The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
70
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structure length |
70
|
Chain Sequence |
b'EEEELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Electron Transfer by Domain Movement in Cytochrome Bc1
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE PROTEIN I, MIT
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
21
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SQQ H; 1L0N H; 3L73 H; 1NU1 H; 3CX5 F; 1EZV H; 1BCC H; 1PP9 H; 1NTZ H; 3L71 H; 2A06 H; 1SQP H; 3H1J H; 1L0L H; 3L72 H; 3L75 H; 2FYU H; 1BGY H; 3H1L H; 3H1I H; 3BCC H; 1SQB H; 3CXH F; 1KB9 F; 4D6T H; 2IBZ H; 3CWB H; 1P84 F; 4PD4 F; 3TGU H; 3L70 H; 1NTM H; 5KLV H; 1NTK H; 4U3F H; 1BE3 H; 1PPJ H; 3H1K H; 3L74 H; 1SQX H; 1KYO F; 2BCC H; 3H1H H; 1SQV H; #chains in the Genus database with same CATH topology 4X66 B; 2HJD A; 3KG2 A; 1S76 D; 4X1I B; 3CP1 A; 4GX0 A; 5KA5 A; 2HFE C; 4DUZ B; 2WPD G; 2YUA A; 1TUE B; 3G67 A; 4IGG A; 5BXZ A; 1F7Y A; 3E83 A; 4X1K A; 1YI2 V; 2ZQM A; 1DLB A; 4QIW F; 4NYK A; 3HKD A; 1GM9 A; 3ZJZ A; 4DV4 O; 3CRR A; 1N4C A; 1VF6 A; 3ZN0 A; 1V9P A; 3RYF A; 2ZNI A; 4LCU C; 1FPO A; 3AG2 C; 4DR4 B; 4LP8 A; 4PA4 A; 2Q7H A; 1EZV H; 4JAV A; 4R7C A; 2RCV A; 5BZB A; 5C8Y B; 1Q81 W; 3PJS K; 1ROP A; 1EN5 A; 3NXS A; 1I7F A; 5DEC A; 5IJ9 B; 4GCZ A; 1FXV A; 3HKE B; 4K35 A; 3Q4H B; 4DUY O; 4JTC B; 2DYS B; 4MVS A; 4NKG B; 5LOV B; 1Y66 A; 2W0X A; 3KKY A; 1RM1 B; 2X6B A; 4IHJ B; 4X64 B; 4WFA V; 2OTJ V; 1KB9 F; 1ARO P; 2EIN B; 5A9G A; 3OM3 B; 4N23 A; 2GUZ B; 1BSM A; 2E75 B; 1WAZ A; 3K58 A; 4YXW G; 2PZS A; 1DF4 A; 3AG4 C; 2EIJ C; 1PNK A; 4X20 B; 2NN4 A; 1VQL V; 2WLN A; 2CTR A; 5JJJ B; 3JAW A; 1L1F A; 4YHH B; 2P6J A; 3RYI B; 4RUE A; 2FKX A; 3PN1 A; 4GKJ O; 3RVY A; 1SZX A; 5EYP A; 3K06 A; 1YEW A; 4DR2 B; 2Y48 A; 3WB0 A; 1YIJ V; 1NH2 B; 4I50 A; 2GDS A; 2GSM B; 1CEZ A; 1X4T A; 1E79 G; 2JK5 C; 3JAK B; 5CN0 A; 1BT8 A; 3OMI B; 4JI8 O; 1Q90 D; 