3FZ9A

Crystal structure of poplar glutaredoxin s12 in complex with glutathione
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
GSRLEDAVKKTVAENPVVVYSKTWCSYSSEVKSLFKRLNVDPLVVELDELGAQGPQIQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPLLSEANAKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-function relationship of the chloroplastic glutaredoxin S12 with an atypical WCSYS active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
source organism Populus tremula x populus tremuloides
molecule tags Oxidoreductase
total genus 34
structure length 106
sequence length 106
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3fz9A00
4FO5A 4TW5A 1GLQA 1PKZA 3A2WA 4NWYA 3QMXA 1GSFA 1RQMA 3S9FA 1UA5A 4ZL9A 1THOA 3KP8A 5FWGA 5IO0A 4DSRA 3BBYA 2KUCA 4KUNA 3ZTLA 4IP1A 3GTUA 1U87A 1OC9A 1FVKA 3ZREA 3IV4A 4EDYA 1KTEA 2H30A 3H79A 2YWMA 3L9UA 2AB6A 1PX7A 3ERWA 3TKSC 5HFKA 4WETA 3DVWA 5G2ZA 3KD0A 1SL2B 4L0UA 1URMA 1F6MC 4TR1B 5KN1A 1Z6NA 2L57A 2YCDA 1TRSA 1K0DA 2OACA 2O8VB 3FZ4A 2N5AA 3Q6OA 4V1Ap 2ZCTA 1OKDA 4KDYA 1ZZYA 3EU3A 1GSEA 2VCTA 3GSSA 1T7PB 4ZB8A 2C80A 2VL2C 4ML6A 5AIVA 3DVXA 2FWHA 3C1RA 3H93A 2FA8A 4L0WA 1F9MA 4POBA 1F2EA 5F07A 3KIJA 5D93A 1TK5B 2AAWA 5CNWA 4ACSA 2OBIA 2G2QA 3ZVJA 4I2TA 5D96A 3KP9A 3HVSA 1YZXA 1ERWA 2IMDA 4I2UA 4K6XA 2OJLA 2YZHA 2I3YA 3F6FA 1ML6A 3ERGA 4TOPA 2LS5A 1FO5A 3KTLA 4X0XA 2LV3A 4KDXA 5ECOB 2IMKA 3IAS2 1EOGA 4L8EA 4ZB6A 4OFTA 2H1GA 3H1NA 1M2BA 2X99A 1U6TA 4TR4A 4MABA 5CRGA 5G1LA 2FGXA 2YV7A 1S3DA 1AQVA 4BVYA 1A2JA 4ZIJA 5KEJA 4JU5A 2QKEA 3VWWA 1VGLA 3F0IA 3VWXA 5ECMB 4IS0A 5J5NA 4KDUA 3UOMA 1GP1A 3FZ5A 2RIIA 5HQPA 1K0AA 2VD1A 2HFDA 2V41A 3HY2A 4F82A 4OCEA 1ACVA 1TK0B 2M72A 1DUGA 1PRXA 1SK1A 2V32A 3QDNA 4DSSB 1SU9A 2C0GA 1PGTA 3NZNA 2R2JA 2YANA 2GSSA 3P7XA 4D73B 1EP7A 3LYKA 4I6XA 1XCCA 2AYTA 4TVEA 1ZMAA 1SYXA 4RI7A 3DKSA 1LBKA 3IK9A 1HYUA 3LFLA 4TXOB 17GSA 5A4UA 1SJZA 2LJKA 2VLVA 3LGCA 3FKFA 1JZDA 3HYPA 3VI7A 6GSVA 1RK4A 1QUWA 2MMAA 2RM6A 5F06A 6GSTA 3FZ9A 3DIEA 3SBCA 3GRXA 