3H45C

Glycerol kinase h232e with ethylene glycol
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
500
structure length
500
Chain Sequence
b'EKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYEFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKFKAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
molecule tags Transferase
source organism Enterococcus casseliflavus
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
total genus 169
structure length 500
sequence length 500
chains with identical sequence D, O, X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2009-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
C PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h45C02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h45C01
1RFQA 3QB0A 5EX5A 1T6DA 4FSVA 4K43A 3H1QA 4BR4A 2FSJA 3DXMA 3ZETA 2Q2RA 3FR0A 3M3ZA 4JN4A 5BREA 3GDQA 5AQVA 3WXKA 4CZEA 1U2VB 3R6MA 3FFKB 3FZFA 3JS6A 3WEEA 1E4GT 3EL2A 3HSCA 2DPNA 4XEIA 3LM2A 4AM7A 4CZJA 2NZTA 1BOTO 1GLCG 4GNIA 4H0XB 4CZFA 3MDQA 3SLCA 3MN9A 3RSEA 3VERA 3H45C 1DGKN 1S22A 1KAYA 2FF3B 4NO7A 5AQFA 4WQ5A 2P9NB 2YHXA 3EZWA 5EY4A 5AFUH 3VF6A 4EIAA 2P9SB 2ZGYA 4BC3A 5AQYA 1MWMA 2P9LA 1P8ZA 3UKUA 4BR0A 3UKRA 2V52B 5EOYA 3KZBA 4A2BA 5FPDA 2E2OA 2Q0UA 4JD2B 2BUPA 5JLHA 3U9ZA 4H03B 1SZ2A 2QW9A 4BRDA 4H0PA 4MLEA 4BQLA 1ATRA 4CZGA 4FWNA 4BRCA 1BO5O 2AA4A 2A42A 3QICA 2Q1NA 2GWJA 1U6ZA 5AZJB 1QZ6A 3QBXA 2QM1A 4XH1A 3VEYA 4CBWA 3SMSA 5EVZA 3EKSA 3P4IA 1TYQB 5AQNA 3VF4A 1KAXA 4B1XB 3O6WA 3VETA 3W0LA 3C7NA 5E26A 3MMVA 4BRNA 3J8AA 3DXKA 4BC4A 1ZBSA 2E2PA 3TPQA 4BG8A 1TUYA 4WYBA 3A5NC 1GLFO 2VYPA 4YDUA 3QBWA 2P9UB 5ADXH 1ATSA 2E1ZA 2GEMA 5BR9A 1J6ZA 3L6QA 1HX1A 4A61A 3VEWA 3U4LA 3S41A 4DB3A 3QDKA 3MN5A 4PKGA 2P9UA 1BU6O 3D2EB 3GE1A 4FL9A 2E8AA 5BPMA 2D0PA 3CQYA 5AQLA 1X3MA 3ATVA 3DXKB 5KPZA 5AQKA 3HBTA 5F2RA 4CD1A 2IIRA 5FPMA 3ZX0A 3FZLA 2D4WA 2QXLA 3VEZA 5JLFA 3GG4A 2BTFA 2PBDA 2VWBA 3WT0A 3L4IA 4WQ4A 1BUPA 2Q97A 3SK3A 4YDUC 1QQNA 3FZMA 1G99A 3HZ6A 2ITMA 4EFHA 2CGJA 1BA1A 3CIPA 4FWSA 5AQQA 5TKYA 2IVPA 5AQSA 2QWRA 