3H6VA

Crystal structure of the iglur2 ligand-binding core (s1s2j-n754s) in complex with glutamate and ns5206 at 2.10 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Distinct structural features of cyclothiazide are responsible for effects on peak current amplitude and desensitization kinetics at iGluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h6vA02
3C9HA 3O6HA 1B4ZA 3BFTA 2Z22A 2Y84A 3T9HB 1QJMA 1DPPA 4KCCA 3TELA 2F8DA 2PX1A 2HZKA 5H8NB 1OQHA 2XXVA 1MQDA 5JEIA 3OMBA 4RY1A 2RC8A 3CSGA 2F34A 1PDAA 3LUYA 1B1HA 4OVJA 1Y9UA 1JW5A 2F7BA 4OHNA 2UVIA 4ELPA 2XD3A 2VD2A 1FTKA 5L9SA 1BTJA 3U93A 3MJNA 3RPWA 3FVNA 4HS7A 1LGBC 1NNPA 3R7XA 5ICTA 2GH9A 1OIBA 4DE8A 3M3FA 4GQOA 1A7LA 5IKBA 1A8EA 1QUIA 4OXVA 5EHMA 4LZ8A 4POXA 3G3IA 4YMBA 1N0TA 1ELJA 4QFNA 2H25A 1M5CA 1SW4A 2I48A 4NTLA 5I56B 3VV5A 1B5JA 3TAJA 2UYFA 2I6EA 2XXPA 4IO5A 2G93A 3UN6A 4NF4A 5ISUA 2I4CA 4Z0IA 4YAHX 1B52A 3SKPA 3W9VA 5CC2A 4OWDA 2RC7A 3CI8A 3ZKKA 2H98A 3M3KA 1WVJA 2E0SA 5ITOA 1XHYA 1EH3A 2A5SA 4NF6A 4JWOA 2PT1A 3TTLA 5L8DA 1PC3A 1B51A 1FTLA 1SD3A 2XX9A 2OWTA 3ECRA 2Y7PA 1FQBA 1AMFA 1EU8A 1LFGA 1H3DA 1Y3PA 2F6PA 1ANFA 1AIVA 3ILTB 3EHSA 4L17A 2P1SA 3IOTA 4U22A 3HO7A 4ONYA 3H6TA 4ZZAA 5AA1A 1D9VA 3C35A 3P7IA 2QL3A 1FTMA 1DTZA 3IOVA 3B6WA 1IITA 5TPAB 3FVKA 4ISUA 4YB7A 1SW5A 2Z8DA 4XIGQ 4OYVA 1N76A 3W9WA 1MM6A 5CMBA 1JNFA 3TPAA 3VXCA 1LFHA 4NE4A 3PUXE 1R9LA 1L5TA 2B65A 3K6WA 5KDTB 2HAVA 1QKBA 1DSNA 1S7YA 1II5A 1URGA 3PPRA 3FD3A 1F9BA 1B1XA 2ZNTA 4MH5A 2QS3A 3MP1A 4ZDMA 2FA7A 4R75A 3ZSFA 4F1UA 5CBRA 3DP4A 3G7WA 1SDXA 3FJ7A 3Q28A 3GBBA 3UGWA 5I2KA 3TYHA 5CMMA 3PMWA 2ZNUA 4ZECA 5H8QB 3FVOA 3K1PA 4F29A 5BWJA 3U1OA 4K3FA 3BFUA 2HFBA 4GD5A 1QW0A 