3G3JA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer i442h k494e k665r i749l q753k mutant with glutamate and nacl at 1.32 angstrom resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
257
structure length
255
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTHLGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEEGKLHMMKEKWWRGCPE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 255
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3jA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3jA02
2O7IA 2ZNTA 4EQ7A 5ISUA 3MZ1A 1IZ1A 3LBSA 4OWDA 2P2AA 2I4CA 2VHAA 2PT2A 1HSLA 4JXIA 4I1DA 3L6HA 5A5XA 3JZJA 3MW0A 5H8HB 4QRZA 4U1OA 5F7VA 3VE1B 1LFHA 3KG2A 2QL3A 4FEBA 2AL4A 4QF9A 1F9BA 2HXWA 3FVOA 4DXBA 1N7XA 1Y4CA 4R74A 4C1TA 1B5IA 2ZXTA 2A5TA 1SW1A 1PB8A 1FTMA 4X9TA 1B3LA 1MXWA 1B52A 3PD9A 4ZZAA 5I59B 1FTLA 2D3IA 3VVDA 4ZECA 3FATA 4XTCQ 3G3FA 4DCXA 2XXUA 4F19A 3ZSFA 4NF4B 3B6QA 2DWAA 1L5TA 2DWHA 1BP5A 4NF5A 1PB7A 3WAFA 4YMBA 3OSRA 4UACA 4LQ2A 4G68A 2E1SA 2RCAA 5ITOA 4RPOA 1B40A 3MVXA 4EQBA 1XVYA 3SEWA 4LA9A 3IOTA 3K02A 3FIRA 1HSEA 2Z8DA 4FIMA 3FASA 4AQ4A 3HN0A 2DP8A 1N76A 3IL1B 4LQ5A 4C1UA 3DM0A 2Z8FA 3M8UA 2F36A 4NWCA 1SVXB 3TTLA 4ZEKA 4R6YA 2YJPA 2UYEA 5JEIA 5IAIA 3TTKA 5CBSA 4DCYA 1YTVA 2DXYA 1MY1A 3DELB 3RUMA 3SEUA 1USYE 4JB7A 2GH9A 1WDNA 2ZNSA 3AXFA 4F1UA 1IIWA 4QFPA 5AA2A 3T9HB 4PQJA 2PVUA 2RF1A 4GOTA 1PC3A 1ZKBA 2XX8A 4ZEFA 1Q35A 5TP9A 2UVHA 2DVCA 3OXNA 2F7BA 4PFTA 3HO7A 3KEIA 2O68A 2I3VA 4Q8RA 4GRKA 3K6WA 1LAGE 4ZE9A 3IOVA 5DEXA 4ELPA 3SEXA 3VXBA 4KYSA 4HW8A 4MF3A 5I57B 1QULA 2V93A 3UIFA 4OFOA 4PFUA 3TUSA 3TPAA 1R1NA 1ATGA 2RCBA 1SW2A 2XXTA 5K2XA 4H5FA 1SQYA 2DE3A 2G93A 4JBZA 1MXXA 1B1HA 5ITPA 2OWSA 4OFJA 4IO3A 