3G3XA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme (t151r1) at 100 k
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVICTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural origin of weakly ordered nitroxide motion in spin-labeled proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3g3xA00
1L96A 1OV7A 3HTBA 3C7YA 143LA 213LA 1C6AA 1DYDA 1P6YA 3SBBC 130LA 1QT3A 144LA 2LZMA 210LA 3DNAA 189LA 1C6EA 1LYEA 1D3NA 243LA 1QUDA 218LA 3SB8A 3DN1A 178LA 1L43A 1C63A 162LA 200LA 4I7RA 4W58A 3FA0A 150LA 175LA 4I7QA 171LA 1D3JA 240LA 1CU2A 1SX7A 1D3FA 1L21A 1L73A 1LGWA 1L41A 1EPYA 1G0KA 192LA 1L70A 2B7XA 3GUJA 4I7MA 2F32A 1L81A 3VW7A 1QUHA 1KW7A 1C66A 1L71A 1L07A 4W52A 1XJUA 3DN0A 173LA 1L27A 4AQNA 3GULA 2OE9X 6LZMA 2Q9EA 3HU9A 2OTZX 2OTYX 1LYIA 1L94A 2QARC 1CV5A 247LA 260LA 167LA 211LA 3HDFA 2LC9A 1TLAA 4K5YA 1LGUA 1G0QA 1L22A 1L77A 3HUQA 4YX7C 1L66A 3ODUA 3G3WA 261LA 1G07A 160LA 1C6DA 2F47A 1L84A 102LA 120LA 2B6ZA 1SWYA 4S0WA 1CV1A 1L20A 138LA 250LA 1P36A 1LI2A 3NYAA 4ARJA 1L0JA 4ARPA 1L92A 1C60A 3EMLA 1L54A 1L01A 2OEAX 3HH3A 4EXMA 1L40A 238LA 3CDTA 3HU8A 3NY8A 1KNIA 1DYCA 2NTHA 1L58A 1L74A 2ANVA 2B70A 1L75A 1L08A 2RAYX 214LA 3C8SA 1OV5A 234LA 1PQDA 1L89A 2RAZX 259LA 1L31A 4GRVA 1T8FA 3NY9A 3QAKA 157LA 239LA 249LA 1QTZA 1L14A 3HDEA 4GBRB 1L34A 1G06A 3L64A 3D4SA 159LA 1L57A 1L47A 2RBNA 1L88A 127LA 1L05A 139LA 1ZWNA 1LWKA 1L32A 1P56A 2B75A 1QTDA 145LA 1QS5A 3DN3A 1L16A 256LA 2B72A 103LA 1L33A 4EKRA 147LA 1G0PA 4ARQB 170LA 1C62A 172LA 3HUKA 1L25A 148LE 1L55A 3GUKA 1NHBA 2RBQA 1L06A 4DJHA 3DMVA 3HH4A 1L91A 1G0LA 1LLHA 1QSBA 2A4TA 2B73A 107LA 1CU3A 245LA 104LA 1SSYA 4ARQA 223LA 244LA 2L78A 1G0MA 1K28A 1LGXA 2OU9A 3DN6A 1L0KA 1L18A 1L46A 4LDOA 235LA 4EKQA 1C68A 3C7ZA 1ZURA 182LA 1C6TA 1DYFA 131LA 1C6HA 4PK0A 3HWLA 3F9LA 1L30A 122LA 123LA 1ZYTA 2O79A 190LA 2HULA 220LA 3DN8A 2QB0B 1T6HA 1L64A 1L69A 1QT8A 3C80A 1L24A 1C65A 128LA 196LA 206LA 155LA 1D3MA 209LA 3SBAA 1QT6A 1G1VA 1L82A 4W57A 4LDEA 3DMZA 4I7TA 2ANXA 2HUKA 112LA 3CDOA 2RBOA 2B74A 152LA 1CU6A 3OE0A 2OE7X 2RBSA 2IGCA 1L63A 2F2QA 1PQKA 140LA 1L59A 7LZMA 246LA 