3FVGA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with msviii-19 in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvgA02
1MM7A 5FHNA 3T96B 1ZKBA 3G3IA 2I49A 4NEDA 4IO3A 3TQWA 4PP0A 4JWOA 3KGCA 3JYRA 3OOAA 5DT6A 1IUDA 4F3PA 2O68A 5H8QA 4EQ9A 2O51A 3K1MA 1QULA 3L6HA 1JETA 4U23A 1Z7NE 3QYTA 1JEVA 1ZJLA 1BLFA 4UACA 1OLAA 3FJ7A 4ONYA 2XXPA 2WKYA 2Z8EA 3S4UA 3N26A 5F7VA 1P1UA 5CMBA 4ZEDA 1UTBB 4TLMB 2A5SA 1MQHA 4RPNA 2DVCA 3VE1B 3N6UA 1MXYA 1Z7ME 3PD9A 5ELVA 5AA4A 1DMBA 3GBBA 5TP9A 2Q89A 4JBZA 1ZU0A 3MVZA 3U94A 5TPAA 3I6VA 4G68B 3HN0A 3OEKA 3EF7A 2F34A 3KN7A 4X1DA 3SERA 3IB0A 1QKBA 3VLWA 2V3UA 2ZNUA 4FJPA 4BDNA 4F18A 3P7IA 1QJMA 2R71A 1WDNA 1XVXA 1EZOA 3PPPA 1XC1A 3IB2A 3GBAA 3BBRA 3ODBA 1B0LA 3WAEA 2A5TA 2ZNSA 2O1MA 2DE2A 2ZXTA 3FXRA 1N7XA 5I2KA 3TUSA 1A8FA 2Y7WA 1NMUA 2Z23A 3G3JA 4BDOA 4OETA 1SDXA 4IO6A 4OESA 5CM6A 4BDQA 4YKKA 1UIVA 1NNFA 3H6WA 4TOZA 3PMVA 3T9VA 2F8DA 1VFEA 1XHYA 3KSXA 2H99A 4H6DA 3MP1A 3UA8A 5JTYB 3CVGA 3DELB 2UYFA 1B3HA 3KSJA 4IY5A 4F3GA 4XKQA 4DDDA 4F19A 2IA4A 3K6VA 2DE3A 4LUBA 4KCDA 3UORA 2Q2AA 2XXQA 1P1OA 4OXVA 1MY1A 4H8IA 1QUKA 2Y7IA 2DXRA 3FVNA 3EPEA 3FIRA 2HCAA 1LB8A 2I58A 4P0GA 4RY1A 3WAFA 4NF4A 4G68A 2O7IA 1AOVA 1MH3A 1LAGE 4UA8A 5ITOA 4BDLA 1FTOA 4GF8A 4PETA 1O7TA 2F78A 3O28A 3RUMA 3K1PA 3RNNA 4Q8RA 4U21A 2F7CA 2F7BA 3EN3A 1IITA 4ELPA 2XXVA 4GVOA 2ONRA 3AXFA 3USDA 4GFRA 1LFHA 4FAJA 3RLFE 1GTKA 2XX8A 1MXUA 2O69A 2RC9A 3MPLA 4RA1A 4R72A 1D9YA 3BFTA 3ZSFA 3SDFA 5K2YA 4GL0A 5I2NA 4MBPA 1H44A 4M4GA 1O63A 3C31A 2PT1A 1WVJA 3IL1B 1M5CA 3C32A 3VV5A 2BJJX 1JQFA 2P1SA 4R2FA 1WODA 1ELJA 3B6TA 3FASA 2OCUA 4EQBA 2P0SA 4KFQA 1MQJA 2I3VA 1I69A 1MXVA 4GD5A 2R6GE 4LQ5A 4KI0E 4JWXA 3LBSA 4YKPA 1SYIA 1IQ7A 5JTYA 1FQFA 1LB9A 1B7UA 4OVJA 3KEIA 2IEEA 5FTHA 1VSOA 3G3KA 2I4CA 3VVDA 2V25A 3VVEA 3N6TA 3RY3A 1MPCA 2F6GA 5CBRA 4QFNA 3OENA 2XX7A 4DIGA 2X7QA 1P1QA 3TTNA 3O2AA 3B6WA 5CC2A 3W15C 3OMBA 4F3SA 2RCAA 2Q9TA 3CSBA 3PUWE 1ANFA 1MXZA 1SVXB 1ZLQA 3I3VA 2I48A 5DVJA 1B4ZA 4OHNA 1B40A 1PB9A 4U4SA 2H25A 5EHMA 1NKXA 3H7MA 4WXJA 4NF8A 3CFLA 