3H7MA

Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
RDRHRTIVVGGDRDYPPYEFIDQNGKPAGYNVELTRAIAEVMGMTVEFRLGAWSEMFSALKSGRVDVLQGISWSEKRARQIDFTPPHTIVYHAIFARRDSPPAAGLEDLRGRKVALHRDGIMHEYLAERGYGKDLVLTPTPADALRLLAAGGCDYAVVAMVPGMYIIRENRLTNLVPVARSIAAQRYGYAVRQGDAELLARFSEGLAILRKTGQYEAIRAKWLGVLEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sensor protein
molecule tags Transferase
source organism Geobacter sulfurreducens
total genus 76
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2009-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA02
4LVQA 4H8JA 2I4CA 2D3IA 3G3JA 1UTHA 4UACA 4BDRA 3OSQA 2F36A 3KFMA 1VR5A 5A5XB 3SEUA 2HAVA 3FATA 5I56B 2Z23A 1MPDA 5DTBA 4QF9A 3MBPA 3PV0E 1P1OA 1R9QA 2Z8EA 1JW1A 2ZNTA 4ECFA 1DPEA 4F18A 5AA1A 3VVDA 2E1SA 1S9TA 1P1QA 4LUBA 3CIJA 2PBWA 4GLIA 1MDP1 1CE2A 1N76A 1H45A 2OBGA 4X9TA 3SDFA 2XXWA 1ZKBA 1Y3PA 3PGFA 1I6AA 1FQBA 1M5FA 4ZEBA 4G2ZA 2FYIA 2F78A 4U23A 1OVTA 3O6GA 2DE3A 2VD2A 4Q0CA 2UVGA 1SW2A 3HSTA 5I2KB 1M5DA 4ND9A 1B2HA 1AOVA 1PB8A 4WKMA 4I1DA 2ONSA 5L8DA 5L9SA 3U72A 2V84A 2B3FA 1MM6A 2Z22A 4G8MA 3K0VA 3MWBA 2V25A 4XIGQ 4QSEA 1B52A 5I2NB 1Y20A 3N6TA 3HV1A 1LAFE 3D4GA 4AB6A 1PB9A 3FV1A 2Y7IA 3KBRA 1POY1 4EQ7A 4F3PA 1JEUA 2YLNA 4XKRA 1PC3A 3LUYA 3G3HA 4F3SA 1IXHA 5TP9A 1HSJA 1US4A 1R1NA 3E3KA 1B3FA 4ESWA 4KI0E 1MXYA 2UVHA 3ECRA 1SBPA 3OOAA 1DPPA 2HZKA 4NF8B 3PPPA 1PEBA 4JB7A 4LQ5A 1B1HA 3EHTA 1LFIA 1B58A 3JYRA 3DP6A 4POXA 3GZGA 1BP5A 5H8HA 3M3LA 1FTKA 4JSOA 3S4UA 4G4PA 1UTHB 3OO7A 1MQJA 4QFLA 3ODBA 2I6EA 2AIXA 4RPNA 2QMXA 3MP8A 5B7DA 2FNCA 2XXQA 2ONRA 5DT6A 3S9NC 3Q28A 3VXBA 1II5A 3C31A 4DXUA 4RXLA 5KCJB 1B3GA 3DM0A 4R73A 3TTRA 2DVCA 3AXFA 3SEWA 1B7UA 2F6PA 4R9GA 5H8QA 1S7YA 2O69A 3G3IA 4I8CA 2HZLA 3KSJA 1T0KA 5AE4A 1Z7ME 2D21A 3KOSA 4IY6A 4U22A 2I0CA 2H98A 3Q29A 5BWJA 3D4CA 4QFNA 4HW8A 1GGGA 2OWTA 5H8FA 1IIWA 3KN3A 4R74A 1D9YA 3QUJA 2RF1A 3O9PA 3H6TA 3N94A 1NL5A 4KCCA 3K6XA 4F1UA 3VVFA 3K1NA 4YAHX 4BLAA 