3FV1A

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with dysiherbaine in space group p1
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 89
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fv1A02
1R9LA 1ZKBA 2QS2A 2ZNTA 1B3GA 1XHYA 1SW4A 4NF8A 2P2AA 2PT1A 2XX8A 1VR5A 3ODBA 2F34A 2PT2A 2UYFA 1IQ7A 3V8XB 1JETA 3SEVA 4U1ZA 3S9LC 4ZEKA 2DXYA 5I84A 3FZVA 1MQJA 2XXHA 2CZLA 3TODA 4F1YA 3ZS6A 5HPQA 5F7VA 5ICTA 1DOTA 3IO4A 1B9JA 4ELRA 1UTBB 4H5GA 2VGQA 5I57B 1LAFE 3S9NC 3GZGA 2ZYKA 2ONRA 1B3FA 5AA2A 3K6XA 3A3UA 1JW5A 3TQLA 4QSCA 2REJA 3SETA 5IKBA 1LCTA 4P0GA 4G68C 4EQ7A 2UVIA 1JW4A 3R7XA 1MQGA 2F35A 2H99A 4GVOA 5CC2A 1MQDA 4WEPA 1AMFA 4H67A 3SDFA 3BFTA 2OBGA 3LSLA 2GFEA 4F2OA 1IXCA 2ALUA 5L9OA 4GXAA 2HQ0A 2DVZA 2YPNA 3SEUA 3M3KA 2PVUA 4U2RA 4OYVA 4YKJA 4NMYA 3DP8A 3O6GA 3V5AA 4LONB 4R9FA 3K4UA 2I3VA 2XXQA 4JSDA 3R6UA 4Q5TA 3PMXA 5ITOA 2REGA 2XXYA 3CIJA 4LQ2A 5KDTA 3KFMA 3TTNA 3H4ZA 1MDQA 1NNPA 3I3VA 2RC8A 3VDFA 3RPWA 4K3FA 1A54A 1B1XA 1P99A 3ZSFA 2HAVA 1ZMGA 3VE1B 5H8QB 2I0BA 2UVJA 3MP6A 3Q29A 4EXKA 2H25A 4R2FA 4FORA 2FNCA 1Q35A 1MRPA 1US5A 4DLDA 3RNNA 4Z7EA 1JNFA 3PUXE 3OOAA 3G3FA 3IOVA 3FXRA 3PPNA 2QRYA 4BDLA 2PBWA 4MBPA 3LUYA 4R6HA 1D4NA 3FATA 1DSNA 3PUYE 2A5TB 5B7DA 1IZ1A 5DYHA 1B4ZA 3VLUA 3IORA 1A8FA 1N0TA 4ND9A 4THIA 4GLIA 4KYEA 2HZLA 4G77A 2I0CA 1IITA 4GIZA 1QKAA 1DPPA 3HN0A 4L17A 2HEUA 1NNTA 1N84A 4KHZE 3IJOB 2Z22A 1XT8A 1MXUA 4H8JA 1UTHA 1Z7ME 2Z8FA 4F3BA 4YAHX 5TPAB 3KN3A 2DQVA 3HSTA 3RY3A 5I58B 4XKNA 4OESA 4JDFA 3H06B 4NE4A 1FQFA 1O63A 2R71A 3SEWA 4WEDA 1P1OA 1ANFA 4IO3A 2H9BA 5I59A 1JEUA 3GBBA 1FQBA 3MP8A 1N7WA 4ZDMA 1LB8A 4FE8A 4R9GA 1TT1A 1WODA 2F5XA 4KR5A 1D9VA 3C36A 3EN3A 3ZKLA 3TCFA 2OLBA 2Z8DA 4RPOA 4RK9A 4H0WA 4KYSA 1OMPA 5H8NA 3PMVA 4EF1A 4G2ZA 3HO7A 2Z23A 4DCYA 3Q25A 3F11A 4LP2B 3OO8A 5FTHA 3OENA 3UORA 4DIGA 3ILUB 3MP1A 1POY1 3MVYA 5EHMA 2F97A 3O29A 4IY6A 2QMXA 2D21A 1JVXA 5TP9B 2QS1A 4BDNA 4I9DA 5DEXB 3FUZA 3TUSA 4C0RA 1RKMA 1UIUA 3CFZA 3TDJA 2DP8A 4ELQA 1B5IA 3T9VA 1USYE 3PD9A 1B0HA 3VVFA 3RGYA 1URGA 5CI5A 2RKMA 3D4CA 3M3FA 2Q2AA 1H44A 