3G9BA

Crystal structure of reduced ost6l
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
155
structure length
148
Chain Sequence
IDDILQLKDDTGVITVTADNYPLLSRGVPGYFNILYITMRMSCQLCHDFEKTYHAVADVIRSQAPQSLNLFFTVDVNEVPQLVKDLKLQNVPHLVVYPPAESNKQSQFEWKTSPFYQYSLVPENAENTLQFGDFLAKILNISITVPQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferas
publication title Oxidoreductase activity of oligosaccharyltransferase subunits Ost3p and Ost6p defines site-specific glycosylation efficiency.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transferase
total genus 42
structure length 148
sequence length 155
ec nomenclature ec 2.4.1.119: Transferred entry: 2.4.99.18.
pdb deposition date 2009-02-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3g9bA00
2P5QA 4MCUA 2R2JA 4HZ2A 4BVXA 5D73A 4N0ZA 1W4VA 4Q5RA 4IW9A 2GQKA 1YKAA 3IDVA 4L5LA 1QMVA 1HYUA 5F06A 1SU9A 17GSA 2I9HA 3LYPA 2QC7A 3PINA 3Q18A 2WULA 2DSAA 2WRTA 3HXSA 1VF1A 1WRYA 4OWYA 3DEXA 2R6KA 2C0EA 4XS1A 5G1KA 2GZYA 1B9YC 2X64A 2E0QA 4J2FA 2OADA 4K7OA 1ZGNA 2HZEA 1CQGA 1K0MA 16GSA 4WR5A 1XVWA 1UA5A 1A23A 3CRTA 1FO5A 22GSA 5AISA 4MH3A 1A24A 1SD9A 3HYPA 1VF4A 2X8GA 3LG6A 5EVOA 1AQWA 1PRXA 3GL3A 3UARA 1O7UA 2LJAA 2VCVA 5CAXA 3PR8A 1Q98A 1K0CA 3FY7A 5HR3A 5IMVA 1N2AA 4MK3A 1YY7A 2YANA 2MMAA 3A2XA 2E2GA 1EOHA 5INYA 1WOUA 3GRXA 2VUPA 3S9FA 2YZHA 4AGSA 3N5OA 3KMOA 1K0OA 5ECLB 2G0FA 5AIVA 2KLXA 3IK7A 4G2EA 4IHUA 2H74A 4OO4A 1YEXA 1OC9B 3D21A 3FZ9A 2DC5A 4DVCA 1XOAA 2PVOC 3J7Yb 4LA1A 5A4UA 6GSUA 2YWMA 1X0RA 2B5EA 4BPYA 5F8BA 1T00A 4KE3A 3OR5A 4XTSA 3CXGA 3TOUA 5E59A 2VCTA 3GFKA 2IL3A 4OFMA 4WF4A 2NBSA 4EF0A 4TXOB 4IGJA 2C3TA 4LL4B 5GAND 3QPMA 3BBYA 5ECOB 3VPQA 1VF2A 2B7JA 