3HBDA

Class iv chitinase structure from picea abies at 1.8a
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
204
structure length
204
Chain Sequence
SVGGIISQSFFNGLAGGAASSCEGKGFYTYNAFIAAANAYSGFGTTGSNDVKKRELAAFFANVMHETGGLCYINEKNPPINYCQSSSTWPCTSGKSYHGRGPLQLSWNYNYGAAGKSIGFDGLNNPEKVGQDSTISFKTAVWFWMKNSNCHSAITSGQGFGGTIKAINSMECNGGNSGEVSSRVNYYKKICSQLGVDPGANVSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Picea abies
publication title The first crystal structures of a family 19 class IV chitinase: the enzyme from Norway spruce.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Class IV chitinase Chia4-Pa2
total genus 73
structure length 204
sequence length 204
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hbdA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 3hbdA02
4H9HA 2W1LA 4HTNA 4NWEA 1IWZA 5KXPA 1IWXA 1LJ3A 2DQJY 1DI4A 2BLXA 1B9OA 6LYTA 2BQMA 1LZRA 4LYBA 3T36A 3LYZA 1JISA 1YROA 4NGLA 2BLYA 1IP3A 1JTOL 1NWGA 1GE3A 1LJHA 1J1XY 1LYSA 1GBYA 2D91A 1NHEA 1UACY 4YEOA 4Z3MA 2ZIJA 2BQHA 1JIYA 4HSFA 1LSZA 3TXDA 1IX0A 4U3XB 4WL6A 1UA6Y 1GFVA 3A3QA 4RW1A 1J1PY 1IR8A 3EMSA 2YBIA 5E9RA 4EOFA 2DKVA 4NWHA 3TMVA 5I4XA 4NSIA 4NSGA 5I4WA 5FCPA 3IJUA 4WM1A 1IOTA 5C6JA 2MEFA 4N1EI 2DQCY 1LZ5A 2D6BA 4FJRA 1LZCA 1LSNA 1DQJC 1WQRA 2XBSA 4B1AA 4TTDA 4LYZA 5KXLA 1VDSA 3A91A 1HSWA 4I0CA 2HEFA 4EMNA 3A3RX 1GF0A 3HBDA 2W1XA 4UWUA 5HMJA 3WW6A 2G4PA 4C5FA 1C43A 1CNSA 1LTMA 4GN5C 4N9RA 1GB3A 4CGEA 1A2YC 194LA 3TXIA 5I5QA 4Z41A 1IR9A 1LSMA 4WM5A 1NDMC 4KL7A 4YOPA 4DYGA 4WG7A 4H8ZA 3WVXA 1OUGA 2G4NA 1LZGA 1G7LC 1XFPL 4PHIA 2BQDA 4NFVA 1W08A 2ZILA 4WG1A 5F9UA 3WUNA 1HEPA 1JKCA 3D9AC 3P4ZA 1GXXA 3M18B 4LYTA 2PC2A 1LZ6A 1B7SA 5HMVA 1IWWA 1IC4Y 1P2CC 1BB4A 1WVUA 4RLMA 1WQPA 4XJHA 3P66A 4NHIA 4NEBA 4ETCA 4QY9A 5KXMA 4MR1A 2AUBA 3IWRA 3GXKA 1UIEA 4XN6A 3CB7A 1GE1A 4NGYA 4OW1A 1DPXA 1B5WA 1OUAA 3W6EA 4NHTA 1NQIA 2F30A 2MEAA 3WXTA 3WPKA 1QUSA 1XGTC 2Y8PA 4J1AA 3WH1A 4DD9A 1B5XA 2VB1A 4J1BA 3TXHA 2G4QA 4NGZA 3TXGA 4LFPA 4QDNA 5LAGA 1UIAA 1B7MA 1GBWA 3WU9A 2ZQ3A 1BGIA 4H9BA 4H9IA 4TSBA 2MEBA 1JJ0A 3W6AA 4G4HA 3AJNA 3N9CA 1I1ZA 4TUNA 4E3UA 1JWRA 4WOAA 