3G15A

Crystal structure of human choline kinase alpha in complex with hemicholinium-3 and adp
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
377
structure length
354
Chain Sequence
EQPEPRTRRRAYLWCKEFLPGAWRGLREDEFHISVIRGGLSNMLFQCSLPDTTATLGDEPRKVLLRLYGAAEAMVLESVMFAILAERSLGPKLYGIFPQGRLEQFIPSRRLDTEELSLPDISAEIAEKMATFHGMKMPFNKEPKWLFGTMEKYLKEVLRIKFTEESRIKKLHKLLSYNLPLELENLRSLLESTPSPVVFCHNDCQEGNILLLEGRENSEKQKLMLIDFEYSSYNYRGFDIGNHFCEWMYDYSYEKYPFFRANIRKYPTKKQQLHFISSYLPAFQNDFENLSTEEKSIIKEEMLLEVNRFALASHFLWGLWSIVQAKISSIEFGYMDYAQARFDAYFHQKRKLGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of human choline kinase isoforms in complex with hemicholinium-3: single amino acid near the active site influences inhibitor sensitivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Choline kinase alpha
total genus 123
structure length 354
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.32: Choline kinase.
pdb deposition date 2009-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01633 Choline_kinase Choline/ethanolamine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3g15A01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3g15A02
1O6KA 1PKGA 3WILA 2FUMA 4FTJA 1STCE 2X7OA 2PZYA 3CTHA 5EM8A 2X2MA 5EQYA 3ROCA 5JN2A 4FIIA 5JFWA 2C5OA 3DKGA 3Q32A 2FSLX 1YVJA 3ORLA 4FKJA 4QMUA 4BVUA 4BZOA 5JFVA 2AC5A 5JFSA 3QYZA 4MNEB 2F7EE 3GOKA 4PP7A 1H8FA 5LJJA 4IAZA 4GT3A 4QMOA 3R8VA 3ZEPA 3OW3A 2YA9A 1WCCA 2IG7A 2OZAA 4E1ZA 2PZ5A 3KREA 3E3BX 5HORA 4NJ3A 5M56A 3GC8A 2Y4IB 5H8GA 5JRQA 3THBA 4JR3A 2ONLA 4L8MA 3E8EA 3RHXA 2R64A 5CEPA 1BKXA 3VAPA 3K5VA 3KXGA 4XP3A 4HYUA 4AP7A 3S00A 5HE0A 3MVJA 3UDBA 4AACA 4TT7A 4QYYA 4WNOA 2WIPA 3K3JA 4MYGA 1MRUA 5AP0A 2C0OA 1YQJA 4K77A 2B1PA 5JZNA 5T68A 4IHPA 5CTPA 4ASXA 4CFMA 3OS3A 4J71A 1R3CA 2JFMA 3KA0A 4X7QA 4HVDA 5GINE 4MNEA 4RC4A 4Q2AA 2HZ4A 4ZTQA 2QOIA 5CEQA 5KMJA 3BHTA 4ZY6A 3A62A 3NUXA 3OY3A 3FSKA 