3GDQA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1-like atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
376
Chain Sequence
GIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1-like
total genus 122
structure length 376
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gdqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gdqA04
4RCHA 4BVOA 4EFHA 4DHYA 4IO8A 4H5VA 1BWFO 5EVZA 1YXQA 3FE1A 1NM1A 3F9MA 1NGIA 3UKUA 3WQTA 1NGFA 4WQ5A 4JHDB 5LY3A 4H5RA 3FZLA 4M7XA 2QWNA 3MN5A 1Y64A 2CH5A 1GLJO 2P9SB 4BR2A 4FWKA 4CD1A 3GG4A 4CZFA 1DGKN 3CJ9A 3QB0A 3ENHA 4FWPA 1XQSC 4O8KA 1K8KB 3L6QA 5AQUA 2P9KB 3VENA 2AP1A 2UYTA 3KHYA 2W40A 1BDGA 4FWSA 1YUWA 5KPRA 2Q31A 2QWLA 1RFQA 3CJ1A 3OHRA 3D7EO 2P9IB 3B8AX 4BRLA 5BREA 2P9NB 4PL8A 2OANA 2Q1NA 2ZGZA 4BRMA 5F1XA 4H0YB 1DKGD 3CJ7A 5AQSA 2HF4A 1NBWA 3EKSA 3ULEB 2QWQA 5TKYA 1WOQA 3AAQA 1QQMA 3CIPA 1P8ZA 3EL2A 4AM6A 4DCHA 2E2QA 3M3ZA 4FWNA 3DXKA 3H46O 4BVPA 1C0FA 1H1VA 4PL7A 4FL9A 1U2VA 3AY9A 4C23A 4H5WA 5I9EB 3BUZB 3IFRA 1BUPA 2FLOA 2PAVA 3QBXA 4FWRA 5E84A 4QS7A 1MWMA 5AQFA 4BRCA 2D0OA 4BGBA 1C0GA 1KXPA 3EN9A 3VEVA 1E4FT 3U8XA 3C7NB 1NGGA 1HX1A 1BA1A 3LL3A 5AQTA 5JLFA 4CZLA 3L0QA 2HOEA 1TUUA 4L3QA 3WEEB 5AQLA 2V7ZA 4B1UB 1NMDA 2J4RA 4BR9A 1NGDA 3LDOA 1NLVA 3AAPA 3VGMA 3MCPA 1GLBG 4I6MA 4K42A 4FO0A 1GLDG 3JS6A 3EKUA 4B1VA 4DQ8A 5AQMA 2Q97A 3FZKA 1MDUB 4H0VB 4A62A 4J8FA 5BR9A 4EHTA 1D4XA 2ZGYA 5E26A 4IJAA 3EZWA 4H5TA 4XH4A 3DXKB 3HM8A 5BPMA 3HSCA 3D2FA 4CZJA 1HPMA 2I7NA 2VCPA 2CH6A 3FZHA 4WQ4C 4BQZA 2FSJA 2QXLA 2E1ZA 3VEZA 3WXJA 3MN9A 2AA4A 5BN9A 4Y0WA 5BPLA 5AZIA 1ZBSA 2P9NA 3VF6A 4FWOA 2P9IA 3MMVA 3QDKA 2QM1A 2NRHA 3GOIA 2QWPA 5AQKA 5EX5A 3WXIA 4CBWA 4KBOA 4CZKA 1GLFO 1DEJA 3ATVA 1K8KA 2D0PA 2FSKA 3G25A 1TYQA 3WUHA 4BRAA 4H0PA 4CI6A 4XEIA 5FPMA 1X9JA 