1QW0A 1TWYA 3MPKA 2HCAA 1B7UA 4BLAA 4YB5A 1S9TA 4MFIA 5I56B 5AE4A 4ZZAA 3O6HA 5K2XA 3MAMA 3EQ1A 4ELOA 1MM7A 3HV1A 1I6QA 4IO5A 1MS7A 1N7XA 1SYHA 4JB7A 5M2VA 3FGSA 2O1MA 3K6VA 1UTBA 3K01A 2ONSA 3H6TA 3RTWB 3VFJA 4G8NA 3O66A 4Q8RA 4KQPA 2DVCA 1ZLQA 4AQ4A 5H8FB 2PYYA 1Z7NE 2GRVA 4R72A 1VFEA 3KG2A 4IGTA 4HS7A 3QUFA 2V3UA 5CBRA 2PMSA 1XS5A 4H6DA 4R6KA 4YU0A 1MY3A 3V89B 4YZZA 3KJ7A 2O7UA 1PC3A 4OXVA 2DOJA 4E0XA 5LOMA 2UXAA 4U22A 4C1TA 4HCWA 1ZU0A 1MXWA 4N6PA 3E13X 2XD3A 1HSJA 4OETA 2I6EA 4OFOA 2Y7IA 3TTRA 1PB8A 1Y9UA 1QUJA 3FJGA 3B6WA 1KWHA 1N3WA 2RINA 2I49A 4O3BA 2P1SA 3EHTA 3UP9A 5BWJA 5F1QA 3VXCA 3TKDA 4OQOA 2GHBA 3TFLA 3LSFB 3JZJA 5H8QA 4I1DA 4U4XA 4DCXA 3N6UA 4HTGA 2DS9A 4PFUA 3CSBA 2ZYNA 1POTA 3CFXA 1ELJA 3H03A 1R9QA 4YMAA 5ISUA 1II5A 4IO4A 3SESA 5AA4B 2XXVA 5CMKA 3B6QA 2XXTA 4XTCQ 3I6VA 5EHSA 3MW0A 3U92A 1GVCA 3K1PA 3W9WA 2A5TA 3IK6B 4YB7A 3H6UA 2F7CA 2CMOA 4M4GA 3O2AA 1SVXB 2O6AA 5KZTA 4ZECA 3PMWA 2E1SA 1NNFA 4G8MA 2XXUA 1XOCA 4R75A 1CB6A 4FIMA 2QS3A 4EDPA 4LZ8A 1B32A 3CG1A 3EHUA 4PFYA 1M5CA 5FHOA 5DT6A 3MPLA 2V3TA 2AL4A 4JXIA 3EPEA 1VSOA 3MVZA 5TPAA 3G3HA 5TU0A 2OWTA 5I58A 1MPCA 2WKYA 3MBPA 1LBCA 1B5JA 2X7PA 5FTIA 1OVTA 2Y7KA 4N13A 3W9VA 4QSDA 4P11A 4KYDA 2VHAA 1IIWA 3EHSA 4OEVA 3RUMA 1MY1A 4XXUA 2B3FA 4AB6A 4MLVA 3FV1A 1BIYA 1VE4A 3DLNA 2NWJA 4R6YA 3UN6A 5H8HB 2G29A 4H8IA 2NVUB 4OEUA 1ATGA 3KZGA 2ZYMA 3C34A 3C4MA 3T66A 2D5WA 1FTKA 4DDDA 1LFHA 5IAIA 1FTMA 4XIGQ 4BDOA 3S2VA 2Y7PA 1R1NA 1IEJA 1B40A 5JEIA 1BLFA 1LLSA 1PEBA 1B5HA 1B52A 1LAXA 2DWAA 4Q30B 1B3LA 3QUJA 3IOTA 3U94A 5TP9A 3KEIA 1EZPA 1M5EA 2V84A 4QFNA 4GL8A 3MUQA 3FD3A 2O84X 5ITPA 1GGGA 5DEXA 1BTJA 4OERA 2X26A 3OEKA 3THIA 2I48A 3CVGA 3C9HA 4HCYA 3TCGA 1H45A 1XVYA 4XKQA 5HM4B 5ELVA 5JK4A 3T9HB 1A8EA 1AH5A 1GTKA 2O68A 4TLMB 2ZYOA 4GXSB 4ELPA 4U23A 5KCJB 5I56A 1LBBA 5I2NB 1OLAA 2A5SA 3JV9A 3K00A 3OEMA 3OD7A 3IAZA 5DTBA 5AA1A 2H4IA 2F6PA 3U8QA 1XC1A 3K1MA 4X1DA 1LAHE 1EU8A 4NF4B 4ESXA 4ZEDA 3ECRA 4YICA 2PX1A 3W15C 4H5FA 4RYAA 3HPIA 1QUKA 5HBCA 2D3IA 2AL5A 3H7MA 2I4CA 2F78A 3S9EA 1MXZA 1Y3PA 4PE5B 4XKPA 4NF6B 1O7TA 