3GL3A

Crystal structure of a putative thiol:disulfide interchange protein dsbe from chlorobium tepidum
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
141
structure length
141
Chain Sequence
SLDKGDKAPDFALPGKTGVVKLSDKTGSVVYLDFWASWCGPCRQSFPWMNQMQAKYKAKGFQVVAVNLDAKTGDAMKFLAQVPAEFTVAFDPKGQTPRLYGVKGMPTSFLIDRNGKVLLQHVGFRPADKEALEQQILAALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a putative Thiol:disulfide interchange protein DsbE from Chlorobium tepidum
rcsb
molecule keywords Putative Thiol:disulfide interchange protein DsbE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlorobium tepidum tls
total genus 40
structure length 141
sequence length 141
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gl3A00
1UN2A 4NAXA 1EGOA 3MWHA 4TR3A 4OO5A 4MK3A 1B8XA 2H8LA 4POBA 4WEYA 2VCQA 4JEDA 1YF0A 5CO3A 4IW9A 3MDKA 2CV4A 5C04A 2MBSA 1YDKA 1YJ6A 1KTEA 2MMZA 2CVKA 4HU9A 2H66A 3W8JA 1FVKA 1YZXA 4OFNA 1HD2A 1S3CA 5C00A 2VUPA 3F3RA 4ECBA 3FZAA 3O3TA 3IAM2 5IM9A 1XWKA 5JWQB 5D73A 2DJ3A 2VLUA 4PXOA 4ML6A 1YY7A 3NIVA 2JZTA 4MF6A 5DAKB 4ZXGA 1AQXA 2C3TA 4IN0A 1RW1A 2PERA 2YJ7A 1JHBA 4L5OA 3PGTA 4MZCA 1FW1A 2MZCA 3GSTA 1G7EA 5IMFA 1Z6MA 3ZREA 5J41A 2O89A 2GZZA 4ZL7A 3FZ9A 4J57E 4EC0A 3D22A 4TXOB 2D2ZA 3U6VA 5DJMA 2P0GA 1XVQA 3HDCA 4K7NA 1HNAA 4EL1A 2B5EA 3IHQA 5J5NA 2E7PA 3TJGA 4WR4A 3MNGA 5G30A 4MLYA 3P8WA 3TGZA 3ZIVA 2WS2A 2H6XA 3V1WA 2K6VA 4KW6A 5AISA 2MMOA 4MF5A 1GSSA 2C4JA 3CRTA 1JFUA 2H75A 4PX1A 2V32A 1GLPA 1PGTA 4GQCA 3UJ1A 1ERWA 3HYPA 4OMVA 2FNOA 3FYGA 2ON5A 4X1UA 4Q5QA 3GHAA 1PL1A 3EMPA 4WBRD 1MTCA 3TJJA 3FZ4A 3CRUA 1GSQA 1R5PA 2H73A 4EVMA 4V2NA 5IQYA 2I4AA 5ECQB 2IN3A 1SK1A 4NHWA 4KX4A 4F9ZA 1GUHA 5G5EA 