3GDQA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1-like atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
376
Chain Sequence
b'GIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1-like
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 122
structure length 376
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gdqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gdqA04
4Y0WA 1GLJO 4BRHA 4A2AA 4QS8A 4FOIA 3A0IX 4J8FA 2Q0UA 2F9WA 2GTDA 4H0VB 4QS9A 3CJ1A 1D4XA 5ADXA 4JD2B 1X3NA 1QZ6A 4I6MB 3W3DA 5AFUA 5AQMA 2QWLA 2A3ZA 4PKHA 4BR0A 5AZJA 4BRGA 4CI6A 4CZEA 3LM2A 5F1XA 5JMVA 2P9NB 3BP8A 4AM6A 1MA9B 4B1XB 4BG9A 3MN9A 4BC4A 1DEJA 3SMSA 4BRIA 3OHRA 4CZGA 3DAWA 1SZ2A 2A40A 3SJHA 5AQSA 5JLHA 2QWNA 3IUCA 2E1YA 3AAQA 1V4SA 1SAZA 3VF2A 1NGGA 2Q2RA 1HLUA 2CGKA 1NM1A 3LDNA 2OANA 1ATRA 5BR9A 1RDWX 1T6DA 3AY9A 3CQXA 1U6ZA 5KPZA 2BTFA 3LDQA 3CETA 3VF6A 4CBXA 3FZMA 2E2OA 4BG8A 1XUPO 5AQFA 4JHDB 3ULEB 2HMPA 2FSNA 5BN9A 5KQ8A 3A5NC 1XQSC 2CH5A 4B1ZA 4RTFD 2A42A 4B1UB 1TYQB 3JXUA 5I9EB 4RWTA 1YAGA 4FWOA 1YUWA 4NB4A 5E26A 1NGBA 1GLLO 2P9LB 5TKYA 4JD2A 4BRQA 3BUZB 4I6MA 1HKGA 2AP1A 4ISFA 2HOEA 2E8AA 1X3MA 2D0OA 4K41A 4B1VA 1NGAA 2QWQA 5BPMA 3WXLA 1Q18A 1X9JA 3R8EA 2CH6A 2P9NA 1ZBSA 4IWVA 4DCHA 5EY4A 2J4RA 3VGLA 3DWLA 3GBTA 1HJOA 4XH1A 3ATUA 2Q0RA 1GLCG 2V7YA 2EWSA 3QFUA 3VEVA 1IG8A 4GNIA 3BEXA 4BRPA 3WEEB 2E2QA 1NGDA 3H1QA 1Z6RA 3EL2A 3ZX0A 3CERA 3WXJA 3U8XA 1T6CA 2D4WA 3WXIA 3DJCA 4FWRA 1YXQA 4FWMA 5AQRA 3BF1A 3MK6A 4IO8A 4YDUC 3QMLA 2DPNA 2ZF5O 5KQDA 4CD3A 3I33A 4JHDA 4BRMA 5AQZA 5AQIA 3ULEA 2QWMA 3L0QA 4H0PA 4BQLA 2V51B 3D2EB 2ITMA 5AQVA 4NO7A 4BR7A 4BQZA 2E88A 1TYQA 2YJFA 4BR5A 3HZ6A 1NGEA 3FZFA 1QZ5A 4A62A 4DQ8A 2P9LA 4H5TA 2IVOA 3SK3A 2YHXA 4O5FA 1NGHA 4H0TB 3D2FB 5AQTA 1MDUB 4GY2B 1GLBG 