3UVHA 1EP8A 3GNJA 2J23A 1GTUA 3A2WA 4I6XA 14GSA 1TK0B 4HS1A 4L5OA 5J41A 4HQZA 4GSTA 3NIVA 2X8CA 1NSWA 5IM9A 1T1VA 2BTOT 2GQLA 2H1GA 4POLA 3KZQA 2B3SA 4DSSB 3SWLA 1A0RP 5J4UA 4LL1B 3F8UA 2F8FA 1JZOA 3GX0A 1DBYA 5G31A 3L9VA 3IV4A 1K0AA 3H4KA 2B5YA 5LD0A 3HHVA 4POMA 3EINA 4ZXGA 1X9MB 4GXZA 3CMIA 2MMZA 2HSHA 1VRSD 3RDWA 4ZB8A 4NWYA 3W6GA 1USBA 3P2AA 1FG4A 2DMLA 5IMCA 2L4QA 1B9XC 2QKEA 3KGKA 4HU9A 4TKYA 3GKMA 2X8HA 3P90A 1THOA 1M7TA 3ZITA 2F9SA 2VM2A 4E8HA 2HSYA 2GSQA 3QD9A 3W8JA 3LGCA 2O7KA 2B1KA 3DXBA 5D9VA 1J0FA 1RQMA 2WZ9A 1ZL9A 1PA3A 1A0FA 3KTBA 1OC9A 4XRAA 1GLPA 5DJLA 1YZXA 5HQPA 4AF2A 3IAS2 1THXA 3AY8A 1UC7A 4HJMA 2CX3A 4RI6A 1AXDA 2H6YA 1SJZA 2YWOA 1WE0A 3KTLA 2FY6A 5G30A 1MD3A 1AAZA 3LORA 2WB9A 5IPGA 4MZWA 1TI1A 1YDKA 2E7PA 1ST9A 1W89A 2VCZA 1GSSA 1FB0A 3DKSA 3TJBA 2VL9A 4TXOA 2CX4A 3LQ7A 3M1GA 1Z6NA 1U6TA 4QQ7A 4EVMA 2GT6A 3HD5A 3Q74A 2C8UA 1PD21 3EWLA 1JLWA 1C72A 1XBSA 2EIQA 4GCIA 1WMJA 3E3EA 2CVKA 1YF1A 4ZIJA 3GSTA 3L78A 4ECIA 3EU4A 3K8NA 3FYGA 4O92A 1OYJA 4DSSA 1HNBA 3BJ5A 4DSQA 4QL7A 3HZ4A 1PKWA 3UVTA 2A4VA 3TJGA 2H72A 1JZDA 1N8JA 2OJLA 4RQRA 1WPIA 2ALBA 3O6TA 1QUWA 4ECCA 1S3AA 4I97A 4X0XA 1ILOA 2H01A 5ENUA 4O7HA 4I8BA 3RPNA 3TGZA 3TKSC 3D4MA 7GSSA 2GSSA 1B4PA 3FZ4A 3TRPA 3U5RE 4ISDA 2GQMA 1EGOA 2IN3A 2XHFA 4YQVA 2IMEA 3GTUB 3D5JA 2H70A 5ECSA 3HJMA 3US3A 3WGDA 5ECRB 2H73A 5DDLA 3MDKA 1A8YA 1V2AA 4OCFA 1GH2A 3FRCA 2HLSA 1SL1B 2FGXA 2ES7A 4WBJA 1T4ZA 5FT3A 3IR4A 3RPPA 1MD4A 4MF6A 2ZNMA 2H19A 1B8XA 1ABAA 2I3YA 2VLUA 4E8EA 2VAFA 2HZFA 3GH6A 4ILFA 2H30A 1SK0A 4PQIA 3Q6OA 19GSA 4KGIA 2DMMA 1GL8A 2RUFA 1TK8B 3F3RA 2JADA 1PMTA 5GAPD 5CREA 3IBHA 1TU8A 2C3QA 1T7PB 2M80A 2HNLA 3BD2A 4AJ6A 1T8EB 2M46A 3UL3A 2IMDA 