3GDQA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1-like atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
376
Chain Sequence
GIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1-like
total genus 122
structure length 376
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gdqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gdqA04
2A40A 3ATVA 5ADXA 5LJWA 5BR9A 1NGEA 2Q36A 2Q97A 3JS6A 4J8FA 5JMVA 3WEEB 3WXJA 1TUUA 4JD2B 3VPZA 1MDUB 2CH6A 3CJCA 4QS8A 1JCFA 5AQGA 4FWNA 5JLFA 3WXLA 2E1YA 1D4XA 1KAZA 1NMDA 2KHOA 2V52B 4ISFA 4BR4A 2CGLA 1QZ6A 4BRDA 3M1FA 5FPEA 2Q31A 3EZWA 4BR2A 4FOIA 1S3XA 5AQXA 1ATRA 1BO5O 2YJFA 3U9ZA 4CZKA 3I33A 4FL9A 4H0PA 3ZETA 1TYQA 3P4IA 5AQPA 4FWRA 2ZGYA 2HOEA 3VF4A 1NGFA 3HZ6A 5B8HA 1X9JA 3ZEUA 2P9IA 3WQUA 5FPMA 4BQZA 3C7NA 4QS7A 4FWLA 4BG8A 4CI6A 5FPNA 2CGKA 4Y0WA 3IDHA 5AQRA 3AY9A 1GLAG 1NWKA 2V7YA 3BF3A 3HTVA 3FE1A 1K8KA 2Q1NA 5KPRA 4B1XB 4Z94A 2I7NA 3W0LA 1Y64A 1U6ZA 3LDQA 2QWQA 3B8AX 1HKBA 1NLVA 4BRKA 1RDWX 1U2VA 4FWMA 3UKRA 1KXPA 3L4IA 4BGBA 3VF6A 3BEXA 1DGKN 4BRFA 3CJ1A 5AQKA 4DB3A 4WQ5A 1C0GA 3GL1A 2FXUA 2FSKA 4BQLA 2ASOA 2F9WA 3AAQA 3LDOA 1BOTO 4JN4A 1NGCA 2W41A 3A0IX 5ELZA 1HKGA 4BRLA 1WOQA 5AZIB 4AM6A 5AQVA 2P9UB 5AFUA 3A8YA 3CERA 4EAHD 3VGLA 3FZHA 2QWPA 1H1VA 3SK3A 4HTLA 1BDGA 2E20A 1HX1A 3RSEB 1JCGA 4B1VA 3UKUA 4F9OA 3GOIA 2YI1A 3DXKB 4LC9B 4I6MB 3O08A 1BA1A 4BG9A 2D0PA 3F9MA 3CIPA 3ZX2A 2V7ZA 2A6AA 3GDQA 3DXMB 3IUCA 1NGGA 5BPLA 2CGJA 3SMSA 3OHRA 4BC5A 1GLFO 2QWRA 4CZHA 5EVZA 3LL3A 4XH1A 3ZX3A 5KPTA 5EY4A 2FF3B 4K25A 3CQXA 3HM8A 3SJHA 2FSNA 3M6GA 1ESVA 4BRIA 5TKYA 5AZJA 2EWSA 4PL8A 1NBWA 4BR9A 4PKIA 5AR0A 2P9LA 4CZMA 4FWKA 2QW9A 2E2NA 1BA0A 1GLJO 4BRPA 5AQQA 4NB4A 4WQ4C 4H0OA 5BN9A 3CJBA 4WQ4A 5AQOA 2QM1A 4ISGA 3L6QA 3KZBA 3VEOA 4IZ9A 