3H79A

Crystal structure of trypanosoma cruzi thioredoxin-like hypothetical protein q4dv70
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
RPSRVVELTDETFDSIVMDPEKDVFVLYYVPWSRHSVAAMRLWDDLSMSQSQKRNHLTFVAARIDGEKYPDVIERMRVSGFPTMRYYTRIDKQEPFEYSGQRYLSLVDSFVFQNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi thioredoxin-like hypothetical protein Q4DV70
rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein
total genus 42
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h79A00
3APOA 3IR4A 1KEBA 3D21A 2B7JA 4I2UA 3HA9A 4MMMA 1U87A 2FUG2 2R5GA 3DIEA 3GX0A 1B48A 1UN2A 1EOGA 1URMA 4MDCA 1UVZA 4NXIA 2HNLA 1XVWA 4AF2A 5JWQB 3IDVA 4KX4A 4XCSA 3F4SA 2R3XA 3LXTA 3QOUA 3HXSA 5DVBA 5JWOB 2KOKA 1K0BA 3C1SA 1F3AA 4YAVA 3TCOA 2AAWA 3H79A 2C0FA 4GQFA 5ECHB 2FA4A 4PURA 1TK8B 2GVPA 5J3RA 2FCHA 4EE0A 4KCAA 4GWRA 4KUNA 3GYKA 3D5JA 1TRUA 5F0GA 5A5KA 4F2IA 2GZZA 2RUFA 6GSYA 4JZQA 2YV7A 4XRDA 1U6TA 3R2QA 1M2BA 4AJ8A 1IYIA 1U3AA 2BMXA 1TU7A 2BJXA 1H4OA 3IC4A 4XS1A 1SJZA 1K0DA 3RPNA 5DCGA 1QFNA 1R5AA 1EOHA 3CSIA 4P3YB 4Q5RA 2V2GA 3ZREA 2PU9C 5G2ZA 3IK9A 3GHAA 2LRNA 3ERGA 1F6MC 4F9ZA 1JZDA 2YJHA 1TXXA 1GSEA 3TDGA 4GSNA 4G2EA 1NSWA 2L6DA 4HZ4A 3A3TA 3UJ1A 5DALA 5EY6A 2IMIA 4O32A 3TKRA 4YH2A 4EVMA 4OMVA 2EIOA 1FO5A 5IPGA 4ZBDA 2G0FA 4EL1A 4ZXGA 3KH7A 2FWGA 5EVOA 3VPTA 1QK8A 2VL9A 1O8XA 5CRHA 2ON5A 4HJ2A 1A8LA 6GSUA 4EC0A 4K7IA 4POBA 1GUMA 3H8QA 5HQPA 3BJ5A 1AQWA 3VK9A 5B8AA 4BPYA 2JSYA 5CNWA 2VLUA 5J9BA 5FWGA 1U3IA 2HLSA 1OE7A 2PN8A 5ECRB 2CVBA 3F9UA 1MDJA 5LD0A 3F3QA 3Q74A 1J0FA 1TKDB 2PMTA 1SENA 2YV9A 3W6GA 4MZBA 5JCUA 1GSFA 20GSA 3IA1A 4DSRA 2YP6A 3WGDA 3H1NA 1HNAA 4ZIJA 2H0IA 2PERA 2WULA 2NPBA 1KBNA 1EEMA 2IMKA 5G5EA 1DE2A 4OCEA 3IAS2 1Z7RA 3L9UA 3DEXA 2C3TA 4I97A 4EDZA 2CQ9A 2MMOA 2K8VA 2FWEA 3GX8A 4L5OA 4MP4A 4NWYA 11GSA 3H4KA 3A2XA 3E0UA 1LU4A 2GGTA 3GL3A 2B5XA 2IWTA 4MJEA 3BOAA 4ZB8A 3CTFA 3KMOA 1V57A 3ZMKA 3U5RE 1ACVA 4WBJA 4RQRA 5IOWA 1VF4A 4HQZA 1PX7A 18GSA 4LLRA 4KSOA 3TJBA 4IJ3A 17GSA 