3HD8A

Crystal structure of the triticum aestivum xylanase inhibitor-iia in complex with bacillus subtilis xylanase
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
386
structure length
370
Chain Sequence
EGLPVLAPVTKDTATSLYTIPFHDGASLVLDVAGLLVWSTCEGAEIACSSPTCLLANAYPAPGCPAKPCTAYPSNPVTGACAAGSLFHTRFAANTTDGNKPVSEVNVRVLAACAPSKLLASLPRGSTGVAGLAGSGLALPSQVASAQKVPNKFLLCLPTGGPGVAIFGGGPLPWPQFTQSMDYTPLVAKGGSPAHYISARSIKVENTRVPISERALATGGVMLSTRLPYVLLRRDVYRPLVDAFTKALAAQGAPVARAVKPVAPFELCYDTKTLGNNPGGYWVPNVLLELDGGSDWAMTGKNSMVDVKPGTACVAFVEMKGVDAGDGSAPAVILGGAQMEDFVLDFDMEKKRLGFLRLPHFTGCSSFNFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
molecule keywords Xylanase inhibitor
publication title Identification of structural determinants for inhibition strength and specificity of wheat xylanase inhibitors TAXI-IA and TAXI-IIA
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 83
structure length 370
sequence length 386
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14541 TAXi_C Xylanase inhibitor C-terminal
A PF14543 TAXi_N Xylanase inhibitor N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3hd8A01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3hd8A02
4BEKA 2FS4A 4Y3RA 4I0IA 3KN0A 3VLAA 3OADB 4LAPA 5P3GA 2BJUA 5P2SA 4Y4GA 1HVCA 3NDTA 4YDFA 1T3RA 5P5GA 1BDLA 4DJPA 2VA5A 5HDXA 3EL5A 4XX4A 4Y5LA 4RZ1A 5CONA 2QAKA 3UDYA 3FSMA 5P4PA 3SA6A 1HXBA 5OZQA 3L5BA 3H5BA 5P5AA 4ZIPA 5DPZA 5P1OA 2CEJA 3SM2A 1T6EX 4B1DA 1FLHA 3BHEA 5P4LA 2ZE1A 4Y5NA 1ZSRA 4YCYA 5P4BA 2B60A 5OYRA 2AVOA 5P2QA 1EBYA 5P8AA 2H6TA 3OXXA 5P8CA 2I0AA 3GI0A 3HAWA 5OZUA 3LIXA 5P8BA 2I4DA 4CPRA 2FDDA 5P4OA 3WZ7A 1GVXA 2F3EA 3UDMA 5P5TA 5HD0A 2JXRA 2F8GA 1HPOA 1ME6A 3OQKA 3S8IA 1MT8A 3OXVA 3OUDA 5P0IA 2PYNA 5P1BA 5P46A 4EXGA 1MT7A 1C70A 3WZ6A 5P2BA 3PJ6A 2OHMA 5P5ZA 4FGXA 5P6FA 1AJXA 1SMRA 3GGAA 4X2LA 3SA4A 2IGXA 4FIVA 5P1EA 5P18A 2QU2A 5P65A 2B7FA 5P4WA 5P3CA 3EKYA 1LYAB 1NPWA 5SZ9A 1LF3A 5P5DA 5P8HA 2OHNA 1EAGA 1W6HA 2RKGA 4RCEA 5P3JA 1F7AA 1FQ7A 1ZJ7A 4LL3A 3NR6A 2MIPA 1SDVA 4Y54A 3OQDA 4Y3HA 4Y4XA 1W5WA 3TNEA 5P5LA 1APWE 5OZNA 5P31A 1AAQA 3RSXA 3GI6A 3UDNA 5P32A 