3G0LA

Crystal structure of human bromodomain adjacent to zinc finger domain 2b (baz2b)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal Structure of Human Bromodomain Adjacent to Zinc finger domain 2B (BAZ2B)
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3g0lA00
4Q0OA 4PY6A 4CUSA 5FE9A 3U5MA 5C4QA 4IOQA 5EK9A 5I40A 2N9GA 5EM3A 2OUOA 4Z93A 5ETDA 4TZ8A 3SVGA 4O72A 5DYCA 4C66A 2YELA 5DFCA 1JM4B 4CUTA 4J0RA 2E7OA 1F68A 5DYAA 4LYSA 4UYHA 4KCXA 3MXFA 4O71A 4DONA 4YH3A 4OUFA 5EP7A 5DKCA 5EPSA 5I7XA 2OSSA 5D0CA 5CGPA 5LKZA 4YAXA 4UIWA 3RCWA 2LSPB 4KV4A 5FFWA 2RFJA 4N4HA 5D24A 3SVFA 3O36A 2RI7A 3LQHA 4HXKA 5F3AA 5AD3A 5HRXA 5EA1A 5A5QA 4BHWA 3P1DA 4O7CA 3JVMA 5I89A 4BJXA 4CUUA 5CRMA 3UV5A 5CQ6A 5EWVA 5ACYA 4TQNA 5ENIA 4Z1QA 5L8UA 2G4AA 4QB3A 5H85A 4NYWA 5D3JA 2FSAA 2OO1A 4HXSA 4QR4A 4UYFA 5II2A 5HELA 4E96A 4UYDA 5HQ5A 4O76A 5CUEA 5L96A 3DAIA 5HQ6A 5DYXA 4F3IA 4MEOA 5E9YA 2E3KA 3Q2EA 4A9HA 3MQMA 3MUKA 3O34A 5JWMA 4QSQA 5KO4A 5KTXA 2R0YA 5E9VA 5H1VA 4BW4A 3U5KA 5HRVA 5D3SA 4A9LA 4C67A 5A81A 3G0LA 4CFLA 4UYEA 3ZYUA 5E9MA 5FB0A 2RNXA 3UV2A 5EI4A 4LDFA 4Q0NA 5FE2A 4A9OA 5J0DA 2F6NA 4YYJA 1EQFA 5C8GA 4KV1A 4NXJA 4PTBA 5EWCA 2WP1A 4QEVA 5EV9A 4YBTA 4N4FA 4FLPA 5CPEA 4HXPA 3GG3A 5L98A 5FB1A 3LJWA 4Z1SA 4WHUA 4QNSA 3DWYA 3P5OA 4NRBA 5JI8A 5DX4A 3UV4A 2I7KA 3QZTA 5KTUA 5II1A 5FE8A 3U5JA 5EWWA 5ETBA 5LKUA 2DVSA 5HENA 4YY4A 3QZVA 5FE1A 5EWHA 5LJ0A 4YADA 4HXMA 5CS8A 5IG6A 4TT2A 4IR6A 4YYNA 5I86A 5HQ7A 4NR8A 4HXOA 4ZW1A 5AD2A 2DVVA 5F63A 4OGJA 5D3PA 3QZSA 4TT4A 5ENGA 5HFRA 4O7AA 4A9NA 2R0VA 5L8TA 5IGNA 4MENA 4HBWA 3G0JA 4QR3A 4O7EA 3FKMX 1N72A 2DVRA 5I80A 5A82A 5CUGA 2YDWA 4IR3A 4QSWA 2YEKA 5CUAA 4YC9A 5I29A 2D9EA 5D3RA 5CUCA 4A9KA 4PCEA 4RVRA 2MJVB 5A5PA 4XYAA 2DWWA 4O77A 5TCMA 1WUGA 4LC2A 4NRAA 4NYXA 5H1TA 2L85A 5ENHA 4YBMA 2DVQA 4QZSA 4XY9A 4XY8A 4QSTA 5FE3A 5D3HA 3AADA 3MB4A 5CRZA 3UVXA 5DW1A 5CFWA 5D7XA 3IU6A 5CQ3A 5G4RA 