3GN3A

Crystal structure of a putative protein-disulfide isomerase from pseudomonas syringae to 2.5a resolution.
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
179
structure length
179
Chain Sequence
MHSDALSWGHGPRLFEVFLEPTCPFSVKAFFKLDDLLAQAGEDNVTVRIRLQSQPWHMFSGVIVRCILAAATLEGGKESAKAVMTAVASHREEFEFEHHAGGPNLDATPNDIIARIERYSGLALAEAFANPELEHAVKWHTKYARQNGIHVSPTFMINGLVQPGMSSGDPVSKWVSDIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a putative protein-disulfide isomerase from Pseudomonas syringae to 2.5A resolution.
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas syringae pv. tomato
molecule keywords putative protein-disulfide isomerase
total genus 65
structure length 179
sequence length 179
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gn3A00
2WULA 1XWBA 3RHBA 4V2NA 1B9XC 4ACSA 1PMTA 2C0GA 1SKSB 2MMAA 2OADA 3QMXA 3DGQA 3UJ1A 1WRYA 3G7YA 4N0VA 1I5GA 2WB9A 3LXTA 4MCUA 4K0NA 5CAXA 3C73A 4K7OA 4Z7XA 1S3DA 2B6MA 3G7JA 1YJ6A 4LL1B 2AUVA 2H0GA 4N30A 4Q5QA 2CQ9A 3I6AA 1ML6A 1R26A 5DCGA 1GRXA 2V41A 4KSOA 4XS6A 3CYNA 1VF1A 2H1DA 3LQ7A 1SK2A 3I9V2 3QAGA 2LQOA 3IDVA 1DE1A 1M2BA 1PQNA 5H5QA 3APSA 3GTUA 2DIZA 3IE3A 1TRVA 4POBA 14GSA 4G9HA 2OBKA 3TKRA 1Z9HA 4TOPA 4ECJA 2BMXA 1NHYA 4KUNA 1X9MB 3FK8A 1T7PB 2D2ZA 1QUWA 1PRXA 2IMDA 1AUCA 2KP1A 4PQIA 3M9KA 5CRHA 4K7IA 2X8GA 1C72A 5CO3A 1B48A 4MP4A 4AJ8A 3NZNA 5AIXA 4F82A 3RBTA 4OFTA 1XWAA 2WDUA 1BJXA 3MWHA 1HNBA 12GSA 1DUGA 1V58A 2DMMA 3IOSA 3UIWA 5A4UA 1OC3A 5IPGA 1AXDA 2OE0A 4F0CA 1QMVA 3FR3A 2DC5A 3O76A 2CAIA 3MSZA 2YJ7A 3ZIVA 1M0UA 3G7IA 6GSUA 1ERUA 2WFCA 1EGRA 2B7KA 3ZRDA 2H6ZA 1K3YA 3HYPA 3PGTA 2VLUA 3N9JA 3N5OA 1XZOA 1ON4A 1QK8A 3UL3A 4HDEA 3F6FA 2L57A 1TJDA 