3G25A 2QXLA 3ZX0A 4B1WB 2E8AA 4BRQA 3IFRA 4L3QA 2FLOA 3MN7A 3U8XA 3A5LC 2PAVA 4A2BA 3VGKA 1CZAN 3EN9A 3LM9A 4IJNA 3VEZA 1TUYA 3CJ7A 5EOYA 4RWTA 1GLDG 4FWQA 4BVOA 3IMXA 1E4FT 3D2EA 2E2QA 3VF2A 5AQNA 1ZBSA 3KVGA 4B1ZA 2CH5A 3H46O 3ULEA 2P9NB 2D4WA 3DAWA 4EHUA 2E1ZA 1HJOA 1GLCG 4HWIA 3L0QA 2J4RA 5F1XA 3CQYA 5BRHA 3R9PA 2HF4A 3H6EA 3QBXA 3S41A 4BRHA 4MO4A 2QWOA 3VENA 3FZLA 5AZJB 3D2FA 1YAGA 1T6CA 2NZTA 4FPBA 4RTFD 3GG4A 1ATSA 5LY3A 3O80A 4BC4A 3O4WA 5BRDA 5AQZA 1LCUA 1MA9B 2NRHA 4IXCA 1YUWA 3TU5A 4NO7A 1GLLO 3EO3A 4CJ7A 3LDPA 3VERA 1T44A 4IJAA 5E84A 2P9PA 3H45C 4DCHA 1ATNA 4CZIA 1BUPA 4CBXA 3MMVA 2I7PA 3MK6A 2P9KA 2VYPA 3MCPA 5AQFA 1T6DA 1XC3A 1Z6RA 4BGAA 1MWMA 3ULEB 2D0OA 2F9TA 3LDNA 2ASMA 3VETA 4H5WA 5BPNA 2QWMA 4H0YB 2PBDA 2FSJA 3MN9A 1MWKA 3O1BA 5AQWA 1GLEG 3AARA 4JHDA 3U4LA 3ZETB 1TYQB 1BU6O 1X3MA 3ZEUB 2GELA 2P9IB 3FR0A 2HF3A 1SAZA 3C7NB 4BRCA 3FGUA 4IO8A 4BRAA 2YHYA 4AM7A 1K8KB 2GWKA 1HLUA 1Q18A 4E1JA 5JICA 4CBUA 2H3GX 1NGJA 3BUZB 3A5MC 1U2VB 4GY2B 3UKRB 1P8ZA 3H3NO 1V4SA 1SQKA 4WYBA 3WEEA 4M7XA 1J6ZA 1G99A 2BTFA 5E26A 3GE1A 2ZGZA 3JXUA 4JD2A 1GLBG 1OKJA 1X3NA 3EKSA 4K43A 3WXKA 3CJ9A 2VCPA 2DPNA 4M7YA 2E88A 3HSCA 2P9SA 1QHAA 3H1VX 4B9QA 3GBTA 4H0XB 4H0TB 5KQ8A 4M63C 1ZXOA 1XUPO 5I9EB 5KQDA 3M3ZA 2UYTA 3O1WA 4KBOA 4FOEA 3DWLA 2FF6A 2W40A 4XH5A 3UKUB 4FWPA 2E2PA 1NGDA 3D7EO 1R59O 1QQOA 2IVPA 5JLHA 4H5TA 1E4GT 3BF1A 3FFKB 3UE5A 4RCHA 4H5VA 4CD1A 3QICA 1BWFO 1KAYA 2Q0UA 4CZJA 1NGBA 1NGIA 5BRFA 5AQTA 1RFQA 2AP1A 4BC2A 4PL7A 2D1KA 1DEJA 2VWBA 1QZ5A 2GTDA 2V51B 1DKGD 1NM1A 3VEXA 5BREA 4BRNA 3CI5A 5AQLA 3H3OB 3SMPA 1LOTB 1IJJA 5AQMA 4BR7A 4FSVA 1JCEA 5BPMA 3W3DA 2AA4A 5EX5A 4EFHA 3HI0A 5ADXH 3MDQA 4DQ8A 5EXWA 5AQIA 3O5BA 3FZMA 3AAPA 1IG8A 2P9SB 3VOVA 1QQNA 4BRMA 4ISEA 3DJCA 2HMPA 2NLXA 4EHTA 