4F2OA 4JDFA 1O7TA 4QSDA 3CIJA 3EQ1A 3IO4A 4PETA 2ONKE 4F22A 3RGYA 2X7QA 1M5CA 3V89B 3IK6B 3CFXA 4X48A 1JEUA 5ELVA 4F3PA 3QSLA 3TTRA 5TPAA 1ELJA 1NH8A 2HCAA 1QUIA 4AB5A 1Y3NA 4POWA 3OENA 2GFEA 2Y7WA 5H8QA 4F3GA 2Q88A 4LVQA 3HPIA 1MPDA 3ILUB 5IKBA 2VD2A 2QJEA 1JW4A 3H6WA 3QAXA 1CB6A 2XHDA 3UK4A 3IJXB 1BTJA 4EXKA 5A5XB 1LB9A 2VGQA 3K6VA 2F35A 2DSFA 3I3VA 2HAVA 2I0BA 4ZEBA 2Q2AA 4UA8A 3N5LA 1URSA 4ZE8A 3FJ7A 1JQFA 4YMAA 4JWOA 1FQCA 3LUYA 1A55A 1PBPA 4U2RA 5I56B 2A5TB 3FGSA 3CR9A 1B4HA 4F29A 3RQTA 4YKJA 4ZDMA 5JTYB 2I48A 3Q28A 2LAOA 2XXYA 3DLNA 5LOMA 4QFOA 1HSJA 2RC7A 1GR2A 2HZKA 4TQUQ 4BDQA 2GHBA 3O97A 4BLAA 2AYSA 3KN8A 4JSOA 1B0LA 2R71A 2B65A 1XS5A 2UVJA 2HZLA 3IAZA 4MFIA 4G68B 3KBRA 3G3GA 5KCJA 4F1YA 2VOZA 3PPNA 3KZGA 2NWJA 5BUUA 3FVGA 1NFTA 3MP6A 2DS9A 4OEVA 4U21A 1FCKA 1LBCA 5AA3A 4POXA 3SKPA 4EQ9A 3C32A 4LATA 1SDXA 3TFLA 1NNKA 4PFWA 3S9MC 4OENA 2V25A 4G8NA 5B70A 4XKQA 4OQOA 5TU0A 2XXWA 4U23A 3A3UA 3VLUA 2Z22A 3KJ7A 3OD7A 3GBAA 2Q2CA 3TQWA 1BIYA 1T0KA 1Q1KA 4HCYA 4P0IA 1EU8A 5L9MA 3ZS6A 1US4A 5AA4A 3K6XA 1FTKA 2Q89A 1TFDA 4MLQA 3MC2A 1EZOA 1Y3QA 1NKXA 3P7IA 5TP9B 2KLFA 2NVUB 3OOAA 3K1NA 1FQFA 3FJMA 1IEJA 3SESA 4OVJA 3G3HA 4YB6A 5CBRA 5DEXB 2QSXA 2F8DA 3U8QA 1O64A 4ZEDA 3KN3A 1YPNA 3CI8A 3SETA 3B7DA 2V3UA 3OO8A 4MBPA 3A3CA 3GZGA 3QXMA 4H65A 2ZYOA 3N94A 4GD5A 1MH3A 4E0XA 1EZ9A 3LC8A 4PE5B 1EZPA 1ZJLA 3I6VA 2F97A 5FHNA 3IB2A 1QVSA 3B6WA 2OK2A 1MQJA 1H45A 3C34A 4KCCA 2RINA 3OO6A 1SI1A 5HBCA 3PPOA 1NNPA 5TPAB 4IY6A 3UA8A 4DZ1A 4OMBA 1A8FA 3LSWA 1ZLQA 4OXVA 4F39A 3MPLA 1MXZA 1LLSA 1A7LA 4TOZA 5H8QB 1VFEA 1POTA 4X1BA 3IOWA 2ONRA 4I8CA 5I84A 1P1UA 2I6EA 3MQ9A 1IITA 2R9JA 2DOJA 1RKMA 2ZYMA 1KWHA 4OHNA 4R2FA 4RY1A 1S9TA 1FTJA 4FECA 5EHMA 2I58A 