The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
b'VTLFVALYDYEAITEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
11
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LQW A; 1X43 A; 3NGP A; 2M0Y A; 1NYF A; 3M0T A; 4J9I A; 2C0T A; 3EGU A; 1JXM A; 4OMM A; 5GJV B; 1MV3 A; 1WX6 A; 1OOT A; 2DM1 A; 1GBQ A; 2J6O A; 2KT1 A; 1PNJ A; 4JZ4 A; 2LNH B; 2O2O A; 1FYN A; 1UEC A; 1Z9Z A; 2MOX A; 4D8D A; 2HBW A; 2JM8 A; 1RI9 A; 2DL3 A; 1AOJ A; 3I9Q A; 1YWO A; 1JEG A; 5FWC A; 2X3W D; 3NPF A; 4LN2 A; 2GTO A; 4AG2 C; 4F14 A; 4Z89 A; 2DE0 X; 1YCS B; 4IIM A; 1CSK A; 2O9V A; 1VYU A; 2YUQ A; 2EPD A; 3SEM A; 1W6X A; 3EHQ A; 2DIL A; 4HCK A; 1OPK A; 1SRM A; 5IHI A; 3VS4 A; 2EYZ A; 1NEG A; 1X27 A; 5IXF A; 5EC7 A; 2K9G A; 2LQN A; 1UJ0 A; 2NUZ A; 2DNU A; 3FJ5 A; 2KYB A; 1AWW A; 1ZUU A; 1OEB A; 2ABL A; 2X3X D; 1UHF A; 4HXJ A; 1K1Z A; 3H0F A; 1M3C A; 2BZ8 A; 2M51 A; 2EVR A; 1YWP A; 1BU1 A; 4JZ3 A; 4F17 A; 2KE9 A; 3EHR A; 4RTZ A; 4R0K A; 2I0N A; 5I11 A; 2RMO A; 3A98 A; 2RQT A; 2PZ1 A; 2KXC A; 3QWX X; 1SSH A; 2CUB A; 1WFW A; 2ROL A; 2HSP A; 1EFN A; 4F16 A; 2RPN A; 1HD3 A; 2F2V A; 2VVK A; 5IH2 A; 1UJY A; 4JJC A; 2J7I A; 2A28 A; 3TSZ A; 1FMK A; 3LH5 A; 2DJQ A; 4A63 B; 4ZNX A; 3R6N A; 1NLP C; 1I0C A; 4J9F A; 2A37 A; 1JU5 C; 2LJ0 A; 2YUO A; 1X69 A; 2RQV A; 2ED1 A; 1M30 A; 2FPF A; 2KRS A; 3GBQ A; 3REA B; 2J06 A; 2RQR A; 1YP5 A; 4RTY A; 1LCK A; 5L23 A; 2GNC A; 2RQU A; 2CSQ A; 4QT7 A; 1TG0 A; 2HDA A; 2LCS A; 3VS6 A; 1KIK A; 2FG0 A; 4HVU A; 2SEM A; 1SHF A; 4LE9 A; 2DX1 A; 2DL5 A; 2O88 A; 3TSW A; 1WXU A; 1J3T A; 1M3A A; 4OMQ A; 1GCQ C; 2D1X A; 2XMF A; 2LP5 A; 2CDT A; 5FWB A; 1VA7 A; 2G6F X; 2GBQ A; 3VS5 A; 2OI3 A; 1G83 A; 3VRY A; 2EQI A; 3H0H A; 2K6D A; 1RLQ C; 1IO6 A; 1I07 A; 2CH4 A; 2DL8 A; 5FW9 A; 4CC7 A; 1UHC A; 4RUG A; 4LUD A; 3THK A; 3VS1 A; 2W10 A; 1YN8 A; 1CKB A; 2W0Z A; 1B07 A; 2LZ6 B; 4J9E A; 2LMJ A; 2PTK A; 1NG2 A; 2K3B