2P9LB 3MN5A 4PKGA 3QDKA 2ZF5O 5AZIA 2ZWHA 4MLEA 4BROA 4A61A 3HBTA 2P9UA 4O5FA 4YDUC 5AQSA 4B1UB 3FZKA 3O6WA 4YDUA 4JAXA 3RSEA 3A5OC 3QFPA 3QMLA 4H0VB 3ID8A 4FWOA 3VESA 4EIAA 1YXQA 3DXKA 3VEYA 4I6MA 3ENHA 3ATUA 2ITMA 4CBWA 4K42A 4BR0A 2YJEA 2YHXA 3EL2A 3D2EB 5LJVA 1KAXA 3FZFA 3DXMA 2IIRA 2OANA 2GWJA 4H5RA 3QBWA 4FWSA 3TPQA 4FPAA 2A42A 2QWNA 4PKHA 1SZ2A 4CZGA 5AQHA 4WQ5C 3FLCO 4CZLA 4B1YB 5CE3A 2A41A 3EKUA 3LM2A 3WQTA 3D2FB 4A62A 3QFUA 4K41A 2Q0RA 3A5NC 3R6MA 2Q2RA 2GUPA 3VEVA 4DHYA 4H03B 4CD3A 5F0XA 3MN6A 1NGHA 2GEMA 1QQMA 4QS9A 4XEIA 2QWLA 5KPZA 3CJAA 1BG3A 5AQJA 4MO5A 4JNEA 1XQSC 4CZFA 4CZEA 4A2AA 1NGAA 5AFUH 3U9DA 3LDLA 5BN8A 2P9PB 3O8MA 4BVPA 3SLCA 4IWVA 5AQYA 2YCHA 2IVOA 4BREA 1EQYA 3WXIA 1HPMA 1YVNA 3C0BA 2IVNA 2P9KB 2YHWA 1ZC6A 1V4TA 5AQUA 3CHWA 3R8EA 3VEWA 5F2RA 1Z05A 3ENOA 4BRGA 2BUPA 3VGMA 1HUXA 4BC3A 1RGIA 2P9NA 5FPDA 2E2OA 4JHDB 4C23A 3J8AA 4MLHA 3QB0A 2ASPA 4GNIA 4FO0A 2A3ZA 4H5NA 4BR5A 1WUAA 3CETA 2A5XA 3I8BA 4XH4A 3BP8A 1HKCA 3WT0A 1C0FA 3WUHA 3H1QA 4O8KA 3KHYA 2WUSA 3UB5A 1S22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LAVA 5M1FA 4CHPA 4J2DA 3M8SA 4LF8K 4CEZA 5BR9A 2KGQA 1LWEA 3JS6A 5JMVA 1VK0A 2HHQA 4KHSA 3WXJA 1TUUA 3OS0A 5JS2A 3CMAN 4QS8A 3CCMN 1YJ9N 4DWIA 1NG9A 5JLFA 1CN2A 1NMDA 2I5JA 2KHOA 4BR4A 4DFJA 2CGLA 1HYZA 4ID5A 5CZ1A 4JRQA 5FPEA 2Q31A 3EZWA 4BR2A 4FOIA 4KI4A 1ATRA 1BO5O 2YJFA 4CZKA 3I33A 2PYLA 4FWRA 2ZGYA 4FM2A 2HOEA 1T0ZA 5B8HA 3ZEUA 1UGLA 3C7NA 4QS7A 4CI6A 2QKKA 5FPNA 5KGWA 3IDHA 4JI0K 5AQRA 3AY9A 4B1XB 4RG8A 4Z94A 1IG9A 3W0LA 1Y64A 1U6ZA 4JI7K 3B8AX 4DR6K 1NLVA 4IOXA 4BRKA 4O55A 3VQ5A 1U2VA 5CY4A 4CQKA 4NXMK 3CJ1A 2UUAK 4JV5K 2ZJRL 3OYHA 3GL1A 1X9SA 4BQLA 4JYAK 3A2FA 2LT8A 3WNFA 4KV8A 4JKGA 1NGCA 2W41A 3A0IX 4CEDA 4GW6A 1WT7A 4FJ9A 1X1PA 5AQVA 4HE7A 