3GLBA

Crystal structure of the effector binding domain of a catm variant (r156h)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
SQTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRHIVLHKEQLKLAIHKHHHLNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Inducer responses of BenM, a LysR-type transcriptional regulator from Acinetobacter baylyi ADP1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
source organism Acinetobacter sp.
molecule tags Transcription
total genus 59
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3glbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3glbA02
4NF6B 4IO2A 1VSOA 4N13A 5CBRA 2THIA 1F9BA 4FE8A 3H4ZA 1NKXA 4DE8A 3MUQA 2RKMA 2PT2A 1MM7A 4IY6A 3C35A 3TFLA 3VLWA 3RTWB 1B1XA 3O6GA 4OEVA 3VE1B 3CFLA 4BDMA 3L6GA 4RA1A 4LZ5A 5K2XA 4R9FA 1LAFE 4KYEA 3PPRA 1LFHA 4QF9A 1T0KA 1WODA 4GRKA 3OEMA 4IO7A 1O64A 2DWIA 1QUJA 4FATA 1JW5A 2F6PA 1I6AA 3VV5A 3OO9A 2O68A 5HPQA 4JB7A 3GXAA 1D9VA 4FIMA 1RYXA 2QPQA 5I56A 5A5XB 5H8FA 1ATGA 1B58A 1AIVA 3VFJA 4NF6A 4R73A 4WXJA 4LZ8A 1H45A 3CFZA 3UK4A 1SI1A 2O7IA 1MH3A 3C4MA 4OENA 2WKYA 2QS1A 2DXRA 1CB6A 3SERA 5BWJA 4NWCA 2NVUB 2ZMBA 3IOUA 2UYEA 3O2AA 2ESNA 4F19A 2I49A 3QUJA 1D9YA 3K00A 4R2BA 3HHGA 3VVEA 5JTYB 3K01A 4NF8B 4GF8A 4FEBA 3TZAA 4F2OA 4RPOA 2H4IA 1N84A 4PFTA 4OTEA 3EF7A 3RNNA 1P1QA 1TXFA 2O6AA 2XXIA 3PPNA 4JDFA 3T9XB 2F7CA 3RQTA 1IITA 2I3VA 5A5XA 3MW0A 3N94A 1MDP1 3U94A 4ZEBA 3V83A 4F3SA 4ELQA 1Y3PA 1QUIA 2UVJA 1D3KA 3K1MA 4U23A 3IX1A 2RC9A 3TAJA 4YKIA 2YPNA 1FQFA 3KJ7A 3IJXB 3SEXA 1SW4A 2GRVA 3H7MA 1LSTA 5H8QB 4C1TA 1N04A 4TLMB 5AA2B 1BP5A 3H6UA 5JTYA 4WKMA 1Q1KA 4NF8A 1DPEA 4IB2A 3KOSA 1BKAA 1MY3A 4ZECA 4P0GA 3T9HB 1OIBA 4RXLA 3MP6A 1OMPA 3MZ1A 4ZS9A 3PMVA 3PGFA 3KEIA 