1EOGA 1ERVA 4FIWA 3IHQA 1FVJA 2R5GA 3EE2A 5DCGA 5IQYA 2CZ3A 2FWFA 3EMPA 4PURA 3TCOA 1A8LA 3VWXA 5KN2A 4IJIA 2LS5A 2HZEB 2XPEA 3GX8A 3H8QA 4MPFA 5G2ZA 3ZFLA 2LQQA 3UIWA 2O87A 3EURA 5FWGA 3ZVJD 1NHOA 2H76A 3KJYA 3M9JA 1A2MA 1OC8A 3IOSA 2O89A 3ZTLA 5ELAA 2GLRA 3GTUA 3KXOA 2TRXA 4YAPA 1Q4JA 1R26A 1V98A 2GT5A 3FW2A 1TW9A 3NOFA 3C73A 5J9BA 4PQ1A 3CSIA 4X1UA 3D4TA 1K3LA 2HE3A 3TRQA 3VWUA 3ISOA 1UVZA 2JACA 1SENA 1LJRA 2CAQA 5IIZA 2DBCA 1GSEA 3DWVA 2MZCA 1KEBA 2PMTA 1SKSB 4N10A 2H8LA 1XWAA 4OO5A 2G2QA 1EEJA 13GSA 4XS4A 5B8BA 3IA1A 2CQ9A 1YKCA 2OE1A 5LNKe 3IAM2 2DJ2A 1F2EA 2C0FA 3F3QA 3GSSA 1G6YA 2WFCA 1OKDA 3HZ8A 5DBQA 2P5RA 4GQFA 3IK9A 4MPGA 4IJ3A 3D22A 2O85A 5AGYA 3I6AA 1PN9A 1XW9A 3ZRDA 8GSSA 3EMXA 5KN3A 2N5AA 1GNWA 3HDCA 4ZB6A 5IOXA 1TI3A 2R3XA 4CHSA 1JFUA 1SKWB 2F8AA 2AYTA 2L5OA 5H5RA 3KP9A 2LRCA 4TR4A 4F0BA 4EXJA 2V1MA 4IKHA 2H6XA 5GSSA 1YJ6A 2H66A 4TN8A 3L4NA 4YQMA 1F9MA 1M0UA 3C8EA 2LJRA 5D9TA 4ULXA 3GIXA 4K2DA 5HR0A 1F3BA 2P31A 3C7MA 1XWBA 5CRDA 2CT6A 3ZMKA 4IELA 3VPTA 2VCXA 3DYRA 2KHPA 3ERFA 4EDZA 3TKPA 3A5WA 4MJCA 3UBKA 3TUEA 4OD7A 2EIOA 4MF7A 2HYXA 3WGEA 1Z5YE 4PQHA 2YOIA 4TR0A 3HJOA 5JWRB 1EEMA 2VCWA 3CSHA 4MMMA 2DJJA 2CA8A 3V1WA 4Q5NA 1MEKA 3IXRA 2GS3A 1XVQA 1A2LA 4HZ4A 2GGTA 3I69A 1SJIA 2FNOA 2FWEA 2H75A 4K6XA 5KEJA 1ZYEA 2FA8A 2LRNA 5EL8A 1WP0A 1AQVA 2K6VA 2YNXA 3HCZA 5DJMA 5JCWA 4GSNA 4N11A 5D8IA 4F9ZA 4KX4A 4V1Ap 2XBIA 3QDNA 3UMAA 1X5CA 4ZBBA 2IIYA 5DVBA 1TRVA 5AIXA 5ABRA 5COHA 3GMFA 4G10A 2VO4A 1J08A 4ECJA 3H79A 2VIMA 1V58A 4L0UA 1U3AA 4MJBA 5CRHA 4JBBA 2OBIA 4KSMA 5B7CA 4MABA 5DCHA 2KP2A 3P7XA 1TOFA 4PGTA 1FOVA 3RBTA 2RM5A 4LLRA 2LEGA 3WD6A 4CW9A 3LJRA 3WT1A 2LNSA 2N5BA 1PL2A 3VI5A 2YWNA 1XWGA 3ZIVA 