3HOTA 3CERA 5JS1A 4EAHD 1HYSA 3FZHA 1H1VA 4ZTJA 1S6PA 4CW7B 5M1NA 5HLFA 2VWJA 4GKKK 4B1VA 4BE0A 2FBVA 4LF5K 3ZSXA 2YI1A 1Q9XA 4OPKA 3OYDA 4I6MB 3ZX2A 1JLCA 3C94A 3AVAA 3GDQA 4CJTA 2KFZA 4DTMA 3BGRA 1NU0A 1UA1A 4OPHA 5CY0A 1JLFA 3DOKA 3QERA 1GLFO 2C1GA 4CZHA 4XH1A 4YHHK 2SN3A 2JDQD 2P51A 3VQ8A 3B6OA 3CQXA 3SJHA 3M6GA 1RT1A 4BRIA 3CFOA 5AZJA 2WONA 4GV6A 2ZJQL 1HYVA 2EWSA 1OH5A 3THWB 3OW2M 4BEBA 4PKIA 4LH4A 1BA0A 4BRPA 3LP2A 1KCFA 3DLHA 1NKBA 2QM1A 4KH6A 4CHNA 1FW6A 2PYJA 1ZUTA 4CK3A 4CFDA 3IG1A 1Q9YA 1LWFA 4L3QA 3CYMA 4O0JA 3EYZA 4WFNL 3JAMO 2FLOA 1PX9A 3A5LC 1BISA 1BMRA 2BE2A 3VEZA 5EOYA 2D56A 4RWTA 1GLDG 2F8TA 2PFUA 2E2QA 4GVMA 2O4GA 3ALYA 4RW4A 1QVGM 3I0SA 3EE8A 2XO7A 2VQFK 4HWIA 1YVUA 4JLHA 2J4RA 3EE9A 4MDBA 3SYZA 1IKXA 4E1MA 3K5OA 1YJNN 1RBUA 3H6EA 3ITHA 1GPTA 1VSEA 3RRHA 4RW7A 4MO4A 4DTOA 1VAZA 3VENA 1VQ9N 4WE1A 4L8RB 4OKEA 3QETA 4A5BA 2NZTA 4FPBA 1BHLA 1ATSA 3O80A 5K14A 4PA1A 1OZZA 1MA9B 1ZBHA 3SQ4A 2YHAA 4IXCA 4NO7A 4YOTA 1JXBA 3PIOL 4DUZK 3ENBA 2NNWA 1T44A 5DMRA 5E84A 4ILGB 2G8FA 2ETJA 2IDOA 3WXMB 5SZTA 3V9ZA 4Z4GA 1PE4A 1EP4A 5J2PA 2P9KA 1T6DA 1Z6RA 5TKWA 1MWMA 3VQ6A 3ULEB 2D0OA 1WSHA 4OGEA 4CJLA 4H0YB 3HM9A 2YBRC 3T7ZA 4DFPA 4BECA 3AA4A 1D5AA 5AQWA 2Z1IA 1YJWN 3AARA 3U4LA 3ZETB 1X3MA 3NGYA 3DM2A 5JVGL 1J9AA 1I39A 4MFBA 1BGXT 2GELA 2P9IB 4DU1A 3PX0A 3FR0A 3AV9A 4C8OA 2B3CA 3QNNA 4BRAA 2YHYA 5C15A 4DTPA 1SKRA 3MWTA 1REVA 4AM7A 1JL2A 3NF7A 3KLHA 1HLUA 1Q18A 4LFCK 1LQIA 4E1JA 1NNEA 2H3GX 5M1QA 1TKTA 3BUZB 1ASUA 1D9DA 5AJ3K 1SL1A 1SUQA 3MXIA 1V4SA 4DUYK 4YOYA 3H08A 3F2KA 3HXMA 4WYBA 1S9EA 4CGDA 3WEEA 1J6ZA 4CHQA 1UAXA 4FJXA 2BTFA 4JD2A 1VQMN 1OKJA 5HBMA 3EKSA 4K43A 3KLEA 1A5VA 4CECA 3SQ1A 1VSKA 3HSCA 2P9SA 4B9LA 3GBTA 4H0XB 1TVRA 4DFKA 4M63C 3CCJN 1VSDA 4JEPA 4DS5A 4HVJA 1NH5A 3O1WA 4FOEA 