3H45C

Glycerol kinase h232e with ethylene glycol
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
500
structure length
500
Chain Sequence
b'EKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYEFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKFKAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule tags Transferase
total genus 169
structure length 500
sequence length 500
chains with identical sequence D, O, X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2009-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
C PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h45C02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h45C01
2P9KA 1S22A 3CQXA 2QWNA 4BVPA 3ZETA 4RWTA 4EAHD 5AQRA 5AQJA 4BG9A 3SJHA 4CD3A 5BRHA 2D0PA 2P9LA 3BEXA 1ZC6A 3DAWA 3O4WA 4CZHA 3C7NA 1WOQA 3VEWA 1QQNA 1JCFA 1V4TA 4BC4A 2AA4A 4EFHA 2I7PA 3HSCA 1R59O 5AZJB 2FSJA 4O5FA 1TUUA 1DGKN 1MA9B 4H0TB 1QQOA 1SAZA 4XEIA 3VEOA 2DPNA 3H46O 3VOVA 1T6CA 4ISGA 3A5OC 1ATNA 4BR4A 3QFPA 3ZX3A 4BGBA 4CZMA 3FZMA 5AQHA 5BR9A 3QICA 4FWRA 4MLEA 3LDLA 4CZIA 1RGIA 2Q97A 1NGIA 1X9JA 4BC2A 1E4GT 3HTVA 2FSKA 5F2RA 2P9PB 3D2FA 3VGMA 5LY3A 5BPMA 3GDQA 4FWMA 5I9EB 5EX5A 2E1ZA 4DCHA 2PBDA 3O1BA 2QWRA 4JAXA 3SMSA 3CI5A 3IFRA 1C0FA 2W40A 3QBWA 5LJVA 4XH5A 2AP1A 1S3XA 5JLFA 3MDQA 2BTFA 2QWMA 4H5WA 4CBWA 4IJAA 3GBTA 2GWJA 4B9QA 1IJJA 2P9NB 2F9TA 4BRMA 2YI1A 3WUHA 1G99A 4IZ9A 2A40A 3L6QA 2GUPA 5AQXA 4JHDA 4B1YB 3MN9A 3QMLA 4CZGA 1NM1A 3DXMA 4CZKA 1HKBA 2QWPA 5AQZA 3O8MA 3VGLA 5AQWA 4F9OA 2BUPA 4GY2B 3H6EA 5E26A 1DEJA 4M7XA 3AAPA 1NGAA 5KPTA 3O5BA 4BRHA 2KHOA 2ZGZA 4YDUC 1SQKA 2J4RA 5KQ8A 3TU5A 4BQZA 5AQKA 3EZWA 1HUXA 3IUCA 2HF3A 1TYQB 4BRDA 2CH6A 1GLCG 4J8FA 3O1WA 3WEEB 3VETA 2D1KA 5ELZA 1Y64A 2E2QA 1T44A 3U4LA 1WUAA 1HJOA 1U6ZA 1TYQA 1X3MA 3CIPA 3D2EB 4FWQA 5AQFA 3R8EA 3S41A 1HLUA 2CH5A 4I6MB 3EN9A 5AQOA 4FPBA 4IO8A 4BRNA 1RFQA 3EL2A 4K41A 2FSNA 5AQIA 1JCGA 3H1VX 2PAVA 1TUYA 4B1VA 2P9KB 4BR5A 3RSEA 2FF3B 4A2AA 4CZLA 3ZETB 5CE3A 3A5MC 5AQPA 5EVZA 1P8ZA 3D7EO 2CGLA 3L0QA 4YDUA 