5EPFA 4KCAA 1V98A 1ERUA 3GIXA 4IELA 1QQ2A 2RUEA 5A5KA 5COHA 5DCHA 3QPMA 3UARA 3HA9A 4ML1A 4EF0A 1K0CA 2TIRA 2ZNMA 3I9V2 2FD3A 3KMNA 2H76A 1SJIA 3ERFA 4HU7A 4CDOA 3CXGA 2LUSA 1T3BA 3GHAA 4JR6A 5DVBA 3GSTA 4ZXGA 5ECSA 1Z6MA 1O6JA 1R4WA 3DGQA 1ZGNA 2XBQA 4GSNA 4BPYA 3BCIA 4IVFA 5E4WA 4WR5A 1EZKA 2D2ZA 1TU8A 4K0NA 4NXIA 4HJMA 1A8LA 3AY8A 1ERTA 4V1Ag 2RLIA 3VWUA 4V2NA 4Q5RA 3W8JA 4XS4B 2AHEA 2B7KA 4K1FA 5JWQB 4PUFC 1OC3A 2VM1A 4F9ZA 1OKTA 5G1KA 2YV9A 5ECQB 4GSSA 1WP0A 1GULA 3A3TA 2PWJA 3LXTA 4ECIA 2JACA 1W89A 2JZRA 2ON5A 1SKSB 3D6IA 2FNOA 1PN9A 3US3A 1ERVA 2DSAA 1THXA 1VF2A 1K0OA 4MZWA 4TXOA 4KH7A 1H75A 3L4NA 1SKWB 4LMWA 4JBBA 3HZ8A 3FR9A 5EL8A 2L6CA 2VCQA 5JWOB 1BYEA 3UAPA 1NHOA 3I69A 3L0HA 3KGKA 5D9VA 1EV4A 4NHZA 3F8UA 3EU4A 1V57A 2VLUA 3MDKA 5DQYA 1G6WA 5ELAA 4XIHA 2CVBA 1B9YC 2O87A 3DMLA 4HOJA 3ZMKA 2CT6A 2NBSA 2PVQA 2GQMA 4BVXA 1XVQA 1B4QA 2RM5A 4KNDA 5DBQA 1VF3A 2H1DA 1FHEA 4KGIA 1GTIA 1FAAA 1Y25A 3RBTA 3QFAC 4V2LA 2LNSA 3TKRA 3KH7A 1K0NA 2B3SA 2LQOA 3P90A 2C0FA 5DQSA 3TGZA 3L9VA 4MPGA 4TR0A 2VD0A 3APQA 4EUYA 2IPAA 1JHBA 3WT2A 4BWSA 1XWBA 1YDKA 2P0GA 4EC0A 3CBUA 3VWVA 3IHQA 2LRNA 2VL9A 4XCSA 1YKCA 4IHUA 5ECIB 4EVMA 3NIVA 1XWKA 1S3AA 1TTZA 3M3MA 4LMVA 5AN1A 2WRTA 4MZCA 1Y6EA 4XS6A 5CREA 3MAKA 1PL1A 5CRHA 1G6YA 2EC4A 3FRCA 3PGTA 4LL4B 2H0IA 3TKSA 4RUVA 3GTUB 4ZB9A 3H8QA 1YF1A 1G7OA 4NAXA 1XIYA 1EOHA 1IYHA 1QGVA 2EIQA 1GH2A 2C0DA 3HD5A 1U3AA 3IAM2 1I9DA 3BCKA 1E2YA 4K7OA 2J9HA 2LRTA 3Q18A 20GSA 2YZUA 2VL2A 3HXSA 2REMA 5IPHA 2DMMA 1M9AA 3IOSA 1GSYA 4PNGA 1BAYA 4GLTA 1YEPA 4YAPA 5GZZB 4Q5QA 2JZSA 1JZWA 3HZ4A 4N0VA 4X1UA 3FK8A 4HU9A 2RUFA 2CX3A 3M8NA 2LTKA 2MYGA 3IBHA 1SKRB 3W8SA 3OR5A 5CP1A 4KA0A 1TOFA 4N0ZA 5A4WA 3IXRA 3UJ1A 2ZUPA 1JLWA 2NVLA 5DAKA 3IR4A 3GX0A 1KEBA 2I81A 1AW9A 5F0GA 1PX6A 3F6DA 2GVPA 1X5EA 1AQXA 4HUAA 4GF0A 1K0MA 4MF6A 3J7Yk 4PNFA 4WXTA 5D9WA 3BD2A 2PU9C 3ED3A 5G5FA 3QD9A 1MDKA 5D9XA 5ID2A 2B6MA 2M80A 2L5OA 4XRAA 1B48A 2R5GA 2K8VA 5L71A 4NPBA 5AISA 3DEXA 1XZOA 3LSZA 2IWTA 4MCUA 5B8BA 2PPTA 1VF1A 