A; 2SRC A; 5GJW B; 3QWY A; 5IHK A; 3VS0 A; 2EYX A; 4K11 A; 2BTT A; 2D8H A; 4HVV A; 2LJ1 A; 1ZLM A; 3ZL7 C; 1PWT A; 1ABQ A; 1GL5 A; 2P4R A; 3UA6 A; 3EG2 A; 1OPL A; 1UE9 A; 3M0P A; 2RF0 A; 1K4U S; 1MV0 B; 1ABO A; 2MCN A; 2PNI A; 3M0Q A; 4RTT A; 4AFZ C; 2EBP A; 2FRW A; 2J6K A; 3IQL A; 1X2K A; 2JW4 A; 1ARK A; 4CC4 B; 1WXT A; 3UAT A; 2DRM A; 1GFD A; 2DBK A; 2CRE A; 2B86 A; 3I5S A; 2A08 A; 2JM9 A; 1AZE A; 1QWE A; 1M27 C; 4J9C A; 1T3S A; 1ZSG A; 4RTU A; 3U23 A; 1PKS A; 4J9D A; 3REB B; 1W1F A; 1AZG B; 2AZV A; 1QKW A; 2VWF A; 3CQT A; 1SHG A; 2DF6 A; 2FO0 A; 2DLP A; 2MIO A; 1PHT A; 4JJB A; 2BZX A; 2LX7 A; 2DYB A; 2EYY A; 2CT4 A; 4AFQ C; 1NEB A; 4DEX A; 1AWX A; 2DL4 A; 3RBB B; 1JXO A; 3PVQ A; 4DEY A; 1WA7 A; 4HVW A; 2ESW A; 2L3S A; 2HEQ A; 1B3Q A; 2YDL A; 2YT6 A; 1W70 A; 1I1J A; 4J9H A; 2DVJ A; 2JXB A; 1XOV A; 2A36 A; 2O9S A; 1M3B A; 1U06 A; 1VYT A; 2L0A A; 1WI7 A; 1KJW A; 2GTJ A; 2KRO A; 1BB9 A; 3ULR B; 2E5K A; 1Z9Q A; 3I35 A; 3I5R A; 4AFS C; 2FPD A; 1WXB A; 1YNZ A; 3PVL A; 1E6G A; 4OMN A; 2L3Q A; 1ZUY A; 2JMA A; 2JS2 A; 4FSS A; 2YUP A; 4OML A; 1ZBJ A; 1KFZ A; 1ZUK A; 2F2W A; 1T0H A; 2BZY A; 1M8M A; 1SEM A; 3M0R A; 4AG1 C; 3EG3 A; 3UA7 A; 2KRM A; 4AFU C; 1V1C A; 2DL7 A; 4D8K A; 1SRL A; 1QKX A; 1GBR A; 5ECA A; 1AEY A; 1QLY A; 2KRN A; 1E6H A; 4RTX A; 2DA9 A; 1MUZ A; 2AKL A; 1HSQ A; 3VS2 A; 2GGR A; 2JT4 A; 4OMP A; 1S1N A; 2CSI A; 3H41 A; 2F2X A; 3M0U A; 3VS7 A; 4OMO A; 2KR3 A; 2V1Q A; 2DBM A; 2EW3 A; 4LUE A; 1KSW A; 2LJ3 A; 2K79 A; 1VYV A; 2JS0 A; 1GCP A; 1BK2 A; 1WIE A; 1A0N B; 4Z8A A; 2O31 A; 2VKN A; 2KNB B; 1UGV A; 1Y0M A; 2RN8 A; 2RQW A; 3VS3 A; 2FEI A; 4Z88 A; 2KT8 A; 2D8J A; 4EIK A; 2QDL A; 4LNP A; 4Y92 A; 2C0O A; 3NHN A; 2ED0 A; 2RNA A; 1TUD A; 1Y57 A; 1UDL A; 1PRL C; 2KBT A; 1U5S A; 4IIO A; 1H92 A; 1ZX6 A; 2L3P A; 3EG1 A; 4CC2 A; 1UTI A; 2KGT A; 5IXB A; 2K7A A; 2EGE A; 1K9A A; 1K0S A; 1AWJ A; 2GQI A; 1RUW A; 