3G6LA

The crystal structure of a chitinase crchi1 from the nematophagous fungus clonostachys rosea
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
TGSINAVYFTNWGIYGRNFQPADLQASKILHVLYSFMNLRVDGTVYSGDTYADLEKHYSDDSWNDIGTNAYGCVKQLYKLKKANRSLKIMLSIGGWTWSTNFPAAASTEATRATFAKTAVEFMKDWGFDGIDVDWEYPASETDANNMVLLLQRVRQELDSYSATYANGYHFQLSIAAPAGPSHYNVLKLAQLGSVLDNINLMAYDYAGSWDSVSGHQTNLYPSTSNPSSTPFSTKAAVDAYIAAGVPASKIILGMPIYGRAFVGTDGPGKPYSTIGEGSWESGIWDYKVLPKAGATVITDSAAGATYSYDSSSRTMISYDTPDMVRTKVSYAKGLGLGGSMFWEASADKTGSDSLIGTALSSMGSHDSTQNCLSYPNSKFDNIKNSLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and mutagenesis analysis of chitinase CrChi1 from the nematophagous fungus Clonostachys rosea in complex with the inhibitor caffeine
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase
source organism Bionectria ochroleuca
total genus 141
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3g6lA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3g6lA01
1QBBA 1Q6CA 4MNJA 1KXTA 4L4PA 4U33A 3O6AA 3L4YA 1R7AA 4PMNA 4UQEA 5D9PA 2W91A 1OT1A 4HOWA 4HPGA 2HVMA 1KBBA 4E8DA 1MWOA 1MYRA 4FF5A 5GNZA 4HPHA 2BY2A 1E4NA 4WSKA 2O92A 1TG7A 4J28A 1ZU8A 4XV0A 4D1IA 4AZBA 3W37A 2E9BA 3M07A 1J0HA 1WDQA 3FHAA 5JBFA 2CXGA 4KH2A 5BRQA 2ZUSA 1E0VA 3M6DA 4TX8A 1TVNA 4H7VA 4DWSB 4CU6A 3L2MA 2EPOA 5D8WA 4H8HA 1VIWA 3BSHA 1V02E 1MQQA 3CHCA 3QOMA 3BMVA 5LA2A 3GH4A 1TA3A 3WFZA 2DT2A 4HZ6A 3UR8A 3WNKA 1GZJA 1OGSA 1VFOA 2F2HA 4DUWA 5A6SA 2D2OA 1CECA 2Y4SA 4QLJA 2G3MA 4MAVA 3VDHA 1JI1A 3OGSA 3WY1A 5JH8A 3BAKA 4NF7A 1BG9A 1NWTA 3S2CA 3NIYA 3GBEA 2WZEA 2X05A 5A6MA 1QI5A 1W3JA 2GJXB 2EO7A 2DSZA 4TOQA 2G3IA 1E6SM 4M1RA 4J3VA 1UD2A 3ARXA 2JE8A 3AIVA 4JCMA 4RE2A 5I79A 2ZUWA 3G6MA 3VIGA 3TONA 1E1EA 3SUUA 5CG0A 2XIIA 4UFMA 1QW8A 1JG9A 2OLHA 5FD0A 4DWSD 4EKJA 3WD1A 1CXIA 5EFFA 4C7DA 4M29A 3PZQA 1UUQA 2CETA 4CCCA 4TVDA 3SEPA 