5P17A 2Q3KA 4GB2A 3T7PA 5OZEA 3SABA 5P33A 2R5QA 3OXWA 4FSEA 3PMYA 1B6JA 2V16C 3EL9A 1UH7A 3OGPA 4AZYA 1HEGE 5P8GA 1BVEA 1TSQA 5P2TA 1PSNA 3UQPA 4J0PA 4AA8A 4Y39A 3TOGA 3UFLA 5P0ZA 4DJOA 2PSVA 1BXQA 3NU5A 3WSJA 5OZ3A 5P8MA 5P5OA 1DMPA 2QI0A 5P3YA 4Y5PA 1OHRA 2R8NA 1LF2A 4QGIA 5HVPA 1XE6A 3BVBA 4PYVA 3PBZA 3PVKA 2AOGA 2QCIA 5P3LA 1B5FA 5BS4A 2QHZA 3QAAA 5AH6A 5P09A 5P05A 3H0BA 4Y5AA 4DJQA 3L5EA 3FX5A 3O9AA 4EQJA 4FRSA 4EP3A 4Y38A 4Y4UA 4Y37A 3RSVA 1LS5A 1B6KA 3TPJA 5P38A 2F81A 1W5YA 4TRYA 2BQVA 3TPPA 3CMSA 3PM4A 3LPKA 5P1PA 1HTRB 1QDMA 3SPKA 4ZPFA 3ECGA 1FQ8A 2O4NA 4DI2A 1LYWB 3SKGA 4A6CA 5P25A 3VLBA 4EJDA 5P4DA 4RVIA 3URLA 2OAHA 1D4IA 5P1ZA 5P22A 5P0PA 5P53A 5P66A 3O9IA 1B6PA 5P34A 3JVYA 1QBUA 2WF3A 4PZWA 5P57A 3PSUA 1TSUA 3UPJA 1DW6C 5P5RA 1W6IA 3FNTA 2NXMA 4ZPGA 4KB9A 3VUCA 1BDRA 1HVIA 1FQ6A 2I1AA 5P3IA 1ZAPA 3VFBA 2AVVA 4CPSA 4XX3A 5OYUA 1D4JA 3OHFA 5AH7A 2QZKA 3PBDA 2ZHSA 3O9CA 5ENMA 5PEPA 1CPIA 1NPVA 3CIDA 3OOZA 3QVIA 4L7HA 3RU1A 3ZKMA 1TW7A 1F34A 2IKUA 5KR0A 1NSOA 4GJ7A 1IBQA 1ZPAA 3DK1A 2V12C 4D89A 7HVPA 1AZ5A 1QRPE 1FMUA 2HM1A 2NTRA 2QU3A 3T6IA 4F74A 1AVFA 4RGHA 5HDZA 5F00A 3I6OA 1EPQE 5P87A 5KOQA 4Y3YA 1W50A 3K5GA 5P1NA 5P6VA 1TZSA 5P3MA 3Q4BA 5P1IA 2NMYA 5P5HA 3NUJA 4Y4JA 1IZIA 1RNEA 5P19A 5KR8A 4Y45A 3TOFA 4FAEA 4GJ8A 1G35A 5OZGA 5AH8A 4Y3JA 3EKVA 2QD7A 4HA5A 5P0QA 4J5JA 5P2VA 5P7KA 1B6MA 2PYMA 5P7WA 4EYRA 2R3TA 3VSXA 5P0BA 4I0HA 5P4KA 4B0QA 5OZAA 2PMAA 3VV7A 3PI5A 1MRWA 4KE1A 5OZCA 5P8NA 2Q64A 3O9LB 4N00A 3DUYA 1LZQA 4CKUA 4J0TA 5P30A 4B00A 4FRIA 3NDXA 2QHCA 1HOSA 4Y4AA 3LZYA 2ER7E 5P77A 4NJUA 2RSPA 4JPCA 2G1SA 5P8JA 2AVQA 3VSWA 3GI4A 5OZPA 3VFAA 5P28A 4DPFA 3OU1A 4I0ZA 5P80A 2UY0A 2WEAA 1KJ7A 4APRE 2OHQA 1EBKC 2FGVA 4I12A 3UQRA 1IIQA 5P6GA 3CKPA 2P83A 5AGZA 4FS4A 1G2KA 3INFA 1D4KA 1META 5P4YA 1K6CA 5P7GA 2NR6A 3MXDA 2J9JA 4D83A 3QI1A 1YX9A 3N4LA 4Y3TA 2I4VA 3EMYA 3KF0A 1ZSFA 2V00A 2PK6A 1A8KA 1QBRA 3PRSA 4YD4A 1YTJA 4B72A 4BELA 3HVGA 5P5XA 4QJ7A 4L7JA 3ZPUA 4Y5CA 3SM1A 5P6NA 2I4QA 5P07A 5P26A 1CZIE 5P6RA 3TPLA 3L58A 4DPIA 2P3CA 4Z22A 5P0SA 3UDPA 1K6VA 1ODWA 3MSLA 3FKTA 5OZDA 5P71A 5F01A 2ZJLA 5P6PA 5P11A 4FE6A 5EZXA 