2XXUA 1IXIA 2V3UA 4F2QA 3T96B 4ZZAA 4GVOA 4X1DA 5I84A 1QUIA 3TFLA 1FCKA 2RC8A 2DQVA 3BBRA 3KN7A 4NF6A 1JVXA 1Y3NA 3ZSFA 3MAMA 4IY5A 4EQ9A 2Q2CA 3H06B 1VFDA 3FJ7A 5KZTA 3O97A 1N04A 2ZYKA 4LQ2A 1IXGA 2OK2A 3SESA 4R6YA 1BTJA 3TCHA 1DTZA 3FXQA 3OMBA 5M2VA 2AYSA 1B46A 1LFGA 2DWAA 3DP8A 3QYTA 4X48A 3TELA 3HHFA 5TP9B 2IA4A 1PDAA 1LCFA 5CBSA 2DWJA 3OXNA 2RINA 3K01A 4LP2B 4OENA 4OERA 3O6IA 4JWOA 2DXYA 4F1VA 4OQOA 3OO8A 2DP8A 2ZXTA 3TYHA 3VLWA 5AA4A 2RCBA 4KYSA 3LSFB 5FTIA 1PBQA 1M5BA 5DVFA 4O3CA 1XOCA 4I62A 3T9HB 3CFZA 2XD3A 5H8SA 1BIYA 2ZYNA 5J1DA 4U21A 5ICQA 2I48A 4TLMB 2XXRA 1XVXA 3W15C 1NKXA 5FTHA 4LZ7A 3QK6A 4HS7A 2GRVA 4GD5A 1SD3A 3KGCA 3Q27A 2BJJX 1MRPA 3WAEA 3FUZA 4EXKA 1B0LA 2XXYA 3MQ9A 5I2NA 1ZTYA 1O63A 3L6GA 4KFQA 4JWYA 1EZ9A 1SW4A 1MXWA 1LAGE 3W9WA 2I58A 1B4ZA 4ZS9A 5H8FB 3R6UA 2Y7KA 3C9HA 5AA2D 3QSLA 4NMYA 5DYHA 3CRBA 1US5A 2REJA 1EZOA 2HXWA 2VGQA 1N7XA 2ABHA 1LCTA 2ZYMA 4Z0IA 3RLFE 5L9OA 3PD9A 1POTA 4NF8A 4TOZA 1B40A 5IAIA 4EF1A 3UIFA 4N07A 3GXAA 3DP4A 4QRZA 5DVIA 2F35A 5ITOA 3IOTA 1SQYA 2NVUB 4P11A 3PUYE 1VE4A 3VFJA 1GV8A 3SEVA 3G3FA 3SERA 5JK4A 1P1NA 3CG3A 3MVZA 3FASA 2DWIA 2XX9A 2Z8FA 2R6GE 3JV9A 3MC2A 3EHUA 1B3HA 1D9VA 1B5HA 2V3QA 3A09A 5KCJA 3ILTB 3E13X 1NNPA 2ZYOA 2XD2A 1IQ7A 4H5GA 3GBAA 4OFJA 1XHYA 1L5TA 3TODA 3TTMA 3KJ7A 3LSXA 1TFDA 4LA9A 3R7XA 3IO6A 1MY1A 5AA3A 3I6VA 3MVWA 1BKAA 2NXOA 3H7MA 1A8EA 1FQAA 5FHMA 3QXMA 3EHSA 1J1NA 1YAEA 3OELA 2QS2A 4PETA 5AA4B 3MPLA 3I5OA 5I59B 1JQFA 5CRYA 1SYHA 1QUKA 2F7AA 3B6WA 3S9EA 4QFKA 3KJTA 3H6VA 2Q88A 3K2DA 3K00A 3IX1A 1B4HA 4NF4A 1TWYA 4F3GA 2P2AA 2Z8DA 4FAJA 3PMWA 2R9JA 3N26A 3IOWA 1H44A 5K2XA 2QS1A 4OESA 3CVGA 1N7WA 2P0SA 1JW4A 3TMGA 1XS5A 2XX7A 4OHNA 4GFRA 1P99A 1MY0A 1P1UA 5TPAA 1TT1A 3G7WA 5B70A 1XT8A 3TKDA 1JEVA 3U94A 4RNSA 4G68C 3LR1A 1DOTA 3TCFA 4YKJA 3VLVA 3UN6A 3PUVE 3LBSA 1MM7A 3EQ1A 4DZ1A 3EF7A 1OLAA 4F22A 5H8NB 4ZEFA 4YMAA 2R71A 3OO6A 3L6HA 1VFEA 4ELQA 3V8XB 3MP1A 3TCGA 1H3DA 2I49A 