3GL5A

Crystal structure of probable dsba oxidoreductase sco1869 from streptomyces coelicolor
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
237
structure length
234
Chain Sequence
HMRVEIWSDIACPWCYVGKARFEKALAAFPHRDGVEVVHRSFELDPGRAKDDVQPVLTMLTAKYGMSQEQAQAGEDNLGAQAAAEGLAYRTRDRDHGSTFDLHRLLHLAKERGRHEALLDAFYRGNFADERSVFNDDERLVELAVGAGLDAEEVRAVLADPAAYADEVRADEREAAQLGATGVPFFVLDRAYGVSGAQPAEVFTQALTQAWGERTPLKLIDAEACGPDGCAVPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Streptomyces coelicolor a3(2)
publication title Crystal structure of probable DsbA oxidoreductase SCO1869 from Streptomyces coelicolor
rcsb
molecule keywords Putative DsbA oxidoreductase SCO1869
total genus 78
structure length 234
sequence length 237
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gl5A01
3PINA 4HJ2A 2FLSA 2I3YA 1SKWB 3APSA 3LXTA 2PU9C 2ON7A 2GQLA 4O5RA 2N5BA 4XCSA 2TRXA 1X9MB 4F2IA 2K8SA 4MJBA 5LD0A 1XBSA 1R5PA 4OWYA 4AF2A 1S3CA 4HOJA 2OE1A 2V32A 2RIIA 1YDKA 5B6MA 3HXSA 4O92A 1O85A 1ZMAA 1YQ1A 3OR5A 3DVWA 5D8IA 1X5EA 2H0HA 5ECRB 4BVYA 2IJYA 1WMJA 1SK2A 2LRNA 5JCUA 4K6XA 3MDKA 1PA3A 3C8EA 3TKRA 1K0MA 5A4UA 3AY8A 1DSBA 3IAM2 3ERWA 2VO4A 2AJQB 4O7HA 2OE0A 2X64A 3HD5A 2KLXA 4QL9A 3C7MA 4V2NA 1AC1A 3D4TA 1BYEA 5JWOB 3CSIA 5G1KA 3HDCA 2HFDA 5IOWA 4FYUA 3TJJA 2G0FA 4J2FA 1GSFA 2I81A 1O8XA 4KDXA 3HJPA 4MPGA 5ABRA 3KMOA 3KP8A 1B9XC 1X5DA 4MZWA 4MF6A 4GLTA 5ECNB 5ECHB 2P5RA 1SJIA 2GTUA 1XZOA 4OFMA 3J7Yk 4OCFA 1SK1A 4OO5A 4OD7A 1XWKA 5DAKA 1M0UA 5A5KA 4G19A 2HYXA 4J57E 4K0GA 1SK0A 1E2YA 3WGDA 1HYUA 2ZCTA 3LYKA 2GSSA 1GULA 1QXHA 3C73A 5F05A 3J7Yb 1QMVA 1TI1A 4POKA 4PX1A 5CP1A 5D9TA 1FW1A 4K2DA 3FZAA 1AQXA 1WWJA 5IIZA 1Q98A 4K7IA 4IELA 1EP8A 