4WHWA 2F6JA 5HRWA 5A5NA 5TB6A 4QSXA 4XUBA 5KU3A 4QYDA 5CQAA 5DBMA 3I3JA 5E9KA 3S91A 3U5LA 4CL9A 3AQAA 4J3IA 5E74A 4BW2A 4QEWA 4N3WA 5FE5A 3JVJA 2YEMA 5E3GA 2YYNA 4UYGA 5EWDA 4O7BA 4AKNA 4OGIA 4PS5A 5E9IA 4NQMA 4UIZA 4QSSA 4A9MA 4N4GA 5ENEA 5CQ4A 5DYUA 5DKDA 5E73A 4QY4A 5D26A 5D3NA 4IORA 3HMFA 5A83A 4HXLA 2RNWA 3MB3A 4O70A 2I8NA 4TU6A 5E7DA 4NR5A 5CQ8A 3O37A 4LYIA 4YATA 3O33A 5DY7A 4CUPA 5I83A 4J1PA 4TTEA 4X2IA 4YBSA 2WP2A 4O75A 5EISA 5A7CA 5I7YA 5EPBA 4LZ2A 5I88A 5BT5A 3UVDA 3ONIA 4QBMA 5F25A 3UW9A 3O35A 4J0SA 3U5NA 4ZC9A 5KHMA 4QUUA 4TYLA 5LUUA 5FE6A 4UIVA 4NR4A 4TS8A 5C89A 4QSRA 5ENBA 5F36A 5CQ5A 4MR3A 4YH4A 4CFKA 5C7NA 5IIDA 5DLXA 5CTLA 5F1LA 4MEQA 5IGLA 2L5EA 4PCIA 2RNYA 2GRCA 5DW2A 5ENJA 4O78A 4TU4A 4QSPA 4WIVA 5A85A 3D7CA 5FE4A 5L97A 4QEUA 4MR6A 3P1CA 5EU1A 5FH6A 5K29A 4LRGA 5F2PA 5CUDA 2YW5A 5FFVA 5CU8A 5EVAA 4YYIA 4UIXA 4NUEA 5ENCA 5A5OA 5F1HA 5HLSA 4IR5A 3NXBA 5F61A 5LKXA 3Q2FA 5LJ2A 2D82A 5H1UA 5KTWA 3U5PA 4O74A 5CQ7A 5F5ZA 4IOOA 4ALGA 5LKTA 4TT6A 5FDZA 2E7NA 5F62A 4YYDA 3JVLA 2RO1A 1E6IA 3LXJA 4HBVA 4NUCA 4A9IA 4HBXA 5E0RA 5DLZA 5FH8A 4LZSA 4QUTA 3HMHA 4N4IA 5E3DA 2RS9B 4LR6A 5COIA 4ALHA 5EQ1A 2L84A 3SVHA 4NQNA 4HXNA 4NR7A 4PKLA 4HXRA 4NUDA 5HEMA 1X0JA 5D25A 4QR5A 5LVQA 5FE7A 5D3TA 5A5RA 5E9LA 4NRCA 5IGMA 4Z6IA 4YY6A 5FFYA 5FBXA 5FG6A 5HCLA 5EPRA 4UYFB 4BW3A 4LZRA 5BT4A 4MR5A 5AMEA 5FG5A 5HM0A 2DKWA 4IR4A 4NR6A 5FG4A 5F60A 4YYKA 4LYWA 2KTBB 4YK0A 4A9FA 5IBNA 5I1QA 5CZGA 3U5OA 5CUBA 5C87A 3IU5A 5CP5A 4UIYA 5HFQA 5AMFA 4Z6HA 4O7FA 5DFDA 4YYGA 2DATA 4QYLA 3UVYA 4HBYA 3TLPA 4UIUA 5CQTA 4YYHA 5C85A 3LQIA 4MR4A 5EGUA 5L99A 1JSPB 5CY9A 5LJ1A 3P1FA 3S92A 4QC3A 5LVRA 3JVKA 5A5SA 3UVWA 4CURA 4NS5A 4QC1A 5D3LA 5DFBA 3K2JA 5G4SA 2H60A 1WUMA 4TZ2A 4QSUA 4MEPA 4NYVA 4BW1A 4YABA 5HJCA 4XUAA 1ZS5A 2R10A 4YYMA 4A9JA 3MULA 4Y03A 2NXBA 4UITA 5EICA 3HMEA 5FH7A 4ZQLA 5BT3A 4QSVA 4GPJA 2R0SA 4A9EA 5DKHA 5IGKA 4CUQA 4NR9A 3P1EA 4CLBA 