3FXYA

Acidic mammalian chinase, catalytic domain
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPAQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Triad of polar residues implicated in pH specificity of acidic mammalian chitinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
total genus 132
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3fxyA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3fxyA01
1VRXA 3J7HA 3M46A 4GQRA 1ODZA 3ZQ9A 1BVNP 1B9ZA 3TTOA 3CBWA 3OIHA 5DMYA 2YL9A 4CU6A 2XVLA 2CBVA 4WKFA 2JIEA 1JZ5A 4Z2IA 2FGZA 4MDOA 1E15A 2WWDA 2W92A 3VIMA 1HJXA 1ZJAA 1BG4A 1ODUA 5D9MA 4Z2LA 3HMCA 3EMQA 4UFLA 1JXKA 1W3JA 1G1YA 1HL8A 4GXPA 1UWQA 4GO9A 2WMIA 1YQ2A 3QOKA 3VILA 3U57A 1B2YA 2JE8A 4PRWA 2XIIA 3NSMA 2WLYA 3S2CA 1QVBA 5AC5A 1HKMA 4DM1A 3WBEA 2CESA 3T2QA 1KWGA 1KCLA 2PBGA 4DUWA 4MNJA 1GOMA 4AD2A 2J79A 1MXDA 2Z1KA 2VJXA 5A6LA 3OLEA 2NT0A 2VT0A 1E6QM 1I75A 4WLCA 1UD5A 5I5RA 4W89A 3RIKA 1DEDA 1H1NA 1GOWA 4OOZA 3VDCA 3ZJ7A 4U5KA 1GORA 1W9XA 4R27A 4D6HA 5FD0A 2YA0A 1RH9A 3ARUA 4GI6A 4KRUA 1E72M 3GNRA 3PHAA 3TP4A 1NOFA 2VX4A 1E70M 2OYKA 1JYXA 2DT1A 3EDEA 2VUYA 1EOMA 1V3JA 2E3ZA 1JG9A 4UFMA 1OCQA 1NP2A 2WHKA 1J18A 3K4AA 4FLOA 2Q8XA 1VB9A 2VR4A 9CGTA 3NJ3A 3WQ8A 4AEEA 1US2A 3BH4A 1ZS2A 3M07A 1TA3B 2AMGA 3K8MA 1KQZA 3NSNA 4FMVA 4MJ2A 1BGAA 1F4HA 5CPSA 4BZYA 5D9NA 1C91A 5E6YA 1VFUA 2YL5A 1W2PA 4UQCA 2YDQA 4U3AA 3WENA 1C90A 2VI0A 1TCMA 1L8NA 3POCA 5E70A 2WHMA 3FY1A 4XB3A 1EDGA 4GI9A 1JFHA 2O92A 3M7SA 4ZXOA 3ZIZA 1Q4NX 1GVYA 1JAEA 2E9LA 4KWUA 1LJYA 1QBAA 4M56A 5FOOA 1EHNA 1FH9A 1CGWA 2DGAA 2WVSA 3I3EA 4OBRA 1GOQA 5I24A 1EDQA 1QI0A 4PTMA 2AOSA 3RDKA 3WH7A 2VOTA 5D4YA 3WNNA 2O9PA 3I3BA 2QMJA 4HPHA 2ZE0A 1KXQA 2ZUUA 3II1A 6TAAA 2GK1A 4BQ2A 1W1YA 5GNZA 3CZJA 5HPOA 5M03A 3RMEA 3ZSSA 3IJ7A 1E56A 4AZBA 4AC1X 1SYTA 2J25A 4OZOA 5ABGA 1KXVA 3MUY1 2G3IA 3QR3A 4E2OA 1WKYA 3EDKA 3TTQA 3KWXA 4AD5A 3VIOA 5JUVA 4GI8A 