3G3WA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme (t151r1) at 291 k
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVICTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Structural origin of weakly ordered nitroxide motion in spin-labeled proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3g3wA00
1L23A 2RBQA 2LC9A 4YXAC 169LA 1G0MA 1G0QA 2OEAX 3C7YA 139LA 3D4SA 3F9LA 1L62A 3C81A 1QTVA 3CDVA 4W53A 1L03A 192LA 1L97A 262LA 181LA 3HH4A 2F32A 2OU8A 1CU6A 1P2LA 201LA 1DYCA 1D9WA 1L30A 3C83A 150LA 1D2WA 2IGCA 1OVKA 1L76A 1DYBA 1LYDA 1P7SA 256LA 1L47A 1L41A 4EKSA 3HTDA 1G06A 2HUKA 1L42A 1OVJA 174LA 258LA 3HTGA 1KS3A 120LA 3C7WA 122LA 183LA 3GUIA 102LA 1L43A 1LGXA 218LA 228LA 1L99A 168LA 1L52A 1L74A 1CV6A 1QUDA 3HDEA 1L94A 3CDQA 239LA 1C69A 215LA 160LA 1C6KA 2F47A 163LA 1PQDA 1C67A 1L50A 1L02A 1QSQA 1SWZA 3OE9A 2NTGA 257LA 220LA 3ODUA 4DJHA 2OE9X 2QB0B 3GUNA 4W57A 1P64A 2O4WA 1L46A 3NY8A 1L05A 1L85A 1L45A 1L15A 1C6NA 1SSWA 3HU8A 1L09A 1T6HA 1C6JA 1G1VA 142LA 188LA 1L12A 1PQJA 1QSBA 3DN1A 1ZYTA 1LWGA 221LA 2RAYX 1D3FA 1LWKA 3SBAA 1L90A 3DN8A 3DNAA 3GUJA 246LA 1QTDA 213LA 1QT4A 3DN6A 1L37A 1C60A 1L44A 137LA 3LZMA 1SX7A 1G0GA 1L86A 1LGWA 129LA 216LA 123LA 3GUOA 245LA 1L77A 1LI2A 1P2RA 2O79A 2B6TA 158LA 199LA 1DYEA 1L17A 1L69A 1SSYA 2RB0X 1LI6A 3RUNA 151LA 4ARPA 225LA 2B7XA 1L06A 4LDOA 1B6IA 1L20A 3OE6A 1OV7A 2HULA 1C64A 248LA 230LA 1KNIA 178LA 4EJ4A 145LA 104LA 1DYDA 2B6WA 147LA 1C6MA 146LA 1L96A 229LA 4ARQB 3HWLA 259LA 4ZPUA 1L25A 1L73A 7LZMA 1QT6A 249LA 260LA 233LA 171LA 1L70A 200LA 157LA 1LYGA 3HH6A 108LA 1L28A 1KW5A 1L60A 3SB8A 2RBPA 3JR6A 1L49A 1P3NA 1C6FA 4I7LA 1OWZA 2ANXA 4I7MA 4EXMA 176LA 3CDRA 211LA 3GUPA 1KW7A 4EPFA 2OTYX 5LZMA 1PQIA 2RBOA 190LA 1P6YA 1L80A 1G1WA 222LA 1EPYA 182LA 1L24A 2NTHA 3HT9A 4W56A 2RH1A 4AQNA 3HT8A 3HUQA 1L65A 1L87A 1L16A 4I7SA 4W54A 1D3JA 3K2RA 1T8FA 4PK0A 2B72A 3V2WA 1QS9A 1QTHA 195LA 4ARMA 177LA 1L95A 1QTBA 1L82A 4I7NA 1L10A 170LA 1L35A 1C61A 1ZURA 1L88A 126LA 1P36A 1L34A 2RB1X 1QTZA 4I7RA 1T8AA 173LA 244LA 3HT6A 111LA 1DYFA 1CU5A 206LA 235LA 261LA 2RAZX 119LA 1G0JA 4I7PA 