2CGKA 3CJ1A 2P9NA 3L0QA 3A0IX 2YJEA 1HKGA 2ZWHA 3HI0A 2NLXA 4ISFA 4FWRA 3G25A 5AQHA 2Q36A 4H5TA 5FPNA 2A5XA 3SMPA 2Q31A 4IWVA 2CH5A 4FPBA 3VF2A 3ZX3A 1WUAA 1CZAN 1NGIA 3DJCA 3MN6A 3LL3A 3M6GA 3VGLA 5ELZA 1OKJA 3LM9A 5CE3A 2CH6A 2D1KA 3TU5A 2EWSA 2I7PA 2P9PB 3H46O 5B8HA 3O5BA 3UB5A 3GOIA 4CZKA 3AY9A 2V7YA 1KAZA 3VGKA 3A5OC 1RGIA 3VOVA 4H5WA 4B1WB 4B1YB 4BGAA 2A40A 5AQPA 3A5MC 4BRIA 3EO3A 3H1VX 3O4WA 3HTVA 1R59O 1TYQA 3WQUA 2FF6A 1XUPO 4B1UB 2ASOA 3FZHA 4DQ8A 2F9WA 1HLUA 5AZJA 4FOEA 4RWTA 1ATNA 4H0OA 4JHDA 3DWLA 1NGDA 4H5NA 4BRHA 1HKCA 3FGUA 5AQTA 4C23A 4PKHA 2WUSA 4O8KA 3OHRA 2FSKA 4BR7A 1WOQA 1ZXOA 3H6EA 3LDQA 3O08A 3WXIA 4BR2A 5LJWA 5AQUA 1Q18A 2KHOA 2V7ZA 1NGHA 3VEVA 4IXCA 3CI5A 2GWKA 3LDLA 3BUZB 1T6CA 2P9PA 4DHYA 5ADXA 3U9DA 1S3XA 5BRFA 4H0YB 4O5FA 1U2VA 2A41A 3EN9A 4K25A 1XQSC 2YHYA 3WUHA 4H5VA 4J8FA 1V4SA 2V51B 3ZX2A 3DXMB 4XH4A 3VESA 4BRPA 4CZIA 3HM8A 1Z05A 3D2FB 4FWOA 4GY2B 3AAPA 1GLBG 3AAQA 2YJFA 4LC9B 4BGBA 4H0TB 4A2AA 1DEJA 2CGLA 3O8MA 1LCUA 1DKGD 3MCPA 3MN7A 2ZF5O 2QWLA 3O1WA 1NLVA 5KPRA 1NGFA 4PKIA 3O80A 1NGGA 3AARA 3CJCA 1BA0A 4ISGA 1HJOA 4EHUA 1E4FT 4JHDB 4MLHA 3CERA 2ZGZA 5LJVA 3GBTA 3IFRA 3ENOA 3MK6A 1NGEA 4BG9A 2YI1A 5AQMA 2NRHA 3ZEUB 2H3GX 2PAVA 1HPMA 4JNEA 4B1VA 2HMPA 1HUXA 4HTLA 5AZIA 3F9MA 1MA9B 1NGJA 2AP1A 2IVOA 4ISEA 3BEXA 4K41A 5BPNA 3GL1A 2E2QA 1C0FA 4L3QA 3C0BA 2QWOA 3JXUA 3DAWA 1Z6RA 3FZKA 4AM6A 1BG3A 1NGAA 3D2EA 3KVGA 1V4TA 3QMLA 3D7EO 4CZLA 4CD3A 4BRFA 4RTFD 4Z94A 4RCHA 1K8KB 4FO0A 4PL8A 4BRAA 3M1FA 4IO8A 1QZ5A 2VCPA 1GLLO 4DCHA 4JAXA 1XC3A 3C7NB 1KXPA 4FWMA 3R8EA 1YVNA 3LDOA 1RDWX 1H1VA 2ASMA 3R9PA 5FPEA 4WQ4C 4BREA 5AQJA 4BRKA 1JCFA 1MDUB 3IMXA 4HWIA 4MO4A 3WQTA 4PL7A 3KHYA 4BR5A 2I7NA 1NBWA 3BF1A 3I8BA 4WQ5C 3A5LC 2P9IA 1LOTB 1K8KA 2HF3A 5KQ8A 3ULEB 4M7XA 2ASPA 5JMVA 4B1ZA 4BR9A 1GLJO 2A3ZA 4BQZA 1QQOA 5AQGA 2W41A 3RSEB 1GLDG 4CBUA 5AQXA 2P9KB 4BC5A 3CJ7A 1YUWA 2P9KA 3VGMA 5BPLA 1T44A 3QFUA 1BDGA 5AZIB 2GTDA 3CJBA 4KBOA 3WXJA 3VEXA 1YXQA 3UE5A 3BF3A 1GLEG 4MO5A 5AR0A 4K42A 1HKBA 2E2NA 5AQWA 4M63C 4EHTA 3ZETB 3ULEA 1NGCA 4XH5A 4B9QA 