3H93A

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa dsba
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
192
structure length
192
Chain Sequence
SNADDYTAGKEYVELSSPVPVSQPGKIEVVELFWYGCPHCYAFEPTIVPWSEKLPADVHFVRLPALFGGIWNVHGQMFLTLESMGVEHDVHNAVFEAIHKEHKKLATPEEMADFLAGKGVDKEKFLSTYNSFAIKGQMEKAKKLAMAYQVTGVPTMVVNGKYRFDIGSAGGPEETLKLADYLIEKERAAAKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
publication title Characterization of the DsbA Oxidative Folding Catalyst from Pseudomonas aeruginosa Reveals a Highly Oxidizing Protein that Binds Small Molecules.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA
total genus 60
structure length 192
sequence length 192
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h93A00
1OC3A 2VM1A 1XVQA 2LEGA 1UVZA 1S3DA 1MDJA 2FNOA 2MBTA 1M2DA 1EEMA 1URMA 3P7XA 1ZCPA 4TR4A 4L0WA 5AN1A 1A2LA 1X9SB 4KW6A 2C80A 4V1Ag 4GXZA 4ZBAA 2K6VA 4MJCA 4ML1A 2PERA 2DJ0A 4E8HA 3GX0A 3I6AA 2BTOT 2IN3A 2TIRA 5DJLA 5DALB 3TRQA 4IQAA 2Z9SA 2VCZA 3GN3A 2OACA 3VWVA 1TTZA 3KGKA 3M1GA 4PNFA 2WS2A 2MMAA 2DJ3A 4HU9A 3DVXA 1H4OA 3FRCA 2H76A 3ZYWA 1N8JA 1XW5A 3L4NA 1O8WA 1LU4A 20GSA 4F03A 1I9DA 2TRXA 1YZXA 3KM6A 3P2AA 4OFNA 1M2BA 2O89A 5E4WA 1X5CA 4ZB9A 1KBNA 3IAS2 4LLRA 4I5QA 4Q5RA 2CAQA 5DAKB 2JZSA 2F51A 2QSIA 3EC3A 4EL1A 4JRRA 2LNSA 2AV4A 2V2GA 1F37A 5IOWA 4PQHA 3BCIA 5EPFA 4BVYA 5F0GA 4EF0A 4KA0A 2VCQA 3P8WA 2B7JA 3A2XA 5DBQA 2KHPA 1GULA 4HJ2A 2VD0A 3QDNA 5J3RA 5IOXA 1MDIA 3ZFBA 4F0BA 2MMNA 1NM3A 3HYPA 2WJUA 2X8HA 4V2NA 3SBCA 4IJIA 5DJMA 3F4TA 2CVBA 1ERVA 2PWJA 1J08A 4AGSA 1XXUA 4ZL7A 4PURA 2YNXA 2K8SA 2H0HA 4CW9A 2DIZA 3EVIA 1PKWA 2HLSA 5CRGA 1AQXA 1Y25A 1YF0A 4TN8A 5F05A 5DQSA 2E7PA 