2YQDA 5FE0A 3LQJA 5ENFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Q0OA 4PY6A 4CUSA 5FE9A 3U5MA 5C4QA 4IOQA 5EK9A 5I40A 2N9GA 5EM3A 2OUOA 4Z93A 5ETDA 4TZ8A 3SVGA 4O72A 5DYCA 4C66A 2YELA 5DFCA 1JM4B 4CUTA 4J0RA 2E7OA 1F68A 5DYAA 4LYSA 4UYHA 4KCXA 3MXFA 4O71A 4DONA 4YH3A 4OUFA 5EP7A 5DKCA 5EPSA 5I7XA 2OSSA 5D0CA 5CGPA 5LKZA 4YAXA 4UIWA 3RCWA 2LSPB 4KV4A 5FFWA 2RFJA 4N4HA 5D24A 3SVFA 3O36A 2RI7A 3LQHA 4HXKA 5F3AA 5AD3A 5HRXA 5EA1A 5A5QA 4BHWA 3P1DA 4O7CA 3JVMA 5I89A 4BJXA 4CUUA 5CRMA 3UV5A 5CQ6A 5EWVA 5ACYA 4TQNA 5ENIA 4Z1QA 5L8UA 2G4AA 4QB3A 5H85A 4NYWA 5D3JA 2FSAA 2OO1A 4HXSA 4QR4A 4UYFA 5II2A 5HELA 4E96A 4UYDA 5HQ5A 4O76A 5CUEA 5L96A 3DAIA 5HQ6A 5DYXA 4F3IA 4MEOA 5E9YA 3VKHA 2E3KA 3Q2EA 4A9HA 3MQMA 3MUKA 3O34A 5JWMA 4QSQA 5KO4A 5KTXA 2R0YA 5E9VA 5H1VA 4BW4A 3U5KA 5HRVA 5D3SA 4A9LA 4C67A 5A81A 3G0LA 4CFLA 4UYEA 3ZYUA 5E9MA 3D1BA 5FB0A 2RNXA 3UV2A 5EI4A 4LDFA 4Q0NA 5FE2A 4A9OA 5J0DA 2F6NA 4YYJA 1EQFA 5C8GA 4KV1A 4NXJA 4PTBA 5EWCA 2WP1A 4QEVA 5EV9A 4YBTA 4N4FA 4FLPA 5CPEA 4HXPA 3GG3A 5L98A 5FB1A 3LJWA 4Z1SA 4WHUA 4QNSA 3DWYA 3P5OA 4NRBA 5JI8A 5DX4A 2EJNA 3UV4A 2I7KA 3QZTA 5KTUA 5II1A 5FE8A 3U5JA 5EWWA 5ETBA 5LKUA 2DVSA 5HENA 4YY4A 3QZVA 5FE1A 5EWHA 5LJ0A 4YADA 4HXMA 5CS8A 5IG6A 4TT2A 4IR6A 4YYNA 5I86A 5HQ7A 4NR8A 4HXOA 4ZW1A 5AD2A 2DVVA 5F63A 4OGJA 5D3PA 3QZSA 4TT4A 5ENGA 5HFRA 4O7AA 4A9NA 2R0VA 5L8TA 5IGNA 4MENA 1ZKRA 4HBWA 3G0JA 4QR3A 4O7EA 3FKMX 1N72A 2DVRA 5I80A 5A82A 5CUGA 2YDWA 4IR3A 4QSWA 2YEKA 5CUAA 4YC9A 5I29A 2D9EA 5D3RA 5CUCA 4A9KA 4PCEA 4RVRA 2MJVB 5A5PA 4XYAA 2DWWA 4O77A 5TCMA 1WUGA 4LC2A 4NRAA 4NYXA 5H1TA 2L85A 5ENHA 4YBMA 2DVQA 4QZSA 4XY9A 4XY8A 4QSTA 5FE3A 5D3HA 3AADA 3MB4A 5CRZA 3UVXA 5DW1A 5CFWA 5D7XA 3IU6A 5CQ3A 5G4RA 4WHWA 2F6JA 5HRWA 5A5NA 5TB6A 4QSXA 3VKGA 4XUBA 5KU3A 4QYDA 5CQAA 3I3JA 5DBMA 5E9KA 3S91A 3U5LA 4CL9A 3AQAA 4J3IA 5E74A 4BW2A 4QEWA 4N3WA 5FE5A 3JVJA 2YEMA 5E3GA 2YYNA 4UYGA 5EWDA 