1X9SB 2IWTA 3DGQA 3GX0A 2A4VA 2DIYA 3H93A 4GF0A 1Z3EA 4Z7XA 1XWBA 3TKQA 4KH7A 2PMTA 3PH9A 2C3NA 5HR0A 2N5BA 3ZMKA 2IMEA 4EO3A 1OE7A 3L0HA 3L78A 1JZDA 3F6DA 3ZVJD 2HRNA 4HS1A 5G1KA 2GQLA 4NPBA 5DJLA 1ZYEA 5DCHA 1B48A 1J9BA 2IFQB 1SU9A 4K0NA 2V6KA 4F03A 4JBBA 1OKTA 2JSZA 4F82A 3LYKA 2FA8A 2C0FA 2ON7A 1DE1A 4TN8A 4K7OA 4F0BA 3BD2A 3TKRA 3VI5A 1MD4A 5IMCA 3UVTA 5D93A 5L71A 2I3YA 3HZ8A 5H5QA 2M46A 4DSQA 3GSSA 4HQZA 2DJ0A 3KMOA 2YZHA 4MA9A 5ID2B 2FWEA 1ACVA 5ECOB 5JWOB 4Q5RA 1T4ZA 2H30A 2RM5A 3ZVJA 1VGLA 4G2EA 3HD5A 3O6TA 4EDYA 2C0EA 2LV3A 4WF4A 1ERVA 2BTOT 3ZFLA 2KP1A 3GMFA 10GSA 5ECRB 4PUAA 3F4SA 3I43A 1EEJA 3ED3A 2GSQA 1TI1A 5B6MA 4ZB6A 2R5GA 3EC3A 2B7KA 3IBHA 4POMA 5FWGA 3Q19A 3CBUA 2DLXA 4HJ2A 3CMIA 1ERUA 1PX7A 2HZEA 1M7TA 4IS0A 3L9SA 2F8FA 5E4WA 19GSA 2LRTA 3TJKA 3QCPA 4Q5FA 1EV4A 1XW5A 3W8SA 1VF4A 1X0RA 1GTIA 2DSAA 4KUNA 3CSJA 2KUCA 2YV9A 2ZNMA 1F9MA 1EV9A 4BWQA 3N5OA 4IQ1A 3J7Yb 2YWIA 2V1MA 3N9JA 1ST9A 1Z9HA 2HZFA 4DSSB 2YCDA 5DBQA 1OC9B 2KHPA 5CRGA 2YJHA 5CRWA 4BVYA 3IK7A 3FRCA 3D4MA 2OE3A 2XBQA 2G0FA 4YH2A 4NHZA 1FAAA 2DJJA 2K18A 3R2QA 3CTFA 3EWLA 3UAPA 4O5RA 4QQ7A 2FA4A 2DIZA 2GSTA 2YZUA 2VL2A 3EURA 4I6XA 1XIYA 3D21A 4KCAA 1TU8A 4K0GA 2F9SA 3CSHA 3KXOA 5HFKA 4RQRA 4D73B 1JZWA 4N10A 2ZCTA 4IHUA 5DAKA 5HR3A 4TOPA 3KIJA 2FGXA 1USBA 4ML1A 1K3LA 3HVSA 3L9UA 3E3EA 1OE8A 2JZSA 2L6CA 1EP7A 2NTOA 4ZL8A 3VFIA 2E0QA 2B1KA 1NW2A 4E8EA 3G7YA 5F07A 2V41A 3IK9A 3EMXA 3KD0A 4NV5A 4ZILA 2GZPA 2MYGA 2VM2A 5ECSA 1SL2B 4TXOA 6GSVA 2GQKA 1GSDA 1TRWA 2QKEA 2DMLA 2FWFA 4DVCA 1G7OA 2HSHA 3HJPA 3KH9A 1SK0A 4JU5A 5A5KA 4XRDA 1U3AA 5ELAA 3QFAC 3KTBA 3IR4A 2AYTA 2OADA 6GSSA 2H1AA 1XW9A 3DIEA 2ALBA 1O81A 1T7PB 3BCKA 4JR4A 1XZOA 