4LQ2A 1URGA 4YB5A 5I58B 4OMBA 1JW5A 1OLCA 5KDTA 5I59A 4R73A 2YPNA 3UP9A 1LSTA 3V5AA 4DXBA 3KFMA 5DYHA 4H1XA 5H8NB 3K02A 4DXCA 1SBPA 1Y1MA 3OSRA 3TDJA 4E0WA 4R6KA 4IO5A 3C33A 4I9DA 4BDRA 3IAZA 4I62A 4ELOA 1A99A 3PUXE 1VFDA 5KCJB 5AA2A 3K1NA 2QS3A 3TYHA 3FV1A 3TTKA 5DVIA 2V3TA 3IO6A 4G8NA 3MUQA 4H0WA 5FHOA 1NNTA 1II5A 2HZKA 3IOUA 3LC8A 2G93A 1QUJA 4F31B 3O29A 1Y3PA 1D4NA 2UVIA 2OWSA 3SEWA 3RTWB 1XVYA 4QFKA 3H6VA 5M2VA 5ITPA 5L9OA 2DSFA 4QFPA 1IXIA 3K00A 3PPNA 3FVGA 3UIFA 2Z8DA 3M8UA 3ONMA 3JV9A 3MW0A 1TFDA 4ZZAA 1H45A 1BP5A 3IJOB 4ESXA 2QS2A 2X7PA 1SI0A 4U1OA 4F22A 4F2OA 3N94A 2AL5A 4ELQA 4HCYA 1USYH 3OO7A 4AB6A 2PVUA 5A5XA 3IX1A 4IO7A 3CR9A 4ELRA 1Y9UA 4QSCA 4MLQA 4WEDA 1AIVA 3G3GA 5AA3A 3RT8A 1DPPA 4XTCQ 2DYXA 5H8NA 4QFLA 4BLAA 2DP8A 1QKAA 2B3FA 2OBGA 3EQ1A 1A8EA 3TMGA 2QL3A 2Y7KA 3FGSA 2ZYKA 4PFWA 1JNFA 1FTJA 3UGWA 3T9XB 3RQTA 3FZVA 3IB1A 2NOOA 3CI8A 5BWJA 4KYSA 1B46A 2DE4A 3H4ZA 5HM4B 3T9HB 4OFJA 1US5A 5IAIA 1LFGA 2QSXA 4OFLA 4ECFA 3FJMA 1L5TA 4L17A 4XKPA 1NH7A 3EHTA 2XHDA 3IO4A 3PUVE 5HBCA 1FQBA 1IZ1A 2XX9A 2DWAA 3HPIA 1Y4CA 3F11A 4QRZA 4AB5A 5FHMA 1P1NA 4FEBA 2GHAA 3OO6A 1IXHA 4F1UA 1JEUA 2P2AA 1YCJA 3C35A 2AIXA 1B3GA 4ESWA 3O97A 3FVOA 5DEXB 3D4CA 1Q35A 4FORA 3PMXA 3HHFA 3O6IA 2ANJA 1USYE 1RYOA 3SKPA 2VGQA 4U22A 4E0XA 5B70A 4YAHX 1N7WA 4GOTA 4G2ZA 1URDA 4H8JA 1LAHE 4NE4A 2DWHA 4ZEIA 5H8SA 5I57B 3TCFA 2AL4A 2DWIA 4F1YA 4RXLA 1MXXA 3LUYA 4FECA 4DZ1A 3QAXA 3TPAA 4OZ9A 3ZKLA 3EHSA 3VVFA 2F7AA 2RKMA 1DSNA 1EZPA 3E9XA 2F5XA 2ZMBA 1QVSA 4NF5B 3VLVA 3KG2A 3FJGA 3O6HA 3DLNA 5AE4A 4WKMA 1R1NA 1SQYA 1UTBA 1OQGA 1MDP1 4THIA 4IGTA 2QRYA 4KHZE 4LZ7A 2E0SA 1URSA 4NF6B 1Y3NA 4G8MA 2Y7RA 1B51A 4X9TA 3TTRA 4AQ4A 4ZDMA 3QIMA 4KD5A 3Q26A 1POY1 3RGYA 4O3BA 1TXFA 4OWDA 1MRPA 2NXOA 1BIYA 4EXKA 3QUJA 4XXUA 3GLBA 1NNKA 3H6TA 3C9HA 1LCFA 4OEVA 3QSLA 1MXWA 2HFBA 1SW1A 4POXA 1LAFE 2YJPA 1SI1A 3N5LA 1MQGA 2W7YA 3BFUA 3PPQA 5ICQA 4ISUA 1MG1A 4IGRA 2HEUA 1PBPA 1LGBC 3UK4A 5DEXA 1JW1A 1MPDA 4Q0CA 2E1SA 4C1TA 3HV1A 2FYIA 3PUYE 1ZTYA 3OO8A 3T22A 4N07A 4OQOA 1I6QA 5L9SA 1P99A 