3GDQA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1-like atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
376
Chain Sequence
GIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1-like
total genus 122
structure length 376
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gdqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gdqA04
4A62A 1GLEG 3F9MA 4I6MB 3ZX2A 4B1ZA 3UKRB 5KPZA 3D2EA 3HBTA 4CZGA 5AQQA 1RFQA 3CQYA 4B1VA 1YXQA 3OHRA 3UB5A 4EFHA 4A2BA 3LDLA 4XH4A 1GLCG 5LY3A 1R59O 1BO5O 3MN9A 5AQSA 3LDPA 2E2OA 4H0XB 5AQUA 2P9NB 4BRAA 4BR7A 1X9JA 4PKIA 2VCPA 3L0QA 4JD2B 3VF4A 5KQDA 4H0OA 3ZEUA 3O08A 3ZX0A 4AM7A 3D2FA 2FF3B 2HOEA 4CZLA 5AQVA 3TPQA 3ATUA 3MN5A 4BRMA 2Q1NA 4BRKA 2QWNA 1XUPO 1HX1A 1BUPA 3JXUA 4JHDB 2YHYA 3ZETA 3DWLA 4XEIA 4BRIA 5LJWA 3CJ1A 3H45C 2V52B 4BGAA 4CZEA 3H1QA 5BRFA 3O6WA 2E88A 3ENOA 5JMVA 2IIRA 2V7YA 3WXLA 4GNIA 1QQMA 4BRPA 3CI5A 4IXCA 4GY2B 5CE3A 1HJOA 4BR0A 4CBUA 1ZBSA 4M7XA 4WQ5A 4Y0WA 1NMDA 2FSKA 2GTDA 1HLUA 2E2PA 1HKGA 2E20A 1NGGA 2P9NA 4CD1A 3I33A 1TUYA 1Q18A 3FZHA 3GBTA 3VEOA 4K41A 4BRHA 3VEYA 3QB0A 2P9IA 2QM1A 3A5NC 3FZKA 3U9DA 4BQZA 1NGDA 3CJ9A 5BPMA 3WEEA 5E26A 3ULEA 3H46O 2NZTA 2CGLA 4BC3A 2A42A 2VWBA 4K43A 4CJ7A 1QQNA 1BU6O 1WOQA 3AAPA 3BUZB 4FWKA 3S41A 3W3DA 1S22A 2ZGYA 4J8FA 3M3ZA 4WQ4A 1T44A 2P9LB 2GWKA 2FSNA 2F9TA 3A8YA 2WUSA 3GOIA 3VF2A 3SJHA 1MDUB 4IJAA 1MWMA 1ATRA 2QW9A 2IVNA 3DXKA 4JD2A 4BR9A 3W0LA 1U2VA 2Q0RA 4A2AA 2D1KA 1QZ5A 3KHYA 4M63C 4B9QA 4E1JA 5ELZA 5AQJA 3FR0A 4IZ9A 1YAGA 2NLXA 3R8EA 4BG9A 4FL9A 1D4XA 5F2RA 2BUPA 4CZKA 3U4LA 4BC4A 3WXIA 1DGKN 3HTVA 3O4WA 3J8AA 3FZMA 2E1ZA 3AARA 4MO5A 2P9SB 3SLCA 5KPRA 4FPBA 2A3ZA 1LOTB 3FLCO 3SMPA 1T6CA 3VERA 4BRFA 2E1YA 2GWJA 4FWRA 3EO3A 1BWFO 3C7NA 2CH5A 4NO7A 5AQTA 4H5TA 5BREA 3LM9A 1K8KB 3QBWA 