3H4KA

Crystal structure of the wild type thioredoxin glutatione reductase from schistosoma mansoni in complex with auranofin
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of Schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase by auranofin: structural and kinetic aspects.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 174
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2009-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 3h4kA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h4kA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA03
1TDOA 2YVGA 1K0AA 1RK4A 3GSSA 3LJPA 1DE2A 3NK0X 5AIXA 2B5XA 4ZCCA 4MJAA 4NHZA 2H0HA 1E2YA 4KUNA 1L0VA 2LEGA 5IM9A 2WS3A 2PHHA 1A23A 3RAZA 1A8YA 2WDQA 2LUSA 1AAZA 3ALJA 3U6VA 4NXIA 2ZZ0A 3I43A 3C7MA 4H4YA 3D22A 4A7AA 3APOA 3ME7A 5L46A 1MDIA 18GSA 4BWSA 1T4YA 3PGTA 2OJLA 4JR6A 3NN6X 3LOVA 4EVMA 2FWFA 1IUVA 4A6NA 4YXDA 2WQYA 5EL8A 4G10A 1GTUA 4WX1A 1H84A 2C75A 4EDYA 4OWYA 4ACSA 1UN2A 5J60A 1X9SB 4YT0A 3UVHA 3P1WA 3GYKA 1UC7A 3I6AA 2C3DA 2R3XA 3F4TA 2XCGA 2GAHB 2A2RA 3AWIA 4H2QA 2B9WA 2QCUA 2KP1A 2C70A 2C0EA 3FG2P 2GT5A 4H4SA 2OA1A 4RI6A 1XXUA 1DOBA 2LQOA 2ZZCA 2VD0A 2N5BA 2HXKA 3MDKA 1TP9A 3EE2A 3DD3A 1S3DA 2K8VA 5FS6A 4KE3A 3M0FA 2FY6A 1K0MA 2C73A 2YV7A 3WD6A 1GWCA 4ILFA 3I69A 1QK8A 3D6IA 1XPQA 4FO5A 1FEBA 5HFIA 3GSTA 4B67A 4YH2A 2C67A 3GIXA 3FR6A 4KAEA 3VWVA 1GESA 1T00A 2A87A 2AQJA 2VRLA 2GB0A 1B37A 1GTAA 4HZ4A 1T3BA 5HFKA 2HYXA 4LIIA 3PVCA 2OAMA 3IHMA 3UOYA 5G5FA 1ZYEA 1XBSA 4U2LA 1BGNA 4IS0A 5JCLA 1ZZYA 2E7PA 4UDPA 2XBIA 3AE5A 4EQSA 2GQFA 2VL9A 1Q9IA 1O73A 3EVIA 3CN8A 4FH8A 5CKUA 1XHCA 4GQCA 3GHAA 1KBNA 2BCGG 2FLSA 1TRUA 5U25A 1E6BA 4YWOA 1SL2B 3CGDA 4IVFA 1JNRA 2JK6A 3KJYA 5EB5A 5IQ4A 3Q6JA 4GSNA 1CF3A 2R0PA 4MH2A 4TR4A 3KLJA 3LYPA 2EQ7A 3UMAA 2P0GA 4I58A 2L57A 1D7LA 3NN0X 4LLRA 2WFCA 2PWJA 4H50A 3OC4A 5ID2A 5DAKB 2H30A 1F8WA 1JHBA 1VGLA 5EY6A 4F0CA 2R4JA 3CPIG 3M0OA 2MYGA 1PJ5A 4G9HA 1SKRB 3KVEA 2BCPA 2Q7VA 3AEDA 4U8OA 1PXCA 4B63A 4MPGA 2C72A 5BRTA 2YZUA 1V9WA 1D4EA 3NOFA 3OZ2A 2H0GA 1EL7A 5D9TA 2WU5A 3AE8A 1MDKA 