1K0OA 1K0AA 2V6OA 3ZL5A 1R5PA 3FZ4A 1A23A 4NMUA 2PMTA 4Q5FA 1NW2A 2I3YA 4ISDA 3TGZA 3RAZA 3I43A 4MABA 5D9VA 3VI5A 5LCZA 3FZ9A 3U6VA 5JWQB 5LD0A 1GUHA 5JCWA 4ZIJA 3ME7A 1N2AA 2HRNA 3F9UA 5DCHA 3VWXA 4DSQA 3FW2A 3RPPA 2VAFA 4OWYA 1A2JA 3D5JA 2YWNA 5ECKB 3HJPA 1GLQA 4QQ7A 4QL7A 2MBSA 3CSIA 3TKSE 4DEJA 4QL9A 1EOGA 3QFAC 4MF6A 5CNWA 1B9YC 4V1Ag 2K6VA 2DBCA 4V2MA 2E0QA 2H1GA 6GSVA 4YH2A 2RM5A 2GGTA 3LWAA 1A2MA 3ZFBA 3GSSA 1XOAA 2YZHA 3GNJA 4JEDA 3RDWA 1TU7A 2LV3A 2LTKA 4O32A 1VF4A 3M8NA 2VCZA 4WBJA 2P31A 4XRAA 1G0TA 4KCEA 4MJBA 1GTBA 1JLVA 3GIXA 2X8CA 2DMLA 1SJZA 2HE3A 3D4MA 4EDZA 1VRSD 4L0WA 1XIYA 2EIQA 1RK4A 3HHVA 2H6YA 2OKAA 4FYCA 5ECHB 4IGJA 4GTUA 2DJ0A 4KGIA 4CW9A 4RQRA 1YQ1A 3W8SA 1CQGA 1HYUA 1ZYEA 2CV4A 4MH2A 1ZMAA 2VCTA 1OYJA 1SK1A 2L6CA 2LUSA 2WGRA 2N5BA 3ZZXA 1MD4A 4E8EA 1X5EA 1A8YA 4J56E 1A2LA 1GSQA 5AISA 2LEGA 6GSWA 3TKSA 5CYYA 1S3AA 4G10A 4YQUA 1GSUA 1V98A 1TK5B 1OKTA 1TK8B 2CT6A 5B6NA 3P7XA 4XS1A 1K3LA 3ZVJD 2L5OA 2N5FA 4XS4B 2GTUA 4MZCA 2ON7A 2H72A 1GLPA 1Z5YE 3GKKA 2HXKA 5C00A 3KM6A 5J41A 3LGCA 1A8LA 3ZREA 2OE1A 2YP6A 5JCGA 1ACVA 3GL3A 4ZBBA 3IBHA 3AY8A 2K8VA 1EV9A 1BX9A 4HJMA 2FY6A 4G19A 2EIRA 3BBYA 3ED3A 2LRTA 4MH3A 2A2RA 1HNCA 3A5WA 1K0NA 2P5QA 3EMXA 3QDNA 5JWOB 1H75A 5DQSA 3V1WA 3GRXA 3SBCA 3IV4A 13GSA 4K8MA 2A4VA 3L4NA 2H76A 2XBIA 2DIYA 2BTOT 3GYKA 4OO5A 3ZLPA 3APOA 3FKFA 1E2YA 4IJIA 1KNGA 5ECRB 4BVYA 5HR0A 1Z3EA 3C1RA 4GSTA 2BJXA 2NBSA 3FHKA 3ZVJA 1OE8A 5HR2A 6GSXA 2VD0A 3QCPA 2E7PA 4ZILA 5CRGA 1O73A 4BA7A 3LYKA 1MDJA 1X5DA 4WEYA 3VPQA 1O8WA 3TRXA 1CQHA 4L5LA 1PN9A 1G7OA 4EXJA 2AHEA 4EL1A 1AQWA 2RM6A 3E3EA 4MZBA 1FAAA 3D21A 2G2QA 1K0DA 1UVZA 4IVFA 2IL3A 1USBA 3WT2A 4DSRA 2VUPA 2VCQA 4BPYA 1AC1A 