The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
70
|
structure length |
70
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Chain Sequence |
EEEELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Electron Transfer by Domain Movement in Cytochrome Bc1
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE PROTEIN I, MIT
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
21
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3H1L H; 1SQB H; 1SQQ H; 3H1K H; 3L75 H; 3H1H H; 1BGY H; 1SQV H; 3CXH F; 1KB9 F; 3H1J H; 1EZV H; 2BCC H; 3BCC H; 3H1I H; 1L0N H; 1NTK H; 3L71 H; 1L0L H; 3L70 H; 1PP9 H; 1NU1 H; 3L72 H; 1NTM H; 1KYO F; 1SQX H; 5KLV H; 3L73 H; 4U3F H; 1PPJ H; 3TGU H; 2A06 H; 2IBZ H; 1NTZ H; 3L74 H; 1P84 F; 3CWB H; 4D6T H; 1BE3 H; 1SQP H; 3CX5 F; 4PD4 F; 1BCC H; 2FYU H; #chains in the Genus database with same CATH topology 2UXC O; 1SER A; 3JYC A; 4YJ2 B; 2BSK A; 3TXS A; 1XL4 A; 1XL6 A; 5B66 Z; 2E74 B; 4BR6 A; 3H1H H; 2NNU A; 2HHH O; 3O65 A; 2Y4T A; 1K3E A; 4XDJ A; 1FD9 A; 2HJD A; 2OCC C; 4DK1 A; 3E89 A; 1NT2 B; 1YJ9 V; 3F7Y C; 2H3O A; 3HKB A; 1SZT A; 3SYQ A; 4J41 A; 1XI1 A; 1ZTE A; 4YY3 B; 3CMA V; 4HZ3 A; 3CPW U; 2XOK G; 3LDD A; 1BGY H; 2X6B A; 4X1I B; 4EB6 A; 1FFX B; 2A0L A; 3HKC B; 4FIP C; 3UT5 A; 3LNM B; 1IBM B; 2CH7 A; 1GM7 A; 1WB8 A; 4DV1 B; 4LF4 O; 2QGN A; 3RN4 A; 2YID A; 3G6B A; 2UUA B; 3CRR A; 2EIN C; 3RYF B; 2ZDI A; 5LP6 B; 3ABK B; 3OR7 C; 1R73 A; 3ZHV A; 4P30 A; 1FJG O; 1OCR C; 4FJC C; 3OFN G; 3ZED A; 1IBK O; 3SPC A; 3S3W A; 2CAZ C; 5CMU A; 2BE3 A; 2Q5Z A; 3E8B A; 3MHH C; 1O9G A; 4HAM A; 4NTW A; 4ZBM A; 4K35 A; 1B6Q A; 2N04 A; 4X1I A; 3L70 H; 1PL0 A; 3U11 A; 1VQP V; 5B1B C; 5JCO A; 2WA3 A; 4X20 A; 2LP7 A; 1SRY A; 4O4J A; 3LDC A; 2QJ1 A; 3RYI B; 4CBC A; 4JAU A; 1NJI W; 4JI1 O; 1D5N A; 3ICX A; 2IJH A; 4JAA A; 2RQ6 A; 1W0J G; 4J42 A; 1JJ2 U; 1D2D A; 2HJF C; 3M7M X; 4O4I A; 4IYI A; 3K79 A; 1XEQ A; 1ZL8 B; 4EFB A; 2WLL A; 1OZ0 A; 3CEI A; 3RT3 C; 