3ZEUA 4BR0A 1GLAG 3CQXA 3QMLA 2E2PA 4BRDA 1BA0A 5AQWA 3O1WA 2V7YA 3QBWA 3ZX2A 2BUPA 1BOTO 4O5FA 1RDWX 2A5XA 5AR0A 2QWMA 1Z05A 3ZETA 3BEXA 4FPBA 4YDUA 3KZBA 2I7PA 1KAXA 4CZHA 4Z94A 4BR7A 2BTFA 3A0IX 1IJJA 1X3MA 2ASPA 3A5NC 2YCHA 4QS8A 4PKHA 5FPDA 5ADXH 3VERA 4I6MB 1HKBA 4FOIA 3U9ZA 4AM7A 3A8YA 3VOVA 2GUPA 2ZF5O 3H6EA 2A3ZA 1GLCG 3ZX3A 5KPTA 2YJFA 1LOTB 4BROA 3R9PA 1E4GT 4FPAA 3CERA 5KQ8A 4BR4A 3D2EB 2YJEA 4JN4A 4JHDA 4BG9A 1MA9B 3S41A 5JICA 1MWKA 2Q0RA 2QWOA 1EQYA 5EY4A 4WQ5C 1V4TA 1JCFA 4CJ7A 4ISEA 5BRDA 3D2FB 3CI5A 3CJAA 5LJVA 4MLEA 4A61A 1G99A 1YAGA 5AQYA 3VETA 4FWMA 3KVGA 2E8AA 3GBTA 1KAZA 1ZC6A 2Q36A 4PKGA 3ID8A 4IJNA 2V52B 5AQVA 4E1JA 4BRKA 1HKCA 3IUCA 3VGKA 2E2OA 3BP8A 5ELZA 2FF6A 1NGCA 4B1YB 1OKJA 3D2EA 4JAXA 5AQZA 3R6MA 5B8HA 3UKRA 5CE3A 4QS9A 3DJCA 4CZIA 4H03B 2VYPA 1SAZA 2HF3A 5F2RA 4H0XB 1HUXA 3C7NA 1JCGA 2GWJA 4BRFA 3JXUA 4MLHA 5AQQA 2VWBA 5JLHA 2KHOA 5AQHA 4IWVA 3W3DA 2P9UB 3VEXA 4B1XB 4ISFA 4YDUC 4H5NA 5AQOA 4LC9B 4B1WB 3O5BA 5BRHA 2E2NA 4EAHD 3VEYA 1T6CA 5JMVA 3SMPA 4RWTA 1NGBA 1T6DA 2D4WA 5AFUH 3L4IA 4H0OA 3GL1A 4BC2A 1Q18A 1SZ2A 1BG3A 1JCEA 1WUAA 2A6AA 2FXUA 3UKUB 3ZETB 3EO3A 3O6WA 2Q2RA 4IZ9A 1ZXOA 2CGKA 4JD2B 2H3GX 3SJHA 2DPNA 1KAYA 4M7YA 3QICA 4A2AA 3GDQA 2Q0UA 2A41A 5BPNA 4ISGA 5AQGA 1GLEG 4EIAA 3ZEUB 2E20A 1J6ZA 3RSEA 3DXMA 3WXLA 1NGHA 4RTFD 3W0LA 4BRHA 4K43A 1QQOA 5KPZA 1TUYA 2P9UA 2GWKA 3FR0A 4WYBA 5AZJA 4PKIA 3H1QA 3HZ6A 3UE5A 4FWQA 5LJWA 1S22A 2P9LB 1Z6RA 2NLXA 4BRNA 4BC3A 5AZIB 2F9TA 1XUPO 4CZGA 3HBTA 3AARA 3VGLA 2P9LA 1QQNA 4BGAA 3R8EA 4WQ4A 4FOEA 3QFUA 4XH5A 1GLLO 4HTLA 1BO5O 3LM9A 2FSNA 3O08A 3SMSA 1ATNA 4BRGA 4CZEA 2E88A 3O80A 4IXCA 3FZMA 3WXKA 2YHYA 1R59O 2F9WA 3FFKB 3HI0A 3VF4A 1U2VB 4JNEA 3CHWA 3MDQA 1YVNA 4MO5A 3VESA 3M6GA 3MK6A 3CQYA 1ATSA 1NGEA 5ADXA 3FZFA 3ULEA 