3GG4A 4PL8A 2P9LB 4RCHA 4Y0WA 3MMVA 3GOIA 2Q36A 1ATSA 4BC5A 4B1ZA 4FWLA 1J6ZA 3C7NB 3EKUA 3VPZA 3DXKA 4B1XB 4B1UB 3QBXA 3UKUA 2EWSA 5E84A 3FZFA 2NLXA 3JXUA 4B1WB 2YHWA 4FWNA 2FXUA 4WQ4C 2P9UA 4H5NA 1GLBG 2H3GX 4IJNA 4WQ5C 5AQTA 1LCUA 5EY4A 3WXJA 3FR0A 2P9SA 3FZHA 1NLVA 1Q18A 4K43A 4A62A 3ENHA 4AM6A 1NMDA 5AQLA 4EHUA 2E8AA 1NGDA 2IIRA 4BR2A 5F0XA 2QM1A 3CQYA 1QZ5A 1K8KB 3C0BA 4FWKA 5BPNA 4ISEA 3DWLA 3VEZA 3W0LA 5TKYA 4H0YB 4L3QA 4A61A 1YUWA 5EXWA 1MWKA 1K8KA 2ZWHA 4JNEA 3R9PA 2ASOA 2E1YA 3D2FB 3FE1A 3VEXA 1BA0A 4QS7A 1MDUB 3FFKB 2YHYA 5KPZA 3ATUA 4IXCA 5ADXH 3H3OB 3WQUA 2ASMA 2W41A 4A2BA 4CZFA 1NGHA 5EOYA 4WQ5A 2CGKA 2E88A 3U8XA 4CD1A 4CBXA 4E1JA 4PKIA 4EHTA 5LJWA 3IMXA 1U2VA 1XQSC 4FWPA 1GLAG 3CJBA 5AFUH 4H5RA 4H5TA 4FSVA 4FO0A 1H1VA 4MO4A 5FPNA 4BGAA 3B8AX 5AZIA 2GTDA 3M6GA 4JHDB 3UE5A 3VENA 2V52B 1MWMA 3DXMB 2A3ZA 4FOEA 4H0PA 3VEYA 3WXKA 4BVOA 5BRFA 2A42A 3CJ1A 5JICA 3BUZB 3W3DA 4LC9B 1BUPA 3OHRA 2HMPA 3H45C 4BRLA 1Z05A 4ISFA 3FGUA 1BA1A 2D4WA 3MN7A 3FZLA 3LM9A 3CHWA 4JN4A 2ZF5O 3WQTA 2FF6A 1CZAN 5KPRA 4H5VA 4DB3A 1DKGD 4GNIA 4BC3A 1BU6O 3HBTA 3LDPA 5FPDA 3QDKA 3SLCA 4DHYA 2ZGYA 3M1FA 2P9IA 2Q0UA 5B8HA 3EO3A 4AM7A 1BG3A 1BOTO 1ESVA 2GWKA 3R6MA 3A0IX 3VESA 5BRDA 5ADXA 2HF4A 2HOEA 1HX1A 5AR0A 3CJCA 3TPQA 2E2OA 3ID8A 3RSEB 1NBWA 1GLFO 4FPAA 3LL3A 4KBOA 1KAZA 2V7ZA 2QWOA 3AAQA 3MN6A 3O80A 3ZX0A 4BREA 2YJEA 3HZ6A 4PKGA 1YXQA 3LM2A 3FZKA 3MK6A 3ULEA 5AFUA 3ATVA 3WT0A 3U9ZA 3DJCA 3DXKB 4HWIA 3UKUB 3GL1A 4FWSA 1XC3A 3HM8A 4XH1A 2QXLA 4WYBA 3CERA 3EKSA 2P9UB 1NGBA 4JD2A 1HKCA 1HPMA 2P9SB 2E2NA 5AQQA 5AQYA 3A5NC 4M7YA 3KVGA 1T6DA 3I8BA 4O8KA 3P4IA 2QWQA 1NGEA 3MCPA 4RTFD 3AY9A 4QS8A 1RDWX 4C23A 1BO5O 4BRFA 2QW9A 3H1QA 3IDHA 1NGJA 2OANA 3LDQA 4EIAA 3AARA 4BRAA 5BN8A 3CJ9A 4H03B 3UB5A 3SK3A 3I33A 4BRPA 4BROA 3ZEUB 4BR9A 1BDGA 3VF6A 3VERA 5JMVA 1X3NA 3CJ7A 3CJAA 2IVOA 4BQLA 4K42A 1U2VB 4WQ4A 1BWFO 3BF3A 2Q31A 3ZEUA 5AZJA 3L4IA 4Z94A 1ZBSA 1QQMA 2Q2RA 3ENOA 4CI6A 3M3ZA 5JLHA 4H0OA 5AZIB 3VGKA 4BRGA 1V4SA 2QWLA 2E20A 2IVPA 1YVNA 4BRKA 1OKJA 2IVNA 5AQGA 