5D9NA 3OGRA 4OOUA 3KL0A 1W3LA 3B9EA 1V3IA 3CMGA 5GQBA 3WNOA 3IAPA 3FW6A 1H4PA 4E4PA 1HP4A 1TUXA 2WZHA 5ABFA 3M46A 1JDAA 1HJSA 3N17A 2DSKA 3W25A 2J78A 1WAWA 3PZUA 2VZTA 1ZB5A 4YHEA 2GJRA 3VKKA 3VGEA 6CGTA 1KGWA 1U2YA 3ZQ9A 1QHOA 4FLSA 3L2LA 3WQ5A 2WHLA 8CGTA 1JNEA 4BZYA 1FHLA 5CLTA 3WD3A 1GVYA 4OBSA 3TOPA 5CZKA 2VJXA 3LPOA 1UA3A 3CUGA 3ARUA 1DWIM 1MQPA 2XM2A 4BS0A 5ABHA 3HU7A 1QNQA 4HMDA 1OIFA 3AIBA 4W8AA 1GCYA 2CYGA 4TTGA 4F9JA 4ATLA 1ISXA 3QOKA 3LPPA 2JALA 1GQJA 3VM5A 7TAAA 3HMCA 3DYPA 4PSRA 5TD4A 4AC1X 1H49A 2VNCA 1VFMA 3CUFA 3WNNA 1G94A 3WD4A 4AIOA 3MUY1 4WKAA 3CBWA 4M8UA 2ZXDA 2DSWA 1HL8A 2VZUA 5A94A 2D23A 1JZ3A 1JXJA 1HKMA 3KZSA 3O2LA 1OD0A 1LL6A 3A6OA 3TP4A 1J12A 3BH4A 4W93A 3VIOA 5DMYA 1PIFA 2A3CA 4MNLA 2JF6A 3KL3A 2VL4A 2CCRA 4KWUA 2ZE0A 2RGLA 1AQHA 3CHEA 1W1VA 3ARSA 1BYCA 3PBGA 3RCNA 1US3A 4LYRA 1XYZA 4X0VA 1G9HA 1F4HA 2VR4A 1E4MM 3RJYA 3BLPX 1H0GA 3B8SA 2DSUA 2BVYA 5BROA 2XVPA 4D6JA 4U3CA 3NJ3A 3GM8A 2VX6A 1E15A 2JIWA 2ZIDA 1QBAA 1EH9A 2VQUA 3AIWA 3BXWA 1UKOA 1GOMA 2YLLA 2WMKA 3WKZA 2YOCA 4MAZA 1B90A 1KGXA 4JFTA 1HIZA 2PBOA 3WBEA 3SCNA 2O9TA 1IT0A 4FMVA 2J7CA 5BRPA 1U30A 2WK2A 1ZJBA 2PI6A 3THDA 4OBRA 3UESA 1VB9A 4LYQA 3K4AA 3WDHA 1LG1A 3WNMA 2IXUA 2J8GA 4CD7A 3CHFA 3FXYA 1JI2A 1MW1A 4B15A 1B3YA 2BS9A 3MUIA 2VCCA 3U7VA 4UQAA 1V0KA 3T0BA 1WDRA 5KZ6A 4U3AA 4P7RA 1NP2A 5CPSA 2F61A 1XH2A 3T08A 4UFIA 2YL8A 2E0PA 5I6SA 1KWKA 3WDJA 3TTQA 4WJXA 1U33A 1JZ6A 3W82A 2XHYA 5BXTA 3WQWA 1W2PA 2WMHA 2E40A 3MV01 1NOUA 3OA5A 3WQ4A 2E3ZA 3VU2A 3BCFA 3BSGA 4PUEA 3L4XA 4XUYA 1KR1A 4LX4A 1E9LA 1PZ2A 2E4TA 2W63A 1FFQA 2BY3A 5A6AA 3N13A 2X2YA 4WK9A 1NWRA 4ZFMA 1QI2A 2DSVA 1YHTA 1Y7VA 1O6IA 1UR4A 4F66A 1B31A 1C8QA 3QHOA 3VGGA 4JFUA 1QNOA 3E1F1 3OZOA 2ZX6A 1GORA 4MJ2A 3MUZ1 4BQ3A 1K9EA 3WUEA 3WH6A 5ECUA 4YPJA 4PMZA 2G4FA 4HZ8A 2FH6A 3VDBA 3NCOA 4OZOA 1NOFA 2VC9A 5E9AA 2DH3A 4J7RA 2VURA 1B3VA 