3PPPA 2VD3A 5CMBA 3CFXA 3TUSA 2XXHA 4RJZA 3D4GA 2B3BA 2F8DA 4EQBA 4IO4A 2E1SA 1DSNA 4LATA 2UVHA 1EZPA 5CMMA 1ZIUA 2QSXA 4F22A 1H43A 3SESA 4QSDA 3R7XA 4UA8A 4QHQA 1FQEA 4EXKA 3DELB 3MPLA 4YAHX 3IB0A 5H8QA 4OETA 1FQAA 5AA2A 1B5IA 2V3TA 4DIGA 1PB9A 4LZ7A 1IUDA 3LSFB 4GQOA 4OXVA 4KCDA 4YKKA 1PB7A 3UIFA 3TCHA 1YAEA 4I8CA 2O84X 4MH5A 4R75A 1LBBA 2XD2A 1Y9UA 3MVWA 4RPNA 3MP8A 1NFTA 2FYIA 5CMCA 1JQFA 3B6TA 1AL3A 4LQ5A 3G3HA 3WAEA 4ZE8A 4RNSA 1IIWA 3IK6B 3BFTA 3DM0A 1B0HA 5ICTA 2Y7KA 1MY4A 1UTHB 1OLAA 2ONKE 1P1NA 4ZE9A 5HM4B 1USYH 1MXYA 4DXCA 4ONYA 4WEPA 1B7UA 2DWHA 3I6VA 3FVOA 3FATA 2A5TA 3K6UA 4ZEIA 1URDA 4EF2A 4QSCA 3M3LA 3IOVA 3TYHA 4TQUQ 5CMKA 1JEVA 1N3WA 1OQGA 2XXYA 1QKBA 5TP9B 3G3FA 2XXRA 3CSBA 4FAJA 2AIXA 3H6WA 3ILTB 3FXRA 3MP1A 3S9EA 2ONRA 1MXWA 1B52A 1SW5A 3T93B 1CE2A 3HCQA 1GVCA 3QUFA 2X7QA 2H9BA 3GZGA 1GR2A 3SETA 4R72A 2OCUA 3G3GA 4BDNA 1YTVA 2YLNA 2RC8A 4O3BA 4U1OA 5I59B 1UTHA 2Z22A 2B3FA 2Z8FA 1SQYA 4MLVA 2ZXTA 1B6HA 3CI8A 2YJPA 4THIA 3OO7A 3M3KA 4G2ZA 5EYFA 2NUVA 4LVQA 4YZZA 1SI0A 3EQ1A 3MZBA 3GBAA 3RLFE 3FXUA 3FASA 5ICQA 4EF1A 4XTCQ 1ZBMA 2HZKA 4PFUA 1GV8A 1MXZA 5TP9A 5DVJA 4R9GA 3ZSFA 3KFMA 2IEEA 3O9PA 1A8FA 2RCBA 5EHMA 3O66A 2ZYMA 4XKNA 1Y20A 4F3GA 2XXTA 2NOOA 2BJJX 3QAXA 4POXA 4IO3A 3PPOA 1IXGA 3E4RA 1LCFA 2OBGA 4OVJA 5FTIA 3IOTA 2HAUA 4DLDA 2W7YA 2I48A 3IL1B 4RK2A 4QFOA 3C33A 3T9UA 3E3KA 1O7TA 1BTJA 3G7WA 1US4A 1HSEA 1UQWA 1M5BA 3O28A 4ZEDA 3BFUA 4OWDA 1I69A 3FV2A 4C0RA 2O1LA 4GXSB 3PU5A 4GFRA 2DE2A 3VXBA 1TFAA 3ONMA 3PUZE 4ELRA 4Q8RA 3C9HA 1QULA 3CVGA 3K6WA 3FVGA 2RINA 2OLBA 1Y3QA 2ZNTA 2A5SA 4GD5A 2ZYKA 3B7DA 1N76A 5K2YA 3Q26A 1ZU0A 3EHSA 3IOWA 4OHNA 1M5CA 1Q35A 2DXYA 4NE4A 2UXAA 1Y4TA 4GIZA 1NH8A 2XXXA 4KHZE 5ELVA 3I5OA 5DT6A 1LB8A 4E0XA 