3MJNA 2F6GA 2QMWA 1TFAA 1OIBA 1AMFA 1JW5A 3T93B 4NE4A 2HEUA 4DCYA 1XC1A 2G93A 2XX8A 3IL1B 1FQDA 1MQGA 2B3BA 1RKMA 4Q8RA 2F5XA 3UK4A 2M8CA 2XXIA 5BUUA 2F7BA 2I0BA 4XKQA 4Q30B 3K6WA 2OWSA 1GTKA 4IO4A 4GOTA 4GWOA 1N3XA 3TAJA 3IK6B 4XKPA 1USYH 4G8HA 1WVJA 4XXUA 3MZ1A 3O66A 5K2YA 3U93A 4FJPA 3VV5A 3T9XB 4G8NA 3K1PA 4F31B 4MBPA 3R26A 1MXZA 4OEUA 3FD3A 2ZMBA 4G77A 2PYYA 2CZLA 4JBZA 4H5FA 4JXIA 2HFBA 3O28A 4OWDA 2H4IA 3Q26A 4OXVA 3EN3A 3CR9A 1P1WA 4C0RA 3IOVA 1IEJA 2F7CA 2AL4A 4DDDA 3VVEA 5FHNA 5TU0A 2H99A 5FHOA 1B3LA 3RGYA 3FZVA 4IO3A 3C4MA 3IJOB 4KHZE 3FVKA 4YB6A 1A99A 1SDXA 5DEXB 1VSOA 5JEIA 3BKIB 3B7DA 4BDOA 2LAOA 3HO7A 1ZLQA 2HQ0A 4YB5A 1OLCA 3S2VA 2UXAA 2ESNA 4R72A 2PMSA 4DLDA 5EHMA 4QSCA 3HN0A 3CI8A 2O51A 4THIA 3T22A 4ESXA 4RY1A 3PPRA 5IKBA 3B6TA 3UGWA 3ZKLA 1UQWA 3OD7A 2DE4A 3EPEA 4XKNA 4NF4B 3O2AA 4GXSB 2GHBA 1MY2A 2O1MA 4ELOA 1M5CA 3PD8A 1B0HA 4MFIA 3DELB 3S9LC 4LZ8A 1LB8A 2O1LA 3H4ZA 3ZKKA 3IB2A 4HCWA 5TPAB 4EF2A 2O7UA 1H43A 4GF8A 4E0WA 1RYOA 2NUVA 1QUJA 5CMBA 4NF5A 4FORA 3KG2A 1MY4A 2ZNUA 3FVNA 1SYIA 1MPBA 3RT8A 4OTEA 1MPCA 2O7IA 2DE2A 2I4BA 5HBCA 3VLUA 4QFOA 2H5YA 1R9LA 5EHSA 1A54A 2OJTA 2ALUA 4YKKA 5JTYB 2ZNSA 2Y84A 2H9BA 1NH7A 3PMVA 3PPNA 1MXXA 4K3FA 4WEDA 4DE8A 1I6BA 5I59A 3WAFA 2F97A 3C32A 3KZGA 3B6QA 4FEDA 2ONKE 4IGRA 4WXJA 4GL8A 4F2OA 4QSDA 1SVXB 3T9VA 4OETA 2RKMA 4YICA 3SEYA 3FJMA 4TQUQ 2OLBA 5F7VA 2DOJA 3QUFA 5AA2B 4QHQA 3KN8A 3K6VA 3PMXA 3QAXA 4NEDA 4F19A 1B1XA 3THIA 1Y4TA 1D4NA 1LBBA 4ZE9A 1EZPA 2PT1A 4R6KA 4M1VA 1Y1MA 4G68A 4JSDA 2DYXA 2DSFA 3N6UA 2A5SA 3OSRA 1N0TA 3LC8A 1OVBA 1SW5A 3K6UA 4PE5B 5CC2A 2Q9TA 3PUZE 2QJEA 1NMUA 5H8NA 4P0GA 1UIUA 2OZZA 1MY3A 4EQBA 1IXCA 4YMBA 3MP6A 3TPAA 4N6PA 3MZ9A 4RA1A 1LSTA 4H6DA 2P1SA 3U8QA 4RYAA 5CMCA 3H03A 4QFPA 5ELVA 4JDFA 1NNKA 3K02A 3TQWA 4MLVA 3U92A 3FJGA 4ZECA 3MVYA 3N5LA 3TTKA 3VDFA 2A5TB 1QW0A 2RC7A 3RY3A 3LSLA 4I9DA 1FTOA 4HTGA 1WODA 4R2FA 2DS9A 4DXCA 3TZAA 2Y7PA 1LGBC 4RK2A 3RQTA 1Y9UA 1MQIA 