4W7UA 1FHDA 2XIBA 4LQ1A 3NSNA 4JKLA 3M7SA 1QPKA 1IZJA 3L4ZA 5I3DA 1PJ9A 1LWHA 4XB3A 2WMFA 1G01A 4NZCA 1N82A 4AEFA 3PTQA 4ZEPA 1NOWA 4HOXA 2XVGA 2YL6A 3SCQA 4UCFA 1NH6A 2CPUA 4AZHA 3CUJA 5BYWA 3QHNA 1OD8A 1BGAA 4WSJA 3IK2A 5LA1A 2VTFA 1GPFA 1OBAA 2Y5EA 2V3EA 3VVGA 1EO5A 4AYSA 2WSKA 5CJ5A 1E6XM 3GXIA 3ZJ8A 1VEPA 3CIVA 1E0XA 1XYFA 2UY3A 4C7FA 3A4XA 3MMWA 4MPKA 1XCWA 3CLWA 1LL4A 4UQCA 3EMZA 2D3NA 3VIMA 3POHA 1UR1A 3WELA 5HXMA 3WN6A 3AMCA 2D20A 2WMIB 3RJXA 3WEOA 3ALFA 2EPMX 5E70A 3WEMA 3GH5A 2WBGA 4MB1A 1BYBA 1QI3A 4A3HA 2XSAA 3EDJA 3GZAA 4D6IA 4XX6A 1ZBKA 1XC6A 4ACYA 1R85A 4HP5A 3VIHA 1RP9A 2CHOA 2FGLA 5D9MA 1UR2A 3SUTA 4RE3A 2Y2WA 1TE1A 4CVWA 4NRRA 5M03A 2DIJA 1V0LA 2WW5A 3HN3A 4JKMA 1MFVA 3AXXA 4H8VA 2CBVA 3MANA 3QR3A 1XD1A 2B31A 2BVDA 4QFUA 1C93A 5A95A 1XGZA 1FP8A 2FH8A 5FCZA 1V6XA 2XVLA 2NSXA 1QOXA 4GKLA 4H41A 1V03A 3AIEA 4UQDA 2FGZA 3SCOA 4AEEA 3GH7A 1WE5A 4CCEA 1EA9C 3WDRA 3EDDA 3AIUA 4Y7EA 2WM0A 3WNPA 5A6JA 4M82A 5EFDA 2PBGA 1GOIA 4JAWA 4Q22A 5C71A 5AC5A 5M17A 4GZIA 1UKSA 3OB8A 3CGTA 4P7LA 2W4XA 4EANA 3I3BA 3SCUA 3FAWA 3OGVA 1E5NA 1UD3A 3ZM8A 1ODUA 4W85A 4DWSA 1DTUA 1QNSA 1W2VA 4GO8A 1HN1A 1NP0A 1PX3A 1X6NA 1ECEA 3AS3A 1AQ0A 1JYNA 3WMBA 1RH9A 3VD4A 2E8YA 4AW7A 1LQ0A 3B9DA 2ZX5A 2PWHA 1J0YA 5JIWA 3VDCA 5IFTA 4ZXOA 1JZ7A 3PZTA 1WZAA 3BGAA 2QMKA 4UFJA 2WSPA 4U5KA 3U5YA 1WZMA 1PX4A 4TVUA 1C90A 1G1YA 7CGTA 1V0NA 1XD0A 4AXNA 3SIMA 4W86A 1W1TA 5M5DA 2DH2A 1G0CA 3FY1A 1B2YA 2DQXA 1C91A 4IM4A 4DUVA 2GJXA 2JEQA 3KWXA 1DWGM 4D71A 3VNYA 4DUXA 1OINA 1E56A 3AHYA 3BAYA 1O7AA 3BAWA 2DEPA 4AD4A 1XSKA 2V3FA 2PF0A 1GOQA 2OSXA 4W8BA 1JZ8A 2YA1A 3WDQA 3AMLA 1GJUA 3W4RA 4U5IA 3PZVA 3G6LA 3KEHA 2HISA 3VNZA 2J7EA 3OZPA 2BFGA 1CPUA 3WH7A 6A3HA 4KRTA 3W38A 2QF8A 2XG9A 2FHBA 2J7FA 4HU0A 2IUZA 4LPCA 4TVCA 4PTVA 2Q8XA 1EIBA 5EMYA 2QHAA 4D6DA 4E2OA 2YBTA 1HKJA 3J7HA 1E40A 1NQ6A 2QV4A 5FKYA 1WPCA 