20GSA 3QFAC 3QVPA 5F0GA 2VZ2A 3CGEA 2LRNA 1ZOFA 5IPYA 1X5EA 1DJNA 2YVFA 4GRFA 1H7XA 3L8KA 3QD9A 1O94A 2X3NA 3FMWA 1OJAA 3C4AA 1NEKA 3PR8A 4K5RA 3DVXA 2EC4A 10GSA 2QSIA 1XVWA 2ZBWA 5ELGA 1M0UA 1T7PB 1BGJA 1J08A 3GX8A 4AJ8A 2WHDA 2GV8A 1EV4A 3ZVJA 2C80A 4X1UA 4GTUA 4EM4A 2CVBA 2QGVA 4A79A 2I9HA 2VIMA 1L9DA 4JY3A 4FK1A 2XVJA 3KP8A 1BX9A 1VRSD 1GEUA 3VWUA 1CC6A 1X0RA 3GX0A 5KEJA 4NHWA 1BF3A 4TLXA 4J36A 2BXSA 2B5YA 2VAFA 3KMNA 4KSMA 4H4XA 3AE7A 3DJDA 3FYGA 1YKAA 1PHHA 1A2JA 2XFOA 4GSSA 2X8CA 1ERWA 1UVZA 3HZ4A 2TRXA 3IPZA 1IYHA 1QQ2A 1WOUA 2O8VB 2HQMA 1ML6A 1E1NA 3WE0A 5AIVA 3UTEA 1ZY8A 2LJAA 4D73B 2YG6A 3GURA 3LJRA 2YLRA 2XVEA 1GRGA 1E6EA 2YJ7A 5CRHA 1EZKA 2N5AA 2P5RA 1GUKA 2RLIA 2IMEA 2GR2A 3ALLA 4BK2A 1MO9A 4H4VA 3URHA 2H01A 3H8QA 1J0FA 3VRBA 2GT6A 4KDUA 1REOA 2PU9C 1GOSA 4BK3A 4TM4A 4L5OA 2BA9A 1TOFA 1OJCA 3ZDNA 1K3YA 3Q74A 1OE8A 2H6XA 1GNEA 4PUAA 4XS6A 1IJHA 5CP1A 3KP9A 3ZREA 2VCWA 3IHGA 2YZHA 1D5TA 2M72A 2V60A 4MJCA 1N8JA 1LQUA 4BURA 1FOVA 1A0RP 3M12A 3L1RA 1XFLA 5IOWA 2LJKA 4N0VA 2ARDA 1FCDA 2XFNA 2G0FA 3ICRA 5DJLA 2C0GA 6GSVA 5ECIB 1QFNA 2HRFA 2C4JA 2VCQA 4XS1A 2VL3A 4CCRA 2JU5A 1LPFA 1O6JA 5DQSA 3NH3X 4ZXGA 3TRPA 3QMXA 2KP2A 1GT8A 5C3JA 4MMMA 4Z2TA 3GTUB 3HHVA 2V6OA 1YDKA 3GH6A 4KA0A 2XLPA 3GDNA 1D4CA 5KVHA 5GSNA 3I9V2 2YANA 4K7OA 1DOEA 4KDXA 4H7UA 3HZ8A 3RP8A 2GR0A 4ADWA 3GKKA 2HZEA 3F8PA 3ISOA 3TB2A 1DNCA 1BWCA 2XPDA 4IQ1A 3V76A 2BTOT 2VQ7A 2R2JA 4EKZA 3K30A 2FA4A 3TJGA 3D1CA 1HNCA 4HB9A 3F3RA 2MBTA 2PERA 3HY2A 1A2LA 1YF0A 1G7OA 1H6VA 2P5QA 2VO4A 2YM1A 2WOWA 4OPIA 3ZYWA 2FWHA 2VOUA 2TPRA 3KTBA 3ABVA 1QGVA 5F05A 3CTYA 3VR9A 1V59A 1O85A 2CVJA 2H70A 1H83A 1SENA 4H4QA 2GSTA 4MH3A 1FO5A 1PBFA 4J2WA 1UKVG 2B7KA 2JZSA 2RUFA 4OCEA 1PBBA 3ITJA 3S61A 4WF5A 4A5LA 1PN9A 16GSA 3F0IA 2BC0A 1U3IA 4XWRA 2KOKA 3TRQA 3DK9A 3US3A 2GMHA 3E9JB 4EMJA 4K0GA 3C1RA 2AJQB 2V3AA 3IA1A 4IJIA 1YEPA 3U5RE 4YSZA 4FX9A 2PVOC 1Q1WA 3DH9A 2DBCA 2C3QA 4EQXA 5IMAA 3NLCA 1CQHA 2GEWA 5D9XA 4IQAA 4U8IA 4J34A 4J56E 1BYEA 3KTLA 5FWGA 1NM3A 1B8SA 1K0OA 4B69A 2NBSA 2H71A 5KN3A 4NEVA 3NT6A 4FYBA 2H72A 3ERFA 4TKYA 3EU3A 5BVAA 