3G3WA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme (t151r1) at 291 k
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVICTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural origin of weakly ordered nitroxide motion in spin-labeled proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3g3wA00
1CU6A 1LYHA 1L07A 111LA 3G3XA 1JTMA 1WTHA 4I7SA 199LA 102LA 1I6SA 3C8RA 1LWKA 3NY9A 1L68A 1ZWNA 3HT7A 2RB2X 1L0KA 3DNAA 3OE0A 3CDVA 239LA 3DN2A 4E97A 4LDEA 256LA 180LA 3C83A 187LA 158LA 3DN3A 170LA 166LA 3UONA 4I7JA 2B6ZA 2OE9X 2B7XA 186LA 2QARC 1LW9A 1QSQA 244LA 4W55A 1C68A 1SSYA 1PQKA 1L22A 1LYJA 2ANXA 1L66A 3F9LA 1L56A 2RB0X 1L76A 2B74A 220LA 3QAKA 1XEPA 3L64A 1L15A 110LA 4ZPUA 2LZMA 163LA 1OVJA 3CDOA 1ZURA 3HU9A 1L27A 1CV0A 259LA 1L09A 1QUGA 3DN8A 1DYDA 1L55A 4W57A 3F8VA 165LA 2A4TA 205LA 109LA 219LA 243LA 1P46A 1LGUA 1C6FA 2OTZX 4I7TA 1L05A 3NY8A 3HDEA 103LA 3SN6R 1CV4A 3GUKA 2QB0B 1L58A 1L46A 1L14A 2RBNA 125LA 1QS5A 3FA0A 4W51A 1L38A 3G3VA 1P5CA 1T6HA 1PQJA 107LA 196LA 1L95A 1L40A 1L81A 140LA 3G3WA 1L64A 162LA 147LA 138LA 4EKQA 228LA 1SWYA 4DJHA 177LA 108LA 198LA 4EKPA 1LI6A 3C8SA 1L49A 1L82A 3DMXA 1OVHA 3GUMA 209LA 1L41A 2OTYX 1DYAA 218LA 1QUDA 1L31A 4PJZA 3K2RA 1L34A 3VW7A 1L90A 214LA 2Q9DA 1P64A 254LA 128LA 2CUUA 2RBPA 2O4WA 1C6GA 1QTHA 232LA 1DYEA 1T8FA 1QT8A 2B72A 1OV7A 151LA 3V2YA 3HT9A 1QT3A 1L53A 4I7MA 104LA 223LA 1P56A 1C6TA 1P3NA 115LA 1L01A 1C69A 1G1WA 1CV5A 247LA 3C80A 4GRVA 7LZMA 260LA 3HH3A 176LA 172LA 1QS9A 1LWGA 1PQDA 3DN6A 120LA 1LYFA 229LA 3SBBC 2B75A 1OVKA 4I7OA 4W56A 1LGWA 169LA 197LA 5LZMA 164LA 1C6AA 4OO9A 4ARPA 2OU8A 1L44A 3V2WA 1L32A 3HH4A 1L63A 1L72A 3RUNA 1L96A 1B6IA 3HUQA 145LA 1SWZA 1L29A 1L69A 1L42A 4I7RA 175LA 1L30A 251LA 1L75A 2B73A 1C6EA 118LA 1ZYTA 252LA 1L84A 2OEAX 1CUQA 1L18A 2B70A 217LA 1L87A 1XJUA 1P36A 1T97A 3EMLA 3C7YA 4YXAC 1G0KA 1L28A 245LA 139LA 1G07A 1L61A 262LA 184LA 1CX6A 2RBOA 1G0PA 240LA 3D4SA 3GUIA 227LA 3CDRA 4EPFA 1QT5A 2NTGA 1C6KA 1L06A 1C6IA 1LPYA 4I7LA 155LA 2B6XA 221LA 1QTBA 1CU5A 1OV5A 2RH1A 1LYDA 4DKLA 257LA 212LA 1QTVA 161LA 2HUMA 3PBLA 