2HNLA 3HD5A 5JCUA 1O73A 3ERFA 3PR8A 2CA8A 12GSA 4RQRA 4ZB6A 2GT6A 1J0FA 4QQ7A 1SKWB 2OJLA 1B4PA 3LWAA 1A0RP 2PVQA 4I6XA 4IS0A 3BJ5A 2WZ9A 3LFLA 5HR0A 4O5RA 1TJDA 3KIJA 2E0QA 5F07A 1TKDB 3IPZA 3TRPA 4NHWA 7GSSA 2CX3A 2J9HA 3GYKA 3HKRA 2GS3A 2ZUPA 1FOVA 2IWTA 4IKHA 1F3AA 2XHFA 3FZ5A 1AXDA 4ECCA 1XOBA 2ON5A 4TOPA 2IFQA 3UVTA 3C1SA 1VF4A 2YCDA 4G9HA 4V1Ap 2FA4A 3GRXA 1T00A 1EP8A 2VCVA 1GLQA 4MABA 3LORA 1DBYA 3TJBA 3D21A 1O8XA 4YH2A 17GSA 3ERGA 4RUVA 3WD6A 5DCGA 3KP9A 4FIWA 5EY6A 3F9UA 1H75A 3Q19A 3MSZA 4HDEA 2XPDA 4RQXA 4KSOA 4QL9A 2CZ3A 5ELGA 1WE0A 3S9FA 1SJ6A 3GFKA 3BCKA 4X43A 3WT2A 2NBSA 4N0ZA 4WF4A 4L5LA 2VL2C 3A3TA 5B6NA 3VI7A 1TK5B 2R37A 3D4MA 2HT9A 3KZQA 2WB9A 1K0CA 1MEKA 1G6YA 4TR1B 3RHBA 2VIMA 5HR2A 2I4AA 4HZ2A 4PNGA 3FK8A 3C8EA 3MAKA 3HVSA 2IMIA 1NSWA 2RUEA 5IPHA 3EU3A 3IE3A 2HZEA 3QAGA 3FZ9A 2N5AA 2C3NA 1E2YA 5A5KA 5CRDA 1TOFA 4K1FA 1TK8B 3CRUA 4YQVA 2OKAA 2HI7A 4HZ4A 2CVDA 4F82A 2VCTA 22GSA 3DVWA 2DJ2A 1SU9A 2DJKA 2VCXA 4ZBBA 1FVKA 1AAZA 5LD0A 1FB6A 3GKMA 1OC9B 4G19A 2FWHA 3NZNA 2GGTA 3APSA 2PPTA 4V2MA 4EKZA 2BMXA 2FLSA 1MD4A 4PGTA 1WIKA 5G1LA 4JR4A 3QFAC 3M0FA 4MJBA 1YF1A 1ON4A 2KLXA 5DALA 4KNDA 4N11A 2XBQA 1ZOFA 1G7EA 1OKDA 4E8EA 1FG4A 3VPTA 1UC7A 3DWVA 2X99A 5ID2A 1GSFA 2L4QA 5B8AA 3NOFA 3O76A 2H72A 1F9MA 4BPYA 2LJKA 1XIYA 2VOCA 2E2GA 4HJMA 5IMCA 3UBLA 2OE3A 1KTEA 1GUMA 4TRXA 2L5OA 2RLIA 3IA1A 3ZVJD 2YWMA 3KH7A 1K3OA 1F6MC 5DAKA 4MF5A 3QD9A 3DYRA 1YQ1A 3HZ8A 1R5AA 2VL3A 2L4CA 3EWLA 3VWUA 1B8XA 1B9XC 1FVJA 4DEJA 3QCPA 3TKQA 1R7HA 4LMWA 4PUAA 1T4YA 1WJKA 1MDKA 3TJFA 4ZBDA 2GZZA 1ZYQB 3F8UA 1KEBA 1PL2A 1GSEA 18GSA 2V32A 3VK9A 1PGTA 3C71A 4PUFC 1TI3A 3UEMA 1CQGA 2GQMA 1BQ7A 5IMVA 1THXA 5IO2A 3WT1A 