4ZJIA 4EK4A 2GQGA 2PU8A 4GYGA 4MCVA 3AGLA 5FRIA 5K5NA 3L9MA 1CKIA 2VTPA 3RAHA 4KBCA 2VX1A 4M12A 2IVTA 2PE1A 3QRJA 4IIRA 4RFMA 4H1JA 3V5TA 2BCJA 5KKRC 3W2QA 3D0EA 4ZSLA 2V5QA 3QQUA 2I0EA 3TV6A 1Q3WA 3MWUA 4FG7A 5G1XA 4NW5A 3VRZA 4AN3A 2H9VA 3COMA 4I4FA 3CE3A 3MV5A 4FV3A 4HPUE 4IFCA 3R9RA 5FEDA 2C0TA 5C26A 1BYGA 5ANEA 4FT3A 2A4LA 4NFMA 4G9RA 1IAHA 2P3GX 4FV0A 3PVUA 4WRSA 3EN9A 4HGEA 4FVQA 5ANDA 4BCNA 3QC4A 4G3CA 4ENXA 1FGKA 3UVRA 4BCJA 2ZMDA 3JS2A 4AZFA 1UNGA 4O0WA 1WMKA 1JAMA 2UZOA 5EM6A 3OCBA 5H3QA 3VQUA 3L1SA 4GVAA 2QI8A 4DEIA 4DINA 3FZTA 3PWYA 3LMGA 2QOHA 4GIHA 5CU6A 2NP8A 1H4LA 2XF0A 4RQKA 4CD0A 1ZMWA 3IW4A 4M3QA 3UVPA 3GC7A 3RI1A 1UU8A 4YSJA 4L3PA 3R0TA 4CSVA 3SOAA 3VBXA 4H3BA 5HVYA 4HVSA 5I9VA 1M2RA 2VO7A 4J98A 5IQCA 2UZVA 5E8YA 3C4WA 2BTSA 3NUUA 1ZOGA 4NCTC 4RJ7A 4IX6A 2VV9A 2FSTX 3NUNA 4L68A 4RVTA 3AC1A 4L53A 2ZV8A 2GU8A 2R3KA 3GU5A 5J9YA 3VS7A 3DAEA 2Y4PA 3R1QA 5IEXA 3W0QA 3FI2A 3FQHA 1GZNA 1YXSA 1PYXA 1UKHA 1XQZA 4RSSA 4M14A 4YJNA 2WMWA 4AW5A 4HNFA 2NO3A 3FEGA 3FMNA 5E8VA 2XJ0A 4EKKA 3UOKA 5AV0A 2OG8A 5CALA 4JAJA 5JGBA 4RVMA 3HL7A 4NZWB 2C5YA 2WQMA 3W2OA 4C4FA 4ITJA 3A7FA 3A7GA 3DZQA 4AZWA 2OIQA 3QUPA 4I0RA 4Q9ZA 1QCFA 5EDPA 5IU2A 2ZM4A 2HIWA 3H9RA 1NXKA 3C4ZA 2FO0A 2XBAA 3R8ZA 4E20A 5ETFA 4QOXA 2RF9A 4DITA 3BYOA 3FHRA 4AFJA 4HJOA 3VUGA 2YACA 5EYCA 5AUYA 4U0IA 3UNZA 4FV7A 2J50A 5A3XA 4BGHA 1BL7A 2QOFA 2YDIA 2XEZA 1YOLA 3DXNA 4BDAA 2VTLA 3OWJA 3AOXA 3QQJA 1TKIA 3FMDA 4EK6A 1Q62A 2W99B 3AT4A 3LXPA 3NNXA 2YIRA 3LFSA 3B2TA 5AAEA 1XH7A 3UIUA 3JVRA 4FT0A 2RGPA 1FBNA 3FV8A 4TNBA 5EQEA 4ZJVA 4U5JA 5EG3A 2QOOA 3VBYA 1WVXA 3LJ0A 5BUJA 3C0GA 4E4NA 3U51A 2ITOA 4A9YA 1U5QA 3PSBA 5EQPA 3ENHA 3R7EA 3U55A 2JC6A 1R39A 1PXMA 2PVLA 2IW8A 4J99A 5JH6A 4N6ZA 4AGUA 2BKKA 5CASA 5CSWA 3ZFXA 4DT9A 2I0HA 3V8WA 5LXMA 4OTHA 3DBFA 3KULB 4DEEA 4WRGA 3SX9A 4FC0A 2YM6A 3TDVA 4LRJA 3JYAA 3KRJA 2C6TA 5IQBA 4GT5A 1GJOA 3UPXA 3FKLA 4DA5A 1ZXEA 4D58A 4C4GA 