3GL5A

Crystal structure of probable dsba oxidoreductase sco1869 from streptomyces coelicolor
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
237
structure length
234
Chain Sequence
HMRVEIWSDIACPWCYVGKARFEKALAAFPHRDGVEVVHRSFELDPGRAKDDVQPVLTMLTAKYGMSQEQAQAGEDNLGAQAAAEGLAYRTRDRDHGSTFDLHRLLHLAKERGRHEALLDAFYRGNFADERSVFNDDERLVELAVGAGLDAEEVRAVLADPAAYADEVRADEREAAQLGATGVPFFVLDRAYGVSGAQPAEVFTQALTQAWGERTPLKLIDAEACGPDGCAVPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Putative DsbA oxidoreductase SCO1869
publication title Crystal structure of probable DsbA oxidoreductase SCO1869 from Streptomyces coelicolor
rcsb
source organism Streptomyces coelicolor a3(2)
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 78
structure length 234
sequence length 237
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gl5A01
4WBJA 2HE3A 2L57A 1OYJA 3N5OA 3GUSA 4TW5A 2HXKA 1YDKA 2HZEA 1GUHA 3JCML 3O6TA 1QXHA 2ALBA 1EWXA 1JZOA 4X0XA 3FW2A 1Y25A 1SL1B 5HR0A 2V32A 1F6MC 3RDWA 2GGTA 4I97A 5CO3A 2C0EA 4HJMA 2GSRA 4O5RA 3N9JA 2O89A 1QK8A 5ECIB 4H86A 2H1BA 3GSSA 5ECRB 4MJCA 3DYRA 2C3TA 5DQSA 3KTBA 1WMJA 5F05A 2NTOA 3D22A 1S3CA 1ZYQB 2PGTA 5B7CA 3PR8A 1Z7RA 4GSNA 3A5WA 1EV9A 2C0DA 2H70A 1ST9A 3HZ8A 4KCAA 6GSYA 4F2IA 4L5LA 2OJLA 2VD1A 4KH7A 1JLWA 5D93A 3PINA 2GQKA 4NV5A 4GXZA 3QOUA 4KCEA 4MF6A 3OR5A 2YWNA 3HJMA 3F3RA 2FWFA 5ECSA 4F03A 1K3YA 2G0FA 4CW9A 4OO4A 1EEMA 1GWCA 2L6CA 3QAVA 2MBSA 2C4JA 2IMFA 10GSA 3WT2A 4NV2A 1EZKA 3LORA 3MAKA 2VCTA 1FW1A 1G6YA 1FO5A 4DEJA 4NWYA 1G7OA 1UA5A 1XW5A 2WRTA 1XXUA 2PPTA 3APSA 2NBSA 1TKDB 3H93A 4KGIA 4ECIA 4OCEA 2VAFA 2VL2C 3D5JA 1GULA 3EU3A 5KN2A 1K0NA 3HJOA 3QDNA 1BX9A 3CRUA 1O81A 1TRUA 4MK3A 3P2AA 1R5AA 