5CA3 A; 3JCZ A; 1N36 B; 4JV5 O; 4ZI7 A; 2OWO A; 1Q43 A; 1N32 O; 3OTO B; 4DR1 O; 1NJI W; 1ZAU A; 2M7W A; 3A0R A; 2LGQ A; 1ZWI C; 5JVD A; 3JSN A; 2R9R B; 2EBO A; 1AIL A; 4XDJ A; 4FLT A; 4DO2 A; 4EB6 B; 2B5U A; 3QNE A; 1NU1 H; 4KFM A; 3K5L A; 5LHG A; 1XNR O; 2HHH O; 4F4L A; 2UXD B; 3ZRS A; 3ABK C; 4JF3 A; 4I55 B; 5L3B A; 2C2A A; 5KAF Z; 1PM9 A; 2Z0A A; 4ZOL B; 2QJ1 A; 3E35 A; 4FM1 A; 2KG7 B; 2VWJ A; 1NR7 A; 1HNZ O; 4FFK A; 4CBC A; 2JVD A; 2EZP A; 1SA0 B; 4UUJ C; 1PP9 H; 1FFX B; 4AIL C; 3JAR A; 4OX9 B; 1JJO A; 4TQD A; 4X62 B; 4RUF A; 4WBN B; 2AHZ A; 2LW7 A; 2VQE O; 3R65 A; 3L9D A; 4UVB A; 1XI1 A; 1BE3 H; 2V1D A; 3FB8 C; 3CCM V; 5KA6 A; 3FFQ A; 3H1H H; 3M99 B; 4TV8 B; 4CH5 A; 5LMU B; 4PDV A; 3LNN A; 4UCT A; 1VQ8 V; 3R66 A; 4I4T A; 5LBQ A; 2MK3 A; 3OGI B; 2P90 A; 1I94 B; 4BWA A; 4O4L A; 2ZCE A; 4OPA A; 5DN6 G; 4KP4 A; 2QEX V; 3JAT A; 4F6E A; 1Z2G A; 4X64 O; 1Q7Y W; 4F6R B; 3EFF K; 5JWP A; 5EC2 C; 4DR7 O; 4A5U B; 2XAG A; 2EIK B; 2JJ2 G; 4KXR A; 4FLV A; 1YVW A; 4CS2 A; 3A0H Z; 2QWO B; 4UXN A; 3VQW A; 4BR6 A; 1P4R A; 1HP8 A; 4LH7 A; 4R8C A; 4JI7 O; 2P4K A; 3CCJ V; 2P7T C; 1KYO F; 3JD2 A; 1S5J A; 4JI5 O; 3SGI A; 2UXB B; 1M56 C; 2CDY A; 2WAM A; 4U7N A; 4LNU B; 3CXC U; 4PEL A; 5H9C A; 3HKB B; 2ZE7 A; 2XTA A; 2W6J G; 3WG7 B; 3I5D A; 1QHT A; 2YI8 A; 2A0L A; 1EZJ A; 4OGQ B; 3H1K H; 2QTS A; 4RAI A; 5JJN B; 4DW0 A; 1OCR B; 4RWU A; 2XOK G; 3ZMZ A; 1MNG A; 4I0X A; 2P67 A; 2ITC C; 2YXL A; 4O4H B; 1OV9 A; 1PL0 A; 1YSC A; 4K8X A; 4WFB V; 3APQ A; 2YSU B; 2HP8 A; 1QLE C; 1N33 B; 1UPG A; 4XDL A; 5JQG B; 5IYD O; 4FVM A; 4O4J A; 4LBE C; 4J7K A; 3UO3 A; 3F7V C; 5B5E Z; 2E5L O; 3B4S A; 3AG3 B; 4LFB B; 4I9W A; 3GB7 C; 5KHI A; 5LHH A; 4NXN B; 2QKS A; 3APO A; 3B8M A; 4B3S O; 4U3J A; 4ZHQ A; 3THO A; 4DV7 B; 4JI3 B; 1IBK O; 4U7O A; 2IW5 A; 1EN6 A; 1Z5W A; 3MAQ A; 4H37 A; 2KKW A; 2V4D A; 4ZKI A; 5BR8 B; 2PUS A; 3CE2 A; 4O2B A; 1TVK B; 3CCE V; 4DV1 O; 2QKC A; 1MMM A; 1K5S A; 3CXH F; 4CH6 A; 4DR3 B; 2JS3 