3FVGA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with msviii-19 in space group p1
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvgA02
3K6WA 3RTFB 4XIGQ 1JW5A 4R6YA 4NF4B 2HAVA 3R7XA 2H9BA 4IY6A 1GGGA 2VOZA 3PMXA 4QF9A 1JW4A 3PU5A 3KN8A 5I2NA 4X9TA 4G68C 1LAHE 5I57A 4IGRA 1MXXA 4IO2A 3KGCA 4UA8A 3FV2A 4QSDA 2RINA 4ZS9A 4KHZE 2I3VA 4MH5A 4OYVA 1EZOA 4F19A 1Y20A 2UVJA 1SQYA 4AQ4A 1JQFA 5AA4B 4U23A 4OHNA 4F29A 3T9HB 3FVOA 1LAGE 1VSOA 1I69A 4ONYA 5AA2B 3N6UA 4HTGA 4RPNA 1QUJA 2DYXA 2DXYA 3IR1A 1PB9A 3PPPA 4Q8RA 1SDXA 3DP4A 1B1HA 1MXZA 1FTOA 1B0LA 5H8HB 3MZBA 1ANFA 3FZVA 4MLQA 4ND9A 3TKDA 4YB6A 4IB2A 3K1NA 3ECRA 5CM6A 2O51A 3I3VA 3CG1A 2PMSA 5B70A 1Y3NA 4KCDA 1Y9UA 2GFEA 2NUVA 2Y7PA 4IGTA 4P0GA 3PPQA 4PETA 5AA3A 1US4A 4NE4A 4OFOA 1QJMA 4LZ5A 4OZ9A 1ZBMA 3T93B 3LSFB 1H3DA 5CMCA 5DVFA 5H8QA 1IXIA 2DE3A 2O1LA 2FA7A 3TPAA 3K0VA 5CMKA 1AMFA 4M4GA 4HW8A 3JV9A 3CVGA 1A8FA 4HCWA 3PUXE 2Q2CA 1R9QA 2F6PA 2QS2A 1HSLA 2F7BA 4XKRA 3PPNA 4GWOA 4DXUA 4EUOA 4NMYA 2E1SA 3A09A 1ZJLA 1O63A 3TCHA 4NF6B 4OQOA 4JWOA 4TOZA 3H6WA 4N07A 3IORA 4OESA 4EF2A 4YKIA 5K2XA 1S7YA 4NF8B 3ZSFA 1D9VA 2YLNA 1OMPA 1VFDA 2HXWA 4JBZA 3IB2A 3WAFA 3SDFA 2IEEA 1BLFA 2NOOA 3MC2A 1N3XA 1VFEA 2I3WA 4KPTA 3O2AA 2XXTA 4WEPA 3VDFA 1B4ZA 4G68A 1FTKA 2R71A 1MY0A 4LA9A 3PUWE 2NXOA 5DYHA 2AL4A 1LFHA 5JEIA 4K3FA 3TDJA 4BDRA 1F9BA 1LBCA 4F1UA 3UIFA 3H6UA 2E0SA 4KR5A 1N7XA 4NWDA 1B7HA 1TFAA 3SEYA 1SW4A 3MQ9A 5H8FA 3S2VA 1MH3A 5A5XB 5CRYA 1ZIUA 5HPQA 5CMMA 3H03A 3O97A 3C33A 4BDLA 1PBQA 1II5A 3O9PA 1MRPA 1Y4CA 2H4IA 2A5SA 3N26A 3FXQA 2DP8A 2QMXA 1GTKA 3MPKA 3FGSA 2CZLA 3EF7A 1IZ1A 2R6GE 4OMBA 5TPAA 1SI1A 2LAOA 2UYFA 4U2RA 4DCYA 1YPNA 4L17A 3VVDA 4PFWA 1AOVA 3FVKA 2PVUA 3DLNA 1VR5A 1LB9A 4RK2A 3HO7A 1FQAA 4ZEKA 1B5JA 1ELJA 2O6AA 3W15C 2O7UA 4C1UA 5FHNA 2A5TA 2OLBA 3MVYA 5JTYB 3V8XB 1LGBC 5AA1A 3IOTA 4YZZA 3UK4A 2AL5A 3DELB 2O84X 4EXLA 4YB5A 4PQJA 2HFBA 3FD3A 4GFRA 3IOUA 4G4PA 2F35A 4WEDA 4EDPA 3T9UA 4R74A 3BBRA 1HSJA 1D3KA 3H6TA 4FAJA 5TP9A 3CSBA 3U92A 2QS4A 5CI5A 3BFUA 2V3TA 3G3JA 3FXUA 4OERA 4P0IA 