5IHSA 2X0HA 1TZ7A 2J4GA 4AZCA 2MANA 2W5FA 3VPLA 2WVVB 1UH4A 2C7FA 3T2QA 1ISZA 3CZGA 1DWJM 2WNWA 1XSJA 4M81A 4UFHA 3PN8A 1JD7A 2X0YA 4AZCB 3RO8A 4MDOA 4NSBA 4PMUA 3WEZA 1H41A 4GXPA 4MNMA 3T0DA 4HU8A 1OM0A 4P8VA 2GJPA 2D0FA 3EDKA 1CGWA 2VX7A 1QHZA 1K9FA 3VIJA 2YDRA 2WPGA 1ISWA 2YL5A 4CVUA 2V3GA 3AOFA 2EXOA 4AZ6A 3LPGA 3SCSA 2XFFA 3AHTA 3ALGA 3QHMA 1DWFM 2PWGA 1W91A 4D6GA 1SR0A 3LPFA 3N18A 1J11A 1V0MA 1ZBWA 2XWEA 2XWDA 4QP0A 3UEQA 1EHAA 4TUFA 2VVNA 1VENA 2CHNA 2Y24A 3VM7A 5ABEA 1ZS2A 1CXLA 3DC0A 1S46A 2VT0A 5HOSA 4CU8A 4BQ5A 4JIEA 5A8MA 3F5KA 4UOZA 4J3XA 3WF3A 1V02A 3QGVA 5M3WA 4DWSC 1CGYA 4PSPA 1R87A 3MO4A 4EK7A 3RM8A 5I0DA 1WP6A 4UR9A 4WIWA 1WB0A 1UKTA 4GQRA 2WKGA 1EHNA 2WBKA 3CZJA 4MB4A 1A47A 2XTKA 4J3TA 4AZIA 4K68A 3ZJ6A 4CN1A 3SCWA 2J77A 3BAIA 4M80A 3N9KA 1E6RA 1FH9A 5HDRA 1Z32X 4P7NA 3U5UA 1US2A 4HA3A 1ZBVA 1UKQA 5IXEA 4JHZA 1B3WA 1LG2A 3GXFA 4YHGA 1E71M 5I5RA 3VD7A 5JBEA 3EDFA 4UQBA 3I3EA 4OJYA 1V3MA 3MV11 1FA2A 2W62A 1G5AA 1W9DM 1E6NA 2YA2A 3WF1A 5FOOA 3MKKA 3VO0A 4RL3A 3ARPA 2E9MA 2CBUA 4W87A 2Y8VA 2ZUVA 3NDYA 1ISVA 5CLWA 2G3NA 3RM4A 4XZBA 2WAGA 4D6CA 3PZOA 3AZRA 3BCDA 3VMNA 1PEZA 1OGBA 3WQ8A 4JCLA 4BCEA 1UQYA 4W7VA 3ZSSA 3WQ6A 5E09A 3BAJA 3DHPA 5IFPA 1JL8A 1XV8A 2ZICA 3VOCA 1BVNP 1XH0A 2YBUA 2WVSA 4MADA 1BFNA 3VTRA 4D1JA 4H04A 2JFEX 4XZWA 2WWDA 3FAXA 3T0AA 1GQLA 2WCGA 3A4AA 5DO8A 3KL5A 3VD9A 5I2UA 3NSXA 2PC8A 3UERA 2EQDA 2IXVA 4AD2A 3II1A 4PTXA 1UWUA 3MUAA 4J27A 3UG4A 2X1IA 3RM9A 1J0ZA 3AHVA 1E5JA 1V6YA 3CHDA 5I78A 1FH7A 1B3XA 4QLLA 1QI0A 2OWCA 2A3EA 2QPSA 3RIKA 1VFUA 1F4AA 1WKYA 4JHOA 3WDIA 2W66A 3ARYA 1GHSA 4URIA 4W5ZA 4BQ4A 5LA0A 1JDCA 3WD2A 2QPUA 4UFLA 1X6LA 1CTNA 1WNOA 3AYRA 1V3KA 1KGUA 4LYPA 5I77A 3K1DA 1VRXA 2UY5A 3ARZA 4AZ5A 3OG2A 4AIEA 2XUCA 1JF5A 2YL9A 4E8CA 5IDIA 1CGUA 3HJEA 1DP0A 1UWTA 4HMEA 2WC3A 2W61A 3WIJA 4WLCA 1JAKA 2CITA 1K9TA 5CSUA 1BYDA 2BY1A 4WF7A 