3JCML 3UEMA 2HZEB 4ECBA 4ZL9A 1ZYEA 3WT2A 4XS6A 5C00A 1OVNA 1A2MA 4Q5FA 5J5NA 3UVTA 2OA7A 4EKZA 3KEBA 3LFLA 2DLXA 3EU3A 2FD3A 5IIZA 5AIXA 4KW6A 2IMEA 3UARA 1TK0B 4PQ1A 1G7OA 2R37A 2VO4A 2HSHA 1XXUA 1TTZA 1SJIA 5AGYA 3G7IA 1FG4A 2VL3A 4MA9A 5ECSA 5DALB 1CQGA 5G30A 1W4VA 2H74A 1EZKA 1X0RA 3IHQA 4TN8A 3ZIJA 1WE0A 3LJRA 3D4TA 3APQA 2FGXA 1V58A 5F06A 4IBPA 1PQNA 1FVJA 2BTOT 1ZCPA 2PPTA 4DSSA 3RBTA 5D93A 1PSQA 3F63A 1ABAA 4AJ7A 2JZSA 5CP1A 3J7Yk 3FZAA 2YANA 1H75A 4BA7A 5ECLB 1XIYA 5IPHA 1FB6A 3IV4A 5G31A 3KMNA 3C8EA 3VI5A 2CVDA 4IS0A 4WF5A 2HYXA 1PN9A 1HNBA 2H8LA 2Z9SA 2L5OA 3QAVA 3QD9A 4L8EA 2RUEA 1B4PA 1B9YC 12GSA 3F4RA 1SK2A 1ILOA 2C3QA 1SL1B 1J9BA 3CMIA 1HNCA 4K6XA 3UL3A 3F0IA 5B6NA 2LJRA 1XWKA 2GTUA 3ZYWA 3GURA 1UC7A 19GSA 1M9AA 2H76A 3IXRA 1PGTA 1T7PB 4RI6A 1M0UA 2DSAA 2YWIA 1TW9A 4POLA 3TKPA 3P90A 3ZVJA 3WD6A 1OC9A 3KM6A 1YF0A 1PRXA 3VWVA 3CSHA 1X5CA 4MCUA 2XHFA 5AIVA 2P5QA 2CAQA 1PL2A 3D22A 4ISDA 3WGXA 1N2AA 1YEPA 4GSSA 1QQ2A 4XRAA 3TJFA 1SL0B 3HJPA 4DSQA 4GRFA 2AB6A 5ECOB 2YWMA 1PKWA 1AUCA 22GSA 1EV4A 1PKZA 4K1FA 5JWRB 5ECMB 3DGQA 1GLQA 4KDYA 4V1Ap 2M46A 2GT5A 4N11A 5DBQA 3TKSC 1WPIA 3MDKA 3FRCA 1G7EA 4V2NA 4MABA 1XWBA 5GSTA 1C72A 3LG6A 2H72A 4IHUA 4EO3A 3LEFA 2KP1A 1ZZYA 3CTGA 2GQKA 3EVIA 2VM1A 3MSZA 4ULXA 3GSSA 2VD1A 2I81A 1AW9A 1XBSA 2NTOA 5F05A 4CHSA 4JR4A 2WS2A 4DSSB 4HUAA 2PBJA 3EMXA 4I8BA 4IQAA 3FW2A 3FZ9A 3LGCA 4IW9A 2HE3A 2JU5A 1JLVA 3LWAA 1XFLA 4JU5A 2V1MA 2WCIA 2JADA 3EURA 1NW2A 3I69A 4HOJA 3EMPA 3DKSA 4GXZA 1GNEA 2X99A 4BL7A 2H1GA 5ECNB 2CT6A 3C71A 2H71A 2LS5A 2FHEA 2YOIA 1FVKA 1S3DA 5HR2A 4GCIA 5B8BA 4O7HA 4RQXA 1XW9A 5IMFA 3GN3A 4FYBA 3LSZA 1N8JA 4YAPA 4KB3A 5ECPB 3LYPA 5H5QA 3L78A 1OAZA 1ZL9A 1A8YA 3ZTLA 3QFBC 1PX6A 3L9VA 1EP7A 3O3TA 5CO3A 3NOFA 4POMA 2REMA 3G7YA 3TOTA 4EDYA 5J9CA 1U88A 5D9WA 2O8VB 2IMDA 2WRTA 4HDEA 2LNSA 1OC9B 2EC4A 1BQ7A 4KAEA 3WYWA 1FOVA 4RUVA 1Z3EA 4MH2A 4MH3A 3TB2A 2CVKA 5H5SA 4G10A 1RK4A 1EWXA 5DQSA 4KSMA 2YWNA 3HVXA 2HZEA 5AISA 4WEYA 