1KEBA 4JE1A 1A2LA 2J9HA 4YQVA 5DALB 5GSSA 1Z6NA 3P7XA 5GAPD 2IIYA 4ZBAA 4HUAA 3M0FA 2RIIA 3F63A 1TTZA 2H74A 18GSA 1QUWA 4ZB8A 5J9BA 2YP6A 4LLRA 4RUVA 1AXDA 5A4VA 3WGXA 1W89A 2IMFA 5HR1A 3WYWA 4XTSA 1R7HA 2L4QA 2JADA 2H70A 2Z9SA 1M2AA 3WGEA 3CXGA 1TRVA 4G19A 3QAVA 1E6BA 1GNWA 3D6IA 4ZBDA 1RQMA 2GSSA 16GSA 4HOJA 3IDVA 1M2DA 3BOAA 2YANA 3LGCA 4ACSA 5IIZA 4F0CA 3C8EA 4TW5A 3G7IA 4TR1B 1UVZA 2PN8A 3EINA 4KGIA 1ON4A 5ECMB 3QD9A 3TJBA 3FK8A 5CAXA 1TW9A 2B7JA 4EUYA 2IFQA 4BWSA 4HZ2A 4YQMA 1O6JA 5B6NA 4RI7A 3KP8A 4LMWA 4KSMA 2L57A 5D9XA 5KEJA 4LL4B 2NVLA 1S3AA 4KDYA 3VLNA 5COHA 3ME8A 2VL2C 3FEUA 2MMAA 1GSEA 3HXSA 1SJZA 5CREA 3BJ5A 3JCML 4AJ7A 4DEJA 5HQPA 2DJ2A 2LRNA 3UBKA 2AB6A 4PURA 3VPTA 3APQA 1GH2A 1S3DA 5GZZB 1IYHA 4IVFA 3DVWA 2L6DA 2WRTA 3A2VA 3TUEA 3DWVA 1ZYQB 4FYUA 2FY6A 4IKHA 4MCUA 2CX3A 1NSWA 2PVOC 3KMNA 3LORA 1MDIA 1R26A 3ISOA 5J9CA 4K8MA 3GFKA 5INYA 1ZMAA 4ILFA 2LQOA 4K2DA 3GL3A 4CHSA 3ERWA 2YN1A 3TKSE 3QAWA 4BL7A 2CX4A 3RHBA 5DCGA 3GTUB 4MABA 2F51A 3QR6A 2WB9A 4OWYA 4NV2A 2AAWA 2BMXA 2FLSA 5ECIB 1SENA 1G6YA 3A2XA 2OACA 2LS5A 3DRNA 3DMLA 1Y25A 3TOUA 11GSA 1WMJA 3GKNA 2HLSA 2BJXA 4HI7A 2DJ1A 1TK0B 4PGTA 1O8XA 2JACA 2LSTA 3F3QA 1SK2A 1CQGA 1JZOA 5D96A 4FYCA 4MH2A 2KLXA 3H1NA 5B7CA 5ECHB 3TJFA 1OVNA 4YAPA 1XFLA 3RDWA 1U6TA 4L5LA 1ZOFA 1SKWB 3EE2A 3CSIA 1SL0B 4GTUA 2JSYA 5FT3A 1EOGA 2I81A 2OJLA 1EP8A 3MSZA 4TR4A 3FKFA 2VCZA 1BEDA 2MBTA 1X9MB 1Z5YE 2X8GA 1TK8B 4TKYA 1VRSD 4XS6A 4MJAA 4XIHA 3IAS2 1AUCA 2NDOA 3J7Yk 1TDIA 3FW2A 2GQMA 2CT6A 2OBKA 2MMNA 3IRAA 2JZRA 2C1YA 1GUKA 1VF2A 1FOVA 3CYNA 3M3MA 1PKZA 1GTAA 2VIMA 3HJMA 5F06A 3HZ4A 2A2SA 3P2AA 5J4UA 1NHOA 1XCCA 4HJMA 3P90A 4MZBA 2TRXA 3ZTLA 5D9VA 2F8AA 2WCIA 