3H7MA

Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
RDRHRTIVVGGDRDYPPYEFIDQNGKPAGYNVELTRAIAEVMGMTVEFRLGAWSEMFSALKSGRVDVLQGISWSEKRARQIDFTPPHTIVYHAIFARRDSPPAAGLEDLRGRKVALHRDGIMHEYLAERGYGKDLVLTPTPADALRLLAAGGCDYAVVAMVPGMYIIRENRLTNLVPVARSIAAQRYGYAVRQGDAELLARFSEGLAILRKTGQYEAIRAKWLGVLEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a histidine kinase sensor domain with similarity to periplasmic binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sensor protein
source organism Geobacter sulfurreducens
molecule tags Transferase
total genus 76
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2009-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3h7mA02
1MQDA 3K02A 3TTKA 1SI0A 1B0HA 3K6VA 5ELVA 3MPKA 4FJPA 1XS5A 5IAIA 4RY1A 3GBBA 3EHTA 1Q1KA 5I2KA 2F35A 5FHMA 4LQ2A 1MXZA 3K2DA 2P1SA 2QMXA 3FVGA 5ITPA 2X26A 3TCGA 5DVFA 2ZYMA 2HEUA 3LC8A 2FA7A 2Y7WA 4RNSA 4OENA 3B7DA 3PPRA 4DLDA 2ANJA 1NH8A 1BTJA 1FTLA 3UN6A 1SYIA 1B3HA 3OO8A 3IOUA 3B6WA 4FIMA 5FTIA 5H8HB 1B6HA 4BDOA 5EHMA 1O63A 4F3PA 5KZTA 1IXIA 3G3GA 4P0IA 2UVIA 1Y4CA 4EF2A 3UK4A 1EZ9A 3FGSA 2PMSA 5I57B 5I58A 4IO6A 1P1NA 2RF1A 4QFLA 3A09A 3LSLA 2HCAA 3ILUB 3TTLA 4DXUA 3V83A 4PFWA 4G8MA 1KWHA 2Q2CA 1I6QA 1P1UA 1FQDA 2DP8A 3SEVA 5TPAB 2CMOA 5F1QA 2I58A 4KCCA 1JEUA 4IO7A 2B3FA 5KDTB 1MY2A 4YB5A 4Q0CA 3PUYE 1MXXA 3BBRA 2AYSA 3FVNA 3BKIB 4F29A 4F3GA 1A7LA 3PD8A 2OJTA 4NF5B 1I6BA 4P0GA 3RUMA 4POWA 3Q27A 1PB9A 4NF4B 1B51A 4GD5A 5EYFA 5A5XA 1MPBA 4R6KA 3FATA 1TFAA 4ZEIA 3SESA 3HHFA 4YZZA 2X7QA 3L6HA 3OELA 5BWJA 2A5TA 1ELJA 2Q8JA 1ZMGA 1D4NA 1MXWA 3V89B 4N6PA 3CG3A 1GR2A 3FIRA 3T9UA 3FVKA 4FEDA 3TYHA 3BFTA 3I5OA 4WEPA 3OEMA 1POTA 3O6HA 2OLBA 3SEXA 1M5DA 4MLQA 5I59B 3QUJA 4ONYA 3U72A 4GL8A 3MW0A 2F36A 3DP4A 2F7AA 