1LYBA 4ZEAA 1EPRE 4FM7A 4MC6A 4HDBA 5KQXA 5OYXA 5P1GA 4Y43A 5IVQA 2NMZA 4PPHA 1SIVA 2G21A 5BWYA 2G27A 3OY4A 5C9BA 5DQ5A 5P86A 3ZKQA 1YM2A 4EQ0A 4PZXA 2PSUA 4Q1WA 3INDA 5P2JA 2ZHTA 2ER6E 3PEPA 3T7QA 3LPJA 3EKWA 3LZSA 5P04A 5BRYA 3CIBA 1MERA 3QS1A 3PCZA 5OZXA 4DJYA 3DCRA 4RLDA 1HWRA 5P4RA 1IZEA 3AIDA 4TVGA 4EJLA 2WF0A 2IQGA 5P7TA 1APTE 3NDUA 1OEXA 4YD3A 1A94A 5P1SA 2HS1A 5P1CA 3NWQA 3KDCA 5OZ8A 2AOCA 3S54A 3OUCA 4I0GA 5P56A 5P7QA 5DGUA 4TVHA 2A4FA 4Y3WA 1MSMA 3UQXA 5P7EA 5DR8A 2ZJIA 7UPJA 2AODA 5OZIA 2PSGA 4ZLSA 3NDWA 1HRNA 5P3OA 5P6WA 3SA9A 1SGZA 2WEDA 4EP2A 3UDKA 5OYVA 5P4NA 2NXDA 4Y35A 3FNUA 1HVRA 2VJ9A 3O9FA 3O99A 3L5CA 4JOOA 5COOA 5P12A 3APPA 4K9HA 1MRXA 5P0TA 5P7IA 1J71A 5P3FA 2ZDZA 5IVTA 1SDTA 5P1TA 2IGYA 2B8LA 4OBHA 4RYGA 2OF0A 1AJVA 4E43A 1E81E 2VA6A 5P74A 5T4SA 2G69A 5P51A 1TQFA 1SGUA 5P5VA 3TPRA 1HXWA 2B8VA 3ZMGA 5P85A 5P6HA 5COPA 5ISJA 4Q1NA 4Y3GA 1XL2A 5P78A 3O9GA 3OADA 4FRJA 5P6XA 1ZBGA 3CYWA 4NPUA 3L5FA 1BWAA 5P6QA 2I4UA 5P1VA 5P8QA 2ZJMA 3BGCA 4A6BA 3MXEA 4TRWA 5P82A 2XYFA 4J1FA 5P5YA 3TOHA 4R8YA 5KQZA 2AOHA 1FMBA 1BDQA 1U8GA 2OHKA 3CKTA 3Q6YA 5P79A 5P3BA 3UCBA 4EJ8A 5J25A 4WY1A 4FL8A 2WHHA 1NPAA 4H1EA 5P3SA 5P1WA 1BWBA 3OUBA 2OHSA 3OU3A 5P1XA 5P2LA 4PHVA 1E82E 3CYXA 5P6DA 3B7VA 4LXMA 3PI0A 1FG6C 5P1KA 1FG8C 5P1DA 3QPJA 4HDFA 5P4VA 3ZKIA 4DQCA 4R93A 5C9DA 4NJSA 4KUPA 5P4MA 2F3KA 3L59A 4FM6A 2HB4A 5P8LA 5P61A 4L1AB 1XS7D 2HB3A 5IE1A 4Y9WA 3EKQA 3R2FA 5P0DA 5P2IA 1K6TA 4QJ8A 4GMIA 3FIVA 5P2AA 4QLHA 3Q5HA 5P5WA 4RRSA 1TCWA 3OQAA 5P48A 3I8WA 1ENTE 3OUAA 5P4SA 4WY6A 3VEUA 1EPPE 5P6IA 1EBZA 1YG9A 2RKFA 1FKNA 1EBWA 3OU4B 1NH0A 3EXOA 1EC3A 3PHVA 5P0EA 5P6SA 1LV1A 1XE5A 4J54A 3IXKA 1BBSA 2AIDA 5OZYA 2V0ZC 4Q1YA 3G6ZA 3QRVA 5P36A 3KFNA 5OZ0A 4QJ6A 2I4XA 2R5PA 3K5FA 3GI5A 1LYAA 5P8FA 3LZVA 5P7YA 1D4SA 2P8HA 1ODYA 4Y36A 4M8XA 5E5JA 5P5JA 4YD6A 2IL2A 5B18A 2PH8A 4I0EA 3R0WA 5HU0A 5EZZA 1T7JA 1BIMA 1XDHA 3EM4A 4J0VA 4GZFA 3DV5A 3KDDA 5P52A 6UPJA 1GVWA 5P4HA 2P3DA 5P2EA 1PSOE 4Y4ZA 1EC0A 4AUCA 5P64A 1BVGA 1PPME 4HEGA 5OZTA 2VKMA 5P0AA 4GJ6A 4ZSQA 5P3QA 4YCTA 1XN3A 2V13A 4B1CA 5HCTA 2BKSA 1C6YA 3EKPA 1OD1A 2G1YA 3ZKGA 3C9XA 4F75A 