1P64A 2Q9DA 1L79A 2OU8A 1L60A 1CU0A 231LA 2CUUA 1L53A 1T8AA 4I7LA 1QUOA 3HT9A 229LA 111LA 1L72A 241LA 1L29A 205LA 1PQMA 1L98A 1LYGA 3L2XA 4EPIA 1C6CA 3SN6R 1CV6A 1CTWA 3UONA 4EKSA 1L97A 1OVJA 1L86A 187LA 242LA 4I7SA 1DYBA 1L67A 1D2YA 228LA 2O7AA 1L76A 1JQUA 1L45A 1SX2A 1QT5A 2RB1X 1L56A 1KS3A 1P3NA 255LA 1QT7A 1L90A 1L11A 3HH5A 4W55A 3HTDA 1P37A 1P7SA 5I14A 3HT8A 2RB0X 1L03A 4YXAC 118LA 1L87A 2B6XA 146LA 1XEPA 3DMXA 2B6YA 3G3XA 2NTGA 4LZMA 4ARMB 4EKPA 3F8VA 2OE4X 227LA 1C6FA 4W59A 1L13A 4W56A 177LA 169LA 161LA 119LA 3DKEX 3HTGA 248LA 151LA 3OE8A 1DYEA 1L10A 3V2YA 1L85A 1L19A 4ARLA 1OYUA 1C67A 3FI5A 4ARMA 1C6GA 4I7OA 219LA 3C83A 3PBLA 5LZMA 126LA 1LYHA 1C6KA 1LI3A 3C7WA 3JR6A 2HUMA 1L65A 3CDQA 1QTHA 3LZMA 3C8QA 3CDRA 1L38A 1PQJA 1C6QA 4LDLA 137LA 109LA 2RB2X 4EJ4A 156LA 1LW9A 3OE9A 1KY1A 3SB5A 1P2LA 3OE6A 186LA 3RZEA 1B6IA 1QTBA 1C6BA 191LA 1L42A 165LA 1QTCA 1LYDA 1LYJA 1PQOA 3FADA 258LA 1L49A 149LA 110LA 4PJZA 217LA 184LA 1L35A 4EPFA 4IAPA 230LA 1P5CA 3V2WA 3PDSA 158LA 3GUOA 4ZPUA 3C82A 180LA 113LA 1D2WA 1CV4A 201LA 2B6WA 114LA 4I7NA 1CV0A 1QUGA 224LA 4I7KA 1QT4A 1L68A 1L04A 3C81A 1L93A 1C6MA 3CDVA 1C6NA 198LA 2LCBA 181LA 232LA 1G0GA 2B6TA 1CV3A 3HT6A 1CVKA 1L15A 257LA 197LA 1LWGA 1L12A 3K2RA 129LA 252LA 236LA 1KY0A 1OWYA 1L39A 1CX7A 1L28A 3SB9A 1CX6A 141LA 1L26A 253LA 237LA 3HH6A 4I7JA 1CUPA 199LA 1L17A 1L80A 1L95A 1D9WA 3HT7A 3RUNA 3SB7A 222LA 188LA 4I7PA 1L61A 1L00A 1I6SA 1QTVA 1L83A 4DKLA 1QS9A 1L99A 1L62A 1T97A 4DAJA 1L36A 251LA 3C8RA 1C64A 254LA 176LA 1L02A 225LA 1P2RA 1QSQA 195LA 1T8GA 1JTMA 3DN2A 233LA 1C6JA 1CU5A 2O4WA 115LA 3GUPA 1L48A 1DYAA 3G3VA 4W53A 3GUMA 1KW5A 3DN4A 4E97A 226LA 4W54A 1L51A 1C61A 166LA 4OO9A 1XJTA 216LA 221LA 1SSWA 3HTFA 108LA 4YXCA 1OVHA 164LA 1DYGA 1L23A 1P46A 3SB6A 1JTNA 4W51A 1L52A 2RBPA 1L50A 1LYFA 168LA 1OVKA 1WTHA 215LA 2Z6BA 185LA 1C6IA 1C6LA 1LI6A 2RBRA 1CUQA 1C69A 212LA 3GUNA 262LA 1C6PA 163LA 183LA 125LA 142LA 1OWZA 1LPYA 1PQIA 3HUAA 1SWZA 1L09A 1G1WA 2OU0X 174LA 1L37A 2RH1A 1L44A 3GUIA 1G0JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP3A 4LYMA 1OV7A 4B0DA 1QUTA 3A3QA 