2I3VA 3A3UA 3KFMA 1MY1A 1B52A 2UVJA 1JVXA 3TUSA 1OQHA 2HAVA 2FYIA 2RCAA 3I3VA 4X1DA 5H8NA 3K6WA 5CMCA 4ESXA 5H8HA 2Z22A 4YKIA 4H8JA 3H7MA 4OYVA 3K1NA 3SETA 4OERA 1QUIA 1MS7A 2I49A 3H6VA 3ODBA 1EZOA 2RC8A 1QUJA 4G2ZA 2HQ0A 5AA2D 1BLFA 1DSNA 3LSXA 5I57A 3LSFB 3H6UA 1LB8A 2I4CA 4MFIA 4IO3A 3CFZA 2H98A 4G68B 3G7WA 1ANFA 1B4HA 4TOZA 3TODA 3WAFA 4NF6B 1PDAA 4R75A 4G8HA 2PYYA 4GXAA 4F1UA 3IR1A 5TPAA 4EQ7A 1H43A 3F11A 3TCFA 4KD5A 1OVTA 1N04A 5KDTA 3KN7A 4JWYA 3FV1A 4EUOA 1QKBA 5CBRA 2F97A 3TCHA 1NNPA 2NOOA 3T93B 3VLVA 2OWSA 3MAMA 3G3IA 3SERA 3H6WA 3RT6B 1RYXA 1SW2A 3CSBA 3B6QA 2UVGA 4PETA 4YU0A 3FZVA 4LA9A 4AB6A 5DTBA 1IEJA 1DTGA 4NE4A 4GF8A 2X7PA 3QIMA 1YTVA 3TEPA 2QS2A 5I56A 3E4RA 3FXUA 1MDP1 3JV9A 1XVYA 1FW0A 4GIZA 2F6GA 2R6GE 3BFUA 3C35A 4F19A 3O28A 3T66A 5KCJB 4I8CA 5I2NA 1B9JA 4PE5B 1LCTA 2F7BA 4M4GA 1FQAA 2VP1A 5F7VA 2QS3A 5JK4A 5I2KB 1RKMA 4EF1A 5I59A 3C4MA 4LZ8A 4ND9A 2RCBA 1UQWA 3WAEA 3FJMA 4JB7A 3EHUA 2V3QA 1MY3A 4F22A 1DPPA 1Y3PA 3S9EA 4KR5A 4LZ5A 4R6HA 1B1XA 4LATA 4QSDA 3ZKLA 1SVXB 3IOTA 1B58A 4JWXA 1RYOA 1FCKA 1A40A 4Q8RA 1PB8A 2XXUA 3FJGA 1O64A 2E1SA 4H5FA 3OO6A 1FQBA 3VV5A 1B0LA 3LBSA 3UGWA 3PD9A 3U92A 3SKPA 3C33A 1XOCA 1IXHA 5I58B 5J1DA 3OO7A 4DZ1A 2KLFA 3FUZA 3CFLA 1UTHA 3IJOB 3FVOA 2Q89A 3VE1B 1OVBA 1LAHE 3DP6A 1Y1ZA 1DOTA 4JBZA 4GFRA 2DWJA 4RPNA 2XHDA 4ISUA 1FQCA 4YMAA 2DWIA 3G3HA 2O7UA 4QF9A 1JW5A 1P1OA 2XXIA 2ZXTA 3IO6A 3TTMA 2BJJX 4OWDA 3ILTB 2QMWA 4OESA 2O6AA 3OOAA 2QS4A 3PMVA 3N94A 1IUDA 3TMGA 2V93A 2I3WA 3RTFB 4WEDA 4R9GA 1HSLA 1H3DA 1GV8A 5TU0A 4R72A 1OMPA 3MC2A 3OENA 4U1ZA 1SBPA 5A5XB 4H5GA 5H8SA 4MLVA 5KCJA 4NMYA 1FTOA 2A5TB 4XXUA 1L5TA 3D4CA 2DSFA 1OLCA 3KZGA 3EPEA 4P11A 4ELOA 3TELA 4IY5A 4PFUA 1XC1A 5FHNA 1YCJA 4C1TA 1JVYA 4YKPA 1ZLQA 4I9DA 