1AQWA 1J08A 3TRQA 2R37A 3L4NA 3KP9A 4I5QA 1K0BA 1XBSA 1JLWA 3HCZA 4POKA 1SKRB 2OBIA 1HQOA 1RK4A 4WR5A 2I9HA 4RI6A 4YQUA 2LKUA 3OR5A 3C7MA 2DMMA 5CRHA 1TKDB 1F37A 2J23A 1OAZA 2IPAA 3IC4A 4AGSA 5CNWA 4KSOA 4JR6A 2XC2A 1NHYA 4MZWA 2CVBA 2KP2A 2VO4A 1WIKA 1X5EA 1XVWA 4MJEA 2GZYA 6GSXA 4ZL9A 1O7UA 3HVXA 5EPFA 2GS3A 2RUEA 1T3BA 3GNJA 1UC7A 1EEMA 3H79A 3VURA 1THXA 3C1RA 1O8WA 2LNTA 5FHIA 3RAZA 3UIWA 6GSTA 3HY2A 4EXJA 2PU9C 5B8BA 13GSA 4N30A 5IPGA 1ZGNA 2H19A 3APOA 4G10A 5DQSA 2VM1A 1ML6A 5G2ZA 2H6ZA 7GSSA 4EDZA 1VF1A 2GDRA 4PUFC 4ECIA 1GNEA 1XWGA 1G0TA 2HFDA 4MMMA 3VWWA 2E2GA 1BQ7A 1OC3A 4MPGA 3ZIJA 3ZYWA 3LSZA 4HEA2 2H0HA 4N0ZA 1GL8A 1Z7RA 3KM6A 4E8HA 1AQVA 2A2RA 2KOKA 3WT2A 5IMZA 3GURA 4FO5A 3UOMA 3BBYA 2XHFA 4ULXA 4TR0A 2NBSA 4KCEA 3Q18A 4MH3A 3QFBC 4ZIJA 1FB0A 1EZKA 2WULA 2H1GA 2HRFA 3WT1A 3KCMA 4J2FA 2H0GA 1OYJA 4ZB9A 4IGJA 3E9JB 5DDLA 4ISDA 1EGRA 1XOBA 2FHEA 2LJKA 1XWCA 4I8BA 4IJIA 2QC7A 3GA4A 3DVXA 1GP1A 3UMAA 2C0DA 4JZQA 5HFIA 3DD3A 4OCEA 4GSTA 1PSQA 2CZ2A 4XS4B 3VWXA 2GT5A 4J56E 2PUKC 4EF0A 1Z7PA 4QL7A 2H1BA 5IPHA 2HNLA 4HZ4A 3WD6A 1XPVA 1QMVA 1XW6A 2EIOA 4N0VA 3C73A 4IELA 2EIQA 4AF2A 5IMAA 2LRCA 2YPMA 2RLIA 3F4TA 5DVBA 2E2MA 3F8UA 2O8VB 5ELGA 1ZCPA 4XRAA 2N5FA 3M8NA 4IJ3A 1FHEA 1T8EB 1GSUA 5H5RA 3DXBA 4GSNA 4V2MA 5CYYA 1O85A 3H8QA 2FWGA 1KBNA 4PNFA 1V58A 2REMA 1JZRA 2IMDA 3RPNA 1CQHA 1X5CA 2B5XA 4XS1A 1QFNA 3GN3A 1K3YA 2H6YA 3GIXA 3M1GA 5G31A 4DSRA 5J3RA 3HHVA 1M9BA 2HE3A 4MP4A 4MJCA 2GGTA 1N8JA 3GH9A 2YWNA 3FY7A 3C71A 3IPZA 1GWCA 5AN1A 2PBJA 1BG5A 4IBPA 5IO2A 1ERTA 1WJKA 3VK9A 3F6FA 4NWYA 5D8IA 2RM6A 2GTUA 3QPMA 1EWXA 5CRDA 1SKSB 4CDOA 4TXVA 3TCOA 5IOXA 3VPQA 1T4YA 1V98A 2K9FA 1MD3A 3ZLPA 4O7HA 5CP1A 