16GSA 2QGVA 3ZRDA 5GAND 4EXJA 1QUWA 3ZMLA 3C1RA 1GUKA 2LJAA 5IQYA 3TRQA 1ZYQB 1XWAA 5LCZA 1JFUA 1JZWA 2RM5A 2C4JA 5IMAA 3KJYA 2LJKA 3HY2A 3TKSA 2JL4A 3G9BA 3VWWA 4TOPA 3PGTA 4WBRD 1O73A 4LMVA 4L5LA 4J2FA 2HFDA 5F8BA 1SU9A 3GA4A 3J7Yb 3TJKA 3M0FA 2C3NA 1K0NA 1X9MB 4OWYA 1T8EB 3W8SA 2H73A 5D9VA 3TJGA 4OFTA 3TOUA 1IYHA 2F9SA 2C0GA 3P7XA 1B9XC 2XPDA 2I3YA 4ILFA 2V41A 2VM2A 4V2LA 1OYJA 3ZFBA 2B3SA 2VLTA 3UOMA 2AJQB 5KEJA 3TUEA 3HZ4A 6GSTA 1SKRB 1Z7PA 3E3EA 2F8AA 2E7PA 1YQ1A 3BCKA 3KGKA 2ES7A 5DQYA 1VF2A 4KDXA 4XTSA 1FHEA 2VIMA 5IO0A 1S3AA 2GSTA 4IGJA 2DJ3A 2JZRA 2C0EA 2AYTA 2PUKC 2IFQA 5G1LA 3FZ4A 4I5QA 5AN1A 1BJXA 1X9SB 3FHKA 4ML6A 3Q6OA 2F51A 4DVCA 5JCWA 1V40A 2NDOA 4HI7A 1BG5A 5CYYA 4EF0A 2QKEA 4MF7A 1OKDA 1WOUA 2E0QA 4X1UA 2MMZA 1QGVA 3GH9A 4TXOA 2HI7A 3HZ8A 3IK7A 4LL1B 4J57E 4XHMA 1AQVA 1M99A 2LQOA 3VLNA 3KCMA 2F8FA 3GRXA 5KN1A 3GTUA 2YCDA 3LQ7A 2GSRA 1ZMAA 2LKUA 4PGTA 3RDWA 2VCWA 2O7KA 2HRFA 3HVVA 3NIVA 1F37A 4PX1A 5ECIB 2EIRA 3H93A 1XW6A 4XS4A 4X43A 3TKSE 3RHCA 4CW9A 1GRXA 4PNGA 1ML6A 4MLYA 2R6KA 1M9BA 1MD4A 2K18A 3LXZA 3CSJA 3EYTA 1YY7A 2LRTA 1YZXA 2XBQA 6GSSA 4IP1A 2GQLA 3LORA 3D6IA 4K2DA 5A4WA 2EIQA 3MAKA 2GT6A 4KH7A 1XCCA 1USBA 2J23A 1F9MA 3FR3A 1OC8A 3TJJA 1ZGNA 4ECCA 5ELGA 4MPGA 1MDIA 4N30A 2YN1A 1CQHA 2DJ0A 1A24A 3VPQA 2IIYA 2M72A 2QSIA 2JACA 4Q5NA 4WKWA 3FZ5A 5GZZB 3BD2A 4K0NA 3P8WA 3TGZA 2H6XA 3IOSA 1XOAA 1Q98A 3GH6A 5CRDA 1TRWA 1O7UA 3ERWA 1F2EA 1OE8A 3Q19A 4I2TA 5A4UA 3HCZA 1WRYA 3D0ZA 1VGLA 2P31A 4K7NA 1T4YA 3ZIVA 4E8EA 4TR0A 3WT1A 5B6MA 1YF1A 4MZWA 5KN3A 4K9ZA 5KN2A 2VCZA 2IFQB 4FYCA 4NAXA 5D96A 2H1AA 5ECKB 9GSSA 2GDRA 2LQQA 3M9KA 3O6TA 1FW1A 1O6JA 4D73A 1SYXA 4K7OA 5IMVA 2WZ9A 2V6OA 3IBHA 2YPMA 5D9XA 3IE3A 1DSBA 3KTLA 3L9SA 3G7JA 2PVQA 3US3A 1XPVA 1NHYA 2PWJA 4TXOB 5CRWA 1B8XA 4PUFC 1VF1A 1A2LA 4NV5A 2GS3A 4ZBAA 4FO5A 4QL9A 2LEGA 4ZL8A 3F4TA 1YEXA 1OKTA 2ZCTA 1A23A 3GTUB 1Z6MA 3CRUA 2FY6A 4KA0A 1FB0A 3A5WA 4L0UA 3QCPA 1TJDA 5HR0A 1M7TA 5FHIA 5J4UA 2GSQA 5E4WA 1XOBA 