2D21A 2AL4A 2OZZA 3T9UA 2A5TA 3LSFB 5F7VA 3CIJA 3PPNA 2Z8EA 4M1VA 4H0WA 3MP8A 1MQJA 3Q26A 3MBPA 1FCKA 4IO7A 1QVSA 4JWYA 4FAJA 3MW0A 1MDQA 3GXAA 3R26A 3EN3A 4OESA 4H6DA 3CFXA 3T93B 4Q8RA 4OFLA 1Q1KA 3RTWB 3TCHA 5HM4B 4R6HA 4OMBA 3TDJA 2OLBA 3K00A 2XXUA 3KBRA 4F22A 1MDP1 3EHTA 4U1OA 2YPNA 4P0GA 4BDMA 2A5TB 2DXRA 4R9GA 2QJEA 2Y7IA 2I3VA 3JYRA 1A40A 2HQ0A 3Q29A 1DTGA 4EXLA 4NWDA 4JWXA 2I0CA 3MZ1A 4QSEA 3D4CA 2NVUB 2O1MA 1B58A 2RF1A 1FQAA 1JW1A 4MF3A 2QRYA 2UVHA 4XXUA 3CRBA 1POY1 3IOUA 3SETA 2XXYA 2DOJA 1LB9A 2XX7A 4HTGA 4Q5TA 1NH7A 3H03A 2NUVA 5DYHA 1A99A 1MRPA 3M8UA 4KQPA 2GHBA 2DE2A 3CFLA 1JVYA 3MVZA 5AA2B 3LBSA 1IEJA 4BDOA 4F3GA 2UVGA 5CMKA 3OO9A 4OFJA 3VLUA 4F2QA 3OXNA 1BIYA 1JEVA 5IAIA 1YAEA 1B9JA 4F3PA 3CG1A 1VE4A 1Y4CA 4GWOA 3TCGA 1NNKA 1OQGA 1SW1A 3OSQA 4YMAA 3MVXA 4GL0A 2O69A 4ZEIA 2CZLA 3DM0A 1NKXA 2DWAA 2ZNSA 2H5YA 4ZEKA 3UK4A 4XKQA 4PFYA 3I5OA 3K01A 4LONB 1Y1ZA 2I4BA 3KN8A 2ANJA 2FYIA 3G3FA 4UACA 2DP8A 3EPEA 5TP9B 1B3LA 1CE2A 4F3BA 4OFOA 1UTBA 4C0RA 1TFAA 4DCYA 1QUJA 1A55A 2O84X 3USDA 5DVIA 1NH8A 1MH3A 4G8MA 1YCJA 3RTFB 1AH5A 1SW2A 1EZOA 2XXTA 2AIXA 2V3TA 4EUOA 3DP8A 1USYE 3OOAA 3RUMA 1J1NA 2ONRA 1O63A 1FQDA 3K1MA 2AYSA 2YJPA 1MXWA 2VGQA 3C4MA 4YB5A 3L6GA 3A3CA 4Q0CA 4QF9A 1MQIA 4OETA 1EZPA 1ZKBA 3QXMA 1Y20A 3MP6A 4EQ9A 4YU0A 2O7UA 4EXKA 4FEDA 1JQFA 1D9YA 1RYOA 1TWYA 3PUWE 1VR5A 3ILUB 4BDLA 4FIMA 4EDPA 2HAUA 5B7DA 4RNSA 3DLNA 2OWSA 5I2NB 5EHSA 1OVTA 4OEVA 1N7WA 1PBQA 4I9DA 3C32A 1B6HA 5CI5A 2R6GE 3FJMA 3EQ1A 3ZS6A 3DP6A 3TZAA 1NFTA 2ONKE 1XS5A 1VFEA 4U4SA 5I56A 4QHQA 3MPKA 2Q2AA 4PFWA 1B05A 1URDA 3M3LA 2DE4A 1LCTA 3K6VA 5H8SA 3IO6A 3O28A 4XKNA 1B0HA 1P1WA 3O29A 3OO6A 1IQ7A 1BKAA 4GL8A 4R2BA 2VP1A 