3HZ4A 1FW1A 3QR6A 3GX8A 1RQMA 2H75A 3AY8A 2VCWA 4ACSA 1UA5A 2FY6A 3H79A 3H8QA 5DDLA 3DIEA 2H1DA 2N5FA 2PGTA 4IN0A 4XS1A 6GSVA 4JBBA 5IMZA 5J4UA 1XWCA 3KXOA 1TK0B 1ZYEA 3W8JA 2F8AA 2VO4A 3M9JA 3GV1A 3VPQA 3UMAA 1VRSD 2F3MA 2JSZA 1TW9A 4XRDA 1FAAA 1XOAA 3UJ1A 3ZRDA 3HJMA 1PX6A 3G7IA 2AUVA 2NVLA 2MZCA 5IMFA 1B48A 3JCML 4BA7A 3VWWA 4JR6A 4PQ1A 2I1UA 1XW6A 1R26A 3TRXA 1EOHA 1PD21 5CYYA 3L9UA 3EMPA 2CT6A 1KNGA 3TJGA 3N9JA 2FCHA 2VLVA 2H74A 3FZ4A 3IAM2 1HYUA 5FHIA 2WRTA 5ENUA 4IBPA 3BOAA 5COHA 1GL8A 3ZTLA 1T7PB 3US3A 3GH9A 3ZVJA 1G7OA 4KX4A 2GT5A 4MCUA 2HRFA 16GSA 4GWRA 1Q98A 4MH3A 4KSMA 2YZUA 2LJRA 1XZOA 4WBJA 5AIXA 4DSSB 2LRNA 4LL1B 1JZDA 1X0RA 1GUKA 2ZNMA 2GSRA 2DSAA 1BYEA 2ALBA 4PX1A 3MDKA 1MD3A 1SD8A 1G0TA 1SENA 3EYTA 5A4VA 3QOUA 3CBUA 3IC4A 4MZBA 3GNJA 1TRWA 3KTBA 4MA9A 4TR1A 3VLNA 5DCHA 2H01A 1ST9A 5INYA 3APQA 2OBKA 2VLUA 4GTUA 2P5QA 4ZXGA 2WGRA 2C0EA 3TOTA 4F2IA 1GSSA 3ZMKA 5J9CA 2B5XA 4F9ZA 2O85A 5LNKe 2L59A 2PMTA 3FKFA 2YZHA 5HR3A 3LYKA 2VUPA 2OE1A 1SK0A 2H19A 4MDCA 1A0FA 3GKNA 2HSYA 1K0OA 4TXOB 4L0UA 3TJKA 4ECJA 1QK8A 1BJXA 4F0CA 3ED3A 4NPBA 1BEDA 2J23A 3GSSA 1SL1B 2CX4A 3LSZA 2HYXA 3ZZXA 1K0MA 2H1GA 3FHKA 4WBRD 5JCWA 3CTFA 1SYXA 3VFIA 2H6YA 5IO0A 2DJJA 1SK1A 4K2DA 1EZKA 2FGXA 1V9WA 1SJZA 3VI5A 1A2MA 1JLWA 2HXKA 2IIYA 5CRWA 3UL3A 4DSRA 1GTUA 1EV9A 1UN2A 5ECKB 1BX9A 1OYJA 2K18A 4ECIA 5ECLB 2DIYA 1AIUA 2TRCP 4I2UA 1EOGA 1T1VA 2B1KA 1YKCA 3HCZA 1PA3A 3QMXA 2DLXA 1PQNA 1XBSA 3F3RA 4MP4A 4TR0A 1SL0B 4MZWA 2G0FA 3ZIVA 3CSHA 4NAXA 4K8MA 5B6MA 1DE1A 2GZPA 1GSYA 3F4RA 3D22A 4G10A 1VF1A 1XW9A 3M8NA 1W4VA 8GSSA 4ECBA 1ML6A 2C0FA 2JZRA 4ZL8A 3CSIA 4NHZA 4XTSA 1ACVA 3GL5A 4NV5A 4FYUA 4LL4B 2QC7A 1E6BA 4V2LA 1K3YA 2X8CA 