1M7TA 1PL1A 2MMAA 2RUEA 4MPFA 5FS8A 4H86A 5H5SA 1F3PA 1RYIA 2H6YA 3CRTA 2NDOA 1OC9B 2W0HA 4JNQA 3OR5A 4NZHA 4TR1A 3KH9A 4F2IA 1BG5A 4ZBAA 1OJTA 2X8HA 3EU4A 4TOPA 2I1UA 4X43A 3HVXA 5FT3A 4TVEA 5J4UA 2E0QA 2VRMA 3R2QA 3RHAA 5J7XA 2YG4A 3LB8A 1DJQA 3H8IA 2CA8A 4MP4A 1K0JA 1PJ7A 4IVMB 3F4RA 3E0UA 1PSQA 3ZMKA 1WWJA 4NV2A 4ZBBA 5HFGA 3BNUA 2X99A 2Q0KA 3NYFA 2WPEA 2I81A 1TW9A 3TUEA 3CIRA 3KGKA 4TXOA 1DUGA 5D93A 1CJ4A 5DBQA 1X9WB 5U1OA 3A2XA 2VCZA 4WR4A 2TRCP 3TJKA 3IXRA 3CNPA 1ELIA 2L5LA 2C0FA 3TKSA 1TDNA 1JRYA 2CVDA 1Q4JA 2WP5A 4YQMA 1P2EA 3KA7A 3TKRA 3WGXA 1AIUA 2B3SA 2B7RA 3GRSA 5ECHB 1JZOA 3A3TA 3I3LA 3UKQA 2PGTA 2RGJA 1GUMA 4HDEA 1U6TA 2RM5A 1VF2A 4ECJA 2WRTA 2YLTA 3BI5A 4MLYA 1NHYA 3TRXA 2GZZA 3VRDB 1ACVA 4EC0A 3F3QA 4YQUA 1Z7PA 3GMFA 1FG4A 2F3MA 3FK8A 4EE0A 4P9SA 3UOVA 1THOA 4OPDA 5ECOB 1E1MA 1XW5A 4O5QA 4H4TA 4K7NA 2XYOA 5DALB 1SK0A 1V40A 2B76A 2LSTA 1LQTA 6GSXA 2CT6A 3HVSA 1YQ3A 4C5OA 3EAOA 1Q1RA 1GSEA 2QC7A 5IOXA 2E4GA 4O5RA 3G5RA 3PH9A 3FRCA 5AISA 4GXZA 2BMXA 2GZYA 5B6MA 2A4VA 3VURA 3P9UA 1T8EB 3UCLA 2M46A 3QFAA 5LV9A 4HJ2A 2TMDA 4DNAA 2L4QA 2DKIA 4WR5A 8GSSA 1Q98A 3LZXA 3KZQA 1SKWB 2NTOA 3KEBA 4B64A 1T4ZA 4Y4MA 1CC4A 3ZZXA 4CY8A 3DGZA 4TM1A 4WETA 2LV3A 1E39A 4V2MA 1K0IA 2V1MA 3AE1A 4MJBA 1OAZA 1N2AA 2LNTA 3H4KA 4ULXA 5IMCA 1LJRA 4CCQA 1FB6A 5ECKB 1R7HA 1YEXA 4A9WA 4H4WA 1YQ4A 4IA5A 1XWKA 2F8FA 3ZIVA 3C73A 3DVWA 6GSYA 4ZB9A 2HE3A 5J41A 1TRVA 1BEDA 1XDIA 1FB0A 2GSQA 5H5QA 3ZTLA 3VWWA 2IN3A 2MMZA 1K0CA 3PS9A 3ISHA 4BVXA 1GRXA 3UIWA 1EEMA 4KCEA 1MDJA 1FHEA 3AD8B 3C71A 4X0XA 4AGSA 3D21A 1GSQA 3VQRA 4HS1A 2A89A 2BC1A 4J57A 4XS4B 4ICYA 1USBA 1Y6EA 2IPAA 1TI1A 2BYBA 2FNOA 3EPTA 3DJJA 1PJ6A 3ZITA 1XOBA 4Z2RA 2YOIA 3AEGA 3QSMA 4I2UA 3RP7A 2YLWA 3DEXA 4CNKA 4ZIJA 1Y25A 1F6MC 3F8RA 4YTPA 4EO3A 3VLNA 4IJ3A 3GNJA 1BQ7A 2IFQB 3M9JA 5CAXA 3M13A 3IR4A 4EM3A 2QA1A 3CMIA 4IBPA 4BJYA 5DBJA 4MA9A 2L5OA 4OFNA 4YAVA 4GRTA 3L9SA 4HQSA 2DKHA 3EF6A 4MCUA 1TXXA 1EWXA 1BZLA 1GRBA 1B4QA 5FMHA 1U3AA 3UVTA 2XLSA 1OJ9A 2BJXA 1GXFA 2XLTA 2YR4A 1EL9A 5IO2A 2DIYA 1CJ2A 4RUVA 3TCOA 4FDCB 5IMZA 1W4VA 2OADA 3QSSA 