5KXLA 3A94A 189LA 1DI5A 1GBSA 243LA 1C43A 218LA 1ZVYB 2Z2FA 178LA 3G3AB 4H9BA 1GAYA 162LA 1GBOA 1GFVA 3FA0A 150LA 3HBDA 2BQKA 4I7QA 5B07A 171LA 4UWVA 3GXKA 1NKHA 4NG1A 5L3HA 1SX7A 1D3FA 1IWVA 1L73A 1QDTA 4WL6A 2YBJA 1C66A 2BPUA 1IP7A 1XJUA 2Q9EA 3HU9A 1OUGA 1LYIA 1L94A 2QARC 4P2EA 1B7RA 2BQLA 211LA 3HDFA 1LZ8A 3LYOA 5IDDA 4K5YA 1TEWA 1GBXA 5M1YA 4GCEA 1L77A 1L66A 3ODUA 1YKYX 5FCPA 1IO5A 5LA5A 4PHIA 1HNLA 2B6ZA 1GF6A 4DD3A 1A4VA 4HPIA 4S0WA 4PGJB 4XJFA 3WW6A 1HEWA 1LSNA 1QSAA 1L92A 2OEAX 4NGLA 2YDGA 2MEDA 3HU8A 1KNIA 4N8ZA 1JPOA 4MSTA 1OUEA 2ANVA 3T36A 1L08A 4XJGA 2RAYX 2F2NA 1T8FA 3NY9A 1QTZA 4W94A 1YILA 1IWZA 3L64A 4QEQA 3A6BY 159LA 3A95A 4NSHA 1L47A 127LA 3WPLA 5IELA 1P56A 1I56A 256LA 3CQLA 4N0JA 1QDRA 1L55A 3GUKA 1NHBA 4DJHA 4NHIA 4H93A 1F6RA 1G0LA 2B73A 2MEBA 4DD1A 1UIDA 1XGTC 1LZCA 1SSYA 1LSMA 4LDOA 1REYA 2YBNA 235LA 5HNCA 3C7ZA 4XYYA 3B6LA 4I8SA 1LAAA 1C6HA 4LYCA 122LA 4XJHA 1JKBA 123LA 1J1OY 2O79A 1B9OA 2QB0B 1T6HA 1OUHA 2VB1A 4NGZA 4GLVA 3TMUA 2D4JA 4LDEA 4A7DA 5FELA 1C08C 4LT3A 2HUKA 1QTKA 3AGGG 1C10A 1LZ6A 2B74A 2BQCA 2IHLA 1B7LA 3OE0A 1IWYA 1L63A 5L3IA 3A92A 3P4ZA 2A7DA 4NGOA 7LZMA 1HFZA 1LSYA 5JENB 1L79A 2XTHA 1EL1A 1EQ4A 3RT5X 1L53A 4I7LA 229LA 2H9JA 1L72A 241LA 3N9EA 1YKZX 5LVGA 5D5CA 3UONA 1KIPC 1LZ5A 5DN5A 4U3XB 1B5YA 1IC5Y 3N9AA 5EBHA 4RW1A 1VATA 1VEDA 3F6ZA 4IJ4A 1CJ8A 1L56A 255LA 1NBZC 4ETDA 4KT3A 1L11A 4PRUA 1P7SA 3ZEKA 2FBDA 4RLNA 2B6XA 1HFXA 1CKHA 1JKAA 2B6YA 3G3XA 1LJ4A 1HFYA 3P64A 4W59A 2W1MA 1L13A 5FHWA 3AGHA 119LA 1GBZA 3DKEX 3HTGA 4HV2A 1DYEA 1L19A 1GFAA 3P65A 3D9AC 1LJ3A 1XEIA 3HFMY 4YEOA 3C83A 4HPEA 1BWIA 2YSSC 1OUAA 1L65A 1DQJC 5FEKA 3A93A 4TTDA 1PQJA 5E4PA 1YAOA 2G4QA 1ALCA 1KY1A 2D4KA 2ZQ4A 3SB5A 1B6IA 1QTBA 1LSPA 2ZIKA 1L42A 5KXYA 1LYJA 1KIQC 4XJDA 258LA 1FN5A 1L49A 110LA 3WPKA 1OQMA 184LA 2YBIA 4IAPA 1P5CA 4WO9A 3V2WA 4C5FA 158LA 4ZPUA 3HBHA 4KPMA 1WVVA 5HNLA 4ZFPA 3ATOA 4NGJA 1LMCA 113LA 1CV4A 2NWDX 2W1YA 114LA 4I7NA 2HEBA 1QUGA 3A91A 1XGRC 3C81A 1C6NA 4J0LA 2DQHY 2DQFC 1G0GA 1CVKA 236LA 1V7SA 3EMSA 1LMOA 4I7JA 1UICA 4WLTA 1CKDA 1L17A 1L80A 1RE2A 4LFPA 4PJ2C 2HEDA 5F9XA 2ZYCA 2FYCA 1I6SA 