2P9PA 2GTDA 2ZWHA 4BRIA 2HMPA 3A5OC 2IIRA 3MN7A 4B1ZA 1RGIA 3O1BA 3U9DA 4BG8A 3A5LC 1T44A 1NGJA 3I8BA 2IVPA 2D1KA 2YHWA 3TPQA 3IMXA 1HKGA 1V4SA 4CBXA 3CJCA 2E1YA 3CJBA 2FF3B 2NZTA 2IVNA 2ASOA 1ATRA 3ATUA 1HJOA 5FPNA 3SK3A 1BU6O 2ASMA 3IDHA 5AZJB 3H3NO 1S3XA 5AQXA 2WUSA 2P9KA 3LDLA 3MN6A 3ZX0A 5AQNA 3DXMB 1ESVA 3RSEB 3VEOA 2A40A 3DWLA 4BRPA 4K41A 4A2BA 2P9SA 4BC4A 4HWIA 3SLCA 2W41A 2V51B 5AFUA 3CETA 4K25A 3QFPA 2CGJA 2GEMA 1LCUA 2YHXA 3FLCO 3H1VX 3U4LA 3LDNA 5BRFA 1NWKA 2A42A 3LM2A 2P9PB 1U6ZA 3A5MC 4JD2A 3BF1A 5AQJA 5BN8A 3I33A 3ENOA 1QZ6A 3O4WA 3VEWA 2IVOA 4XH1A 2QWRA 3WT0A 1QHAA 2PBDA 3DAWA 4CBUA 3WQUA 3P4IA 3LDQA 1X3NA 4H0TB 4M63C 3M1FA 1TYQB 5AQRA 4FWLA 4GY2B 2YI1A 4BR5A 3H45C 3LDPA 4EHUA 2EWSA 3H3OB 4BREA 3GE1A 5F0XA 5AQIA 3TU5A 3WEEA 4CD3A 2CGLA 1XC3A 4FSVA 4BQLA 3UKRB 4NO7A 3HTVA 3VPZA 1CZAN 3FGUA 4BC5A 4NB4A 2ITMA 1SQKA 4F9OA 5FPEA 3BF3A 3VF2A 1HLUA 5AQPA 1QZ5A 5EOYA 5KQDA 2QW9A 1NGAA 3UB5A 3C0BA 4MO4A 2GELA 5EXWA 4DB3A 3J8AA 4B9QA 1IG8A 4CZMA 4BRQA 3O8MA 4GNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K5LA 3CM5A 4ELUA 1BWFO 3SNNA 1YXQA 3FE1A 2NRRA 4E0DA 1TK5A 1RTJA 2F7TA 5LY3A 4M7XA 5TKWA 2QWNA 3MN5A 5C15A 5DMRA 4X62K 1Y64A 1RT7A 3JAMO 2ETJA 2P9SB 2YILA 4B8CA 3GG4A 3QB0A 4FWPA 4YY3K 2JDQD 2P9KB 3VENA 4QOZB 4CK3A 2UYTA 1QSYA 4WFBL 4FWSA 3AO4A 3VQAA 4CEAA 1W0HA 2P5OA 1UA1A 1KVCA 1RFQA 5AJ3K 2LJMA 3CCLN 3KK7A 2P9NB 5HROA 2OANA 1NRBA 2VWKA 5F1XA 4H0YB 2KBKA 4AH9A 5FDLA 1VNAA 1NBWA 4DTNA 3TAMA 3AAQA 3CIPA 3HOTA 1VK0A 3LAMA 5HP1A 4B9NA 2N69A 3DXKA 5GINA 3LWMA 3H46O 3SCXA 4FL9A 1U2VA 1BHLA 4C23A 2HVIA 2HHQA 4H5WA 4FCYA 4C8NA 4DV2K 5E84A 5JVGL 1PE4A 4B9TA 1HJRA 1YI2N 1MWMA 4YFUA 1C0GA 1N32K 3OYCA 4DWIA 4CJEA 3C7NB 1BA1A 5AQTA 4DS5A 5JLFA 4J2AA 2P5GA 3E01A 4CHQA 3E7UX 1NGDA 2F96A 3TABA 1NLVA 