3VEZA 1S3XA 1S22A 2NRHA 3ZEUB 2FLOA 5AQLA 3CJBA 1U2VB 2A41A 3HTVA 1NGJA 2E2PA 3A5OC 4H0OA 4H5NA 2IIRA 1QQOA 4QS7A 5BPNA 3HSCA 4FWQA 4RCHA 2D1KA 4O8KA 3WEEA 1BDGA 4CJ7A 3O5BA 3MN6A 3MDQA 4CZKA 2D0PA 3HM8A 2CGLA 5LJWA 4BRFA 1MWKA 4BC2A 3H6EA 4H03B 4YDUA 1KAZA 3H46O 4EAHD 2VCPA 3O6WA 2QWPA 3U9DA 2FF3B 1BOTO 5FPNA 3UKUB 5LJVA 4MLEA 2ZWHA 4FWSA 1IJJA 2W41A 4B9QA 3KZBA 3D2EA 5AQWA 2YJEA 3CQYA 2PBDA 4BR9A 3GL1A 2P9SB 3TU5A 1KAXA 1NLVA 3IFRA 4ISEA 1ZXOA 4IJAA 2ASOA 3MMVA 3DXMB 5AR0A 3WXKA 1NMDA 4FPBA 2P9UB 3VOVA 5AQGA 4BRLA 1Y64A 3VGKA 5BRDA 4EHTA 2VWBA 1EQYA 3EO3A 4PL8A 3D2FA 4K25A 4BRCA 1NGCA 3ZETB 4K43A 2GUPA 3ZEUA 1TUUA 3U9ZA 1JCGA 5BPLA 2YHWA 3EN9A 4CD1A 3ZX2A 3QB0A 4M63C 3VENA 1U2VA 2UYTA 3ID8A 4BC3A 1HPMA 5CE3A 4H5RA 3S41A 1DKGD 3ENHA 3GG4A 3WQTA 3R9PA 2P9PB 3GOIA 3JS6A 2I7NA 3A5LC 4H5VA 4C23A 3LDLA 1ATNA 1XC3A 3FFKB 3RSEB 1BWFO 4MO5A 4HWIA 2ZGYA 4FPAA 4BRDA 2FSKA 3SLCA 4EIAA 3O80A 2FXUA 3EKUA 1DGKN 4PL7A 3UB5A 1ATSA 4FL9A 3C7NB 3DXKB 2HF3A 3O4WA 2CGJA 4FWLA 4MO4A 3VEOA 1E4FT 5ADXH 4BROA 5AQNA 3EKSA 5AFUH 3H3OB 1QHAA 5EX5A 2GWJA 3VEXA 3UKUA 4KBOA 4H0YB 4LC9B 4CZJA 4CZIA 1RGIA 4CZFA 4ISGA 2V7ZA 4WQ4C 4EHUA 2P9SA 3FZKA 1HX1A 4AM7A 3KHYA 1NGIA 1NWKA 3FR0A 3DXMA 1MWMA 5B8HA 1BU6O 2P9UA 2Q36A 5JICA 2Q97A 2YHYA 4L3QA 2QM1A 3QICA 5BRHA 1BA1A 2YCHA 4JAXA 2QW9A 2F9TA 3ZETA 4Z94A 2AA4A 4FWKA 3W0LA 2E20A 3LDPA 2E2NA 4BRNA 5EVZA 4IXCA 5FPEA 1BO5O 3LM9A 4WQ5C 3FZHA 3FGUA 2P9IB 1OKJA 3CJCA 3IMXA 3L4IA 2P9PA 2YI1A 3GDQA 2HF4A 4IJNA 2QXLA 1HKCA 1SQKA 4MLHA 4BGAA 4BVOA 5JLFA 3J8AA 4BREA 5KPTA 2NLXA 3VESA 4BGBA 1RFQA 3A8YA 5AQXA 3LL3A 3C7NA 3DXKA 2PAVA 2Q1NA 3UKRB 4DHYA 3QDKA 4A2BA 3A5MC 3FZLA 3O8MA 3O1WA 3MCPA 2E1ZA 3SMPA 3EZWA 4XH5A 1HKBA 3QBWA 2A6AA 1GLAG 1LCUA 1ESVA 3R6MA 3U4LA 4F9OA 3H1VX 3LDOA 1HUXA 5AZIB 3M1FA 