3GL5A

Crystal structure of probable dsba oxidoreductase sco1869 from streptomyces coelicolor
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
237
structure length
234
Chain Sequence
b'HMRVEIWSDIACPWCYVGKARFEKALAAFPHRDGVEVVHRSFELDPGRAKDDVQPVLTMLTAKYGMSQEQAQAGEDNLGAQAAAEGLAYRTRDRDHGSTFDLHRLLHLAKERGRHEALLDAFYRGNFADERSVFNDDERLVELAVGAGLDAEEVRAVLADPAAYADEVRADEREAAQLGATGVPFFVLDRAYGVSGAQPAEVFTQALTQAWGERTPLKLIDAEACGPDGCAVPG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of probable DsbA oxidoreductase SCO1869 from Streptomyces coelicolor
rcsb
molecule keywords Putative DsbA oxidoreductase SCO1869
source organism Streptomyces coelicolor a3(2)
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 78
structure length 234
sequence length 237
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gl5A01
1TKDB 3MAKA 4K9ZA 1T4YA 1X9MB 2F9SA 4XRDA 1XPVA 5KN0A 2FWEA 2IWTA 1KEBA 4KCAA 1CQGA 2C80A 4X0XA 1GTAA 5AISA 2ZCTA 5JCUA 1BX9A 4HEA2 1N2AA 1AAZA 2CAQA 3P8WA 3VPTA 5D9VA 5G1LA 2LQOA 2O89A 1X9SB 2OACA 3GTUB 3MNGA 5DALB 2VL2C 4E8HA 2GSQA 6GSSA 1TXXA 2HYXA 1FAAA 5AIVA 2HFDA 4BWSA 1F3AA 4DEJA 4L0WA 2CAIA 1JZDA 4O5RA 2CZ2A 4HJ2A 4JRRA 3L0HA 2MMOA 1GLQA 3NIVA 4RI6A 1SJIA 2GZYA 3GFKA 13GSA 1UVZA 5INYA 2B5EA 2IMEA 1FW1A 2H72A 4HQSA 14GSA 2OBKA 2VCVA 1G0TA 5C04A 4WXTA 4TR0A 1M2BA 4XS6A 4F0BA 1ZOFA 2KHPA 1SL2B 1BJXA 12GSA 5A5KA 4K1FA 3EURA 2C4JA 2FWGA 4ZBDA 5F07A 2K6VA 3GTUA 3KXOA 2E0QA 5DALA 2HSYA 4ZL8A 18GSA 2IFQB 4WETA 1WMJA 5KN3A 1RQMA 3Q74A 4TXVA 1ERWA 3WT1A 3QAWA 1XIYA 1Z6NA 2GSRA 2HZFA 2N5AA 1THXA 2OE1A 2WULA 4TR1B 4KB3A 2HSHA 1S3DA 3ZFLA 2H73A 5GSSA 2HRFA 4PQIA 3M8NA 2YOIA 1A0RP 5IOWA 2YPMA 1JHBA 1J0FA 3P7XA 1CQHA 1DSBA 5ECMB 