5HR2A 3BOAA 3E9JB 3ZIVA 1GRXA 1OYJA 3GMFA 3CMIA 1O8XA 4ZBBA 3HKRA 1M2AA 1CQGA 2LQQA 3TRPA 2X8GA 2P5QA 3ZZXA 1M7TA 2C0EA 5LCZA 2PERA 4MF5A 1C72A 2E7PA 1X0RA 2K6VA 1A2LA 3EMPA 11GSA 4MH3A 2ON7A 4FIWA 4PURA 5CAXA 1K3LA 1KNGA 2FWFA 3L9SA 2O89A 3GFKA 1GUKA 3WD6A 2GSTA 3D0ZA 3RPNA 2H70A 5B7CA 2IN3A 3KH9A 2YJ7A 2F51A 2L6DA 4MH2A 4OFNA 3TKQA 1EWXA 2HZEA 4POKA 1RW1A 2B5EA 8GSSA 4MMMA 1N8JA 4YQMA 5JWRB 1JLVA 4XRDA 1PSQA 2J23A 2VLTA 2KLXA 1DE1A 5IMDA 2LNTA 3EYTA 1BX9A 2NDOA 3EURA 3VFIA 1QMVA 3TRQA 3U6VA 5KN0A 3O6TA 4DSQA 4O92A 1Z7PA 5LD0A 2HT9A 4HJ2A 1XVWA 1TRUA 4O5RA 2H73A 2IIYA 4J56E 1K3YA 1A2MA 4JEDA 6GSWA 1T4YA 2GSQA 4MZBA 3GN3A 2AV4A 2C4JA 2CA8A 1ON4A 1O73A 3WGXA 3EC3A 3D22A 1V9WA 1M2DA 2MMOA 2IMEA 4P3YB 4WBRD 4IP6A 3VI5A 1K3OA 3I6AA 4HQSA 1SK2A 2F9SA 4WF4A 4IN0A 2H0GA 2I4AA 3KZQA 3FR6A 4IJIA 3IRAA 4TN8A 1HQOA 2VM2A 3LQ7A 1BJXA 1TK8B 5D8IA 2F8AA 2XHFA 1B4PA 2IJYA 2EIOA 1GTUA 3P8WA 2H6ZA 1PMTA 4FYUA 5JCGA 1WOUA 2DIZA 1XWCA 2GQKA 2YWNA 5GAND 3QAGA 3GH6A 2GZYA 3HCZA 4J57E 1JZOA 3P2AA 3TKSE 1AIUA 1EV9A 2JSYA 3GNJA 4K7IA 5IQYA 1PL2A 4ILFA 1PD21 2R6KA 1UVZA 3F4TA 3HJMA 3E0UA 1A24A 2KHPA 2OKAA 2H19A 2AJQB 1JZRA 3M9JA 3DXBA 2V1MA 10GSA 1T1VA 2X8CA 2PVOC 2C3NA 1HNBA 3DWVA 5C04A 4K2DA 3EINA 5J41A 3C7MA 4Q5FA 1EGOA 5HR0A 2FHEA 5CRDA 4BA7A 3TCOA 1GSSA 4Z7XA 3C8EA 4EKZA 3ISOA 2X64A 2E2MA 5J9BA 1N2AA 2NTOA 3U5RE 4O7HA 2R37A 1QK8A 4L5OA 2YP6A 4MLYA 4KSMA 3F4RA 1YJ6A 1YF0A 2OE3A 4LA1A 3WGEA 4QL7A 4G2EA 4OMVA 2BMXA 3KTBA 4Q5NA 4OFMA 3FW2A 3MSZA 3N9JA 1J9BA 4NHWA 5ECLB 4CW9A 2B1KA 4LLRA 5ECKB 5J4UA 1A8YA 3HJPA 1SL0B 3GH9A 2C3TA 2E2GA 1EGRA 5HFIA 1X5DA 4E8HA 2VCZA 3UVHA 2P31A 1XW9A 2GT6A 2PGTA 5E59A 1AAZA 4WBJA 4TRXA 3DYRA 4I8BA 4JRRA 1G7EA 2PN8A 2YNXA 1XBSA 3ME8A 1XOAA 4ZILA 1SYRA 1USBA 4AJ8A 3D21A 2ES7A 2N5FA 1ZL9A 1SD9A 1FB6A 4GSTA 3M9KA 2H8LA 1OE7A 1R5AA 2HRFA 2K18A 3FHKA 7GSSA 1M0UA 2JL4A 2A4VA 1X9MB 5DALA 2VL3A 4AJ7A 1TRVA 1GNWA 5KN2A 4TKYA 4XS1A 1T00A 1XOBA 3O3TA 1O8WA 3QOUA 4QQ7A 1W4VA 4JR4A 3VPTA 5IMAA 5IOWA 2GT5A 2MBTA 2E0QA 