3DP6A 3A3UA 4MF3A 3VVFA 4FORA 4PFWA 1PC3A 1JW1A 4DXUA 1ZMGA 1ZLQA 1FTJA 3TTNA 4EQ9A 2DQVA 3AXFA 1H3DA 1IXIA 1KWHA 2XX8A 5CI5A 3CR9A 4YICA 3SKPA 2PBWA 5CM6A 1B5HA 2ONSA 3KG2A 2B65A 3K2DA 1PBPA 3Q25A 4OEUA 3MAMA 3W9WA 2Q2AA 4G77A 2GH9A 5DVIA 3MQ9A 1B1HA 2Y84A 3TDJA 4Q30B 4JWOA 3C32A 3W15C 3W9VA 1N0TA 3KJTA 3C34A 4OQOA 1JVXA 4DCYA 1Y3NA 4G68C 4M4GA 4JWXA 2XX9A 4N07A 1R9QA 4R6HA 2RCAA 3LSWA 2OK2A 1MY2A 4YKJA 1Z7ME 4FJPA 1MQIA 2VGQA 5L9SA 2Q2CA 4OYVA 5AA4B 2AL5A 3MVYA 4QFKA 3Q28A 4ESWA 3A09A 3U93A 4G8HA 3PUYE 1LAXA 3QK6A 2Z8DA 5L8DA 4KPTA 2IA4A 4X9TA 1VFDA 3OSQA 2ZYOA 3GLBA 2O69A 1WVJA 1HSLA 1FW0A 4YB5A 3KSXA 3MPKA 5FHOA 1AOVA 3PD9A 4EDPA 4PQJA 5L9OA 1ELJA 1EZ9A 1N7WA 1B40A 2F5XA 4FEDA 3V8XB 3R26A 3OXNA 3T96B 2DE4A 3H03A 4G4PA 2F6GA 4BLAA 1IZ1A 3VLVA 5DEXB 3K6VA 1LBCA 3OO8A 2F7BA 3BBRA 1AMFA 4QFLA 3MVZA 5FHNA 5AA4A 3TKDA 4QFPA 4DXBA 5AA3A 5I57B 1TT1A 2V3UA 1FTKA 4RK9A 3PD8A 3KSJA 4F1VA 3S9LC 4R74A 4GXAA 4XIGQ 2DS9A 3FXQA 3E9XA 1A55A 4KR5A 3OEKA 3Q29A 3RUMA 3UA8A 1DOTA 4PETA 1P1WA 3TODA 4U4XA 3EPEA 5B7DA 1NNKA 2OWSA 2X7PA 3IORA 2Q88A 1B32A 5F1QA 1FTOA 4Q0CA 3LSXA 2HCAA 4ZEKA 4O3AA 2HQ0A 1JNFA 5CRYA 3A3CA 3MWBA 2HZLA 3ILUB 4TLLB 5DEXA 3JZJA 2UVIA 2XXPA 5IKBA 2XXVA 2Y7PA 3RN8A 4DDDA 1SYHA 2QMXA 3M3FA 4JSDA 1MPCA 3USDA 2H25A 5I57A 1FQCA 2V3QA 4F1UA 2I0BA 3LUYA 1XS5A 4F29A 3TQLA 1RKMA 2QS2A 3K0VA 2P2AA 3KN8A 4NF4B 1MQJA 5FTHA 4JXIA 1NH7A 3TTLA 2OWTA 5H8NB 2RF1A 4OFOA 4O3CA 3K1NA 1B7ZA 4KCCA 1MXVA 3ZKLA 3OELA 1LGBC 4KYSA 1EH3A 3FJMA 3FZVA 4GOTA 1B46A 1P1OA 3IO4A 3VVDA 3O97A 3QIMA 3L6HA 4U2RA 1O63A 4BDRA 1Z7NE 4HCWA 4NWDA 5M2VA 5CBSA 1B5JA 1B3EA 2UVGA 3TQWA 2OJTA 2G93A 1BIYA 3PPQA 3D4CA 1H44A 3ZS6A 2F78A 1LAHE 1MQDA 3LBSA 3V5AA 4YU0A 4HW8A 3FUZA 4NF5B 3T9VA 4I9DA 