3Q5IA 3DXPA 1GNGA 1UA2A 1YI4A 2WTKB 5AX9A 3RINA 2JKOA 4XG9A 3TXOA 5CSXA 4S33A 2XYNA 3PJ2A 3Q9WA 2H96A 3ZRKA 4L9IA 4QYFA 4CLIA 4CKJA 1CKJA 5C01A 4D4YA 4YJVA 4B8LA 2W5AA 4LUEA 4JG8A 5AUZA 5GIOE 1PYEA 3D94A 3RPOA 3UZRA 4PDOA 5D1JA 4AT5A 3NVKI 3SC1A 3NIZA 2QKWB 3REPA 4C3FA 2R4BA 3I5NA 3BGPA 3PY1A 4FSUA 4EH9A 4XG7A 1H28A 2BTRA 3LMHA 2PVYA 3U4WA 3CSVA 5BYLA 4F9BA 1XBBA 5I9WA 3KULA 2DUVA 5L3AA 4FIGA 2PE2A 5CVHA 3SG9A 3ZZWA 1OI9A 3TM0A 3R30A 3QTIA 2XK3A 3GBZA 4ZS4A 2P2HA 3CR0A 3HV3A 2ZM3A 3ZBFA 4YJPA 2R3JA 2XNEA 4DEBA 5BYYA 3QLFA 2XM9A 2UW7A 5CXZA 1ZOHA 3Q6WA 5LQFA 2VRXA 3W8LA 4X2NA 5EI2A 1UWJA 4LL5A 2C5NA 3UIMA 4W4YA 5JSMA 1VR2A 5ACBC 2JDOA 5FGKA 4MD9E 2CCIA 4ERKA 1KV2A 1KE8A 2PL0A 5LMKA 2XNPA 3LCOA 5D7VA 5AP6A 3AMBA 4F7NA 3NPCA 2F2CB 3Q9YA 2OLCA 3ELJA 1CKPA 1W98A 4ZLZA 4FEWA 4FYNA 4LRMA 2EB2A 3JR1A 5E1SA 4YBJA 4RJ5A 4CQEA 1O6LA 4YZ9A 3PUPA 4BR3A 4PDSA 4O0VA 5H9BA 2BKZA 3KKVA 3OCSA 3Q96A 5J8IA 4IH8A 3UVQA 3NWWA 3W2PA 4BCIA 1JPAA 3DKFA 3O8PA 3RPSA 4H39A 5ANOA 1U54A 2OIBA 5L6OA 2PUIA 2UW6A 3CPCA 1FVVA 4RX5A 4MBJA 3F7WA 3ZC5A 1V0BA 1QPCA 3QTWA 5AP2A 3E5AA 3QTSA 4GFMA 4IZ7A 5CI6A 2V7OA 3SOCA 1IA9A 3Q53A 2OJFE 4WD5A 3Q4TA 4B0GA 2QO9A 2XIXA 3V51A 1ERKA 1IAJA 2W06A 4IJ9A 3MN3A 4FV1A 4Y83A 3JY9A 4E93A 4AS0A 4ANBA 1SMHA 4B4LA 4UYNA 2ZAZA 4MXZA 5E90A 1PMVA 2Y6OA 3WBLA 5IISA 4PWNA 3BLHA 3DNEA 3CP9A 1NY3A 4CLJA 3OXIA 2AYPA 3SHEA 4U7ZA 4D5HA 4RFYA 1KE5A 5IA3A 3OBJA 4ZZMA 4ZSJA 3GVUA 3A60A 3QLGA 1TQIA 2WPAA 3RWQA 2J2IB 4NKAA 5LVLA 5FDXA 1H27A 2OZOA 3MS9A 4IBMA 4U80A 3TTJA 3PDTA 1KWPA 3ANQA 4FR4A 3UMXA 3UJGA 4BDKA 4AT3A 2R7IA 3NNVA 5IMEA 5TKDA 3VVHA 1A06A 3BEAA 4YBKA 3VS1A 4GVJA 5FM3A 4G5PA 2IZUA 2HXLA 3A99A 1NA7A 4KIQA 4DBXA 4LFIA 4DGLC 2W5HA 1GIIA 2HWOA 4GS6A 4U45A 2R3OA 4X6RA 4QMQA 1JVPP 3OEFX 4L45A 5CZHA 4AW2A 4E26A 5HBJA 3LHJA 5HQ0A 4BZDA 4F9CA 4WIHA 2W5BA 4U41A 2VTHA 4XG3A 5C4LA 4ZOGA 2R0IA 5FLFA 5A9UA 3L8SA 3A7HA 3BZ3A 1LUFA 3QU0A 5A6NA 