1R1NA 1NFTA 4EQBA 2DE2A 2V3UA 3QAXA 4GOTA 3H6TA 4NF8A 4KYEA 5DEXA 2V84A 1ZKBA 4X1BA 4JSDA 4OFJA 4U21A 3PUVE 4RYAA 5H8NB 1D3KA 4ZE9A 4WXJA 1FTMA 4YAHX 4M1VA 4R74A 3MP8A 3MQ9A 1AOVA 3KOTA 2ESNA 2Q2AA 2NWJA 4AQ4A 4BLAA 1JEVA 5L9OA 4R2BA 4Q30B 4ELQA 3S2VA 3O97A 5HBCA 4C0RA 1TWYA 3IAZA 4QRZA 1URDA 2XXTA 3MVWA 4FAJA 3MVXA 2WKYA 1R9QA 3OEKA 4BDNA 5TP9A 1JETA 3PGFA 3G3KA 3QSLA 3IB0A 4GWOA 3CI8A 4H1XA 2O1MA 3KJ7A 4DXCA 3HO7A 2QPQA 2F6PA 2O1LA 3PU5A 5K2YA 1NNKA 1AMFA 4QFPA 1N76A 5CBSA 3ECRA 1WDNA 3R6UA 3K4UA 5H8FA 1S50A 1FTKA 5I56B 1B5JA 3R7XA 3S4UA 1AL3A 1T0KA 1H45A 2F34A 3QXMA 4F31B 3MBPA 4XKRA 3V8XB 4IO5A 5I2NB 3VLUA 1USYH 2O7IA 4OXVA 3JZJA 4H6DA 3USDA 3I6VA 1SYHA 1SQYA 2VGQA 3S9LC 2OWTA 5H8QA 5M2VA 1LBCA 4OVJA 3HPIA 1XT8A 4MF3A 2I4BA 2Z8DA 1URSA 4KPTA 1F9BA 4EXLA 2REJA 5ITOA 2GFEA 4ZS9A 5IKBA 2QL3A 4EXKA 1PB7A 4QHQA 3TPAA 2QJEA 3O9PA 2XXRA 1H44A 4F1YA 4N07A 1WODA 1CE2A 3RT8A 5B70A 1YAEA 3HSTA 4DE8A 1TT1A 2AL5A 3TQLA 4QFKA 1MRPA 3O6IA 5AA3A 4IO4A 3T9VA 2ALUA 5AA4A 1DMBA 1O7TA 2F7CA 4XKQA 2ONRA 4O3AA 3DLNA 3TQWA 1B2HA 3SEWA 4OFLA 1A8FA 2B65A 2H25A 3E9XA 1LAGE 1HSJA 2F78A 2D21A 2DE4A 1NH7A 4K3FA 3CVGA 3GBAA 1UTHB 4IY6A 2Z23A 1QJMA 2PBWA 4ZEKA 4EQ9A 3SDFA 2H4IA 1MXYA 4NWDA 3PPPA 1Z7NE 4Z7EA 3CFXA 1PBPA 4EDPA 4G68C 2Y7PA 4QSCA 3PPOA 1EZPA 3HCQA 4RJZA 1IITA 1MM7A 1B05A 4DDDA 2UYEA 5CM6A 3C31A 4OQOA 3E13X 1Y3NA 4Z0IA 3KN3A 2R71A 2NUVA 4HW8A 2GHBA 2XXQA 5JTYA 4OTEA 1QUKA 4XKNA 2M8CA 3K01A 2DXRA 2DWHA 4FORA 4IGRA 1LBBA 1JW4A 2PT1A 1M5CA 2IA4A 3FXRA 4OEUA 2YJPA 3CR9A 2GRVA 3K1MA 4BDMA 1QVSA 3W9VA 4R2FA 2ZNTA 3ZKKA 3K6UA 3PMXA 1NMUA 2O68A 3JYRA 3B6TA 1B46A 3KGCA 1N3XA 2I48A 5AA1A 4NF8B 3VVDA 1LAXA 3IK6B 1BP5A 3VDFA 5DEXB 5FTHA 1SDXA 2XX9A 4LONB 3KN8A 2RC9A 2Q9TA 3C9HA 1PEBA 4RK9A 