4JKLA 1PAMA 2WMIB 5A8QA 4WSJA 3IJ9A 1UG6A 1JD9A 3VIHA 2E4TA 1TG7A 1E40A 2XVGA 2VCBA 1CNVA 4YPJA 3U5YA 3WH8A 3POHA 1VBRA 3U7VA 2BHYA 3WF3A 3GNOA 4HMDA 3AS1A 5E6ZA 4GZEA 4AZHA 2OWWA 2PWDA 3VIPA 2CIPA 3CZGA 4UCFA 3BSGA 1E3ZA 1JZ4A 3PZNA 4M1RA 2WVUA 2DSKA 3WF0A 1HKJA 2YA1A 5CSUA 1QNPA 3VX0A 5BROA 3PZVA 1EH9A 3CHCA 4W88A 1JFXA 1MQRA 4CKQA 4HZ7A 2VQUA 1Q6GA 1AVAA 4Z2KA 1V03A 1UOKA 4JCLA 5E9AA 3WD2A 4H2CA 2E8YA 2EJ1A 1W1VA 3PN8A 2ZXQA 1IZJA 4AXNA 5BCAA 2B31A 2PF0A 2PBOA 4P7RA 1R7OA 5CG0A 1J0KA 3VU2A 2WAGA 1W32A 1GQKA 2UY2A 2WLZA 3L4XA 1XH0A 2YJQA 3EBVA 1VBUA 2Y5EA 3CHFA 2V3EA 4ZEPA 6A3HA 1UR1A 2WCAA 2WXDM 3DYPA 3W28A 2X05A 5BXTA 3W27A 4B16A 3AXHA 4Y7EA 3W0KA 2GJXA 2IUZA 4NRSA 4MAZA 1BLIA 1GHRA 4AEFA 2X8RA 2D24A 5I78A 3MMDA 1R85A 2Y8KA 4AZ6A 3ZJ6A 3CHEA 4GKLA 1HVQA 1V6XA 4KRTA 2DT0A 3OBAA 4HA4A 3WUEA 4AZCA 3WH6A 5JBEA 1V0NA 1U33A 1GUVA 5EFFA 3RM9A 4CVUA 2ZX7A 2QLYA 4CD8A 1DWJM 2WCSA 1W9BM 3LPGA 4IPLA 3L4ZA 6CGTA 3WFZA 1CXHA 1O7AA 3AIBA 3UG5A 5HNNA 1GHSA 2GK1B 3FN9A 2WZEA 2J78A 3UG3A 1D2KA 1W3HA 3AICA 3ZMRA 1QW9A 3L2LA 1H3GA 2C7FA 1ISWA 2WHLA 1CYGA 1UWSA 3N18A 2CBJA 2F8QA 2V5CA 1IV8A 1KBKA 3MO4A 1V3KA 5BWFA 2DH3A 5AYBA 3BC9A 4HOXA 1IT0A 4B9ZA 3OLGA 1GOKA 2O9TA 3OLIA 2X2YA 3WKZA 2XJ7A 1W91A 1UR4A 2WMGA 2XSAA 5LA1A 1VEMA 1LL6A 1XRVA 2PC8A 1CXKA 3VD9A 1ITCA 1V02E 1NARA 2XSBA 3NDYA 1JF6A 1CZ1A 1TMQA 3QOMA 4TTGA 1B0IA 3RM8A 3SCTA 2YLAA 5IHRA 2CETA 1UR8A 1LWJA 4HZ8A 1UKTA 4OOUA 3B9AA 3WEZA 1UWUA 3W6MA 3WBAA 2J74A 1XCWA 4D6IA 4UNIA 1TVPA 4TX6A 1AMYA 5ABFA 2NT1A 1TUXA 4AMCA 1H5VA 4D71A 4AIOA 1OWQA 1KGXA 4AYSA 4D72A 2BHZA 4PMYA 2ZUWA 4PMUA 5LYRA 3VINA 2CKSA 2J75A 1CPUA 4M81A 3DHUA 4YHGA 1FP9A 5M17A 2W5FA 3WDQA 2EXOA 2FHCA 3WH9A 1PJ9A 1V6WA 4F9DA 1M53A 1SFSA 4M80A 4PMQA 1PX8A 2OWXA 3F5LA 4AZ5A 2FHBA 3W29A 2RGLA 1V6YA 3AHYA 5A6KA 4HA1A 1H49A 5EBAA 2D0GA 1G01A 4A4AA 4JFUA 4OUEA 4W93A 4PMOA 3WDRA 2XIBA 5A94A 2WHJA 3SCWA 1CLXA 2W4XA 4OKDA 