3AEI A; 3AK3 A; 4QE9 A; 5BMV B; 1A32 A; 4J9Y B; 5K1X A; 1SQB H; 4ZI7 A; 4QIW F; 5LOV A; 4RWU A; 1KB9 F; 3SJQ C; 1FS0 G; 3H1J H; 4G2K A; 2YIB A; 3UM7 A; 2GUZ B; 1EZJ A; 5IJ9 A; 3TJT A; 3B8M A; 3FAV B; 4DRX A; 4EEQ A; 3W7U A; 2IJK A; 2Q68 A; 4HNA B; 3OR6 C; 3E22 B; 2ADP A; 1KBH A; 2ILM A; 3KKY A; 3SYA A; 1R3J C; 1DGS A; 4I4T A; 3HKE B; 1B06 A; 2BCC H; 1RPR A; 1BQZ A; 2B9Z A; 1WN7 A; 1EN6 A; 1L0L H; 2WLJ A; 3OGC C; 4UVA A; 4LWS B; 3JAL B; 1S5H C; 1VQN V; 1NVP B; 1E79 G; 4DV5 B; 4FZ0 A; 5IYZ B; 2OCH A; 1FYJ A; 5IYB O; 1NZ6 A; 3K03 A; 1XNQ B; 2A9H A; 2JK5 C; 5J2T B; 3B8N A; 5LGN A; 3OEH G; 4DR4 B; 2PUS A; 1YJN V; 3K0D A; 5F2V O; 3DGE A; 1YDX A; 2LFS A; 4K8X A; 3ZN1 A; 2V4D A; 1NH2 D; 3BY6 A; 3VOU A; 2GUZ A; 3A2F A; 2AZ0 A; 4DV1 O; 2F43 G; 3H01 A; 3FAV A; 3BEH A; 4PEL A; 4DUY B; 2CGO A; 2XAF A; 2UUA O; 1JR9 A; 3WG7 B; 5L3B A; 1YJW V; 1WJZ A; 4P9P A; 1S5J A; 3ZHR A; 3HKE A; 3CE2 A; 3K08 A; 1EBO A; 4KFM A; 5KMG B; 1SQG A; 3GWO A; 1JJO A; 2HLD G; 2GHY A; 3F7V C; 5EBW C; 2NR5 A; 4XDK A; 3DXR A; 3JAT B; 3BRC A; 4QPK A; 4LF7 B; 1WPB A; 1AR1 B; 4WFG A; 4MVU A; 2H8P C; 1TGO A; 2F95 B; 1Q6H A; 1NR7 A; 1GK9 A; 5B5E Z; 1JFF A; 3JAK B; 4AIL C; 4YIP A; 4RUE A; 3W7T A; 1Y66 A; 1M1K W; 1WP8 A; 3LNN A; 2IBZ H; 3N2K A; 2M7W A; 4PA3 A; 2EIK B; 1M56 B; 4FLT A; 1YTF B; 2UUB B; 4JI8 B; 3E2E A; 3A0H Z; 4UXN A; 3LDE A; 3LSQ A; 2AW9 A; 4LP8 A; 4UB8 Z; 1US6 A; 4N23 A; 5LXT A; 2P4V A; 2YIB D; 1K7D A; 3PJS K; 4MTX A; 1EN4 A; 5EYP A; 3SPH A; 4NKG B; 2P7T C; 2GBO A; 2BTO A; 1Y76 B; 1BMF G; 1Y6X A; 2CK3 G; 2N74 A; 1PNK A; 2QR4 A; 3KG2 A; 3N27 A; 1L1F A; 2UUC B; 3OW2 U; 2E76 B; 4KHP B; 4B3T B; 1VMG A; 2O57 A; 4RQE A; 4BIO A; 5C93 A; 1YVW A; 2DMX A; 4LNU A; 4DW1 A; 4FPP A; 1WB7 A; 1AI7 A; 2XAS A; 1H2L A; 3OMN B; 5B3S C; 5KA6 A; 4DV5 O; 1MG1 A; 3FB8 C; 1SS3 A; 1KKC A; 1XNQ O; 1MOF A; 3CX5 F; 1MZE A; 2WAM A; 3HKD B; 3RGB A; 2Q7H A; 3TXQ A; 1Q6U A; 4DR4 O; 1SQV H; 3E8F A; 5TIS Z; 3AG3 B; 4BW9 A; 4IYH A; 1L8D