3G0LA

Crystal structure of human bromodomain adjacent to zinc finger domain 2b (baz2b)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of Human Bromodomain Adjacent to Zinc finger domain 2B (BAZ2B)
rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3g0lA00
5EWCA 5C87A 2DVRA 4O75A 4XUAA 3JVJA 3MB3A 3D7CA 3AADA 5HRWA 5KO4A 5CGPA 3SVGA 1ZS5A 5I88A 5F5ZA 5CUAA 5C85A 4J3IA 4NYVA 1EQFA 4TZ8A 3MUKA 3JVLA 5EQ1A 5FB0A 4QB3A 4UYFA 5D3TA 1WUGA 4BW2A 2NXBA 3UV5A 4O7FA 2DVVA 4O70A 4TU6A 4BW1A 4QEVA 4YY4A 5HQ6A 5CZGA 5FE8A 3LQIA 5A7CA 1X0JA 4PS5A 3LXJA 5ENHA 5IGKA 5D3HA 4NQNA 5E3DA 1WUMA 5HRXA 4QSPA 4OUFA 3UVXA 4QYLA 2WP1A 5A5QA 4A9NA 1JSPB 5DLXA 2RS9B 4QC1A 5A5SA 5D0CA 5CRMA 2L5EA 3S92A 5L97A 5G4RA 4WIVA 5II1A 5AD2A 1F68A 5EGUA 2LSPB 5HENA 4NR7A 4KCXA 4NS5A 2KTBB 4UYEA 5I7YA 5F36A 2YELA 5I1QA 5LKUA 5D25A 5G4SA 5DLZA 5E3GA 5EISA 4IOOA 4NR6A 3UVYA 1N72A 4HXKA 5C7NA 5ENIA 3NXBA 5D7XA 5H85A 4PKLA 5EWHA 5IBNA 4E96A 4UITA 3S91A 5CQ7A 4HBWA 5E9KA 4YBTA 5HQ5A 5J0DA 2N9GA 4QBMA 3LJWA 5DFDA 4YBSA 4LC2A 3O35A 4ZW1A 5F25A 5CQ4A 5E9VA 5CP5A 4MEOA 2F6JA 5I80A 2OO1A 5CUEA 3JVMA 3Q2EA 1JM4B 4LDFA 5FE5A 4WHUA 5HFRA 4J0SA 2L84A 5FBXA 4CL9A 3P1EA 5F1HA 4MEQA 2OUOA 4QSWA 2D82A 5AD3A 5D3RA 2OSSA 5LVQA 3UVWA 2D9EA 5LJ2A 5KTUA 4YYHA 3O37A 5FFVA 4IR4A 3IU5A 5E0RA 4MR4A 4QR4A 4UYDA 5FE9A 3P1DA 3P5OA 4HBYA 4A9IA 4YADA 4ZQLA 5IG6A 5FH7A 4OGIA 4NUEA 3P1CA 5FE3A 3TLPA 4YATA 4TT6A 5L8TA 4O74A 4FLPA 4LYIA 4XYAA 3LQHA 2YEKA 4YYMA 2GRCA 5F60A 4A9LA 4DONA 3O33A 3AQAA 5HFQA 5DKHA 4J0RA 4LR6A 4CUQA 5H1TA 5LUUA 3K2JA 5D26A 5FFYA 4QNSA 5EV9A 3O34A 2E7NA 5CUCA 5F61A 4UIVA 5F1LA 5L99A 3G0LA 4CUSA 5JWMA 4NXJA 4A9JA 4O71A 5F62A 5EI4A 5HM0A 4Z93A 2YYNA 4UIZA 2I8NA 4YBMA 2YEMA 5CS8A 4A9HA 2DVSA 2DKWA 