3HZ6A 3EKSA 3UKUA 3BF1A 2VYPA 5KQ8A 1XQSC 2F9WA 3UKRA 3ID8A 3O1BA 4CBWA 1NGAA 4CZIA 3BF3A 1H1VA 5AZJB 1ATNA 4YDUC 4WYBA 2ASMA 3MN7A 1WUAA 1QHAA 4MO4A 2P9PA 5EX5A 3LDQA 5F1XA 4H0VB 1GLFO 2Q31A 3ATVA 1C0GA 2W40A 5AZIB 2YI1A 2FLOA 2FSJA 2E8AA 1NGCA 1NGFA 1GLLO 2FF6A 3VEZA 3A5OC 1G99A 4H5VA 1DKGD 2Q0UA 1KAXA 4NB4A 3A0IX 3LM2A 3QBXA 4BC5A 1BOTO 2GELA 4BRQA 3B8AX 3RSEB 4A61A 1IJJA 5AQHA 2V51B 2Q97A 1NLVA 3O5BA 4K25A 4BRNA 2P9KB 3WXKA 4RCHA 4Z94A 4JAXA 3VF6A 2W41A 4FPAA 3VEXA 5TKYA 3BP8A 4BQLA 1HUXA 1V4SA 2IVOA 2QWRA 2ASPA 1NBWA 2P9LA 4FWPA 4DCHA 3VGMA 5JLFA 3U8XA 3HI0A 4AM6A 3D2EB 3VEVA 3WQUA 1BA0A 4H0PA 3UE5A 4BREA 1E4GT 5EXWA 1HKBA 3SK3A 3WEEB 2GEMA 3A5LC 4PKHA 5I9EB 1Z6RA 4BC2A 4B1YB 2QWLA 3CERA 1NGJA 4MLHA 1ZXOA 4CZHA 2FXUA 3H6EA 2DPNA 3DXMA 4CBXA 5BRDA 3D2FB 1U6ZA 3CJAA 1HPMA 3VOVA 3ZX3A 4BRCA 2HF4A 1KAZA 3IMXA 3MK6A 2QWOA 1J6ZA 2J4RA 2D4WA 3QICA 4DB3A 1GLBG 3CJBA 2I7NA 2PAVA 2UYTA 2P9KA 5AZIA 1C0FA 3M6GA 4DQ8A 2QWMA 2NRHA 4LC9B 5AQPA 3U9ZA 3RSEA 5ADXA 4FOIA 1QZ6A 2AA4A 3TU5A 1HKCA 1ZC6A 4MLEA 5AZJA 3FZLA 3GG4A 4FWOA 5ADXH 5JICA 3EL2A 4H5WA 5FPDA 4XH1A 4CZMA 2A6AA 4BRGA 5AQYA 5EY4A 4CD3A 5BRHA 3DXKB 2CGKA 1YVNA 5AQLA 5AQOA 2D0OA 3ZEUB 1U2VB 1X3MA 3WUHA 4B1WB 5BN8A 1S3XA 3H1VX 4IO8A 1CZAN 2H3GX 3VESA 1NGBA 3H3OB 5BPLA 4O5FA 5JLHA 5BR9A 3KVGA 5AQIA 1ESVA 5AQXA 4JHDA 2BTFA 4BRDA 1P8ZA 5AQMA 2ZF5O 2ITMA 3MDQA 3WQTA 4FWNA 1NM1A 1RDWX 4BR2A 4QS8A 4L3QA 3CJ7A 3R6MA 4FWSA 4FWMA 4IJNA 3R9PA 3H3NO 5AFUA 1SQKA 3M1FA 3GDQA 5BN9A 3QFPA 4H0YB 4QS7A 1MWKA 2Q36A 5AQWA 1ATSA 4BG8A 4ISGA 5EOYA 2YCHA 1GLAG 4BVPA 3UKUB 3VGLA 2Q2RA 3VGKA 5KPTA 1DEJA 3QFUA 4FSVA 1V4TA 2YJFA 1OKJA 2HMPA 4H0TB 1JCGA 2CGJA 4CI6A 3QDKA 4WQ4C 1KXPA 1QQOA 1XC3A 3O1WA 4HWIA 1NWKA 3ULEB 1EQYA 4CZFA 4ISEA 3MN6A 4JN4A 2A41A 3JS6A 4QS9A 3CETA 1GLJO 