2DSFA 2F7AA 3FJGA 3Q26A 1S9TA 3TODA 4KYEA 2YJPA 3MZ1A 3FASA 1Q1KA 2B65A 4QFPA 4GLIA 1YTVA 3KEIA 4LP2B 3LSXA 4IO4A 2XD2A 1SI0A 4R73A 2RF1A 2RC9A 4MF3A 3C34A 2DWAA 2I58A 4EQ7A 2Q9TA 4LZ8A 3FATA 2XXRA 4NF5A 3TFLA 3M3LA 1IITA 1MQIA 2H98A 4Q5TA 4LONB 4XTCQ 2I0CA 1IXHA 2D3IA 2O68A 2REGA 4YMBA 3DP6A 5CBRA 3H3GA 4ELRA 2FNCA 4OEVA 3TYHA 1B4HA 1Q35A 3FVNA 1JEUA 1US5A 3CIJA 1PB7A 3UP9A 3KN3A 2RC8A 2XXXA 3N94A 2XX8A 1MY1A 5BUUA 3O6GA 3OELA 1B1XA 1LSTA 1MPDA 2P2AA 2XXIA 4GIZA 2I0BA 3PMWA 2I4BA 4ZE8A 1JW1A 1QUKA 3DM0A 2Z8EA 3H06B 3IJXB 4F1YA 2F36A 1OVBA 4R9GA 4OFJA 3QSLA 1MY3A 4XKQA 4BDOA 2DVCA 3MP6A 4LUBA 1B51A 3OSQA 4GL8A 2DS9A 4H65A 4JXIA 4Z7EA 4QSCA 1LB8A 3SEXA 5DEXA 4ECFA 4ZDMA 3IO4A 4F22A 4EF1A 3T66A 3RT8A 4X1BA 3DP8A 2W7YA 2OK2A 2ZYNA 2DE4A 4BLAA 1FTMA 3U1OA 1CE2A 2NVUB 1B5HA 3VV5A 3TQWA 1B05A 4U4SA 4OXVA 5H8NB 1B46A 2Y7KA 4EQBA 4FEDA 4ZZAA 2UXAA 4JB7A 1EZPA 2XXWA 4GVOA 3ILUB 1Y3PA 3ZKKA 3KOSA 1B0HA 3HN0A 1RYOA 4H6DA 1PC3A 4XKPA 2PYYA 1YCJA 5BWJA 1R6ZA 4G8NA 1ZKBA 1TWYA 1RKMA 1UTHA 4R75A 2O1MA 3VLVA 4R6KA 3OO7A 3S9LC 5L9SA 2DOJA 2B3BA 3QXMA 3VE1B 2QS1A 1NL5A 2CMOA 4KD5A 2XXPA 5FHOA 1IEJA 4ZEDA 2F5XA 3TTNA 3THIA 1URGA 4GRKA 1AH5A 3FIRA 4N13A 4F2OA 1DTZA 2UYEA 5I2KB 1UTBA 3WAEA 4IO7A 1SD3A 2XXHA 5I84A 3VFJA 1B40A 3IO6A 3I6VA 3TCGA 3G3IA 4G2ZA 4JDFA 2ZXTA 2VD2A 4ZZEA 1XT8A 1UQWA 3L6GA 3ILTB 4OENA 3AXFA 4BDNA 2ZYOA 2OZZA 3V5AA 3KSJA 4GF8A 3OO9A 3ONMA 1JETA 3Q25A 4DIGA 3TCFA 3MVXA 3CR9A 3RQTA 2XXQA 4QFLA 3SESA 2UVIA 2ONRA 1HSEA 4U1OA 1FQCA 3MUQA 1I6BA 4ESXA 3PD8A 5I2NB 5I57B 3OO6A 2RC7A 2VGQA 2ONSA 1MXWA 3SKPA 4GD5A 2XD3A 3MBPA 4TLMB 1M5FA 3LBSA 4E0XA 2QJEA 2I48A 4XKNA 2V84A 5JK4A 4DLDA 4RNSA 2ONKE 1GV8A 3T22A 1SW2A 2P0SA 2Y7RA 3OEKA 3OD7A 1O64A 1JVYA 3UA8A 5I56A 4YICA 4DDDA 4X1DA 4IO6A 1B5IA 3RPWA 3IK6B 4EXKA 1MPCA 5ICTA 4PE5B 2OWSA 4KCCA 1UIUA 2GRVA 4Z0IA 3H7MA 3PUVE 4ESWA 3K1MA 4RYAA 5J1DA 3OENA 1MY2A 3EQ1A 3V89B 2RCAA 3RT6B 4X48A 4H5FA 2R9JA 4ZECA 2Y7WA 4ISUA 4H0WA 3PUYE 3VLWA 4KQPA 2V3QA 2ABHA 3TTKA 3TELA 1B7UA 1I6AA 3GZGA 3B7DA 1N7WA 2I4CA 4AB6A 2F97A 3OMBA 