3FZ5A

Crystal structure of possible 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase from rhodobacter sphaeroides
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
200
structure length
190
Chain Sequence
AMNPIEFWFDFSSGYAFFAAQRIEALAAELGRTVLWRPYMLGLSSTPLKRDYAQRDWARIARQRGLTFRPPADHPHVALAATRAFYWIEAQSPDAATAFAQRVFDLYFSDRLDTASPEAVSRLGPEVGLEPEALLAGIADPALKETVRKIGEDAVARGIFGSPFFLVDDEPFWGWDRMEMMAEWIRTGGW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of possible 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase from Rhodobacter sphaeroides
rcsb
molecule keywords Possible 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Rhodobacter sphaeroides 2.4.1
total genus 62
structure length 190
sequence length 200
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3fz5A00
1GP1A 4KB3A 2R3XA 5D8IA 3H93A 4K0GA 2VM2A 5JCWA 4Q5RA 3ZITA 3LXTA 1SL2B 3DYRA 1HYUA 2F3MA 2KP2A 1MEKA 2E7PA 3NIVA 2NDOA 3BCIA 4FIWA 1NM3A 4N11A 5H5SA 3QFBC 1OKTA 3GSTA 1SKWB 4XHMA 3QAVA 5COHA 1WRYA 2AB6A 2XBIA 3H1NA 4EE0A 1XW5A 1U6TA 1ACVA 1M9BA 2CVBA 3FR9A 2JL4A 2ZUPA 19GSA 1TTZA 3M1GA 1AIUA 2FY6A 3L9UA 3ZRDA 5IM9A 2EC4A 1EZKA 4KUNA 1F2EA 1F37A 4KE3A 4MLYA 2EIOA 4DSSB 2P5RA 1QK8A 4AF2A 3QAGA 3VK9A 4MJBA 1NHOA 4EL1A 3RPPA 2GZPA 2YPMA 4AJ8A 2V41A 4MK3A 1V40A 1V57A 2DJJA 4DEJA 1SJZA 1TRWA 3QAWA 3HYPA 4AJ7A 4EO3A 4OD7A 4G10A 1MTCA 1A23A 1AQXA 1MDJA 5IO2A 1SJIA 2PU9C 1THXA 1A2LA 2X8CA 3IPZA 3F4RA 4CW9A 3ZYWA 5HFGA 3UIWA 5ELGA 3WT2A 5J9CA 4BVXA 3QFAC 2OACA 4K6XA 2QKEA 2DJ2A 5JCUA 2C3QA 5E59A 4ZBDA 4I6XA 2F8AA 5A4UA 4K2DA 1Z9HA 3WT1A 1W4VA 5KN2A 1THOA 2VIMA 4ID0A 1JLWA 3VPQA 1C72A 3ZIJA 2H71A 3IRAA 2PN8A 3MWHA 3Q19A 5D9TA 3C7MA 2MBSA 3P7XA 1K0MA 