5EKNA 4I0SA 4DYMA 5JT2A 3UP7A 5KKRB 3EL8A 5IQAA 3P86A 4UN0C 4DGNA 2I40A 1QL6A 3QTUA 2CGWA 2XIRA 2BILB 2X7FA 3ZDIA 2X9EA 5FXRA 2QVSE 2YDJA 3R2BA 5EFQA 4XG6A 4C62A 3Q04A 3EN6A 5DA3A 5CQWA 4O91A 3C0IA 4AXAA 2HY81 3EOCA 3NYVA 3QZFA 2PUPA 3Q9ZA 2IO6A 3R7OA 5JEBA 4QMTA 1KOAA 2WFYA 3IO7A 3TZ7A 5KO1A 4JXFA 4D5KA 4PV0A 5A4QA 1LEZA 2O2UA 3H4JA 4ERWA 1J3HA 3KU2A 4YZDA 3VNTA 5IA1A 3LQ3A 3WZUA 4Q5HA 4CXAA 2WMRA 1OM1A 2F9GA 2HW7A 1WBTA 2VO6A 4FYOA 3V01A 2BPMA 2JDSA 4TYIA 5L6WL 3NDMA 4K8AA 1H24A 3NR9A 4R78A 1ZY5A 2F4JA 3TUDA 2WMBA 4FICA 5EW8A 3V5LA 3QTRA 4FIJA 5EOBA 4O6EA 5HU9A 3DK3A 3H9OA 3MJ1A 4EYMA 4ZTNA 1H1WA 4GFOA 3QBNA 4GIIA 3BI6A 3G0EA 3W2CA 3KF7A 4RWIA 3CCNA 5HG5A 2CKEA 3C5UA 1P14A 1LPUA 1Q41A 2GQRA 3FSFA 1URCA 3HYHA 3Q4UA 4S2ZA 3OY1A 5JGDA 1XBCA 1H0WA 3PE1A 4GMYA 5DH3A 2VTJA 4U9AA 1GZKA 4K11A 4YSMA 5EI6A 4HZRA 5A14A 2HY0A 3F3TA 4DG0E 3D15A 4JX3A 3A2CA 4DFUA 4E6CA 5BQ0A 3MY1A 2W1GA 2XJ1A 4XEYA 4FEUA 2GNIA 4C4JA 3KEXA 1H08A 5F94A 4BCGA 3IDPA 4EL9A 2Q0NA 5CAPA 3W8QA 3CTQA 3QZIA 4NKSA 4H3PA 2RFSA 4IACA 4WG5A 1WBPA 3QZHA 4NCTA 3MY0A 5EHYA 2C47A 5IA4A 4O7LA 3DKCA 2R3MA 2J0IA 4CEGA 4WUNA 4AWIA 4ZLOA 2XA4A 5HZNA 4B7TA 3BIZA 3TV7A 3GCQA 5H2UA 4C02A 2YCFA 4I6FA 2VGPA 5A4EA 5J9ZA 1ATPE 4J8NA 4YPDA 4IZ5A 3QKKA 3E63A 4QYEA 4BC6A 3N4UA 5K4JA 4KD1A 4RX7A 1PMUA 5IH6A 4IAKA 4AE9A 2WU6A 3GCPA 2ETRA 4MXCA 2CN5A 4X0MA 4MBIA 4RLKA 3BYMA 2GNFA 3P9JA 5GIPE 5DBXA 4N4SA 5E8XA 3E7OA 2YCSA 3NUAA 5HVKA 1H1QA 4TYEA 1W82A 1JKSA 3VF8A 4HVIA 4ORKA 1Q8UA 4BHNA 2UVXA 2UZLA 3AD4A 4PTGA 4WBOA 3I5ZA 1OIQA 3BV3A 3IOKA 3MJ2A 3DJ7A 5DR2A 2GCDA 4O83A 4FIFA 2J90A 4E8AA 4IX5A 1ZMUA 2VWVA 2HZNA 2R3LA 4AA4A 4DFLA 2YZAA 3LCDA 4PMTA 5CSPA 3KXNA 1G3NA 4B6LA 4AA0A 4USFA 1WBNA 2V22A 1X8BA 4I6BA 5M53A 4I0TA 2VTNA 3MFTA 3ORZA 5FTGA 4JAIA 1OL6A 3GQLA 2WIHA 3QWJA 2XZSA 4S30A 4IZAA 3WI6A 5IEVA 4MXYA 5AA9A 1J1BA 3I81A 1WAKA 1OZ1A 3IW6A 3OXZA 1DAWA 5HU3A 4K9YA 4X2GA 3VS6A 3OWLA 3QRUA 3FKOA 