1L48A 1K28A 226LA 156LA 4PK0A 185LA 2RBSA 3HDFA 1L02A 1D3FA 2Z6BA 3HH5A 113LA 1L25A 3LZMA 213LA 231LA 4K5YA 1L45A 1SX2A 3OE9A 1L99A 168LA 1L21A 3HH6A 1C60A 4EJ4A 1L04A 2ANVA 224LA 3L2XA 2F32A 4I7QA 3GUOA 3JR6A 1L23A 2B6WA 3HUKA 181LA 248LA 1L89A 1L91A 4ARMB 157LA 1CUPA 3C8QA 6LZMA 1P2LA 1L54A 4EKRA 258LA 1L11A 1PQOA 191LA 3DN1A 3SBAA 183LA 137LA 1L52A 1KW5A 1L08A 2B6YA 1G0MA 1T8GA 1L00A 206LA 1L71A 1C63A 1LLHA 3C7WA 1QTDA 3C7ZA 1L73A 1C67A 1QTZA 148LE 3HWLA 3FADA 1L59A 3OE6A 190LA 1L35A 1L19A 4I7PA 210LA 129LA 1T8AA 3OE8A 130LA 1L92A 1C62A 4S0WA 1QT4A 114LA 1C66A 141LA 1SSWA 1L0JA 3SB7A 1CV1A 1L47A 1L79A 1CVKA 178LA 1L57A 127LA 1LYGA 250LA 3GULA 144LA 150LA 1L10A 1P6YA 3DN4A 1CTWA 1L20A 3HTBA 182LA 1D3MA 1L65A 2RBQA 3ODUA 1G0QA 1L24A 1L17A 234LA 174LA 4EXMA 3DMVA 1L51A 1C6CA 1L98A 160LA 3SB6A 3GUJA 2O7AA 1PQMA 1KW7A 241LA 1L85A 142LA 1LGXA 189LA 1LI2A 2NTHA 1L60A 1C61A 1KNIA 201LA 4LZMA 1L50A 1JQUA 249LA 1G06A 1L62A 253LA 149LA 1D3JA 1CV6A 1TLAA 3PDSA 200LA 4ARMA 1L43A 261LA 1C6JA 1C6PA 1L37A 173LA 1QUOA 4YXCA 1D2YA 4W52A 211LA 1C6NA 4GBRB 122LA 3DN0A 1OYUA 3SB5A 2F47A 1CX7A 1L13A 4W54A 171LA 237LA 3NYAA 2Q9EA 3DKEX 4EPIA 2IGCA 1CV3A 167LA 4ARJA 4LDLA 1C6BA 1L67A 1C6MA 246LA 1L86A 1QT6A 1G0GA 1L80A 1SX7A 2B6TA 2OU0X 159LA 4ARQB 1DYGA 1KY0A 1EPYA 3CDTA 1C6DA 1CU2A 1L93A 1CU0A 1C64A 3C82A 1L70A 5I14A 1L77A 1NHBA 1L36A 1PQIA 4ARLA 2F2QA 238LA 3RZEA 215LA 1L33A 2O79A 2OU9A 4YX7C 242LA 3GUPA 236LA 1G1VA 3SB9A 4AQNA 1LYIA 3HTFA 126LA 1JTNA 1L83A 1L12A 1KY1A 4W58A 1QSBA 123LA 188LA 1P37A 1L88A 1L16A 1XJTA 1D2WA 2LCBA 2RAYX 1P7SA 131LA 3HT8A 1L26A 1P2RA 2RAZX 1KS3A 1CU3A 4LDOA 2OE4X 3HTGA 4W53A 4I7KA 1D9WA 112LA 3CDQA 1L74A 3SB8A 1QT7A 2HUKA 1G0LA 1DYFA 222LA 2HULA 4I7NA 1D3NA 1DYBA 3DMZA 216LA 3FI5A 3HU8A 3HTDA 1L03A 1L97A 1G0JA 2RBRA 1QTCA 2LC9A 3HUAA 1DYCA 225LA 1LYEA 3HT6A 1LI3A 235LA 4W59A 192LA 3C81A 195LA 1C6QA 152LA 1C65A 2L78A 3GUNA 1QUHA 1C6LA 1L94A 4DAJA 1OWYA 1OWZA 1C6HA 4ARQA 4IAPA 4EKSA 119LA 230LA 233LA 2RB1X 2OE7X 143LA 146LA 255LA 1L39A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L07A 1LAAA 