2QSIA 2C3QA 3Q74A 1YY7A 4IJ3A 1TW9A 5DAKB 3LWAA 3WGDA 4NV5A 1R26A 4OO4A 2H66A 2R3XA 2KP2A 2JZTA 3D4TA 5D9TA 5ECNB 3ZL5A 1ILOA 4NV2A 4MPFA 2DJ3A 5IMZA 4YQVA 2AUVA 2DJKA 3C73A 3H4KA 4ZBAA 2LJRA 2MBSA 4OCFA 5ID2B 2QC7A 3VPQA 3C71A 4MF7A 2K9FA 4ISDA 5B6NA 2XPDA 2A2RA 5IMCA 2H1BA 1TJDA 4HZ2A 1F3BA 1ZOFA 2CAQA 4JZQA 3RPPA 2V6KA 4GXZA 4G19A 6GSUA 1YQ1A 4XTSA 5LNKe 1SJ6A 1XW5A 2PUKC 1JFUA 4WF5A 2HXKA 3A2VA 3JCML 1OC8A 2V2GA 2KP1A 3GA4A 5ELGA 5G31A 1XWGA 3WT1A 3LEFA 1PQNA 2B7JA 1YEXA 4MDCA 4MK3A 3C1SA 1WWJA 1A0RP 2DIYA 5B6MA 2IFQA 1WPIA 4PX1A 3TB2A 2YWIA 4ECJA 5DJLA 2FLSA 1X9WB 1NHYA 2DJ0A 1WRYA 2GQLA 4KE3A 3ME7A 2P5RA 4KAEA 4GQCA 3CTGA 3Q19A 4DVCA 2YJHA 2HZEB 2CVDA 4O32A 2H01A 22GSA 1ZYQB 1Z9HA 2X8HA 2IL3A 4WR4A 4EO3A 3TJKA 3UBKA 2CZ3A 3LXZA 1GUHA 4HS1A 2L4CA 2WJUA 3EMXA 2O85A 2YWOA 4GQFA 5ENUA 4ZL7A 2H72A 5AGYA 3G9BA 1U88A 5A4VA 2KOKA 3EE2A 3F3RA 4EE0A 2YPMA 1ZCPA 3LYPA 4LL1B 4FYCA 3UIWA 1GSDA 3IK7A 1CQHA 2A2SA 2LKUA 2H71A 1XWAA 1Z5YE 4EL1A 2L4QA 1GTBA 1WIKA 2G0FA 4PUAA 3EVIA 1MD4A 1GUMA 1TI3A 5JCWA 4JE1A 2PMTA 2B5YA 5FT3A 1NM3A 3I43A 4HI7A 4KSOA 5J9CA 6GSYA 1A23A 1EP8A 3L78A 5AIXA 3ZLPA 3KJYA 1V40A 1BG5A 4AJ6A 2HSYA 3QAVA 4K7NA 4BWQA 3PINA 3R2QA 3GV1A 1HD2A 1MDJA 4YAVA 3QFBC 1SD8A 2GS3A 1WJKA 1F37A 1R7HA 2VUPA 1OAZA 1T4ZA 1ZYEA 4K9ZA 2L5LA 1S3CA 4ID0A 1MD3A 1AUCA 1A0FA 2JU5A 1NW2A 5CYYA 2VCVA 1TXXA 4AGSA 2LJAA 1B9XC 1OE8A 1U3IA 3KCMA 2HI7A 3VK9A 2O7KA 4MJAA 5CO3A 1WE0A 2TRXA 1UN2A 3SWLA 2C1YA 3RHCA 1TU7A 2DBCA 1K0BA 1VF4A 3TOUA 1XPVA 1XFLA 3UVTA 2LSTA 4PGTA 3CTFA 1FG4A 4GWRA 4HEA2 2HZFA 4MA9A 5JCUA 3ZVJD 3F63A 1DBYA 1FB0A 1TP9A 4HZ4A 1DE2A 3ZYWA 1TKDB 2N5BA 3PH9A 2WULA 3G7IA 3HVXA 3DD3A 3TJGA 3CRTA 5IM9A 4IQAA 4ECBA 4GTUA 3TRXA 4X43A 3UL3A 1J0FA 4HQZA 3HDCA 3HHVA 1NSWA 2WCIA 2YN1A 3CRUA 3FZAA 1SL1B 1BQ7A 1O81A 1QFNA 3LJRA 4ULXA 1UC7A 1BEDA 1MDIA 4MJCA 5INYA 3CSJA 2HSHA 5H5SA 3GYKA 4PXOA 3QCPA 2ALBA 5KN3A 4YQUA 4F2IA 2VO4A 3TUEA 2BJXA 1Z7RA 3ZFLA 1GSQA 2XC2A 1FVJA 2XBIA 4QL9A 1MEKA 5DALB 1AQWA 4I97A 3IE3A 4TR1A 5GAPD 