2C80A 1GTBA 1Z6MA 5J9CA 4F2IA 4JZQA 4EC0A 1G7OA 3LFLA 2LKUA 5IMFA 1OC3A 2KUCA 3PGTA 4ZL9A 1OKTA 3P8WA 2C0DA 3DVXA 4GF0A 2LRTA 5HFIA 1K3OA 2D2ZA 2VLVA 2MMOA 4GWRA 1GSDA 1R5AA 3GH9A 1SKRB 2RM6A 1Z7PA 3F0IA 2VCQA 3D6IA 4KAEA 1M2DA 1U88A 1YQ1A 1DE2A 1E2YA 2L6CA 3IPZA 1GRXA 3HVVA 11GSA 2RLIA 4V2LA 3RAZA 2OA7A 4V1Ag 4FO5A 1S3CA 3CTGA 1AW9A 4FYUA 3EYTA 2I1UA 2LV3A 2AUVA 1F6MC 3ZLPA 4IQAA 4NAXA 2KP1A 4WETA 2PUKC 3KCMA 2VL3A 1DE1A 3C71A 4NHWA 3APOA 3QCPA 1QFNA 2YN1A 3QMXA 5J5NA 3VWWA 1XCCA 4ZL7A 6GSYA 2VM1A 3ZZXA 3TKRA 5IOWA 1MTCA 4GLTA 1Z7RA 1K0NA 2YZUA 1TJDA 4GRFA 4BWQA 2K8VA 1ZCPA 4NMUA 1JHBA 1HNAA 3UJ1A 3L0HA 5G5FA 5ECKB 1S3DA 2RIIA 3KD0A 1R7HA 2NTOA 4POBA 1HNCA 5B6MA 1G6WA 3PH9A 4F0CA 1SYRA 6GSSA 3G7IA 3FEUA 2YV7A 1BYEA 4KCAA 4OFTA 1LBKA 1J9BA 3IRAA 5H5SA 2DJ0A 2GVPA 3QFAC 1O8XA 4BL7A 2K8SA 4XS6A 4K7IA 4GSSA 1SK2A 5JWQB 3ZVJA 5DQSA 3HVSA 3LEFA 1GSFA 1K0DA 4EE0A 6GSWA 4MJAA 1FHEA 2WJUA 1BQ7A 1X5DA 2IWTA 5DALB 2MYGA 1JZRA 3IE3A 1XW5A 5KN1A 2V6OA 3NZNA 3QAVA 3HA9A 3RHCA 1H4OA 3ZL5A 3GN3A 2B1LA 3TDGA 3QAWA 1BG5A 2ZCTA 4BWSA 2VLTA 1FVKA 4XS4B 1NHYA 5AN1A 4L8EA 1DSBA 4HQSA 2WS2A 5ECQB 2CZ2A 3O3TA 3KM6A 1HQOA 2RUEA 2YPMA 2R4VA 3GA4A 4NXIA 5HR2A 1WWJA 1U87A 3TKSE 2JU5A 2MBSA 4FYBA 4MP4A 1R5PA 3FZAA 2B7KA 3WGXA 1OAZA 2H0GA 2K18A 1XIYA 3BOAA 1U3IA 1V9WA 1XFLA 4Q5QA 3DD3A 3M3MA 1M9BA 3TKSA 3G7JA 2EC4A 2LTKA 3GV1A 4DEJA 1GSQA 5ID2B 4OMVA 2AB6A 2IPAA 1ACVA 4I2UA 5A5KA 5D96A 1UN2A 2ZUPA 4FYCA 3L9SA 5FHIA 2TRCP 4JEDA 2B5XA 1XZOA 1TDIA 4G19A 1F3AA 3QR6A 4CDOA 1X9WB 4TOPA 2E2MA 4K1FA 4MA9A 1PSQA 1SK1A 1Z9HA 2N5FA 4WEYA 5JCGA 4HEA2 1LU4A 4ECBA 3KH7A 5IO0A 4KUNA 3LWAA 5DALA 5IMZA 3UEMA 4XCSA 1X9SB 2WGRA 3ED3A 4PUFC 3WYWA 1XWKA 4EDYA 