4PNGA 3VWVA 5EY6A 2DJJA 4J56E 2AV4A 2DSAA 5CREA 4V1Ag 1KTEA 2KUCA 1XWKA 1H4OA 4NMUA 2P31A 1R4WA 5HR1A 3PGTA 2H0HA 1PA3A 1B9YC 3G7YA 1THOA 2VL9A 1GLPA 5LD0A 3UIWA 3L9VA 2YCDA 4K7IA 2MMAA 4XRDA 5J41A 4Q5FA 4XS4A 2J23A 4GWRA 2VLTA 2X8HA 3I69A 3UOMA 1O8WA 1HNCA 4MP4A 1X0RA 4HS1A 4TOPA 3S9FA 1AIUA 1G6WA 2CX4A 4HQSA 3TJBA 1GSQA 1Z5YE 2VM2A 3TKSC 4ZL9A 3F9UA 5IMAA 2NDOA 4PNFA 2WS2A 3QFAC 4ZB6A 4IP6A 4ECJA 1QMVA 2B5EA 3CYNA 5CAXA 5C00A 1SJ6A 4MF5A 1XW9A 1M2BA 3L78A 1VF2A 2YP6A 1GTIA 4MJBA 3E9JB 3WYWA 4XHMA 4J57E 5H5SA 2OE0A 5KN1A 1HNAA 1FHEA 3KZQA 2QKEA 2LRCA 2MZCA 1MTCA 4RQRA 3GKMA 2F8FA 1HYUA 1J9BA 4K0NA 3CSIA 3VFIA 8GSSA 2RM5A 2VL3A 1SJZA 3NOFA 5HR2A 3I6AA 1YKAA 4XCSA 1UVZA 4EE0A 1SD8A 4WEYA 5IMDA 4D73B 1AC1A 4MPGA 1U3AA 2VIMA 1PX7A 3IHQA 3C73A 3LYPA 1A2LA 2H74A 3D4TA 1A8YA 1M0UA 3QAGA 6GSSA 1XFLA 1XOAA 3HDCA 1V40A 3TRPA 4WETA 4PQIA 1T3BA 2FA8A 4L8EA 4F0CA 2V41A 1NM3A 2B7JA 3FZ9A 3A2XA 1SKSB 4AGSA 3EVIA 2PMTA 1KBNA 2H1GA 1VF3A 2CV4A 4QQ7A 1O7UA 2H30A 2FD3A 4ML6A 4ZB9A 1AQVA 2NVLA 4MZCA 4NHZA 2KOKA 3HJPA 4KB3A 4J2FA 4TVEA 1JZWA 2JU5A 3ZMLA 2X8CA 1PL2A 1VRSD 2H0IA 1XW6A 4TXVA 1EOHA 1S3DA 5DALB 3IBHA 2CA8A 3SWLA 3QCPA 2V1MA 3QAWA 5G5EA 1X9SB 3IRAA 1K0AA 5D9WA 4KDXA 1AQWA 2C80A 5G2ZA 1GSDA 1B9XC 4O32A 1X5EA 4K6XA 1PX6A 1RK4A 1YEXA 1K0CA 2VUPA 1V58A 2H72A 3CSHA 3TOUA 1KNGA 2YANA 5G1KA 4K7NA 2H0GA 3H1NA 2HLSA 5GSTA 3ZZXA 1DUGA 2B1KA 2R37A 4JEDA 1LBKA 1GL8A 1NHOA 1EV4A 2WZ9A 1X9MB 3UL3A 4I5QA 2VD0A 4EC0A 3UBLA 1HD2A 1TW9A 4IHUA 2DIZA 2AJQB 4OO5A 2VCXA 4BA7A 1V2AA 1K0MA 3BJ5A 4LA1A 1I9DA 4K7OA 4DVCA 2N5FA 2XHFA 3CRTA 1EGOA 2L59A 2IIYA 1PRXA 5J9BA 3WGDA 1FVKA 5CRWA 5ECOB 2WFCA 3K8NA 4K0GA 4KE3A 3US3A 1WWJA 3UVHA 4DSRA 22GSA 5ELGA 2X99A 