3IORA 1MDQA 4NTLA 3UP9A 2PX1A 3V83A 4BDNA 3FGSA 2QSXA 4YKPA 3RTWB 2VP1A 4F3BA 2CMOA 4NF5B 3O29A 3TUSA 4EUOA 4RK9A 1DMBA 1PBPA 1LAHE 4R2BA 1LFHA 3UORA 1FW0A 1RYXA 1YTVA 4AQ4A 1KWHA 1LAXA 1I6QA 2V3TA 4ISUA 1XVYA 4KQPA 1IITA 4X1BA 1QVSA 3T9UA 1HSLA 4PP0A 1B51A 2X7PA 5DEXA 3U1OA 1DTGA 4GL0A 1Y1ZA 2VD3A 2YPNA 3FVOA 4GXAA 2G29A 2X7QA 1JVYA 1B32A 1FQCA 5KDTA 2XXHA 3ILUB 1B9JA 5EYFA 3FV2A 4PFUA 1B3EA 1SI1A 4PQJA 4ELRA 4WEPA 4ONYA 3V5AA 2WKYA 4EDPA 3I3VA 4UA8A 2PVUA 3MPKA 3QIMA 1HSEA 1D3KA 3KOTA 3TTLA 2YJPA 3OO9A 4ZEDA 2DXRA 1ANFA 1MH4A 1N84A 1JETA 3S9MC 1URDA 4JWXA 1AIVA 2Y7RA 1ELJA 4MF3A 2VHAA 2KLFA 3F11A 4G68B 1MG1A 1LLSA 4R6HA 4OZ9A 3RN8A 1A40A 3HPIA 1Y4CA 2XXXA 3VE1B 2GH9A 2I3WA 1FQFA 3C36A 3CFXA 4F1YA 4IO7A 2NOOA 3T66A 3UA8A 5ICTA 1TXFA 3ONMA 1Y3QA 5JTYA 3Q25A 1MH3A 3HHGA 2GHAA 3H6UA 4AB5A 1MQHA 2RCAA 1UIVA 1SW1A 2UYEA 2F8DA 1GR2A 2I3VA 2NWJA 2RC9A 3TTNA 4R9FA 4NWDA 4YKIA 1PB7A 5DVJA 4H1XA 4ZEKA 1N3WA 1FTJA 3MZBA 3GLBA 2Q89A 3C33A 3DLNA 4XTCQ 2UVJA 2REGA 2UYFA 3TEPA 4BDMA 3JZJA 2OCUA 4FECA 1B6HA 1MS7A 1MXVA 3CSBA 1FQEA 3PUWE 4TLLB 1A7LA 1EU8A 3W9VA 5AA2A 4RPOA 3CG1A 1NFTA 4H65A 4OEVA 3RUMA 4GQOA 1A55A 4ELPA 1LB9A 4U1ZA 1B05A 2O6AA 4IGTA 3FVGA 4U2RA 2Y7WA 2F34A 2ANJA 1B7ZA 3FXUA 1Q1KA 4Q5TA 3FXRA 4Z7EA 3K4UA 2Q8JA 3E9XA 4OFLA 5I58A 1QKBA 4C1TA 3RT6B 3IOUA 4FATA 1QKAA 4M4GA 5CI5A 2E0SA 5I57A 1GVCA 4F39A 3CFLA 4U1OA 5KDTB 3OENA 4ZE8A 1S50A 1MQDA 4DXBA 4YB7A 4LATA 4DCXA 2W7YA 1O64A 3A3CA 2HCAA 4PFTA 4MH5A 1WDNA 3KSXA 4U4SA 2A5TA 3PPQA 1CB6A 1QULA 2V93A 3IJXB 3H6WA 4BDQA 1I69A 4F29A 4KR5A 3BFTA 2QS4A 5CM6A 1ATGA 4ZEIA 3MVXA 3SEXA 1ZU0A 4O3AA 1AH5A 4H67A 3IB1A 2QRYA 1IZ1A 5CBRA 2XHDA 1UTBA 4IO6A 4GRKA 3OEKA 1URSA 4P0IA 4FE8A 1OQHA 4PFYA 4ZDMA 3PPOA 3M3KA 3M3FA 4OMBA 5A5XA 1DSNA 3G3GA 2IEEA 5HM4B 3O6HA 5I56A 2FA7A 3E4RA 3G3KA 5ITPA 2GFEA 2XXPA 3GBBA 4E0XA 3PUXE 2H25A 2HAUA 4KCDA 1O7TA 1F9BA 3MW0A 4LZ5A 2PT2A 4IO2A 2VOZA 3CSGA 1R6ZA 4KYEA 4RJZA 4C1UA 4PFWA 