4WQ4A 5F0XA 4XEIA 3GE1A 4K42A 5AQJA 4EFHA 5AQOA 1LOTB 4CBUA 1C0GA 3VPZA 4H0XB 5FPMA 2P9KB 1YVNA 2FSJA 3VEYA 3QFPA 4E1JA 3L6QA 2ZGZA 4FWNA 4DB3A 3VF4A 3MN5A 1KXPA 4M7YA 3IDHA 1E4GT 4CZLA 3F9MA 4WQ5A 3CIPA 4PKGA 1V4TA 3P4IA 1P8ZA 2P9IA 3VERA 4FSVA 3HBTA 4BR2A 4CBWA 5BRFA 3H3NO 1G99A 4BVPA 3H45C 5F2RA 1K8KB 3VGMA 3WUHA 2IVPA 3CHWA 3I8BA 1J6ZA 4FWPA 3CJ9A 5BREA 3UE5A 5AQQA 4BRAA 4BRKA 2GWKA 2NZTA 3WT0A 3UKRA 5AQPA 2FF6A 2I7PA 3ZX3A 4FO0A 1T44A 3HI0A 3CJAA 5FPDA 2ASMA 1H1VA 2VYPA 1JCFA 3M6GA 2V52B 1QQMA 5AQKA 4BR4A 5AQYA 3TPQA 5AZIA 1NGFA 2H3GX 3B8AX 5AZJB 2GELA 1BUPA 3QBXA 1JCEA 5BN8A 3O08A 4JN4A 2GEMA 2KHOA 4XH4A 2P9KA 4M7XA 3D7EO 4BC5A 3M3ZA 3ENOA 3MN7A 5EXWA 4H5WA 2Q31A 1GLFO 1QQNA 1WOQA 4JNEA 1KAYA 3BF3A 2ASPA 5AQHA 4CZHA 2QWRA 1ZC6A 4HTLA 3FE1A 1NBWA 2WUSA 1TUYA 1C0FA 4A61A 3KVGA 4B1YB 5LY3A 3G25A 3ATVA 3VETA 4WYBA 1BG3A 3CI5A 1Z05A 1BA0A 5ELZA 2IVNA 1CZAN 3VEWA 3WQUA 3CJ7A 1K8KA 3AARA 2QWOA 5EOYA 1R59O 2W40A 1GLDG 2BUPA 5AQUA 3C0BA 5KPRA 4B1WB 1WUAA 4FOEA 4CZMA 3RSEA 5E84A 1GLEG 3FLCO 4IZ9A 3O1BA 3AAPA 2A5XA 4PKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLJO 4BRHA 4IEEA 4DG1A 4U67L 1P00A 4FOIA 1VHXA 1IKVA 3MWPA 2F9WA 2D56A 3HPGA 4CJWA 4H0VB 2HHSA 3K5NA 5HP1A 1YITN 4CCHA 1WLJA 3CXCM 4IOAL 5A2QO 1NK6A 2Z1IA 3R2VA 3V1RA 4CI6A 4CZEA 2P9NB 4AM6A 4BC4A 1I2VA 1BQMA 2YILA 2JWKA 1JLGA 4CFAA 3SJHA 5JLHA 2QWNA 4DV1K 1CZ9A 3IUCA 4K8XA 4M45A 3AAQA 3KOYA 2E2FA 4W5RA 5DM7L 1HLUA 3AVBA 4JKCA 3LDNA 4CFDA 1YIJN 3BZCA 3PUFA 2LY5A 2E2OA 4OVLA 3CCRN 1XUPO 4DUYK 4NLBA 5HRNA 4CJ4A 3ULEB 1ASUA 1NNEA 5BN9A 2E3GA 1GPTA 3AA3A 1NK9A 2BDPA 4TSXA 2CH5A 3NDKA 3O9UA 4Q5VA 2HW3A 3RMCA 4DR1K 1TYQB 4NYFA 3AVKA 2IOCA 4KREA 4E72A 1ZYQA 4G9ZA 2P9LB 5TKYA 4JD2A 3OBYA 1NOZA 1K73O 4I6MA 1L5UA 2KQ2A 1CHZA 1HQEA 3PY8A 3DLHA 3WXLA 