The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTAEEKSLVSGLWGKVNVDEVGGEALGRLLIVYPWTQRFFDSFGDLSTPDAVMSNAKVKAHGKKVLNSFSDGLKNLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFKLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPQVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of dog (Canis familiaris) hemoglobin
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-03-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ITH A; 1V9Q A; 1Y0A A; 5EET A; 2RAO A; 1J7W B; 3O7N A; 3GDJ B; 5HLX A; 1J40 A; 2AUP A; 3K9Z A; 1FAW A; 3ZJR A; 2ZT2 A; 4M4A A; 1QXE B; 1B86 B; 1Z8U B; 3BOM B; 1XXT A; 1YEU B; 5JOM A; 3ECZ A; 4U8U C; 5SW7 A; 2WTH A; 4FWZ A; 1FHJ B; 1CH2 A; 1Y5K B; 1CLS B; 2ZLW B; 5EYS A; 4VHB A; 1MBO A; 1HBA B; 5EUI A; 4MQC A; 3D1K B; 1CBM A; 1YOG A; 1NWN A; 1CO8 A; 1URY A; 2V1F A; 2O58 X; 1J41 B; 1A00 A; 1HCO A; 1MWD A; 4MBA A; 1XZ7 B; 1DWT A; 2OH9 A; 4XS0 B; 3G46 A; 1LFZ A; 2D2N D; 2ZS1 A; 1CH1 A; 1FSX B; 2VLZ A; 4DWT A; 1BUW B; 1LFL B; 3FH9 A; 3LR7 A; 1SDK B; 106M A; 1XZ2 B; 3LB3 A; 1G9V A; 107M A; 2QFN A; 1MLL A; 1HDA A; 2D2N B; 5EE4 D; 1Y0T A; 2V1J A; 4NI0 A; 3G4Q A; 1GBV B; 2D2M A; 3UH6 A; 3QJE B; 1OUU B; 3NML A; 3D17 B; 4ODC A; 2ZS0 C; 1ABW B; 1NS6 B; 2MB5 A; 3WFX A; 2BK9 A; 3OJ1 A; 2Z6S A; 2ZSY A; 1S56 A; 3D7O B; 1G0B B; 1QI8 B; 3WCT B; 5F0B A; 2GRZ A; 1Y4G B; 4YU3 B; 3DHT A; 1DO3 A; 4N7O B; 3WCU D; 2ZSR A; 1YG5 B; 1YIH B; 3AT6 B; 1CMY B; 4F6J A; 2QFK A; 2ZLT A; 1N9F A; 2W72 C; 3UHC A; 1SI4 B; 1BVD A; 2NRL A; 1DO1 A; 1MLG A; 1YEQ A; 2MGD A; 2G0V A; 3WCU B; 1CH9 A; 1MNI A; 3U3E A; 1IWH B; 2HBG A; 1Y7C B; 1XZV A; 2R50 A; 1JZK A; 1QSI B; 1AJH A; 5CN8 A; 2XYK A; 1UC3 A; 1HAC A; 1Y0W A; 1AZI A; 1MBC A; 1UT0 A; 1YHU C; 1BVC A; 3UHD A; 4QAU A; 2GTL A; 2O5Q X; 3ZJN A; 2EVK A; 2DC3 A; 3S1I A; 3GQG A; 2O5T X; 1WLA A; 3G4R A; 2ZLV A; 1Y4V A; 3QM7 A; 1O1N B; 3EOK A; 1XY0 B; 1G0A B; 3A5A A; 1XYE A; 2MYD A; 5JDO C; 1K1K B; 1BZ0 A; 1O1I A; 2D5Z A; 1NPG A; 1OUT A; 1JL6 A; 1J3Z A; 2CMM A; 4L7Y B; 3ZJS A; 4FC3 B; 1NAZ A; 3GQP B; 4MPM A; 5CHQ A; 2MBW A; 3ZJM A; 2IN4 A; 1LTW A; 2LH3 A; 1DLW A; 2AV0 A; 3DR9 A; 1X9F D; 3IC2 A; 1RTE A; 3DUT A; 3ZJI A; 1MLS A; 1NEJ B; 1SPG A; 2PGH B; 