2V32A 3UVHA 2CX3A 3ZVJA 3FRCA 1PKZA 3TKSA 1JZOA 3KD0A 5EL8A 4HQSA 4TXVA 1X9WB 1TU8A 1O8XA 1JZDA 3GH9A 1Z6MA 1XZOA 4YQMA 5DAKA 3C1SA 2EIQA 4JU5A 2VCWA 3TKQA 4F0BA 2B7JA 1V9WA 4MZWA 4GWRA 1TU7A 2H0GA 2N5FA 2L59A 3EURA 4POKA 5E4WA 4IS0A 6GSUA 1TRVA 4KW6A 1FG4A 3F4SA 1VRSD 3W8JA 1QGVA 1ZOFA 3EMXA 2MZCA 1NW2A 4DVCA 4OWYA 4PUFC 1B48A 3G7YA 4IJ3A 3F63A 4FYBA 1SKRB 3J7Yk 2WZ9A 4JR6A 4K7OA 4WETA 1EV9A 6GSSA 1VF3A 2L5OA 2G2QA 1R5AA 2I1UA 4DSSA 2PVOC 3LEFA 1LBKA 4NWYA 1PMTA 1HNAA 4MF5A 4X0XA 4OFTA 1VF2A 2B1KA 1O7UA 4K7NA 3IAM2 3IR4A 2IMKA 2AHEA 4GLTA 5EPFA 3BBYA 4HU7A 2MMZA 4MDCA 2PERA 1E6BA 4EDYA 1GTIA 4POLA 2MMOA 4XRAA 3PGTA 1V2AA 4GCIA 3RAZA 2NPBA 4NMUA 1O6JA 5C04A 2LQQA 4HJ2A 1Q4JA 4EKZA 4LLRA 5AIVA 5IOWA 4L5OA 4TRXA 3HA9A 1YY7A 3FR3A 1M2BA 1GSSA 1GTUA 2CVKA 2HZFA 5ECRB 2LEGA 3GTUB 5J5NA 2H1BA 2RIIA 4MP4A 1SD9A 1XVWA 3GH6A 4X1UA 4XS4B 1G0TA 3BD2A 2VO4A 3GX8A 3IDVA 4N30A 4ECJA 5J3RA 3EYTA 3IBHA 5GAPD 1F9MA 2C0DA 4TR1B 3GL5A 5D9WA 4ULXA 4N10A 3SBCA 4HJMA 1A24A 2BMXA 2WCIA 3S9FA 5J9BA 3VURA 1OE8A 4KAEA 3SWLA 4HUAA 2HYXA 1GUKA 1N2AA 2VD0A 3IHQA 4E8EA 3ME8A 4WF5A 1V58A 1BQ7A 4J57E 5J41A 1WOUA 1JLVA 4TOPA 4K1FA 3UL3A 2IN3A 2DIYA 2ALBA 4YQVA 5ECMB 3KTBA 4OO4A 3ERGA 4F2IA 1K0DA 1YKAA 4BVYA 4YAPA 3L9SA 3G9BA 2VLVA 3CSIA 3D4TA 2H1GA 3QMXA 3TJFA 1PQNA 2J9HA 2O7KA 5KN1A 2HRNA 3W8SA 5D73A 4ZBBA 2LNTA 3U5RE 2WJUA 2FCHA 4BA7A 3TKSE 1QFNA 1K3YA 2OE0A 3HJPA 22GSA 2FNOA 2G0FA 1N8JA 4HOJA 3VPTA 1WMJA 2RLIA 4QQ7A 3HXSA 1IYHA 4PQHA 1SYRA 1ZYEA 1OC9B 1SENA 4XS6A 1XIYA 2H72A 2I9HA 2GT6A 4BL7A 3D0ZA 1BG5A 3GX0A 1WWJA 2H1AA 3UOMA 2KLXA 3F0IA 5ECLB 2X8HA 4XTSA 3LGCA 2FLSA 4MABA 1OKDA 3C1RA 3TJBA 3D5JA 4O32A 5HFKA 3KJYA 5IMFA 4PUAA 4JBBA 1TJDA 2GDRA 