3OE0A 1LW9A 165LA 3CDTA 184LA 236LA 3QAKA 4ARJA 3DN3A 1L33A 3HTBA 1L92A 1C66A 4K5YA 1CV0A 1QT3A 4PJZA 1L83A 3DKEX 1SWYA 1L13A 1L26A 1L51A 1ZWNA 4GBRB 3V2YA 1L08A 1C6HA 2B75A 3SBBC 4DAJA 1CV5A 1I6SA 1L53A 110LA 253LA 4W59A 1L31A 1L66A 4LZMA 127LA 175LA 3PBLA 1L07A 167LA 3NYAA 1CU0A 2OTZX 186LA 4LDLA 115LA 1L57A 1P46A 1C6BA 3PDSA 164LA 1L38A 152LA 172LA 1LYJA 3G3VA 6LZMA 1G0KA 1L22A 114LA 3DN0A 1T97A 3RZEA 1L63A 5I14A 2RBRA 3OE8A 3DMVA 1XJUA 1CV1A 3F8VA 1L64A 1L75A 234LA 1LI3A 113LA 205LA 144LA 1K28A 1L21A 1OYUA 2B70A 3SB7A 1P37A 1DYAA 138LA 1D2YA 1CX7A 1L19A 1QT7A 4W52A 1L59A 1OWYA 1L72A 4IAPA 166LA 1L67A 1OVHA 1L39A 1JTNA 161LA 1CX6A 1L01A 1KY0A 189LA 2L78A 1C6GA 4W58A 3C80A 1C65A 3HDFA 2OU9A 1T8GA 2LCBA 1OV5A 1L54A 197LA 162LA 243LA 2A4TA 1QS5A 1D3MA 2RBNA 3DN2A 1C6EA 4W51A 1LYEA 4I7KA 4EKRA 231LA 2Q9EA 4ARMB 2RB2X 1LYIA 3SN6R 1CU3A 3HH5A 223LA 1C6QA 1L84A 1L27A 4S0WA 4ARLA 1C6DA 187LA 4E97A 1SX2A 1C68A 159LA 141LA 3CDOA 156LA 1G07A 3GUMA 4I7OA 1DYGA 1QUHA 1NHBA 1QTCA 2B74A 3GUKA 1C6AA 109LA 1QT8A 180LA 1CUQA 155LA 219LA 196LA 2RBSA 1L32A 148LE 1C63A 198LA 1C6CA 2HUMA 254LA 3HT7A 2B6ZA 3NY9A 1L0JA 1L89A 3G3XA 3C7ZA 232LA 1L93A 1XEPA 1G0PA 1L29A 1L00A 3EMLA 128LA 1G0LA 1L91A 2CUUA 3SB9A 4I7JA 2B73A 2F2QA 226LA 1LGUA 4DKLA 1WTHA 1LYFA 1CV4A 118LA 1PQKA 3C8QA 3DMXA 1PQMA 131LA 1C62A 3HTFA 227LA 1L36A 1CV3A 4GRVA 1CUPA 107LA 1CTWA 4OO9A 3C82A 2Z6BA 1L48A 1C6IA 1L14A 1L68A 1QUOA 1D3NA 1JQUA 1LYHA 1L11A 247LA 3FADA 209LA 3FA0A 224LA 210LA 3G3WA 250LA 1L56A 1L04A 1L0KA 1XJTA 1P56A 251LA 1C6TA 214LA 1L81A 217LA 125LA 1L55A 149LA 2OE7X 3DN4A 1QT5A 4EKPA 4EPIA 1C6PA 1JTMA 2LZMA 3L64A 240LA 2B6YA 3C8SA 1LLHA 4EKQA 1L58A 3SB5A 241LA 1L18A 130LA 3HUKA 2Q9DA 4LDEA 4YXCA 238LA 1LPYA 1CVKA 212LA 1P5CA 3DMZA 112LA 4W55A 2ANVA 252LA 140LA 4I7TA 3UONA 185LA 1C6LA 1L61A 2O7AA 2QARC 3L2XA 1TLAA 3C8RA 3HUAA 1L79A 1CU2A 242LA 1PQOA 1QUGA 191LA 2OU0X 103LA 237LA 1L71A 3HH3A 3SB6A 143LA 2OE4X 1L98A 3HU9A 4I7QA 3VW7A 255LA 4YX7C 2B6XA 1L40A 4ARQA 3GULA 3FI5A 1KY1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DKVA 1G0MA 1G0QA 139LA 3D4SA 3F9LA 