2FLSA 4HJ2A 1M2AA 1XWBA 3D4MA 3IK7A 4ISDA 3P8WA 4ID0A 3MWHA 9GSSA 1GSEA 2GZZA 2QGVA 1XPVA 1T8EB 3F0IA 2LRTA 2HRNA 3F8UA 3F3QA 14GSA 4I2TA 2VCVA 5AIVA 3CTFA 2YWIA 4TR3A 4D73A 2H19A 5IIZA 5LCZA 1E6BA 1MEKA 3BOAA 2E7PA 3C7MA 2HZFA 1N2AA 4ZL8A 1M9AA 2YZHA 2HSYA 1PN9A 2GSQA 2O85A 1SU9A 2HI7A 4YQVA 3ZIJA 2AB6A 2GQMA 3G9BA 1CQHA 1TK5B 2C8UA 4POMA 2PN8A 3RHBA 4N10A 3LGCA 2R3XA 2YN1A 1V98A 2TRCP 2I3YA 4OMVA 2BJXA 3DVXA 5B6MA 1M2DA 2GT6A 5IOXA 4KDUA 3M9KA 2IWTA 1PD21 4XIHA 1JLVA 2P0GA 3LSZA 5C04A 3ZL5A 2IMIA 4BWSA 5L71A 5G1LA 3KH9A 2LS5A 3D0ZA 2P5QA 2IFQB 3ISOA 5A4UA 1FVJA 4HU7A 3ZYWA 1OKTA 3GN3A 1FB6A 6GSWA 4OD7A 2LNSA 2YPMA 2CQ9A 2KP1A 5DALA 5A4WA 3ZREA 3PH9A 1Z7PA 4QL9A 1QUWA 4TR1B 5A5KA 2H8LA 3A3TA 3KH7A 3TKPA 4POKA 4JU5A 3GKNA 17GSA 2N5BA 3DD3A 3EC3A 1DBYA 4FO5A 5FT3A 18GSA 4KSOA 4FYBA 1PMTA 2OKAA 3KM6A 3W8SA 3DGQA 1ZZYA 4E8EA 1QQ2A 2L5OA 2PVQA 1K0BA 2EIOA 1PL1A 2FHEA 1XWCA 2JZSA 1PQNA 3DMLA 1M7TA 4MJEA 3J7Yk 2ZNMA 4HOJA 3LXZA 1XBSA 3AY8A 4OFTA 1XZOA 2LJKA 2YV9A 2RLIA 3L0HA 4YAVA 2CZ2A 2DJ2A 5D96A 3TCOA 1RQMA 3I43A 5DJLA 2WDUA 1NSWA 3HVVA 2X8GA 5IMFA 4N30A 3GH9A 1WIKA 5CYYA 1I5GA 1OC8A 1B8XA 1Q98A 4QL7A 1SL2B 3FYGA 1EP8A 2VCWA 4GCIA 3NIVA 3TJKA 1UC7A 4AJ8A 4ZIJA 4DSSB 4POBA 5IMCA 1GLQA 2G2QA 1OVNA 2GZYA 2C0FA 4YQUA 1OC3A 5ECNB 4IN0A 2K9FA 4TN8A 1ZMAA 2F9SA 3C1RA 1NW2A 1IYIA 2FNOA 3QD9A 1F3BA 4KW6A 4EO3A 2CVBA 2DIYA 3TKQA 2LJRA 1HNBA 3VWUA 2K8SA 3TKSE 1F3AA 3QFBC 1THXA 5F8BA 1OC9B 4PX1A 2XBQA 2WGRA 1MD3A 4ULXA 2L4QA 2K18A 3GV1A 2LQQA 5J9CA 3O3TA 2CAIA 2F51A 2BTOT 4TXOB 3IR4A 4O92A 1U88A 4G10A 2H6XA 2OBKA 3DRNA 5AIXA 3CBUA 2LUSA 4FIWA 4AF2A 3F6FA 2LTKA 3Q74A 2BMXA 3BCIA 3G7IA 3VI5A 2NPBA 1AXDA 1ZL9A 1JHBA 3O76A 3GRXA 4JR6A 2JZTA 