3G0LA

Crystal structure of human bromodomain adjacent to zinc finger domain 2b (baz2b)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal Structure of Human Bromodomain Adjacent to Zinc finger domain 2B (BAZ2B)
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3g0lA00
5FE6A 5AD3A 3HMEA 4UIXA 4LR6A 4O7FA 2GRCA 2YELA 5DY7A 5LKUA 4FLPA 4KCXA 4Z1QA 5CUCA 4C67A 4TQNA 4NRCA 5EWVA 3U5NA 5CUAA 4O7BA 2D82A 4A9FA 5CUEA 3QZVA 5C85A 2DATA 2R0SA 2RS9B 2E3KA 3IU5A 4YH4A 3S91A 5ACYA 5HELA 5D3JA 3LJWA 3U5JA 2DVQA 4PCEA 4TYLA 4QEWA 4HXOA 5FE1A 4MEOA 5E9LA 4ZC9A 5AMEA 5FG6A 2LSPB 4HBWA 5CQTA 4YAXA 3HMFA 4HXLA 5FG4A 2RNWA 5EP7A 5A5PA 3O36A 5CP5A 4QR4A 2RI7A 4NRAA 5AMFA 4QC1A 4YYKA 5F2PA 4TZ2A 4QR3A 5D25A 4J1PA 3RCWA 5A7CA 4NR6A 3G0JA 5HRVA 4CUQA 5H85A 3U5LA 3MULA 4KV4A 4NXJA 3P5OA 4Q0NA 5DFDA 2R0VA 4A9JA 4QUUA 5EWWA 4YYDA 5F61A 4NYVA 4WHUA 5HQ5A 5E9VA 2F6NA 2YDWA 1E6IA 4MR4A 5I1QA 5IGLA 4UYFA 5LVQA 5HLSA 4O75A 4PKLA 5H1UA 5C87A 4O70A 5KTXA 5FE0A 3K2JA 4Z6HA 3P1CA 5KTUA 5E3GA 2I8NA 4NUDA 2DVSA 5HM0A 5HCLA 5FH6A 1F68A 4LC2A 5KO4A 4O72A 4QZSA 5D3TA 5KHMA 5CQ5A 4E96A 2YEMA 4NR7A 4XY8A 5I40A 5L97A 4XY9A 5CQ4A 4N4HA 4MR6A 4NQMA 4YADA 5LKZA 4LYIA 4OUFA 4N4FA 5ENEA 4NQNA 5D3RA 5DBMA 4LZRA 5EWHA 3LQIA 4TT2A 5EU1A 1JSPB 5E9MA 5IGKA 4QB3A 5CUDA 1WUMA 3QZTA 5DKCA 2DWWA 4QSSA 5EGUA 4O7CA 4A9HA 4WHWA 5HRWA 5D3LA 5DLXA 2E7OA 4KV1A 5A5RA 4HXMA 5A5NA 4YYHA 4NS5A 5A83A 4BW1A 5I88A 5IIDA 4YY6A 5I29A 4Z1SA 5E9IA 4UIWA 3SVGA 4QEUA 4CURA 1WUGA 4NRBA 4HXKA 5FE7A 4QNSA 2G4AA 3TLPA 5I86A 4BHWA 5LKXA 5L98A 5IGNA 5CQAA 4CFKA 5DYUA 5F62A 4LYSA 4LZSA 3JVJA 5EQ1A 2YQDA 3UVDA 3D7CA 5CUGA 5C8GA 4F3IA 4UIYA 4QBMA 4YYJA 5CS8A 5FB0A 5TB6A 4YY4A 4C66A 4NR5A 1ZS5A 5F60A 5I7XA 4BW4A 4QYDA 4HXNA 3SVFA 