3W53A 3AYRA 2GJXB 1K9TA 3A4XA 3WF2A 2WMHA 3MUZ1 2VZUA 3CZ8A 1UUQA 3CUJA 4M24A 3ZT6A 1NQ6A 1J0HA 3BMWA 4AD1A 1EQCA 3RPMA 2WKLA 1BYBA 7CGTA 1EA9C 2QHAA 2VX6A 1ISYA 2OSXA 4UFIA 2XWDA 3K8LA 2NSXA 4AZCB 3UEQA 4DUXA 1UR9A 1QHOA 2OYLA 4ACYA 1EDTA 1OSEA 5AC4A 1LF1A 5A2AA 2J8GA 5IXEA 3VX1A 2DPEA 5BXRA 1FFRA 4BF7A 3DYOA 2FGLA 3WDPP 1LWHA 1OIFA 1CGVA 4PMNA 3UG4A 1MVYA 4OBSA 1J0ZA 1J11A 1MYRA 1JDDA 4JIEA 5E0CA 4C7DA 3ZT7A 1JZ7A 2VTFA 1IZKA 4EANA 3RJYA 5M3WA 2CERA 1VIWA 1I1WA 3K4DA 3JUGA 3WUFA 4AIUA 1PEZA 5A6MA 3MANA 1KBBA 2XFRA 3KL0A 3OA5A 4HOWA 5C71A 2WWCA 3WDJA 4RE2A 3CPUA 4ATWA 2VRJA 2J7CA 1G9HA 3CGTA 3PTQA 1C8YA 1Q6FA 4LXFA 1EGZA 3LPFA 1CXLA 3AIEA 2A3HA 2OSYA 3QHNA 4J3TA 1E6SM 2BHUA 2EPMX 3AIRA 5D9PA 3VO0A 3N11A 4PTVA 1JYWA 2XWEA 2CKRA 1I1XA 3K8KA 4MPKA 3WDIA 1CWYA 1UZ4A 4S3KA 3NUKA 3BAKA 5ABFB 3WNPA 4GO8A 1W1TA 1VF8A 3L2MA 5CJ5A 3VDAA 3ARYA 3SCUA 3AXIA 4LX4A 3WIJA 1KWKA 5AYIA 3KZSA 1E6XM 1E5JA 4LYRA 3GH4A 1HJSA 1B31A 4AIEA 1OIMA 3MUAA 3B8SA 3ZJKA 1FA2A 1WB0A 1QI3A 3AIQA 1MWOA 4HP5A 1UH3A 2E0PA 1VFFA 4P8XA 3HU7A 3TONA 1EO7A 4JFWA 4JCMA 2A3BA 3UR7A 3UETA 5A8OA 1W2VA 3ALFA 4V27A 3SCOA 4P8UA 4PN2A 1OGBA 1G0CA 3EDDA 2JF6A 2YOCA 1HJWA 1B3XA 1C8XA 1WZMA 1KB3A 1H09A 5A69A 2BVYA 3N15A 3GXDA 4MNMA 1CGUA 2YKKA 4P8VA 1OB0A 4AZIA 1PIGA 1WO2A 3A47A 2CPUA 4E8CA 3UCQA 3QGVA 3WNOA 4UZUA 1CENA 2WMKA 3T08A 1NWRA 3CUIA 1U2YA 4CN1A 3AHTA 2ZUTA 3A3HA 2GFTA 2D22A 3CZKA 4RE3A 1HIZA 1U30A 1W9VA 2XM1A 3VMNA 4WF7A 1EOKA 2PWFA 4PTXA 2VVNA 4B3LA 4H7VA 1KFWA 4UOJA 3CHDA 1E6RA 1GOOA 2BXYA 5GNYA 5LA2A 1XYZA 2Y2WA 2GDUA 1FHLA 3EYPA 1CBGA 4CCEA 2DSUA 2WBKA 2A3CA 4XZWA 4WIWA 5AY7A 3TTYA 4CUCA 5A8PA 4NF7A 1GJWA 1J12A 3KL5A 4P7OA 1UKPA 8A3HA 1V3MA 4C7FA 3RO8A 3VPLA 1FFQA 3AXXA 3CIVA 2X1IA 7TAAA 3D3AA 1BYAA 3VIJA 3ZSTA 1HJQA 1HP4A 1CXFA 3KEHA 3NCOA 3SIMA 1E55A 4JL1A 2DSWA 3VGDA 4PTWA 2BVTA 2ZX5A 2MANA 1US3A 2EPKX 2A3EA 1UR2A 4BQ5A 1M01A 4FLRA 5I79A 1H2JA 