2RO1A 4XY9A 4YH3A 4O72A 4MEPA 5DW1A 3MULA 4QC3A 2G4AA 4QUTA 4TS8A 4QEUA 4XY8A 4O7AA 4NR9A 5HJCA 4BHWA 2RNXA 3O36A 4NRAA 4YYKA 4YY6A 2YW5A 5K29A 5FFWA 3U5PA 5IGNA 2H60A 3SVHA 5TCMA 4BW4A 5E74A 4C67A 3DAIA 4N3WA 5FE7A 4CFLA 3DWYA 4CUUA 5ETBA 4YABA 5BT4A 5DYXA 4O77A 5FB1A 4OGJA 5HQ7A 2E3KA 4NRBA 3U5OA 4IR5A 5HRVA 5LVRA 4GPJA 5CQ3A 5DBMA 4ALGA 5D3PA 4BJXA 3LQJA 3QZSA 5ETDA 5DX4A 2E7OA 3I3JA 4LYWA 5EPBA 4YYGA 3IU6A 5CY9A 5E9LA 5E9MA 5EVAA 4QZSA 5CPEA 5FE1A 5AMEA 5I7XA 5DYCA 5CU8A 4LRGA 4QSSA 4TZ2A 4QR3A 4A9MA 5EPSA 3QZVA 5E9YA 4HXLA 5EM3A 4O78A 4HBVA 5BT5A 5L96A 4LYSA 4BW3A 5L98A 5LJ1A 5ENCA 4TTEA 5I29A 2DWWA 4TQNA 4YAXA 4NYXA 5F3AA 3MXFA 4CFKA 5BT3A 4NRCA 5D3LA 4NR4A 5DFCA 5CFWA 5KU3A 4QY4A 3MQMA 4QSXA 2R0YA 5HELA 5CUDA 4HBXA 5DY7A 4Z6IA 5F2PA 2MJVB 4CUPA 5FG5A 5FE4A 4J1PA 4QSVA 3U5JA 4HXPA 2RNYA 3HMEA 5C4QA 4NUCA 4O7EA 5DKDA 5LJ0A 3U5LA 2YDWA 4N4FA 5FG6A 5IIDA 5EWWA 3MB4A 4LZRA 5H1UA 5FDZA 4QSTA 5KTWA 4CURA 4A9KA 4MR5A 3U5MA 3QZTA 4YYNA 3HMFA 5DYAA 4A9OA 3G0JA 5I83A 4IR3A 4ZC9A 2F6NA 4IORA 4PY6A 4NQMA 5D3NA 4HXMA 4QEWA 5CUGA 4AKNA 5EU1A 2R10A 5HLSA 5A81A 4YYIA 4A9EA 4MR3A 4A9FA 5E73A 2I7KA 4TT2A 4UYHA 4QUUA 5EP7A 4TU4A 4NUDA 5FE0A 5ENJA 4HXNA 3U5NA 4N4GA 5EA1A 5A85A 5D24A 4YH4A 4Z1QA 4IR6A 4XUBA 4Z1SA 4UYFB 2RNWA 1E6IA 3GG3A 5AMFA 5DYUA 4N4IA 5ENBA 5EWDA 5E7DA 5A5NA 5TB6A 4LZSA 5DFBA 4LZ2A 4PTBA 4QYDA 4Q0NA 5IGMA 3UW9A 4KV1A 5JI8A 2DVQA 5COIA 4HXOA 5FH8A 2L85A 4WHWA 5ENEA 5HEMA 4QSQA 4IOQA 4PCIA 4YC9A 5C8GA 4X2IA 5ACYA 5DW2A 5ENFA 5FG4A 4UIXA 5CQ8A 4ALHA 4YYDA 4N4HA 4QSRA 4RVRA 5EWVA 5F63A 5A5PA 5H1VA 4TYLA 5II2A 4Z6HA 3P1FA 5A82A 5I89A 5CTLA 2WP2A 5EK9A 5FE6A 5KTXA 4YYJA 5I86A 5FH6A 4QSUA 5A5RA 4TT4A 4UIWA 5A83A 3JVKA 5CQ5A 3FKMX 5LKZA 2R0VA 5L8UA 5CRZA 