3TAPA 4E7KA 3QETA 4DKWA 3PLAA 2O8BA 4B1VA 3F5TA 3NFAA 5CHIA 4HUGA 4A62A 4H0VB 3HT3A 3PX6A 3AVHA 4H5TA 3DXKB 2F8SA 3SUPA 2OPPA 2O8BB 2BE2A 3LP3A 5HRPA 1CN2A 2E1ZA 1RT5A 4HUFA 4Y0WA 4H8KA 3MMVA 4FVMA 3TI0A 2E5LK 5K14A 2QWPA 1TV6A 5J2MA 1IH7A 4KYPA 3WXIA 3C94A 4FLTA 2E4LA 4CZKA 1FJGK 3TAGA 1B9DA 4DV1K 4M3UA 1TYQA 5EU7A 3NF7A 4CI6A 3AGRA 3QLHA 5I42A 2HMIA 2B3CA 2VY6A 4Y1DA 4E7HA 1K73O 1GLAG 4CHNA 2E2PA 3RRGA 1WSJA 1BA0A 1BCOA 5AQWA 3O1WA 2V7YA 3QNOA 3V9XA 3ZX2A 4QAGA 3L2RA 4AHRA 1RDWX 3VN5A 3DLBA 4BEBA 1S6QA 3BEXA 2YX6A 4W5QA 2VG6A 4YDUA 3KZBA 1Q82O 1W7AA 1TKDA 4JKGA 4LY7A 2G8FA 1RDUA 3OY9A 5M1NA 1XC9A 1JLFA 2ASPA 1J9AA 2YCHA 2YBRC 3R2VA 4QS8A 4FW1A 1HKBA 1PX9A 3SQ2A 1T0ZA 2NRTA 3U9ZA 2PYJA 3VOVA 1UWBA 3ZSOA 4LF6K 3ZSWA 3H6EA 1WSGA 5J2PA 4RW9A 2MN5A 4BROA 3TAQA 4FYDA 1E4GT 4CEFA 5GAHP 2W42A 2YJEA 1C56A 4NXNK 1OH6A 4JHDA 2IAJA 1MA9B 1MWKA 3C6UA 3BDPA 2HHSA 4G1QA 1VRUA 1O1WA 1JCFA 4ZHRA 3OJSA 3D2FB 5KGXA 5KRSA 1YAGA 2RHKA 4CJTA 5AQYA 2D0AA 4CESA 3KVGA 3GBTA 1ZC6A 5LMNK 4DV3K 1U45A 4K8ZA 4LF9K 1SL0A 5C0YA 3HM9A 2OCEA 1B3CA 1VQ4N 2GL1A 1QVGM 4KTQA 3NGZA 3UIQA 1E3MA 2HBMA 5AQZA 4KV8A 5CE3A 1TKTA 4DS4A 4H03B 1SAZA 1YT3A 2F4VK 1VNBA 2KPYA 1U4BA 4DR7K 1ZUTA 4E7JA 3JXUA 4MLHA 3SPZA 1F21A 3T7ZA 4IWVA 3R3LA 4LF7K 4YOUA 2HW3A 4EAHD 3BZKA 3VEYA 4KAZA 5DM6L 3SMPA 3SBGA 4RWTA 2D4WA 3CW4A 4DTXA 4H0OA 2VQEK 1Q18A 4MFBA 3HOSA 2Y1JA 3O6WA 2Q2RA 5D3GA 2CGKA 1NK6A 3R1XA 3KK1A 4BE1A 1ZFUA 2IC3A 4I2QA 5SWMA 4LF8K 2ITGA 5BPNA 4JKCA 2F8TA 2OYQA 4WF9L 4LH5A 3DLKA 1C0MA 3ZEUB 1BK8A 1QHTA 4E1MA 5MLCQ 1T03A 1VAZA 3D0PA 1NGHA 4JKHA 2UXDK 4BRHA 4K43A 3CCRN 2P9UA 4UAFE 1KVBA 3FR0A 4WYBA 3OA9A 3HZ6A 3C6TA 4JI2K 3HP9A 3UE5A 4O0JA 1Z6RA 4FLXA 4BDPA 2PYLA 4DSLA 4LF4K 4DTPA 4OPHA 3PX4A 2P9LA 4DFKA 2RN2A 3K5OA 3R8EA 4WQ4A 3QFUA 4XH5A 2IDOA 