1UCWA 3ANYA 3FS2A 3TAKA 3DXIA 1U83A 3TNOA 4DF0A 3STEA 3D0CA 2Y62A 2ZZ6A 5KTLA 1LRTA 3OVRA 3R5EA 4DEFA 1GVSA 1G7VA 2QCNA 3S1XA 1LLWA 4LRSA 4ADTA 4X22A 1YPFA 5AB3A 1QOPA 3TJLA 4AF0A 3BLIA 3GLCA 2C14A 4IUOA 3MO7A 4MFEA 4PCFA 1K7FA 5J5DA 1K3UA 4MZ1A 1VS1A 5BNKA 3N73A 3KAOA 2H8XA 4JY8A 1WYIA 2PRLA 2NWSA 4ALDA 2C13A 1X1OA 3I7SA 1OYBA 2G96A 4YCPA 4LVFA 4ZQRA 1WOBA 4DBEA 3U2OA 4W9TA 2CLHA 3DHFA 1VYPX 1H51A 1UB3A 1SQ7A 3NEVA 4K8EA 3QYQA 2PURA 2ZRVA 3BLEA 4JTEA 3TR2A 1P0NA 5LGXA 3LCHA 4NNCA 4ZQCA 1K7EA 1TB3A 1LZOA 1ZAIA 2FQIA 2I9EA 3P80A 4FHAA 4A21A 2E68A 4O0ZA 1GVQA 2NWRA 3PB2A 2AGKA 1OK6A 4FF7A 5E93A 3P8JA 5AHNA 1SR9A 4Z08A 4KFOA 4N4QA 4EVZA 1DQWA 3JRKA 3ATZA 3TU9A 5AC6A 3R8RA 4IQLA 1TPVA 4A22A 2DU2A 2B7OA 3GDLA 4FNTA 1ZNNA 4JTFA 1TTPA 2Y6ZA 3L5MA 3ZWTA 1SW7A 1JCXA 2FPYA 3TW6A 4OQVA 3TXVA 1ME7A 1IXPA 2ALDA 1IXNA 1H7PA 4JTTA 4ML9A 4PL1A 5G1YA 5DCDA 1SPQA 1EPXA 1KV8A 2I14A 4Y9AA 2GJLA 4H6KA 1VC4A 1LTDA 3LBCA 3W85A 2E09A 2DJXA 1TCDA 2QJHA 2QR6A 1S5VA 1S5TA 4MLJA 1T99A 3EX2A 1GEQA 1OK4A 4QNWA 3SGUA 5HWNA 2A5HA 3M1ZA 3BLFA 4K8HA 3HG4A 2CZFA 2A1YA 5D03A 1TQJA 3GR7A 2Z6JA 4HKPA 1OABA 1VCFA 3L0KA 3QW3A 3C56A 3MP3A 4IOTA 4ADSA 4AHOA 3W7OA 1S3HA 3LLDA 3HOJA 3S1UA 3EX4A 3IIXA 1G7UA 2ISVA 2A2IA 3O6DA 5CZ0A 3C2VA 3GDRA 1H7OA 4HNVA 4IMEA 5HMSA 5I3KA 5D02A 1FX6A 1NVMA 3N14A 2YW4A 1A5AA 3DU0A 2Y7DA 5HWJA 3N9RA 4MLRA 1A5BA 3STGA 2YPIA 3W9ZA 1N55A 4H4IA 4PH6A 1KM3A 4FNRA 3CTLA 1LRQA 3CLMA 5FESA 3LERA 4XKYB 3DENA 1K7XA 3KRSA 2ZRWA 4RCXA 1J4EA 3QEZA 3O15A 1B4KA 4NXSA 3W2UA 4DXVA 1TIMA 1CI1A 3NPUA 1OG0A 1PV8A 3SGZA 4IX2A 3C3NA 2E5DA 3U8GA 2QCMA 1QCWA 3GYEA 5FEWA 4S1FA 4K36A 2CLFA 3L66A 1ML1A 4HNUA 3B0VC 1RQEA 1JCYA 4GXMA 3PSVA 3L5LA 1F6KA 5AOUA 4FX6M 4MJMA 2JGQA 2QCHA 