1RK4A 3QOUA 4TR1B 3JCML 4N30A 3RHBA 3F4SA 2GTUA 4YQUA 1TXXA 2MMNA 2ON7A 5C04A 2P0GA 3VK9A 1YEPA 2L5LA 5EPFA 1XXUA 4YH2A 1GNEA 3R2QA 5IO2A 2I81A 4X43A 4WF5A 3GHAA 4IS0A 2DIYA 2BJXA 3DVWA 4H86A 5CYYA 2FLSA 2M72A 6GSVA 4HI7A 2CV4A 3LXTA 4HU7A 3KMNA 1K0BA 4MZCA 4NV2A 2V6KA 1BX9A 3F4RA 2TIRA 3MNGA 4BA7A 1VGLA 2FWGA 3GKXA 3SBCA 4G9HA 4IN0A 4KNDA 2C0GA 4K0GA 1ZYQB 1Y25A 2PERA 1Y6EA 4MLYA 3CBUA 4IP6A 5E4WA 5L71A 3UAPA 1FB6A 2Z9SA 5ID2A 3CSJA 3QFBC 3TJFA 1M2BA 1KNGA 1JZWA 3I9V2 2HT9A 1MDJA 1TRUA 1BEDA 4PXOA 5ECHB 1EWXA 4ML6A 2XC2A 1QQ2A 12GSA 2H0HA 1V57A 3TJJA 2VOCA 4LMWA 1NW2A 1WJKA 5HFGA 1GTAA 2VD1A 1URMA 5D9WA 1M2AA 3M9KA 3FZ5A 4V2MA 2AHEA 1TK5B 2YWIA 4IBPA 2WDUA 1NM3A 1AC1A 5D93A 5GSTA 4JRRA 2KOKA 3E9JB 3D0ZA 4PNGA 4N0VA 3VURA 2PVQA 3KEBA 2IJYA 5J3RA 2DLXA 2A2RA 4TR1A 5G5EA 6GSXA 5ECMB 4TVEA 5LCZA 3CTFA 2HI7A 1GSUA 2CVDA 2MBTA 4JR6A 2IFQB 9GSSA 4IP1A 4ACSA 4HOJA 5DAKB 2HRFA 2JSYA 3APSA 1AUCA 1XW6A 5IMAA 5F0GA 2L57A 4NV5A 2H1BA 4WXTA 3BCIA 2FWHA 6GSTA 3FR9A 2QSIA 1TRWA 3DMLA 4K7NA 3FK8A 3GKKA 4LMVA 3TKQA 2PWJA 4FH8A 1IYIA 3CRUA 3N9JA 1PX6A 1GUHA 2LJKA 4I5QA 2AV4A 2WCIA 3FR3A 5G1LA 1TU7A 4OFNA 3UBLA 3FHKA 4TRXA 3EU3A 2OE3A 3DRNA 5CRGA 2XPDA 4OCEA 3VI7A 4AJ8A 1QK8A 1TP9A 3WT2A 10GSA 4POKA 1O73A 2HXKA 2IMFA 2YV9A 18GSA 4ID0A 2AAWA 4XIHA 1Z3EA 3TB2A 2GZZA 2DJ3A 3F6DA 5B6NA 4KDXA 2YJHA 1HD2A 3F4TA 2L4CA 1FW1A 3MSZA 2GSTA 1AQXA 2FHEA 4IVFA 2NVLA 2AJQB 4PNFA 4WR4A 5JWOB 2XBQA 3VFIA 5CRWA 5HR1A 3H93A 1BJXA 1A2JA 3GURA 2HFDA 2OE0A 5B8AA 3O76A 5CO3A 3HVXA 1B4QA 1PX7A 2DIZA 2L59A 4WBRD 3BCKA 4HUAA 1TRSA 2IFQA 1KTEA 1GTIA 5DAKA 2V41A 1R4WA 1RW1A 1AIUA 3M8NA 3VLNA 5ECIB 2YJ7A 4JE1A 1GWCA 2JZTA 4RI7A 2JZRA 2F51A 1O6JA 5IMDA 