1LJJA 4UWNA 1QTEA 5HLLA 1L36A 3C8RA 4NGWA 135LA 4G4CA 1WQQA 1P2RA 1QSQA 195LA 5C6LA 1JTMA 233LA 1C6JA 1CU5A 2YVBA 3GUPA 1LHMA 4WLYA 4H8ZA 3TXHA 3G3VA 4W53A 5LVIA 3DN4A 226LA 1LZRA 5I4YA 4W54A 1L51A 166LA 221LA 1SSWA 2ZWBA 2F4GA 1P46A 1L52A 1BB6A 1VDSA 1GB8A 1UIBA 1OVKA 1LZ4A 215LA 2Z6BA 1C6LA 262LA 3LYZA 1C6PA 4NSIA 125LA 1OWZA 1HMKA 1UC0A 2F4AA 174LA 1FLQA 1GD6A 1L96A 5DN4A 3EBAB 1UIEA 1P6YA 5LAGA 144LA 3DNAA 1GDXA 4WM1A 3G3BB 1LKSA 1B7MA 4DDAA 4WM2A 3A8ZA 2Z39A 2HUBA 4MR1A 1GFRA 1LSGA 1LJKA 1D3JA 3OK0A 5KXTA 240LA 1BB4A 4BS7A 4HP0A 1LZAA 1L41A 1XGPC 1JTOL 4LT1A 2B7XA 4CFPA 2F32A 2BQGA 1REXA 2D91A 5LVKA 1V7TA 3WW5A 3DN0A 3GULA 1BQLY 2OE9X 3AJNA 4I0CA 1LKRA 1TCYA 1YL1X 4PRQA 1HERA 167LA 2HU3A 3A3RX 4J1BA 1LGUA 3HUQA 4J7VA 2PC2A 1UIAA 4DT3A 1G07A 1UIHA 1L84A 4X3BA 4YEMA 120LA 2BQBA 1SWYA 5F9UA 5ILFA 1GE3A 1LMAA 1YQVY 1L0JA 2ZNWY 4H1PA 1GFKA 1L01A 1XEJA 1LYZA 2NTHA 1L75A 4N1CC 4J1AA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IP3 A;  4LYM A;  1OV7 A;  4B0D A;  1QUT A;  3A3Q A;  5KXL A;  3A94 A;  189L A;  1DI5 A;  1GBS A;  243L A;  1C43 A;  218L A;  1ZVY B;  2Z2F A;  178L A;  3G3A B;  4H9B A;  1GAY A;  162L A;  1GBO A;  1GFV A;  3FA0 A;  150L A;  3HBD A;  2BQK A;  4I7Q A;  5B07 A;  171L A;  4UWV A;  3GXK A;  1NKH A;  4NG1 A;  5L3H A;  1SX7 A;  1D3F A;  1IWV A;  1L73 A;  1QDT A;  4WL6 A;  2YBJ A;  1C66 A;  2BPU A;  1IP7 A;  1XJU A;  2Q9E A;  3HU9 A;  1OUG A;  1LYI A;  1L94 A;  2QAR C;  4P2E A;  1B7R A;  2BQL A;  211L A;  3HDF A;  1LZ8 A;  3LYO A;  5IDD A;  4K5Y A;  1TEW A;  1GBX A;  5M1Y A;  4GCE A;  1L77 A;  1L66 A;  3ODU A;  1YKY X;  5FCP A;  1IO5 A;  5LA5 A;  4PHI A;  1HNL A;  2B6Z A;  1GF6 A;  4DD3 A;  1A4V A;  4HPI A;  4S0W A;  4PGJ B;  4XJF A;  3WW6 A;  1HEW A;  1LSN A;  1QSA A;  1L92 A;  2OEA X;  4NGL A;  2YDG A;  2MED A;  3HU8 A;  1KNI A;  4N8Z A;  1JPO A;  4MST A;  1OUE A;  2ANV A;  3T36 A;  1L08 A;  4XJG A;  2RAY X;  2F2N A;  1T8F A;  3NY9 A;  1QTZ A;  4W94 A;  1YIL A;  1IWZ A;  3L64 A;  4QEQ A;  3A6B Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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