A; 1WAZ A; 1AJP A; 2ZE8 A; 2WLM A; 1SES A; 4YJ3 A; 2Q69 A; 2QKS A; 5GTH Z; 4DUY O; 3CSX A; 1XMQ B; 4WF9 V; 1OCZ C; 4D6T H; 2QDO A; 2BOC C; 2EIN B; 4LFB B; 4PDM A; 3SJC C; 2LGQ A; 3BVO A; 4FFK A; 3SJB C; 2JIZ G; 1SKV A; 3ZMT A; 2BTQ B; 4O4L B; 4AI8 A; 1SC5 B; 5IY5 B; 4DR2 B; 3AG7 A; 4I0X B; 5FNV A; 3ZHQ A; 2PF4 E; 5IJ0 A; 3K04 A; 1F7Y A; 1VQM V; 1K33 A; 4LF7 O; 2YS8 A; 1N34 B; 1TVK B; 2EZO A; 2KQX A; 4UCT A; 1OCC B; 3IAY A; 1QU7 A; 1KEC A; 1GH6 A; 4E4E A; 2W6I G; 1IXB A; 2X0L A; 4FMT A; 3QO5 A; 2ZNJ A; 3TCU A; 1G4Y B; 4CH6 A; 5KHH A; 2DYS B; 3OE7 G; 1BE3 H; 2F66 C; 4JTA B; 3CC4 V; 4J7K A; 2UUB O; 4JI8 O; 2EIJ B; 4ICG A; 4BW5 A; 4GUN A; 4AQY B; 2VQE B; 3CCQ V; 5KHI A; 4RAI A; 4NYK A; 4YXW G; 4C7U A; 2BTQ A; 5L3F A; 4PA7 A; 2PY5 A; 1M57 C; 3LUT B; 1QBZ A; 4GKJ B; 4G27 B; 5CA0 B; 1FXK C; 4JAV A; 3OTF A; 1K4D C; 3T1C A; 4X1K A; 1VEW A; 5ITZ B; 5L3E A; 2Y69 C; 1Q3E A; 2DYR C; 2LW1 A; 2VWJ A; 2WLI B; 1OJH A; 4KHP O; 5LGU A; 4OGQ B; 4B3T O; 4DK0 A; 2ODM A; 4QJF B; 4DR1 B; 1S72 V; 4ZIB A; 3JAS B; 4PI0 A; 4GYC B; 1VAR A; 4KL1 A; 2F4V B; 2ITD C; 2OTL V; 4F4L A; 1F23 A; 2QM7 A; 3J81 N; 2A7W A; 4L87 A; 1RM1 B; 3OTO O; 1XOU A; 4GX5 A; 2MK3 A; 3ABL C; 1ZSP A; 3B77 A; 2BSK B; 5KAF Z; 1GN4 A; 2GTA A; 1N36 B; 4JZ2 A; 1XNR B; 3T1Y B; 1HDJ A; 2OIE A; 3ZHS A; 2X7R B; 3BCC H; 4UCU A; 1ZWI C; 4Z1M G; 3ASO C; 2Q67 A; 3HKB B; 3R65 A; 1XMQ O; 3SYO A; 1N0N A; 3ABM C; 1OHH G; 5KA5 A; 1QHT A; 1WLE A; 4WFH A; 1U97 A; 4LFB O; 4OX9 B; 4TQD A; 3ZHU A; 4JI0 B; 1XBL A; 3JAS A; 4QPJ A; 3K5O A; 5KAI Z; 4EB6 B; 3VQV A; 2EIM C; 4MVO A; 2ZT9 B; 3MDS A; 5A2Q N; 3UT5 B; 5LYJ A; 4DR2 O; 1QCE A; 2CDY A; 2CH7 B; 2CTW A; 2OT5 A; 2OIG A; 3RFR A; 2ZKO A; 1AB3 A; 4OXS A; 1AR5 A; 2UXB O; 1N34 O; 4PA6 A; 1R6N A; 1XQ8 A; 2ZIO A; 3OD4 A; 5L3C A; 2Y0P A; 1G1X B; 3X2Q C; 2JEU A; 3IFX A; 1NH2 B; 2Y0I A; 1Y74 A; 2ZD9 A; 5E79 Z; 3VQX A; 3EVK A; 2Q7G A; 1VP7 A; 3CCR V; 2Z0A A; 4GX2 A; 3CB2 A; 1TA8 A; 3W7W A; 1R3K C; 3ZCC A; 