1TAUA 2RPIA 2NY9X 3MX5A 3CCLN 5EY4A 2J4RA 1U47A 4CK1A 3OS1A 1N36K 1P90A 1QSYA 4LFAK 4N5SA 2VG7A 3QNNA 1C1CA 4JKEA 4GVMA 3ATUA 2V7YA 4E7HA 4OKJA 3THYA 3PX4A 2EWSA 3NMUA 4BRPA 2XY6A 3L2RA 4Y1DA 1LW0A 2E2QA 3H1QA 1SS6A 4JI1K 3ZX0A 2O8BB 1Q82O 1Z25A 1BHLA 3CM5A 2X6SA 2KFNA 4FWRA 4UADE 1IKYA 4FWMA 2BE2A 3L4QA 3KLEA 3MK6A 4IO8A 4YDUC 1ITGA 3K5MA 4CF8A 1VQMN 5AJ3K 4JHDA 3V81A 2LY6A 3NAEA 4CIEA 3VQ7A 3L0QA 3RR7A 1QVFM 1IV0A 4O0JA 4O0IA 3NGZA 3KOXA 2VWKA 1IKWA 3V4IA 1YVUA 1NGEA 1QZ5A 3PLAA 1QSLA 4FVMA 2F96A 2IVOA 4L8RB 1SKRA 3OW2M 2YHXA 1RT5A 4O5FA 2F7TA 4CGJA 3F2KA 1S1XA 5AQTA 3VEZA 2YBRC 2NRHA 2FLOA 4E7IA 5AQLA 3TARA 1BIZA 4ID5A 1NGJA 2E2PA 4DTJA 4H0OA 1XHZA 4FJ8A 4E89A 2F8TA 1U45A 5C0YA 4FZZA 4CJ7A 3WEEA 4YOWA 3O5BA 1N4NA 4RW9A 3PX0A 3MDQA 3HM8A 5LJWA 3VQAA 4FJIA 1MWKA 3OYFA 3KWGA 4EAHD 3OS2A 3E66A 3V1OA 5JS1A 1EO1A 2FBXA 3LPTA 2P51A 3K5LA 2QEXN 3LP1A 3CM6A 2ZWHA 4MLEA 3JSMA 1OMYA 3D2EA 3CQYA 2PBDA 4BR9A 5HLFA 2OPSA 5FRNA 2OPQA 3DXMB 2ZE2A 4Z4HA 1JJ2M 3WXKA 4B9VA 4BRLA 3VOVA 4WF9L 2PFUA 3SAHA 4PL8A 3D2FA 3KP0A 3TTCA 2FBYA 2YNGA 3I0RA 3OYAA 3K0SA 2E3FA 3M8PA 5BPLA 2HHIA 4M63C 3ID8A 1NKEA 1HPMA 3E7RL 3DOKA 2ATBA 2F4VK 1J9AA 4OGCA 4JK8A 4LH4A 4X62K 1KFSA 3P31A 3FFKB 1A5XA 4HWIA 1T03A 4FPAA 4DF8A 1HJRA 2FSKA 3G71N 4UJ0A 2FXUA 5CY4A 1KD1O 1CN2A 2OZSA 3UIQA 4JKGB 2ZD1A 4W5NA 4JI8K 3EZ5A 5ADXH 4GV3A 1YJ9N 3BK3C 3EKSA 5AFUH 3H3OB 4N41A 4M3TA 2GWJA 2F8SA 3VEXA 3ID6A 1ZU3A 2NRTA 1WAJA 3KOZA 3ZSQA 3OYHA 1O1WA 2P5GA 4AHUA 1AYJA 3C95A 5H1SQ 2Y1IA 2GMOA 4WQ4C 4CESA 1D5AA 1GOAA 3OYDA 3KHYA 4B9LA 4O4GA 2X6NA 1ZBFA 1LQIA 1BU6O 3ZSXA 5J2PA 2YX6A 1SL2A 4B9NA 1BA1A 1IO2A 4ELUA 4N47A 4M41A 1OVQA 2AA4A 3HP9A 2E2NA 1XI1A 4C1NI 4WCEL 4YNQA 5CZ1A 1BO5O 3FGUA 2YEOA 5J2MA 1HNVA 2E6LA 5D3GA 3KK7A 3KLGA 1NKBA 4CVNE 4AHTA 4CJQA 