5E0KA 5J5RA 1M6JA 3LM7A 3QQ0A 3HG2A 4DO5A 2HS8A 3G3MA 4UTMA 2O7QA 5EPDA 1QPOA 1MEHA 2OX1A 2Y85A 1VR6A 1QPRA 3W1NA 2VFHA 4MY8A 2B0MA 3IVSA 4UUIA 3F03K 3PM6A 2BWGA 1TV7A 4HIBA 2HSAA 4IXHA 2JBMA 3W07A 2FPVA 3NQGA 1RPXA 3IEBA 3MBDA 4NNBA 2RH9A 3GX9A 4AF0B 3C8FA 4PA8A 2ZZ7A 3Q94A 1DJNA 3BG5A 2YW3A 1KLYA 1C8VA 4HT3A 5D2YA 3A23A 2FFCA 3WJWA 4O8RA 1EWDA 5DCEA 2ZFAA 2B7QA 3AO0A 3KXQA 4MZYA 3VFLA 3PUDA 3QMSA 1F76A 2R91A 2ISWA 2FPTA 2ZZ1A 4ONVA 5CSSA 5LNWA 3G1XA 4X3ZA 4EWND 2JK2A 1U5JA 3I68A 3KRUA 1UBSA 3W7RA 1V7YA 3O63A 3T4CA 4YMZA 3W1XA 4FIQA 4IPIA 4JICA 3S5YA 5HR6A 1AG1O 3LBMA 3S5ZA 1OX5A 2QF7A 3W7JA 1OX6A 4MUZA 1LRNA 4OWGA 2FJKA 2FTPA 3NQ2A 1SSGA 1W3IA 3L68A 5LNRA 3UQNA 4QISA 3TC6A 4JXCA 2YR1A 5G2IA 4BK9A 1ZY9A 5F2LA 5SWUA 1FDYA 5K9DA 2YCEA 4KWVA 4YWIA 1WXJA 3G0UA 3IIPA 1KFEA 3O8AA 3PR2A 4E0CA 2CW6A 4EF9A 3ZS4A 4BF9A 2NX1A 4XTIA 3NL2A 5GVJA 3L21A 3OG3A 2V8ZA 4K6AA 4LVGA 4WX2A 5CPLA 1YPIA 2E5BA 4JDYA 1WOAA 5C55A 1TJRA 3C0JA 3EB2A 3M5ZA 4L4MA 3UWWA 3QC3A 2X1TA 1QWGA 4E38A 3O1NA 4J9JA 5DY2A 3EXSA 2VXNA 1FCVA 1QOQA 2RDWA 4LV4A 3F1QA 1QNVA 5AFDA 5LHEA 4I9AA 2NUYA 2DZUA 4Z0JA 1QPNA 3S8HA 3TSBA 2ZRYA 1OF6A 5AHEA 3UXDA 2V9DA 3G1VA 3EWYA 3S5NA 1G69A 1MXSA 4TMBA 3C2EA 3E12A 3HF3A 2C16A 4WXZA 5BMWA 2QEZA 3P84A 1LROA 1TSIA 4KWWA 4CQAA 1ADOA 2WNQA 3GDMA 4H3DA 4NT0A 3IIOA 1WV2A 4PFMA 2X1RA 3KHJA 4RLIA 3W86A 3CQ0A 3UWZA 4DF1A 3DFNA 3NNTA 2J9YA 3WJZA 2X30A 2DZWA 1TV5A 1O94A 2RHGA 1QPQA 5A8GA 5H91A 2Y7GA 1AW5A 4UXDA 3W1AA 2GUUA 2BTMA 3EX3A 2DP3A 3OHIA 5D05A 1FWSA 5D2TA 3ATYA 3LI1A 5CZTA 1GT8A 2P10A 3MMTA 3O16A 5KZEA 5DY3A 4AH7A 3CPRA 1B3OA 1DVJA 3K30A 3W2NA 3IGXA 3E49A 3EXRA 3L67A 1SFLA 3O07A 1JUKA 1GYLA 1Q6OA 1EEPA 3GK0A 1ZALA 3PSWA 3E9AA 4MZ8A 2PRHA 1TJPA 5FF7A 