2M8CA 2R9JA 4NF4A 2GHBA 3VXCA 3OSRA 2ZYNA 4H5FA 4GL8A 4KI0E 5H8NA 2QS4A 3ZKKA 2V84A 3FVNA 3OO6A 3QXMA 1S7YA 1B3FA 1PEBA 1ZKBA 1B3LA 3IB2A 3LSLA 3FV1A 1A40A 2F34A 4IO6A 1QKAA 3SDFA 3TTKA 5AA1A 3E13X 3C31A 1MS7A 3RTFB 1BLFA 3DP4A 5EHSA 4P0IA 3CIJA 4YB7A 2PX1A 3EHUA 3N26A 1GGGA 1R1NA 2QMWA 3HHFA 4WEDA 1POY1 1URSA 5KDTB 3PMXA 1IEJA 2QS3A 5I59A 4NF5A 2AYSA 4Q5TA 1XVYA 1A99A 5KZTA 1SD3A 5FHMA 2PMSA 3JV9A 1VE4A 5AE4A 5CC2A 2D5WA 4R6YA 2Y7IA 2VHAA 4R6KA 3EN3A 1QJMA 1M5EA 4IGTA 2I4BA 2O1MA 3ODBA 3G3KA 1MY1A 3TTMA 4GL0A 5LOMA 3MC2A 4PFYA 1POTA 1B05A 4KD5A 3TPAA 3PUVE 4FECA 2I4CA 2LAOA 3HO7A 5KDTA 1TFDA 5JK4A 3RPWA 4ISUA 3G3JA 2ANJA 1FQDA 4ND9A 1IQ7A 2VOZA 4GVOA 3FGSA 3KN7A 2P0SA 1MQGA 4OERA 1B2HA 4JBZA 3Q27A 3LR1A 1H76A 1LB9A 1B0LA 4MFIA 4DZ1A 1LFIA 3KOTA 3RGYA 4UACA 2XHDA 3KZGA 2DSFA 2NXOA 4POWA 3K4UA 1YPNA 1FTLA 4X48A 2Y7RA 5F7VA 2CZLA 5ISUA 4U4SA 1D4NA 3FJGA 4H0WA 4OESA 4ELPA 3S4UA 2E0SA 4HCYA 5H8HB 3K02A 1XOCA 3JYRA 4LQ2A 1URGA 3B6QA 5B70A 4H8IA 1S9TA 1B4HA 1SBPA 1A54A 2Z23A 4YB6A 1XVXA 5I58B 1B9JA 4ZZEA 1DMBA 1Y1MA 4E0WA 4M1VA 1GTKA 3OMBA 3HSTA 2I0CA 2KLFA 2REJA 4MLQA 3O29A 3TCFA 1B4ZA 3IR1A 3T66A 1ZJLA 2R6GE 3FVKA 2I58A 4EQ7A 3HN0A 1FCKA 4KQPA 2F7AA 3ECRA 4I1DA 2VP1A 1N3XA 1JEUA 3QYTA 1B51A 1DPPA 2O51A 3N6TA 4IO5A 4ZZAA 1QUKA 1Y4CA 3U92A 3TMGA 4OFLA 5H8HA 1US5A 2HEUA 5DTBA 2CMOA 2F36A 4NTLA 1USYE 4QRZA 3TTRA 4F3PA 1R6ZA 1XC1A 1SW2A 5I58A 1DTZA 4H1XA 3THIA 3MBPA 3SEYA 1TWYA 4QSEA 2UYFA 1DTGA 2R71A 2I6EA 3P7IA 3N5LA 2DOJA 1YCJA 3K1PA 1B7HA 4EUOA 3CG1A 4XKQA 1VFEA 3MVXA 3B6WA 5ITOA 2G29A 3RT8A 2D3IA 4X1BA 3G3IA 5ITPA 2ZNUA 4U1ZA 1QW0A 4RY1A 4IGRA 1JVYA 2DWJA 2QRYA 4XXUA 3FIRA 4NMYA 2DP8A 4LP2B 1MM6A 1JW4A 3N6UA 4ZEFA 4F1YA 2XXUA 4JSOA 3BKIB 1PBQA 3LC8A 5TU0A 