1TK5B 1XBSA 1AC1A 2O85A 2VL3A 3RHBA 3ZRDA 10GSA 2FUG2 5ECQB 2VCZA 2LV3A 2LJKA 2E7PA 3GKKA 4HU9A 3VWUA 1GH2A 2PERA 2V6OA 4I2TA 5D8IA 4EC0A 4WBJA 4OWYA 5E59A 1GNWA 1I9DA 4F0CA 2VIMA 2H1GA 2X99A 2REMA 4RUVA 2L6DA 3TCOA 1M7TA 3SWLA 3D6IA 1OE7A 3TRXA 1H4OA 3BOAA 3HYPA 2FGXA 4ID0A 4N10A 2IFQA 4ECCA 1DUGA 1YKCA 1F2EA 1X5EA 3TDGA 5F06A 1GLPA 3CXGA 3KD0A 4XCSA 1A8LA 1FHEA 1XWCA 2HZEB 2VAFA 3HHVA 4IS0A 5D96A 4IELA 2JL4A 5JWQB 4TR1A 5G5FA 1OC9A 1SENA 2JADA 2C0EA 20GSA 3A2VA 2RUEA 3G7JA 3MDKA 4LMVA 7GSSA 4HZ2A 5B8BA 2M72A 2YWMA 3C1SA 4EL1A 5DVBA 4ZIJA 5ABRA 3KTBA 1U88A 5CRDA 4WKWA 4JR6A 3C1RA 4DSRA 4I8BA 1TRUA 2ZUPA 2AYTA 4GSSA 2RM5A 1X5DA 3GKMA 1GUHA 4H86A 1T7PB 4BVYA 4MPFA 2K18A 4N0ZA 5JWRB 3JCML 1OKTA 4NMUA 3APSA 4F2IA 3PH9A 1FOVA 3HJOA 3EMPA 5C00A 1PN9A 3DIEA 2CT6A 1TTZA 2HZEA 1EP8A 1PQNA 3FKFA 1AW9A 2EIOA 3IXRA 4HS1A 3QOUA 2H0IA 2YZHA 4Q5RA 1FG4A 2OE3A 1AQWA 1K0CA 1YDKA 3F63A 4KCEA 5DJMA 2QC7A 2MMZA 1WP0A 2WB9A 3UEMA 3VURA 3BCIA 1G6YA 4V1Ag 2C3QA 3QAVA 5F0GA 3GKNA 1GTIA 1AQXA 2PN8A 3BBYA 4PURA 3C8EA 2G2QA 3IOSA 2XHFA 2F8FA 2V1MA 3LXTA 4DSQA 2GSTA 2JZTA 4TXOB 1XWAA 2L5LA 5G1KA 1EV9A 4HOJA 3GL3A 1K0OA 5JWOB 4MF5A 2K8VA 2XPEA 3GYKA 2CQ9A 3IBHA 4EUYA 4MJEA 3FHKA 5GSTA 1Q4JA 1PMTA 2IMDA 2C3NA 3N9JA 2NDOA 2YV7A 3C73A 3LQ7A 4FYUA 4TOPA 4ULXA 1O85A 1XW6A 4YAVA 3C7MA 2D2ZA 3EU3A 3HDCA 3TGZA 1T4ZA 1FB0A 1O73A 5CO3A 3IV4A 2LS5A 1V40A 3FK8A 1AUCA 2MZCA 2L4QA 3UVTA 2VL2A 3RDWA 4TXOA 2R4VA 3ZMLA 4KW6A 4V2MA 4G19A 4MJBA 3W6GA 2BTOT 16GSA 2VCXA 4K8MA 1HNCA 5CRHA 4EDYA 4XTSA 1EOGA 3EWLA 3DWVA 1HNAA 5F8BA 4GLTA 3US3A 3LGCA 3QFAC 2LRCA 3VWVA 1PKWA 3GRXA 4WR5A 3W8JA 2MMNA 1XW5A 4NXIA 2F51A 2OKAA 4MF6A 2FNOA 4ECBA 4KDUA 1SK0A 5LD0A 3HVSA 4HJMA 2WRTA 