5CUBA 5KHMA 4UYGA 2RI7A 5FE2A 5D3JA 5HCLA 3HMHA 4NYWA 3ONIA 4HXSA 5CQTA 2RFJA 4NR8A 4QR5A 5C89A 5IGLA 4O7CA 4MENA 4F3IA 5LKTA 4UIUA 4C66A 4CUTA 5D3SA 5EPRA 5CQAA 5E9IA 4O76A 4PCEA 3SVFA 4KV4A 3ZYUA 5I40A 4CLBA 5EICA 3UV2A 3U5KA 4NR5A 2YQDA 3UV4A 4UIYA 5A5OA 2DATA 4MR6A 4Y03A 2FSAA 5ENGA 3Q2FA 2R0SA 4YK0A 4O7BA 5LKXA 3UVDA 4HXRA 3RCWA 5DKCA 4Q0OA 5CQ6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EWCA 5C87A 2DVRA 4O75A 4XUAA 3JVJA 3MB3A 3D7CA 3AADA 5HRWA 5KO4A 5CGPA 3SVGA 1ZS5A 5I88A 5F5ZA 5CUAA 5C85A 4J3IA 4NYVA 1EQFA 3D1DA 4TZ8A 3MUKA 3JVLA 5EQ1A 5FB0A 4QB3A 4UYFA 5D3TA 1WUGA 4BW2A 2NXBA 3UV5A 4O7FA 2DVVA 4O70A 4TU6A 4BW1A 4QEVA 4YY4A 5HQ6A 5CZGA 5FE8A 3LQIA 5A7CA 1X0JA 4PS5A 3LXJA 5ENHA 5IGKA 5D3HA 4NQNA 5E3DA 1WUMA 5HRXA 4QSPA 4OUFA 3UVXA 4QYLA 2WP1A 5A5QA 4A9NA 1JSPB 5DLXA 2RS9B 4QC1A 5A5SA 5D0CA 5CRMA 2L5EA 3S92A 5L97A 5G4RA 4WIVA 5II1A 5AD2A 1F68A 3D1BA 5EGUA 2LSPB 5HENA 4NR7A 4KCXA 4NS5A 2KTBB 4UYEA 5I7YA 5F36A 2YELA 5I1QA 5LKUA 5D25A 5G4SA 5DLZA 5E3GA 5EISA 4IOOA 2EJNA 4NR6A 3UVYA 1N72A 4HXKA 5C7NA 5ENIA 3NXBA 5D7XA 5H85A 4PKLA 5EWHA 5IBNA 4E96A 4UITA 3S91A 5CQ7A 4HBWA 5E9KA 4YBTA 5HQ5A 5J0DA 2N9GA 4QBMA 3LJWA 5DFDA 4YBSA 4LC2A 3O35A 4ZW1A 5F25A 5CQ4A 5E9VA 5CP5A 4MEOA 2F6JA 4AKHA 5I80A 2OO1A 5CUEA 3JVMA 3Q2EA 1JM4B 4LDFA 5FE5A 4WHUA 5HFRA 4J0SA 2L84A 5FBXA 4CL9A 3P1EA 5F1HA 4MEQA 2OUOA 4QSWA 2D82A 5AD3A 5D3RA 2OSSA 5LVQA 3UVWA 2D9EA 5LJ2A 5KTUA 4YYHA 3O37A 5FFVA 4IR4A 3IU5A 5E0RA 4MR4A 4QR4A 4UYDA 5FE9A 3P1DA 3P5OA 4HBYA 4A9IA 4YADA 4ZQLA 5IG6A 5FH7A 4OGIA 4NUEA 3P1CA 5FE3A 3TLPA 4YATA 4TT6A 5L8TA 4O74A 4FLPA 4LYIA 4XYAA 3LQHA 2YEKA 4YYMA 2GRCA 5F60A 4A9LA 4DONA 3O33A 3AQAA 5HFQA 5DKHA 4J0RA 4LR6A 4CUQA 5H1TA 5LUUA 3K2JA 5D26A 5FFYA 