3MQMA 5COIA 3G0LA 5EK9A 3MB4A 1N72A 3UVXA 5DFBA 4PTBA 5CZGA 3GG3A 5CQ6A 4Z6IA 2WP2A 4LRGA 4TS8A 5D3SA 4A9EA 3AADA 4GPJA 5CQ8A 4BJXA 5A85A 4Z93A 4CUUA 4CUSA 4NR4A 4MENA 4X2IA 4UITA 4O7EA 5FFVA 5ENCA 2D9EA 4IR4A 4TT6A 5DYXA 4UYEA 5F1LA 2R10A 5F63A 4IOOA 2H60A 5A5QA 5FB1A 4MR3A 5ENIA 4QC3A 4UYGA 5C4QA 2WP1A 3FKMX 3SVHA 5A81A 2OO1A 5JI8A 5D0CA 4CFLA 4NUEA 3UV5A 2DKWA 5F5ZA 3P1EA 4CUTA 3P1FA 4A9LA 5HJCA 4HXPA 3U5PA 5E73A 2L85A 2RNYA 4LDFA 4Q0OA 3LQJA 5BT5A 2YEKA 4OGJA 3P1DA 4YABA 5FBXA 4ZQLA 5CFWA 5CRMA 4Y03A 4ALGA 4N3WA 5CTLA 5E9KA 5I7YA 4UIZA 4YYNA 3ONIA 4XUBA 3IU6A 4LZ2A 4LYWA 3Q2FA 4QR5A 5H1TA 3O33A 4IR6A 4MEQA 5J0DA 2OSSA 5II2A 5FE2A 4YC9A 4CLBA 5IG6A 4PS5A 3DWYA 3Q2EA 4NUCA 5H1VA 5L96A 5IGMA 5L8TA 5E74A 5HEMA 4TU4A 4QSPA 5HRXA 5AD2A 5E0RA 5I80A 4A9KA 4YBSA 4UYFB 5LJ0A 3O34A 4QSVA 4A9IA 5D26A 4O77A 2L84A 5ENBA 4IR5A 5G4RA 3U5KA 4XUAA 2N9GA 5CPEA 2RFJA 3AQAA 4O7AA 5F25A 5ENJA 4N4GA 5EPRA 4HXSA 5CGPA 5ENGA 4QY4A 3UV2A 4A9NA 5L8UA 3U5OA 5EPSA 3UVYA 4OGIA 4QSTA 5FE4A 5LUUA 5FDZA 5E9YA 4PY6A 4UIUA 5EM3A 5HQ7A 4A9OA 2F6JA 4QSXA 3MXFA 5D24A 5I83A 5CQ3A 5HFRA 4TZ8A 4QEVA 5DW2A 2R0YA 5K29A 5LVRA 5BT3A 5FE3A 4NYXA 4J0SA 2FSAA 4CUPA 4J3IA 4CL9A 5ENFA 3ZYUA 4NR8A 5TCMA 5LJ1A 2OUOA 4HBVA 4BW2A 1EQFA 3HMHA 5EV9A 3QZSA 5CRZA 4XYAA 5FH8A 4QYLA 5DKHA 3UV4A 5DLZA 4PCIA 5HFQA 3UW9A 4BW3A 3JVKA 5EWCA 5E3DA 5II1A 4HXRA 5D3HA 5FE9A 4N4IA 4TU6A 4UIVA 5L99A 2RNXA 4O71A 4O76A 5A5SA 5KTWA 5A5OA 4A9MA 4NR9A 5ETBA 4O74A 5I89A 2RO1A 4QUTA 5F36A 4QSRA 4TTEA 5LKTA 5EA1A 4YYGA 5G4SA 5C7NA 4YH3A 5EVAA 5EWDA 4WIVA 4DONA 4HBYA 4IR3A 5BT4A 5HQ6A 4ZW1A 5LJ2A 4UYDA 3O35A 4MR5A 5E7DA 5FE8A 4ALHA 4IOQA 3S92A 5DW1A 3JVMA 5EICA 5FH7A 4QSWA 5HENA 5FE5A 5A82A 4AKNA 3JVLA 3I3JA 5DKDA 3LQHA 5EI4A 