1FQEA 1PC3A 4TQUQ 2PYYA 2Y84A 3MBPA 1N76A 3UN6A 1UTHB 2PBWA 4KYEA 2I4BA 3H06B 2F36A 3FUZA 3EHUA 3KJ7A 4JWYA 4YU0A 2XXUA 5H8FB 1MY4A 3HO7A 1PBQA 4NF5A 3IOWA 2HAVA 1MQIA 1D9VA 3MC2A 3QUFA 2YLNA 3DP4A 1M5DA 4I1DA 2GRVA 1GV8A 4O3AA 2I0BA 4KCCA 1EZ9A 4X1BA 1LBCA 4ZEFA 2HAUA 5I56B 2Y7PA 1MS7A 4JSDA 4MF3A 1ZMGA 1B7HA 2B3BA 3IJXB 3I5OA 2ONSA 3H6UA 2H4IA 2VHAA 2D3IA 1HSEA 2ESNA 2HZLA 1I6BA 4GQOA 2OWTA 5CMKA 3KJTA 4LZ8A 3MPKA 3MJNA 4GIZA 1B6HA 4XIGQ 1VR5A 3E4RA 3VFJA 2UVJA 2H9BA 1DPEA 1Y20A 3TQLA 2QMXA 3A3CA 1RKMA 1TFAA 2I0CA 1MY2A 2R9JA 2UXAA 3KOSA 3S2VA 1O64A 3C36A 3QK6A 1I6AA 3OEMA 5CMMA 3ECRA 5H8HB 3U8QA 3BKIB 4GXSB 4G77A 4JB7A 1JVXA 1XT8A 2XXHA 3KBRA 2ZYNA 2QPQA 3MZBA 4LZ5A 3OXNA 4F2QA 2UYEA 3D4GA 4N13A 4FIMA 2OJTA 5KZTA 1UTHA 2CMOA 4ZE9A 1NFTA 4NWDA 4PFUA 4N6PA 5JK4A 4Z0IA 4I8CA 2FNCA 5IKBA 2Z22A 1H3DA 2DOJA 2XXIA 4MLVA 2PT2A 2XXWA 2Z8FA 4R74A 3H3GA 4YB7A 2OLBA 3V8XB 1FQDA 2OZZA 1TT1A 3TAJA 1M5BA 1FTLA 1SW4A 1A54A 1B3EA 5FTIA 3Q28A 3OO9A 5I56A 2QS1A 3U72A 4OYVA 1SW5A 4RNSA 3B6QA 4ZE8A 1OMPA 3SEXA 1LAXA 2XD3A 5AA4B 5TP9B 4EQ7A 3S9MC 2HQ0A 1LCTA 1PDAA 3MVWA 1OQHA 2ONKE 1AL3A 1MPBA 2CZLA 3RPWA 5TPAB 5CRYA 3QXMA 1YAEA 4YMBA 3C4MA 4R9GA 3TELA 3JZJA 1SYHA 2LAOA 3CG1A 3CRBA 3TTLA 2QJEA 3W9VA 5H8HA 3IK6B 3TODA 2REGA 3VXCA 4H5FA 5JEIA 1R6ZA 3ZS6A 3SETA 3TFLA 4OERA 3PV0E 1D3KA 5I58A 2A5TB 2DVZA 5L9MA 1LFIA 3HHGA 1VE4A 3O9PA 4QSEA 4DLDA 1PEBA 3C34A 1B3LA 3R6UA 5TU0A 2ABHA 3K0VA 4G68C 4P0IA 4PQJA 1HSLA 5DVFA 2RC7A 4GWOA 2OK2A 3E3KA 3CFZA 4LP2B 2RINA 4HTGA 1B32A 4YB6A 4MH5A 4RPOA 3CIJA 2DXYA 3GZGA 5KCJA 3IR1A 5EHSA 1M5FA 1B9JA 4EF1A 1B1XA 2GH9A 4YMAA 1ATGA 3IORA 1H76A 2QS4A 1NH8A 3U93A 4LATA 4HW8A 5DTBA 2VD2A 1MQDA 2GHBA 3M3KA 3LSXA 3GXAA 1B5IA 3THIA 3CSGA 1KWHA 4POWA 3MWBA 1RYXA 4PE5B 1IEJA 5CI5A 3SEVA 4NF4B 1TWYA 2ALUA 3T9UA 4QF9A 4X48A 2V93A 4OENA 4TLLB 3E13X 3RTFB 3VXBA 1M5EA 3MAMA 1FTMA 1GR2A 4C1UA 4ZZEA 3OD7A 4JXIA 1POTA 4PFTA 2VP1A 2X26A 1OVBA 4R6HA 4GL8A 3HSTA 4MFIA 3K2DA 1JVYA 4OFOA 4KQPA 1MY0A 4ND9A 3T93B 4RK2A 1GVCA 3M3FA 4F39A 1QW0A 5I2NB 1FQCA 2NUVA 2V3QA 