1V9WA 1YKAA 2N5AA 4GRFA 5IOWA 1J0FA 2DBCA 5IO0A 12GSA 4WETA 4AJ6A 4POLA 2HZEB 2WJUA 2AV4A 1SD9A 1KNGA 1WP0A 4IQAA 1OKDA 4K1FA 5KN0A 4L0WA 1A0FA 2QSIA 3EU4A 1ILOA 1WOUA 3AY8A 1THOA 3LG6A 1JLVA 1TP9A 1F3AA 2ZUPA 2XPEA 3GX8A 3IA1A 1FB6A 3ZL5A 5D9WA 1ABAA 5HFGA 3ZITA 2EC4A 3TB2A 1MDJA 3FR6A 2L59A 3LEFA 3LXTA 6GSUA 4XHMA 2VLTA 3RBTA 2VCWA 2FCHA 1YEPA 3GUSA 3IOSA 1PL2A 1DE2A 1FO5A 2PWJA 1XWAA 1PA3A 2IJYA 3PINA 1K0NA 4OD7A 5ID2A 3ZRDA 4KE3A 5LNKe 5JCGA 3WGDA 1A2JA 2O85A 2WDUA 2QGVA 1K0DA 2GLRA 1QGVA 3EYTA 4YAVA 2B1LA 2DJKA 3LQ7A 1V57A 1SD8A 3L9VA 5HR2A 4KAEA 1T1VA 1X5DA 1AW9A 2LJAA 3EU3A 3MAKA 3PR8A 4HQSA 5KN2A 1OC8A 2DC5A 2LUSA 4HU7A 4ID0A 2AHEA 1N2AA 2EIRA 5AIVA 3KGKA 1SJ6A 4KDXA 4KDUA 4TRXA 1TOFA 3FHKA 1DUGA 3UEMA 3QDNA 2LJRA 4HDEA 2H71A 1TRSA 5LD0A 3VWVA 2YV7A 3F4RA 2H1DA 3H4KA 5IMVA 4KNDA 2LQQA 1PMTA 1A8LA 3ME7A 1GTBA 1V40A 3QMXA 1Y6EA 2AUVA 2LEGA 4L0UA 3HJOA 2H76A 1PRXA 4RQXA 2YWOA 1M99A 3LWAA 3FR9A 4WXTA 2V6OA 1H75A 3HA9A 2O7KA 4OO4A 4O92A 4DSSA 1OC9A 2CAIA 3GKKA 1R4WA 2K8VA 4WF5A 1K3OA 2GVPA 2P5QA 2F3MA 4AJ8A 1WPIA 1BYEA 4OFMA 2C0GA 1SJIA 2VOCA 1K0OA 3APSA 2FWHA 1YF1A 4MDCA 3GH6A 2IMIA 1G6WA 1B4PA 2VAFA 2YOIA 2VL3A 2G2QA 4H86A 2H01A 3Q74A 3UBLA 4K6XA 1BAYA 5GSTA 2X8CA 4FIWA 1T00A 1QK8A 4D73A 2L5LA 2R4VA 2VLVA 1BJXA 3FZ5A 3I69A 1U87A 3QOUA 5F8BA 2TIRA 2XBIA 1NM3A 1SYRA 2NPBA 4XS4A 22GSA 1TJDA 5ECPB 5KN1A 2V2GA 3UARA 3NZNA 1TI3A 2R6KA 1GSYA 4X43A 3ZZXA 2OKAA 3LXZA 4GSSA 5ECKB 5AGYA 2K8SA 2HI7A 4F2IA 4K7IA 1B9YC 2IMKA 1C72A 5LCZA 3F0IA 1K0CA 2HYXA 1MDKA 1X9WB 3SBCA 4WBJA 3TRXA 5AIXA 1A24A 5JCWA 2VCXA 3FR3A 1E2YA 3HVVA 1SL1B 3GL5A 2TRCP 1U3IA 3D5JA 2HXKA 2WGRA 3EVIA 1A8YA 3U5RE 3G7JA 5A4WA 1TRUA 1B9XC 1Q98A 