4WL7A 4AGAA 3G3AB 4GCFA 2BQAA 1XSFA 1TAYA 1KXXA 1REZA 1TBYA 5I53A 4A7DA 4HTQA 4B4IA 5L3IA 2BQCA 1JSFA 1SLYA 3A95A 1BWJA 3AZ6A 4ZFPA 2CWIA 1JKAA 4CFOA 1FLUA 4J7VA 4DDBA 1LSAA 4YEMA 1GFAA 2HUBA 3AGHA 5HQ1A 1JPOA 1LCNA 1FLYA 4NSHA 1B7QA 2YVBA 4O34A 133LA 4H1PA 1QTKA 2HEAA 1H87A 1QTEA 2D4IA 3OK0A 3W6CA 2F4AA 1HEWA 1JHLA 4LT2A 2BQKA 1UUZC 2LYOA 4W94A 4C3WA 2F2NA 1RJCB 4OWHA 1GAYA 3TMXA 1BVKC 1D0LA 4HV1A 4KPMA 2I25L 3CSZA 4LGKA 1GB9A 1GB0A 2BQIA 4XJGA 4NHPA 1LSGA 3RW8A 5L9JA 5A3EA 1N4FA 1FDLY 1GB6A 1HERA 2CGIA 4KT3A 5LVIA 3CT0A 4NGJA 1UIHA 3A96A 1LPIA 3LN2A 4AXTA 4LFXA 2BQBA 4WLYA 4DD2A 2YSSC 4KXIA 4GN4A 1AT6A 1VEDA 2EQLA 2Z2FA 4XJBA 3WYHA 1J1OY 5DM9A 1UC0A 1UBZA 1NMMA 1YKYX 3RT5X 1IOCA 2YBNA 4B49A 4WO9A 132LA 1I56A 1G7IC 2D4KA 2ZWBA 5L3HA 3B6LA 1CKFA 1LZTA 1UIDA 1VDPA 1DZBX 2C8PA 3A93A 1JJ1A 1GFRA 5LAFA 4HJZA 1LJEA 2LZTA 2MECA 1LAAA 2HEEA 4DD3A 1CJ9A 1LJ4A 1O23A 1GPQC 4H8XA 4N8ZA 5B07A 3W6FA 2YBLA 3CQLA 4NIJA 5KXNA 1IOSA 4HJVA 4BS7A 3MGWA 1B5VA 1MELL 1YAPA 4H9EA 5LVJA 1F6SA 5LVHA 1IC5Y 8LYZA 1HC0A 1FLWA 1KIRC 2YBMA 1KXWA 1LSBA 2LYZA 3M3UA 2IHLA 1JJ3A 1GB2A 2A7FA 1BHZA 5JENB 1GEZA 1HSXA 1VDQA 5LINA 1LSDA 1LZ9A 1LZNA 3BKVA 1GB7A 4IASA 3RU5A 1IP5A 1HF4A 4H9FA 1REXA 5LA8A 9LYZA 4WM2A 2Q0MX 1GWDA 1C10A 4HTKA 5C6IA 3WVYA 3ATOA 1LJFA 1UICA 4ET9A 3A90A 4RDSA 1JITA 1VFBC 3TMUA 3F6ZA 1LJIA 1V7TA 1GE2A 1YILA 3LZTA 1HENA 1IWTA 5FEKA 5F14A 1LSPA 2H9KA 1AZFA 1GBOA 3FE0A 5B06A 5LVKA 1HEOA 2BQFA 2DBTA 3J4GA 3W3EA 2Z37A 5LVGA 4R0FA 4UWVA 3IJVA 4ML7A 3WPJA 4TX7A 1CKDA 1LZAA 1GFHA 1LZ8A 1KXYA 4FDYA 5AMYA 1GFTA 4B4JA 4PGJB 1LMQA 1BWHA 1GAZA 193LA 4WM6A 1BB3A 1F6RA 2C8OA 4HPEA 4NHSA 2I26L 4WLDA 5APFA 3AGGG 1ZMYL 3AW6A 1UIFA 3HBHA 1FN5A 1HMLA 1LHKA 5F81A 3ULRA 4PRQA 1HMKA 1F0WA 3CT5A 3LYOA 1LJJA 4H93A 1LMCA 1ALCA 1NF5A 3P68A 3QNGA 1YKXX 4QGZA 2H9JA 5KXXA 2W1YA 5IDDA 1XGUC 2B5ZA 3TXEA 1GFUA 1C46A 4TSCA 5LYTA 1BWIA 1LOZA 1IO5A 2BQJA 4OOOA 1VDTA 5A3ZA 3EBAB 5KXTA 1LJGA 4NGOA 2LHMA 3CSQA 3B72A 1GFGA 1LJNA 4ETDA 1G7HC 3QE8A 1LZDA 4H91A 4P2EA 5IHGA 5FSTA 6LYZA 1OUJA 1LHHA 1IEEA 1JKBA 4N1CC 2ZYCA 1LYYA 1TCYA 3WXUA 3BKHA 153LA 1FKVA 1FKQA 2WARA 1DI3A 2ZNWY 3WU7A 