4O7BA 4AKNA 3D1DA 4OGIA 4PS5A 5E9IA 4NQMA 4UIZA 4QSSA 4A9MA 4N4GA 5ENEA 5CQ4A 5DYUA 5DKDA 5E73A 4QY4A 5D26A 5D3NA 4IORA 3HMFA 5A83A 4HXLA 2RNWA 3MB3A 4O70A 2I8NA 4TU6A 5E7DA 4NR5A 5CQ8A 3O37A 4LYIA 4YATA 3O33A 5DY7A 4CUPA 5I83A 4J1PA 4TTEA 4X2IA 4YBSA 2WP2A 4O75A 5EISA 5A7CA 5I7YA 5EPBA 4LZ2A 5I88A 5BT5A 3UVDA 3ONIA 4QBMA 5F25A 3UW9A 3O35A 4J0SA 3U5NA 4ZC9A 5KHMA 4QUUA 4TYLA 5LUUA 5FE6A 4UIVA 4NR4A 4TS8A 5C89A 4QSRA 5ENBA 5F36A 5CQ5A 4MR3A 4YH4A 4CFKA 5C7NA 5IIDA 5DLXA 5CTLA 5F1LA 4MEQA 5IGLA 4AKIA 2L5EA 4PCIA 2RNYA 2GRCA 5DW2A 5ENJA 4O78A 4TU4A 4QSPA 4WIVA 5A85A 3D7CA 5FE4A 5L97A 4QEUA 4MR6A 3P1CA 5EU1A 5FH6A 5K29A 4LRGA 5F2PA 5CUDA 2YW5A 5FFVA 5CU8A 5EVAA 4YYIA 4UIXA 4NUEA 5ENCA 5A5OA 5F1HA 5HLSA 4IR5A 3NXBA 5F61A 5LKXA 3Q2FA 5LJ2A 2D82A 5H1UA 5KTWA 3U5PA 4O74A 5CQ7A 5F5ZA 4IOOA 4ALGA 5LKTA 4TT6A 5FDZA 2E7NA 5F62A 4YYDA 3JVLA 2RO1A 1E6IA 3LXJA 4HBVA 4NUCA 4A9IA 4HBXA 5E0RA 5DLZA 5FH8A 4LZSA 4QUTA 3HMHA 4N4IA 5E3DA 2RS9B 4LR6A 5COIA 4ALHA 5EQ1A 2L84A 3SVHA 4NQNA 4HXNA 4NR7A 4PKLA 4HXRA 4NUDA 5HEMA 1X0JA 5D25A 4QR5A 5LVQA 5FE7A 5D3TA 5A5RA 5E9LA 4NRCA 5IGMA 4Z6IA 4YY6A 5FFYA 5FBXA 5FG6A 5HCLA 5EPRA 4UYFB 4BW3A 4LZRA 5BT4A 4MR5A 5AMEA 5FG5A 5HM0A 2DKWA 4IR4A 4NR6A 4AKHA 5FG4A 5F60A 4YYKA 4LYWA 2KTBB 4YK0A 4A9FA 5IBNA 5I1QA 5CZGA 3U5OA 5CUBA 5C87A 3IU5A 5CP5A 4UIYA 5HFQA 5AMFA 4Z6HA 4O7FA 5DFDA 4YYGA 2DATA 4QYLA 3UVYA 4HBYA 3TLPA 4UIUA 5CQTA 4YYHA 5C85A 3LQIA 4MR4A 5EGUA 5L99A 1JSPB 5CY9A 5LJ1A 3P1FA 3S92A 4QC3A 5LVRA 3JVKA 5A5SA 3UVWA 4CURA 4AKGA 4NS5A 4QC1A 5D3LA 5DFBA 3K2JA 5G4SA 2H60A 1WUMA 4TZ2A 4QSUA 4MEPA 1PUOA 4NYVA 4BW1A 4YABA 5HJCA 4XUAA 1ZS5A 3ERRA 2R10A 4YYMA 4A9JA 4AI6A 3MULA 4Y03A 2NXBA 4UITA 5EICA 3HMEA 5FH7A 4ZQLA 5BT3A 4QSVA 4GPJA 2R0SA 4A9EA 5DKHA 5IGKA 4CUQA 4NR9A 3P1EA 4CLBA 2YQDA 5FE0A 3LQJA 5ENFA
chains in the Genus database with same CATH topology
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