3IDHA 4BRGA 2P9IB 1NGBA 2HF4A 4IJNA 3VPZA 5KPTA 4H5RA 2QWNA 4BRLA 2IVNA 1ZC6A 3EKUA 3CQXA 5E84A 4BC2A 4F9OA 3FE1A 3O1BA 1JCGA 1SQKA 5EXWA 2HOEA 5F1XA 2D0OA 2FXUA 3FLCO 3SJHA 3VEOA 1BWFO 3CHWA 4A62A 3CJAA 4CI6A 3CJ9A 2E88A 3D2FA 3I33A 5AFUA 1EQYA 1Y64A 4I6MA 2FLOA 4FWPA 4Y0WA 3CETA 1X9JA 5F0XA 4BRQA 4NB4A 3ENHA 1TUUA 3W3DA 5BN8A 2F9TA 4JD2A 3IUCA 3QFPA 3UKRB 5AQRA 3UKUB 4FWLA 1NM1A 2P9LB 4BVOA 2P9SA 2YCHA 1QQMA 1ESVA 5LY3A 2UYTA 4BVPA 4E1JA 4M7YA 4QS8A 5AQZA 4IZ9A 4EAHD 3H3NO 2FSNA 3BP8A 4CZMA 1GLAG 1IJJA 5KQDA 3WXLA 1MWKA 2J4RA 1YAGA 2QWMA 4CZHA 2E20A 3WEEB 4CBXA 2A6AA 2QWPA 4FPAA 3ZEUA 3H3OB 4FWQA 4FWKA 2Q0RA 3A8YA 3VENA 2E1YA 2YHWA 5BN9A 1NWKA 1D4XA 2GELA 4QS9A 4FOIA 4H0VB 5AQOA 3LDNA 1C0GA 4I6MB 5BRHA 1NMDA 5BRDA 1X3NA 4BROA 4QS7A 1JCEA 2GUPA 3ID8A 3LDPA 3B8AX 3ATUA 4IJAA 2QWQA 5I9EB 5AQIA 1IG8A 3U8XA 2W40A 2OANA 5JICA 4BRMA 4CJ7A 1QHAA 1SAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NCAA 3JSMA 1T6DA 1ILYA 1SUQA 3THVA 1YT3A 4CCHA 1W7AA 3ZETA 2Q2RA 3FR0A 3U3GA 4G1QA 5AQVA 3WXKA 1VQ9N 2HNZA 3R6MA 1ZBFA 4FLWA 3JS6A 1VSKA 4R79A 3HSCA 5C2DA 1VSFA 4CZJA 3ZSZA 3LWLA 3MDQA 4R5PA 1DGKN 2IOCA 5HP1A 1RBUA 4C8OA 1YVUA 4DF4A 3UKUA 4HHTA 2KQ2A 5FPDA 3KZBA 1M1KO 4J2AA 2BUPA 2IAJA 1NJXA 4IG0A 3NH1A 3U9ZA 4N5SA 4M3TA 2NRRA 4LFAK 4CZGA 3EY1A 4A5AA 4ICLA 2AA4A 1I3AA 3RVCA 4LF4K 1QZ6A 1T7PA 3VEYA 3PX0A 1XHXA 3F73A 4CBWA 3P4IA 5AQNA 3O6WA 1S9GA 3WNHA 4CGGA 5C15A 1ZBSA 2E2PA 4Y1CA 2B6AA 1TUYA 5DM7L 2HHWA 4KREA 3QBWA 5ADXH 3CPWM 1RT2A 2GEMA 4LH5A 1J6ZA 4A61A 1HX1A 4DS4A 4FK2A 3VEWA 3T7ZA 3MN5A 5HOOA 3E9LA 1X9SA 3D2EB 1S1UA 1NG9A 1UAXA 2F96A 2D0PA 1OH8A 1KLMA 4E1MA 3JYTA 3ZT3A 4OX9K 5AQKA 3OYKA 4AHVA 4IOXA 5FPMA 3QESA 1JLCA 3VEZA 1JLGA 3M8QA 3TSPA 1HYSA 1HNZK 2VG6A 3RWUA 2Q97A 3IAYA 3SK3A 5E41A 3OA9A 2QK9A 4Z4IA 5HBMA 5HRRA 5HRPA 3I8DA 5AQSA 4YOVA 1VRTA 4B8CA 1XWLA 3OYJA 2NLXA 4FWRA 1IKXA 5AQHA 5FLXO 3KK7A 4FZYA 3CFOA 1WSIA 1CLQA 4B9NA 5M1NA 3K2PA 4IWVA 3VQPA 4PHTX 3CCEN 3RMDA 4FYDA 3RMAA 2A1RA 3D6RA 3DJCA 3M6GA 5CYQA 3TU5A 3KLHA 1SL2A 3NF9A 2I7PA 1LW0A 2ATQA 3H46O 3UB5A 3NE6A 