5JCUA 5DALA 1XOAA 1UA5A 1XXUA 4JRRA 2R2JA 3LJRA 1F2EA 5DQYA 1DBYA 3TOTA 1R5AA 3I9V2 2R3XA 3C1SA 1TXXA 1HNBA 4BA7A 2OA7A 3KJYA 20GSA 4PQIA 2PGTA 4IP1A 3VWUA 6GSYA 4TVEA 3W6GA 1GRXA 2ES7A 1WWJA 2C8UA 3D0ZA 1QQ2A 3GYKA 1IYIA 2X64A 2M72A 3KEBA 3CTGA 1PX6A 4GCIA 4BVXA 1ZZYA 1F6MC 3TKSA 4I2UA 5D9TA 3ZMLA 4PNGA 4GWRA 4G9HA 4IP6A 5G1LA 4TR1A 3F9UA 4P3YB 5JWRB 5E59A 2YWMA 3RHCA 2VCTA 4V2LA 4OFTA 3G9BA 4WKWA 1K0AA 3K8NA 4GLTA 4CW9A 4FH8A 4L8EA 1FVJA 3GRXA 1PN9A 5ENUA 1V2AA 1BX9A 2C80A 3LFLA 1YEXA 1K0MA 1Q4JA 2X8HA 1M0UA 2XPDA 3KH7A 4ECJA 3QAGA 1LJRA 2FD3A 2O87A 3IE3A 2RUFA 3KTLA 2VD1A 3SWLA 1WE0A 9GSSA 1YKCA 1WRYA 3DEXA 4XCSA 1GSFA 2WZ9A 4I2TA 2OE1A 3DKSA 3ERFA 1M2BA 3GKXA 3UVHA 3A2WA 3US3A 17GSA 2P31A 3IV4A 1I9DA 3M9KA 2JL4A 2L4CA 1PQNA 1U88A 4N11A 2M80A 3I6AA 5F0GA 1LU4A 2GT6A 2P5RA 3IXRA 2CA8A 2CQ9A 5ECNB 2I1UA 1AC1A 1GULA 1GLQA 3A3TA 2HT9A 1F3BA 1HNCA 1O73A 2OE0A 3RPPA 3A5WA 2H72A 4GXZA 5EL8A 1H4OA 4NMUA 2C3QA 3GTUA 3HKRA 3TKPA 1TU7A 3VI7A 4PQHA 4GQFA 4X0XA 5IMDA 2GSRA 3LYPA 5A4UA 4ECCA 3M9JA 5F05A 2JU5A 5G5FA 3Q6OA 4QL9A 4BPYA 1VF3A 5ECLB 2B6MA 3UL3A 4EE0A 1HYUA 1PD21 3D4TA 4V1Ap 3GV1A 4O32A 2B3SA 3TDGA 2YNXA 4LL1B 2H0IA 3E0UA 1LBKA 3BCIA 1GTUA 1PKWA 2IL3A 4MJBA 1AIUA 4V1Ag 1DSBA 4NXIA 1EOHA 1URMA 1GUMA 4FYBA 4MF7A 2PVQA 1ZL9A 2L5OA 2HSYA 4OCFA 3TKSC 2B5YA 3DYRA 1AAZA 4PQ1A 1M9AA 2FUG2 4EKZA 5EY6A 4ZBBA 1W4VA 2LNSA 1YQ1A 1TK5B 2VL9A 5EVOA 4I97A 1A2MA 5GAND 2LTKA 6GSWA 8GSSA 14GSA 4K9ZA 3S9FA 4LA1A 4MPFA 1QXHA 2AJQB 3ZFBA 2VCVA 3TRPA 5KN3A 4KA0A 1A23A 4KB3A 2CAQA 2VD0A 1B4QA 2PPTA 3ERGA 1A0RP 5ABRA 1I5GA 1SYXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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