4I5QA 4TR1B 5ECLB 4ML1A 5B7CA 3IR4A 1WMJA 2VD1A 4BWQA 1AIUA 3FEUA 3K8NA 10GSA 2IMEA 2LNTA 1XBSA 2TRXA 1OVNA 2WZ9A 1OC9A 4YQMA 2LJRA 2XBQA 5H5SA 1J9BA 5F0GA 4NAXA 3Q19A 1XVQA 2GT5A 1B4PA 3L9UA 1F2EA 2M72A 2MMZA 1A24A 2K18A 2V2GA 3F63A 2DSAA 1QFNA 1FOVA 2WRTA 4ZL9A 3LJRA 3CTGA 1QQ2A 3F3RA 5G5EA 2F3MA 3S9FA 4Q5RA 4KW6A 4WR5A 1XXUA 1B8XA 2CVDA 1JHBA 3UMAA 5INYA 4JRRA 5ECIB 5F07A 3KMNA 5COHA 3F8UA 3EU4A 4KNDA 5KN1A 1XW9A 3DRNA 5GSTA 3GX8A 3GMFA 4ZL7A 3BJ5A 3GV1A 3ZMLA 1K0MA 5HR1A 1OC8A 4D73A 1TW9A 5CRDA 19GSA 2YWMA 2AJQB 2H75A 3KTBA 4ZXGA 3H4KA 3UBLA 4XS4A 4H86A 4X43A 3F4RA 5IMCA 2VO4A 1MD3A 2LQQA 4MJEA 2V6KA 1M7TA 6GSYA 3U5RE 4PUFC 1VF2A 2X99A 5ECPB 1TI1A 3TJJA 4WF5A 3VWVA 1OE7A 3TOUA 1N8JA 1TU8A 1XCCA 5KN0A 2F51A 1F37A 3GH9A 3H79A 1FG4A 1J0FA 1X9WB 3TDGA 5J9CA 5IIZA 2C0DA 5G31A 3EWLA 4TXOA 5C04A 1RQMA 2LRNA 4RQXA 1LBKA 4GQFA 3ZMKA 2MMOA 2FCHA 2L6DA 3D22A 1ERTA 2R4VA 2C80A 4V2LA 2FNOA 3ERGA 4OCFA 4MJAA 1O85A 3KZQA 2GZZA 5ID2B 4IP6A 4L0UA 1R5AA 1G7EA 1PGTA 2B5XA 4EC0A 5CRWA 2CZ3A 5ECOB 2PN8A 3UAPA 1MDIA 1X0RA 3HCZA 1TTZA 2R3XA 2GZYA 1T1VA 1T3BA 5IOWA 5HR3A 5CREA 3EYTA 5IMAA 2MMNA 2QSIA 5J5NA 5DJMA 2B5EA 3IAS2 5KEJA 3TJKA 1A0FA 4GSSA 5EPFA 3CSHA 5DJLA 3C8EA 5D73A 4J2FA 2VOCA 4K1FA 1S3CA 5HFIA 2AV4A 1PD21 5ECMB 3LSZA 1R4WA 4ZB8A 2GS3A 1HD2A 2XC2A 2C3TA 1PL1A 4PURA 5DALB 1PSQA 1EOHA 1ZOFA 4PQHA 1ZL9A 4TKYA 5HFKA 2B1KA 3A3TA 3HVSA 4EF0A 1OAZA 1DE2A 4J57E 3Q18A 4HU7A 1JZRA 2OBIA 1UN2A 4TR1A 3VI7A 2L4QA 3DYRA 5AGYA 5KN3A 1KTEA 2HI7A 2R5GA 4EDYA 3A2XA 3VK9A 1GSFA 3TUEA 1THOA 3KP9A 3QD9A 4HEA2 1ST9A 4AF2A 3UEMA 1EV4A 4ECCA 2PUKC 5IMDA 2L5LA 2LKUA 4IW9A 1V57A 4CHSA 2C8UA 1SD9A 2IMKA 2GSTA 5HQPA 1V2AA 2DJKA 5A4WA 1PL2A 2JACA 