2NZTA 2UYTA 2VCPA 2CGJA 2VYPA 3MN5A 1KXPA 2Q1NA 4FL9A 4PKHA 4IWVA 2ITMA 1HKGA 2YHXA 1NGFA 3KZBA 4QS9A 4M63C 3U9DA 1LOTB 5FPMA 3H3NO 3O08A 3VF4A 1JCEA 2P9PA 3F9MA 3JS6A 4BRQA 1NWKA 5FPEA 1C0GA 3WXIA 5BN9A 2V7YA 2ASPA 2FLOA 4PL7A 1GLLO 3GE1A 4H0XB 4BG8A 4MO5A 5BREA 3BP8A 3G25A 2NRHA 3O6WA 3SMPA 3LDNA 1GLDG 2D0OA 2E2PA 2YCHA 3QB0A 4XH4A 4CZEA 5AQNA 4BR7A 1QHAA 2P9IB 4NO7A 5BPLA 5KQDA 2I7NA 4H0VB 4NB4A 1ZXOA 4K25A 5AQVA 3HI0A 5F1XA 2P9NA 2F9WA 5AQSA 3J8AA 2VWBA 3UKRB 2GELA 2WUSA 4DQ8A 2V51B 4FWOA 1Z6RA 2YJFA 2A6AA 3ULEB 3FLCO 3CETA 3UKRA 4BR0A 1NGGA 1NGCA 1SZ2A 1D4XA 4HTLA 2A41A 3VEVA 1GLEG 3VF2A 5AQUA 4JD2B 3LDOA 2GEMA 3A5LC 1QZ6A 1KAYA 3WEEA 2Q0RA 3A8YA 4MLHA 4BRCA 3KHYA 4FOIA 1E4FT 4CJ7A 4BRIA 1ATRA 3ZX2A 3D2EA 4I6MA 1EQYA 1IG8A 3WXLA 5AQMA 2A5XA 3BF1A 1XUPO 3QFUA 1YAGA 1KAXA 4CZJA 4CBUA 1GLJO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZHRA 2QWNA 2P5GA 4FJNA 3TAQA 5AQRA 4DR4K 4NCBA 3C7NA 2OZSA 1CXQA 4EFHA 3F5TA 3HSCA 4OKJA 5KRSA 3E9LA 3G71N 1QSSA 4B9UA 3VQ6A 4B9TA 3J7AP 1XI1A 4CFAA 4BE1A 4CW7B 4IG0A 4B9NA 1T6CA 3HPHA 3KJVA 4GV6A 3U3YA 4BR4A 3QEVA 1RTJA 1ILYA 3SBGA 3KWGA 3ZX3A 4OX9K 5AQHA 3ZSYA 3VQDA 4JRPA 4KHUA 4IOCL 3RMAA 4W5RA 3R3LA 3ZSVA 1X9JA 3CM5A 5DK5A 2QXFA 4BC2A 4C1NK 5CR4A 1FJGK 4Q0BA 5LMNK 3D2FA 3VGMA 2NRWA 1C0TA 4JKDA 3GDQA 4FWMA 5I9EB 4J2BA 1ITGA 3SYZA 3O1BA 4JAXA 1SKSA 3IFRA 3AVIA 4CJUA 3V4IA 4O0IA 4BDPA 4A57A 5JLFA 1JLQA 1TAQA 4H4OA 4Z4HA 1HYSA 3V9XA 2XY8A 1G99A 3WNGA 3KK3A 4FVUA 4FM1A 2GUPA 5AQXA 4JHDA 4E7JA 3MN9A 1CLQA 4CHOA 5JVHL 2P1JA 4CZKA 3KLFA 3IKMA 2QWPA 4DSFA 5AQZA 3VGLA 2X78A 3H6EA 5E26A 1DEJA 4DFMA 1WN7A 1YITN 2KHOA 4DMNA 1T03A 4CHQA 3VMFB 3DLGA 5KQ8A 4LF4K 5I42A 4R5PA 4E1NA 1L3VA 3CC4N 1TYQB 3NF7A 4CK1A 3EY1A 3ZLJA 1JLFA 1WAFA 1HRHA 5ELZA 3QLHA 3NVMA 4DFPA 1VSIA 5AQFA 1NK4A 4NXMK 1X3MA 2JLEA 1HLUA 4FLXA 1ZYQA 4BRNA 3EL2A 1N33K 2YKMA 2FBVA 2XRIA 1TUYA 4NLCA 4B1VA 4BR5A 3P1GA 4A2AA 3K59A 1RDAA 1J5EK 5AQPA 3D7EO 3K2PA 2CGLA 3GG4A 4PL8A 1SL0A 2KZMA 3GOIA 3NAEA 2ITGA 4X65K 4JK7A 2PY5A 4B1ZA 4IOAL 3C7NB 3P39A 4B1XB 