4AB5A 3IB1A 3MP1A 1IUDA 2Z23A 1MXVA 4DZ1A 5DVIA 4FECA 1H45A 4LVQA 3U72A 3S4UA 4H8IA 3O6IA 2DE2A 3T9VA 3C9HA 1EH3A 3W9WA 3CFXA 5L9OA 1BTJA 4GOTA 4F3BA 4GQOA 5H8QB 3TAJA 2PT1A 2PX1A 4YB7A 2X26A 1M5CA 2GHBA 3PD9A 3KBRA 1I6QA 4RPOA 5M2VA 3TTMA 1LFIA 4F39A 4FEBA 1LBBA 4R2FA 5HBCA 3VXBA 2Z8DA 3Q27A 2OCUA 1NH8A 1MM7A 5K2YA 3TEPA 1USYE 1EU8A 3C4MA 5KDTA 4WXJA 3RNNA 4E0WA 3O29A 3LSWA 5I59A 2DWIA 2ZNTA 1MQHA 1B3FA 3G7WA 3I5OA 4M1VA 4I9DA 1JEVA 4G8MA 4U21A 2DVZA 1QW0A 4H8JA 4BDQA 1NNTA 3HHFA 2UVHA 4KI0E 3IB0A 1A7LA 1EZ9A 2FYIA 2ZNUA 2D5WA 3S9NC 3Q29A 3L6HA 1P1WA 1URSA 2HZKA 4G68B 2XXVA 2XXYA 3K00A 4MFIA 1B3EA 2RCBA 2RKMA 3K02A 4R6HA 3A3CA 1XHYA 4U22A 3MAMA 3CSGA 3C35A 1MDP1 4QFKA 1YAEA 3K6UA 3D4GA 3FUZA 1NNPA 3A3UA 3K6XA 2ESNA 1XVYA 2F78A 1TXFA 5L8DA 5I58A 5KCJA 1PDAA 5H8FB 1M5DA 4NF4A 3S9MC 3PV0E 1Y1ZA 3PPRA 2YPNA 2HZLA 4RY1A 1Y4TA 4Q0CA 1MQGA 3IOVA 4Q30B 1DMBA 4R9FA 3K6VA 5TPAB 1FW0A 2G29A 2I6EA 5AA4A 2XX7A 1MY4A 1B32A 3JZJA 1MXYA 3G3GA 3SETA 3JYRA 1BIYA 1JNFA 3K1PA 4PFUA 1QVSA 5DTBA 5AA2A 3HSTA 3E9XA 3OO8A 4F1VA 1QUIA 2H25A 3LUYA 2A5TB 5H8HA 3QUFA 3UN6A 1NKXA 5LOMA 1IIWA 4QSEA 1GR2A 2B3FA 3KJTA 2ZNSA 3MWBA 2HQ0A 3KSXA 4POWA 3MVZA 3O66A 3IX1A 3OEMA 1KWHA 5H8SA 3U93A 1IXGA 3F11A 3IL1B 1LAXA 5TP9B 1D4NA 3USDA 4DCXA 4NEDA 1B58A 5IKBA 4O3CA 2P1SA 1N0TA 1XC1A 1AL3A 2HAUA 3TTRA 3PGFA 3QYTA 1QKAA 4LATA 2ANJA 3M3KA 4OTEA 2GHAA 1OIBA 3IJOB 2REJA 3TUSA 3BFTA 3QK6A 4GL0A 2HCAA 3ZKLA 3MJNA 2QMWA 3LSLA 4G77A 3VLUA 3K4UA 3Q28A 2H99A 4NF6A 3SEWA 2NWJA 1R9LA 4KYSA 4IY5A 2X7PA 4NF5B 1SW1A 4PFTA 4ZE9A 3N6TA 5AA2D 4NF8A 1MS7A 3KN7A 4QFNA 2ZMBA 1B52A 3E3KA 3CFZA 5L9MA 4P11A 2UVGA 3K2DA 3OOAA 4RK9A 4POXA 1A8EA 1OVTA 4YU0A 4DE8A 1SVXB 3PMVA 3VVFA 3ZS6A 1NNFA 1LLSA 2M8CA 3RLFE 2VP1A 5CMBA 1NNKA 3U8QA 1Z7NE 4U1ZA 1OQHA 3MP8A 1MH4A 1VE4A 1M5BA 1ZU0A 4R72A 5B7DA 3FJMA 4WKMA 1JVXA 1A40A 1N3WA 1R1NA 4KFQA 1P1NA 4O3BA 3K01A 1DOTA 4F18A 1LFGA 5ELVA 4TLLB 3O6HA 4U4XA 1P1OA 3E4RA 1N04A 3TTLA 5A5XA 1S50A 5ITPA 3GLBA 4UACA 3FV1A 4ELQA 4FE8A 2XXUA 1OLAA 3SERA 2Q89A 1POY1 4QHQA 4ZEFA 3EHTA 3OXNA 