2H6YA 1VF1A 2YOIA 2C80A 3E9JB 2CV4A 3E3EA 5DVBA 1AQVA 1UN2A 2F8FA 5ECOB 2B6MA 5CP1A 4LA1A 3FK8A 3E0UA 5GZZB 2TRCP 4MZBA 3D4MA 4ZBAA 5ECQB 4XRDA 3GTUA 2LRTA 17GSA 6GSVA 4OCFA 3APOA 3GA4A 4EC0A 1B8XA 3ZFBA 4XS4A 3TRQA 1BAYA 3L4NA 2DLXA 4MPGA 1WE0A 4TR1A 3M9KA 4IKHA 5G31A 3HJOA 3Q6OA 5C00A 2C4JA 3DKSA 4F9ZA 5G5EA 4KGIA 4IVFA 2B5EA 1OC3A 3DVXA 5IOXA 1R26A 4FYCA 3N5OA 5B8AA 3ZZXA 1SL0B 3BJ5A 3ZFLA 4EDZA 3Q18A 4K9ZA 3HZ4A 2RUEA 4Q5FA 4IELA 5HR3A 2IMFA 1GTAA 1HQOA 2B1LA 3GL3A 4ML6A 2O85A 1PX6A 3GHAA 3UBLA 2LSTA 3C73A 1USBA 3PR8A 2HXKA 5HQPA 3HY2A 1DUGA 1XWKA 2V6OA 1SK1A 5ID2B 1BJXA 3UVTA 3KGKA 4KSOA 4MJAA 2GGTA 3BOAA 2YP6A 2MMNA 3D6IA 4AJ6A 5IIZA 3TRPA 2PVQA 1K0NA 3F6FA 4BWQA 4WF4A 2K6VA 1OC9A 1ERVA 1A8LA 1BEDA 1TI3A 3KZQA 3TB2A 2YWIA 3LJRA 3HVVA 1EWXA 4GF0A 3U6VA 5DCHA 1TK0B 3HJMA 4K8MA 5CNWA 1S3DA 3TUEA 5D9XA 3GKNA 2R37A 1ILOA 3A2VA 5DQSA 3IE3A 3WGDA 3KEBA 2L6DA 3P8WA 1EGOA 1NSWA 2CZ2A 1F3BA 3EE2A 4XCSA 3QOUA 1PL2A 1FW1A 2LRCA 16GSA 4MF7A 2AV4A 1KNGA 4CHSA 4G19A 3UARA 1E2YA 3GN3A 1YQ1A 1DE2A 3ERFA 2C3TA 2VCXA 2LQOA 3ZMKA 4PNGA 2LS5A 1SK0A 1GNWA 1TDIA 2HFDA 3F3QA 3QDNA 3K8NA 3TCOA 4ZXGA 2P31A 3TKSC 1JZRA 14GSA 2CAIA 1M7TA 2A2SA 3LWAA 2LJAA 1GH2A 1X9MB 1UVZA 4NHZA 5INYA 1SK2A 2B7KA 1Z3EA 3L0HA 5G1KA 2L5LA 2Z9SA 2OE3A 2PWJA 3VWWA 3TKPA 3CYNA 1B9XC 4TN8A 4L5LA 1DSBA 1T4ZA 4RI7A 5HR0A 5CYYA 3UAPA 1T7PB 3KM6A 1ST9A 4DSQA 4O7HA 1XBSA 2PUKC 3F6DA 4LL4B 1VF4A 5ID2A 3M0FA 4I8BA 3FHKA 1AUCA 3FW2A 2REMA 2QGVA 3IK7A 3PINA 1GSEA 2WRTA 2GSSA 1I5GA 5IPHA 4XIHA 3CTGA 1A8YA 5FHIA 4KH7A 1U88A 3O76A 4NV2A 5IMVA 2DJ0A 4GSSA 5B8BA 1M9AA 1OVNA 3DVWA 5H5QA 1ON4A 2HSYA 1XOBA 13GSA 3HKRA 4FO5A 3GRXA 1ML6A 3HHVA 3VI5A 4PNFA 5DCGA 1SL1B 1AQWA 2K8SA 