111LA 1LYSA 1WTHA 4J0LA 9LYZA 2W1XA 1LJHA 4WLXA 5B05A 1OUFA 3NY9A 2HU1A 5LXWA 3LZTA 1G7LC 4N1CC 1ZWNA 4HTNA 3P64A 4HSFA 3DNAA 2ZYPA 2D4IA 2CJLA 1FLYA 5APDA 3C83A 187LA 170LA 1IWTA 1GE1A 2B6ZA 2B7XA 186LA 4U3XB 5DL9A 244LA 1GB6A 3QE8A 5KXLA 1L22A 1L56A 4TUNA 2LZMA 3A6CY 1L27A 2BPUA 3DN8A 5KKJA 1HEPA 2A4TA 1HC0A 109LA 1YAPA 1GB5A 1L05A 2QB0B 1L58A 4LYZA 1L14A 4ANRA 125LA 1QS5A 4WG7A 2BQOA 3FA0A 4W51A 1P5CA 1L40A 1W08A 1LSDA 162LA 1LMOA 4MCKA 4LZTA 1SWYA 1XGQC 4I0CA 4TTDA 3DMXA 3C8SA 4QDNA 4TSCA 3EXDA 5I54A 4J1AA 218LA 1IP2A 1L31A 1P64A 3ATNA 1JKDA 2O4WA 1G7HC 2YBIA 4C3WA 3HT9A 4I7MA 1P56A 1P3NA 4BADA 4HJZA 1NDGC 2Z38A 5KXWA 4TSBA 2LZ2A 1CV5A 4GRVA 2F30A 4YM8A 1YAOA 1EQ4A 2D4JA 172LA 1GE4A 2HEAA 229LA 1JJ0A 4WLYA 2BQKA 2A7DA 2OU8A 1AKIA 3P65A 1RCMA 1ALCA 1SWZA 1SQ2L 4ZIXA 1XGUC 2LZTA 251LA 1L75A 2B73A 2EPEA 1ZYTA 1LJ4A 4OW1A 2YVBA 5HMVA 2YSSC 1IWXA 5K7OA 1L87A 1P36A 5DM9A 1WQMA 3EMLA 4ETDA 1JUGA 184LA 3WMKA 2RBOA 1GF3A 4DD7A 1J1PY 1G0PA 1LJGA 1W6ZA 1NMMA 4NWEA 2B6XA 2ZQ3A 5I4XA 1OV5A 4KPMA 257LA 4NHQA 5KKIA 1UCOA 1D9UA 2DQAA 1QIOA 4PK0A 185LA 1LHJA 4AXTA 2Z6BA 3WXUA 5LVGA 3LZMA 1C45A 213LA 231LA 1L45A 1SX2A 1GF5A 4HP0A 1L21A 1B7NA 1C60A 4EJ4A 2F32A 1B2KA 1GWDA 2W1LA 1IIZA 4LYCA 3GUOA 3JR6A 1L23A 2B6WA 3HUKA 1LHHA 3WU9A 1L54A 258LA 3DN1A 1L52A 1KW5A 1ZMYL 3AB6A 206LA 1L71A 1C63A 4DQ5A 1OUJA 2GV0A 1QTZA 148LE 1IEEA 2D6BA 4KXIA 1LSYA 4KT3A 4LYMA 1IP5A 3OE8A 1FLWA 1VDTA 3AJNA 1CVKA 1L57A 127LA 1LYGA 250LA 2EQLA 1FKQA 4BAFA 3BKVA 1L20A 3HTBA 5APCA 5ILFA 1D3MA 2RBQA 3ODUA 1JEFA 4DQ7A 234LA 5KXTA 1KW7A 241LA 1PZYA 3LYOA 1L85A 1IC7Y 3QNGA 4GN4A 4M4OA 2BQEA 1L50A 1GB3A 1WQQA 1JQUA 249LA 5LYZA 4Z3MA 4RDSA 2FBBA 3ZVQA 1C6PA 5IHGA 2MEFA 1LTMA 4YXCA 194LA 4W52A 3B0IA 3DN0A 1IP4A 5L3HA 3SB5A 1CX7A 4W54A 1IWZA 1C7PA 3NYAA 4G4HA 1CV3A 167LA 3M18B 4ML7A 246LA 1L86A 1G0GA 1L80A 1V7SA 1GXXA 1FKVA 4ARQB 1DYGA 1N4FA 1KY0A 1LHMA 1HFYA 1C6DA 3W6BA 5LA5A 1WQPA 3J6KA 4NGZA 5LVHA 1LZ4A 1PQIA 2F2QA 1GFRA 1LSNA 4XYYA 1LHLA 215LA 1RFPA 2O79A 242LA 3GUPA 3W6DA 1IVMA 1DPWA 5APFA 1F6SA 3BKHA 1H87A 3A6BY 4RLMA 3HTFA 1QSBA 4RW1A 1P37A 1L88A 