2VHB A; 2FRI X; 3HHB A; 3NG6 A; 4MQG A; 1YGF A; 1HLB A; 2QU0 A; 3ZJJ A; 3WCW A; 1X9F B; 1HBH B; 1C7B A; 4LPI A; 3GK9 A; 3QZZ A; 3ORD A; 1FLP A; 5HAV A; 3QJD A; 4NXA A; 4MXL A; 1LH7 A; 2XKI A; 1BZ1 B; 1Y0A B; 1MTJ A; 111M A; 1OFJ A; 2RAO B; 1DWR A; 3ONZ B; 3DHR A; 1Y5F A; 1J40 B; 1FAW B; 5EOH A; 1LH6 A; 1Y85 A; 4M4A B; 3M3B A; 1MLM A; 1JY7 A; 1XXT B; 1YE2 A; 2HBS A; 1BZP A; 2FRF A; 1IRC A; 2LH2 A; 2FAL A; 1YEO A; 1JZM A; 5EUI B; 4MQC B; 1IT3 A; 2ZS1 D; 3GDJ A; 1NWI A; 1LH2 A; 2IG3 A; 1A00 B; 1HCO B; 3HRW A; 1Y8I A; 1CG8 A; 1LFZ B; 1V4W A; 1YDZ A; 3UHI A; 2GRH A; 2B7H A; 2D2M D; 4O2G A; 3FH9 B; 5MBA A; 3QJB A; 3D1K A; 5D1V A; 4MBN A; 2HBE B; 1EBT A; 1G9V B; 4FH6 A; 2BLI A; 3WFT A; 1HDA B; 1Y0T B; 2MGM A; 3VRF A; 1N9I A; 1MOC A; 3KUO A; 4NI0 B; 3WI8 A; 2D2M B; 2AUQ A; 1YVQ A; 1XZU A; 2GRF A; 4YU4 A; 1Q1F A; 4ODC B; 2GL3 A; 3IXF A; 3PI9 B; 1DKE A; 1KFR A; 3TM9 A; 3QM9 A; 1YMA A; 1CH7 A; 1BUW A; 2ZT3 A; 1NS9 A; 3DHT B; 3OK5 A; 1MLH A; 1MBD A; 3MKB B; 2MGK A; 1LH5 A; 1IOP A; 1MLR A; 1HAB B; 2ZLT B; 2W6X A; 1MWB A; 3OO4 A; 3D17 A; 2MYE A; 1XQ5 A; 2AUR A; 3UH5 A; 1YEQ B; 3HEP A; 4L2M A; 1UX9 A; 1HDS A; 5CNB A; 4ZVA A; 1HGB A; 3HXN A; 3AG0 A; 3AT5 B; 3M39 A; 2EKU A; 1QI8 A; 3WCT A; 4H2L A; 1XZV B; 3UHG A; 4N7N A; 2C0K A; 3B75 A; 5ILE A; 2GTL D; 4N7O A; 3A5G A; 1YG5 A; 3WCV A; 1R1X A; 2LH1 A; 1O1K A; 2MGA A; 1YHE A; 2HZ1 A; 1O1J A; 1O16 A; 1Y7Z A; 1Y0W B; 3ODQ A; 2GTL B; 3LB1 A; 1MOD A; 2AUO A; 5E6E A; 3GQG B; 2ZLV B; 1Y4V B; 3EOK B; 2ZLX B; 1CP0 A; 1MBS A; 1XYE B; 3UHZ A; 2BWH A; 1FSL A; 1QSI A; 1BZ0 B; 1LFY B; 2WY4 A; 2ZT0 A; 4PQC A; 1O1I B; 1OUT B; 2G10 A; 1YGD A; 3UI0 A; 1J3Z B; 2R80 B; 4OOD A; 5CMV A; 4HSW A; 2EF2 A; 2GLN A; 4SDH A; 1DTM A; 1DXD A; 1JEB A; 2ZLU B; 3EDA A; 3WCW D; 1LA6 A; 3EDB A; 5EYJ A; 3DUT B; 5HU6 A; 1SPG B; 3LHB A; 1A0Z A; 1XY0 A; 2DN1 A; 4TYX A; 5B84 A; 4MQK A; 3HHB B; 3NG6 B; 1J7Y A; 4MQG B; 1NIH A; 1UX8 A; 1YGF B; 3MVC A; 1GDI A; 3WCW B; 1C7B B; 4MXK A; 109M A; 1MBA A; 1Y8K B; 3GOU A; 1LFQ A; 5C6Y A; 1Y8H A; 1IDR A; 2RI4 A; 1Y7D B; 1HBB A; 5MBN A; 2JHO A; 3DHR B; 1Y5F B; 6HBW A; 1N9H A; 3UHT A; 3HEO A; 1Y85 B; 2PGH A; 3BA2 A; 1O1P B; 4XDI A; 1JY7 B; 5AZR A; 2MGH A; 1N9X