4CZKA 3AY9A 2HHHK 5KRTA 4DTOA 1B9DA 1WAJA 3PX4A 3VTHA 4CGFA 3SI6A 2OPPA 1OVYA 4DLEA 3H1VX 4B9UA 3HTVA 1KRPA 4OGEA 1NK7A 1XUPO 4AQYK 1YJWN 3HXMA 2OZSA 5AZJA 2BH1A 3HL8A 4RWTA 3O9QA 3DWLA 4CFDA 2F8TA 4H5NA 4YNQA 1MU2A 4O8KA 1HMVA 2XY6A 3P38A 1FK9A 3OVNA 3H6EA 1BIUA 1JLEA 2RN2A 3LDQA 3QINA 5LJWA 3VQ9A 4KB0A 1WN7A 3T69A 4QAGA 2FBTA 1X9MA 3NFAA 1JLBA 2B5JA 2EX3A 4Z0UA 3CCJN 3MWPA 1N8RO 4O5FA 1RT5A 3QNNA 1XQSC 2X6NA 5CY4A 4H5VA 3G6EN 4XH4A 1EX4A 4CK2A 2WOMA 3HM8A 4FJ7A 4Q0BA 4FWOA 4GY2B 4ELVA 1S5JA 3AAQA 2YJFA 2XY5A 4FJJA 4DFKA 3MN7A 4CEFA 1C0TA 2OA8A 2QWLA 5KPRA 3CYMA 4DSKA 4ELTA 4JKBA 3THXB 1LW2A 4ILJA 1RBRA 1E4FT 1N34K 4MLHA 5LJVA 3IFRA 5C25A 3RR7A 1RTHA 3V81A 3SJJA 1NGEA 3MAQA 1NKCA 4FJMA 3ZEUB 1HPMA 4JNEA 4B1VA 2HMPA 3F9MA 3C6UA 2UU9K 4B9SA 5AJ3K 4K41A 1LWEA 2E2QA 1C0FA 3TR8A 3C0BA 2QWOA 4BDPA 3K59A 4DTRA 2OPSA 1J54A 4M3ZA 3BZCA 3D2EA 3KVGA 3NGIA 3OTOK 3VQ8A 4JI7K 1Z25A 4OPHA 1NMNA 3AVGA 4BRFA 4Z94A 4FO0A 4PL8A 3OBYA 3E9OA 4OPKA 4I9QA 4CVNE 3V9UA 3L2QA 1VQ5N 3C95A 4E89A 3R8EA 3LP3A 1RDWX 3O3FA 4B3SK 3TSQA 4BRKA 3K58A 2XY8A 3WXMB 3KWGA 4WCEL 1J5OA 1L5UA 3K5OA 2YKNA 4WQ5C 4EP5A 1K8KA 1Q86O 3AV9A 2PFUA 3FFIA 3PUFA 4NXMK 2OTLN 5KQ8A 4FJ9A 5C0YA 3NF8A 3NCIA 4M7XA 4AH9A 2WC9A 4FZXC 4BQZA 4M41A 5JS2A 4G9ZA 1VSLA 3OYNA 4DTPA 2DY4A 2YNFA 5AQXA 1KLNA 4JV5K 1QHTA 3BZKA 4DU3A 1DLOA 5BPLA 4FVMA 3SQ4A 4N76A 4KHWA 3T1AA 3G4SN 5IT9O 4O4GA 4MO5A 3QEPA 4BE2A 5KTQA 3ZETB 4ID1A 3C94A 3ZYYX 3I0SA 3L2WA 4B9QA 2E6LA 3IDHA 3AA5X 4KH5A 3KLFA 4FJ8A 4IDKA 5KPTA 4BRLA 4CIGA 2IVNA 1ZC6A 4F9OA 3PIOL 4NYFA 2UUCK 4KHYA 1NKEA 3O1BA 1JCGA 3DLEA 2HOEA 3CC4N 1B92A 3NVMA 4DR3K 3U3YA 1BWFO 4HUEA 3CJAA 5AFUA 2VG5A 4OKKA 1EQYA 1Y64A 4Y0WA 2FLOA 1VQ6N 3CETA 1X9JA 4NB4A 3ENHA 1TUUA 4FXDA 3DLRA 5GIOA 2F9TA 2OYQA 4H4MA 1P90A 5AQRA 3UKUB 1K6YA 4CF8A 4CEAA 5FRMA 1ESVA 3AGKA 3DI6A 2UYTA 1UOCA 4BVPA 4O8UA 4FM2A 5DMRA 2ZJQL 3IRXA 3BP8A 4CZMA 1GLAG 1IJJA 5KQDA 1RTIA 2ZM6K 1CXQA 4CBXA 4FPAA 4Z4HA 4IKFA 2Q0RA 2X78A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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