4NHWA 2C3NA 4V2NA 5EVOA 1ABAA 3EYTA 3MDKA 2HYXA 1WE0A 4POLA 2B1LA 4ML1A 4RI7A 5D73A 4MPFA 3GNJA 2LKUA 4N0VA 3TRQA 1TRWA 2VOCA 4L0UA 2C0GA 2WCIA 3DXBA 2AUVA 4IGJA 1Z6NA 4FYCA 4AJ6A 1B4PA 1FG4A 2A4VA 3HVSA 2HT9A 4IQAA 1TDIA 2IFQA 5EPFA 1QGVA 1TRVA 3M0FA 20GSA 3ZIVA 2LEGA 4ZBBA 1Y6EA 4GSTA 2F8AA 3CSJA 4TR1A 4K1FA 5KN3A 4Z7XA 3M1GA 5JWRB 4YAPA 2LQOA 4IS0A 5IMZA 3GMFA 5IM9A 1GSUA 1TJDA 1A0RP 1SKWB 2B6MA 4LL4B 2ON7A 4F82A 3VWXA 1TK0B 1BQ7A 3FZ5A 2JSYA 1E2YA 2R4VA 3CTGA 16GSA 5F0GA 4RQXA 3HYPA 2C3QA 3W6GA 3GKXA 1X9WB 2KHPA 4L5OA 4LLRA 4WF4A 1BG5A 2ZCTA 5HR3A 2CT6A 3ZVJD 1OKDA 2I9HA 6GSUA 5LNKe 4PXOA 3H79A 3KXOA 2N5AA 1O8XA 1X5DA 4BL7A 4WBRD 1BJXA 2WJUA 4XS1A 3J7Yb 3IXRA 1TU7A 3TUEA 4DSSA 1AQXA 4ECCA 1W89A 4G19A 4L0WA 2GDRA 2RUEA 2LJAA 2B3SA 4MLYA 1TI3A 3ZVJA 3GTUB 1GSFA 5ECLB 3WD6A 4TRXA 2IMKA 3W8JA 5GSSA 3TJFA 1R7HA 2MMNA 3UJ1A 3HZ4A 2DMMA 3UVTA 1OC9A 3EURA 4PGTA 3FR6A 2ON5A 2DC5A 4HZ2A 1T4YA 3E3EA 5D9VA 5HFGA 2IJYA 4IW9A 5ELAA 4TXOA 3GX0A 4MZBA 1K0OA 5KN0A 1U3IA 1H75A 2YWMA 4LMWA 1WOUA 3FZ4A 2I81A 4LMVA 2FGXA 4MJAA 1VGLA 1TOFA 2F3MA 4TKYA 4ZXGA 5ECKB 3LXTA 4V2MA 2M72A 3BCKA 4V2LA 5ID2B 1B4QA 3ZITA 3IK9A 4IVFA 1G0TA 5B8AA 1GSSA 1JZRA 1MDJA 4JE1A 3FKFA 1AAZA 4IKHA 1PGTA 2B7KA 3CXGA 4I6XA 2H1AA 1WPIA 2DBCA 2GSTA 3KEBA 2GTUA 4EDZA 5GZZB 2DJ0A 1FOVA 4KAEA 1SYXA 1PKWA 1V57A 2B5XA 4TR0A 5IPHA 2EIRA 4GQFA 5CRHA 3HCZA 1XCCA 3U5RE 2J9HA 3IPZA 2R5GA 3EWLA 3D6IA 4PUAA 2D2ZA 5JWQB 4TR4A 4NPBA 1RW1A 3KGKA 4IBPA 1Z9HA 2FCHA 1SK1A 3F4RA 3WGEA 3ME7A 4Q5NA 5J4UA 1ERUA 2VL2A 4KA0A 2YOIA 2PERA 3KP8A 4EXJA 2XBIA 2KLXA 5DAKA 5A4VA 3F63A 4ILFA 1A8LA 1WJKA 1YEPA 1U87A 3GURA 3GKKA 3ZFBA 1R5PA 2CAQA 2P5RA 4ZB8A 1O6JA 1IYHA 2IPAA 2H1DA 2FA4A 3QPMA 1GUKA 