2UVHA 1B2HA 3Q25A 2HXWA 2UVGA 3RT6B 4RK9A 1DTZA 2Q8JA 4K3FA 3SEUA 4KPTA 3TCGA 3FXQA 1LBBA 1A40A 4FATA 4EXLA 4DCXA 2XXRA 2G29A 4IB2A 3TEPA 3KOTA 3OSQA 3MZ9A 3V83A 2XXYA 3H03A 1J1NA 3DM0A 1IIWA 3FD3A 1MH4A 2VOZA 3FV2A 3TZAA 2D5WA 4YZZA 5ISUA 1DOTA 1GGGA 1SD3A 1B3FA 5AA2D 2Q2CA 4ZECA 1PB8A 4XKRA 3LSFB 4JDFA 5BUUA 4OEUA 4KR5A 3DP8A 4FEDA 3TCHA 3M3LA 3B7DA 1FTKA 2V84A 3KN8A 2PX1A 4U2RA 4JSOA 2ZYOA 2GFEA 3K6XA 4ZS9A 5AA1A 3IOVA 2Q88A 4RYAA 3K4UA 1N3XA 2F35A 3FVKA 5I84A 1Y3QA 5EYFA 1EU8A 3ILUB 1R9LA 1MDQA 1US4A 4F1VA 4IO2A 1IXGA 1MY3A 4P11A 1NNPA 1B0HA 4KYDA 4RJZA 2ZNTA 4NF8B 1MM6A 4U1ZA 3VLUA 3MVYA 4YICA 1OVTA 4O3CA 4IY6A 1YPNA 4DE8A 5I57A 3SEYA 2XD2A 3KN3A 1Y1ZA 5KDTB 3VDFA 4EUOA 3K6UA 5I59B 2NWJA 3Q29A 4R2BA 3LSLA 2D21A 2DQVA 5ICTA 1EH3A 5K2XA 3MP6A 3ZKKA 4WEPA 3PD8A 4LA9A 3RN8A 3V89B 5LOMA 4NF6A 3K6WA 4ZEKA 3FXUA 1AH5A 4Q30B 4QFOA 4NMYA 4HCWA 3PGFA 5AA2B 1QUIA 1R9QA 3S9NC 2QMWA 2O84X 3FATA 5L8DA 2THIA 2F97A 3U92A 4R9FA 1FW0A 3U1OA 1B7ZA 3TTMA 3S9LC 1HSJA 5F1QA 1DTGA 1N84A 5CMCA 1ZIUA 1BKAA 4HS7A 1A7LA 5HPQA 4GRKA 3MZ1A 1YTVA 1B52A 1UQWA 2B65A 2O6AA 1IXCA 1B5JA 3O66A 3OELA 3PUZE 4BDMA 2KLFA 2I6EA 3A3UA 1JW4A 1PB7A 3G3HA 3IOTA 3Q27A 4ZEBA 1S7YA 2VD3A 4Z7EA 3PMWA 4R75A 4EF2A 1B58A 1H43A 3LSWA 3MVXA 4OTEA 2AYSA 1T0KA 2XXXA 5B7DA 5H8FA 1N0TA 3PPOA 1A55A 5J1DA 2O7UA 2REJA 1CB6A 1F9BA 3S9EA 5H8QB 1SW2A 2PMSA 4H67A 1ZBMA 5A5XB 4DXUA 1OIBA 4U4XA 2RF1A 2F6PA 4NTLA 4M1VA 2DS9A 4YKJA 1FQAA 2ZYMA 3K01A 4H5GA 4Q5TA 2M8CA 3LR1A 3PPRA 4QSDA 3O6GA 4R6YA 1LLSA 2XXTA 1Q1KA 3SESA 4LVQA 1B4HA 4FE8A 1P1WA 3MP8A 1Y4TA 1UIUA 4GLIA 4C0RA 4XKNA 3HCQA 2DWJA 3A09A 3MQ9A 4QHQA 5CBSA 3DP6A 4GXAA 4PFYA 4YKIA 3CG3A 4H65A 1XS5A 4DCYA 1B5HA 4F3BA 1FCKA 3R7XA 3PU5A 1S50A 1BTJA 4NWCA 2RC8A 4EDPA 3TKDA 1N3WA 2H98A 4G8HA 1S9TA 4IO4A 2I3WA 4F29A 4G4PA 1N04A 3W9WA 1NL5A 3G7WA 1CE2A 1B1HA 2FA7A 1AMFA 1XOCA 3T66A 3G3FA 3CFXA 3ILTB 3R26A 2O1LA 3L6GA 1B05A 3KZGA 2NVUB 2H5YA 4LONB 5I2KB 2RCBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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