3ZRDA 4PQIA 3KM6A 5ECRB 2C8UA 1EEMA 16GSA 1DSBA 3RHBA 2VCWA 3GURA 4V2MA 3ZITA 4F0CA 2LRCA 4YH2A 1MTCA 1ABAA 3MNGA 5J3RA 4F03A 5B8AA 5DJMA 2FWGA 4L5LA 2HNLA 5F05A 4N10A 3QAWA 2WS2A 4EXJA 4ZBDA 3IPZA 1EEJA 2GLRA 2H75A 4WKWA 2YOIA 1G0TA 2HRNA 3GL5A 4FYBA 1OVNA 4RQXA 5FHIA 2GDRA 3VLNA 1PA3A 4K8MA 1ST9A 3GUSA 2B1LA 3KMOA 4KW6A 1Q4JA 5DCGA 5DDLA 2IMFA 4TXVA 2GZPA 1FW1A 4IQ1A 3UMAA 1GNEA 3F9UA 3N5OA 1XW6A 2VAFA 5IO2A 5G5EA 3CYNA 4J2FA 5EVOA 3UBLA 5IIZA 3A5WA 4FH8A 3MWHA 3LORA 4RI6A 2H6YA 5ECHB 4TR3A 5ABRA 2HLSA 2FWEA 1GWCA 3W6GA 2MMNA 1I5GA 1M99A 2FCHA 5C00A 3APOA 5GSSA 2WGRA 2OE1A 4DSSA 2CV4A 3RAZA 2DJ1A 2HYXA 3GL3A 4OD7A 14GSA 3IA1A 4D73A 3O76A 2VCXA 2GZZA 1T8EB 2VOCA 1X9SB 4E8EA 1M9BA 3HJOA 13GSA 1LU4A 1TDIA 2CVKA 5H5QA 4N30A 1IYIA 4XHMA 2R4VA 4NMUA 1V2AA 1X5CA 4G10A 3WYWA 2IFQB 3ZMLA 2GGTA 3TJJA 3GKMA 3K8NA 2JSZA 2FUG2 3CSHA 2V6OA 3IDVA 5HR3A 4I5QA 4PQHA 3M0FA 2CZ2A 2BTOT 2H1AA 4KB3A 2DC5A 1E6BA 2DMLA 3HVVA 3BJ5A 1O7UA 3D5JA 3F3QA 4ECCA 4OO5A 1SENA 2B5XA 5IOXA 3UEMA 4IW9A 2L59A 5IMFA 3A2XA 9GSSA 5ECPB 18GSA 5D73A 2WB9A 2MMZA 1Q98A 2DLXA 5EY6A 1J08A 2M46A 4EDZA 4BL7A 2DJJA 4IKHA 2FA4A 3G7JA 1GL8A 2JADA 3FEUA 3CSIA 4ZL8A 2OE0A 1F3AA 1AXDA 1GSUA 3GKKA 2MZCA 4HDEA 5HFGA 4MJBA 2I9HA 1LJRA 4N11A 3DRNA 2DJ2A 19GSA 3E3EA 4POLA 12GSA 2VIMA 5CRWA 1TI1A 2EIRA 4XS4A 3D4MA 3FR3A 4OWYA 3IC4A 2CX4A 3F4SA 4K0GA 4WEYA 1HNAA 3VURA 4AF2A 3QR6A 3G7YA 4DEJA 2F3MA 2IMIA 2WFCA 2QGVA 4H86A 3EWLA 3V1WA 1OC9B 3TJBA 2OA7A 6GSXA 1QXHA 2H6XA 1VRSD 4IGJA 4RQRA 3LG6A 3APSA 3PR8A 2F8FA 2K8SA 1FOVA 4G9HA 4MJEA 2CQ9A 2FY6A 5F8BA 1YKAA 2CAIA 3TOTA 1XXUA 5HR1A 3TKPA 2LEGA 4POMA 3KXOA 2OBKA 2WDUA 1GTAA 5G30A 3TJFA 3J7Yb 2PBJA 3TDGA 1R5PA 4KCEA 2H0HA 2I1UA 1AC1A 5H5RA 2GSRA 4CHSA 4GRFA 2Z9SA 1B8XA 3ZIJA 5IPGA 2XPEA 4F0BA 1O85A 3RDWA 1SK0A 1KBNA 4KX4A 1GLPA 1H4OA 4IBPA 5IMVA 4GCIA 4PQ1A 6GSSA 2NPBA 3GKXA 3M1GA 1HNCA 1V58A 3ZFBA 3FY7A 2WZ9A 3GX8A 2GTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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