1X6G A; 3RNJ A; 2EGA A; 2ENM A; 1QWF A; 4RTV A; 1UUE A; 1CKA A; 2EKH A; 3JV3 A; 2JMC A; 2FRY A; 1G2B A; 4KRT A; 2DMO A; 5IHN A; 1X6B A; 2ECZ A; 1JQQ A; 1PKT A; 1UFF A; 4CC3 A; 1HJD A; 3UF4 A; 3H0I A; 1H3H A; 5HCK A; 2CT3 A; 2V1R A; 4GLM A; 2AZS A; 2C0I A; 1RLP C; 2JTE A; 4GBQ A; 1NYG A; 2YSQ A; 1X2Q A; 3PE0 A; 4WCI A; 4X1V A; 2YUN A; 1JO8 A; 1GRI A; 1AVZ C; 1UG1 A; 1NM7 A; 1T3L A; 1PRM C; 1WDX A; 3KFV A; 1BBZ A; 3NMZ C; 2IIM A; 1WYX A; 1N5Z A; 2NWM A; 1NLO C; 2AK5 A; 3SHW A; 4ESR A; 2AKK A; 2HCK A; 4M4Z A; 1AWO A; 1GFC A; 2KEA A; 4JPB W; 1E7O A; 2KYM A; 2FPE A; 3C0C A; 1WLP B; 2OJ2 A; 3VRZ A; 4J9B A; 3O5Z A; 3TVT A; 1AD5 A; 4ORZ A; 2DRK A; 2H8H A; 1OV3 A; 3M0S A; 2CUD A; 1SPK A; 4E6R A; 2ROT A; 2EYW A; 2KXD A; 1T0J A; 4JJD A; 2K2M A; 1H8K A; 1GCQ A; 1U3O A; 2J05 A; 2J6F A; 4J9G A; 3EG0 A; 5I22 A; 2D0N A; 1K76 A; 2OAW A; 2EGC A; 2L2P A; 1K0X A; 1QCF A; 2CH4 W; 4RTW A; 1TUC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BY7 A; 1NJI C; 4C8Q A; 3I55 T; 1WNL A; 1EX4 A; 3M0T A; 1SSF A; 4FW2 A; 3M55 A; 2DTI A; 1OOT A; 2NUP A; 4QW2 A; 2J6O A; 3CCM Q; 2LCL A; 1FYN A; 1G8X A; 1UEC A; 1VQN T; 4FCY A; 2HBW A; 2JM8 A; 2DL3 A; 1AOJ A; 3JCM Q; 2E41 A; 3RDV A; 1B34 B; 2XDB A; 4JRI A; 5FWC A; 5GAM d; 2X3W D; 2MWO A; 3CXC S; 1YIT A; 2DE0 X; 4IIM A; 4KUL A; 3KXT A; 5KYX B; 2RK1 A; 2YUQ A; 2EPD A; 1JRI A; 4LDU A; 3CPW P; 2RI2 A; 2EYZ A; 5EC7 A; 5LJ5 f; 4FYW B; 3LWH A; 2LQN A; 1UJ0 A; 2DNU A; 1M90 U; 2ABL A; 2LT1 A; 4E7S A; 3CC4 A; 4HXJ A; 2CZ6 B; 3H0F A; 1M1G A; 2EVR A; 4JZ3 A; 4C8Q B; 2CP0 A; 3QJ6 A; 2DD4 A; 2E5Q A; 4D6W A; 4UC4 A; 2QEX Q; 4FW1 A; 1WHM A; 3L42 A; 2RJE A; 1W2B P; 2QQB A; 2QGF B; 4QVZ A; 2NUP B; 3QWX X; 2QA4 Q; 2DXT A; 3CCR Q; 4A53 A; 5DM7 R; 5CIU A; 3JRZ A; 2WAC A; 3PTA A; 3R6N A; 2VUB A; 1TOV A; 5I2S A; 3CCL T; 1OZ3 A; 4BD3 A; 1JU5 C; 1O9S A; 2CZ1 B; 2LJ0 A; 2VB6 A; 3VV0 A; 2EQU A; 4XU1 A; 1M30 A; 1KD1 