3O66A 4EQ7A 4XTCQ 1B46A 3CVGA 1LAHE 2XXRA 2R9JA 3C34A 2IEEA 1OLCA 4UA8A 1P1QA 3OD7A 3T66A 5A5XB 3O2AA 3TCFA 1VSOA 5I57A 3PD9A 4P0IA 3OELA 3PV0E 5KZTA 3VLVA 1MPDA 1Y3QA 4G68B 4ZEFA 3OENA 1MXUA 3K6XA 3CFZA 1DPEA 3H06B 2ONSA 3TTKA 2QPQA 3FV1A 1IIWA 3O97A 3SDFA 1CB6A 1B5HA 5TPAA 3SERA 2H4IA 2RINA 3Q27A 4WEDA 3KJTA 3PPQA 1I69A 3FXUA 4QFLA 2VHAA 2XX8A 4HW8A 3ODBA 4F1VA 3UORA 2R71A 3R6UA 4JDFA 5AA3A 4WEPA 4NF5A 3FXRA 1SI1A 3FGSA 5FHNA 1FW0A 3SESA 5KDTA 3E13X 3RN8A 4LATA 5I57B 4U1ZA 4GOTA 4IO2A 1PB7A 3AXFA 5TU0A 1A8FA 4ZZEA 3L6HA 5CRYA 3VVFA 1B4HA 2O68A 1WODA 4YKJA 3ZKLA 2ZYMA 3HN0A 4THIA 5AA2D 4AB6A 3TEPA 3SEYA 5FTHA 3UP9A 3MWBA 2PMSA 3S9NC 3U94A 4F19A 5FTIA 3TTMA 4YKIA 5H8QA 3RT6B 4PETA 1Q35A 1B40A 5L9OA 4RK2A 4ZS9A 2DE3A 3IB1A 3KGCA 5DTBA 3K6UA 3TTRA 1SYHA 3PPOA 4NF5B 4ESWA 1B3EA 4AB5A 4F31B 3QSLA 4LVQA 3FUZA 4O3CA 2F97A 3ONMA 4R2FA 3WAFA 1Z7ME 1MPCA 1GR2A 1H45A 4R9FA 4MLVA 1S50A 5I59A 5CMCA 3PU5A 2G29A 3UA8A 3O6IA 3QAXA 4TOZA 4N6PA 1MM7A 1H43A 4PE5B 4TQUQ 3W15C 1UIVA 3E3KA 1Y3NA 5H8HA 4LZ7A 1UTHB 1ZU0A 2GFEA 3A09A 3PMXA 1D3KA 1UIUA 2ZYNA 3KFMA 2H99A 3MC2A 3EF7A 1URSA 2F7AA 3GZGA 4NMYA 4OENA 3MAMA 1ATGA 4YICA 4H5FA 1MY4A 1MXZA 1LFIA 3RY3A 1HSLA 3S9MC 4X1BA 1FQEA 2W7YA 2PYYA 1GV8A 3VFJA 5I59B 3PUYE 5EYFA 1A54A 3D4GA 1P1OA 2F35A 2HCAA 2F36A 4JSOA 3MVYA 3QUJA 2PT2A 1Y4TA 1MH4A 3IL1B 4JSDA 5H8HB 3H6VA 1B7ZA 4G68C 1JVXA 2DWJA 1SBPA 3OO8A 1SYIA 3KJ7A 3PUVE 4ZE9A 5AA2A 1MY1A 2OK2A 2NOOA 3I3VA 3PGFA 4QSCA 4U21A 4F18A 4HCWA 2QSXA 1M5EA 3FATA 5I84A 1HSEA 4DIGA 1MXYA 4TLMB 2XXQA 3QIMA 1XVYA 1B7HA 1ZLQA 1B3GA 3K0VA 1R1NA 5M2VA 3U92A 3HHFA 4U4XA 1GGGA 2XD2A 2BJJX 2KLFA 3TKDA 4G8NA 1M5BA 2DYXA 3OEKA 4GRKA 3BKIB 3FASA 1NNFA 