3H7MA

Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
RDRHRTIVVGGDRDYPPYEFIDQNGKPAGYNVELTRAIAEVMGMTVEFRLGAWSEMFSALKSGRVDVLQGISWSEKRARQIDFTPPHTIVYHAIFARRDSPPAAGLEDLRGRKVALHRDGIMHEYLAERGYGKDLVLTPTPADALRLLAAGGCDYAVVAMVPGMYIIRENRLTNLVPVARSIAAQRYGYAVRQGDAELLARFSEGLAILRKTGQYEAIRAKWLGVLEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Sensor protein
publication title Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Geobacter sulfurreducens
molecule tags Transferase
total genus 76
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2009-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA02
1MQIA 4NF6B 5H8HA 2Q88A 4O3AA 2XX9A 3AXFA 5DTBA 2HFBA 2Z22A 2X7QA 3N6UA 2Y7KA 4AQ4A 3I5OA 2VGQA 2QS1A 4KHZE 1FTJA 1HSEA 1URGA 5H8QB 5TPAA 4R2FA 3UK4A 1QW0A 3I3VA 2X26A 2O1LA 3IAZA 5L8DA 1FW0A 4F39A 2PT2A 1A40A 1N84A 3K6UA 4PFUA 3RNNA 3PU5A 4E0XA 5F1QA 3EHTA 5JTYA 3W9WA 1LB8A 1SYHA 3UP9A 2OJTA 2FYIA 3S9MC 2HAVA 3PGFA 4N13A 1MM6A 4U22A 3U72A 1D3KA 1MXZA 5H8FA 4U4XA 4AB6A 3G3FA 3KOSA 1B5JA 5DYHA 1NNFA 2DE3A 1MH3A 4YB6A 3VXBA 3HN0A 2DWAA 4GFRA 3G3IA 4R74A 1H43A 1MXWA 5K2YA 4F1YA 4C0RA 2OK2A 5I84A 5KZTA 1A55A 4XKRA 4ZS9A 4F29A 4JXIA 1B2HA 2NOOA 4POXA 4IO2A 3P7IA 1B3HA 4EQBA 1ATGA 4GXSB 3M8UA 4EXKA 4IO7A 1VR5A 1LAXA 3U93A 3N94A 2R6GE 2QRYA 4RXLA 3BFUA 3H06B 4R9FA 1IEJA 4RJZA 4RPNA 4HS7A 3KOTA 1NFTA 2F78A 1GR2A 2Y7PA 1MQHA 3H6VA 2QS4A 3IB0A 3PUVE 5L9MA 4AB5A 3K01A 3TUSA 1AIVA 4F2OA 4GIZA 2QL3A 3TQWA 3C34A 4LA9A 4NE4A 3KN8A 4OMBA 1SBPA 4C1UA 4FATA 5TP9A 3E3KA 4KFQA 1FTOA 4X9TA 5CMBA 3W9VA 1VFDA 4MH5A 1TXFA 3MVYA 4HW8A 4JDFA 1M5DA 4WKMA 3KJ7A 1B7HA 4N07A 4OZ9A 4F3PA 5TU0A 4ZE9A 4DCXA 3PV0E 4JBZA 5CBSA 3CSGA 4FIMA 1Y4CA 4XKPA 2O69A 3K0VA 1DMBA 4IY5A 4Z7EA 4KCDA 3E9XA 