1KVBA 1IKYA 5E84A 5KGWA 1HR0K 1RT1A 3IAYA 3FZFA 1TVRA 4I2QA 4WQ4C 3G0ZA 1GLBG 4HHTA 4ELUA 5AQTA 1LCUA 3FR0A 3I56N 1NLVA 3TAPA 1HYZA 4EHUA 1XHXA 1NGDA 3M8QA 3TR8A 1RBSA 5HRSA 3ENBA 4WFNL 3M8SA 1MU2A 5GIPA 4A61A 4DFKA 2OA8A 1NK0A 4EP4A 2ASOA 4KAZA 3D2FB 4AF1A 4QS7A 4DS5A 3RR7A 4FJGA 3FFKB 4ID5A 4CHYA 3K5LA 5ADXH 4BDYA 1WB9A 1D8YA 5IWAK 3QO9A 4B9LA 4LSLA 3CYMA 4YOXA 3VA0A 1XQSC 3PUFA 1NK8A 4OPKA 1JXEA 3O9SA 4E7KA 4IKFA 1CZBA 5HL7L 1KFDA 1DTTA 2GTDA 2LSNA 3T1YK 4JHDB 4FLTA 1BCOA 2GV9A 2G8UA 4FOEA 4BVOA 4E1MA 2A42A 1VQ9N 1SV5A 1FW6A 2HMPA 3I0SA 4FJ8A 4F2RA 1Z05A 4ISFA 5A2QO 2JWLA 4O8UA 1VSKA 3LALA 3FZLA 1BL3A 4DR3K 1YTAA 4FJIA 1SS6A 4J2DA 3E1YA 5KPRA 3K9KA 2NUBA 3QDKA 4DQPA 3SLCA 2P9IA 4E7IA 1TKDA 4AM7A 3IS9A 2HOEA 3MWTA 5AR0A 3M8PA 1XNRK 1NBWA 4FPAA 3LL3A 1GOCA 3MEDA 1YF5L 1EWRA 4OGEA 2VQFK 3G10A 2QWOA 1C1AA 3MN6A 4BREA 4J2EA 4PKGA 3LM2A 3FZKA 4FLZA 4Y1CA 3PY8A 4CGJA 4R79A 2VG6A 4HWIA 4C8MA 4AILC 4FWSA 1IKVA 5CZ2A 1XC3A 1WSIA 4OVLA 2QXLA 4DR7K 4ID1A 1HJRA 1HKCA 2E6LA 4ZTJA 3OTOK 1T6DA 4JS4A 4CVNE 4LSNA 5FROA 3DRSA 3P4IA 1WAJA 3MCPA 4JI0K 3SPYA 4N41A 4LF7K 4JI8K 3S3NA 4KHPK 1VSEA 3H1QA 1NGJA 4CJEA 1WBDA 1RT3A 4ICLA 4GKJK 5GINA 4KHQA 3CJ9A 2Z1IA 3MXMA 3BZCA 4BROA 1NK7A 4BR9A 1WSFA 3IRXA 1Z26A 3T1AA 4EZ6A 4BQLA 1N32K 3NH2A 3ZEUA 1X9SA 4Z94A 1ZBSA 1OH6A 3ENOA 4ILHA 3K58A 1NU0A 4BRGA 1FKPA 4JKBA 3O3GA 2IVPA 1UWBA 4B3TK 4IBNA 4PWDA 1LW2A 2IVNA 2NZTA 2VYPA 3MN5A 3SZ2A 4FJ7A 3L4QA 4DV7K 2ITMA 4KI6A 1S1TA 2IC3A 2WONA 3F9KA 3L3UA 1XC9A 1X9MA 1JLCA 2ZE2A 1LOTB 1OH8A 5EU7A 4BRQA 3ZT4A 1VQ4N 1M90O 3WXIA 5D3GA 2V7YA 1KQSM 3TTDA 2KFNA 4JKGA 3BP8A 3O6WA 3L2QA 4JKCA 1EO1A 2ZJPL 4A59A 3VQ8A 2VWJA 3QETA 4O0JA 5J1EA 4CJ3A 1UA0A 1X9WA 4DR5K 4LF9K 2P9IB 3OBWA 2O8EA 3OY9A 5KQDA 5HRPA 2I7NA 1ZXOA 3ALYA 1OH7A 2I5JA 2P9NA 3EE8A 2F9WA 4PA1A 1RDUA 4X62K 1WBBA 3N4QA 3SJJA 3AO1A 5J2MA 3AVGA 4GV3A 2RE2A 2GELA 2WUSA 4DQQA 2YJFA 3CPEA 3CCUN 1Z25A 4I2PA 1CZ9A 4G1QA 4M3UA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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