5TP9A 4BLAA 1VFDA 3RNNA 5L9MA 4QRZA 4LQ2A 4FECA 1D4NA 2GRVA 3IJXB 3A3UA 4MBPA 4MLQA 1JW4A 3RT8A 3GLBA 4GVOA 4YZZA 4PFTA 1GVCA 3Q25A 4IO6A 1H76A 3F11A 3KZGA 5B70A 2AL5A 1FTJA 3OEMA 4RPNA 4YKKA 4DXUA 1RKMA 4PFUA 1FTOA 3T9VA 2DWHA 1N7XA 1NNTA 2V25A 3IORA 2H9BA 3VVDA 3VXBA 2O7IA 4KYEA 2THIA 3LSWA 5HBCA 2XXXA 1AOVA 1MQGA 4O3BA 5LOMA 3FJGA 1IXIA 1N84A 1T0KA 2D5WA 3S4UA 4DXBA 3I6VA 4JB7A 2HEUA 1IZ1A 5J1DA 4LP2B 4KI0E 4QSDA 1N04A 4EF2A 1MY3A 2DSFA 5I2NA 1PEBA 3JV9A 2ZXTA 4G8HA 3S9EA 4H67A 4R74A 2QS2A 2F7CA 5AE4A 2Z8FA 3QYTA 2QS1A 1R6ZA 1M5FA 3KSXA 4NEDA 4XKPA 2Z23A 1QUKA 3RGYA 4KCDA 4EQBA 3G3GA 4HCYA 2REJA 4ZE8A 4G4PA 1P1UA 2V3UA 2WKYA 3QK6A 2UXAA 4IGRA 1JETA 1ZIUA 1N3XA 2XHDA 3VVEA 5KCJA 3IK6B 3O6GA 4OTEA 1B2HA 4QFKA 1I6QA 2O51A 3N6TA 3KG2A 2PVUA 3TFLA 4OERA 2F5XA 1MS7A 4G2ZA 1US4A 3B7DA 3SEVA 4YKPA 5DT6A 5A5XA 1QULA 4ECFA 4OZ9A 4EF1A 3LR1A 3LC8A 5ITPA 4H1XA 1I6BA 3FZVA 3MQ9A 2F78A 5CBSA 3MZBA 3C36A 3THIA 3WAEA 1IUDA 4P11A 4QFOA 4G68A 1Z7NE 3V89B 3BBRA 2QMWA 1LSTA 3K4UA 3CR9A 4IO3A 4XKRA 2PBWA 1QKAA 5K2XA 4O3AA 3FV2A 2YLNA 1MXXA 1TFDA 5K2YA 5KCJB 1LAFE 1LB8A 3TQLA 4C1TA 1B3FA 3QUFA 5I58A 2DVCA 4X1DA 2X26A 2D3IA 3OSRA 2ZYKA 4KD5A 4WXJA 5DVJA 4KYDA 1LAXA 1S9TA 4FJPA 1BP5A 1IXCA 4F2OA 3N26A 4RYAA 3PD8A 4FORA 2ESNA 2VD3A 3IX1A 1SI0A 2HZLA 2F6GA 1HSJA 4F39A 3HPIA 1JEUA 3FVGA 3JZJA 4FEBA 4BDRA 3H4ZA 4I1DA 4GXSB 4DCXA 5DVFA 1TXFA 3O9PA 2ABHA 3MPLA 2Q9TA 4F3SA 1ZMGA 5H8FA 1UQWA 5I58B 2B3FA 2RCBA 3CSBA 2DWIA 4Z7EA 3CG3A 4I62A 4KFQA 3VE1B 1LLSA 1O64A 1OLAA 4H65A 1USYH 4H8IA 5ICQA 3T22A 3G3KA 4GXAA 1MY0A 3G3HA 2ZMBA 4N07A 3SEWA 3LSLA 3KOSA 4OEUA 3N6UA 4RXLA 1B7UA 4GIZA 2QS4A 1IXGA 2DS9A 4H8JA 1NL5A 1SQYA 1UTHA 4NF4B 3KN7A 