A; 5KX5 B; 5FL7 G; 4QE9 A; 1GN3 A; 1KKC A; 4HYO A; 4JAU A; 3JD3 A; 1HNW B; 5D5Q A; 3RYH A; 1Q82 W; 2B1G A; 1ZUQ A; 2CK3 G; 5J2T B; 2OT5 A; 3NR7 A; 3ETE A; 1IZ3 A; 1B3Q A; 3GWK C; 4CC6 A; 5KMG B; 2ADQ B; 5E79 Z; 5H6Q A; 2ZXW C; 3RYC A; 2JGD B; 2ODM A; 5L3G A; 3E22 B; 4LF8 B; 1R3J C; 2LP7 A; 4LWS A; 3JD4 A; 4J11 A; 1F4N A; 2EIM B; 5IYZ B; 4FMT A; 1VQ9 V; 2FYU H; 2Q6A A; 1H8E G; 1IX9 A; 2LJ2 A; 1AR1 B; 5B66 Z; 2A9H A; 1CXZ B; 1M9N A; 1IBL B; 1GK9 A; 3BEH A; 4LF9 B; 2IH1 C; 2WLL A; 2E76 B; 5KLV H; 3RGB A; 5LYJ A; 3W7T A; 3F7Y C; 3ZRX A; 1TA8 A; 3JAS B; 3FAV B; 2LFR A; 2N04 A; 4GKK O; 1BS3 A; 1BMF G; 1VQM V; 5H5N A; 2CH7 B; 5IJ0 B; 3AEI A; 5L3C A; 1OCC C; 5K1X A; 3DGE A; 1GM7 A; 4PDM A; 4WFE A; 1DGS A; 1J95 A; 1PNM A; 2YIC A; 3D36 A; 1VF5 B; 5CA1 B; 2F4V B; 2FML A; 1LNQ A; 1W2B U; 3CX5 F; 3X2Q C; 1XMQ O; 3ZRW B; 3L72 H; 2HEP A; 5CA0 B; 1R6K A; 1WA8 A; 4DK1 A; 4DV6 B; 4WCE V; 1WPB A; 1R3L C; 3QO7 A; 3N2K B; 4J42 A; 4KUM A; 2WWW A; 5CBG A; 2BSK B; 5KUK A; 4JYA O; 4I5S A; 2NLJ C; 3ZMS A; 5IY5 B; 4FM0 A; 2F93 B; 3SPC A; 2QM8 A; 1IUR A; 4HNA A; 1RSO B; 3ABL C; 1N34 B; 3JAL B; 4X9Q A; 3ZS8 C; 3K03 A; 2ZIO A; 1K4C C; 5B1N A; 3E8B A; 3JD0 A; 4X1Y B; 1BCC H; 2UXC B; 4JAA A; 5FNV A; 2AW9 A; 4DW1 A; 1HNX B; 4DV3 B; 3T2M A; 1O9H A; 3ABT A; 4WFF A; 1JCH A; 1OCZ B; 2XAH A; 3QG5 A; 2UUC B; 2LW1 A; 1K9M W; 5HFM A; 3BAB A; 4LF4 B; 2DWD C; 4K0K O; 3CCR V; 1Y4M A; 3T1C A; 2CAZ C; 3AG7 A; 4LC1 A; 4DV5 O; 4W4L A; 5LHI A; 3DTU B; 2QM4 A; 1NTM H; 4WFH A; 4PI2 A; 2CGO A; 2H8P C; 1HR0 O; 4LFC B; 3L71 H; 3K59 A; 1KU9 A; 2QR4 A; 1PD3 A; 1UFI A; 3SR2 C; 3ZHR A; 4LF7 O; 1GN4 A; 3HKC B; 3HKD B; 3T1H B; 1G8M A; 4JTD B; 1K3E A; 4DV0 O; 4FLW A; 3ZIA G; 4PA9 A; 5E1A C; 1FS0 G; 3CRM A; 3I55 V; 1I08 A; 5A2Q N; 4TOI A; 2OTL V; 3MHS C; 1A32 A; 4IT5 A; 4K3A A; 5ITZ A; 3TK1 A; 1QR9 A; 1VQ5 V; 2IJH A; 3N2G A; 4YIO A; 2YEV A; 2QDO A; 3MHH C; 3TJT A; 1BL8 A; 1TUB B; 3GWO A; 5EBL C; 1G6U A; 3L75 H; 4PV1 B; 3EVK A; 