4QNSA 5EV9A 3O34A 2E7NA 5CUCA 5F61A 4UIVA 5F1LA 5L99A 3G0LA 4CUSA 5JWMA 4NXJA 4A9JA 4O71A 5F62A 5EI4A 5HM0A 4Z93A 2YYNA 4UIZA 2I8NA 4YBMA 2YEMA 5CS8A 4A9HA 2DVSA 2DKWA 2RO1A 4XY9A 4YH3A 4O72A 4MEPA 5DW1A 4QC3A 3MULA 2G4AA 4QUTA 4TS8A 4QEUA 4XY8A 4O7AA 4NR9A 5HJCA 4BHWA 2RNXA 3O36A 4NRAA 4YYKA 4YY6A 2YW5A 5K29A 5FFWA 3U5PA 5IGNA 2H60A 3SVHA 5TCMA 4BW4A 5E74A 4C67A 3DAIA 4N3WA 5FE7A 4CFLA 3DWYA 4CUUA 5ETBA 4YABA 5BT4A 5DYXA 4O77A 5FB1A 4OGJA 5HQ7A 2E3KA 4NRBA 3U5OA 4IR5A 5HRVA 5LVRA 4GPJA 5CQ3A 5DBMA 4ALGA 5D3PA 4BJXA 3LQJA 3QZSA 5ETDA 5DX4A 2E7OA 3I3JA 4LYWA 5EPBA 4YYGA 3IU6A 5CY9A 5E9LA 5E9MA 5EVAA 4QZSA 5CPEA 5FE1A 5AMEA 5I7XA 5DYCA 5CU8A 4LRGA 4QSSA 4TZ2A 4QR3A 4A9MA 5EPSA 3QZVA 5E9YA 4HXLA 5EM3A 4O78A 4HBVA 5BT5A 5L96A 4LYSA 4BW3A 5L98A 5LJ1A 5ENCA 4TTEA 5I29A 4AI6A 2DWWA 4TQNA 4YAXA 4NYXA 5F3AA 3MXFA 4CFKA 5BT3A 4NRCA 5D3LA 4NR4A 5DFCA 5CFWA 5KU3A 4QY4A 3MQMA 4QSXA 2R0YA 5HELA 5CUDA 4HBXA 3VKGA 5DY7A 4Z6IA 5F2PA 3ERRA 2MJVB 4CUPA 5FG5A 5FE4A 4J1PA 4QSVA 1PUOA 3U5JA 4HXPA 2RNYA 3HMEA 5C4QA 4NUCA 4O7EA 5DKDA 5LJ0A 3U5LA 2YDWA 4N4FA 5FG6A 5IIDA 5EWWA 3MB4A 4LZRA 5H1UA 5FDZA 4QSTA 5KTWA 4CURA 4A9KA 4MR5A 3U5MA 3QZTA 4YYNA 3HMFA 5DYAA 4A9OA 3G0JA 5I83A 4IR3A 4ZC9A 2F6NA 4IORA 4PY6A 4NQMA 5D3NA 4HXMA 4QEWA 5CUGA 4AKNA 5EU1A 2R10A 5HLSA 5A81A 4YYIA 4A9EA 4MR3A 4A9FA 5E73A 2I7KA 4TT2A 4UYHA 4QUUA 5EP7A 4TU4A 4NUDA 5FE0A 5ENJA 4HXNA 3U5NA 4N4GA 5EA1A 5A85A 5D24A 4YH4A 4Z1QA 4IR6A 4XUBA 4Z1SA 4UYFB 2RNWA 1E6IA 3GG3A 5AMFA 5DYUA 4N4IA 5ENBA 5EWDA 5E7DA 5A5NA 5TB6A 4LZSA 5DFBA 3VKHA 4LZ2A 4PTBA 4QYDA 4Q0NA 5IGMA 3UW9A 4KV1A 5JI8A 2DVQA 5COIA 4HXOA 5FH8A 2L85A 4WHWA 5ENEA 5HEMA 4QSQA 4IOQA 4PCIA 4YC9A 5C8GA 4X2IA 5ACYA 5DW2A 5ENFA 5FG4A 4UIXA 5CQ8A 4ALHA 4YYDA 