1CGVA 5ABGA 1BF2A 3W81A 3PZMA 1HJWA 3CUIA 3AZTA 3ARQA 1RPKA 3EDEA 1CIUA 5LYRA 1KQZA 1QNRA 3TTSA 1B30A 2ZUNA 5A2CA 1CLXA 1H3GA 1R86A 3GXMA 4MB5A 3SUWA 1BQCA 1LLOA 1UD6A 3W26A 3CPUA 4AD3A 2DT0A 3ZJ7A 1BPLB 4W8LA 3IJ7A 2YDSA 1M53A 3OLDA 1XSIA 2BXZA 3CO4A 1DWHM 1KR0A 1DWAM 1J0JA 4BF7A 3AXHA 2JIEA 1VBUA 1W1PA 3WF4A 1ITCA 3MMDA 4QAWA 2G8ZA 2VVSA 4OKDA 4JL1A 3PZIA 1CEOA 1E70M 1EQPA 5BCAA 2Z1KA 4QCFA 1M04A 3GBDA 1L8NA 5E0FA 4ZXLA 4AIUA 3AFBA 1GONA 4CCDA 5EB8A 2J47A 4MDPA 4W88A 1C7SA 1RD6A 4U2YA 1HKKA 2WHKA 2BVTA 1I1XA 1HJVA 2GUYA 4CU7A 1W3KA 2FHFA 5DF0A 1I75A 3ZR5A 2UY4A 3OLGA 4MB3A 3WQVA 1JGIA 3MS8A 3S6TA 4ATWA 3A47A 1B9ZA 1JDDA 4AD1A 4QCEA 4IPLA 2RGMA 1OB0A 2XM1A 4J3SA 1UWRA 1Q6GA 1K6AA 1KXVA 2EEXA 3L4UA 3NUKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1ISY A;  1E55 A;  2BHU A;  4W5U A;  1E4I A;  1GQK A;  1GUV A;  3DYO A;  5A6B A;  4AIS A;  5D4Y A;  3EYP A;  8A3H A;  2WCA A;  1NAR A;  1BLI A;  1Q6E A;  2ZX8 A;  5AY7 A;  2OSW A;  3THC A;  1CXH A;  1E3X A;  1MVY A;  1H2J A;  1KFW A;  1JZ2 A;  1MW2 A;  3WH5 A;  1HVQ A;  3AZS A;  5A8P A;  2ZXB A;  2VX4 A;  1MXG A;  4B16 A;  3WF2 A;  3VD3 A;  1UA7 A;  4GZJ A;  1W9V A;  2VO5 A;  1NM9 A;  2W67 A;  3FND A;  1XRV A;  2DGA A;  3OBA A;  4P7O A;  4PCS A;  4V28 A;  3OLE A;  3K46 A;  1WZL A;  4ZE4 A;  2CNC A;  3AQU A;  1J0K A;  3AIS A;  2C0H A;  4U2Z A;  2DT1 A;  1VEO A;  1W9B M;  3WBA A;  2ZXQ A;  4IIS A;  5F7U A;  3MMU A;  1HJX A;  4U31 A;  4FLO A;  4V2X A;  4DM1 A;  1V08 A;  1BYA A;  1Q6D A;  4Z2G A;  3AMD A;  4JFS A;  1HKI A;  2PWD A;  4S3K A;  2X8R A;  1JYV A;  1J10 A;  1UG6 A;  2BV9 A;  1K9D A;  2ZUM A;  1QHP A;  4GIN A;  3W24 A;  5CPT A;  3ARR A;  2WZI A;  2XJ7 A;  4NRS A;  3GYC A;  4MNK A;  2UWF A;  3VGB A;  3TTO A;  4AZ7 A;  1KQY A;  4UOQ A;  3GTN A;  3VIF A;  1EOM A;  5JUV A;  1P6W A;  3VUP A;  4F8X A;  5A6B D;  1Q4N X;  