2QSIA 4IELA 2PWJA 2FY6A 3IV4A 1W4VA 1J08A 1GP1A 3GYKA 4WF5A 2C1YA 4PURA 2FWEA 3VPQA 3ED3A 1TRSA 3L9SA 5G30A 1MDKA 3GFKA 2GS3A 5CNWA 1YJ6A 1GRXA 2OE1A 1J0FA 4YH2A 3TJJA 3LJRA 2PVOC 3C71A 5ABRA 2HSHA 3TKSA 1FAAA 5GAPD 3H4KA 2OBIA 3FRCA 1ZOFA 3ZFLA 3ZMKA 3RHCA 2DJKA 4V1Ap 1GNEA 4IJIA 1ACVA 1MD4A 2DLXA 1O73A 5FWGA 3U6VA 4EL1A 1YKCA 2YV7A 2GZPA 2GQLA 3GTUA 4GQCA 1T1VA 1XWGA 2CZ3A 2OE3A 3FZAA 3L9UA 2HFDA 4MH2A 1ERTA 3G7JA 2PU9C 3HXSA 1N8JA 4HZ4A 4MF7A 4BVXA 1F37A 2OACA 2FWGA 4YQMA 3WGXA 3LG6A 4BWQA 4GRFA 3LWAA 1YY7A 5CP1A 2OA7A 1A23A 3GL3A 3EMXA 3ERWA 2H76A 3LQ7A 3KIJA 3KTLA 1YF0A 2H01A 2MMZA 3IAM2 5ENUA 5ID2A 5H5RA 3ME8A 3M9JA 1OE7A 5G5FA 4HDEA 1JZDA 3GX8A 3QR6A 1XOBA 5CRDA 3VWWA 3BD2A 5H5QA 1GTAA 2REMA 1OE8A 1OAZA 5ECQB 3EMPA 5JCGA 2E2MA 4HQZA 2K6VA 2ES7A 3ZRDA 5AISA 3Q18A 3RAZA 5IPGA 5D9TA 5CRGA 1EEJA 1MDIA 4BVYA 2A2SA 3L4NA 4G2EA 3ERGA 3HVXA 2IMEA 4K9ZA 4PQ1A 1SL0B 3NZNA 5GAND 1XVWA 5DCHA 3V1WA 4KX4A 5JCWA 1EP7A 5IMVA 1EOGA 4XRAA 1GNWA 2XPDA 3QMXA 3DVWA 4XS6A 2JSZA 3GA4A 2PBJA 2X64A 1ZGNA 1ZYEA 3HY2A 4GTUA 3IA1A 5F06A 2OADA 3TB2A 1SK0A 1DE1A 3UEMA 5DBQA 4N0ZA 1T00A 4K2DA 2LNTA 5HFIA 3UAPA 4WR5A 4OWYA 4EDYA 1TK8B 4KSMA 3FY7A 2ZUPA 4RI6A 1VF4A 2VCZA 4GF0A 1ON4A 3P7XA 4AJ7A 5G31A 3VK9A 2H66A 1Z6MA 2YJ7A 3BBYA 2H73A 3TDGA 5D8IA 3SBCA 2K8VA 3DWVA 3UBKA 13GSA 1YF1A 2E2GA 2GVPA 1JFUA 2RIIA 3EINA 5IO0A 4XTSA 1FB0A 1DSBA 2XPEA 5IQYA 3KP9A 2MMOA 1NHYA 1BAYA 1PKZA 2CVKA 4F9ZA 4K8MA 4E8HA 1TU8A 3HHVA 1HQOA 1VF1A 2YNXA 1BEDA 4JZQA 2GSSA 3IE3A 5J5NA 1X5CA 2HNLA 1A24A 1AW9A 4HEA2 3A2WA 3E0UA 5HFKA 4EVMA 4IQ1A 2I4AA 1C72A 1SD9A 2YJHA 1U6TA 1QFNA 2AHEA 5DAKB 1G7EA 2B5YA 3Q6OA 3IOSA 3KCMA 1USBA 2JADA 3R2QA 3RBTA 3LFLA 3P90A 4RUVA 6GSTA 3A2VA 