4N4HA 4QSRA 4RVRA 5EWVA 5F63A 5A5PA 5H1VA 4TYLA 5II2A 4Z6HA 4AKGA 3P1FA 5A82A 5I89A 5CTLA 2WP2A 5EK9A 5FE6A 5KTXA 4YYJA 5I86A 5FH6A 4QSUA 5A5RA 4TT4A 4UIWA 5A83A 3JVKA 5CQ5A 3FKMX 5LKZA 1ZKRA 2R0VA 5L8UA 5CRZA 5CUBA 5KHMA 4UYGA 2RI7A 5FE2A 5D3JA 5HCLA 3HMHA 4NYWA 3ONIA 4HXSA 5CQTA 2RFJA 4NR8A 4QR5A 5C89A 5IGLA 4O7CA 4MENA 4F3IA 5LKTA 4UIUA 4C66A 4CUTA 5D3SA 5EPRA 5CQAA 5E9IA 4O76A 4PCEA 3SVFA 4KV4A 3ZYUA 5I40A 4CLBA 5EICA 3UV2A 3U5KA 4NR5A 2YQDA 3UV4A 4UIYA 5A5OA 4AKIA 2DATA 4MR6A 4Y03A 2FSAA 5ENGA 3Q2FA 2R0SA 4YK0A 4O7BA 5LKXA 3UVDA 4HXRA 3RCWA 5DKCA 4Q0OA 5CQ6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EWC A;  5C87 A;  2DVR A;  4O75 A;  4XUA A;  3JVJ A;  3MB3 A;  3D7C A;  3AAD A;  5HRW A;  5KO4 A;  5CGP A;  3SVG A;  1ZS5 A;  5I88 A;  5F5Z A;  5CUA A;  5C85 A;  4J3I A;  4NYV A;  1EQF A;  4TZ8 A;  3MUK A;  3JVL A;  5EQ1 A;  5FB0 A;  4QB3 A;  4UYF A;  5D3T A;  1WUG A;  4BW2 A;  2NXB A;  3UV5 A;  4O7F A;  2DVV A;  4O70 A;  4TU6 A;  4BW1 A;  4QEV A;  4YY4 A;  5HQ6 A;  5CZG A;  5FE8 A;  3LQI A;  5A7C A;  1X0J A;  4PS5 A;  3LXJ A;  5ENH A;  5IGK A;  5D3H A;  4NQN A;  5E3D A;  1WUM A;  5HRX A;  4QSP A;  4OUF A;  3UVX A;  4QYL A;  2WP1 A;  5A5Q A;  4A9N A;  1JSP B;  5DLX A;  2RS9 B;  4QC1 A;  5A5S A;  5D0C A;  5CRM A;  2L5E A;  3S92 A;  5L97 A;  5G4R A;  4WIV A;  5II1 A;  5AD2 A;  1F68 A;  5EGU A;  2LSP B;  5HEN A;  4NR7 A;  4KCX A;  4NS5 A;  2KTB B;  4UYE A;  5I7Y A;  5F36 A;  2YEL A;  5I1Q A;  5LKU A;  5D25 A;  5G4S A;  5DLZ A;  5E3G A;  5EIS A;  4IOO A;  4NR6 A;  3UVY A;  1N72 A;  4HXK A;  5C7N A;  5ENI A;  3NXB A;  5D7X A;  5H85 A;  4PKL A;  5EWH A;  5IBN A;  4E96 A;  4UIT A;  3S91 A;  5CQ7 A; 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