1NW2A 3EINA 1JFUA 1GTIA 1SK2A 5DQYA 2H6XA 5D73A 1GUHA 2HFDA 1SL2B 4AJ8A 4TW5A 4KDYA 5ECQB 5FWGA 4GRFA 19GSA 3MNGA 4MZCA 4TKYA 5IMAA 1GLPA 3A2VA 2CV4A 3KCMA 3TGZA 4EUYA 1AUCA 3DKSA 1Z7PA 4N0VA 1GSQA 1XVWA 4HQSA 3DGQA 4BL7A 3VWXA 4MLYA 4EDZA 3DXBA 3LXZA 4D73B 2PN8A 1THOA 1NHYA 2B3SA 2X64A 5ECNB 1M99A 5ECPB 3KTLA 2H1BA 3FZAA 3IDVA 2B5YA 3IK7A 3FR9A 4OD7A 5G31A 3OR5A 3UBKA 4XS4A 5L71A 6GSYA 1SJIA 2FHEA 3G7YA 2HZFA 2FD3A 2KP1A 2YOIA 4WKWA 13GSA 2EC4A 4DVCA 2B7KA 1TI1A 5C00A 3KMNA 4PXOA 1S3CA 4OO5A 2HSHA 3CRTA 1GSUA 4P3YB 3J7Yk 4GQCA 4CDOA 3TKSE 4K9ZA 2E2MA 2A2SA 4KUNA 3RHCA 1SKSB 2RUFA 3GKKA 4JU5A 1XFLA 3KEBA 2WCIA 2K9FA 1O85A 3UARA 1FB0A 6GSTA 4ILFA 2H66A 1GP1A 4YQUA 1GH2A 2IJYA 1CQHA 3CYNA 1LJRA 2JL4A 2LTKA 3NIVA 1O6JA 1V57A 3LEFA 2V6KA 2CVKA 2H71A 1A24A 2M72A 1O81A 3IHQA 1GRXA 4XIHA 9GSSA 1YDKA 1OE8A 4I2TA 4BVXA 3BD2A 2NDOA 4IP6A 4WR4A 2L5LA 2FA8A 4AF2A 2KP2A 1K3LA 4JEDA 3UVHA 3C73A 5JWRB 4HI7A 4OCFA 4POLA 3D5JA 4MK3A 1TP9A 1YKAA 1U6TA 3P90A 4Z7XA 2VLTA 1V2AA 3F4SA 5CRHA 4DSQA 5EVOA 4AJ6A 4YQMA 3U5RE 4TVEA 1EGRA 1WOUA 1K0DA 1VF2A 3ZREA 5D9VA 2AAWA 4PQIA 1HD2A 2CQ9A 11GSA 3TB2A 1XPVA 1ZZYA 4X0XA 5F06A 5G30A 1M7TA 1XWKA 1N2AA 2YPMA 4J57E 3HXSA 4Q5FA 3O3TA 1PRXA 1ERTA 1GNEA 5HFIA 2LSTA 2LJAA 3U6VA 10GSA 1XWAA 3WGDA 1Z6NA 2I9HA 4K6XA 4MH2A 1YEXA 1U88A 1YJ6A 3QAVA 2RM5A 3H4KA 4WEYA 2K8VA 3Q18A 4KDUA 4MMMA 1QXHA 2YV7A 3GHAA 2OBIA 4ISDA 5KN1A 4RI6A 5ABRA 2AHEA 4I8BA 3LG6A 3WGEA 1ZL9A 4O32A 1LBKA 1Z6MA 2HRNA 5D9WA 1X9WB 1ZMAA 2VM2A 4I97A 1XWBA 3EURA 2DMMA 2LRTA 5GAND 3I9V2 5HFKA 3W8SA 4XHMA 2DBCA 3KD0A 2I3YA 5G1KA 5DVBA 4FYCA 1ABAA 4ZL9A 3ZLPA 1PKZA 2FWFA 2WDUA 4GSNA 2YANA 1QGVA 3A5WA 3M9KA 5IQYA 3FR6A 2OA7A 4IQ1A 