A; 2SPL A; 4JAC A; 1HBH A; 2ZSP A; 3AQ6 A; 2HBS B; 2W6Y A; 4F6F A; 5CN4 A; 1CG5 A; 2G3H A; 5CNF A; 2QLS A; 1YEO B; 2ZFO C; 1BZ1 A; 2VYW A; 3WFW A; 3MBA A; 2WTG A; 2VLY A; 1L2K A; 3ONZ A; 4NK1 A; 3UHS A; 4MAX A; 1Y22 A; 5EU2 A; 3EU1 A; 4X0L A; 1Y0D B; 1SWM A; 4KMV A; 3HRW B; 1KR7 A; 1Y8I B; 1CG8 B; 1V4W B; 3G4Y A; 1YDZ B; 3GKT A; 3MYN A; 4MU5 A; 3D1A A; 2B7H B; 4TWU A; 3IC0 A; 1FDH A; 3QJB B; 2MGC A; 1J7S A; 1Y4Q A; 1YH9 B; 4TWV A; 1D8U A; 4HRT A; 5EE4 C; 3VRF B; 1MTI A; 1A9W A; 1YVQ B; 1XZU B; 4YU4 B; 2W6V A; 1J52 A; 4AVD A; 3ECL A; 3ECX A; 1C7C A; 2FRJ X; 1DKE B; 2EB8 A; 1S69 A; 1K0Y A; 1NZ3 A; 3G4U A; 5CHR A; 2DN3 A; 4ESA A; 1Y83 A; 1NS9 B; 1THB A; 1YMB A; 1JP9 A; 1XZ4 A; 2W6W A; 1SDL A; 2HBE A; 3GLN A; 1SHR A; 2BKM A; 5AZQ A; 1Y2Z A; 1YEV B; 2H8F A; 3WCT D; 1VHB A; 4WJG 1; 1W92 A; 2O5M X; 3OO4 B; 2OH8 A; 3LB2 A; 1HGA B; 1XQ5 B; 3OGB A; 3PI9 A; 1MNK A; 3M3A A; 1HDS B; 3WCV D; 1HGB B; 3HXN B; 4F6B A; 4U8U B; 2HBC B; 4H2L B; 1A6K A; 1GZX A; 4N7N B; 2BNL A; 1CPW A; 1HBS A; 3B75 B; 4HHB A; 1Y35 A; 2MGL A; 1ECD A; 1JDO A; 1PMB A; 2ZSX A; 2LHB A; 3WCV B; 1R1X B; 1O1K B; 3MKB A; 5E83 B; 1CO9 A; 1YHE B; 2O5O X; 1O1J B; 1Y7Z B; 1HAB A; 1MYF A; 4WCH D; 1Y45 A; 1CH4 A; 1YCB A; 4NXC A; 3ODQ B; 1Y8W A; 1WVP A; 2OLP A; 5E6E B; 1MNJ A; 1UIW A; 4ZVB A; 1HGC A; 2MGJ A; 1MOA A; 1EMY A; 3AT5 A; 3A59 A; 4N8T A; 3ZJL A; 1BJE A; 4JYQ A; 1YGD B; 5KDQ A; 3D4X A; 1DXV A; 2O5B X; 2QRW A; 3ZH0 A; 1MYG A; 1DXT A; 1HRM A; 1HHO B; 3ASE A; 4FWX A; 1JEB B; 5HY8 B; 2ZSZ A; 1LA6 B; 1X9F C; 3QZX A; 5C6E A; 3W4U A; 1GVH A; 3BJ1 A; 1Y09 A; 5HU6 B; 1A0Z B; 2ZLX A; 3PIA A; 2DN1 B; 2D60 A; 4O4T A; 4B3W A; 1C7D A; 1UMO A; 3V2Z A; 2ZT4 A; 4MQK B; 1J7Y B; 1A0U A; 1NIH B; 1F63 A; 2Z85 A; 1LFY A; 1JPB A; 2R80 A; 2HHD B; 3GOU B; 1LFQ B; 3ARJ A; 1Y8H B; 2RI4 B; 1S0H A; 3A5B A; 1JL7 A; 5M3S A; 2V1E A; 1YCA A; 2DXM A; 2ZLU A; 1HBB B; 2NX0 A; 5HLQ A; 2OHA A; 1AJG A; 3CY5 B; 1MYT A; 6HBW B; 1NQP A; 4UUR A; 2GDM A; 1HBR A; 3ED9 A; 2NSR A; 1VXD A; 2R4W A; 3MJU A; 1PBX A; 5AB8 A; 1ECN A; 2AA1 A; 4AVE A; 1LHT A; 2QSP A; 4KJT A; 3FS4 B; 1CG5 B; 1Y8K A; 3P5Q B; 3QM6 A; 1RPS A; 1A01 A; 3GQR A; 2QLS B; 3UBC A; 1OFK A; 5JDO D; 4M4B A; 1Y7D A; 