133LA 1L62A 1MELL 3CDVA 1GFAA 1LZDA 4B4EA 4H8XA 3CB7A 2HEDA 3WVYA 2F32A 1P2LA 1DYCA 2IGCA 1OVKA 2BQDA 1B5VA 1L41A 2HUKA 1L42A 3WU9A 5KXLA 174LA 5HQ1A 3C7WA 2BQOA 3AYQA 3GUIA 102LA 5B07A 1B5UA 228LA 1LYOA 3LYOA 1L52A 4FJRA 4NSHA 1QUDA 1LSYA 4B49A 1L94A 3CDQA 239LA 1C69A 3LZ2A 160LA 3AJNA 1SWZA 3OE9A 1TEWA 4NGIA 2OE9X 4W57A 1L46A 5KXZA 3NY8A 1HEMA 1A4VA 1G7JC 1L45A 5B59A 1C6NA 4ETEA 1T6HA 3WUMA 1G1VA 1GWDA 142LA 2BQGA 1PQJA 4ML7A 2BQFA 3LYZA 2I26L 5F81A 4XADA 5LVIA 246LA 1QTDA 1JUGA 1LYSA 1O23A 1JJ0A 1L37A 3FE0A 1L44A 4I0CA 3CQLA 3EXDA 4LFXA 129LA 4LT1A 1IORA 3WL2A 1AZFA 1L77A 4G4HA 1QDTA 3RUNA 1UIAA 1L06A 4LDOA 4L41A 1OV7A 2DQDY 4P2EA 145LA 4TUNA 229LA 1VEDA 5L9JA 1NWGA 4DD9A 249LA 171LA 1YILA 3HBHA 3EO5A 4CJ2A 1YKXX 1SQ2L 3JR6A 5KXWA 1P3NA 3CSQA 3CSZA 1C08C 1Z55A 211LA 3GUPA 1GB7A 1KW7A 2OTYX 3P66A 1HENA 4Z41A 1TBYA 190LA 1DKKA 3RZ4A 1LSZA 1P6YA 1IX0A 2LYMA 4KPMA 1G1WA 2XQOA 2W1MA 182LA 1L24A 3LN2A 4AQNA 4DDAA 1L65A 3K2RA 2HU3A 2WARA 2B72A 1QTHA 2EQLA 2BQHA 4WOAA 4ETAA 177LA 4NSIA 1L10A 3CSRA 1YAOA 1L35A 2XBSA 1BB5A 4LYTA 2YDGA 1G7LC 4NGWA 173LA 244LA 3HT6A 3LYMA 3AZ7A 1VDQA 261LA 1LHLA 165LA 5KXXA 4E3UA 5KKJA 3A6BY 3DN3A 1C66A 2DQFC 3FI7A 1QT3A 1GFRA 1SWYA 1L26A 1ZWNA 1B7QA 3V2YA 4Z3MA 4ETCA 4W59A 2MEBA 4TTDA 1JTPL 1IWTA 167LA 3NYAA 4QGZA 2ZILA 4H1PA 3WW5A 5APCA 1L57A 1P2CC 1LJGA 152LA 172LA 1LYJA 2Q0MX 1IOTA 114LA 1CJ7A 1XGUC 4J7VA 1LSNA 2N5ZA 1EQEA 3WXUA 1XJUA 1L64A 3KAMA 234LA 2FYCA 1K28A 1L21A 4LT0A 3TXGA 2FBDA 1DYAA 1D2YA 4ANRA 132LA 4WL7A 4MSTA 2BPUA 1L72A 4IAPA 1HEPA 166LA 1CX6A 1LZNA 1IR7A 1C6GA 3C80A 1GXXA 1VAUA 1C65A 1T8GA 2D6BA 1OV5A 4YEMA 162LA 243LA 1LZAA 1OUJA 1CJ9A 2XJWA 1D3MA 1JSFA 1LZ5A 1F6SA 1LYEA 1GB8A 5APFA 4IJ4A 231LA 2HEAA 5F14A 2RB2X 1YIKA 1L27A 5KXYA 156LA 4HJZA 1GFVA 2CWIA 4HJVA 1GF3A 1CUQA 2D91A 219LA 196LA 3IJVA 1YQVY 5LIOA 1LHKA 1L32A 2RBSA 5APEA 1C63A 2HUMA 254LA 1FDLY 2YBMA 1HFZA 1L0JA 3AGHA 1L89A 2BQEA 4C5FA 1L29A 5I53A 1L00A 3TXIA 1B7SA 3SB9A 2F2QA 1LMTA 226LA 1LZGA 1WTHA 5LAFA 1PQKA 1LHMA 3HTFA 227LA 4H94A 1EQ4A 107LA 2I25L 5IELA 4ZFPA 2Z39A 3GXRA 1L68A 1XSFA 1GBWA 1OP9B 4J1AA 1DKJA 