3Q25A 1XVXA 3QYTA 3ZKLA 5KDTB 4G77A 3T66A 5AE4A 1JW5A 1SI0A 3WAEA 5JK4A 4LUBA 3BKIB 1Z7NE 3PMXA 2QMWA 4Q30B 2PYYA 2Z23A 1N04A 3PUVE 3CFZA 4H8JA 1FTOA 1DOTA 3CG1A 3VFJA 1URDA 5HPQA 3K1PA 3LSXA 4YB7A 1XOCA 4LZ5A 3OELA 4HS7A 1J1NA 2P0SA 2QS3A 4EDPA 5I58A 2O51A 4H67A 1D3KA 4TLMB 1ZMGA 4ELQA 5DVIA 5DVJA 3K4UA 2UYFA 2H99A 1CE2A 5CC2A 1B3HA 5DT6A 4RXLA 3FD3A 3PPPA 2DYXA 4F18A 4ND9A 1UTHA 4Z7EA 5I2KA 1O63A 2F5XA 5CMMA 4U4XA 3PUXE 1NMUA 3PUZE 5KCJB 3L6GA 1D4NA 3KOSA 4HCWA 1MH4A 3VDFA 3JYRA 4R6HA 2DE4A 2M8CA 2XXHA 3H6TA 3MZ9A 4IO7A 4ESWA 4N13A 3GXAA 3O28A 2V3QA 4RK2A 4DE8A 3UORA 3IJOB 3MP8A 1RYXA 3KSJA 3MVYA 3K6UA 1PDAA 4M1VA 1H44A 1MXUA 1B51A 1B5HA 3U92A 1OMPA 4QFLA 4JWYA 2XXQA 4H6DA 2HEUA 4DLDA 5AA2D 4KQPA 3VLWA 3MBPA 4BDOA 4Q0CA 1OVBA 4NF6B 3W9VA 4NF8A 2PBWA 5AA4B 1SD3A 2OJTA 2QS1A 1OIBA 4Z0IA 1MQHA 2GHAA 4YICA 2Q9TA 3FXUA 3TZAA 3SEVA 3RY3A 3PPQA 3OO7A 2NUVA 3BBRA 3ILTB 2FA7A 4RA1A 4XKRA 4LZ8A 5I2NA 1M5FA 4G68C 2HAUA 3UGWA 3RNNA 1USYH 1UTBA 3PPRA 4FEDA 4H1XA 4OETA 4NE4A 3S4UA 4KCDA 4PFYA 5CMKA 3DP4A 3Q29A 3IX1A 3VV5A 4NTLA 1MPCA 4F2QA 1TWYA 2O1MA 3IOUA 1Y9UA 3D4GA 2I0CA 3OEMA 1VFDA 4O3AA 3DP8A 2O6AA 4OERA 2CMOA 4H5GA 3V8XB 2Y7PA 3FV1A 1IXCA 2R6GE 3GBBA 4F31B 1DSNA 1LAXA 1LFIA 2F7CA 5H8HA 4ZS9A 1ZBMA 2DWIA 3C31A 4H0WA 1NNTA 1VR5A 3SDFA 4KHZE 2Y7IA 1QKAA 4LP2B 3B6TA 4RYAA 4R75A 4JWXA 3PMVA 3E3KA 4QHQA 5CMCA 4IO4A 3IB0A 4P11A 3HCQA 3G3KA 3T9XB 5H8NA 3EPEA 3M3LA 1D9YA 1B46A 1Y1ZA 2UXAA 4OFLA 3RLFE 1QUKA 4YAHX 2CZLA 1DTGA 2FNCA 4YKKA 1N84A 1YCJA 3MZBA 3KN7A 3QK6A 4NF4A 4XXUA 1B7UA 1VE4A 3O6IA 5DYHA 1LB8A 3EHSA 1LCTA 1SBPA 3W9WA 2F7AA 4GF8A 1H76A 4WEPA 1LCFA 2BJJX 3HSTA 4KD5A 2W7YA 3ECRA 4ONYA 4FJPA 2ZYKA 4NF5B 1FQBA 1Y20A 4MLVA 4YB5A 3EHUA 3Q26A 4XIGQ 