1IQ7A 4RK2A 2VOZA 2O51A 3E3KA 3ONMA 3S9MC 5B7DA 3L6GA 2DYXA 3MVYA 1N0TA 1OLAA 1NKXA 1S9TA 1MPDA 1LLSA 1B3LA 2PT2A 2Y7IA 2G29A 3IB1A 1R9LA 4F2QA 3C34A 3KJTA 3UIFA 4R9FA 2DQVA 4OETA 3RY3A 2RINA 1US5A 4KCDA 2Z8EA 3AXFA 1P1WA 4DXBA 4PFYA 1A54A 3U8QA 3IOVA 3Q26A 4GQOA 4KYSA 1N7XA 2ZYOA 4OFOA 3CRBA 2QSXA 1GGGA 4AB5A 4F3BA 5TP9B 2DOJA 1URGA 1VR5A 5DT6A 1B32A 4O3BA 1AH5A 1B4ZA 2DS9A 3SEYA 4NTLA 2DVCA 2XXYA 1LCFA 4I62A 3LR1A 4U1OA 4XIGQ 4NWCA 4HTGA 2RC7A 3T22A 4FATA 2Y7RA 1JW1A 2B3BA 2HFBA 2D5WA 3IORA 4QFOA 4YKKA 5H8FB 3KBRA 1QW0A 3TZAA 1SW5A 1UIUA 5FHOA 3PUXE 3O29A 1Y9UA 1LGBC 4KQPA 3MP6A 3A3CA 2VHAA 4IB2A 1SW1A 2FNCA 1US4A 2GH9A 3OD7A 1MM6A 3CSGA 2A5SA 1SD3A 5DVIA 5H8QB 1Y1MA 3N5LA 1D9YA 4JDFA 1HSEA 1M5FA 4F3SA 4IGTA 1A99A 3MZ1A 3THIA 1B5HA 2HZKA 1MQHA 2XXPA 3RLFE 4H8IA 2I6EA 1GVCA 2H99A 4YKJA 1DTZA 4F39A 3Q25A 2Y84A 3QYTA 4G4PA 2R9JA 3V5AA 1VFDA 2VD3A 3M3FA 1ZU0A 4ESWA 1IXCA 3M3LA 2UVHA 1Y4TA 3O6GA 1B7UA 3FV2A 3KSJA 1IXGA 3IB2A 4GVOA 5ISUA 5AA4B 3MZ9A 2QRYA 4F1VA 1JNFA 1LFGA 3TTRA 2XXHA 2VD2A 4ZECA 3HV1A 1QULA 2Z8FA 4ZEBA 2OZZA 5ICTA 1TFDA 1I6AA 1XHYA 1MQIA 3U93A 2O84X 1OIBA 2PX1A 1LAFE 1EH3A 3TKDA 5AA2A 1II5A 1M5EA 2E0SA 1P1QA 1UTBA 3MUQA 4ZE8A 3RNNA 2IEEA 1ZBMA 1VFEA 3PV0E 1BIYA 1Y3QA 3KSXA 3OO9A 5CMMA 2UXAA 1BKAA 3RQTA 2HZLA 4RXLA 2OCUA 2ABHA 1B3EA 4XTCQ 1AIVA 4HS7A 3VVEA 3D4GA 1NNFA 1LFIA 1YPNA 5LOMA 2Y7KA 4E0WA 3N6UA 1Q35A 4ELRA 5JTYB 1CB6A 3LSWA 3EF7A 2ONKE 4GXSB 3GLBA 2GHAA 3MJNA 4ZDMA 2P2AA 3MP1A 4F18A 4U23A 3QK6A 1VSOA 3KG2A 1MQGA 3W15C 4H67A 4U2RA 1PC3A 2LAOA 1MXUA 3O2AA 1POY1 3HHGA 1N7WA 3PPNA 1SW4A 3IJXB 2ZMBA 3S9NC 4U4XA 3FXQA 4PQJA 4MH5A 3RN8A 4GLIA 3KEIA 3ZSFA 2DVZA 4U22A 3GZGA 1LSTA 3Q29A 2H5YA 4ELPA 3UP9A 5DVJA 3K6XA 4OZ9A 5EHSA 2F8DA 3VFJA 1B1HA 3G3FA 4OMBA 