2VM2A 2NTOA 2FLSA 2JADA 3NIVA 3EURA 4FO5A 1VGLA 1GTIA 2L59A 1OC9B 4OFNA 5GZZB 3MAKA 1NSWA 4HUAA 3KTLA 2O85A 4PXOA 4G2EA 1U6TA 1XOBA 1FO5A 1U3AA 4F9ZA 5IOXA 5B8BA 3BCIA 2M46A 4LLRA 4WF4A 1T00A 4PNFA 4MF7A 3LFLA 1O8XA 1URMA 5G1KA 1SL0B 3FR6A 3QFBC 2YNXA 1FW1A 2H71A 2IWTA 5F8BA 4F2IA 5FWGA 1XW6A 2VCWA 2CA8A 3TB2A 2HFDA 3DD3A 3TKSC 2CVKA 2HZEA 4OFMA 2DJ2A 2DJJA 4KSMA 3GN3A 1GSYA 2YPMA 3CMIA 3W6GA 2NPBA 4TR3A 1YF0A 2C0EA 3QAVA 5IMFA 3TCOA 3GSTA 3QR6A 2M80A 3CSJA 4D73B 4O92A 4X1UA 5FT3A 3MDKA 3UVHA 3H1NA 2NDOA 2KLXA 2TRCP 3IPZA 3KEBA 3KH9A 1T4ZA 3PR8A 3IHQA 3WGDA 2AYTA 5DBQA 1NM3A 1GWCA 1GTAA 2K8SA 4RI7A 1PX6A 2DLXA 1FVJA 3CBUA 4EE0A 3HY2A 4WBRD 3JCML 4TR0A 3Q74A 3GURA 4JU5A 3F3QA 4I97A 1SYXA 3C7MA 3H8QA 1M9BA 2YWIA 3WGXA 1WIKA 3FY7A 2DJ1A 7GSSA 2F8AA 1AQVA 5G1LA 1E6BA 2J9HA 4IBPA 2X8HA 3TRQA 1XWKA 1XPVA 4IQAA 4LMWA 4BVXA 4IS0A 2LNSA 1YEPA 3L78A 1YF1A 1F9MA 2LJAA 3UBKA 5ID2A 5DAKA 5FHIA 2PU9C 5D9XA 4TXOB 3GL5A 3UVTA 2CAQA 2IJYA 1JFUA 1WP0A 2PVQA 4HU9A 2YWOA 3TJFA 4AGSA 3FR9A 2H73A 2VLVA 2L4CA 1FB0A 3RHCA 2LJKA 2IMFA 2O7KA 3HZ4A 4XCSA 5B6MA 1JZWA 4ZL8A 1X5CA 4TRXA 4F03A 1GP1A 2YZUA 3IA1A 3TKPA 2H66A 5DALA 1F3AA 2RIIA 1TDIA 5IMZA 2DJ3A 1G6YA 4BL7A 1ILOA 2LS5A 2GSQA 4L8EA 2PPTA 4N0ZA 1IYIA 4X0XA 4TW5A 3MNGA 5GAPD 2LSTA 3VWUA 3IC4A 5KN2A 4OMVA 5D8IA 1ZZYA 3GFKA 1YZXA 4KAEA 2GZPA 1BQ7A 4K0GA 2FGXA 2VCXA 3VPTA 2ALBA 1JLWA 1K0CA 3D4TA 3FZAA 2JSYA 4GCIA 1WWJA 1GNWA 4TR4A 1K0BA 3LYPA 4MZWA 2GQMA 4HQZA 2F8FA 1EGOA 3M1GA 4PNGA 5F05A 5J3RA 2VL2A 1Z6NA 1ABAA 3QOUA 2ES7A 4GWRA 5IO2A 3R2QA 3DMLA 2C0FA 4HQSA 3GH6A 4WETA 2H1BA 3WGEA 2PWJA 1EEJA 3KD0A 4L5OA 3HXSA 1X9SB 4ZB9A 2GLRA 5G5FA 1AW9A 1EWXA 2JZTA 2PVOC 3DVXA 2REMA 3GKMA 3SWLA 2O89A 