3L78A 3O6TA 3D5JA 2C0FA 2WDUA 3GYKA 1SD9A 2NBSA 5ECIB 1ACVA 2GVPA 2L6CA 1X0RA 3CTGA 1XWCA 1A0FA 3IR4A 3FYGA 5JCGA 2H1DA 2GZYA 4MMMA 2CAQA 4HUAA 3UL3A 2DJ3A 3EYTA 4I2UA 3ISOA 2RUEA 1F37A 3IXRA 5F06A 1BQ7A 2A4VA 3ZYWA 3HA9A 3LORA 2H72A 2C0DA 1AW9A 4L8EA 1ZCPA 3ZIJA 1H4OA 3O76A 4I6XA 3CSJA 3P90A 3GL5A 2RM6A 1NHOA 2H30A 1NSWA 5FHIA 1F3BA 4KAEA 3IPZA 2C3TA 1OKDA 1U87A 1PD21 4IW9A 3ZTLA 4Z7XA 4FYCA 4ZBAA 2L4CA 1GSUA 4JE1A 4WBJA 3HJOA 1V2AA 6GSWA 2PGTA 1OVNA 2X8GA 1K3OA 1EEMA 5H5RA 2FGXA 2N5AA 4K8MA 2R37A 4GXZA 3QFBC 4RI6A 3WYWA 5J3RA 4DEJA 2GZZA 2R5GA 1JHBA 3DRNA 3LG6A 3TJGA 1SYRA 4CW9A 4GRFA 3FZ5A 2LUSA 4ML6A 1MDJA 5ECMB 4N0VA 5CRGA 3ME7A 3WD6A 2REMA 2AV4A 3E0UA 2HT9A 4ECBA 3QAVA 3F63A 1TK8B 4RUVA 4K9ZA 1K0NA 2H6ZA 2ES7A 2C0GA 3F9UA 1NW2A 1LJRA 3EMPA 1RQMA 5D9XA 2ON5A 1N2AA 4O32A 2OACA 2R6KA 1JZDA 3VPTA 2IFQA 2WGRA 5D93A 5ELGA 3KEBA 1HQOA 1PL2A 2HZFA 3GX0A 3F4SA 1T8EB 2CVKA 1JFUA 3D21A 2B3SA 2VAFA 1N8JA 3IDVA 1EV9A 3TOUA 3RHCA 2O89A 1YKCA 2JZRA 5B7CA 2VLUA 3TRXA 2VCTA 3DMLA 2PUKC 2MMNA 1SD8A 1ZZYA 3DEXA 4I5QA 4X1UA 2CT6A 4RI7A 1YKAA 1ZOFA 4I2TA 3CYNA 1GSDA 1V9WA 1VF4A 4NHZA 2KOKA 3P2AA 4NV2A 2O87A 4OFTA 1TK0B 2DJ0A 3GSSA 2LEGA 4WR5A 1SJ6A 3Q74A 2IFQB 3LQ7A 3GKNA 5HFGA 1AQVA 1JZRA 5DALA 4MCUA 2VLTA 4MJCA 3QAGA 1X9WB 4X43A 1WPIA 2EIRA 4JR6A 2DBCA 3WT1A 4GSNA 1GUMA 1K0AA 3DXBA 2IN3A 4G10A 1ZGNA 2H8LA 2C1YA 3CSHA 2JZTA 4ISDA 1W4VA 2VD1A 1K0CA 3TDGA 1WRYA 3EC3A 1SJZA 1CQHA 4L0WA 4XS6A 4V2MA 2JL4A 2TIRA 1B9YC 2IMFA 4GQFA 1A24A 3GTUA 2LNTA 4TXVA 1JLVA 4IQAA 3GRXA 1UVZA 1MD4A 4HU9A 5AISA 4DSQA 5H5QA 2A2SA 4KCAA 3RBTA 5CYYA 4BVXA 4AJ8A 1M99A 2OADA 1TP9A 5IPGA 3TKPA 2H71A 2WFCA 3UVTA 5DALB 4AGSA 2RLIA 1UA5A 2M46A 4KB3A 2E2GA 2CA8A 