U; 2J06 A; 2RQR A; 2GNC A; 1WPY A; 2ZAE A; 1KIK A; 3DKM A; 2FG0 A; 2LX9 A; 4HVU A; 5EG2 A; 4LE9 A; 2DX1 A; 2MI6 A; 4M7D F; 3TQ7 P; 2CKK A; 2E12 A; 1Q82 R; 1J3T A; 4OMQ A; 1BI0 A; 1GCQ C; 2CDT A; 2IPO B; 4OB0 B; 4IKF A; 3OS5 A; 5CKD A; 2GBQ A; 4OVA A; 2DET A; 4BUG A; 1G83 A; 2M0O A; 1RLQ C; 2EYQ A; 1G3Y A; 4RUG A; 3OYN A; 1X01 A; 1YN8 A; 2W0Z A; 2OTJ A; 4J9E A; 1WZO A; 2CZ0 B; 3MO8 A; 3OYF A; 3CCE T; 1WJQ A; 3VS0 A; 2EYX A; 2D8H A; 3OYM A; 1ABQ A; 4LXC A; 1GL5 A; 3D7S B; 5I2M A; 1P92 A; 1OPL A; 1VQO A; 2RF0 A; 1ZHI A; 4XQ3 A; 2CGH A; 2VXF A; 1AT1 B; 3TCJ A; 1Q95 G; 1B7T A; 1TUG B; 3G1J A; 2HZY A; 3A1P A; 2RK2 A; 1YI2 A; 4C92 F; 3JCM h; 2H3E B; 1C0M A; 4FIB A; 2MK5 A; 2JW4 A; 3PMT A; 4CC4 B; 1WXT A; 2K3X A; 2DRM A; 1Y71 A; 3CCS A; 4XU0 A; 2DBK A; 3CCJ A; 3SFM A; 2CRE A; 3OSS C; 4O5V A; 5FLX E; 3S3M A; 3I5S A; 2QQR A; 2FL7 A; 1QWE A; 2COY A; 3DLL A; 2K2V A; 5CQY A; 2AZV A; 2ZPF B; 3G4S A; 2VC8 A; 5LJ5 d; 2DTO A; 3CQT A; 1MGQ A; 1OI1 A; 1SHG A; 5A2Q E; 2RHI A; 3A8L B; 5GAN 3; 3L2U A; 1Q7Y C; 2D9T A; 3G4S Q; 2CP6 A; 4OMF B; 1BI1 A; 2LX7 A; 4RKU E; 2CT4 A; 5GAN h; 1VQ6 T; 5L8R E; 1KQS S; 1IB8 A; 2CP3 A; 2JN0 A; 5LJ3 h; 1B3Q A; 1WHH A; 2JXB A; 1XOV A; 4HA8 A; 3V8J A; 1VYT A; 3CCU T; 2KY9 A; 1VQ4 A; 2GTJ A; 2KRO A; 2IVW A; 1WHL A; 1RAI B; 4AFS C; 3S3O A; 5KYY A; 3PVL A; 1MMA A; 2L3Q A; 4M75 E; 2RD1 A; 1ZBJ A; 1K9M R; 3F70 A; 3SWN A; 2BZY A; 1M8M A; 3M0R A; 1HYO A; 4PFZ A; 1S72 A; 3EG3 A; 5LJ3 g; 2FHD A; 5HK3 A; 5GAO m; 4AFU C; 1V1C A; 3CC7 Q; 4D8K A; 4KH0 B; 1SRL A; 3MKD A; 1AEY A; 3CCV T; 4RTX A; 2PU9 B; 1MUZ A; 2RI3 A; 3L2Q A; 4M77 G; 4HT9 A; 2GGR A; 3VJP A; 3LLR A; 1ZA2 B; 3C95 A; 4OMP A; 4KGZ B; 2AHJ B; 3SB2 A; 5KCO A; 4IUV A; 3V7C A; 3LH0 A; 3FB9 A; 3QDR B; 1VYV A; 5D6W A; 2JS0 A; 4M78 F; 1UGR B; 4JRK A; 4M7D G; 2HD0 A; 2GQV A; 3QYH B; 1A0N B; 4Z8A A; 2O31 A; 5DLQ E; 2KNB B; 4N4I A; 2RN8 A; 3L1A A; 2FEI A; 