5KOXA 2XVHA 1X31B 2PPTA 1DSBA 2V3BA 4POKA 1GRFA 3L9VA 4ECCA 1Z6MA 5IPGA 3A5WA 5KN0A 1S2YA 1PBEA 4NMUA 1ZOVA 4K5SA 3AD7B 2GZPA 3TOUA 4H4UA 2JADA 3J7Yb 1FL2A 2AV4A 5JCKA 2I0ZA 1G7EA 4Z2UA 4XTSA 1XPVA 2CQ9A 2C66A 1LVLA 4EXJA 1B4PA 4RG3A 3P4RA 2NVLA 4H4ZA 2IMDA 4DSHA 4V2NA 1URMA 1F37A 2MZCA 2R0GA 5LD0A 5IMVA 1K0DA 4D73A 1G6YA 5INYA 1RSGA 2CV4A 4U2SA 1SYRA 1KSSA 4MF7A 5DDLA 3WGDA 4AF2A 3ICTA 3NK2X 2J23A 3O6TA 11GSA 1GTHA 3REDA 3GYJA 1DXLA 2CAQA 1JRXA 4PNGA 2I4AA 3JSKA 3LGCA 1S3BA 1Y0PA 3UP4A 2H8LA 3GDPA 5HR1A 3UOZA 4BJZA 4A6NB 3NZNA 4F9ZA 4OCGA 1TYPA 4OO5A 1GRHA 5ELAA 1WE0A 3KCMA 4CW9A 1FOHA 5FS9A 2V61A 3TJJA 2ACZA 1MD3A 4K2DA 2XVFA 1Z5YE 4CHSA 3GKNA 3L4NA 4ZCDA 1N4VA 3WT2A 3AEAA 3FZ9A 3VPQA 2GH5A 1F3BA 2VQBA 4O7HA 3SWLA 2E5VA 1N4WA 3S9FA 4OPTA 12GSA 4OMVA 2B7JA 2GS3A 1YKJA 3IC9A 2KHPA 3DK8A 2O89A 2V32A 3AXBA 3RNMA 4POLA 2F8AA 2MMOA 2WESA 3D8XA 4TXVA 2Z5YA 3UKPA 2WDUA 3LZWA 5IQYA 4BL7A 1SU9A 4PGTA 5G1LA 1CC2A 1J9BA 4V1Ap 4N9XA 5B8AA 2R6KA 2P31A 1WPIA 3GKMA 2YP6A 4QL7A 1S3EA 3ZRDA 3G5QA 3VRAA 2JACA 2R5GA 4KW6A 4L8EA 3F8DA 2XC2A 4Y4LA 5GSSA 3CGCA 3GD4A 3P4PA 1K3OA 1GNWA 3VK9A 1H7WA 1NDAA 3HD5A 1JNZA 2HLSA 1G0TA 2H0IA 5G30A 4K7ZA 4YKFA 4BV6A 3LXZA 2L6CA 1X9MB 5B6NA 5HXIA 1PX7A 2AB6A 4GSTA 14GSA 4PXOA 4V2LA 3ATQA 1GSDA 1Z9HA 3E3EA 4N11A 3AE9A 2HT9A 3AEBA 2GDRA 4MF5A 5GRTA 2X50A 4K22A 2C76A 4OPGA 5ECSA 4H2NA 2A8XA 3GUSA 5HYMA 2B9YA 2WU2A 4NPBA 3ZL5A 1TRBA 3BJ5A 5FHIA 3KD9A 5ID2B 4K1FA 4DGKA 3EYTA 4G19A 2Z5XA 1ZGNA 3P4QA 2AHEA 1JFUA 1OE7A 3J7Yk 3R9UA 4FIWA 5KOWA 2H66A 1Z6NA 5ECMB 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 4Q5F A;  3GV1 A;  5DCH A;  1SJI A;  1IYX A;  3SFD A;  1FW1 A;  4H19 A;  4H83 A;  2EIO A;  5C04 A;  3GH9 A;  2OBK A;  1D4D A;  4OPL A;  3IBH A;  3FHK A;  3GL5 A;  2R46 A;  3K7T A;  4D03 A;  3D9X A;  1ZMA A;  3B6D A;  4TXO B;  3T0K A;  1XIY A;  1MUC A;  3FJ4 A;  2K6V A;  3EMP A;  2YR6 A;  4WEY A;  1SL1 B;  4DSR A;  2OLO A;  3UOX A;  4U8M A;  1GV4 A;  4J57 E;  3DA1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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