4TR3A 2VL3A 1MEKA 2YWIA 4KNDA 3UJ1A 3ZL5A 2LTKA 4PUFC 2V41A 2YPMA 4PGTA 2L4QA 1GSEA 1A2JA 4IBPA 2PBJA 3EINA 3H79A 1FB0A 3GSTA 3GTUB 4HEA2 2H70A 2K8VA 1UC7A 1TXXA 4NHWA 3HY2A 2NDOA 1FOVA 2DJJA 2X8HA 5J41A 2L5LA 2CVDA 1SKRB 1F2EA 2ZNMA 1OKTA 11GSA 3UAPA 4TR0A 2OA7A 3CMIA 5D96A 2VCQA 4NPBA 5CREA 3MSZA 4QQ7A 2TRCP 1XWBA 3A2VA 4GSSA 1FVJA 2GLRA 3HZ8A 4KDUA 4EVMA 5ECKB 2IWTA 3FZ9A 1IYHA 1EOGA 2AHEA 2L5OA 5GSSA 1ML6A 3APQA 1WJKA 3EURA 1V98A 3PGTA 1GSQA 3IK9A 1B4PA 1BJXA 1M2BA 1U3IA 3QAWA 2JSYA 3GMFA 5EVOA 4EO3A 4YAVA 3GKXA 2KP2A 5C00A 3ZVJA 4DVCA 5FWGA 4E8HA 2IL3A 1TU7A 2VCXA 2Z9SA 2WJUA 3US3A 1FO5A 2F3MA 4ZILA 2WCIA 3GFKA 4POBA 6GSSA 1ILOA 5F8BA 4IN0A 1Z6NA 3KXOA 2AB6A 4KGIA 2XPEA 5DCHA 3TKQA 1A2LA 2A2RA 1XVWA 1YF0A 1ZYQB 1TOFA 1TRWA 2C0EA 2D2ZA 3HJMA 1YZXA 3VWXA 1U88A 5ID2A 3ZZXA 2CV4A 4HU7A 2VUPA 5J9CA 2FWEA 1R4WA 4Q5NA 5IMVA 1ERVA 5HR0A 3TJBA 4ML1A 4TR1A 3E3EA 1AUCA 5G30A 5CRDA 1XW6A 3L4NA 3FW2A 4POMA 3KM6A 3UEMA 4PUAA 1X9SB 1GSYA 1O7UA 4BA7A 2O8VB 2WS2A 2GSRA 2M72A 1UN2A 1GTUA 2HSHA 1R5AA 1I5GA 4TOPA 2B1LA 3F3QA 5GAND 2VM2A 3IK7A 3W8JA 1GP1A 3KCMA 3L9UA 3VLNA 1AAZA 4V1Ag 5JWQB 3D0ZA 2HNLA 1M7TA 5ID2B 2R4VA 6GSXA 5HR2A 3TRPA 1T4YA 5EPFA 2JADA 5D9VA 4Q5QA 2PMTA 4ULXA 4MK3A 2YJ7A 2C8UA 1VF2A 1V58A 2C3QA 4WR4A 1TJDA 4N30A 1G7EA 3KJYA 2K18A 4I97A 5F0GA 1GTIA 1SYXA 4MABA 5A4WA 4TKYA 3DKSA 4PURA 2HSYA 1NHYA 5B6NA 3GHAA 3KTBA 4IS0A 2YNXA 5E4WA 2V1MA 4RQXA 1JZOA 4IJ3A 4MF7A 4OO4A 3HHVA 2DJ2A 3LYPA 4JEDA 3I9V2 4ZXGA 2CX3A 3F4RA 5ECOB 2HRNA 5LNKe 3A2XA 4HJMA 2E0QA 17GSA 2LS5A 2J9HA 2PPTA 2L59A 1G7OA 1TW9A 3TKSC 3ED3A 4MF5A 1A23A 4IHUA 3L0HA 1QFNA 4N10A 4TXOA 1RK4A 2ALBA 4MH3A 1THOA 2B7JA 5IMCA 3VFIA 4F82A 1VF3A 4IKHA 2LV3A 