4IL6 Z; 2HVJ C; 5JJE B; 1ORQ C; 1RPO A; 3OMA B; 2IJK A; 1I5Y A; 2JEX A; 3CCL V; 1YTF B; 3BPZ A; 1AI5 A; 2NNU A; 3B40 A; 1PNL A; 5JH7 A; 3RFR A; 3C90 A; 4DV6 O; 4X8A A; 1AJN A; 2BTQ B; 3C3T A; 2XAF A; 2XT9 A; 1NTZ H; 2ZR3 A; 2B1I A; 4LF5 O; 2WLI A; 3H1I H; 2ADP A; 1W0J G; 2WLJ A; 3AK1 A; 1H2S B; 3CWB H; 1K73 W; 2Q7E A; 4B3T B; 4PA3 A; 2X6C A; 3VQV A; 4YJ2 A; 1GO3 F; 5CBF A; 3CJH B; 4JGS A; 3UCS C; 4OPH A; 4X65 O; 2UUB B; 4X1I A; 1Q6I A; 1XRE A; 5B1A B; 1XHZ A; 2PI4 A; 1XEQ A; 1YJ9 V; 4B7E A; 5EYP B; 3KCY A; 1XOU A; 3G6B A; 3TGU H; 2Q5Z A; 3TXQ A; 4NB5 A; 1XMO O; 5GW7 A; 4D7S A; 3T1Y O; 5IE9 A; 3QVN A; 3LDE A; 1KKD A; 2ZM6 B; 4YY3 O; 5JCO A; 2DOS A; 4AQY O; 4JI2 O; 1PKX A; 3OT7 A; 4FK5 C; 5LMN O; 5GON A; 3E8G A; 5JCO C; 4LF6 B; 5IJ9 A; 2QE7 G; 3HKE A; 4JPR A; 1AP5 A; 3Q4H A; 2GTS A; 3BA8 A; 2F23 A; 5JVD B; 1B6Q A; 4BIO A; 5LOV A; 4CH3 A; 1ZL8 A; 3FYI B; 1TGO A; 3ABK B; 1WNS A; 4QE7 A; 2DYS C; 2ZE8 A; 4P2Z A; 3UT5 B; 1YCI A; 4BIU A; 4BIZ A; 1SER A; 2GUZ A; 3BY6 A; 2PGG A; 4JI4 B; 2RJZ A; 1D5N A; 2EIN C; 1V54 B; 1W0K G; 1T5E A; 1GTO A; 4J9Z B; 4X20 A; 3SDL A; 4MS2 A; 2A79 B; 4B3R O; 3SPJ A; 4JAS A; 3RYI A; 2V7Q G; 1HWY A; 4P9P A; 3JAR B; 4I7Z B; 2FL4 A; 1BGY H; 1N8R W; 3FB7 C; 4X66 O; 1KD1 W; 3ASN B; 2CUG A; 1GN6 A; 1NTK H; 4DUZ O; 3TCU A; 3JAK A; 1P49 A; 4MVQ A; 4DR6 B; 2YIB D; 1XHX A; 4TV9 B; 1BQ0 A; 3SPI A; 2L35 A; 4G27 B; 4I4T B; 1XL6 A; 5EIB D; 3DXR B; 3OD4 A; 1I0H A; 3O9O A; 1WPX A; 4ABM A; 1MSD A; 3ASO B; 4O4L B; 3BVO A; 4DR4 O; 5IT9 N; 4EEQ A; 5KHJ A; 2W0F C; 3W7W A; 3QF7 A; 3ZHU A; 2Y69 B; 3JAT B; 4GYC B; 4JI6 B; 5L3F A; 2QWR B; 4EKW A; 1R3K C; 3K04 A; 1YHQ V; 4JI0 B; 2LGW A; 2CE4 A; 2XND G; 5HFL A; 4B3T O; 2Q9L A; 1H2L A; 2IH3 C; 4UCU A; 1B06 A; 4FLU A; 1JJ2 U; 1L8D A; 4JYC A; 1G1X B; 4X88 A; 3SYQ A; 5B1B B; 4ZOL A; 2EZO A; 2Q73 A; 2RQ6 A; 4YIP A; 1M5I A; 1YTF D; 1XDC A; 3RVZ A; 1FFX A; 3K79 A; 3ABM C; 2P5O A; 1S3J A; 4O2A A; 4G28 B; 4GX2 A; 3OFN G; 3CCU V; 2WLM