2CX4A 1EZKA 1UC7A 4JR4A 4WR4A 4HZ4A 2FWHA 2JZSA 1K3OA 2IN3A 3EE2A 4MDCA 1MDKA 3E9JB 4NXIA 1EP8A 5D9WA 2WCIA 1ZYQB 4EUYA 4N10A 1YDKA 2LRCA 4O7HA 4ID0A 1SYRA 1TI3A 2JL4A 3G9BA 2IMIA 1WE0A 1AQXA 1SKWB 3KIJA 3LG6A 2GQKA 2YV9A 1TK0B 2YCDA 1SU9A 1ERWA 4I6XA 2A2SA 2HZEB 4K2DA 2TIRA 2J23A 2FHEA 3FRCA 1GUMA 4NPBA 2H70A 4E8HA 1U87A 1MEKA 4WKWA 1M2DA 1ZGNA 4KDUA 6GSSA 5J4UA 4I2UA 4ML6A 1R7HA 20GSA 2E2GA 1PX7A 3DXBA 3GX0A 3F0IA 2FWGA 4XHMA 1VF3A 2IFQA 3A2VA 3DKSA 3KXOA 1F3BA 1SD8A 2K9FA 4DSSB 1M9AA 3KCMA 1I9DA 1ERVA 4MMMA 1RW1A 2JZRA 2HNLA 2RLIA 1FB6A 3EMPA 1TRSA 2XPEA 1WOUA 1Y25A 3EVIA 4FH8A 5B8AA 2ZCTA 1SL1B 1BAYA 2CZ2A 3M9JA 4JR6A 1WJKA 1TRWA 1XWCA 2PERA 5ELGA 1T8EB 3HVXA 1T4YA 2KOKA 1ZCPA 4NHZA 1PA3A 1PKZA 1JZDA 4POMA 4IQ1A 4RI6A 2I9HA 5DAKB 5L71A 2B5YA 3RPNA 5JWRB 5F06A 2E2MA 4WXTA 2MBTA 3US3A 3KH7A 3CXGA 4EKZA 4ULXA 5E4WA 3HD5A 1M99A 2QGVA 3HA9A 2KP2A 1GH2A 2FWFA 4XRDA 4GF0A 4K9ZA 3ERFA 2R37A 5DVBA 2GSSA 4NWYA 5A4VA 5IPHA 5J9BA 3ZITA 4KCAA 2EC4A 3A2WA 1KEBA 1HNAA 5D96A 3BCKA 2FA8A 4KA0A 2P5RA 2RUEA 2N5AA 3CTFA 3ZFLA 4ECIA 3UARA 4BWSA 3VWWA 4OD7A 4CDOA 3IK7A 3WT1A 6GSTA 3L0HA 2JU5A 5G2ZA 3KP8A 4YAPA 1AAZA 2YN1A 3ZIJA 3HJMA 1TKDB 1DSBA 2X64A 5EY6A 4AJ6A 2YV7A 4HOJA 1GUKA 3TKQA 3WD6A 1BEDA 3L9VA 2GSRA 2OJLA 2HLSA 3NOFA 3OR5A 3LXZA 4ILFA 2B7JA 2JSZA 3PINA 3DVWA 3HJOA 3DEXA 3O6TA 4YAVA 5ELAA 4LL4B 4ZB6A 4NHWA 3E0UA 4ZBDA 2H0IA 9GSSA 4Q5NA 4MF5A 1KBNA 4FYBA 1EP7A 1OKDA 2QC7A 1V9WA 5G30A 1SENA 5EL8A 1SK0A 2VM1A 2NVLA 1Z6MA 3DWVA 1U3IA 3F4SA 4GXZA 3TJGA 3C1SA 3J7Yk 4HJ2A 3CRUA 3IK9A 2FA4A 3IRAA 4XTSA 2P0GA 1MTCA 2I81A 4PQ1A 4YQVA 3FZ5A 4GLTA 4FYUA 3H93A 5AN1A 1W89A 2PBJA 5GSSA 3TRPA 5GAND 3KMOA 4I2TA 4PUAA 3GUSA 5D93A 3BOAA 