5FG5A 2DVRA 3DAIA 3MUKA 3U5MA 2I7KA 5DX4A 4YYMA 5ENHA 2KTBB 5DYCA 4UYHA 5CU8A 5F1HA 5CUBA 5F3AA 5DFCA 5DYAA 5FFYA 3UVWA 5CQ7A 4TT4A 5D7XA 4QSUA 3LXJA 4MEPA 4YATA 3MB3A 4IORA 5CY9A 4NYWA 5ETDA 2YYNA 5D3PA 5FFWA 5EPBA 5C89A 3O37A 5EISA 4J0RA 2E7NA 4YYIA 4YK0A 1JM4B 2YW5A 5IBNA 4YBTA 5D3NA 2DVVA 4YBMA 5KU3A 4O78A 4RVRA 2MJVB 2NXBA 2L5EA 3NXBA 5JWMA 4HBXA 1X0JA 4QSQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE6A 5AD3A 3HMEA 4UIXA 4LR6A 4O7FA 2GRCA 2YELA 5DY7A 5LKUA 4FLPA 4KCXA 4Z1QA 5CUCA 4C67A 4TQNA 4NRCA 5EWVA 3U5NA 5CUAA 4O7BA 2D82A 4A9FA 5CUEA 3QZVA 5C85A 2DATA 2R0SA 2RS9B 2E3KA 3IU5A 4YH4A 3S91A 5ACYA 5HELA 5D3JA 3LJWA 3U5JA 1ZKRA 2DVQA 4PCEA 4TYLA 4QEWA 4HXOA 5FE1A 4MEOA 5E9LA 3ERRA 4ZC9A 5AMEA 5FG6A 2LSPB 4HBWA 5CQTA 4YAXA 3HMFA 4HXLA 5FG4A 2RNWA 5EP7A 5A5PA 3O36A 5CP5A 4QR4A 2RI7A 2EJNA 4NRAA 5AMFA 4QC1A 4YYKA 5F2PA 4TZ2A 4QR3A 5D25A 4J1PA 3RCWA 5A7CA 4NR6A 3G0JA 5HRVA 4CUQA 5H85A 3U5LA 3MULA 4AI6A 4KV4A 4NXJA 3P5OA 4Q0NA 5DFDA 2R0VA 4A9JA 4QUUA 5EWWA 4YYDA 5F61A 4NYVA 4WHUA 5HQ5A 5E9VA 4AKHA 2F6NA 2YDWA 1E6IA 4MR4A 5I1QA 5IGLA 4UYFA 5LVQA 5HLSA 4O75A 4PKLA 5H1UA 5C87A 4O70A 5KTXA 5FE0A 3K2JA 4Z6HA 3P1CA 5KTUA 5E3GA 2I8NA 4NUDA 2DVSA 5HM0A 5HCLA 5FH6A 1F68A 4LC2A 5KO4A 4O72A 4QZSA 5D3TA 5KHMA 5CQ5A 4E96A 2YEMA 4NR7A 4XY8A 5I40A 5L97A 4XY9A 5CQ4A 4N4HA 4MR6A 4NQMA 4YADA 5LKZA 4LYIA 4OUFA 3D1DA 4N4FA 5ENEA 4NQNA 5D3RA 5DBMA 4LZRA 5EWHA 3LQIA 4TT2A 5EU1A 1JSPB 5E9MA 5IGKA 4QB3A 5CUDA 1WUMA 3QZTA 5DKCA 2DWWA 4QSSA 5EGUA 4O7CA 4A9HA 4WHWA 5HRWA 5D3LA 5DLXA 2E7OA 4KV1A 5A5RA 4HXMA 5A5NA 4YYHA 4NS5A 5A83A 4BW1A 5I88A 5IIDA 4YY6A 5I29A 4Z1SA 5E9IA 4UIWA 3SVGA 4QEUA 4CURA 1WUGA 4NRBA 4HXKA 5FE7A 4QNSA 2G4AA 3TLPA 5I86A 4BHWA 5LKXA 5L98A 5IGNA 5CQAA 4CFKA 