1YF1A 4ZL9A 3F0IA 1XWAA 5A4VA 2LRTA 3F6FA 3DIEA 2YWMA 4IQ1A 5AIVA 5J4UA 16GSA 2YV9A 3TUEA 2MMAA 4MPFA 5DVBA 3F4TA 1SENA 3QMXA 3BD2A 4LMWA 1OAZA 5DAKB 10GSA 2JACA 1GLPA 2XBQA 4K0NA 1WOUA 5FT3A 3ZVJD 2HZEA 2YN1A 5KEJA 2P5QA 3VURA 5KN2A 3E9JB 3NIVA 4POLA 4GF0A 2F51A 2GSQA 1FB6A 4WEYA 5G5FA 2GZPA 2VL2C 2E7PA 4GQCA 1Z5YE 4LA1A 1TRVA 4LLRA 1GSSA 2DIZA 2VD0A 5H5SA 3ZRDA 2BTOT 3QCPA 3DWVA 3HCZA 1O6JA 3ZITA 3FHKA 1M2AA 5AN1A 2F9SA 4JRRA 3VWUA 2NVLA 3KGKA 2VCZA 1GLQA 4TR4A 3TJFA 3LGCA 2EIQA 4HI7A 4PNGA 2H1GA 5CNWA 1J9BA 1G0TA 2AUVA 2XHFA 4XS1A 1THXA 2OKAA 3FRCA 3F8UA 4KDYA 3N5OA 2OBIA 4K7NA 1FAAA 1XVQA 2KHPA 2N5FA 1QK8A 3LWAA 4F0CA 2RUFA 3RDWA 1XIYA 3GX8A 1VGLA 5CO3A 5B8BA 1C72A 2V6KA 5DBQA 3HYPA 5ELAA 4MLYA 3A2WA 3QDNA 4TW5A 1XOAA 1YEPA 5HR3A 1JLWA 2LQOA 1J08A 2IMKA 2HLSA 4PNFA 5IO0A 3CXGA 1ABAA 5KN1A 4AJ7A 1LBKA 2H6YA 3M9JA 1TKDB 1BEDA 3GIXA 1HD2A 4WKWA 4MJAA 2GGTA 1CQGA 3DVXA 2VCWA 4ID0A 1G6WA 2EC4A 2FY6A 1G6YA 5J5NA 1H75A 4DSSA 1GNEA 1K0DA 4KH7A 2H19A 4MJEA 4ZL8A 19GSA 3ERFA 3WGXA 1K3YA 2C4JA 5KN3A 4MDCA 3BOAA 2XC2A 1HNAA 3ZFBA 4ACSA 1AXDA 1Q4JA 22GSA 3IAS2 3CRTA 4NAXA 3EU4A 5INYA 1ERWA 3M3MA 3GL3A 3H93A 14GSA 1XWGA 3MWHA 4KA0A 1EGRA 4EC0A 5HR1A 2I9HA 4TVEA 2B5XA 4N11A 3TKSA 2E2MA 3H4KA 2O85A 3KD0A 4NXIA 3RPPA 3HVSA 2FA4A 4EDYA 4XTSA 3SWLA 1QUWA 1LU4A 3CBUA 4CHSA 5GZZB 2H0IA 4NMUA 2GDRA 2PVOC 1S3AA 3Q6OA 1S3DA 4PXOA 4DSSB 2NTOA 5CAXA 2DMMA 4EDZA 2RM5A 3PH9A 3QD9A 1DE1A 4EKZA 5IMDA 1O73A 1PN9A 1URMA 3H1NA 2P0GA 1K0BA 2HI7A 3M9KA 2H73A 3MAKA 5IM9A 2C80A 3G7IA 2H0GA 2YV7A 4ECIA 2VCVA 4EXJA 4JBBA 3ZMKA 2MMOA 4LMVA 3MNGA 2FHEA 2QKEA 2P31A 2VL2A 1OE8A 2IMIA 4Q5FA 1J0FA 4IVFA 4L5OA 4F03A 3IHQA 1JZWA 4PQHA 1T00A 4H86A 1Y25A 3KMNA 