2QKEA 3KJYA 2YANA 2O8VB 3QPMA 4IP1A 1FHEA 4MLYA 1J08A 4KB3A 1Q4JA 2IIYA 1TRUA 4V1Ap 4GSNA 2FD3A 4TVEA 1B4QA 2R2JA 4JE1A 4EVMA 2ON5A 4XIHA 4TN8A 4IELA 4DSSA 2Z9SA 18GSA 2YOIA 4ECBA 4KX4A 5ECSA 2I4AA 1Q98A 2HSYA 1XFLA 1NHOA 3VURA 2WJUA 4RUVA 2HRFA 2OE3A 2CX3A 4F0BA 2GDRA 1GTUA 2IPAA 4MK3A 3LEFA 1IYHA 5DQYA 3DIEA 2HSHA 2FUG2 2H0HA 1SKRB 2CVBA 2VCVA 1GSDA 1GL8A 2IFQB 1M2AA 3BD2A 1Z7RA 4PGTA 1F6MC 4JBBA 4O5RA 5IM9A 3TJBA 4K6XA 3VFIA 3ISOA 1SJIA 5IO0A 4MPGA 4OCEA 2H6XA 4K7NA 1G6WA 1LU4A 1GSEA 2H8LA 3HDCA 2KUCA 4JZQA 1QXHA 1BG5A 4KDYA 5ENUA 3EC3A 3UOMA 17GSA 2AB6A 5IQYA 3GTUB 2H1AA 5A5KA 1YKAA 4EO3A 2B1LA 3Q6OA 2HT9A 1WPIA 3CRTA 4NV5A 3ZTLA 2C3NA 2H19A 3ERWA 4IN0A 4HI7A 2R6KA 1TP9A 2KHPA 5AIVA 2G0FA 1GNEA 4IHUA 3O3TA 2ZNMA 2C1YA 3KGKA 1H4OA 3ZYWA 1BYEA 3F6DA 1XWGA 2VIMA 2EIOA 3EU3A 2F9SA 3W8JA 1U88A 1QGVA 2PGTA 1SL2B 4KH7A 4FIWA 3P8WA 3L9SA 4N11A 1EEMA 1W4VA 1A0RP 3QAWA 8GSSA 1DBYA 22GSA 4DVCA 2VLTA 4MPFA 2H74A 5ABRA 1SJ6A 1TXXA 3VLNA 5IMVA 1HQOA 1O81A 2VL2C 2MYGA 5JCUA 1UA5A 2VL9A 1Z7PA 3F4TA 2HZFA 3C71A 3PH9A 5EVOA 2GVPA 4GQCA 4KE3A 4PX1A 2C4JA 4KDXA 2C3QA 11GSA 2I1UA 1JZOA 3TOTA 5DDLA 3HKRA 4LA1A 3HZ8A 2WS2A 4LMVA 4P3YB 1YEXA 3M3MA 4IKHA 1LJRA 2B3SA 4TXVA 3LORA 5ECQB 16GSA 3I69A 1Y6EA 2XHFA 1XW5A 2ZUPA 3GKXA 5ECNB 4ZBAA 3D6IA 3IAM2 1O6JA 4MJCA 3GKNA 5LNKe 3GA4A 2FWEA 3APQA 3P90A 3FYGA 1O7UA 5HFGA 2OACA 1YY7A 4GRFA 4OO4A 4IJ3A 4NV2A 5D9TA 2YJHA 1TOFA 2H30A 3D0ZA 5E59A 5H5RA 2OA7A 2H01A 2O87A 3HVVA 4HS1A 1V40A 1XVWA 3J7Yb 4POKA 3WYWA 2GT6A 4HZ2A 2HYXA 2VL3A 2V32A 2RUFA 4MA9A 4I8BA 4AJ7A 2GQLA 2V1MA 3ME8A 2XPDA 3IXRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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