1JQUA 1L11A 2F30A 3LHMA 1GEZA 1LZEA 2DQEY 4H92A 3FA0A 224LA 2RSCA 1L04A 1P56A 2F4GA 217LA 1B7LA 1B7RA 2OE7X 1L58A 4H93A 1IR8A 130LA 4LDEA 238LA 212LA 4WLXA 2MEHA 5F16A 1B0DA 2ANVA 1LYZA 4KL7A 5EBHA 1JIYA 1YL1X 3UONA 1LSAA 242LA 5FHWA 1PQOA 4TSBA 5D5CA 1L71A 1L98A 2BQIA 4DDBA 255LA 2G4PA 5HMVA 5KXOA 1KY1A 2RBQA 1BGIA 4J0LA 1GBXA 1IVMA 3A3RX 4WM1A 2VB1A 3WU7A 1WQQA 192LA 262LA 181LA 3WPLA 1LMQA 1L30A 1BB3A 2HECA 1D2WA 4TWSA 3P65A 4NHIA 4EKSA 3HTDA 4B4JA 1OVJA 2HEBA 3HTGA 4WM2A 3LZTA 4WL6A 1C10A 1GFGA 1C45A 1LZBA 2EIZC 1C6KA 1REMA 163LA 1QSAA 1L50A 5HMJA 257LA 1CJ6A 3ODUA 4DJHA 2QB0B 3GUNA 3WYHA 4LGKA 3WW6A 3CT0A 1GF6A 1L09A 4O34A 1C6JA 3AW6A 1JSEA 1LSPA 188LA 1ZYTA 3A6CY 221LA 1BWIA 1D3FA 1DPWA 1L90A 1IP3A 2EKSC 1IIZA 3A8ZA 1DXJA 3RT5X 3A93A 5KY1A 3DN6A 1C60A 3B0KA 4NHTA 4DYGA 1G0GA 4LFPA 208LA 216LA 2BLXA 1PS5A 4NG8A 153LA 5FELA 4CHXA 4KT3A 1V7TA 158LA 1L17A 3J4GA 193LA 1VFBC 1LJEA 4ARPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2DKV A;  1G0M A;  1G0Q A;  139L A;  3D4S A;  3F9L A;  133L A;  1L62 A;  1MEL L;  3CDV A;  1GFA A;  1LZD A;  4B4E A;  4H8X A;  3CB7 A;  2HED A;  3WVY A;  2F32 A;  1P2L A;  1DYC A;  2IGC A;  1OVK A;  2BQD A;  1B5V A;  1L41 A;  2HUK A;  1L42 A;  3WU9 A;  5KXL A;  174L A;  5HQ1 A;  3C7W A;  2BQO A;  3AYQ A;  3GUI A;  102L A;  5B07 A;  1B5U A;  228L A;  1LYO A;  3LYO A;  1L52 A;  4FJR A;  4NSH A;  1QUD A;  1LSY A;  4B49 A;  1L94 A;  3CDQ A;  239L A;  1C69 A;  3LZ2 A;  160L A;  3AJN A;  1SWZ A;  3OE9 A;  1TEW A;  4NGI A;  2OE9 X;  4W57 A;  1L46 A;  5KXZ A;  3NY8 A;  1HEM A;  1A4V A;  1G7J C;  1L45 A;  5B59 A;  1C6N A;  4ETE A;  1T6H A;  3WUM A;  1G1V A;  1GWD A;  142L A;  2BQG A;  1PQJ A;  4ML7 A;  2BQF A;  3LYZ A;  2I26 L;  5F81 A;  4XAD A;  5LVI A;  246L A;  1QTD A;  1JUG A;  1LYS A;  1O23 A;  1JJ0 A;  1L37 A;  3FE0 A;  1L44 A;  4I0C A;  3CQL A;  3EXD A;  4LFX A;  129L A;  4LT1 A;  1IOR A;  3WL2 A;  1AZF A;  1L77 A;  4G4H A;  1QDT A;  3RUN A;  1UIA A;  1L06 A;  4LDO A;  4L41 A;  1OV7 A;  2DQD Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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