5EVOA 4IP6A 3RBTA 4J2FA 1B9YC 2OA7A 2VL9A 4N0VA 3F9UA 2AUVA 1TXXA 4I5QA 2DSAA 1NHYA 4KDYA 4IGJA 3VWUA 3FZ4A 5G30A 3GKMA 2GSTA 2IWTA 4NAXA 1GLQA 5HR1A 2I3YA 2NVLA 2H75A 2YANA 4IN0A 5KN0A 5JCGA 1H75A 1TKDB 2VM1A 1MD3A 3ED3A 4FYUA 3KMOA 2F51A 5CO3A 5LNKe 2H30A 3ZLPA 3KP9A 1T8EB 4ISDA 4LMWA 2YV7A 2LTKA 2NTOA 3KCMA 3BCKA 2VLTA 2X99A 2GZYA 1SD8A 5CRGA 4L0UA 3MDKA 1TRUA 1X0RA 5IPGA 1GLPA 4I2TA 4ECIA 5CAXA 1YKCA 2GQMA 5AIXA 1PRXA 3P2AA 2WB9A 2LRNA 3TRXA 1GUMA 4PXOA 1RQMA 2O87A 5ECKB 4V1Ag 5F06A 5IO0A 4ZB6A 3FZ9A 1ERWA 4MH3A 4Q5NA 3ZL5A 5D93A 1Z5YE 2K9FA 2C0FA 4IBPA 2PGTA 1GWCA 2GQLA 2MBTA 2IFQB 1M99A 2YZUA 1M0UA 3DIEA 4IQAA 1FAAA 1PX7A 1EP8A 4TKYA 1G7EA 2F9SA 9GSSA 1GL8A 3I43A 3CRUA 2H6ZA 4ECCA 1FVKA 3TKRA 2LJKA 3WYWA 4HI7A 1X5CA 1T1VA 2VAFA 2IPAA 2H19A 4ACSA 4MZCA 4OFNA 2WULA 5ECIB 3RHCA 1SJ6A 2YN1A 4MJCA 1BX9A 3FYGA 5AN1A 4POMA 1GULA 4K7IA 4H86A 4V2MA 1FOVA 1S3AA 1AC1A 3A5WA 3KP8A 2E2MA 3PH9A 4IP1A 3C71A 4IHUA 3EMPA 1GRXA 1TOFA 2IMDA 4Z7XA 1XWCA 2DMMA 4KCEA 4EXJA 2LKUA 3ME7A 1TP9A 4JR4A 5F0GA 1A0RP 4GQFA 1YZXA 2GSRA 1FO5A 2L6CA 3GV1A 3M8NA 2OJLA 5DQYA 1XOAA 2JACA 2H6XA 5A4WA 3GIXA 3FR6A 5CRHA 1K3LA 3DGQA 3IAS2 2EIRA 1A2MA 2HI7A 1QXHA 2KOKA 4RUVA 1PD21 2CQ9A 2M46A 3EVIA 3CMIA 5ECPB 2HLSA 4V2NA 1XWGA 2O89A 2VCZA 2H66A 2B5YA 2QC7A 3HCZA 3L9VA 4ZB9A 3TJJA 2AAWA 2CX4A 3LQ7A 1M2DA 4O92A 3IOSA 2GTUA 4CDOA 4JE1A 5L71A 4TVEA 2VL2C 3TGZA 4HZ4A 2VOCA 1O73A 2IFQA 1WP0A 3ERWA 3HVSA 4L8EA 2FGXA 1K0BA 2RM5A 3CSJA 1OAZA 3H4KA 3ZREA 2FA8A 2JZTA 2VD1A 2H0HA 2KUCA 1ERTA 2R2JA 4MF6A 3VI7A 5G1LA 4I2UA 2L57A 3L78A 1MDKA 2R4VA 1RW1A 2JU5A 2CT6A 4TXOB 3C8EA 1V98A 3J7Yb 3LYPA 2KHPA 1O8WA 4N0ZA 2H70A 2OADA 1J08A 1BYEA 3QPMA 4GRFA 4PQIA 1TK5B 2N5AA 