3CJCA 5AQZA 1BG3A 3DXMB 2YJEA 3KZBA 4C23A 2GUPA 2A40A 3AY9A 3D7EO 5LJVA 3BEXA 1MA9B 3C0BA 4FOEA 2I7PA 3SMSA 2QWPA 3IUCA 2OANA 1K8KA 3L4IA 3CHWA 4BRLA 4EIAA 4YDUA 5EVZA 2CH6A 4H03B 4EAHD 1IG8A 1Z05A 1NGHA 1Y64A 3VENA 3EKUA 3IDHA 2E2QA 5AQFA 3MMVA 1YUWA 2P9UB 3LDNA 1X3NA 3WT0A 5AQKA 1NGIA 4XH5A 3FZFA 4DHYA 1E4FT 1TUUA 3O8MA 4O8KA 3DAWA 3P4IA 4FO0A 1T6DA 5B8HA 3FE1A 1JCEA 2YHWA 4K42A 3WXJA 3VEWA 4EHTA 3O80A 4ISFA 4PKGA 4BVOA 3VPZA 5AQRA 1JCFA 4FWQA 2ASOA 3QMLA 4BGBA 3LDOA 2YHXA 1TYQA 2V7ZA 1TYQB 3EN9A 4KBOA 1BDGA 1BA1A 2E2NA 5AR0A 1GLDG 2QXLA 3DJCA 1KAYA 1NGEA 3HSCA 4CZJA 4BR4A 4B1XB 3EZWA 3AAQA 2EWSA 3HM8A 3GL1A 3FGUA 4M7YA 4PL8A 3C7NB 4IWVA 2P9IB 3A5MC 4PL7A 4HTLA 4RWTA 4I6MA 2P9UA 5FPEA 2HF3A 2ZGZA 3G25A 2IVPA 5AQGA 3I8BA 4B1UB 3VETA 4FWLA 5F0XA 3FFKB 4JNEA 3ENHA 2PBDA 2A5XA 4F9OA 5AQNA 2ZWHA 2P9PB 1SZ2A 2D0PA 3IFRA 5FPMA 1RGIA 4RTFD 5E84A 4BROA 2P9SA 5AFUH 5FPNA 2AP1A 4BR5A 1SAZA 4H5RA 4H5NA 2KHOA 1LCUA 5BPNA 3CQXA 2QWQA 4EHUA 3MCPA 3CIPA 4WQ5C 3LL3A 3ZETB 3GE1A 3L6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UKRB 3CYMA 3AA3A 4OKKA 2YIPA 3CQYA 3UB5A 2KQ2A 3I55N 4EZ6A 2YC1C 1PTXA 3TAQA 4W5OA 4O0IA 3OBWA 4DR7K 3AVGA 3O9TA 4H0XB 1A5WA 1GPTA 2P9NB 4YOTA 1X9JA 4KH6A 1VQ9N 4BE0A 4CIFA 2HNZA 4CHZA 4AEIA 1EETA 4K0KK 1BISA 4FJXA 4BRMA 3MN5A 4BRKA 3TAGA 2OA8A 4YNQA 4N5SA 1BUPA 4Z4CA 2YHYA 4OPJA 4BRIA 4FJMA 3CJ1A 2HHUA 1WAJA 4NCGA 3UIQA 4IXCA 5CE3A 4GY2B 1HJOA 3E66A 1CN2A 3DMJA 4CIEA 4GV3A 4BDYA 1VAZA 4WQ5A 4Y0WA 1PX9A 3CG7A 3NVKA 4UADE 1DJTA 1N32K 1I6FA 1NJWA 3GBTA 3DLHA 4LF7K 4DR6K 1VNAA 2QM1A 3FZKA 3KOYA 2HBMA 4CEFA 2O8FA 5C15A 1FH3A 2GBZA 4DV0K 4HUFA 5A2QO 5E26A 2CGLA 4R79A 4BC3A 1EX4A 1VRUA 2VWBA 3DRSA 4GV6A 3PLAA 3U3GA 2AJQA 4FWKA 1BU6O 1WOQA 3BUZB 4DV1K 1S22A 2ZGYA 4CERA 3C6UA 3V9UA 4J8FA 3ZSOA 