4EE0A 1V58A 2CX4A 4ISDA 3KJYA 5IMAA 2VD1A 3VWXA 3GIXA 2H1DA 2GZZA 1EGRA 5ELAA 1T3BA 4MZBA 1Y25A 5IMFA 2WZ9A 3GX0A 1X0RA 5AIXA 3L78A 1XWKA 2CVDA 5IO0A 5ECIB 1GL8A 4POMA 3Q18A 1TRVA 2PBJA 1GTUA 1NW2A 3CRUA 4MP4A 2H6ZA 3KEBA 3UJ1A 1ERUA 3DRNA 2VD0A 3VPQA 1G7OA 3E9JB 4IQ1A 1WOUA 3FY7A 1UA5A 3BD2A 4MH2A 1FO5A 3UBKA 1SJZA 3ME7A 1LJRA 2IN3A 1Z7RA 11GSA 5FHIA 3APOA 1RK4A 1ST9A 5HFKA 4K7NA 2H66A 4JBBA 6GSYA 3QPMA 1GNEA 1NHOA 5EL8A 5G31A 3QMXA 1W4VA 1NSWA 5HR3A 1XXUA 1LBKA 2E2MA 5IQYA 3FR6A 2NTOA 3EE2A 3DKSA 2EC4A 1U87A 3TJBA 4CW9A 4GWRA 3TJFA 4MZWA 1TW9A 2J23A 3VI7A 4G2EA 1SL1B 3RPPA 3KH9A 2GT6A 5J5NA 4GRFA 1A8YA 3CTGA 2WS2A 3LJRA 5HQPA 4ECJA 3V1WA 3KGKA 1VF1A 3D0ZA 2CV4A 2L4CA 2IPAA 2AV4A 5DCGA 2H0GA 5IIZA 1R5PA 3F4RA 4IJIA 2YJHA 2L59A 1AQVA 3N5OA 4E8EA 2GDRA 3A2XA 3I6AA 5JCWA 2FHEA 4NPBA 4PNFA 3K8NA 4ML1A 1OVNA 1WIKA 5CYYA 4TVEA 5IO2A 5D9XA 3IHQA 2XBIA 6GSTA 4MCUA 3F3QA 1T00A 1PL1A 4WR4A 6GSWA 3HJMA 1FB6A 1GSFA 2DSAA 5IMVA 3PGTA 4LL4B 1KNGA 1K0NA 4FH8A 1YEXA 4XS4B 2ON5A 3QCPA 4HU7A 3GH9A 3SBCA 1XZOA 2H6XA 1R26A 3QAGA 5DJLA 3KP8A 2TRCP 3S9FA 3GL5A 6GSVA 3GSTA 5EY6A 2LNSA 3TJJA 1ON4A 3E0UA 1KTEA 1SYXA 2DBCA 3ERWA 2YANA 3TKSC 5F05A 2VLTA 1TRWA 1XFLA 2LTKA 4MH3A 2JU5A 4WF5A 2DJKA 1U6TA 1XW9A 3UBLA 2IMIA 4YAPA 4TRXA 4PXOA 5HR2A 1QFNA 3FZAA 3VLNA 5LCZA 1WE0A 1BEDA 4YQMA 1EV4A 2TIRA 2IJYA 3P2AA 3FYGA 1OE8A 1M0UA 2YCDA 4XS4A 1A24A 3IRAA 1WWJA 1SD8A 5DAKB 4Q5FA 1GSSA 4RQRA 3FRCA 1YZXA 5DCHA 5H5SA 2LJRA 4HZ4A 4L5OA 3D4TA 3ZVJD 2KLXA 2C0FA 5KEJA 2AJQB 3TKQA 3CSIA 4I2UA 4K0GA 5COHA 3M1GA 2DIYA 1B4PA 1PD21 2YV9A 1PX6A 4HI7A 2YNXA 4IW9A 3LYKA 2NVLA 2R5GA 3A3TA 2ES7A 4V1Ap 2GQMA 1Q98A 2I81A 5D9TA 4DSSB 1Z7PA 4MABA 2HNLA 1DBYA 1SYRA 2QSIA 