3S9FA 5JWRB 2MBSA 3G7YA 3IBHA 3IOSA 1ON4A 4KX4A 2QGVA 3F3RA 3FR6A 4KUNA 4ZL7A 1KEBA 2B5YA 2PWJA 4DSRA 3UOMA 1BAYA 3G9BA 2H74A 4F9ZA 3LSZA 3GUSA 4G9HA 1GTAA 4I8BA 3FR3A 1GL8A 3M1GA 4XIHA 5IMFA 2VL9A 2VM1A 3FK8A 2H01A 2YCDA 4XHMA 5HFKA 2X99A 1FG4A 2PVQA 2KP1A 3G7JA 1MD3A 2BJXA 1GNWA 1A8LA 1ZYEA 1BG5A 1GUHA 1GRXA 4KW6A 2OJLA 2GQMA 2H1AA 4IP6A 2X8CA 4TRXA 3BJ5A 3P8WA 4MZBA 4YH2A 2QSIA 4MP4A 1A0RP 1YEXA 2G2QA 3FZ4A 3BBYA 3Q19A 1GTBA 2AAWA 2FWFA 4MH2A 1OC8A 1EGOA 3KH7A 2IPAA 3CTFA 3RPNA 4EE0A 1K3LA 4NV5A 5HQPA 1KNGA 4ECJA 2M80A 2GS3A 1Z6MA 5ECLB 2LRCA 7GSSA 4Q5RA 3FEUA 4WF5A 1TI3A 4N0ZA 4HQSA 4FYBA 4OCEA 1XFLA 1PQNA 1WE0A 2MYGA 2IIYA 4YQUA 2DIYA 2PERA 1ERUA 2LJKA 2J23A 1AIUA 3VK9A 2DJ1A 2ZUPA 3EWLA 3KTLA 5CRHA 3VWWA 4XS4A 2R3XA 3JCML 1X5CA 1OC9A 3I43A 5DQYA 2YP6A 4D73A 4ZB8A 1R7HA 20GSA 1OE7A 2IMDA 4HS1A 3D6IA 3EMXA 2WULA 4XRAA 18GSA 5G5EA 4E8EA 4HQZA 1B48A 3M8NA 2FCHA 3KH9A 1PMTA 5EY6A 2B1KA 2WRTA 3GNJA 5ENUA 1Z7RA 1SU9A 1SKSB 4WXTA 3IV4A 4EL1A 1AQWA 4FO5A 3I6AA 12GSA 1OYJA 1MDIA 1O8WA 4TR1B 4ZBBA 3QPMA 3LJRA 1OC3A 3WT2A 3UARA 4XS4B 1OC9B 2BMXA 1A2MA 1EV4A 1YJ6A 2HXKA 4LL4B 4D73B 5D73A 5JCWA 1F9MA 4L0UA 3IA1A 4PQ1A 2LJRA 2YOIA 3GV1A 2MZCA 5DJMA 3VPQA 1PRXA 1VRSD 1MDKA 4KSMA 5J9BA 1KTEA 2FUG2 1PL1A 3NOFA 2V6OA 2GT6A 1EZKA 3ZLPA 2H75A 1F3AA 3QR6A 1DBYA 8GSSA 1M9AA 2LJAA 3C1RA 4WF4A 3TOTA 3ZREA 3QFAC 3VI7A 4EF0A 4WETA 6GSUA 5IMZA 2YANA 2CAIA 4TN8A 4RQRA 5IO2A 1TK5B 2KUCA 5GSTA 4PQIA 2HE3A 2FWGA 5B8AA 5GAPD 3ME8A 2WB9A 4FIWA 3BCIA 3TB2A 3GN3A 1VF1A 1TTZA 5ECQB 3C1SA 3FKFA 2PN8A 2LNSA 3F6DA 5G31A 4IGJA 3ZIVA 4GWRA 3FR9A 2DSAA 4NWYA 5COHA 2EIOA 3QOUA 4P3YB 4TXOB 3CRUA 2JU5A 4FH8A 4YAPA 1HNBA 1PX6A 4JR4A 2L6DA 2YJHA 1GUKA 4ZBDA 