2FSNA 2O8CB 2F9TA 3GOIA 4IJAA 2QW9A 3DXKA 4ILGB 5DM7L 3SUQA 1RDAA 5IT9O 4GMJB 3OY9A 2Q0RA 2YNIA 4A2AA 1JLAA 1WBBA 4CEQA 1QZ5A 5BR8K 1UAXA 5ELZA 5AQJA 4M45A 1YJNN 3DLKA 5JS2A 4IZ9A 3SAHA 3ZSRA 4BE2A 3ZT3A 5F2RA 4DSEA 3LZIA 3SZ2A 3SUNA 4CK1A 4JKBA 4BC4A 1I2UA 3QEVA 3J8AA 2OTJN 4E7IA 2E1ZA 3AARA 1WT7A 2P9SB 5KPRA 4FLUA 3TARA 2E1YA 2GWJA 3WXMB 1QHTA 3QERA 4H5TA 3LM9A 2E6LA 1HJRA 2VYPA 1XQSC 3UKRA 3ID8A 4Z0UA 4CZIA 2IOCA 2WONA 1ATNA 1WMTA 3L56A 3J81O 3CM5A 1CLQA 1TKDA 2ASMA 3KHWA 1XMQK 4V19S 5EX5A 2O8BB 3LDQA 2G8VA 4JRPA 1OMYA 1ZU3A 1GLFO 3CCJN 2VY6A 1C0GA 4I2PA 5C12A 4FM2A 1L4VA 5MLCQ 1C55A 3TTFA 1NGFA 1GLLO 1E3MA 2KJAA 3L8BA 4MFBA 3A0IX 3LM2A 3SNNA 3MEGA 2B68A 2GELA 1X9WA 4K25A 3JAMO 2Q97A 3O4QA 5M1FA 1VQ6N 3NE6A 4JAXA 4LF9K 3PO4A 3J7AP 4BQLA 2IAJA 3D0PA 1V4SA 3DRRA 1CXUA 4JKEA 2PY5A 4JKFA 2WFBA 3S3MA 3OYJA 2P9LA 1A5XA 4FWPA 4FZXC 3RWUA 5JLFA 1IKYA 4AM6A 1REVA 3MX2A 3D2EB 3OS2A 5LMUK 1SKSA 3UE5A 4KHUA 4I9QA 2E0HA 3CCRN 3SK3A 3HVTA 4PKHA 5I9EB 2XO7A 2VWKA 4R5PA 4GVMA 3E1YA 1RCHA 1ZXOA 4CFDA 3EYZA 3SQ1A 5BRDA 4RG8A 1T7EA 4IEEA 3VOVA 4KHNA 1WSFA 1KAZA 3IMXA 4A57A 4W5RA 1NK9A 3MCAB 2HHHK 3MK6A 4A5AA 3EEQA 4NCAA 1GLBG 4DQQA 1VQNN 4KHYA 5AZIA 3SYZA 5AQPA 3U9ZA 1WBDA 3TU5A 1ZC6A 4MLEA 4X62K 1TGOA 3THYA 1QSLA 3FZLA 4JI1K 2OPSA 4KH4A 4X66K 4W5NA 2MN5A 1IKWA 1ZVEA 4CZMA 2A6AA 4BRGA 4OGEA 1J5OA 3DXKB 3OYHA 4LF4K 4DFMA 1YVNA 3QINA 1POIA 3QEWA 4FJHA 1U2VB 4BEBA 1VQKN 3EZ5A 3NGYA 4DUYK 2K35A 1S3XA 3H1VX 3KKSA 4IO8A 2FBVA 2YNGA 3SV4A 1BCMA 1NGBA 4CHNA 4O5FA 3QEXA 3T7ZA 3LZJA 3CC4N 4JHDA 3LAKA 3KC6A 1P8ZA 3L2WA 1T7PA 3MDQA 1KVAA 4NLBA 3WQTA 1JXBA 3CC2N 4BR2A 3CMEN 3THXB 4DTSA 2D5RA 4CJ5A 4N76A 5C10A 4FWSA 3R6MA 4FWMA 4H8KA 4IJNA 4IKFA 3AO4A 5CZ2A 3KD5E 3HT3A 4CK3A 3E9PA 4H0YB 3CCQN 1ZBHA 5AQWA 2G8WA 1BRZA 5CYMA 4F4KA 