4AB5A 4ECFA 2XXWA 3MZ9A 5DYHA 4KFQA 3C36A 1LFGA 1A7LA 2P1SA 2Q89A 4H6DA 5J1DA 5HBCA 4BDLA 1MPDA 2ABHA 4R2FA 4YMAA 1WDNA 2PT1A 4NEDA 4Z7EA 1JETA 2ZNSA 2DVZA 5L9MA 1ZTYA 4HTGA 3IB1A 3HV1A 2HXWA 2H98A 3H3GA 3SEVA 1MXUA 4DCXA 2OZZA 3IO6A 2A5TB 1FQBA 2PYYA 2F97A 2RC7A 4G68B 4LONB 1QVSA 3GBBA 4JWYA 1XT8A 1OVTA 1OLCA 1MH4A 4H67A 3DLNA 3RY3A 2PVUA 4L17A 4X1DA 1EZOA 2F35A 2O7UA 5JEIA 5H8SA 2H99A 3UN6A 1II5A 4TOZA 4C1UA 5AA2D 2H5YA 3TELA 3TCGA 3UGWA 4LA9A 1MQHA 3O6IA 1LAGE 1LCTA 4Z0IA 3PV0E 3KBRA 3UP9A 1ANFA 3KGCA 3U8QA 3UORA 3FJ7A 3CG3A 3VDFA 3S9NC 3H6TA 4N6PA 1OQHA 1NNPA 2QJEA 4LUBA 3PMWA 2DE3A 4G68A 3H6VA 1NL5A 2DVCA 4RYAA 5KCJB 4P11A 5TPAB 3S9MC 3OOAA 4AB6A 1UTBB 3IJOB 4ZDMA 3T22A 1PDAA 1R9LA 4F2QA 1VR5A 5BUUA 5I2KB 4OFJA 3CRBA 4I62A 1LLSA 3WAFA 1MRPA 5I2NB 2NWJA 5IAIA 4MBPA 4OZ9A 4YKPA 1I6QA 1SYIA 1PB8A 2VD2A 4AQ4A 3PUXE 3M8UA 4GLIA 1UIVA 3MJNA 1Y1ZA 4HS7A 4F3BA 1MY0A 4QFNA 4KYDA 3U72A 2DYXA 1B3HA 1NNFA 3EHTA 2V93A 3HPIA 1IXHA 4H8JA 4BDQA 2X26A 1MG1A 1NNTA 3I3VA 4F31B 2Q9TA 4H65A 1FTMA 4GWOA 2D21A 4G8NA 5KCJA 3DP8A 5TPAA 1M5FA 2GHAA 3RT6B 1UTBA 3OENA 3R6UA 1SVXB 1HSJA 1P1UA 1J1NA 2XD3A 4BDOA 2AL4A 1MXXA 2HFBA 2FNCA 2V25A 5I2KA 3U1OA 4ESXA 2REGA 3S2VA 3CSGA 3SEWA 4IY5A 5DVFA 5I2NA 1P99A 3F11A 3OD7A 2Z8EA 1XHYA 4PE5B 4XKPA 3SEUA 1MPBA 4U22A 1MDQA 1B3GA 1I6BA 1RYOA 1L5TA 1N7XA 1SW1A 3TEPA 3O6HA 2FA7A 2GFEA 2Q8JA 4EXLA 3K6XA 3H06B 1NMUA 4H5GA 3QSLA 4K3FA 3VLUA 3V89B 2HAVA 3IAZA 2XX7A 1M5DA 3PUWE 1IXCA 5I84A 4F18A 3KN3A 4OMBA 2XXQA 4ELOA 1SDXA 1S50A 2ALUA 2I3WA 4F39A 4G8MA 1AH5A 2Y7WA 2QL3A 2DWAA 1OVBA 4YMBA 1EU8A 3FD3A 4XKRA 4U21A 5I56B 1UIUA 5H8FB 4PP0A 1A8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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