4DWU A; 2ZS1 C; 1MOH A; 1Y22 B; 1CIO A; 3EU1 B; 4X0L B; 1RVW A; 1O1P A; 3PT7 A; 1CBL A; 1ASH A; 2OIF A; 3MN0 A; 3UHQ A; 3BJ3 A; 3WTG B; 1MKO A; 2R4Y A; 1NZ5 A; 3V2V A; 5CN9 A; 3D1A B; 4NS2 A; 2MGG A; 2D2M C; 1V07 A; 3IC0 B; 1GCW A; 4MQH A; 1J7S B; 1Y4Q B; 5JGG A; 1HDB A; 2MGE A; 3S65 B; 4F4O A; 5ILR A; 1OR4 A; 1A3N A; 4HRT B; 1V4U A; 1M6M A; 1NZ4 A; 1G08 A; 1GBU A; 2H8D A; 1Y0D A; 2HZ2 A; 1JZL A; 2W6V B; 5ILM A; 2E2Y A; 1IT2 A; 1C7C B; 3SDH A; 3G4W A; 2MYC A; 1K0Y B; 3UHV A; 4F68 A; 4ROM B; 4F6G A; 2DN3 B; 4ESA B; 1Y83 B; 1THB B; 1XZ4 B; 1SDL B; 1YH9 A; 1RQ4 A; 1J3F A; 4IRO B; 1SHR B; 3G52 A; 1MLJ A; 1Y2Z B; 1RSE A; 1I3E A; 2H8F B; 1UFP A; 1MYJ A; 3UHX A; 1MTK A; 1MYI A; 3HYU A; 2GKN A; 3LR9 A; 5CN5 A; 1MOB A; 2KSC A; 2AV3 A; 2MGI A; 1GLI A; 1Y01 B; 1UFJ A; 105M A; 1MLF A; 3R0G A; 1GZX B; 1HBS B; 4HHB B; 2ZFO A; 2GTL C; 1Y35 B; 1Y4R A; 2YRS A; 1VXB A; 5IKS A; 1EBC A; 1YEV A; 4FH7 A; 5KKK A; 1Y45 B; 3HF4 A; 3VHB A; 3PI1 A; 3VRG A; 1YEN A; 1HGA A; 1QPW A; 1Y8W B; 2HBF A; 2V1H A; 1LH1 A; 1UIW B; 1HGC B; 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3QQQ A; 1VXC A; 3BJ3 B; 1MKO B; 5D5R A; 3FS4 A; 2NRM A; 3P5Q A; 2GNV A; 3UH7 A; 1GCW B; 4MQH B; 102M A; 1YHU A; 3UBV A; 1G09 A; 1LJW A; 5JGG B; 1HDB B; 1GCV A; 4F4O B; 3BCQ A; 1LFV A; 1A3N B; 1MBI A; 1KD2 A; 1V4U B; 4O35 A; 1HLM A; 3VAU A; 1G08 B; 1GBU B; 3UGZ A; 1BAB A; 1CQX A; 2H8D B; 1O1M A; 2R4Z A; 1SPE A; 3CIU B; 3WTG A; 2D2N C; 1NPF A; 1MNH A; 1QXD A; 2HBD A; 1DO7 A; 2VRY A; 3OZV A; 4B4Y A; 1HBI A; 1RQ4 B; 2G0S A; 3S65 A; 3O89 A; 3AQ7 A; 1JW8 A; 1MLU A; 1HJT A; 3WCT C; 3QQR A; 1S5X A; 1AJ9 B; 3HYU B; 1GDJ A; 2ZFO D; 3UHK A; 5JDO F; 1V5H A; 2QSS A; 2GNW A; 3E5I A; 3ZOM A; 3WCV C; 2EVP A; 1GLI B; 4KMW A; 108M A; 2Z6N A; 1V75 A; 4ROM A; 1VWT A; 2ZFO B; 1Y46 A; 5CNE A; 3WCU C; 1Y4R B; 2YRS B; 4O4Z A; 4IRO A; 5F2A A; 1ECA A; 1TES A; 3LB4 A; 3TLD A; 4U8U D; 3KMF C; 3HF4 B; 4F69 A; 5KER A; 4HRR A; 4ILZ A; 3VRG B; 1YEN B; 3QM5 A; 1QPW B; 1VXG A; 2HBF B; 1LFT A; 4G51 A; 4OF9 A; 3MJP B; 3SZK B; 4WJG A; 1YMC A; 1Y7G B; 1XZ5 A; 1RQA B; 1U7S A; 1WMU B; 2LH7 A; 2ZT1 A; 1FDH G; 3UHB A; 3K8B B; 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