3C73A 1TOFA 2N5BA 2OBIA 1PD21 1QXHA 4LA1A 4XS4B 4OCFA 3KZQA 2AV4A 1ERVA 3KP8A 4JBBA 2DJ1A 1GH2A 1Y6EA 1NM3A 2L5LA 4H86A 3P2AA 3EE2A 3IRAA 4PXOA 2QC7A 2YNXA 4IN0A 3RAZA 1TU8A 2VOCA 2TRXA 3A2VA 2H0HA 4LMWA 1SL2B 3GKXA 4OD7A 4IP6A 3Q18A 3M1GA 3APSA 5HR1A 5JCGA 1O85A 1G0TA 2XPEA 1GTUA 1XZOA 2IPAA 1E6BA 4GLTA 2R2JA 1GTBA 1NHOA 3MWHA 5EL8A 3A2WA 4FYUA 1ERUA 2CV4A 2IMFA 1Z6NA 3I9V2 2L4CA 3HJOA 2P0GA 2WB9A 1BYEA 3ED3A 2D2ZA 1G6YA 4GF0A 4KGIA 2C80A 3DD3A 2JZTA 1TI1A 2GLRA 3N9JA 4MZCA 1R5PA 4TW5A 2OJLA 3HYPA 3I6AA 2FLSA 5IMCA 3VFIA 2ZNMA 3UMAA 1TRVA 3S9FA 3HJMA 4MF5A 5ELAA 4HZ2A 1V98A 2X8GA 3KTBA 7GSSA 4TR4A 1A0RP 3KXOA 1UA5A 3ZL5A 3IPZA 4JR6A 3FEUA 1LBKA 3F6DA 2OE1A 3LYKA 3QAGA 2CAIA 3KH9A 1WMJA 4FIWA 2LUSA 2I4AA 1MDKA 4YQMA 1EGOA 1EP8A 2TRCP 3E9JB 1W89A 2DIYA 3BBYA 4D73B 2OKAA 2FA8A 4G19A 4WETA 3VWXA 2VCVA 3GKMA 4GTUA 1TRSA 4IJIA 2OE3A 4PQIA 2K8SA 2DBCA 2WJUA 4MJBA 1T00A 2HRNA 3F6FA 2C8UA 1V9WA 1MTCA 3GNJA 2C1YA 5LNKe 2KP2A 2B5EA 13GSA 4MJAA 2O89A 3FR9A 4F0CA 2MMAA 4ML1A 1A2JA 2AHEA 4HQSA 4PNFA 2V6KA 1DUGA 4F0BA 5FT3A 2VCQA 2E2MA 3QMXA 4JRRA 4O92A 5INYA 2H0GA 2ON7A 4X0XA 3OR5A 2ALBA 4F03A 1I9DA 1AQXA 1R26A 3KD0A 2HXKA 2N5AA 2DMMA 3GKNA 1PMTA 2XBIA 1TK5B 2RM6A 3O76A 3ZFLA 1K0CA 4OFNA 1GSSA 5HFKA 3GFKA 4ZILA 1SJ6A 2VD0A 2NBSA 3ZZXA 3FK8A 2IL3A 1PA3A 1S3CA 4BVYA 4G9HA 3M3MA 5HR3A 2C0DA 1O8WA 4ZB6A 1GL8A 2H19A 1GP1A 1K0OA 4IVFA 5CAXA 2H1DA 5D73A 1ERWA 1JZRA 1GTIA 1GLPA 5D9TA 3UVHA 3PINA 4TR1A 4MF6A 1WJKA 1GTAA 5G5FA 1SK1A 2A4VA 1XWCA 3L0HA 2H30A 1GSYA 2DJKA 4ID0A 5ID2A 2NVLA 1XW5A 3NZNA 2LTKA 2MYGA 5G1KA 4V1Ag 4N0VA 3TRPA 3D4MA 5KN0A 3RHBA 3GIXA 1THXA 4NMUA 4ZL7A 1GWCA 5DCHA 3CYNA 2X64A 4K8MA 5C04A 2H1BA 4TKYA 3DYRA 2PVOC 1F3BA 1KNGA 3DVWA 3HDCA 2F3MA 1TI3A 3TRXA 1ZOFA 4FH8A 3BCIA 3ZLPA 2M80A 1HYUA 4CDOA 1HD2A 3UBLA 1T1VA 1YKAA 1K3OA 2IJYA 2L6CA 3M9JA 4ECIA 3CRTA 2MBTA 2O85A 5E59A 4MPFA 4V2MA 4JEDA 2R4VA 1A0FA 2DMLA 3IAM2 4BWQA 4HU9A 4XIHA 1VF3A 3QAWA 3QR6A 3EC3A 2AUVA 5A4VA 1BX9A 4QL7A 2GQMA 