4M3TA 3DWLA 2W40A 5JVHL 4JI8K 5GIPA 3F73A 2O8BB 3KLIA 1RDAA 2RN2A 3I8DA 4G9ZA 2VG5A 3FFKB 3UE5A 3WNGA 4RCHA 3FFIA 2HHSA 3CC2N 1RFQA 2LY5A 4A57A 2I61A 3G6EN 1YI2N 1KRPA 3BDPA 4BE1A 1NPIA 2M8BB 3CW4A 1JJ2M 3ZT0A 2VWBA 1Y97A 1CXUA 1CXQA 2V51B 2RHKA 3OYJA 4BRNA 5AQLA 3OYFA 3HL8A 2O8CA 3M8QA 3O3FA 4EFHA 5ADXH 2ZJPL 4AAZA 5C10A 1NJYA 1SN1A 4OPAA 2NLXA 4DU3A 1XHXA 5CR4A 3AVIA 4PKGA 3QDKA 4Z4IA 3S9HA 3LP1A 3VTHA 4FLVA 4E7IA 2P9UA 4ILJA 3KP0A 1JKZA 2HHXA 4M3UA 3O6WA 2G8IA 1C0UA 3RSEA 4CJSA 3QFPA 3VESA 4EIAA 4BWJA 1T7EA 2FBXA 3VEYA 4CBWA 2ITMA 5HP1A 4IFEA 4K42A 4BR0A 2X78A 2YHXA 3EL2A 4IFYA 3S3NA 1KAXA 3L2VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LAV A;  5M1F A;  4CHP A;  4J2D A;  3M8S A;  4LF8 K;  4CEZ A;  5BR9 A;  2KGQ A;  1LWE A;  3JS6 A;  5JMV A;  1VK0 A;  2HHQ A;  4KHS A;  3WXJ A;  1TUU A;  3OS0 A;  5JS2 A;  3CMA N;  4QS8 A;  3CCM N;  1YJ9 N;  4DWI A;  1NG9 A;  5JLF A;  1CN2 A;  1NMD A;  2I5J A;  2KHO A;  4BR4 A;  4DFJ A;  2CGL A;  1HYZ A;  4ID5 A;  5CZ1 A;  4JRQ A;  5FPE A;  2Q31 A;  3EZW A;  4BR2 A;  4FOI A;  4KI4 A;  1ATR A;  1BO5 O;  2YJF A;  4CZK A;  3I33 A;  2PYL A;  4FWR A;  2ZGY A;  4FM2 A;  2HOE A;  1T0Z A;  5B8H A;  3ZEU A;  1UGL A;  3C7N A;  4QS7 A;  4CI6 A;  2QKK A;  5FPN A;  5KGW A;  3IDH A;  4JI0 K;  5AQR A;  3AY9 A;  4B1X B;  4RG8 A;  4Z94 A;  1IG9 A;  3W0L A;  1Y64 A;  1U6Z A;  4JI7 K;  3B8A X;  4DR6 K;  1NLV A;  4IOX A;  4BRK A;  4O55 A;  3VQ5 A;  1U2V A;  5CY4 A;  4CQK A;  4NXM K;  3CJ1 A;  2UUA K;  4JV5 K;  2ZJR L;  3OYH A;  3GL1 A;  1X9S A;  4BQL A;  4JYA K;  3A2F A;  2LT8 A;  3WNF A;  4KV8 A;  4JKG A;  1NGC A;  2W41 A;  3A0I X;  4CED A;  4GW6 A;  1WT7 A;  4FJ9 A;  1X1P A;  5AQV A;  4HE7 A;  3HOT A;  3CER A; 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