1MIQA 3OWNA 5P4IA 1GNMA 5P1HA 1QS8A 2CEMA 2AOFA 5P8PA 3MSKA 3SACA 1YM4A 5P8IA 5P01A 5ER2E 5OZRA 5OZMA 4B05A 5P10A 3ZKNA 3M9FA 4ACXA 1FQ4A 3GGVA 3INEA 4Y3NA 4D8CA 5OZSA 2VIZA 4GYEA 2ANLA 2QMFA 4MC1A 3VF3A 4NPTA 4Y4DA 4LXAA 1WBKA 1HBVA 2QI7A 3EM6A 4J0YA 5OZ9A 3HLOA 5P0CA 5P58A 1VIKA 5P6AA 3QN8A 3FNSA 5P2KA 5SY2A 2ER9E 5P40A 5P5SA 1M43A 2P3BB 1LYWA 3R1GB 5P7RA 1CMSA 3PLLA 1MEUA 2WECA 4Y6MA 1GNOA 4CPTA 3HAUA 2PQZA 4FRKA 4Y48A 4Z2ZA 3UDJA 1AXAA 5P5CA 4UPJA 5TOLA 4XKXA 5P2DA 2QNQA 4H3FA 1T7IA 3OQ7A 4D88A 2Q54A 1D4YA 3BUGA 4IVSA 3LIYA 2O40A 2FNSA 4MC2A 3OTYA 5DR1A 5I3XA 5SY3A 4LP9A 3D20A 5HE4A 2QK5A 2IENA 4NJVA 2ZJNA 3VF5A 4ZSRA 3ZPSA 2QD8A 5P6LA 1SDUA 3LHGA 2BPVA 5P5BA 2VNNA 4ZE6A 3VG1A 1DPJA 4OBDA 2BBBA 3VYDA 3TLHA 4Y4EA 1ZPKA 4B78A 4Y3QA 3NU3A 4F76A 3EM3A 5P4FA 2BPZA 5P37A 3LIVA 1ZTZA 4OC6B 3QBFA 2CENA 5DQ4A 5P3TA 4GJBA 2NPHA 3U6AA 5P8KA 5P7AA 4K8SA 4Y5EA 3PLDA 3LINA 2JJIA 3SA8A 4GJ5A 3KMXA 2Q55A 2QMGA 1GKTA 5P03A 4J0ZA 4YBIA 1HVSA 3HW1A 4J1HA 3IGBA 5P2NA 3EKXA 5P3PA 3D1ZA 4HE9A 5DQ2A 1UPJA 1MTRA 4J55A 2WJOA 2QMPA 3ZL7A 3DM6A 2ZGAA 5P8UA 4FAFA 4FLGA 4COEA 4GJ9A 3U7SA 4DFGA 5P35A 1M4HA 5P6UA 3NXNA 3DOXA 9HVPA 1Q9PA 3RTNA 3JW2A 3O9LA 5P2OA 3PWRA 2Q15A 3LZUA 4EXHA 4U8WA 1BV7A 4BFDA 3NYGA 2HC0A 2JYSA 5P6CA 2BPWA 4LBTA 2O4PA 4Y4WA 3OK9A 1VIJA 2FDEA 5P8DA 5P2RA 4JP9A 3S43B 3PMUA 1ODXA 5P4TA 2FXEA 2QD6A 1FFIC 1GVTA 2XYEA 1PFZA 5OYYA 1FGCC 3PWWA 2V10C 1MSNA 1FFFC 3ZLQA 3QVCA 1TCXA 2R43A 4ZSMA 1A9MA 4LXKA 4U7QA 4Y3XA 2IS0A 4Y3MA 4B1EA 8HVPA 5ER1E 1C6ZA 5OYQA 5P81A 4ER2E 5P8RA 5P7CA 4Y4TA 4ZPEA 1BAIA 3L5DA 5P1QA 5P3UA 5OZOA 2VIYA 4DJRA 4Y57A 1YT9A 1HSGA 5P0RA 5P6MA 5DR3A 1FIVA 5OYTA 5P7MA 5P1UA 5P3HA 5HTZA 4OBZB 4ER4E 3HD8A 1ZLFA 5P73A 1UH8A 5P0YA 4DJXA 4YE3A 2Q11A 3GGXA 2OHUA 4EPJA 3KYRA 5P2GA 2PWCA 2WKZA 4APEA 4OBFA 1EPLE 2G1OA 4OBZA 2A1EA 2WF2A 5P1FA 5P59A 5P5QA 2BPYA 1RV7A 4I8ZA 2G20A 2NXLA 4Z4XA 1PROA 3O9DA 1QBSA 1WBMA 5P3EA 3EL1A 3ZPTA 3KFSA 2G26A 1SIPA 3PGIA 3EL0A 5P00A 4IVTA 2VNMA 5OZVA 5OZJA 5P2CA 5P7NA 4B70A 3NU9A 5DR0A 3TKWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4BEK A;  2FS4 A;  4Y3R A;  4I0I A;  3KN0 A;  3VLA A;  