3QEVA 4HTLA 1BO5O 4W5TA 1L3SA 3LANA 4DQRA 3SMSA 4CZEA 4CHOA 3PY8A 3L2UA 5GIOA 1FKPA 3O3FA 4W5NA 1IV0A 3CHWA 1WAJA 4JK7A 3CQYA 1C55A 1HR0K 4C1NK 2UUCK 3D6RA 2QKKA 2GTDA 4GMJB 4M42A 4E19A 4YORA 4I2PA 1NGJA 5J2QA 4JI5K 3CMAN 4CBXA 4N56A 3K0SA 2E1YA 4OKKA 4DV7K 2NZTA 2ASOA 3RR8A 4FJLA 2DFFA 3ULDA 2LY5A 3AVAA 3LP1A 3I8DA 3SUNA 2P9KA 2VWJA 4B9LA 2WOMA 3LDLA 4AEIA 1ESVA 2HNYA 3VEOA 3DWLA 1U48A 4K41A 3NBPA 3KKRA 4DSEA 4K0KK 3VTIA 2V51B 1VQLN 1ZYQA 1TK0A 2NRWA 3SUOA 3QFPA 2CGJA 1NK5A 3U4LA 3LDNA 2HNZA 3VQPA 3BF1A 4HVJA 4IG0A 2JWLA 4XIUA 4KB1A 5C10A 3VEWA 1WAFA 4OPJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K5L A;  3CM5 A;  4ELU A;  1BWF O;  3SNN A;  1YXQ A;  3FE1 A;  2NRR A;  4E0D A;  1TK5 A;  1RTJ A;  2F7T A;  5LY3 A;  4M7X A;  5TKW A;  2QWN A;  3MN5 A;  5C15 A;  5DMR A;  4X62 K;  1Y64 A;  1RT7 A;  3JAM O;  2ETJ A;  2P9S B;  2YIL A;  4B8C A;  3GG4 A;  3QB0 A;  4FWP A;  4YY3 K;  2JDQ D;  2P9K B;  3VEN A;  4QOZ B;  4CK3 A;  2UYT A;  1QSY A;  4WFB L;  4FWS A;  3AO4 A;  3VQA A;  4CEA A;  1W0H A;  2P5O A;  1UA1 A;  1KVC A;  1RFQ A;  5AJ3 K;  2LJM A;  3CCL N;  3KK7 A;  2P9N B;  5HRO A;  2OAN A;  1NRB A;  2VWK A;  5F1X A;  4H0Y B;  2KBK A;  4AH9 A;  5FDL A;  1VNA A;  1NBW A;  4DTN A;  3TAM A;  3AAQ A;  3CIP A;  3HOT A;  1VK0 A;  3LAM A;  5HP1 A;  4B9N A;  2N69 A;  3DXK A;  5GIN A;  3LWM A;  3H46 O;  3SCX A;  4FL9 A;  1U2V A;  1BHL A;  4C23 A;  2HVI A;  2HHQ A;  4H5W A;  4FCY A;  4C8N A;  4DV2 K;  5E84 A;  5JVG L;  1PE4 A;  4B9T A;  1HJR A;  1YI2 N;  1MWM A;  4YFU A;  1C0G A;  1N32 K;  3OYC A;  4DWI A;  4CJE A;  3C7N B;  1BA1 A;  5AQT A;  4DS5 A;  5JLF A;  4J2A A;  2P5G A;  3E01 A;  4CHQ A;  3E7U X; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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