1VQ7 V; 3B09 A; 1SET A; 1NS1 A; 4F6R A; 4W4L A; 3FB6 C; 3H9V A; 4HYO A; 2DW4 A; 4R50 A; 1VQO V; 4EKW A; 3ZS8 C; 2KKW A; 3BAA A; 4JYC A; 4BIU A; 1AI5 A; 1XHX A; 4AQY O; 3EFF K; 2VQE O; 2HEP A; 5HFL A; 1RFY A; 4J80 A; 2YEV A; 3SPG A; 3IGA C; 3RYH B; 3WB2 A; 4I55 A; 2IW5 A; 1YF2 A; 1THZ A; 4N21 A; 1XMO B; 4GKJ O; 2EIL B; 4X20 B; 1PD3 A; 3L9D A; 5CB4 A; 4X62 O; 3VQY A; 4LF6 B; 2QWN B; 1BCC H; 4O4J B; 1GMG A; 5JQG A; 1EM1 A; 1AIL A; 4JYA B; 1VQL V; 2WPD G; 4DO2 A; 4X64 B; 2PI5 A; 5B1A B; 1HNW O; 4JI2 B; 4O4I B; 3B4S A; 1VQ4 V; 2ZM6 B; 1VQ6 V; 2ZXW C; 2WLL B; 1BHB A; 4H0L B; 1W0K G; 4DR1 O; 4B7K A; 1TUE B; 4I9Q A; 1KQS U; 2HKO A; 4FLW A; 2XTA A; 4X1Y A; 1MA1 A; 2HVJ C; 4ZI7 B; 1E1Q G; 4Q20 A; 4E2L A; 5LOV B; 3ABU A; 2IJI A; 1K34 A; 4CH4 A; 2YI9 A; 3CCS V; 4ZHQ A; 2IU0 A; 5IJ9 B; 3O9O A; 4WFF A; 3RYH A; 1N8R W; 4X65 B; 4UCS A; 4DRX B; 3CC7 V; 5LHI A; 5FLX N; 3ASN C; 3ZHT A; 4UCO A; 3ZIA G; 1HR0 B; 4IHJ A; 5J9P C; 3DC5 A; 2JJ1 G; 4I4T B; 1PNM A; 1N36 O; 2LQT A; 2HR3 A; 3D36 C; 3L75 H; 3SYP A; 3T1Y O; 2P6J A; 2Q73 A; 1K8A W; 3ZRW B; 3FYE B; 4H44 B; 3K5M A; 1XRE A; 3ETQ A; 2EJ7 A; 2JGD A; 3W7X A; 5LA6 A; 3RYC A; 1DK1 A; 1D5A A; 4BWA A; 2W0X A; 4OX9 O; 4JI0 O; 2QKC A; 1Y67 A; 4FM2 A; 1R3I C; 2UXX A; 1ZLZ A; 2JRI A; 4UB6 Z; 2ADQ B; 3B40 A; 1I08 A; 2YXH A; 3GB7 C; 2QWP B; 4B3M B; 3D3Q A; 4WCE V; 4WFE A; 4Z2W A; 1K97 A; 3ETG A; 3AG1 C; 4FLX A; 1VQ8 V; 1X59 A; 1Q8I A; 2ZIM A; 4DV4 B; 4DR6 B; 3ZN0 A; 2EJR A; 4JZG A; 1YIJ V; 3H1L H; 1QLE B; 1BQ0 A; 4FFB A; 3WFV A; 1YZB A; 3APQ A; 3MD0 A; 1MNG A; 4X66 B; 5LBQ A; 2C2A A; 3MAQ A; 2QTO A; 3SJA C; 3I5D A; 3CCL V; 4ABM A; 4PDV A; 3ZRW A; 3K5L A; 3G4S V; 3DXR B; 4LBE C; 5B1N A; 3T4Z A; 4PDL A; 3HB3 B; 1I0H A; 3SR2 C; 1Z5W A; 4YY3 O; 1S3J A; 2GTS A; 1BSM A; 2XAQ A; 4MW8 A; 4LF9 B; 1W59 A; 1JFF B; 1S77 D; 1H2N A; 4JTD B; 1IBM O; 2VS0 A; 2JVD A; 2KG7 A; 5EBM C; 1XMO O; 1FXH A; 3N2K B; 4NTX A; 4X8A A; 1WPX A; 2P22 C; 4KXR A; 3N2G A; 4LF6 O; 1GM9 