1H44A 4YMAA 4JSDA 5DEXB 3G3HA 4DXBA 3R26A 5KZTA 3UORA 4ELOA 3B6QA 1DTGA 2DXRA 4FJPA 5F7VA 5ITOA 3HHGA 2XHDA 1OLCA 4I8CA 2DWHA 2F7CA 4LQ2A 3MPLA 1SYHA 5EYFA 3RY3A 4YAHX 3VXCA 1DSNA 1P99A 1IXCA 2F34A 3QIMA 3MVWA 2IA4A 1WVJA 1FQEA 3B6TA 3H4ZA 3ODBA 3O28A 1Y1MA 2Q2AA 5JTYA 4ELPA 1PB8A 5TU0A 3IOWA 3KOTA 4OETA 3CRBA 2QL3A 2VD3A 1A54A 1O7TA 1UTHB 1ATGA 3E13X 4JSOA 1DPPA 1UIVA 4I62A 2QS3A 2BJJX 1H76A 1XVXA 1MXUA 1B7ZA 1NFTA 1GVCA 4R2BA 2THIA 5EHMA 5FHMA 3MZ9A 5DT6A 4F2QA 1B2HA 4HCYA 4I1DA 4MBPA 1UTBB 2ZYKA 1B3HA 4ZEIA 3TZAA 2WKYA 4THIA 3SEUA 4G8HA 2AYSA 4F31B 2OJTA 1FTJA 2Q88A 3OSRA 1FCKA 2HEUA 3B6WA 3FXRA 4OWDA 1MQJA 2GH9A 3U94A 3KJ7A 3TQLA 3V83A 1Y3QA 1AIVA 2DWJA 3S9EA 2QRYA 4MLVA 4BDMA 4H1XA 4IO3A 3SEVA 1N76A 1OQGA 5IAIA 5AE4A 4QRZA 5CBSA 1POTA 3FVGA 1B3LA 4C1TA 3P7IA 3TMGA 3BKIB 3EPEA 1MG1A 1MQDA 4JWXA 4OFLA 2VHAA 1WODA 1MPBA 4DXCA 1FQDA 2F8DA 4H67A 3C32A 4NTLA 3GXAA 3M8UA 4YKKA 4RA1A 2H5YA 3RN8A 5I56B 1SW5A 3LR1A 2OWTA 4F3GA 4GXSB 3QAXA 4LQ5A 1MM6A 2X7QA 4PP0A 1TFDA 3C36A 1QKBA 3RGYA 4GXAA 1WDNA 2G93A 2V3UA 1LCTA 5DVJA 1SYIA 1URDA 1XOCA 3CFLA 1LAFE 1FQFA 4C0RA 4YKPA 4IO5A 4H5GA 2PBWA 3R6UA 3GBAA 1ZTYA 3QUJA 1BP5A 1USYH 2QPQA 2DQVA 4N6PA 1A99A 1B9JA 4F3PA 4FATA 2Z22A 3HCQA 3FJ7A 3CI8A 2O7IA 2ZYMA 4TQUQ 5H8NA 1B6HA 1DPEA 3RUMA 3EHUA 1P1QA 4HS7A 4F3SA 1QULA 1NMUA 2XX9A 1L5TA 5HM4B 1CB6A 2ALUA 3KZGA 1MDQA 3HV1A 1N84A 1ZMGA 1P1UA 2Y7IA 2F6GA 1SBPA 4LZ7A 1PBPA 1B3GA 3KG2A 5ICQA 3PPOA 1PEBA 3EHSA 5ISUA 3HPIA 3D4CA 2V25A 1BKAA 3CG3A 4KYDA 5F1QA 1J1NA 3PUZE 2QSXA 3W9VA 3MW0A 5EHSA 1FQBA 5FTHA 5KDTB 4PFYA 2Y84A 3VVEA 4FIMA 2I49A 3G3KA 3EN3A 5I59B 1M5EA 2OBGA 5I2KA 2O69A 4QFOA 4EQ9A 3N5LA 4NWCA 1TT1A 3LC8A 1FTLA 1H43A 1D9YA 3C31A 2Z8FA 2D21A 3IAZA 4ZEBA 3M3FA 4O3AA 3T9XB 3G3FA 4JWYA 2KLFA 2AIXA 1IQ7A 1Z7ME 2V93A 2PT2A 2Q8JA 3UGWA 4RJZA 3KFMA 4RXLA 3RTWB 1RYXA 1A55A 1LCFA 4FORA 1T0KA 1NH7A 5FTIA 5CC2A 3T96B 1ZLQA 3H6VA 4OEUA 4XXUA 4OVJA 5I58B 1XS5A 5KCJB 3GBBA 4YKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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