7LYZA 5FELA 1DI5A 2ZQ4A 1LSFA 1QUTA 3LYMA 1XGQC 2EPEA 154LA 1REYA 1GXV2 2FBBA 4OWEA 1GBZA 1OUIA 2LYMA 1JTPL 2HEDA 3QY4A 4DWXA 5KXOA 1IOQA 2MEHA 1BB5A 1C7PA 3GXRA 1LZ1A 3WU8A 4ETAA 1C45A 1CKCA 1HEQA 5ILCA 4IATA 2DQHY 1W6ZA 3RZ4A 1GB5A 1LZBA 3AB6A 1IP4A 1BQLY 1CKGA 1LSCA 1JSEA 4Z46A 1PS5A 4LZTA 2D4JA 2EIZC 1LMOA 3W6DA 208LA 3D3DA 4CFPA 4NG8A 1HNLA 2W1MA 1D6PA 1B7LA 2DQGY 3ZVQB 4WLTA 1CJ6A 1GFJA 3AZ7A 135LA 1GD6A 4OWCA 3CT1A 2Z19A 1GE0A 4LYMA 1NBYC 3J6KA 1OP9B 4DD0A 2YBHA 5B05A 1AT5A 5DN5A 3WULA 5HNCA 2CJLA 2LZ2A 3EO5A 3A34A 1QIOA 1KIPC 2DQFC 4GLVA 4TWSA 1B5YA 4NY5A 4W96A 1NDGC 1JTTL 1B7RA 1QDTA 2ZYPA 3RNXA 4GLAA 1BB7A 1F10A 1GF4A 1HEMA 4OWAA 3W6BA 5E4PA 3TMWA 5FHWA 1ZVYB 5ILFA 5KXRA 1QSAA 5D5CA 1BVXA 4N0JA 1SQ2L 4WO6A 1TEWA 1IIZA 3N9AA 1QSWA 4GCCA 1IORA 1D9UA 1DKJA 1GDWA 1B7NA 1B7PA 5KXZA 1LSYA 4BAPA 4GN3A 4PJ2C 1IP6A 4LYCA 1Z55A 2XTHA 3WW5A 1QQYA 1FLQA 5FDJA 1OQMA 3TXBA 3ZEKA 4B0DA 1XEJA 4ZIXA 3A6BY 5F16A 3LZ2A 1OUBA 1LHMA 1B0DA 1UCOA 2HECA 1G7MC 2H5ZA 2YDGA 3ATNA 1UIGA 4BAFA 1IY4A 4RLNA 5C6LA 1GF9A 4LT0A 4GCBA 1H6MA 1LJKA 1TDYA 3G3BB 5HLLA 4NG1A 2EKSC 3WL2A 4YENA 4CJ2A 4ETEA 2DQIY 1YKZX 5KY1A 5LXWA 4HP0A 1GF6A 1LMTA 1WVVA 1WQNA 4OOTA 4LT1A 1PZYA 3B0IA 3TXJA 1XGPC 4HPIA 3B0KA 4LT3A 1V7SA 5LIOA 5DN4A 4HJYA 4XADA 3EXDA 5APEA 3AW7A 1I20A 3AZ4A 4ETBA 1KIQC 2Z18A 3HFMY 2N5ZA 1GEVA 5EBHA 2XJWA 1YL0X 3A67Y 2DQEY 5LYMA 5KKIA 1HELA 3VWOA 1GBXA 1WQMA 4H94A 1CKHA 4WLXA 1B7OA 1WQQA 4H90A 3P65A 4UWNA 1T3PA 1LHIA 1OUFA 2A7DA 5II3A 4DC4A 3E3DA 3SP3A 4R6CA 4GCEA 4DD7A 5B59A 1LYZA 1HFZA 1LKRA 1LZYA 1YANA 2BQGA 2Z39A 4D9ZA 1MLCE 4G4CA 2MEGA 1JUGA 1VAUA 2BQOA 5LYZA 1OUCA 4MSTA 3WMKA 2Z2EA 2DQDY 4ZEEA 4HV2A 1VATA 1GF8A 1ZV5L 1RFPA 4DT3A 2BAAA 2XBRA 4H9AA 4NGWA 5DL9A 2BQEA 1LYOA 2NWDX 4DD1A 5I54A 2F4GA 5K7OA 5F9XA 1GF3A 4XJFA 5APCA 5KXYA 1YL1X 1CJ8A 4WM3A 2BQLA 1LMPA 1LKSA 3OJPA 5IELA 2FBDA 2HEBA 3T6UA 4OWBA 4NGKA 1JKDA 5KKJA 1IY3A 1LZEA 1YAMA 1INUA 3AGIA 1OUEA 1UIBA 1EQ5A 1GFEA 4GCDA 4ANRA 3A92A 2FYDA 1LHJA 3WPLA 1NBZC 1WTMA 4NHQA 2RSCA 1GE4A 2BPUA 2GV0A 3ZVQA 1B2KA 3HBEX 4BADA 1IVMA 1IC7Y 1EL1A 1IP7A 3LYTA 4PRUA 1AM7A 1LHLA 3A8ZA 1GBSA 2HU3A 1DKKA 