4H65A 4R6YA 1MDQA 2ONSA 3TTNA 1IZ1A 2ZYKA 1I69A 3T96B 1JQFA 2H9BA 4G8NA 4RPOA 1H76A 4FE8A 3PPQA 3UORA 1VE4A 1QKAA 1NNTA 3RGYA 3FJ7A 1P99A 5ICQA 5L8DA 4IO2A 5CC2A 2XX8A 2HAUA 4YICA 2OK2A 1R6ZA 3KOSA 1MPCA 1ATGA 3C36A 3C32A 4GRKA 4UA8A 1DPEA 4NEDA 2DE3A 5CMBA 3EQ1A 1GTKA 1B3FA 4YB6A 1S7YA 3K1PA 1B7ZA 3FASA 4KFQA 1FTJA 4TLLB 4LUBA 4POXA 4LP2B 3O66A 4E0XA 4KI0E 3EN3A 2O69A 5BUUA 1LB9A 3H3GA 2DXYA 5AE4A 1FQEA 3U94A 1J1NA 3PUWE 4GL0A 3CIJA 3M3KA 3RTWB 1N3WA 3N26A 2XXVA 1XVXA 1A8EA 2UYFA 4LQ5A 2QS1A 2W7YA 1MH3A 1D9VA 2XXWA 1Y20A 4YB7A 4ZEFA 3PUZE 1USYE 3H06B 4NF5A 4JSOA 3T9XB 4HCWA 4BDRA 4FECA 5DYHA 1B5IA 2I0BA 2V25A 1TXFA 4X48A 4U4SA 4MBPA 2D3IA 2F5XA 4H0WA 4FEBA 1M5BA 1B3GA 4NF4A 4ECFA 2G93A 1LFHA 4F2OA 4DIGA 3HN0A 5K2XA 3VXBA 4BDQA 2NXOA 3VLWA 5I84A 2DWAA 3Q28A 4RA1A 3N6TA 2XXXA 3T9HB 4ZEDA 4QSEA 2THIA 3P7IA 2V3TA 4TQUQ 4YMBA 1SI1A 3K00A 2Q88A 3K0VA 2PVUA 1A55A 4N13A 3OXNA 3VXCA 1MQJA 3GXAA 1MY4A 3W9WA 1ZJLA 1IIWA 2ZNUA 4Q5TA 5CI5A 2NVUB 3OSQA 4KYDA 3RPWA 3OSRA 4XKPA 3M8UA 1UIVA 1ZIUA 1Z7ME 3DM0A 4BDLA 4PFTA 1NL5A 3MVZA 2XD2A 5CRYA 2AIXA 1B7HA 2CZLA 3CG1A 3EHSA 4OHNA 3TDJA 2I0CA 4R73A 1EU8A 3LUYA 4HCYA 3IOWA 1FQFA 3U1OA 4OEVA 2OBGA 3MZBA 1MG1A 3G3JA 1OQGA 2XD3A 5L9SA 4JWOA 5L9MA 3DELB 3R26A 4LVQA 1PBQA 5AA2B 4O3CA 3H03A 4G68A 3ZS6A 2RKMA 3OMBA 4KHZE 4TLMB 1MY0A 1UTBB 4NF6A 4DCXA 4THIA 3IX1A 4UACA 3IO4A 3IL1B 2HXWA 4G77A 3TFLA 4ZZEA 4X9TA 1MXVA 5HM4B 5CMKA 4C1UA 3MPLA 4ZZAA 1N84A 2ZYNA 4PP0A 2REGA 3TAJA 5JEIA 4WKMA 3UA8A 1B40A 4QFNA 2ZNSA 2YLNA 4L17A 3PMWA 2YPNA 4DCYA 3MWBA 3H4ZA 3QUFA 4JXIA 2AL4A 5HPQA 1MH4A 3DP8A 4I1DA 3SEUA 2XX7A 1ZTYA 3VVFA 4LZ7A 1WVJA 3FD3A 2P0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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