2XX9A 1I6BA 4JSDA 1A54A 4U4SA 4O3BA 5I58B 1DPPA 1N3XA 1N7WA 1P1WA 1A8EA 2ONSA 4G8HA 1LGBC 2IEEA 3HHGA 2V3TA 3C4MA 1N3WA 1R9QA 1MQIA 5CMBA 4EUOA 2OBGA 1MY4A 4GXSB 4FORA 4IO6A 1UTHB 3V5AA 4KYEA 5I2KB 1BLFA 2Y84A 2DVZA 4YKIA 3LR1A 1DTZA 1B2HA 3T9UA 5AA2B 3SEYA 3C35A 2DWJA 4NEDA 2I49A 5FHMA 4ZEIA 4PP0A 4BDLA 1B1XA 1P99A 3T9VA 1H3DA 3H4ZA 3ZKKA 3IO6A 3PUWE 1TFAA 2XXIA 2NXOA 3O6HA 1OQHA 1MG1A 4G4PA 4AB6A 4QFKA 4BDNA 3S9LC 2YLNA 3IR1A 3TCHA 1I69A 4DIGA 2H5YA 1R6ZA 4NF8B 1B05A 1JVYA 2X26A 4BDMA 3KGCA 5KZTA 2QPQA 4YU0A 3IB1A 1MY0A 1QUJA 2QRYA 2AIXA 4HTGA 3C33A 1SYHA 2YPNA 3TTNA 2A5SA 1B3GA 3FV2A 2UVGA 1OLCA 4GLIA 3PUYE 2B3BA 1UTBB 2IA4A 3TCGA 3S9NC 4GVOA 1QKBA 1MXVA 3TYHA 5HM4B 3OSQA 3S2VA 4IGRA 4EF1A 5L9OA 1DMBA 3MAMA 2OZZA 4GXAA 3FJGA 3D4CA 3H03A 3G3JA 3MUQA 4NWDA 4LONB 3N6UA 3THIA 2ABHA 3K0VA 3PD8A 4BDRA 2HFBA 5L9SA 3TAJA 1MQDA 3O29A 4F3SA 1FQEA 2V84A 3FXRA 1B6HA 3DP6A 4I9DA 2D21A 3RTWB 3O9PA 1EH3A 4OESA 2I3WA 3VVFA 4KR5A 4RK9A 4R9FA 5I56A 4WKMA 4R2BA 3H6VA 1Y1MA 3SERA 5H8NB 1MQGA 2VP1A 3U72A 1B9JA 4Q5TA 3MWBA 5JTYA 4U22A 3MVWA 1XC1A 3TDJA 3IORA 3U94A 1IXGA 3FVNA 3U93A 3H06B 4WEDA 3QUJA 2X7PA 3LSFB 2H9BA 2QMXA 1SW5A 3EF7A 3W15C 4G2ZA 5H8FA 1AMFA 3E13X 2H25A 3C9HA 3E4RA 2XX7A 4QSCA 4IO2A 1PEBA 1MDP1 4RJZA 4IGTA 2F6PA 3R26A 1DPEA 1UIUA 2G29A 4F3BA 5F1QA 3TEPA 1B32A 3ODBA 3C36A 4DXCA 3TQLA 1MXYA 3RN8A 3CSGA 1XT8A 1GVCA 3KOTA 1URGA 1LAFE 5H8SA 1AOVA 5EYFA 1MS7A 3I5OA 1GV8A 5M2VA 3S9EA 4FE8A 1MY3A 4RPNA 4THIA 3HV1A 5ICQA 1UIVA 1MRPA 4FAJA 2WKYA 4LZ7A 3BFTA 2ALUA 2Y7KA 3T93B 4GQOA 4ELRA 4GFRA 2XXXA 3H6UA 1B3EA 1Y3PA 2F34A 1GGGA 3KFMA 1B58A 1FQDA 5CM6A 3KSXA 3TCFA 5CRYA 1MM7A 3ONMA 3JV9A 4E0WA 2THIA 3EN3A 5FTHA 1Y4TA 1LBBA 3PGFA 2DXRA 1XHYA 4K3FA 