3MAKA 1J9BA 2VLUA 2HRFA 5IQYA 3M9JA 1G6WA 5F8BA 2DJ1A 2VUPA 3GMFA 5A5KA 3Q74A 3APSA 3EWLA 3ZVJD 4HEA2 4WR4A 5LD0A 4TR0A 3KMNA 3V1WA 3GURA 4HU9A 2V6KA 3G7JA 4QL7A 5JWRB 2H1DA 3APQA 1SU9A 1XXUA 3ZMLA 1FB0A 1Y6EA 2R5GA 5B7CA 2DJ3A 2XBQA 1ZL9A 1OC8A 2K18A 2L4QA 3FEUA 1SKSB 3KH9A 3QCPA 3H8QA 4D73B 3TDGA 1RK4A 2OBIA 1Z7RA 4E8HA 6GSXA 4IW9A 2AYTA 1B4PA 4LL1B 1TI1A 3KIJA 1W89A 1DE1A 11GSA 3OR5A 2HT9A 4TR3A 1G6YA 1ZGNA 1LJRA 3FKFA 6GSYA 3ZIVA 2I4AA 1URMA 3CSHA 3P90A 3CBUA 4KCAA 3HZ8A 2C8UA 2ZCTA 1R7HA 3N9JA 1HNBA 2VCVA 4MCUA 1SYXA 2FHEA 20GSA 3KTLA 4MMMA 2DMLA 2M80A 4IJIA 3G7IA 1CQGA 1CQHA 2IIYA 3UJ1A 5ELAA 3CRTA 1FB6A 4RQRA 3CXGA 2FWEA 4K0NA 5AGYA 2I81A 4KDXA 2K8VA 5IMZA 2WGRA 4ECBA 2FWHA 2YWNA 3A2WA 3EU3A 2NBSA 4TXOA 5B6NA 1B4QA 3O6TA 18GSA 1R5PA 5CRDA 4YQUA 3NOFA 3DWVA 2GT5A 3IV4A 6GSWA 2DC5A 1TK8B 3LG6A 5F05A 2GS3A 5ECNB 3MNGA 2VL3A 2IJYA 2JZRA 2H73A 2IMIA 1J0FA 2X8GA 3ZTLA 3TJKA 3UMAA 3LXZA 2DJKA 5FWGA 2RM6A 4KNDA 3I69A 4PQ1A 1M2AA 2CVDA 5JWOB 4ZL7A 5CREA 2IL3A 4MA9A 4YH2A 1AXDA 2YCDA 6GSTA 2PMTA 1Z6NA 2KP1A 2TRXA 5DALB 2HNLA 5F07A 4RI6A 2GQKA 3DXBA 7GSSA 3WGEA 1ZYQB 4PGTA 2HZEB 3GSSA 1LU4A 1XFLA 3GKKA 2HSHA 4GSTA 3HDCA 4EUYA 5H5RA 2GVPA 1A2JA 1FVJA 3VLNA 1F6MC 4D73A 2CA8A 2B5XA 2E0QA 1EEJA 5KN3A 4KX4A 1GUHA 1UC7A 2N5BA 3H79A 2LNSA 4L0WA 3VWVA 1U3IA 5D9VA 3KXOA 3W6GA 3GFKA 1YJ6A 4WR5A 1T3BA 1XW9A 1T00A 2JZSA 1K0CA 2R6KA 10GSA 4JZQA 2IMEA 2MYGA 4OFMA 2VCTA 4BWSA 4F82A 1K3OA 4YAVA 3MSZA 4X43A 1YDKA 1S3CA 5B6MA 3CTFA 4HDEA 4QL9A 1FHEA 2WFCA 1PA3A 1KTEA 5GSSA 1JZWA 2H8LA 2M72A 2YNXA 1G7OA 3HVXA 1U87A 1X5DA 2H76A 5HFIA 4GQCA 2H01A 2GLRA 1GNEA 1PGTA 3TJGA 2JADA 1XPVA 1GSUA 4HQZA 5IMCA 3IA1A 4MJEA 1ZCPA 1KBNA 5G5FA 3FZ5A 4JEDA 