3FR9A 4CHSA 2EIQA 4HI7A 3DKSA 4EUYA 2V2GA 1WP0A 2QC7A 1F2EA 2GLRA 4MCUA 1XVQA 3APOA 3M3MA 5ECPB 4EKZA 3ZLPA 4OFMA 3LEFA 2A2RA 5COHA 2DJ1A 4ZBAA 2TIRA 3FR3A 1Q4JA 3GH6A 5KEJA 5B6NA 5B8BA 1SK2A 5F07A 4Q5RA 2H75A 3GHAA 2E0QA 1GTUA 1PSQA 4ZILA 3DEXA 1BYEA 3KJYA 3Q19A 3UMAA 2IMDA 3TRXA 4WXTA 4HU9A 2O8VB 1LU4A 3IC4A 2WB9A 4EF0A 2KP2A 4ZBDA 4ECBA 2H6YA 6GSXA 3H8QA 4JRRA 1UN2A 1R26A 4F0BA 1CQGA 1XWAA 4P3YB 5DJMA 3RPNA 4DSQA 1TP9A 3VI7A 4NXIA 3MNGA 4GSSA 2YWOA 4JBBA 1GH2A 5DCGA 3IDVA 5J3RA 5JWOB 3GSTA 2M80A 3KMOA 2HZEB 4MDCA 1ERVA 3LYKA 19GSA 5HQPA 1KEBA 1K0DA 1K3LA 2CX3A 4I8BA 1T4ZA 1SENA 3F4TA 2H71A 3GL5A 1TTZA 4BPYA 2IL3A 3WT1A 2VLUA 4MZWA 1A2MA 2L4CA 2V6OA 2O7KA 4IP1A 2YZUA 1B48A 2MYGA 2M46A 4Q5QA 3MSZA 4O7HA 11GSA 3VPTA 5DVBA 4X43A 2L6DA 3HA9A 5AGYA 4WR4A 1F9MA 2DJ3A 4HUAA 2O87A 1XIYA 2EC4A 1SYRA 1EGRA 3VLNA 2TRXA 3IAS2 4GLTA 1A0FA 2L5LA 3TOTA 4ZL7A 4PQHA 5IO2A 4JR4A 5IOWA 1A2JA 2RUFA 2LRNA 2JZRA 4MMMA 3C1SA 5FHIA 2V6KA 1URMA 2CVDA 4MH3A 2JL4A 3TKRA 2VO4A 2VCQA 3RPPA 2JACA 3F6DA 3I9V2 3GIXA 4N11A 4LL1B 2LV3A 2Z9SA 5DDLA 2H6ZA 5JCUA 2WULA 1SKRB 5ECHB 5E4WA 3VURA 3KMNA 3KD0A 2FUG2 3ZTLA 5D9XA 2VLVA 1K3OA 1V9WA 4FYUA 3FK8A 1ZCPA 2LSTA 2I1UA 3ERFA 5ECMB 1T7PB 1ERWA 3APQA 1GTBA 4OFNA 1LJRA 2GT5A 2R6KA 4G9HA 3DIEA 1GSYA 1ILOA 2R2JA 3D21A 4OCFA 3FEUA 3UARA 1O85A 1GUMA 4KUNA 4MABA 3CMIA 4I2UA 2RM6A 4X1UA 3F4SA 6GSVA 2AAWA 2FWHA 4CDOA 4PUFC 3FHKA 3EU4A 7GSSA 1TI1A 4KDYA 3TJGA 2XC2A 4XS4B 3C8EA 1SJIA 5EL8A 4MA9A 4KNDA 5AN1A 12GSA 3TGZA 1DE2A 3EE2A 1M99A 5DQYA 1S3AA 3HD5A 5E59A 2AYTA 1WRYA 2VM1A 3M8NA 1YZXA 3HKRA 1M9BA 4FH8A 2MBTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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