2DQDY 1L26A 5LAFA 4PJ2C 4LDOA 1NDMC 1Z55A 4W53A 1YILA 3W6CA 5FCPA 3SB8A 2HUKA 4PHIA 1D0MA 3A3RX 216LA 5IELA 1UACY 1L03A 3SP3A 1QTCA 4R6CA 3HUAA 1CNSA 1YAQA 235LA 1A2YC 2WARA 1C6QA 1HHLA 1LSMA 152LA 2L78A 1L94A 4FDYA 1VEDA 1OWYA 2H5ZA 3TMVA 3TXEA 1LZNA 4PRQA 1LSFA 1GB2A 4EKSA 2OE7X 146LA 5HMJA 3G3XA 1JTMA 1GF7A 1GEZA 1GD6A 4GCBA 1ZVHL 1LPIA 3OJPA 1I20A 3HT7A 4J1BA 4ET8A 1LSBA 3CDVA 3DN2A 180LA 1GFAA 1KXXA 3HFMY 158LA 1G7JC 3DN3A 166LA 1QUTA 4I7JA 1O23A 1LW9A 1HSXA 1QSQA 1ZV5L 3A3QA 1SSYA 1PQKA 2ANXA 1L66A 2RB0X 1L76A 3QAKA 1XEPA 3L64A 1L15A 110LA 2X0AA 5A3EA 1BVKC 3P68A 1HMKA 1C10A 3CDOA 1IOQA 1ZURA 2HEFA 1CV0A 4OWHA 1L09A 1IP7A 6LYZA 4WM3A 205LA 219LA 1NWGA 3GUKA 1B7SA 1GF6A 3TXIA 3AW6A 1PQJA 1UIGA 1OP9B 2PC2A 1BB6A 3TXGA 1WVUA 2EKSC 3B72A 4LGKA 3AZ6A 4B0DA 2DQIY 147LA 3WYHA 1BB4A 1NKHA 1GHLA 108LA 4EKPA 1L49A 1L82A 3W3EA 4LT1A 1OVHA 1IP1A 209LA 4H9HA 3K2RA 3VW7A 1NF5A 3WVYA 254LA 1JKCA 1QTHA 1J1XY 4GN5C 2B72A 3AGIA 1OV7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L07 A;  1LAA A;  111L A;  1LYS A;  1WTH A;  4J0L A;  9LYZ A;  2W1X A;  1LJH A;  4WLX A;  5B05 A;  1OUF A;  3NY9 A;  2HU1 A;  5LXW A;  3LZT A;  1G7L C;  4N1C C;  1ZWN A;  4HTN A;  3P64 A;  4HSF A;  3DNA A;  2ZYP A;  2D4I A;  2CJL A;  1FLY A;  5APD A;  3C83 A;  187L A;  170L A;  1IWT A;  1GE1 A;  2B6Z A;  2B7X A;  186L A;  4U3X B;  5DL9 A;  244L A;  1GB6 A;  3QE8 A;  5KXL A;  1L22 A;  1L56 A;  4TUN A;  2LZM A;  3A6C Y;  1L27 A;  2BPU A;  3DN8 A;  5KKJ A;  1HEP A;  2A4T A;  1HC0 A;  109L A;  1YAP A;  1GB5 A;  1L05 A;  2QB0 B;  1L58 A;  4LYZ A;  1L14 A;  4ANR A;  125L A;  1QS5 A;  4WG7 A;  2BQO A;  3FA0 A;  4W51 A;  1P5C A;  1L40 A;  1W08 A;  1LSD A;  162L A;  1LMO A;  4MCK A;  4LZT A;  1SWY A;  1XGQ C;  4I0C A;  4TTD A;  3DMX A;  3C8S A;  4QDN A;  4TSC A;  3EXD A;  5I54 A;  4J1A A;  218L A;  1IP2 A;  1L31 A;  1P64 A;  3ATN A;  1JKD A;  2O4W A;  1G7H C;  2YBI A;  4C3W A;  3HT9 A;  4I7M A;  1P56 A;  1P3N A;  4BAD A;  4HJZ A;  1NDG C;  2Z38 A;  5KXW A;  4TSB A;  2LZ2 A;  1CV5 A;  4GRV A;  2F30 A; 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