4JAWA 3RILA 1BYDA 1QBBA 5CLWA 4D6JA 2DSVA 2XHYA 3WF4A 3ZOAA 3TOPA 3OZOA 1JDCA 1DWGM 2WZIA 4EAMA 2VZVA 3ARTA 4ZFMA 1GJUA 2HISA 3MKKA 1UHVA 5KEZA 1LL4A 1ZB5A 1PX3A 2XYLA 5CSYA 4QCFA 3T2OA 2EPNA 2QF8A 4QFUA 1G5AA 2Z1SA 4AW7A 1BSIA 5I23A 3T0DA 1BVZA 4S3JA 3WSUA 3PZQA 5JBFA 2C8NA 2QV4A 1CXEA 2YLLA 4HMCA 3WQ5A 2VVSA 1E43A 1OD8A 2VZTA 1LG1A 3VGGA 2X0YA 5ECUA 3N04A 3FHAA 4D1JA 2WPGA 3PZGA 4DWSD 2WVTA 2WYSA 1JI2A 1B3ZA 5BYWA 3AROA 4BA0A 4D1IA 1WAWA 4PCTA 2OLHA 3SCVA 1Z32X 2D20A 4JHZA 5I3DA 4RE4A 1CIUA 2ZUNA 3LPPA 5A8MA 1C7TA 3OGVA 5A8NA 2J8FA 3A6OA 3GYCA 2FH6A 1RD6A 4TUFA 2BNJA 5D9OA 5EB8A 3VMPA 3KL3A 3FHQA 1QI5A 2W61A 3CTTA 4NZCA 3CLWA 3NYDA 4Q22A 1JI1A 1FH7A 3WEOA 3VD5A 4QCEA 1SR0A 3VGFA 2CBUA 5CGMA 1CTNA 2YDRA 1PPIA 3AZTA 4MB4A 1Q6CA 3ARWA 5I0DA 4W84A 4HA3A 1GQJA 1XD1A 1KCKA 1XYFA 1PZ2A 2J7HA 3WNKA 1UH2A 2BFGA 3CMJA 4W86A 2V3FA 4DM2A 5JH8A 1QW8A 2W67A 3PZIA 5A1AA 5BXPA 4F66A 2ZX8A 3WMCA 3VGHA 3FW6A 1J10A 4UQAA 5A6AA 4DWSC 3IAQA 1XSKA 4N42A 3AS0A 2D0FA 1QNOA 4CD4A 5BRQA 4A3YA 1GCYA 3CZEA 3SEPA 3WQVA 3K46A 4TXEA 3AOFA 1JDAA 2PI6A 1HXJA 3PTMA 4QLKA 1TVNA 2EPLX 4E4PA 1FP8A 3SUWA 2QMKA 5ABEA 2G3MA 5D8WA 2WCGA 1JYVA 1V3IA 1R8LA 1BGGA 3AIUA 1OT2A 1JZ6A 2YA2A 1SMAA 3BMVA 3I3DA 3O9NA 3UERA 1LQ0A 4Z2HA 3L4UA 2VX7A 1CEOA 3GM8A 1UD3A 1UWTA 1ZBWA 4CD6A 3VGEA 1W9UA 2WBGA 4H8HA 1BG9A 1PIFA 2J4GA 3AYSA 1BHGA 4JL2A 3MS8A 2QPSA 1WDSA 2GSJA 5IFPA 4MB1A 1NWUA 2G3JA 5FCZA 4H8UA 3ZR5A 2BY1A 4ZENA 2CXGA 3VD3A 3AS3A 1UZ1A 3VUPA 3OGSA 2EEXA 1ISZA 3WUGA 4MB5A 4P7QA 4V2XA 1P6WA 2VZSA 4H41A 3WF1A 2WK2A 1JIBA 5IFTA 1GZJA 1OD0A 4AISA 1RP8A 1HKIA 2CYGA 2WC7A 4PMZA 5DO8A 4EKJA 3FXYA 1OM0A 2BY2A 2WVVA 2WANA 5LA0A 2UY4A 1MQPA 2J7GA 2JIWA 2VC9A 1E3XA 4IISA 1GQLA 3VM5A 7A3HA 3AIVA 2D0HA 3SUUA 2CEQA 4HU8A 3WL0A 3B9EA 1WCGA 4JHOA 1RP9A 4Z2JA 1V3HA 2UY5A 4F9JA 4RL3A 4PYSA 4XV0A 4H04A 4NRRA 4W5ZA 2ZUSA 1ZU8A 4YN5A 3EDFA 4ATLA 3AFBA 1E71M 1ZBCA 1QOXA 3ECQA 1CGXA 