4RQXA 2P0GA 4Q5QA 2D2ZA 5EY6A 5JWQB 5DJLA 1PL1A 4ZIJA 1MD4A 5DDLA 2FUG2 4F0CA 3A2XA 1IYIA 4NV5A 1K0AA 1ZMAA 3IK9A 3D22A 1R4WA 2GSQA 4HZ2A 4GSNA 2X64A 2H0IA 4AGSA 4ZL8A 4G9HA 1T4YA 4POBA 1GSDA 2ON5A 3F4TA 4P3YB 4HS1A 5DALA 5DJMA 1HNCA 2C0GA 3I6AA 1EP7A 4NPBA 2HZEA 4ZILA 1H4OA 3US3A 2MMAA 2YZHA 2CZ3A 4OO5A 1O85A 12GSA 2V2GA 4WEYA 1X5EA 3DMLA 4BPYA 2LJRA 3LFLA 4O5RA 4JRRA 5A4VA 4WBRD 3I9V2 2AJQB 3LORA 3UEMA 4KSMA 4I97A 2XHFA 3FY7A 1PKWA 4EF0A 2L4CA 1ERUA 4WXTA 1PSQA 2JSZA 5IMAA 4IQ1A 4F03A 8GSSA 3VWXA 2WDUA 3ISOA 2PPTA 3TOTA 4G2EA 2JSYA 5ECHB 2QSIA 1YEXA 1ABAA 1O81A 1Q98A 1GSQA 4PX1A 2WS2A 1JFUA 1YF1A 2BJXA 4WKWA 1KEBA 3DD3A 1YEPA 2V1MA 4NXIA 5D96A 5HR2A 2VCQA 4MPFA 3DEXA 1GSFA 2LV3A 3LSZA 1U3AA 1EOHA 2FWFA 2GZZA 3GKXA 1WIKA 1UA5A 2OKAA 5IMDA 3QD9A 1XWBA 3IXRA 4ILFA 1OYJA 2DIZA 5AISA 3F3RA 2PBJA 3QR6A 2BTOT 4ZB8A 2YJ7A 2C1YA 1WPIA 2ZNMA 2XPDA 1OE7A 1PN9A 3LYKA 5CRWA 1K0OA 4XS1A 4TR4A 3GNJA 1TRSA 2FWGA 3RDWA 5GSTA 4KDUA 4V1Ap 2ES7A 1ZZYA 3IC4A 2CAQA 3O3TA 2YWOA 5ABRA 1Z7PA 5ENUA 1QMVA 3AY8A 2FA4A 3GUSA 3WGXA 2RUFA 2XPEA 1XVQA 3VFIA 4PURA 2C0EA 1JHBA 2J23A 1EOGA 4NHWA 1XCCA 5DBQA 3TOUA 4GTUA 4OCEA 4OMVA 2OBKA 2FD3A 3EINA 4V2LA 3UBKA 5FT3A 2YWMA 2E2GA 1WJKA 4FH8A 4TW5A 1QUWA 5LCZA 3EU4A 3FZAA 2YV9A 4EVMA 3NZNA 1HD2A 1X9SB 2H74A 5GAND 3RPNA 2P5QA 1EGRA 3R2QA 2VL2A 4GXZA 1TW9A 3JCML 5KEJA 3F8UA 3RHBA 1EV4A 4DSRA 1F3AA 1AAZA 2A4VA 3EC3A 5ECSA 4MH2A 5G2ZA 2XC2A 1GSYA 4WBJA 3GYKA 2TIRA 2YJHA 1I9DA 4ML1A 1AW9A 1EEMA 4ZL9A 2ON7A 4LMVA 1XWAA 1Y25A 1DBYA 4J56E 5J4UA 3D21A 1A0FA 3DRNA 2LUSA 1XW6A 3KH7A 2OE1A 3HD5A 3A3TA 5DAKB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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