2Z1HA 2YCHA 1VSEA 3QFUA 2YJFA 1LWCA 4H0TB 2HMPA 4CI6A 1JCGA 3RMBA 4ID5A 4WQ4C 1WSJA 4DWIA 4CJPA 1EXQA 1KXPA 3AVHA 4YORA 1SN4A 3ULEB 3BGRA 4CFBA 3EY1A 4ISEA 3MN6A 3JS6A 4DFKA 3CETA 3TWHA 5KGWA 1GLJO 2D0CA 4HCBA 4AAZA 3M8SA 1ASVA 1WWNA 3J7YP 3THXA 4M3XA 1RTJA 4JKCA 1DQ7A 3C0BA 5CY0A 4FOEA 4HHFA 5M1PA 2OANA 4BRLA 1N8RO 4KB1A 1XNQK 5EVZA 4H03B 1U48A 1Z05A 1NGHA 2QI2A 3IDHA 2E2QA 1YJ9N 3K57A 4AHTA 1NG9A 2HNYA 1X3NA 4UAEF 4A59A 2NRXA 2P5GA 4C8NA 3T19A 1TUUA 4CE9A 1JLEA 4O8KA 3A2FA 3C6HA 4GVEA 1SKWA 1S6PA 1X9SA 3FE1A 1JLBA 1NK4A 5J2NA 3V9SA 4EHTA 1Q9XA 3V81A 4JI5K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3UKR B;  3CYM A;  3AA3 A;  4OKK A;  2YIP A;  3CQY A;  3UB5 A;  2KQ2 A;  3I55 N;  4EZ6 A;  2YC1 C;  1PTX A;  3TAQ A;  4W5O A;  4O0I A;  3OBW A;  4DR7 K;  3AVG A;  3O9T A;  4H0X B;  1A5W A;  1GPT A;  2P9N B;  4YOT A;  1X9J A;  4KH6 A;  1VQ9 N;  4BE0 A;  4CIF A;  2HNZ A;  4CHZ A;  4AEI A;  1EET A;  4K0K K;  1BIS A;  4FJX A;  4BRM A;  3MN5 A;  4BRK A;  3TAG A;  2OA8 A;  4YNQ A;  4N5S A;  1BUP A;  4Z4C A;  2YHY A;  4OPJ A;  4BRI A;  4FJM A;  3CJ1 A;  2HHU A;  1WAJ A;  4NCG A;  3UIQ A;  4IXC A;  5CE3 A;  4GY2 B;  1HJO A;  3E66 A;  1CN2 A;  3DMJ A;  4CIE A;  4GV3 A;  4BDY A;  1VAZ A;  4WQ5 A;  4Y0W A;  1PX9 A;  3CG7 A;  3NVK A;  4UAD E;  1DJT A;  1N32 K;  1I6F A;  1NJW A;  3GBT A;  3DLH A;  4LF7 K;  4DR6 K;  1VNA A;  2QM1 A;  3FZK A;  3KOY A;  2HBM A;  4CEF A;  2O8F A;  5C15 A;  1FH3 A;  2GBZ A;  4DV0 K;  4HUF A;  5A2Q O;  5E26 A;  2CGL A;  4R79 A;  4BC3 A;  1EX4 A;  1VRU A;  2VWB A;  3DRS A;  4GV6 A;  3PLA A;  3U3G A;  2AJQ A;  4FWK A;  1BU6 O;  1WOQ A;  3BUZ B;  4DV1 K;  1S22 A;  2ZGY A;  4CER A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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