A; 2WWW A; 2LJ2 A; 1GM8 A; 1OCO B; 2R70 A; 4TV8 B; 5FPO A; 3EXA A; 4X64 O; 4MSW C; 4JI2 O; 5JJE B; 4UVC A; 2EX3 A; 1AVM A; 5LXT B; 1N33 B; 2ZM6 O; 4U3F H; 4BAY A; 2W0F C; 3D3I A; 3R66 A; 5EYP B; 4DYL A; 2Q0A A; 1V55 C; 3JD1 A; 3E8H A; 3GVM A; 3ML0 A; 2QEX V; 3CRA A; 4JV5 B; 4GX1 A; 4HBN A; 2IJJ A; 3S3X A; 3CC2 V; 2ZE6 A; 1Q86 W; 1N32 B; 4J7J A; 3I56 V; 1I94 B; 2L35 A; 1QLN A; 1LUV A; 3OMI B; 4J7Z A; 4DR7 B; 5LMU B; 1FFT B; 5LHG A; 5EIB C; 3HPL C; 4FK5 C; 4QNH B; 1HR0 O; 4WFB V; 4K0K B; 2JDI G; 1KUQ A; 3CME V; 3OUS A; 4LNU B; 2P06 A; 1FXK A; 3JD3 A; 2CTP A; 1B3Q A; 1R6K A; 2QKA A; 4TV8 A; 1VQ9 V; 4D7T A; 3BA8 A; 2QA4 V; 3K0G A; 1HNX B; 1TUB A; 1P7G A; 2GDS A; 4UV8 A; 4JI4 B; 1GN2 A; 3VBB A; 4ZKI A; 2DE0 X; 3STZ C; 2RMK B; 3AK1 A; 4H13 B; 1V54 B; 1FPO A; 3UO2 A; 3IC7 A; 4NXM B; 5EC2 C; 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2X6C A; 3DC6 A; 1I94 O; 3JAR A; 4PJ0 Z; 1PL4 A; 4CS2 A; 5L3G A; 4DR7 O; 2QWR B; 5LMU O; 5KLV H; 4GZR B; 4P9O A; 1ZUQ A; 5B1B B; 1DF4 A; 1WA8 A; 4K0K O; 1SQF A; 2XAJ A; 1ZX3 A; 4MVR A; 2FKX A; 3E8G A; 5KX5 A; 1SQQ H; 1YCI A; 1R1B A; 3P3P A; 4CH5 A; 1NTK H; 1MMM A; 3QF7 A; 4JI4 O; 4DV2 B; 4U7N A; 1NU1 H; 3WU2 Z; 3U10 A; 2D2C B; 2AHZ A; 2ETN A; 3ZRS A; 1QNM A; 3RWR D; 4NXM O; 1VIB A; 2FML A; 4O4H B; 1YSC A; 1KD1 W; 4J9Z B; 4JI6 B; 3FB5 C; 2PI4 A; 2BOB C; 2B5U A; 2H94 A; 4O2A A; 3A8T A; 2YC0 A; 1H2S B; 2UUC O; 1NTM H; 4MVQ A; 4JI3 B; 4PA9 A; 4RQF A; 3CCV V; 2CE4 A; 3TGU H; 3L74 H; 5IYC O; 4UUJ C; 2UXD B; 3ETD A; 4LFC B; 2CTQ A; 2JJ2 G; 3WG7 C; 4DUZ B; 4BIZ A; 3Q4H A; 4KUM A; 4B3R B; 4CZZ A; 3D36 A; 3M8A A; 4P2Z A; 3FB7 C; 4I50 B; 4DR3 O; 1KC8 W; 5LYJ B; 1Q7Y W; 1EN5 A; 5JH7 A; 4TQF A; 3OMA B; 4IIJ A; 3UCS C; 4JI7 O; 2ITC C; 4UV9 A; 2XUM A; 2DWE C; 3W7S A; 1BHA A; 1DTO A; 3SPJ A; 3PN1 A; 4TUY A; 1P7B A; 1Y74 B; 4O4H A; 3H1K H; 4LF5 B; 1NBM G; 1EFR G; 4U7O A; 5CN0 A; 4DV7 B; 2P5O A; 1GN6 A; 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