1V3J A;  1UR9 A;  4ACZ A;  1KXH A;  4AD0 A;  5JBD A;  2VCA A;  2EPK X;  1CEN A;  2J7H A;  4FLR A;  3DHU A;  2WC7 A;  1UZ4 A;  2CBI A;  4LGX A;  2VUY A;  4GPN A;  1VJZ A;  1BAG A;  5A8N A;  4PMD A;  3WD0 A;  3CZL A;  1DHK A;  4KRU A;  2DT3 A;  2DDX A;  3CZK A;  3ZST A;  1V6U A;  1ODZ A;  1XCX A;  2YIH A;  3IAQ A;  1PIG A;  2J62 A;  1MW3 A;  1MQR A;  3AMG A;  1ZBC A;  1UR8 A;  4GI8 A;  1W32 A;  3WMC A;  2WMG A;  5CSY A;  2G41 A;  2GK1 A;  1UWS A;  1B1Y A;  1GVI A;  2AOS A;  3OIH A;  4CN6 A;  4ZEN A;  2OYK A;  4PTM A;  3CTT A;  4UZU A;  4X0N A;  3WNL A;  2XFY A;  1W3H A;  1JD9 A;  2WCS A;  4CGT A;  4WKF A;  4L4O A;  3ZIZ A;  5CGM A;  2GK1 B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DBP A;  4R7J A;  1FCV A;  2DV0 A;  2E28 A;  2RDU A;  2V5K A;  3QEZ A;  3AYV A;  1KXT A;  4YJ5 A;  1R7A A;  3WLH A;  1KKR A;  1RAK A;  1XYL A;  4PMN A;  1OC5 A;  4C1L A;  3TYZ A;  1F2J A;  1Q3N A;  5AHF A;  4HPG A;  3BJT A;  5DCD A;  4E8D A;  1MWO A;  3FGC B;  4S38 A;  5GNZ A;  3O07 A;  4HPH A;  1U79 A;  4WSK A;  4LAW A;  2MUC A;  3WJW A;  5LSM A;  2E1D A;  1QAS A;  3GND A;  1JNS A;  1ZU8 A;  5AVH A;  3N4E A;  1M68 A;  3W37 A;  4IIE A;  4Y6G A;  2ZRZ A;  5BRQ A;  2ZUS A;  5RUB A;  4A8I A;  4JDY A;  4TX8 A;  3KW3 A;  4CU6 A;  3L2M A;  1I8J A;  4KET A;  3MP5 A;  3ODK A;  5FEZ A;  3CHC A;  2E5D A;  3BMV A;  2Q8Z A;  3CTL A;  3WFZ A;  4V1X A;  4HHL A;  3UR8 A;  4E6M A;  1OGS A;  2ZZ7 A;  1D7K A;  4DUW A;  1RSC A;  1DJH A;  2C0A A;  2G3M A;  2BB0 A;  3WQP A;  4YS1 A;  1IEV A;  5T8G A;  4C5Z A;  4NAF B;  1NWT A;  1Z8A A;  4KEV A;  5BU6 A;  1BL4 A;  5A6M A;  5EKY A;  1W3J A;  2GJX B;  4LUI A;  2A21 A;  1RXO B;  1KM1 A;  1XUZ A;  4A3U A;  4M1R A;  4J3V A;  2LPV A;  3ARX A;  2JE8 A;  3AIV A;  4JCM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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