2B3FA 1LFGA 3SEWA 4RA1A 1WVJA 1EH3A 4JWYA 3TODA 2V84A 1DPPA 2F34A 4G8HA 4FECA 3EHUA 2I0BA 3JYRA 3PPNA 2XD2A 2OWSA 4THIA 1GGGA 5AE4A 3EN3A 1B7UA 1A8EA 3O6HA 1B5IA 3N5LA 1MS7A 1LAHE 1ZJLA 1XS5A 3DP8A 3IR1A 5DVJA 5H8SA 3RPWA 5I58B 3CRBA 2HEUA 4Q5TA 4YZZA 1B4HA 1NNTA 4F3SA 4OEVA 1OLAA 4ZEDA 3RTWB 1AH5A 2E0SA 2B65A 2XXRA 1JEVA 1PBQA 5KDTA 1SD3A 1JETA 2ESNA 3A09A 5H8NB 4U23A 2M8CA 2AL4A 1Y20A 1VSOA 2O6AA 3IO4A 2R71A 5M2VA 1MRPA 2P0SA 2DVCA 1NH8A 3UGWA 5K2XA 5IAIA 1LLSA 4NTLA 3FXRA 4R73A 2OZZA 5EYFA 4NF5B 2HAUA 4FE8A 3HO7A 2PT1A 4YMBA 3IK6B 1JQFA 3IJOB 2HZKA 3VV5A 4Q0CA 5FHNA 1URSA 1DOTA 4QSDA 2RCBA 3U1OA 1SYIA 4G4PA 2X7PA 3OOAA 4F3GA 5CRYA 4IY6A 1A99A 3KSXA 4OERA 3G3GA 3G7WA 4F1UA 1YAEA 2H5YA 2GH9A 2QMWA 3VLVA 1LAFE 4MLQA 3EF7A 1AOVA 3L6GA 2DP8A 2NWJA 1EZPA 3CIJA 4UACA 5HBCA 5L9OA 1A7LA 2G29A 4NMYA 3GLBA 3PUYE 1LAGE 5TPAB 3WAFA 4PFYA 4H8IA 4MBPA 1JNFA 4FORA 2ONSA 1R1NA 1B51A 2F36A 3KJTA 5EHMA 1B40A 3G3HA 1B05A 1T0KA 4DDDA 1I6AA 4NWDA 2YLNA 2V93A 1M5FA 4BLAA 1O7TA 1QKBA 1B9JA 3H4ZA 3Q28A 3FJ7A 5KCJA 3FJGA 1QVSA 3MJNA 4LQ5A 4GXAA 1SQYA 1BKAA 3TCHA 2NUVA 2YPNA 3CR9A 2I0CA 1Y1ZA 3LUYA 2HXWA 3FD3A 1RKMA 3I6VA 4X48A 2DQVA 4LZ7A 2DYXA 2XXWA 1MQGA 3FXQA 1VFEA 4QFLA 4DXCA 4U21A 4EXLA 1Y9UA 1B52A 4OFLA 3QXMA 4WXJA 1SW5A 3OSQA 4JSDA 5ISUA 4GD5A 5CC2A 3IOVA 1SI0A 4XIGQ 3ZSFA 1UTBB 3U8QA 1MG1A 4P0GA 4X1BA 4H5GA 3PMWA 2DXYA 4G68A 4IGRA 3TDJA 1B3FA 3E4RA 4NF4A 1N7XA 1FCKA 2H9BA 3ZKLA 2Q8JA 4F18A 2DOJA 3CG1A 2I48A 3B6QA 1LBCA 4F22A 4PE5B 1FTMA 1ANFA 3FJMA 4R72A 1O63A 1R9LA 5B70A 1N04A 1OQGA 4GWOA 3ZKKA 1B1HA 4R6HA 5DEXA 4E0WA 3JZJA 1TWYA 3VLWA 1AMFA 2F6PA 4L17A 2ONKE 5AA1A 3HCQA 4JWXA 3R6UA 1WODA 3EQ1A 5CMMA 5HPQA 2F5XA 2ABHA 2A5TA 2PX1A 2O7UA 3TELA 4IO3A 2XX8A 3FATA 3KZGA 