1DSBA 1EWXA 2P5RA 4JZQA 2IL3A 5CP1A 4ULXA 2GSSA 1JZOA 2G2QA 3QPMA 1S3AA 3LYPA 1EEJA 2P31A 1C72A 3FR3A 4MF6A 3I69A 2H30A 1Z3EA 2H70A 4LMVA 1R5PA 5HQPA 4KH7A 4ZIJA 5H5RA 1X5EA 2VD1A 3ZITA 2JZTA 1MTCA 3L78A 1ZGNA 1O7UA 2LRCA 2GZYA 2CAIA 2GSTA 2P0GA 2GDRA 2MBSA 2A2RA 2XBIA 2YP6A 3KMOA 1JLVA 3N5OA 1B4QA 1Q4JA 2PU9C 2X8GA 2PBJA 2A4VA 2IMFA 1WRYA 3FYGA 3R2QA 1V40A 4OFTA 5IMDA 3ERWA 4HS1A 3HA9A 2R3XA 2KOKA 2O8VB 5HFGA 1YEPA 2VL9A 2NTOA 3WGXA 4XS6A 1OC8A 5D9TA 6GSWA 1GSDA 4FYBA 2WFCA 2OADA 2V6OA 4GLTA 4MJAA 4NV2A 3EE2A 4KCAA 2GQKA 3LGCA 1TXXA 2JACA 3IK9A 1TRSA 3TKSA 2LS5A 6GSXA 2LUSA 4MJEA 5JWQB 5D9XA 4FH8A 1GTBA 4EDYA 1NHOA 2H8LA 2H6ZA 4ML6A 4EO3A 4FO5A 1FO5A 3UOMA 2GVPA 5ECMB 5ID2B 1BG5A 4G2EA 5H5QA 2O7KA 1FHEA 4ZILA 4Q5QA 4X1UA 1PX7A 2GTUA 1K0AA 3CXGA 5CNWA 1EP7A 1OC9A 1USBA 2AYTA 3ZIJA 4XCSA 2DJ1A 4OFMA 3RPPA 2R4VA 3DD3A 2C3TA 4XRAA 2R6KA 4WETA 4O92A 1M9BA 2MYGA 3PINA 1VF3A 1PMTA 5ECIB 2NPBA 1OAZA 2B6MA 1T4ZA 4LA1A 4EXJA 4IVFA 2VL2A 3CSJA 1VGLA 3KH9A 4CHSA 4OO4A 5H5SA 4GSSA 3Q6OA 3E3EA 5C04A 4POMA 5IPGA 2R5GA 1A8LA 4IW9A 2YV9A 1U3IA 3E0UA 3VURA 2H1AA 1EV4A 1QUWA 5G2ZA 2EIRA 2PVOC 2HE3A 2LKUA 1M2AA 1R4WA 4ZB8A 3F63A 1TU7A 4BWQA 1GNWA 1QQ2A 2LQOA 4K7OA 1RK4A 3BBYA 1AQWA 3IR4A 3W6GA 3EU4A 4K0GA 4J56E 3A2WA 2JSYA 5G5EA 2RIIA 5LCZA 2H0GA 5ELAA 1DE2A 1A2JA 1ERUA 2YJ7A 3KJYA 4GF0A 3PH9A 3K8NA 1IYHA 5A4UA 1HNBA 1DUGA 1PN9A 1W89A 2B1LA 4K7IA 2R2JA 4H86A 3GSTA 4BWSA 3RPNA 2EIOA 5KN0A 1GWCA 4KGIA 3IRAA 1AC1A 6GSUA 4KB3A 4GQFA 4N10A 4N30A 5J5NA 1M9AA 3TKSC 2H73A 4IP1A 1SYRA 3ME8A 3ZMLA 4IELA 4EVMA 1JZRA 1TRUA 1TU8A 1F2EA 1EGOA 3HVVA 4GSTA 4OCEA 4L5OA 4EE0A 1YY7A 4EC0A 3L9SA 3FW2A 3GTUB 4OWYA 5J9BA 3RAZA 1HNAA 3TKPA 3LXTA 1XCCA 