2JDRA 3C4CA 3ZO1A 2B55A 3D5UA 2H8HA 2QHNA 3F3UA 2BDWA 3BELA 3NUSA 4M67A 4PMSA 4TZRA 4H58A 4IAAA 1XH8A 3O50A 2BHHA 3G6HA 3MVMA 4FOCA 5FXSA 4XUFA 3PY3A 4X2FA 4CMUA 2XYUA 3OVVA 1ZY4A 3FAAA 4HVHA 1NT2A 2B9IA 2ITUA 2QQ7A 2LGCA 3B2WA 2VWZA 2BFXA 2E9PA 4YO4A 2QO7A 3RK9A 2VTSA 2CNUA 3PA4A 5ANJA 3HRBA 4XV2A 5BVKA 3HUCA 5C9CA 3DU8A 3FLNC 3VQHA 4HOKA 2XIYA 3BPRA 4HGSA 3S95A 1KE9A 4I93A 3ID6C 5AWMA 1GY3A 4B8MA 4DBNA 2WMUA 4YR8A 2CGVA 4F99A 1MRYA 3DQWA 4WNPA 3G51A 2ZMCA 1AD5A 2A27A 4BDCA 4CG8A 4IAYA 4CT2A 2W9ZB 4XJ0A 3NW6A 4G17A 5BVOA 3GENA 1Q8ZA 2X4ZA 4YJRA 4FEVA 3EYGA 2YEXA 3C0HA 3DFAA 2WO6A 2YIQA 3DK6A 3DTWA 3GGFA 4FI1A 4QTCA 4UXLA 4Y73A 1URWA 3EN7A 3PP1A 2R3NA 4BDGA 4FODA 4RX8A 3FXXA 4YJUA 4EWHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2PVH A;  3LFQ A;  4J97 A;  4RZW A;  4LMN A;  5HIB A;  4OT6 A;  4RRV A;  4OTW A;  1GZO A;  2QOC A;  4D1X A;  4Z7G A;  2XAR A;  3QCQ A;  3RAK A;  4FUY A;  5D11 A;  3U54 A;  2JDT A;  3BE9 A;  3VC4 A;  4EK8 A;  4F1T A;  2XKE A;  4E6A A;  2B0Q A;  4DLJ A;  2CSN A;  2XK8 A;  4ALV A;  4FL1 A;  3V5W A;  1RE8 A;  4AGW A;  4OGR A;  4CFX A;  3UO4 A;  4ARK A;  3GU7 A;  3R1Y A;  1YXV A;  1REK A;  3SVV A;  4TXC A;  3ZO4 A;  4CZU A;  3P79 A;  3CIK A;  3D5X A;  4JRV A;  5CT7 A;  4FKG A;  1B39 A;  2NYA A;  3QRT A;  4Y72 A;  4ZTR A;  2UW4 A;  3ET7 A;  4O81 A;  3K3I A;  4PUZ A;  4A9S A;  3AC4 A;  4AUA A;  4BZN A;  4CRS A;  4YTC A;  5DWR A;  5J9L A;  5KX8 A;  4CVA A;  4IWP A;  1OKW A;  3HLL A;  4YZB A;  4ZTM A;  2BFY A;  4TRL A;  1XKK A;  1JWH A;  1FVR A;  3JUH A;  1WZY A;  2JDV A;  2OZA B;  4PNI A;  3TAC A;  4FOB A;  3RM6 A;  1S9J A;  3DOG A;  1YDS E;  5J87 A;  3CKW A;  2PVM A;  3UYT A;  4MD7 E;  4DCE A;  5KCV A;  4FVR A;  4RC2 A;  4O22 A;  4DTA A;  1QPJ A;  3HA8 A;  4G3E A;  1H26 A;  3ORM A;  2WEI A;  2WXV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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