3OEKA 1B1XA 4OTEA 2GFEA 2I3VA 5CI5A 5AA2A 4LP2B 4XKQA 1MQJA 2ZYOA 3MUQA 5AA4B 3S2VA 3A3UA 1N3XA 4F31B 3O6GA 1IQ7A 4BDLA 1H44A 1MXVA 4LZ5A 2Z8EA 5AA2D 4KR5A 4BDRA 3PD9A 2I3WA 2XXPA 3VE1B 3JV9A 2IA4A 4GL0A 5DVFA 3KSJA 5I57A 1RYOA 3H7MA 3FGSA 1FTLA 1Z7NE 1GV8A 2R9JA 5I56A 3FASA 2H25A 2Q9TA 3VLUA 3OXNA 1UIVA 4Z0IA 3N6TA 3R26A 1SDXA 4GL8A 4WEPA 3FZVA 3SEVA 1LB9A 1CB6A 2XXVA 2I58A 5CM6A 4Q30B 5J1DA 1MQDA 4QFNA 4YB5A 4R2BA 3TMGA 4EQ7A 2PMSA 3KBRA 1YCJA 3CFXA 5JEIA 2Y7WA 4NF6A 1ZIUA 3VVDA 4M4GA 2WKYA 3THIA 4LZ8A 4IGTA 4OENA 1EZ9A 1QUKA 3MP6A 1MXUA 1OVTA 4H6DA 5KDTB 4GOTA 3IOWA 2QS2A 4ZZAA 2GRVA 4ESXA 5BUUA 2B3BA 1UTHB 5AA3A 2Q2AA 5H8QA 4KYSA 4KQPA 1UIUA 1J1NA 3UA8A 3Q29A 3VFJA 2I6EA 3O9PA 1POTA 2O68A 4N6PA 5CMKA 3S4UA 1MPDA 3OELA 2ZNTA 3FV2A 4OYVA 4H5FA 3RUMA 2V3UA 1MXYA 1MY4A 4TQUQ 2YJPA 3DM0A 1PB7A 4LONB 3VXCA 4DIGA 2H98A 4OEUA 4ZDMA 3H6UA 1OQHA 3IO6A 2ALUA 3BFTA 1MDQA 4H65A 3Q25A 4QF9A 1LGBC 3HHFA 1GTKA 3RT6B 1MPCA 3H03A 4H8JA 3UIFA 3G3KA 1ZKBA 3PMXA 3KG2A 3C36A 1NL5A 4YAHX 3GBBA 4EDPA 4ECFA 2RF1A 4ZEKA 1VE4A 1B4ZA 1FQDA 1S50A 3SDFA 4I9DA 3TTLA 1B5HA 4XXUA 3IL1B 2VOZA 3M3LA 1MPBA 1B3LA 4OVJA 5FHMA 4I1DA 3MVWA 3KGCA 1MY1A 2F7BA 3QAXA 3MPLA 4LATA 4ND9A 5KCJB 3TFLA 3OSRA 4IO6A 1BP5A 1URDA 2P2AA 3UN6A 3LC8A 3T93B 2PYYA 2OBGA 3MZBA 1ZBMA 1DPEA 4EF1A 2RKMA 3MC2A 1GVCA 3B6WA 5IKBA 4JB7A 3SEYA 3MBPA 1SI1A 1P1WA 1MH4A 1SW2A 4ISUA 5I2NB 5LOMA 3PD8A 3U94A 2XXUA 3T9UA 3S9LC 1B46A 5FHOA 2FA7A 1YTVA 4NF8B 2CZLA 2ZYKA 3K1PA 1I69A 3ODBA 3QYTA 3GZGA 3LSLA 4FJPA 4ZE8A 5BWJA 4YKPA 4G68B 1MM7A 2DE2A 1TT1A 1D9YA 4QFOA 2AL5A 5CMCA 2KLFA 3K1MA 2F97A 3USDA 3ILTB 5H8HB 4ELQA 2REJA 1PDAA 1OIBA 2RINA 1US5A 1YPNA 3PUXE 1JEUA 2DVZA 3TTRA 1HSLA 4O3CA 3V5AA 3MVXA 2VP1A 3EPEA 5ICTA 4GQOA 