1F5ZA 1KM5A 1XBZA 5G4WA 1P0KA 2P1FA 4DELA 4LV9A 1A50A 3HGRA 4MKNA 1H60A 4IXXA 1HL2A 5A5WA 4PL2A 1Z44A 4GUFA 5DCBA 3PBWA 4GUJA 4EF8A 3AJXA 3W75A 5I3HA 2Y61A 3NQMA 5CG7A 4DO6A 1DHPA 2X1SA 3LTSA 1C9DA 1YDOA 5L9FA 4FNUA 2FIQA 2A7PA 3UWUA 1LLZA 1YLVA 3PG9A 3ABSA 4Y8FA 4UMCA 3HG3A 2A21A 2QUUA 4Q33A 1IIHA 2H90A 4KFPA 1MSSA 1JCMP 5D09A 3EX6A 4JDBA 4NX0A 2JKAA 3TQ0A 5F2GA 1VH7A 3W76A 3TK7A 3LHTA 2EGZA 4PC8A 2J88A 5FF3A 2EAWA 2ZA2A 2XFWA 4RZ6A 4TMCA 1K03A 1UASA 1KTCA 5F1UA 4MY9A 3MI6A 1H1YA 5F1VA 1ONRA 5C2XA 3USBA 5CPOA 3NAVA 3P60A 1W5PA 4FNSA 2V30A 5AYZA 3LX9A 1AK5A 2JKEA 6ALDA 3L9CA 3W7QA 1KV5A 5HR7A 1JQXA 1H1ZA 3FIGA 4OHQA 4UTTA 5IBXC 4N9CA 3W1UA 4RK8A 3QSTA 1THFD 6TIMA 3CIWA 4IMGA 4JTJA 3I7QA 4QIUA 1GTEA 1F73A 4NZFA 1R47A 1VLIA 2Y89A 4NU7A 4UCGA 4LWWA 3SECA 3BO9A 2C19A 1XBXA 1OFEA 1R46A 2Q3RA 3CWNA 4JX6A 3T44A 4ADUA 1JVNA 3V75A 1BEUA 3HMJG 2GQ9A 5FEXA 3F4WA 4LS1A 3LLFA 3DFOA 4ZQOA 1FXQA 4GFSA 1CW2A 2DZPA 4HHPA 1LYXA 3DFQA 1FWRA 1TPC1 2H8ZA 2WSQA 1N8FA 2A6LA 2CLIA 3EWZA 2I1OA 4O4VA 3S6DA 4FNPA 1V5XA 4A2RA 4RXGA 3GZ3A 3M44A 5K9XA 1R2SA 3V1PA 2HMCA 2DZXA 2E5CA 3QW4B 3LHVA 4O14A 4JIQA 5K3VA 3M16A 1JRBA 4RZ4A 1W5MA 1L2UA 2BSLA 3LI0A 3PY2A 3TW7A 3LV6A 2NV2A 1PL9A 3W3OA 2C18A 3NM1A 4LOCA 3W23A 3LXAA 4AAJA 4MJZA 1GOXA 2ATMA 1P5BA 3W70A 4ZQNA 1WX0A 3KX6A 1H50A 4GRSA 5LKYA 3GXTA 1W5QA 4WUIA 4JN6A 4I7WA 2H6RA 3DZ1A 1EP1A 3W1LA 1OX4A 4IPJA 3ELFA 1NF7A 1SO4A 4O1AA 1FWWA 2R94A 4IMFA 2BLEA 4NJIA 3W83A 1KBJA 4YL2A 5CPNA 3I65A 3PUEA 4B5NA 1VYRA 1WAUA 3PVFA 5ABTA 4WY0A 2PE4A 4RX0A 2VKZG 4BR1A 4QJ1A 4QQ3A 4U28A 1SZGA 1H7NA 3R12A 1IXOA 2Z0IA 3EWBX 1DJQA 1TRDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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