3VVEA 3C31A 4IB2A 3KSXA 2DWIA 1T0KA 1Y3NA 1B7HA 4POXA 2IEEA 2VOZA 3O97A 2R9JA 2ZNUA 3PPRA 3N26A 5CM6A 4JWOA 3MQ9A 3UK4A 2UVGA 3D4GA 4EF2A 1OVBA 4NF5B 1QJMA 2HZKA 1I6AA 5EYFA 3P7IA 2XXWA 2G93A 1SD3A 1URSA 4OMBA 3K0VA 3MVXA 4U4SA 2VD3A 2DXRA 1QUIA 1SDXA 2W7YA 3FXQA 4OENA 5L9MA 3B6TA 2OJTA 3PD8A 1YTVA 1P1WA 2H5YA 2QPQA 3BBRA 4BDMA 1MXVA 4KFQA 4H1XA 1M5FA 1Y20A 4ZEBA 3CFLA 2QJEA 1N04A 3MZBA 4F2QA 1Y4CA 4YB6A 4U21A 5DVFA 4G4PA 3DELB 4LUBA 2NXOA 3OSQA 4FAJA 3DP4A 3CSGA 3SERA 4F19A 4FEDA 2O1LA 2O51A 3WAFA 1BKAA 1J1NA 4ZE9A 1MY4A 3B7DA 1ZTYA 1FQEA 1PB7A 4GL0A 3IL1B 4JWXA 1EH3A 1N76A 3HHGA 4F39A 1DMBA 4OVJA 2AIXA 4RXLA 2V3QA 1FTOA 1UTHB 1D3KA 5A5XB 5I57A 3FJ7A 3GLBA 2F7AA 3ONMA 3OO9A 3LSXA 1ZIUA 1JEVA 1B1HA 4QSEA 4PQJA 2RF1A 3MJNA 3H3GA 3TPAA 1NH8A 3OMBA 4OHNA 3L6HA 2NUVA 3VXBA 4Z0IA 3T93B 1MG1A 3E4RA 2THIA 3K6UA 2YJPA 1RYXA 3FVNA 5AA3A 4FATA 3VVDA 3KBRA 1MPBA 3RT8A 4QFLA 2IA4A 1B6HA 3PU5A 1N3XA 4H65A 1SQYA 3TQWA 3E9XA 3TELA 4HW8A 3C33A 5H8HA 4KI0E 2P0SA 4BDRA 4GFRA 1Y3QA 3ZKKA 4DXUA 4M1VA 4X48A 5I2KB 4GQOA 4IO2A 2Q8JA 1YAEA 3QK6A 3G3JA 2RCBA 3C35A 3FJMA 3FXUA 4EQBA 2F36A 1US4A 1USYH 3LSWA 1BP5A 3M8UA 1DTZA 4G68B 5JTYB 1RYOA 4KD5A 1TXFA 2B65A 3TTLA 2UYEA 3VLVA 4G8HA 3G3KA 1B05A 3TTKA 4IY5A 2Q2CA 2X7QA 3KSJA 1QVSA 3T9XB 1A99A 1H76A 3CR9A 1MY0A 4I62A 3IX1A 4JBZA 1NFTA 2I3WA 3IR1A 3TAJA 4P0IA 2ZNSA 2HAUA 1SW1A 4DE8A 1B58A 1UIVA 1I69A 4PFWA 1JW1A 3IOWA 4DXBA 3Q27A 5KCJA 4IO6A 4U1OA 3N94A 5I2NA 1MH3A 5FHNA 3O6IA 4N07A 1PBPA 4YKKA 3U72A 1Y1MA 5CBSA 4GF8A 3A09A 2UVHA 3MVWA 1HSLA 2F8DA 4YKIA 1B2HA 4DZ1A 4NF4A 4FEBA 2ZXTA 5B70A 1MQHA 3UA8A 3ILTB 3K6WA 3V83A 1FQDA 1WDNA 1Y4TA 2ONKE 2FYIA 3FVGA 5J1DA 3CRBA 5CMMA 3JYRA 2Y84A 3HCQA 3IOUA 4NF6A 3EF7A 3A3CA 3PPQA 1NMUA 5ICQA 4NTLA 2XX9A 1P1QA 2GH9A 3OO7A 2YLNA 3MWBA 4KCDA 4IO7A 1LFIA 2LAOA 3SKPA 3IO6A 5BUUA 1M5DA 2F6GA 3PPOA 3IJXB 4PP0A 4NWDA 1B46A 3PV0E 3QYTA 4QHQA 4C1UA 1NNKA 3R26A 4NF5A 4F1UA 3FVOA 5CMCA 3H6WA 2HXWA 3AXFA 1CE2A 3TZAA 3DM0A 3DP6A 1AOVA 2XXIA 3TYHA 3UIFA 2DE4A 3U93A 3UGWA 2NOOA 1F9BA 4BDQA 3KJTA 1SI1A 3QIMA 4DXCA 1FW0A 1FTLA 