3MAMA 5DEXB 4ZEBA 3D4CA 1JW4A 3RTFB 2Y84A 2AIXA 3R7XA 3RT8A 4RK9A 1LBBA 1MXXA 2P1SA 4R75A 4XTCQ 4IB2A 1PB9A 1B3GA 2I4BA 5CBRA 1USYE 3UORA 4TOZA 5I58A 3N26A 1TFAA 5JTYB 3PPRA 1UQWA 5A5XA 4FEDA 3T66A 3A3CA 3QK6A 1QUJA 4PFTA 2QPQA 2QMXA 3O28A 3QUJA 2DE4A 3HHGA 1ZTYA 1QUIA 1R9QA 5H8FB 2RCAA 1Q1KA 1PBPA 5ITOA 3OO6A 4DLDA 4QFKA 2BJJX 2DWHA 4G8MA 3CFLA 2UVJA 1EU8A 3C35A 2ZYMA 3MZ1A 2QS3A 4POWA 3LR1A 1XT8A 4YU0A 5I57B 2I49A 1P99A 2CMOA 2Y7IA 3V83A 1IZ1A 1N7WA 1Y4TA 4F2QA 1QKAA 1IXGA 2D21A 3TZAA 1MY2A 4RYAA 4NF5A 1A54A 4JWOA 2XD3A 1XVXA 1NKXA 4LUBA 1O64A 2O51A 1MY3A 5DVIA 4OFOA 3OO9A 2UVHA 5I2KA 3RN8A 3HSTA 4DXBA 4GLIA 1HSJA 4YKJA 1H76A 4O3BA 1Y1MA 3PPOA 1PEBA 4ZEFA 2AYSA 1FQBA 3TAJA 3W15C 4DZ1A 2THIA 3FIRA 5B7DA 2XXQA 3FXUA 4ELRA 4WEDA 2LAOA 1Y3QA 2DWIA 4MF3A 2D3IA 4PP0A 4G68C 3PPPA 3ILUB 5I59A 1BIYA 3TTNA 2HQ0A 3FUZA 3VVEA 2V3TA 3Q27A 4FAJA 1I6BA 5EHSA 5TP9B 2ZXTA 2UXAA 3TKDA 3O97A 4KD5A 1I6QA 1NNPA 3F11A 2RC8A 3QUFA 3PUZE 3Q26A 4QHQA 1Y3NA 3K02A 4K3FA 2O1MA 3H3GA 3DLNA 3T9XB 4BDMA 3C31A 2DSFA 1MDP1 2F7AA 2ZNSA 2Z8FA 4X1DA 1WDNA 3C32A 4F19A 2ONRA 1Z7ME 4YMAA 4OESA 3HV1A 3ECRA 3K1NA 4G2ZA 3K6XA 3LSWA 1ZU0A 1FQAA 2REGA 1AL3A 2I4CA 5ELVA 1P1UA 3BBRA 4OFJA 2H4IA 2OWTA 4ELOA 2ZMBA 2O84X 2DXRA 1M5CA 3OO7A 2GHBA 2XHDA 3TTKA 2F7CA 3CG3A 3MWBA 2NVUB 4MFIA 1QJMA 1UTBA 1LCFA 3K6VA 1FQEA 1JW5A 4TLMB 4KCCA 3MZ9A 3DELB 4YKKA 4GF8A 4U1ZA 2Z8DA 4I62A 2NXOA 5DT6A 3O66A 4ESWA 4KI0E 4P11A 2V25A 2XXYA 3T9HB 2UYEA 3PPQA 1LSTA 3S9EA 3M3KA 4JSOA 1ELJA 1M5EA 3TCFA 1XHYA 1Q35A 3ONMA 3CI8A 3TCGA 2QSXA 3IOTA 1DTGA 1IITA 3KFMA 1SW4A 2UVIA 4PQJA 2V3QA 1P1OA 4I8CA 2D5WA 4U4SA 3V8XB 3DP4A 3SKPA 4M1VA 4BDNA 3OD7A 2XXHA 4RK2A 4QFPA 4XKNA 3OO8A 4UA8A 4PETA 3RGYA 2VHAA 3GBAA 1OLCA 2RC7A 1N76A 