2UXCK 1SQKA 2NRXA 4BGAA 1DJTA 3T1HK 2OPRA 1ICAA 2NLXA 3TABA 4DR4K 1W7AA 5AQXA 3LL3A 3C7NA 4KO0A 3UKRB 4O5BA 4FLZA 3VQ9A 3MCPA 3OYIA 2I61A 3SQ4A 1GPSA 2A6AA 1GLAG 3F9KA 4FLUA 3R6MA 4F9OA 1AHOA 4J2DA 4E7LA 2LSNA 3M1FA 3NVMA 4V1DC 3CC4N 4OPKA 3KC6A 4K42A 3OVNA 3NF8A 3VA0A 2D5RA 4IDHA 3T19A 4YOYA 2FSJA 3AVLA 1KVBA 4KTQA 3VEYA 3QFPA 2KBHA 1EWQA 3PIPL 1RILA 4KB1A 1XWLA 1WB9A 1U04A 2OTLN 2K35A 4DU3A 4I9QA 2XY5A 4PQUA 2P9IA 3VERA 2UXBK 1JLEA 3HBTA 1HYZA 4RG8A 1QSSA 3TSPA 4CHOA 1TKTA 4BVPA 2HNYA 1F21A 3ULDA 2O8FA 3VGMA 3C6TA 4DLEA 3NF7A 3T3FA 4FWPA 4HUFA 3UE5A 1M90O 4IG0A 1K8BA 3LP0A 2NZTA 3WT0A 1N5YA 3THWA 3ZX3A 3KLFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1GLJ O;  4BRH A;  4IEE A;  4DG1 A;  4U67 L;  1P00 A;  4FOI A;  1VHX A;  1IKV A;  3MWP A;  2F9W A;  2D56 A;  3HPG A;  4CJW A;  4H0V B;  2HHS A;  3K5N A;  5HP1 A;  1YIT N;  4CCH A;  1WLJ A;  3CXC M;  4IOA L;  5A2Q O;  1NK6 A;  2Z1I A;  3R2V A;  3V1R A;  4CI6 A;  4CZE A;  2P9N B;  4AM6 A;  4BC4 A;  1I2V A;  1BQM A;  2YIL A;  2JWK A;  1JLG A;  4CFA A;  3SJH A;  5JLH A;  2QWN A;  4DV1 K;  1CZ9 A;  3IUC A;  4K8X A;  4M45 A;  3AAQ A;  3KOY A;  2E2F A;  4W5R A;  5DM7 L;  1HLU A;  3AVB A;  4JKC A;  3LDN A;  4CFD A;  1YIJ N;  3BZC A;  3PUF A;  2LY5 A;  2E2O A;  4OVL A;  3CCR N;  1XUP O;  4DUY K;  4NLB A;  5HRN A;  4CJ4 A;  3ULE B;  1ASU A;  1NNE A;  5BN9 A;  2E3G A;  1GPT A;  3AA3 A;  1NK9 A;  2BDP A;  4TSX A;  2CH5 A;  3NDK A;  3O9U A;  4Q5V A;  2HW3 A;  3RMC A;  4DR1 K;  1TYQ B;  4NYF A;  3AVK A;  2IOC A;  4KRE A;  4E72 A;  1ZYQ A;  4G9Z A;  2P9L B;  5TKY A;  4JD2 A;  3OBY A;  1NOZ A;  1K73 O;  4I6M A;  1L5U A;  2KQ2 A;  1CHZ A;  1HQE A;  3PY8 A;  3DLH A;  3WXL A;  1TAU A;  2RPI A;  2NY9 X;  3MX5 A; 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