2DJ3A 3EINA 4D73B 4KDXA 1FVJA 3FR9A 1A2LA 4XRAA 3IC4A 2I1UA 1XOBA 2MMAA 3A2WA 2EIRA 1XWGA 2WCIA 4ZBAA 4OD7A 1F3BA 4X1UA 3C71A 4OFTA 2VCQA 5ECLB 1O7UA 1XVQA 4I97A 1PA3A 2MYGA 4ECIA 3CMIA 3M9JA 4N0VA 3ME8A 2RIIA 4GSNA 3F4SA 5D9WA 5HFGA 3MSZA 2DJ2A 3EMXA 1IYIA 1ZMAA 1EOHA 2JACA 1O8WA 2GLRA 4ZB9A 5A4VA 8GSSA 3GUSA 1F6MC 5KN1A 3IDVA 2VOCA 5IMDA 4DSSA 3ZYWA 3DMLA 5ENUA 3NZNA 4AGSA 1UN2A 1E2YA 3LXZA 5J9CA 4D73A 2YZUA 5J41A 5CRWA 4YQVA 2V2GA 19GSA 1MEKA 2I9HA 2F3MA 5B6NA 1B9YC 1IYHA 3D22A 2X8HA 4OCEA 4N30A 4K2DA 3O6TA 2DC5A 3KIJA 3O76A 2BMXA 1J08A 4ILFA 1V2AA 3EYTA 3PINA 4RI7A 5CP1A 2VL9A 3F6FA 1F37A 3QDNA 4MMMA 4IN0A 4GQCA 3G7YA 5CAXA 5GAND 3IPZA 4EO3A 3DVWA 3QR6A 1PSQA 3AY8A 3UVHA 2O87A 3A5WA 1UC7A 4GSTA 3LYPA 1JLVA 1A2JA 1ERVA 3GNJA 4CDOA 3GX8A 4K6XA 5HR0A 3M3MA 4KH7A 4KX4A 2IMFA 3L9SA 4PQHA 2E2GA 3I69A 3D21A 1ZGNA 2FA8A 5L71A 2P5RA 2DJJA 4JE1A 5EPFA 3WT2A 5B8AA 1ZZYA 1SL0B 1O8XA 2GQKA 2WJUA 2XC2A 2PUKC 4BWQA 2B5XA 2JZRA 1U3AA 5D73A 5IMCA 2VM1A 3QFBC 1QXHA 3D5JA 4IJ3A 2YWIA 1HD2A 3KH7A 22GSA 2VM2A 1JLWA 3GV1A 1Z9HA 3HZ8A 1YY7A 2P0GA 4EVMA 2L5OA 3F8UA 3ZZXA 2RLIA 1W89A 2JSZA 1G6WA 3QD9A 3UMAA 2GSSA 4FIWA 1GSYA 4TR3A 4L8EA 2VCTA 2AHEA 3VK9A 1NHYA 1TRSA 2GS3A 4IHUA 4BA7A 1M9BA 1THOA 4AF2A 5G30A 4WBRD 3CSJA 1TJDA 5H5RA 1T8EB 1S3CA 2WFCA 4KGIA 5ECKB 4AJ8A 1E6BA 3GMFA 1Y6EA 4IQAA 2P31A 5A4UA 3GURA 2YWNA 1SJ6A 2KUCA 3CYNA 3HZ4A 1MD3A 2LUSA 4L5LA 4QQ7A 3HKRA 4XHMA 3LG6A 2R37A 2H8LA 1BG5A 4OO5A 3TB2A 4BVXA 17GSA 4F03A 3DEXA 2KP2A 4MJCA 2H71A 4K7IA 1XWBA 1M9AA 1OC8A 2B6MA 5GZZB 5DDLA 1G7EA 3WD6A 3IK9A 2C1YA 3KMOA 4DVCA 2M80A 4KAEA 4CHSA 2H0HA 3HD5A 4MF7A 3ZLPA 2HI7A 4TW5A 5A4WA 1ZYEA 1AIUA 1C72A 1FVKA 1BQ7A 2V6KA 2BJXA 5EVOA 3J7Yk 2MBSA 