5DYUA 5F62A 4LYSA 4LZSA 3JVJA 5EQ1A 2YQDA 3UVDA 3D7CA 5CUGA 5C8GA 4F3IA 4UIYA 4QBMA 4YYJA 5CS8A 5FB0A 5TB6A 4YY4A 4C66A 4NR5A 1ZS5A 5F60A 3VKGA 5I7XA 4BW4A 4QYDA 4HXNA 3SVFA 3MQMA 3VKHA 5COIA 3G0LA 5EK9A 3MB4A 1N72A 3UVXA 5DFBA 4PTBA 5CZGA 3GG3A 5CQ6A 4Z6IA 2WP2A 4LRGA 4TS8A 5D3SA 4A9EA 3AADA 4GPJA 5CQ8A 4BJXA 5A85A 4Z93A 4CUUA 4CUSA 4NR4A 4MENA 4X2IA 4UITA 4O7EA 5FFVA 5ENCA 2D9EA 4IR4A 4TT6A 5DYXA 4UYEA 5F1LA 2R10A 5F63A 4IOOA 2H60A 1PUOA 5A5QA 5FB1A 4MR3A 5ENIA 4QC3A 4UYGA 5C4QA 2WP1A 3FKMX 3SVHA 5A81A 2OO1A 5JI8A 5D0CA 4CFLA 4NUEA 3UV5A 2DKWA 5F5ZA 3P1EA 4CUTA 3P1FA 4A9LA 5HJCA 4HXPA 3U5PA 5E73A 2L85A 2RNYA 4LDFA 4Q0OA 3LQJA 5BT5A 4AKGA 2YEKA 4OGJA 3P1DA 4YABA 5FBXA 4ZQLA 5CFWA 5CRMA 4Y03A 4ALGA 4N3WA 5CTLA 5E9KA 5I7YA 4UIZA 4YYNA 3ONIA 4XUBA 3IU6A 4LZ2A 4LYWA 3Q2FA 4QR5A 5H1TA 3O33A 4IR6A 4MEQA 5J0DA 2OSSA 5II2A 5FE2A 4YC9A 4CLBA 5IG6A 4PS5A 3DWYA 3Q2EA 4NUCA 5H1VA 5L96A 5IGMA 5L8TA 5E74A 5HEMA 4TU4A 4QSPA 5HRXA 5AD2A 5E0RA 5I80A 4A9KA 4YBSA 4UYFB 5LJ0A 3O34A 4QSVA 4A9IA 5D26A 4O77A 2L84A 5ENBA 4IR5A 5G4RA 3U5KA 4XUAA 2N9GA 5CPEA 2RFJA 3AQAA 4O7AA 5F25A 5ENJA 4N4GA 5EPRA 4HXSA 5CGPA 5ENGA 4QY4A 3UV2A 4A9NA 5L8UA 3U5OA 5EPSA 3UVYA 4OGIA 4QSTA 5FE4A 5LUUA 5FDZA 5E9YA 4PY6A 4UIUA 3D1BA 5EM3A 4AKIA 5HQ7A 4A9OA 2F6JA 4QSXA 3MXFA 5D24A 5I83A 5CQ3A 5HFRA 4TZ8A 4QEVA 5DW2A 2R0YA 5K29A 5LVRA 5BT3A 5FE3A 4NYXA 4J0SA 2FSAA 4CUPA 4J3IA 4CL9A 5ENFA 3ZYUA 4NR8A 5TCMA 5LJ1A 2OUOA 4HBVA 4BW2A 1EQFA 3HMHA 5EV9A 3QZSA 5CRZA 4XYAA 5FH8A 4QYLA 5DKHA 3UV4A 5DLZA 4PCIA 5HFQA 3UW9A 4BW3A 3JVKA 5EWCA 5E3DA 5II1A 4HXRA 5D3HA 5FE9A 4N4IA 4TU6A 4UIVA 5L99A 2RNXA 4O71A 4O76A 5A5SA 5KTWA 5A5OA 4A9MA 4NR9A 5ETBA 4O74A 5I89A 2RO1A 4QUTA 5F36A 4QSRA 4TTEA 5LKTA 5EA1A 4YYGA 5G4SA 