1M90 R; 4M77 C; 5KYY B; 2KT8 A; 1X75 C; 2ZCF B; 2D8J A; 4C0G A; 4EIK A; 3CC2 T; 4EDU A; 3SWN B; 3C94 A; 1N9R A; 2LRQ A; 4C0D C; 1NJI U; 1PSF A; 5CAI A; 1D3B A; 4X34 A; 4M7D C; 3BFM A; 1U8R A; 4M7D A; 1N6A A; 2QAZ A; 4QKU A; 2EQM A; 1K73 C; 1AWJ A; 1VQ5 A; 3RNJ A; 4A4G A; 3VKI A; 3UWN A; 2JMC A; 4M77 E; 3TEE A; 4CI0 C; 4C92 G; 1OQK A; 1KD1 R; 1IHV A; 1X6B A; 3A8H B; 1YJW T; 1UFF A; 4JLI A; 1YBY A; 3NTK A; 1PSE A; 4E7J A; 1PCX A; 1YJN T; 1H3H A; 4L59 A; 5FRO A; 4C5H A; 3HTR A; 4GLM A; 5GAO l; 1KQ2 A; 4LDY A; 2JTE A; 3CBP A; 3TU4 K; 2YSQ A; 3VYG A; 5J39 A; 2HKN A; 4FSX A; 4BDY A; 1KK7 A; 2Y4Y A; 1AVZ C; 3GP8 A; 4M7A E; 4C92 C; 3VUB A; 2QGG A; 4C92 A; 1D3B B; 2QTV A; 2HKQ B; 2FVU A; 2NWM A; 3M5A A; 4M7D B; 1NLO C; 3RKY A; 1YHQ T; 2E6N A; 3I56 A; 1G3T A; 4J9B A; 1JJ2 A; 1QQJ A; 4ORZ A; 1I81 A; 1FMW A; 1OV3 A; 3PFS A; 4AMC A; 3CD6 A; 3G71 Q; 1FWZ A; 3OW2 P; 2KXD A; 1T0J A; 5DY9 A; 1H8K A; 1I5L A; 4J9G A; 3RMS A; 1V76 A; 4PFO A; 2DO3 A; 2GCX A; 2CH4 W; 1M3B A; 1BI3 A; 2AT1 B; 5CKH A; 4J9I A; 2CP2 A; 5D6Y A; 1VQM A; 3EGU A; 1SKU B; 1MV3 A; 3P8B B; 2V8I A; 5KCH A; 4IUU A; 1QVG S; 2DM1 A; 1ZQ1 A; 1GBQ A; 4C92 B; 2KT1 A; 1PNJ A; 5CQX A; 4ZN3 A; 2QQS A; 1Z9Z A; 2MOX A; 4D8D A; 1M8V A; 3RUX A; 5GAN 2; 1YJ9 T; 1IHW A; 3JCM P; 1RI9 A; 2QAS A; 4PFP A; 1YWO A; 2EJG A; 1JEG A; 3NPF A; 4LN2 A; 4AG2 C; 3UT1 A; 4B9W A; 1YCS B; 4M78 G; 5GAN 5; 2D0Q B; 4DBR A; 4HCK A; 2RJF A; 3MET A; 3J7A F; 5IHI A; 2G3R A; 4PJO E; 4FYV B; 3VS4 A; 4E47 A; 1GXI E; 2RA2 A; 5FU6 C; 3JCM e; 1VQK Q; 1AWW A; 1OEB A; 2X3X D; 3OYA A; 2WSF E; 2P0Q A; 2DVE A; 2R57 A; 3MEV A; 4M78 C; 2I0N A; 3I55 A; 3A98 A; 4PNO A; 4M78 A; 3X28 B; 4HCZ A; 2KXC A; 2CUB A; 1WFW A; 2ROL A; 3UPU A; 3I55 Q; 2HSP A; 2RPN A; 5D7U A; 2M9U A; 2J7I A; 1QVF A; 1FMK A; 2P4T A; 1IXD A; 1VQ9 Q; 3G6E Q; 3N5B B; 3QUI A; 2COW A; 1Q7Y U; 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