1GRXA 2PU9C 2PPTA 1QUWA 4QL7A 4ML6A 2Z9SA 2H76A 5JCGA 1SKWB 5H5QA 3ED3A 4IVFA 3J7Yb 2CVKA 4BL7A 3RBTA 4KSOA 4EF0A 1V98A 1DE2A 4P3YB 2O7KA 1J9BA 3CBUA 4Q5NA 3EU4A 3LWAA 6GSXA 3WYWA 2A4VA 4OMVA 2LNTA 1X5CA 2JSYA 4KE3A 4LMWA 4XS1A 3KCMA 3Q6OA 2OBIA 4PUAA 3ISOA 4PUFC 3ZITA 3EC3A 4NHZA 1R7HA 1O6JA 2LKUA 2VLUA 3ZMKA 5DQYA 1JFUA 2PGTA 4J2FA 4IGJA 1SKRB 5IPGA 3HCZA 2MBTA 1TK0B 2WGRA 4NAXA 3ZIJA 1X9WB 1GSDA 3H8QA 1H75A 4OCFA 3LORA 1EEMA 4ZL9A 1SD9A 5G2ZA 1N8JA 2RUFA 4KUNA 2R2JA 1R4WA 2IL3A 1S3AA 3DVXA 2H75A 1VGLA 1VRSD 4L0UA 2L6CA 4NV5A 3ZL5A 2QKEA 1YF0A 1GSQA 3TUEA 3UL3A 5IOXA 3FEUA 1K3YA 5CREA 1JZWA 4G9HA 2M46A 2CVBA 2KP1A 5ECHB 2O8VB 5ECRB 5HFIA 2AAWA 4JZQA 3BJ5A 4GTUA 2HRNA 2OA7A 4N11A 3H4KA 4G10A 1AXDA 3GH6A 5CRGA 5DBQA 1WPIA 2FLSA 2C3TA 4POKA 4LL1B 4K0NA 3FZ9A 2XBQA 4GQFA 2HT9A 2K8SA 5D93A 1DE1A 4Q5QA 2OE0A 4NWYA 2FWHA 1B8XA 1OYJA 3U5RE 3F4TA 4IP1A 2IMKA 3TKPA 5E4WA 4KDYA 4BPYA 4IP6A 2LEGA 4PNGA 3L4NA 5KN2A 3M9KA 2YWOA 4F9ZA 3UAPA 1K0DA 1Z6MA 2V32A 4KNDA 1VF4A 1PL2A 2GT5A 4TN8A 4ZXGA 2PMTA 5ID2B 3ERGA 2GZPA 2H74A 1TDIA 3VWWA 1EWXA 3G9BA 1VF3A 5ECPB 4HDEA 2FA4A 5HR1A 1OC9B 2HXKA 4PX1A 2B3SA 2I4AA 2X64A 1YEPA 3G7IA 4OFNA 3VI5A 4Z7XA 1MD4A 2DJ1A 2KOKA 3GHAA 5J3RA 4J56E 3DD3A 2C8UA 2A2SA 3KTLA 2PWJA 2I3YA 3TRPA 2DMLA 3TJGA 1PKZA 3KM6A 3TKSE 5LNKe 2OADA 2AB6A 3L9UA 2HE3A 1EP7A 4F82A 1KBNA 3ERFA 3TKRA 5ID2A 1SK1A 5DAKA 4YH2A 4O92A 1USBA 3CRTA 1YKAA 1HNBA 5J9BA 3ZTLA 3IE3A 2FY6A 2DLXA 1TI3A 2DIZA 3I9V2 4ZILA 1XOAA 5DQSA 3DXBA 4OO4A 1YF1A 5J4UA 3W8SA 4AJ7A 4JEDA 1Z3EA 4IKHA 3OR5A 3WGXA 2QGVA 3Q19A 2H6YA 3TOUA 2VCWA 3FZ5A 2V41A 3HVXA 3GA4A 2X8CA 2YP6A 2J9HA 1M2DA 4FYBA 3EVIA 4O7HA 1GUKA 5ELGA 1PGTA 3FW2A 4J57E 1XVWA 3TOTA 5IPHA 