3SWLA 5B7CA 3HDCA 2AJQB 1K0NA 3M3MA 4OMVA 1T3BA 5ECOB 2ES7A 2REMA 1T8EB 2IMKA 4KCEA 5KEJA 2LQQA 3D6IA 4KDXA 3HY2A 4O7HA 1WP0A 1RW1A 1Z5YE 5AGYA 3F3QA 3TOUA 5ECRB 4POBA 1AQVA 5AISA 2IPAA 4YAVA 2I81A 4NWYA 3MWHA 1G6WA 1K0BA 3ME7A 4KE3A 2C1YA 5D93A 3V1WA 5ECSA 3ISOA 4HEA2 1WWJA 1TDIA 4DSSA 3GMFA 1X5DA 1Z9HA 1HQOA 5IIZA 5GSTA 1U3AA 1ILOA 2L6CA 4MPFA 2LNTA 2DMLA 3HJOA 3UIWA 4AJ7A 2V1MA 1Y6EA 2L6DA 4Q5NA 1B9YC 2C0DA 4IGJA 3TJJA 1SKRB 2IMEA 2KUCA 2C0GA 1PL1A 4JE1A 1F3BA 3DEXA 1X9MB 4HQZA 5ECHB 5GZZB 2YWNA 1XWGA 2YWOA 3GIXA 2M80A 3HJPA 1OVNA 4NXIA 2JADA 4QL7A 3IV4A 1IYIA 5AIVA 4GCIA 3QFBC 2XPEA 2CZ2A 2N5BA 5CAXA 2C8UA 2F8FA 3GURA 5GSSA 2L57A 5JWOB 3I43A 2VAFA 3C7MA 3D0ZA 1QMVA 4J2FA 4TXOA 4IJ3A 3H93A 1A23A 1V98A 1M0UA 1OKTA 1J9BA 5KN2A 3L9VA 5J41A 14GSA 2PUKC 1AW9A 5KN3A 3RDWA 1I5GA 2EIQA 4TR3A 1Z7RA 3F0IA 3HVXA 6GSSA 4ID0A 5A4WA 5IM9A 3ZL5A 2GSQA 2AB6A 4HUAA 5D8IA 5B8BA 3TUEA 3TKRA 4WR5A 3QAWA 1WPIA 2YWIA 3APOA 4K7NA 2D2ZA 2FWEA 3KP8A 3F6FA 2C4JA 4YAPA 5GAPD 3HHVA 3LJRA 3GH6A 5CO3A 3G9BA 3TCOA 1BAYA 3D4TA 5D96A 4KAEA 2F9SA 2YN1A 2LV3A 2DC5A 2ON7A 2V41A 3DMLA 5JCGA 5E59A 3H1NA 3RBTA 1GTAA 4WXTA 2IFQB 3GA4A 4WF5A 4TXVA 4IHUA 2RM6A 1QFNA 3ZFLA 5HR1A 3LQ7A 3PGTA 5F8BA 2XC2A 2QKEA 5G5FA 3E9JB 1TRVA 3WYWA 1JHBA 1ERWA 1V58A 4L8EA 1PSQA 5EL8A 4K0NA 1JZWA 3CTGA 3IBHA 4MPGA 2BJXA 3FY7A 3IOSA 3L0HA 3Q74A 2JU5A 3IXRA 5FT3A 1WMJA 3CMIA 2QGVA 3GUSA 3GL3A 2H0IA 4NMUA 2M46A 4XS4B 4RI7A 2C3QA 4HOJA 3O6TA 3J7Yb 2IMDA 3G7JA 1SD9A 2YJHA 2FWGA 2FUG2 2WULA 1OE7A 2HZEB 2GLRA 3TDGA 1U87A 4HU7A 3GTUA 4D73A 1HNCA 4MF7A 2MMOA 2GQLA 3C1RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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