A; 2VQF B; 1DK1 A; 4YHH O; 2UUA B; 3K5O A; 2JRI A; 3VQY A; 4NXM B; 3LNM B; 4NTW A; 1S0V A; 1YZB A; 2LFS A; 2WA3 A; 1L0N H; 4DR2 O; 1XNQ B; 3ZX6 A; 4XDK A; 3TET A; 1OZ0 A; 4LR3 A; 3I56 V; 2F1M A; 1YIT V; 1PL4 A; 3VQX A; 3P3N A; 1Y6X A; 5LXT B; 4PD4 F; 1SES A; 5FPO A; 4J7Z A; 3ZRV A; 1N36 O; 3IC7 A; 3U0Z A; 1K5Q A; 1KBH A; 5AG2 A; 1R6N A; 5BY1 A; 3OTO O; 4B3M B; 3HR0 A; 4F6R A; 3DC5 A; 1J5E B; 1NR1 A; 4Q20 A; 2BE3 A; 4MVM A; 3CPW U; 3CC2 V; 2JIZ G; 4TT3 G; 3ZMT A; 2EIK C; 1E1Q G; 4DV2 B; 5KAI Z; 4L87 A; 4MTX A; 1AP6 A; 1FJG B; 2UXD O; 1LR1 A; 1NH2 D; 3E8F A; 1XBL A; 4ASU G; 3G71 V; 1JFF A; 4DXW A; 2XAQ A; 4LNU A; 4E2L A; 3OR7 C; 3HKB A; 2DN9 A; 2WSS G; 3G4S V; 2OIE A; 4MT8 A; 1OHH G; 5EBW C; 2Z5U A; 2IBZ H; 1JVM A; 5LGT A; 4H33 A; 3WG7 C; 2YXH A; 1PPJ H; 3B77 A; 4OX9 O; 1ZSP A; 3RYH B; 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4L8J A; 3K08 A; 4FPP A; 5IYZ A; 2HR3 A; 3WB1 A; 2EIM C; 3JCU Z; 1OCO B; 4FZ1 A; 1SKV A; 5EK0 A; 1XIL A; 1V55 B; 1VQN V; 2E74 B; 1N33 O; 2CTQ A; 3D3Q A; 1H2G A; 5KHG A; 3T4D A; 3FYE B; 2R9I A; 1SS3 A; 4JYY A; 4LFB O; 1BQZ A; 3KZI Z; 1XL4 A; 2RN9 A; 3RWR D; 4NXN O; 5FNV B; 4DV4 B; 1EFR G; 4DV7 O; 4JI3 O; 3STZ C; 1P7B A; 4MVZ A; 4UFZ A; 1W59 A; 5BR8 O; 1NBM G; 1NS1 A; 2Z3Y A; 3S3X A; 1CP9 A; 3DSQ A; 4GUN A; 2F43 G; 3H01 A; 3OR6 C; 1SQG A; 3AG1 C; 4DR3 O; 1IVS A; 1VP7 A; 5CA0 A; 4DUY B; 1HNW O; 2YDE A; 1GAX A; 1MA1 A; 3CMA V; 4RO2 A; 1Q6H A; 4OXS A; 2FTK A; 2GV9 A; 1VEW A; 2BSK A; 2YIA A; 3GVM A; 4FFB A; 2NR5 A; 1FXK A; 3OMN B; 1KP2 A; 1DTO A; 3L73 H; 1HW7 A; 4LF8 O; 4IIJ B; 4JYB A; 2DYR B; 3G80 A; 4P9O A; 1N0N A; 2BTO A; 2R72 A; 1FXK C; 4J7J A; 5IY5 C; 1RSO A; 3AK2 A; 4UVC A; 1COW G; 2ZNJ A; 1VQ7 V; 3M8A A; 3OEH G; 4GKJ B; 2Q69 A; 1F23 A; 2P22 C; 2EJ7 A; 1AJQ A; 3SYC A; 1AI7 A; 3OE7 G; 5H6R A; 1CPY A; 1IBL O; 4LF9 O; 1PV0 A; 4X1Y A; 1QQC A; 3RN4 A; 3H1J H; 1VAR A; 2ATK C; 1EBO A; 1SQF A; 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