4XIHA 4FO5A 3GSSA 4MJAA 1GTBA 1GWCA 1ERTA 2VLVA 1PX7A 2N5FA 3APQA 3KMNA 1EGOA 1TK8B 1NM3A 1M99A 1R5AA 5IM9A 2PVOC 4X43A 4MDCA 1MDIA 4MPGA 3HVVA 3P90A 1F9MA 1ZCPA 3ZVJA 1EEJA 4IBPA 2R6KA 3E3EA 3D4MA 5ECNB 2LRNA 3VFIA 2VUPA 3I43A 3F9UA 2C0GA 4ZL7A 1BYEA 4ZB6A 5CNWA 3HJPA 3IAM2 3WGEA 2C0DA 4TR4A 2A2RA 2LSTA 3O3TA 2X8GA 1QGVA 1YQ1A 2GVPA 2FWFA 1VF2A 2DJ0A 2ON7A 4ZBBA 2CX3A 1GUMA 1TP9A 2B7JA 4WF4A 1QQ2A 2R3XA 4K7OA 2YJ7A 1V57A 1TOFA 4RQXA 1SU9A 1ZL9A 4MZCA 3RAZA 1RW1A 3ZREA 2JZSA 1K0AA 5FWGA 1I5GA 4HUAA 4ZB8A 4KSMA 3IA1A 4AJ6A 5AGYA 1SKSB 3CTFA 2TRXA 3WGDA 3ZFBA 3IK7A 3F3RA 1T1VA 4EDZA 1OC3A 1WRYA 1HYUA 2N5BA 4O32A 1YJ6A 9GSSA 2FD3A 3H1NA 3FZ4A 3H79A 4EXJA 2XPDA 3IAS2 3F6DA 3U6VA 1JZOA 2H19A 2GQLA 4LA1A 5ECSA 1ML6A 4HQZA 3DYRA 2B1LA 3L9VA 3BCKA 1QK8A 2ZNMA 2B1KA 2RM6A 2F8AA 3FR3A 1K3OA 1ACVA 1SK2A 1GULA 1U3IA 1O81A 3F0IA 3HY2A 1GSUA 1M2AA 3IR4A 2ALBA 3UOMA 4MLYA 2NPBA 2EIQA 3PR8A 2K9FA 4ACSA 3LEFA 1TU7A 1MTCA 1WJKA 2LJAA 2H30A 4EKZA 5B6MA 2B7KA 3M0FA 4KA0A 4JU5A 3TKSA 1A2MA 4LLRA 1B4QA 1BAYA 4GCIA 2GTUA 3KZQA 1K3LA 3GKXA 4I5QA 3NOFA 1MDJA 1GSEA 1OAZA 2HLSA 2IIYA 4NHWA 3GN3A 1GP1A 2H1AA 2CA8A 2WDUA 1ZYQB 4WEYA 2OJLA 4OFMA 5IMZA 6GSUA 1B48A 1TU8A 2GGTA 1QMVA 4GXZA 1B9XC 5G5EA 2H1BA 2H01A 3HXSA 4MA9A 2P5QA 1TI1A 1A0FA 5AN1A 5FT3A 2B5YA 4POLA 4QL9A 2AUVA 5B7CA 3UIWA 5GAPD 2LQQA 2PVQA 2DMMA 1URMA 2L57A 3TRQA 2LRTA 3H93A 1K0BA 2CZ3A 1ILOA 2G0FA 3LFLA 1A23A 4V2LA 1HQOA 2NBSA 1JZRA 3R2QA 4MK3A 2YN1A 1MDKA 3DGQA 4FYCA 1V9WA 5ECOB 3HA9A 4POBA 1LU4A 1EZKA 2VO4A 4NV2A 1ABAA 3ZIVA 3UARA 1PRXA 4I6XA 3RHCA 2FCHA 4V2NA 1Z5YE 1K0MA 4GF0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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