2CDSA 1LSEA 4CHXA 2HTXA 4N5RA 4M4OA 4ET8A 5T3FA 3FI7A 3LHMA 1IP2A 1IWVA 5KXSA 2Z38A 2FYCA 1XGRC 1ZVHL 3AYQA 1T6VL 5D5FA 5DLAA 3KAMA 1NKHA 1GB8A 2YBJA 5KXKA 1HFXA 1EQ4A 1FBIX 5M1YA 1RE2A 4J0LA 2IFFY 134LA 1IWUA 2MEIA 1B5ZA 2MEDA 1CJ7A 1GF5A 1D0MA 4XENA 2ZIKA 4H9CA 3N9EA 4PPOA 1G7JC 5LA5A 2BQNA 4II8A 2X0AA 1OUHA 4H8YA 4L41A 207LA 4LYOA 5KJ9A 1BB6A 1LZSA 3B0OA 5HNLA 1YAOA 1WQOA 2ZNXY 1YIKA 4WMGA 4I8SA 1LMNA 5B1FA 1IP1A 1IWYA 4Z98A 1E8LA 4NGVA 4MCKA 1XEKA 3TXFA 1REMA 1HHLA 1RCMA 1GHLA 4NGIA 4DDCA 1XEIA 1QDRA 4G4BA 5APDA 1B5UA 1LZ4A 4H92A 1YAQA 1GDXA 4XYYA 1HFYA 1LMAA 3CSRA 1A4VA 4XJDA 1JEFA 1IR7A 1DPWA 1YQVY 4WM4A 1EQEA 2Z12A 4G9SA 4X3BA 3WUMA 5J7CA 2HU1A 3TXKA 5B1GA 1C08C 1OUDA 1GFKA 2I6ZA 3A6CY 1AKIA 2MEEA 3A94A 3P64A 4XJIA 4IJ4A 4B4EA 5KXWA 4YM8A 3K3TA 4M6DA 1WTNA 3AZ5A 4YF2A 1DXJA 4NSJA 4QEQA 3WUAA 1RI8B 4G49A 1D0KA 4RW2A 5I4YA 1GF7A 2DQAA 1D6QA 4DDAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H9HA 1L42A 1DI4A 1L47A 3LYZA 2BLYA 1IP3A 1L18A 1LYSA 2D91A 1UACY 2ZIJA 2BQHA 1JIYA 3A3QA 3C80A 5LZMA 1IR8A 2O79A 3EMSA 4I7PA 3TMVA 5I4XA 4NSIA 2NTHA 2MEFA 1LZ5A 260LA 1L03A 1WQRA 1CX7A 3A91A 1HSWA 1OVKA 3OE0A 4YXAC 1GF0A 3WW6A 1QT3A 4UWUA 2CUUA 4CGEA 1LWKA 5I5QA 4DYGA 1ZURA 4YX7C 4H8ZA 245LA 1JKCA 3D9AC 1B7SA 5HMVA 1P6YA 1C6PA 1QSQA 1IC4Y 1P2CC 1WVUA 4RLMA 1C61A 4XJHA 2AUBA 4XN6A 1DPXA 4NHTA 2F30A 5I14A 3WXTA 164LA 2B6XA 4DD9A 1CV5A 2VB1A 167LA 137LA 4NGZA 3CDOA 2B75A 4QDNA 1C63A 188LA 4W55A 3WU9A 4H9IA 1C6GA 2MEBA 3W6AA 1L07A 224LA 4E97A 1G0MA 4TUNA 1KXXA 4A7DA 5L3IA 2BQCA 3A95A 1JKAA 1L85A 2HUBA 5HQ1A 1CU6A 133LA 4H1PA 4I7JA 1QTKA 3OK0A 2F4AA 3F9LA 4C3WA 1L40A 151LA 2F2NA 1CV1A 3CDRA 250LA 5L9JA 107LA 3HTFA 2CGIA 5LVIA 3CT0A 3HTDA 3LN2A 249LA 2BQBA 4LFXA 4GN4A 3PBLA 1C6KA 3DN1A 1UBZA 1IOCA 132LA 1I56A 1C65A 2RH1A 1CKFA 3B6LA 1LZTA 1XJTA 1GFRA 5LAFA 2MECA 1P64A 1O23A 1LI6A 1GPQC 5B07A 3GULA 3MGWA 1F6SA 1HC0A 2YBMA 2IHLA 235LA 5JENB 1P3NA 126LA 1L96A 4H9FA 1L62A 4HTKA 3WVYA 1LJFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H9H A;  2W1L A;  4HTN A;  4NWE A;  1IWZ A;  5KXP A;  1IWX A;  1LJ3 A;  2DQJ Y;  1DI4 A;  2BLX A;  1B9O