3OAD B;  4LAP A;  5P3G A;  2BJU A;  5P2S A;  4Y4G A;  1HVC A;  3NDT A;  4YDF A;  1T3R A;  5P5G A;  1BDL A;  4DJP A;  2VA5 A;  5HDX A;  3EL5 A;  4XX4 A;  4Y5L A;  4RZ1 A;  5CON A;  2QAK A;  3UDY A;  3FSM A;  5P4P A;  3SA6 A;  1HXB A;  5OZQ A;  3L5B A;  3H5B A;  5P5A A;  4ZIP A;  5DPZ A;  5P1O A;  2CEJ A;  3SM2 A;  1T6E X;  4B1D A;  1FLH A;  3BHE A;  5P4L A;  2ZE1 A;  4Y5N A;  1ZSR A;  4YCY A;  5P4B A;  2B60 A;  5OYR A;  2AVO A;  5P2Q A;  1EBY A;  5P8A A;  2H6T A;  3OXX A;  5P8C A;  2I0A A;  3GI0 A;  3HAW A;  5OZU A;  3LIX A;  5P8B A;  2I4D A;  4CPR A;  2FDD A;  5P4O A;  3WZ7 A;  1GVX A;  2F3E A;  3UDM A;  5P5T A;  5HD0 A;  2JXR A;  2F8G A;  1HPO A;  1ME6 A;  3OQK A;  3S8I A;  1MT8 A;  3OXV A;  3OUD A;  5P0I A;  2PYN A;  5P1B A;  5P46 A;  4EXG A;  1MT7 A;  1C70 A;  3WZ6 A;  5P2B A;  3PJ6 A;  2OHM A;  5P5Z A;  4FGX A;  5P6F A;  1AJX A;  1SMR A;  3GGA A;  4X2L A;  3SA4 A;  2IGX A;  4FIV A;  5P1E A;  5P18 A;  2QU2 A;  5P65 A;  2B7F A;  5P4W A;  5P3C A;  3EKY A;  1LYA B;  1NPW A;  5SZ9 A;  1LF3 A;  5P5D A;  5P8H A;  2OHN A;  1EAG A;  1W6H A;  2RKG A;  4RCE A;  5P3J A;  1F7A A;  1FQ7 A;  1ZJ7 A;  4LL3 A;  3NR6 A;  2MIP A;  1SDV A;  4Y54 A;  3OQD A;  4Y3H A;  4Y4X A;  1W5W A;  3TNE A;  5P5L A;  1APW E;  5OZN A;  5P31 A;  1AAQ A;  3RSX A;  3GI6 A;  3UDN A;  5P32 A;  5P17 A;  2Q3K A;  4GB2 A;  3T7P A;  5OZE A;  3SAB A;  5P33 A;  2R5Q A;  3OXW A;  4FSE A;  3PMY A;  1B6J A;  2V16 C;  3EL9 A;  1UH7 A;  3OGP A;  4AZY A;  1HEG E;  5P8G A;  1BVE A;  1TSQ A;  5P2T A;  1PSN A;  3UQP A;  4J0P A;  4AA8 A;  4Y39 A;  3TOG A;  3UFL A;  5P0Z A;  4DJO A;  2PSV A;  1BXQ A;  3NU5 A;  3WSJ A;  5OZ3 A;  5P8M A;  5P5O A;  1DMP A;  2QI0 A;  5P3Y A;  4Y5P A;  1OHR A;  2R8N A;  1LF2 A;  4QGI A;  5HVP A;  1XE6 A;  3BVB A;  4PYV A;  3PBZ A;  3PVK A;  2AOG A;  2QCI A;  5P3L A;  1B5F A;  5BS4 A;  2QHZ A;  3QAA A;  5AH6 A;  5P09 A;  5P05 A;  3H0B A;  4Y5A A;  4DJQ A;  3L5E A;  3FX5 A;  3O9A A;  4EQJ A;  4FRS A;  4EP3 A;  4Y38 A;  4Y4U A;  4Y37 A;  3RSV A;  1LS5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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