5JK4A 4AQ4A 5H8FB 3H3GA 4M4GA 2NWJA 4TLLB 5CM6A 1MPBA 2GHAA 2DQVA 2OBGA 2X7PA 1DMBA 1YPNA 4ZEDA 1US5A 4LZ5A 3S9LC 3TODA 4NF6B 3SEXA 5ELVA 4ESXA 3V5AA 2HXWA 4DLDA 4ELRA 3IR1A 2DVZA 2I3WA 2P2AA 5BUUA 3H6WA 2B3BA 4PQJA 2Y7KA 3OO7A 3LSXA 3FXQA 2ALUA 2E1SA 4N13A 3EHUA 2FNCA 3UIFA 1AL3A 2IA4A 4GFRA 4ELOA 3B6QA 4KHZE 1YTVA 1B5IA 3TQWA 3IJOB 2OJTA 1Y1MA 3FIRA 4NF8A 1OMPA 4PP0A 4IGTA 3V83A 4DXCA 3U72A 1XC1A 4U23A 4F1YA 2I0BA 2X7QA 4KYSA 3C33A 1P1NA 4ND9A 1RYXA 4FATA 1IXHA 1GTKA 5HPQA 2Q2CA 1KWHA 4RPOA 3GBAA 4RJZA 2I49A 2XXIA 1LAGE 2XXWA 3G3JA 3C31A 5I2KB 4H5GA 1B32A 2NXOA 1LBBA 3N94A 5F1QA 4NF8B 3HV1A 4ZEBA 1XT8A 1I6AA 1MQHA 2LAOA 3TTNA 2V3QA 1ZJLA 1TT1A 3PPPA 2QMXA 3V8XB 2Y7WA 2Q88A 2Q89A 3IAZA 4IO4A 4U2RA 2M8CA 3KOTA 4IB2A 4ELQA 4LQ5A 1FQFA 4R6YA 3PUZE 2UYEA 3IB2A 2ZYOA 1OVBA 3H6UA 3PMVA 4R72A 2UVJA 3B6TA 4X48A 3MUQA 3TUSA 1B0LA 4QFPA 4FE8A 2O6AA 3S2VA 1WDNA 1M5DA 3KSJA 3E4RA 3H7MA 1O7TA 4E0WA 4I8CA 3TMGA 4KPTA 4GF8A 2RC9A 1BLFA 2RCAA 4DDDA 3HHGA 2P0SA 1R9QA 2O1LA 1SVXB 2VOZA 1EZ9A 2Y7RA 1XOCA 4Q30B 4G77A 2Q8JA 3K1NA 2REGA 1MG1A 3T9XB 5DEXA 4R6KA 1LCFA 1B3HA 3SEUA 2V93A 1LBCA 4IY6A 3VDFA 2XXHA 3HSTA 4E0XA 1POTA 2I58A 4BDNA 1ZBMA 1MXVA 5AA4A 4KR5A 5FHMA 3IB0A 3IOWA 2CMOA 3MVWA 2V84A 1P99A 1FQCA 3RQTA 2DXYA 4JXIA 1DOTA 5JTYA 4NWCA 4LA9A 4JBZA 3VLWA 4IY5A 5DEXB 4RK9A 1MY2A 3MZ9A 5FHOA 4RA1A 3K02A 3T96B 4WKMA 1NMUA 3IO4A 2RKMA 1N3WA 3KEIA 5H8NA 1ZTYA 3N5LA 3RLFE 1PBPA 5AA4B 4BDQA 3K2DA 1H44A 4LUBA 4POWA 3U8QA 2OCUA 4R73A 4GLIA 4OQOA 3HCQA 4DZ1A 4C1UA 1XVXA 1PB8A 4X9TA 5JTYB 1PB9A 4MFIA 3E9XA 3DELB 1UTBB 4YB6A 3KN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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