4EUYA 2JZSA 3U6VA 1XXUA 5G2ZA 1PSQA 1DUGA 4KSOA 3M0FA 3SBCA 3DYRA 4V2LA 3W8SA 3U5RE 3IRAA 3KIJA 1XW9A 1B8XA 1W89A 3EVIA 2L57A 4IJIA 3TJKA 4GTUA 1ERTA 5C04A 2HZEB 1T4ZA 3HZ4A 1NM3A 13GSA 3TGZA 3ZFLA 4LL1B 1V57A 2H1BA 4XRDA 1A8YA 3C71A 2R2JA 5CRWA 1GH2A 3UBLA 1MTCA 1SL2B 1T7PB 4OFNA 2HRFA 3I69A 1TRSA 1K0OA 3GH6A 5ECSA 4KE3A 2FD3A 1EP7A 1V40A 1XW5A 1XPVA 1TU8A 4MZCA 9GSSA 1ST9A 2DC5A 2WZ9A 2CZ2A 3KP9A 6GSYA 1PKZA 2B6MA 3O3TA 2YWOA 1T3BA 3H8QA 2YZUA 3LXZA 4HZ2A 3Q18A 4K7OA 1M9BA 1O81A 2K6VA 5LCZA 3EE2A 4ZB9A 1B4QA 3DGQA 4BL7A 3HVVA 4IP1A 4QL7A 3UMAA 1EEJA 5EL8A 5DJLA 4G2EA 1F6MC 2LQQA 4KCEA 5AGYA 4ZB6A 6GSVA 3GA4A 2C3NA 1I9DA 3RAZA 3A3TA 2GSTA 3L9SA 4HDEA 2DJKA 6GSTA 1DE2A 1Z7PA 2AYTA 2B5EA 3GKMA 3APOA 1TRUA 3LEFA 5IPHA 2H6XA 3ERGA 5F07A 4JZQA 1BX9A 5DDLA 1HNCA 2GQKA 1PKWA 4ILFA 2H76A 3EU3A 3NZNA 2F8FA 3D22A 3GH9A 5IQYA 1T1VA 1PGTA 4F0BA 1U3AA 2VOCA 2OBKA 1GWCA 3VWVA 1PX7A 3N9JA 2H66A 4AJ6A 1YY7A 1Z3EA 3GURA 4GSTA 5IMAA 5G1LA 2XPDA 3IE3A 2CZ3A 2GT5A 4BWSA 3IC4A 4YQMA 2OE3A 4ZIJA 1Z9HA 2DMLA 5KN0A 2NPBA 1TDIA 5DQSA 1E6BA 2O7KA 3BCKA 1M2DA 3TCOA 3DD3A 3ZMLA 2DLXA 3V1WA 3PR8A 1XCCA 3P7XA 2YWNA 3FY7A 1U6TA 2MBTA 3K8NA 5IOXA 1R26A 5ECPB 4YQVA 1WP0A 1XOBA 2K9FA 1EOHA 4HZ4A 2I4AA 1SL0B 3L9VA 4V1Ap 2VLVA 3D4MA 2CQ9A 1ZL9A 3UBKA 5L71A 2I1UA 4BPYA 4OMVA 4J56E 1Y6EA 1USBA 3GKKA 4CDOA 1WIKA 2IMEA 2FWHA 3KZQA 4ECCA 1QQ2A 1FHEA 2XBIA 5E59A 4X0XA 3UIWA 3W6GA 3UVHA 5AIXA 3HKRA 1FVKA 2FA8A 1IYIA 2MMZA 4WBRD 1KBNA 2CX4A 3HVXA 1RW1A 2QC7A 3TKSE 4JU5A 4GCIA 4MA9A 4L5LA 2V2GA 4BWQA 5HFIA 2B7KA 3A5WA 3WGEA 2JSZA 2LKUA 3VI5A 1SL1B 3RHBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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