4OXVA 1M5BA 1S7YA 2OLBA 2VD3A 2XXTA 5ICQA 3LBSA 1LFHA 4YKIA 4DE8A 5HM4B 1JVYA 5AA4A 4H67A 4TLLB 3OEMA 2H99A 4LVQA 2A5SA 1XVYA 4EF2A 1XOCA 1JVXA 3LSFB 1LFIA 1OMPA 1IIWA 3SEUA 1B32A 3C9HA 1CE2A 3TPAA 3MW0A 3SEXA 3TTMA 4F1VA 2XXXA 2IEEA 3H6WA 5FTIA 3HPIA 1PC3A 2ANJA 1FTKA 1SW1A 4EQ9A 3GXAA 3QSLA 2DS9A 4IO5A 2GHAA 3EHSA 4DXUA 3PMVA 2HCAA 4F3BA 2XXIA 3C33A 1TFDA 3MPKA 1R6ZA 1N0TA 4R9GA 3QIMA 3FVOA 3H6TA 3VVFA 5A5XB 2HZLA 4QRZA 3RY3A 3TQLA 4OHNA 3MQ9A 4Q8RA 1LCTA 3CVGA 1FQCA 4QSCA 5JK4A 3IX1A 1A8FA 1II5A 4KYEA 1XC1A 5L9SA 4NEDA 1SVXB 4P0IA 4R6KA 4BDOA 4HCWA 1P1QA 3L6HA 4U2RA 1B58A 1UTHA 4PFWA 1US4A 1DSNA 3IJXB 3IORA 3TEPA 3MP1A 3FV1A 4QSEA 2Q2CA 1DTZA 1P1NA 1H45A 4H1XA 1FQFA 4LQ2A 4BDQA 2QJEA 4U1OA 4ZZEA 3RQTA 2F35A 1B3EA 4NF4B 4R6YA 4ONYA 3G3JA 3OENA 5I2KB 2F8DA 1B0LA 3B7DA 5F7VA 2OCUA 1KWHA 1OVBA 4ZEIA 3O6IA 1POY1 1USYH 2PVUA 3IB2A 4OWDA 3E13X 4RNSA 3S9NC 4H0WA 1D4NA 1B7ZA 2G93A 3FVNA 4HCYA 3FVKA 4IO4A 4ELPA 3K6WA 3BKIB 3C4MA 4NWCA 3CSBA 3K2DA 1N3WA 2UVGA 4YICA 4GVOA 3T96B 1B6HA 4ZECA 4OETA 5I59B 2A5TB 2ZYNA 3KN7A 4MLVA 1Y3PA 3WAEA 2DWJA 3T9VA 1PB8A 2RC9A 2VD2A 3M3FA 3T22A 2W7YA 5AA2B 3CFZA 4RPOA 4YB7A 3D4GA 1ZMGA 3PUWE 2F6GA 1F9BA 1EZOA 1ZLQA 1NNKA 1D9VA 1NH7A 1BLFA 3O2AA 3VDFA 4GRKA 2UYFA 2Y7RA 1S9TA 2FNCA 4OQOA 5H8NA 1L5TA 3U92A 1MY0A 2Q89A 1H3DA 1IUDA 4FEBA 3K00A 1IXCA 4G8NA 4C1TA 4KPTA 2PBWA 1NMUA 3B6TA 4HTGA 4RY1A 5I56B 3O29A 3FVGA 1QULA 5I2NA 3MVZA 2Z23A 3SETA 3MP8A 3KEIA 3SERA 5ITPA 4NF8A 3IOUA 4G77A 3DP6A 3SESA 4EUOA 3IB1A 1IXIA 2XX7A 3KN3A 3RLFE 3TYHA 3K4UA 2O7IA 4DCYA 3ZS6A 2ZNUA 1B0HA 3OMBA 2E1SA 1BTJA 1RYXA 3V89B 1JW1A 4KYDA 1IXHA 3LSXA 5FTHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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