4KB3A 2ON5A 4KCEA 5DQYA 2FUG2 3ZIJA 1B48A 2OACA 3F6FA 3G9BA 3A2VA 2PU9C 2C4JA 4MJEA 1ZZYA 4ZB9A 3Q19A 1FAAA 3TRXA 3MAKA 1V40A 3ZREA 1DUGA 4ZL8A 3C1RA 1T4YA 2PGTA 4V2NA 2YCDA 1SJ6A 2R37A 2DJ1A 4J56E 3FR6A 4KDUA 4RQXA 5ECPB 1ON4A 2LSTA 3LXZA 4GTUA 4EO3A 3FKFA 1ML6A 1XOBA 3G7YA 1BAYA 3QAGA 3TOTA 3EVIA 1M9AA 4KW6A 3M0FA 1GP1A 3A3TA 2C1YA 1EV9A 4Z7XA 1OE7A 2GZPA 1I5GA 4O32A 4KSOA 3GL5A 3C1SA 2GDRA 3KIJA 2H6ZA 3HKRA 3UOMA 4AJ7A 2V2GA 5F07A 2FA4A 2LQOA 1E6BA 4O5RA 1TKDB 4HJ2A 1K3YA 4KDYA 2IMKA 1VF3A 1YF0A 2F3MA 1PQNA 2BMXA 2HRNA 5H5QA 4F03A 1QXHA 1WIKA 1O85A 1SL0B 3GUSA 3APQA 4RUVA 5CNWA 4ZILA 4GQCA 1MDIA 1SL2B 2DJKA 2LNTA 3E0UA 3GYKA 4MZBA 2PBJA 4Q5FA 3ERWA 4JR4A 3EC3A 4I2TA 4PUAA 2CVBA 4IQ1A 3H1NA 1QGVA 1I9DA 1EP7A 2B6MA 3KH9A 2LUSA 4PX1A 3F63A 3ERGA 3CYNA 2REMA 3ME7A 2JSZA 2V32A 3LYKA 4NPBA 2CAIA 4BVYA 5F05A 1GLQA 3F9UA 4D73B 2YP6A 4NHZA 2C3NA 3GKNA 4KH7A 4L0WA 2H71A 2FD3A 3VWVA 2VL2C 2A2SA 3J7Yk 3MWHA 4TXVA 3IC4A 2K9FA 4DSRA 3DIEA 3ZFBA 1OE8A 4YAVA 20GSA 3ME8A 4J57E 2O8VB 1XPVA 1ZOFA 4MF5A 2JL4A 3TJKA 3HJPA 5GZZB 1X5EA 4WKWA 3L9UA 1IYHA 1PGTA 1CQHA 1T3BA 4P3YB 1G7EA 2H1AA 5A4WA 5JCUA 4KA0A 1GSYA 2OKAA 4K0NA 4ZBAA 4TR3A 2NDOA 1SD8A 1JLVA 2GSRA 1EGRA 3DGQA 2J9HA 4MH2A 2VD0A 4HDEA 5A4VA 2L6DA 1XWCA 5ECNB 2PN8A 4EUYA 4EKZA 5HFKA 4F82A 4ML1A 1EZKA 1GUMA 2QGVA 1F37A 4ZBDA 4JU5A 1ZMAA 2EIRA 4EL1A 5KN0A 1H75A 1ERTA 3HY2A 4XRDA 1OVNA 1SYXA 2NPBA 5IPHA 2H0IA 2OBKA 1TTZA 5D9XA 4K8MA 3ZYWA 1KBNA 1ERUA 5ELGA 1O81A 1M99A 1ERWA 2PPTA 4MDCA 5C00A 1EV4A 3LSZA 5CP1A 1MDKA 4K9ZA 1GUKA 1GULA 4D73A 1G0TA 2I4AA 1PKZA 2VL2A 3ZMLA 4QL9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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