A;  6LYT A;  2BQM A;  1LZR A;  4LYB A;  3T36 A;  3LYZ A;  1JIS A;  1YRO A;  4NGL A;  2BLY A;  1IP3 A;  1JTO L;  1NWG A;  1GE3 A;  1LJH A;  1J1X Y;  1LYS A;  1GBY A;  2D91 A;  1NHE A;  1UAC Y;  4YEO A;  4Z3M A;  2ZIJ A;  2BQH A;  1JIY A;  4HSF A;  1LSZ A;  3TXD A;  1IX0 A;  4U3X B;  4WL6 A;  1UA6 Y;  1GFV A;  3A3Q A;  4RW1 A;  1J1P Y;  1IR8 A;  3EMS A;  2YBI A;  5E9R A;  4EOF A;  2DKV A;  4NWH A;  3TMV A;  5I4X A;  4NSI A;  4NSG A;  5I4W A;  5FCP A;  3IJU A;  4WM1 A;  1IOT A;  5C6J A;  2MEF A;  4N1E I;  2DQC Y;  1LZ5 A;  2D6B A;  4FJR A;  1LZC A;  1LSN A;  1DQJ C;  1WQR A;  2XBS A;  4B1A A;  4TTD A;  4LYZ A;  5KXL A;  1VDS A;  3A91 A;  1HSW A;  4I0C A;  2HEF A;  4EMN A;  3A3R X;  1GF0 A;  3HBD A;  2W1X A;  4UWU A;  5HMJ A;  3WW6 A;  2G4P A;  4C5F A;  1C43 A;  1CNS A;  1LTM A;  4GN5 C;  4N9R A;  1GB3 A;  4CGE A;  1A2Y C;  194L A;  3TXI A;  5I5Q A;  4Z41 A;  1IR9 A;  1LSM A;  4WM5 A;  1NDM C; 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 1CKH A;  4WLX A;  1B7O A;  1WQQ A;  4H90 A;  3P65 A;  4UWN A;  1T3P A;  1LHI A;  1OUF A;  2A7D A;  5II3 A;  4DC4 A;  3E3D A;  3SP3 A;  4R6C A;  4GCE A;  4DD7 A;  5B59 A;  1LYZ A;  1HFZ A;  1LKR A;  1LZY A;  1YAN A;  2BQG A;  2Z39 A;  4D9Z A;  1MLC E;  4G4C A;  2MEG A;  1JUG A;  1VAU A;  2BQO A;  5LYZ A;  1OUC A;  4MST A;  3WMK A;  2Z2E A;  2DQD Y;  4ZEE A;  4HV2 A;  1VAT A;  1GF8 A;  1ZV5 L;  1RFP A;  4DT3 A;  2BAA A;  2XBR A;  4H9A A;  4NGW A;  5DL9 A;  2BQE A;  1LYO A;  2NWD X;  4DD1 A;  5I54 A;  2F4G A;  5K7O A;  5F9X A;  1GF3 A;  4XJF A;  5APC A;  5KXY A;  1YL1 X;  1CJ8 A;  4WM3 A;  2BQL A;  1LMP A;  1LKS A;  3OJP A;  5IEL A;  2FBD A;  2HEB A;  3T6U A;  4OWB A;  4NGK A;  1JKD A;  5KKJ A;  1IY3 A;  1LZE A;  1YAM A;  1INU A;  3AGI A;  1OUE A;  1UIB A;  1EQ5 A;  1GFE A;  4GCD A;  4ANR A;  3A92 A;  2FYD A;  1LHJ A;  3WPL A;  1NBZ C;  1WTM A;  4NHQ A;  2RSC A;  1GE4 A;  2BPU A;  2GV0 A;  3ZVQ A;  1B2K A;  3HBE X;  4BAD A;  1IVM A;  1IC7 Y;  1EL1 A;  1IP7 A;  3LYT A;  4PRU A;  1AM7 A;  1LHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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