3N1AA 5EFDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2WM0 A;  3A4A A;  4UOQ A;  1UA3 A;  4ACZ B;  1NOU A;  2VL4 A;  2ZUM A;  3ZM8 A;  4ML4 A;  3OZP A;  2PWH A;  1AQM A;  2F61 A;  4GZJ A;  3SCS A;  1CDG A;  2W63 A;  1V08 A;  2XFY A;  1JZ2 A;  1A47 A;  5FIP A;  1MFV A;  5FL1 A;  2PWG A;  1JAK A;  1R7A A;  4BQ3 A;  2XTK A;  1D7F A;  5DT5 A;  3SUT A;  4ZE5 A;  3ZR6 A;  1E4I A;  3ALG A;  4ZE4 A;  1C8Q A;  1AQ0 A;  3D5H A;  1JND A;  3BXW A;  4QAW A;  2HVM A;  2WW5 A;  3ARX A;  1HKK A;  4WK9 A;  3LMY A;  3SUR A;  1MQQ A;  4X0V A;  5A2C A;  3AS2 A;  1V6V A;  4BQ4 A;  4FF5 A;  1UA7 A;  5CQ1 A;  2W91 A;  3VD7 A;  1N82 A;  2XM2 A;  3GH7 A;  3N12 A;  2VQT A;  3K1D A;  3NDZ A;  3GDB A;  1GON A;  3AMC A;  5BXS A;  1XH1 A;  3PBG A;  4KH2 A;  4GQQ A;  5C70 A;  2O9R A;  4D6C A;  3ARS A;  1NH6 A;  1VAH A;  4UFH A;  2YIH A;  4HOZ A;  4TVD A;  5HOS A;  4MTV A;  3N17 A;  1E4N A;  1BYC A;  1GPF A;  4GIN A;  2JAL A;  3GBD A;  4UR9 A;  2G4F A;  1JF5 A;  3AHX A;  1L0P A;  1V02 A;  2YBT A;  2G41 A;  1XGZ A;  5ABH A;  1B3V A;  1QHP A;  2VR5 A;  4LQ1 A;  5DF0 A;  3ZJ8 A;  3ZO9 A;  1HVX A;  1B3W A;  3WD3 A;  2J7B A;  3WY1 A;  1WZA A;  4URI A;  3OGR A;  1HP5 A;  2JEP A;  1KR0 A;  4W8L A;  3GH5 A;  4PMD A;  1TA3 A;  2ZWZ A;  1CEC A;  2E9M A;  3ZT5 A;  1XC6 A;  5HDR A;  1HNY A;  3PZU A;  1UR0 A;  3DC0 A;  4PMV A;  5HBF A;  1MXG A;  4AZ7 A;  2V3D A;  4LYP A;  1UKO A;  5CZK A;  4FK9 A;  2FH8 A;  3MUI A;  5A95 A;  1J01 A;  5CPQ A;  1HL9 A;  3AML A;  2E8Z A;  3O2L A;  2GVY A;  4MB3 A;  1W3L A;  4J3U A;  4TVC A;  4CD5 A;  2EBN A;  3SCN A;  1V0M A;  4GIA A;  3BAX A;  4IPN B;  5CPT A;  3GXM A;  4PSP A;  1DWH M;  3IK2 A;  3M6D A;  2GDV A;  1EQP A;  3S6T A;  3OLD A;  3VM7 A;  1TZ7 A;  1E4M M;  1HX0 A;  4HPG A;  1V0L A;  2F2H A;  1CGY A;  1YHT A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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