4TQUQ 2OZZA 1P1NA 3PUWE 3LR1A 1B4HA 1JVYA 4R2BA 3QSLA 3MZ1A 2RC9A 4JWYA 2OK2A 3Q26A 2RC7A 4LZ5A 3N6TA 3FASA 2Q88A 2O7IA 1S7YA 2FA7A 3SEYA 4NF8B 2H98A 3OO6A 5L9SA 4GWOA 3FIRA 2VP1A 4POWA 5DVIA 5AA2D 5H8SA 2VD2A 4QF9A 1LAGE 3G3GA 4XKRA 3VV5A 1MXYA 4QFPA 1QULA 1Y1ZA 1MDP1 3FV2A 3Q28A 3RT6B 4ESWA 4F1VA 4YKPA 2O69A 1LGBC 3K02A 5AA2B 4R73A 3KN8A 2DE2A 5A5XA 2DYXA 2M8CA 3L6GA 1PDAA 3IB0A 4KCCA 3RTFB 1MH4A 3T9UA 5H8FA 2QSXA 1A40A 4FECA 1B7ZA 1NL5A 2QL3A 3C32A 4MF3A 1FCKA 2DE3A 4F18A 4UACA 4QFKA 1UQWA 4LZ7A 1A55A 1MM6A 1TFAA 1FTJA 1DPEA 2QS4A 2DWJA 1LB9A 4I8CA 1B0LA 4PETA 3OXNA 2XX7A 1R6ZA 4OFLA 4ZEFA 3USDA 3S4UA 2ABHA 4OFJA 5L8DA 1JQFA 4RA1A 1O64A 3M3LA 1FQAA 1LFGA 1DTGA 1GR2A 1FQCA 2V25A 4F31B 4AB5A 1OLCA 1S50A 1QKBA 3K2DA 4O3CA 1P1UA 5KDTB 2XHDA 3CI8A 3I5OA 3WAEA 1B51A 4JSOA 4TOZA 4LQ5A 4ECFA 1D9YA 1TFDA 2BJJX 2DSFA 4Q0CA 1LSTA 3OELA 3G7WA 5I2KA 1VFDA 1I6BA 1SBPA 3N5LA 1H3DA 2XXPA 4WXJA 4RK2A 1URDA 4NEDA 1SW2A 3OSRA 2XD2A 5CMBA 1SI0A 2ESNA 4ZZEA 3G3IA 3CG3A 3TCHA 1EZOA 1YCJA 1MXXA 2I4BA 1Q1KA 4G68A 5JTYA 4F29A 4EUOA 3MZ9A 5AA4A 1MPDA 1A7LA 3K1NA 3LC8A 2R6GE 4OTEA 3QXMA 4X9TA 2E0SA 4R74A 4F3GA 3KN7A 2Q9TA 4MLQA 4KPTA 2Z8EA 2HFBA 4O3AA 1WVJA 1IXIA 1PB9A 4NWCA 5DVJA 4LATA 3S9MC 3H6VA 3O28A 3KGCA 2OWSA 2XXRA 3FVKA 3IB2A 3GBAA 4LVQA 3PPPA 3HHFA 1HSEA 3KOTA 3TMGA 3IB1A 4RPNA 3T22A 4OZ9A 2OCUA 3E3KA 4FJPA 3T96B 4F22A 2B3BA 1M5BA 2KLFA 1OQHA 2XXXA 3KOSA 4IGRA 5I59B 4RNSA 4TLLB 4ZEIA 1SW5A 1OQGA 4F3SA 3BFUA 1EZ9A 1ZJLA 4QFOA 1IXGA 1YPNA 1H43A 1GV8A 1NKXA 1L5TA 4ISUA 4E0WA 3MC2A 4RJZA 1IXHA 3O9PA 4OWDA 3PUZE 4GRKA 3TTMA 1IUDA 1B3HA 4MH5A 2F7BA 4PFTA 4WKMA 5H8NB 2ZMBA 3GXAA 2V93A 2ANJA 4X1BA 4LA9A 2Q89A 4YMBA 4EQ9A 3PGFA 4GOTA 1NH7A 3QAXA 4GD5A 2GHAA 1LCFA 5K2YA 1AL3A 2AYSA 2I58A 3RN8A 4RY1A 3TEPA 3RQTA 3RLFE 5CRYA 1MY2A 1MQIA 1AIVA 3VLWA 4ZS9A 1PBQA 4ZE8A 2RCAA 4F3PA 3U1OA 3LBSA 3SEXA 2Y7WA 2QMWA 1OIBA 4QRZA 4ONYA 1XVXA 2DWHA 2Y7RA 1B3EA 3BKIB 5FHMA 1ZBMA 4UA8A 4EXLA 3PUVE 1SYIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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