2WFCA 1JHBA 3QPMA 4KE3A 3HD5A 4WR5A 4HU7A 2B5YA 2RLIA 1X5EA 4E8HA 2YZHA 2DC5A 1TDIA 4POKA 4ACSA 4TRXA 1Q4JA 8GSSA 10GSA 4WF4A 1SKSB 2MZCA 2XC2A 2LNTA 4ECJA 2OE0A 3DRNA 1SD9A 4PQHA 1DE1A 2B1LA 3L4NA 2VL2C 1R4WA 3EU4A 1I5GA 3QDNA 4LL4B 2YZUA 2LV3A 3UIWA 2L4QA 4KCEA 2FWHA 4BVXA 4EUYA 3TKQA 1GSQA 2VLVA 1J08A 2J9HA 2P5RA 1XVQA 2GZYA 2JSZA 5COHA 1K0AA 2RIIA 6GSWA 1XWGA 1GUHA 2K9FA 2LSTA 4I6XA 1QMVA 3ZITA 2HZFA 2I1UA 2HSYA 4TR1B 1ERTA 2B7KA 3UBKA 3UAPA 4NPBA 1SKWB 5ID2B 3C7MA 1K3YA 1AXDA 1GSUA 2A2RA 4OO5A 4J56E 1MEKA 4TR3A 4WR4A 4Z7XA 1K0MA 4OO4A 1Y25A 3HKRA 14GSA 4HS1A 5EPFA 5F07A 2O87A 4RI7A 1O81A 1YJ6A 5L71A 2H70A 3DMLA 3I43A 5DAKA 1WP0A 3N5OA 2I9HA 2OACA 3VURA 3EWLA 4IKHA 4WXTA 1OC3A 3PR8A 3VWUA 1T3BA 5ENUA 2YWOA 5IM9A 1YDKA 4N10A 1MD3A 2H01A 1K3LA 3GMFA 2H6ZA 4HJMA 1VRSD 2VAFA 2GSSA 4IELA 4TVEA 3KIJA 3DVXA 3FR6A 2VUPA 4IQ1A 1AC1A 4OFMA 2CX3A 2B6MA 5DJLA 1RW1A 4ZBBA 2IN3A 1WIKA 1R7HA 5DJMA 2X8HA 5GAPD 2N5FA 2B1KA 3VI7A 1BEDA 2LRCA 4HEA2 3ISOA 1SK0A 5D8IA 3GKKA 1GULA 1KTEA 3MNGA 4PUAA 2WGRA 6GSVA 4TXVA 1EEJA 3AY8A 1ON4A 1THOA 5B7CA 1Z9HA 2OADA 3CXGA 2VCTA 1AIUA 5CREA 2MMNA 4K0GA 1DBYA 3GV1A 5CRGA 2A2SA 1EGRA 2PGTA 2TIRA 1M2AA 3FYGA 2DIZA 3ME8A 3U6VA 1GNWA 2VL2A 4GQCA 4AJ6A 4NHZA 4MJCA 2E2GA 5J41A 1FAAA 2V32A 5HFIA 2H75A 4BWSA 4DEJA 3DXBA 2KLXA 5HFGA 4KNDA 4O5RA 1E2YA 3PH9A 3GSTA 2H66A 5H5RA 4ZB9A 1JZOA 3K8NA 2VCXA 3KP9A 3F3RA 5IOXA 1SD8A 4F82A 3EINA 1T4ZA 1BAYA 4GSTA 3M8NA 2CZ3A 1X5DA 1ST9A 2GZPA 2FNOA 2H6YA 1G6WA 2KUCA 4NV2A 3HHVA 2CA8A 3QFAC 2G2QA 1Z5YE 1V2AA 2CX4A 4N0ZA 1AAZA 2DJ2A 3FKFA 2L59A 3FY7A 5IMDA 2K6VA 3RPPA 3GUSA 2OBKA 4Q5QA 2YJ7A 2DJJA 5IO2A 2KHPA 3ZVJD 3ERFA 2WDUA 4L0WA 5DAKB 3V1WA 5GSSA 3W8JA 1JLWA 1B4QA 3SWLA 4NHWA 2MBSA 2CZ2A 3SBCA 2L57A 5IMZA 4KDUA 3F8UA 3WGEA 2X8CA 6GSXA 3DWVA 4AGSA 1EV9A 2HT9A 1GSDA 2ZUPA 3ME7A 3HVSA 1PL1A 3GL5A 5ECQB 4QQ7A 1YKCA 1X9WB 4YQUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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