3RNNA 1OQGA 1Q35A 1B5IA 5L9MA 1FTMA 3FIRA 1ZBMA 1AL3A 1ZIUA 4FEBA 2Q2AA 4BDLA 1JNFA 3IAZA 3USDA 3HCQA 4H0WA 5LOMA 4YU0A 1ZJLA 2DWHA 1SI0A 3SETA 4KYDA 3RTFB 1M5EA 3RPWA 3OEMA 3C34A 5H8HB 3IB0A 4LONB 4U4XA 2XXVA 1EH3A 4OYVA 3PU5A 4KD5A 5I2KA 3IR1A 2X26A 1MXUA 1IUDA 3C35A 1B7HA 1YPNA 3BFUA 2QL3A 1OMPA 4GIZA 1A8FA 2AL5A 4IB2A 3TDJA 3H3GA 5CMKA 3LSWA 5ISUA 5I58B 4L17A 3M8UA 5H8QB 4ZZEA 4R75A 3KEIA 3K1MA 4EXLA 2B65A 1ZMGA 4FIMA 2QS3A 4IO5A 3V89B 5I57B 2D5WA 4KPTA 2QPQA 1Z7NE 1FTLA 1QJMA 3ZS6A 4HCYA 4O3BA 2XXTA 4H8IA 1USYE 1YCJA 4DIGA 1H76A 3P7IA 1NNTA 2O84X 1NNFA 4YZZA 2DVZA 5CMMA 1URGA 4POWA 3TQLA 4OVJA 5F1QA 1B5JA 3SKPA 1BLFA 4OFOA 3A3UA 5HPQA 3IO4A 1NH8A 2UVIA 1LBCA 3MUQA 4MLQA 4NWCA 3VXCA 2THIA 4NF6B 1UTBB 2O68A 4N13A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1PEBA 4JB7A 4LQ5A 1B1HA 3EHTA 1LFIA 1B58A 3JYRA 4DI4B 3DP6A 4POXA 3GZGA 1BP5A 5H8HA 3M3LA 1FTKA 4JSOA 3S4UA 4G4PA 1UTHB 3OO7A 5ESYA 1MQJA 1NV7A 4QFLA 3ODBA 2I6EA 2AIXA 4RPNA 2QMXA 3MP8A 5B7DA 2FNCA 2B4MA 2XXQA 2ONRA 5DT6A 3S9NC 3Q28A 3VXBA 1II5A 3C31A 3E79A 4DXUA 4RXLA 5KCJB 1B3GA 5EYHA 3DM0A 4R73A 3TTRA 2DVCA 1NV0A 3AXFA 3SEWA 1B7UA 4PF6A 2F6PA 4R9GA 5H8QA 1S7YA 2O69A 3G3IA 4I8CA 2HZLA 3KSJA 1T0KA 5AE4A 1Z7ME 2D21A 5ET6A 1LBYA 5DW8A 3KOSA 4IY6A 4U22A 2I0CA 2HPGA 2H98A 3Q29A 5BWJA 3D4CA 4QFNA 4HW8A 1GGGA 2OWTA 5H8FA 1IIWA 3KN3A 5F24A 4R74A 1D9YA 3QUJA 2RF1A 3O9PA 3H6TA 3N94A 1NL5A 4KCCA 3K6XA 2QVVA 4F1UA 3VVFA 5IGAA 3K1NA 4MHFA 2P3NA 4YAHX 4BLAA 2XXUA 1IXIA 2V3UA 4F2QA 3T96B 4ZZAA 1LBWA 1LEVA 4GVOA 4X1DA 5I84A 1QUIA 3TFLA 1FCKA 2RC8A 2DQVA 5LDZA 3BBRA 3KN7A 4NF6A 4PAFA 1JVXA 2Y5KA 1FPKA 2XXKA 1Y3NA 3ZSFA 1CNQA 1FTAA 2CZIA 3MAMA 4IY5A 4EQ9A 2ZZVA 2Q2CA 3H06B 1VFDA 3FJ7A 4PFIA 4PCDA 5KZTA 1NV2A 3O97A 1N04A 2ZYKA 4LQ2A 1IXGA 2OK2A 3SESA 4R6YA 1BTJA 4GWXA 3TCHA 1RDYA 1DTZA 3FXQA 3OMBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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