2F78A 3TTMA 2REJA 4KYDA 4EXLA 2XD2A 3GLBA 1OLAA 1UQWA 2GRVA 5L8DA 1B7HA 1LSTA 3BFUA 3A09A 1AIVA 3TKDA 5J1DA 1PB9A 2XD3A 3N6TA 1I6AA 4MH5A 1I6QA 1S50A 1LFGA 1B5JA 5K2YA 1MPBA 3MPKA 2QS2A 1N0TA 3K00A 1RYOA 2RC8A 3N26A 1JW1A 3RT8A 2PT1A 3TODA 1ZTYA 2ANJA 4ECFA 4P0GA 2OWTA 1WODA 3U1OA 1B0HA 1P1QA 2P1SA 3HHFA 1QW0A 1OVTA 2AL5A 3G7WA 2ZMBA 3F11A 1WVJA 4KI0E 1Z7ME 1IUDA 3CRBA 1JETA 3PMWA 4N07A 2F6GA 5DVFA 1FW0A 3M3FA 1ZU0A 1B3FA 2Z8EA 2Y7RA 4XKNA 2O84X 3FZVA 1B7ZA 4X1DA 3Q27A 2B3FA 4EF2A 1B4ZA 4U1ZA 1GTKA 1BKAA 1H43A 5I59A 1IXHA 4IY5A 4FATA 1D9VA 2H98A 5CI5A 5KDTA 3OEKA 1SW4A 1YAEA 3K2DA 1NH7A 2OCUA 5ICTA 4GIZA 1P1OA 1II5A 1OQGA 4DDDA 4QSEA 2FYIA 3CVGA 2XXVA 1M5DA 1FQAA 5DTBA 1R9LA 2PX1A 4GL8A 2D5WA 3QIMA 2NOOA 5EHSA 2Q8JA 4YKPA 3VVEA 3OMBA 1IQ7A 4I62A 2XXPA 1M5BA 3PU5A 4OTEA 1IXIA 4L17A 1US5A 3VLVA 3M3KA 4QFNA 4O3CA 3CFLA 4IO5A 2O69A 3E9XA 1NL5A 3T22A 5B7DA 2E0SA 3V83A 3FXQA 5H8FB 4KPTA 1TXFA 3QUFA 3K01A 3UN6A 1NNFA 4IB2A 4C0RA 1P1NA 4YZZA 5FHOA 4H8IA 4WXJA 4OZ9A 4XKPA 1AL3A 1MDQA 3TELA 3USDA 3FUZA 2QS4A 4OEUA 2RC9A 3O6GA 2ZNUA 3MJNA 4ELOA 3T96B 2RKMA 2ESNA 1SYIA 1JNFA 4ZZEA 3FVKA 3PV0E 3H7MA 1TT1A 2XXRA 3R6UA 2HQ0A 1ANFA 3CSBA 3MVZA 3OO9A 3RT6B 4G8MA 3R7XA 1AH5A 2ZYNA 1JEVA 2VD3A 1MM6A 4NF6A 2DE2A 3RPWA 2I4BA 3RTFB 3VXCA 1JVXA 4F1VA 5I57A 3MP1A 1LAHE 3O66A 1VSOA 1A40A 2DQVA 2O1LA 1M5EA 2UVIA 3K1MA 4OYVA 4ISUA 4NMYA 4R6KA 4GL0A 3EHTA 4ESXA 3CG3A 4N6PA 2O7UA 4DXUA 1ZIUA 2PMSA 4KFQA 4R73A 5FTIA 2H4IA 4R9GA 5BWJA 1S7YA 3UP9A 1QJMA 4TLLB 3TMGA 1A99A 3H3GA 5I2NB 4RNSA 1POY1 4GWOA 2OLBA 4R72A 3O2AA 4M4GA 3LSLA 2REGA 5AA1A 1PBQA 3KJTA 1MY2A 3G3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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