5C7NA 4YH3A 5EVAA 5EWDA 4WIVA 4DONA 4HBYA 4IR3A 5BT4A 5HQ6A 4ZW1A 5LJ2A 4UYDA 3O35A 4MR5A 5E7DA 5FE8A 4ALHA 4IOQA 3S92A 5DW1A 3JVMA 5EICA 5FH7A 4QSWA 5HENA 5FE5A 5A82A 4AKNA 3JVLA 3I3JA 5DKDA 3LQHA 5EI4A 5FG5A 2DVRA 3DAIA 3MUKA 3U5MA 2I7KA 5DX4A 4YYMA 5ENHA 2KTBB 5DYCA 4UYHA 5CU8A 5F1HA 5CUBA 5F3AA 5DFCA 5DYAA 5FFYA 3UVWA 5CQ7A 4TT4A 5D7XA 4QSUA 3LXJA 4MEPA 4YATA 3MB3A 4IORA 5CY9A 4NYWA 5ETDA 2YYNA 5D3PA 5FFWA 5EPBA 5C89A 3O37A 5EISA 4J0RA 2E7NA 4YYIA 4YK0A 1JM4B 2YW5A 5IBNA 4YBTA 5D3NA 2DVVA 4YBMA 5KU3A 4O78A 4RVRA 2MJVB 2NXBA 2L5EA 3NXBA 5JWMA 4HBXA 1X0JA 4QSQA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5FE6 A;  5AD3 A;  3HME A;  4UIX A;  4LR6 A;  4O7F A;  2GRC A;  2YEL A;  5DY7 A;  5LKU A;  4FLP A;  4KCX A;  4Z1Q A;  5CUC A;  4C67 A;  4TQN A;  4NRC A;  5EWV A;  3U5N A;  5CUA A;  4O7B A;  2D82 A;  4A9F A;  5CUE A;  3QZV A;  5C85 A;  2DAT A;  2R0S A;  2RS9 B;  2E3K A;  3IU5 A;  4YH4 A;  3S91 A;  5ACY A;  5HEL A;  5D3J A;  3LJW A;  3U5J A;  2DVQ A;  4PCE A;  4TYL A;  4QEW A;  4HXO A;  5FE1 A;  4MEO A;  5E9L A;  4ZC9 A;  5AME A;  5FG6 A;  2LSP B;  4HBW A;  5CQT A;  4YAX A;  3HMF A;  4HXL A;  5FG4 A;  2RNW A;  5EP7 A;  5A5P A;  3O36 A;  5CP5 A;  4QR4 A;  2RI7 A;  4NRA A;  5AMF A;  4QC1 A;  4YYK A;  5F2P A;  4TZ2 A;  4QR3 A;  5D25 A;  4J1P A;  3RCW A;  5A7C A;  4NR6 A;  3G0J A;  5HRV A;  4CUQ A;  5H85 A;  3U5L A;  3MUL A;  4KV4 A;  4NXJ A;  3P5O A;  4Q0N A;  5DFD A;  2R0V A;  4A9J A;  4QUU A;  5EWW A;  4YYD A;  5F61 A;  4NYV A;  4WHU A;  5HQ5 A;  5E9V A;  2F6N A;  2YDW A;  1E6I A;  4MR4 A;  5I1Q A;  5IGL A;  4UYF A;  5LVQ A;  5HLS A;  4O75 A;  4PKL A;  5H1U A;  5C87 A;  4O70 A;  5KTX A;  5FE0 A; 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