3HJPA

The crystal structure of bcp4 from sulfolobus solfataricus
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
b'MVEIGEKAPEIELVDTDLKKVKIPSDFKGKVVVLAFYPAAFTSVSTKEMSTFRDSMAKFNEVNAVVIGISVDPPFSNKAFKEQNKINFTIVSDFNREAVKAYGVAGELPILKGYVLAKRSVFVIDKNGIVRYKWVSEDPTKEPNYDEIKDVVTKLSLE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Peroxiredoxin, bacterioferritin comigratory protein homolog
publication title Exploring the catalytic mechanism of the first dimeric Bcp: functional, structural and docking analysis
rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 47
structure length 158
sequence length 158
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hjpA00
3VLNA 4IHUA 1SJIA 3UARA 4PQIA 4F0BA 5JCUA 1NM3A 2A2SA 2VIMA 4BVYA 5G1KA 1XOAA 4XTSA 3QCPA 1ML6A 2GZPA 4K0NA 3HJMA 5CP1A 2LJAA 5D9TA 3ZITA 2RLIA 1YZXA 5F07A 4F0CA 1R5PA 3KTLA 4JR4A 4WKWA 1XVQA 1YF0A 1AW9A 4DVCA 3ZVJD 1G6WA 3ED3A 4HQSA 1GTUA 3FKFA 5EY6A 3L4NA 1ZL9A 3QAGA 4GSNA 1K0CA 2FNOA 1NW2A 1B48A 4J2FA 2PBJA 4XIHA 4TW5A 2GSSA 1DUGA 2OE1A 1J0FA 2L57A 3L9VA 4JE1A 1GTAA 1BX9A 5CO3A 3QAWA 5CAXA 4MJEA 5ID2A 5HR1A 3MSZA 3WYWA 5ELGA 3A3TA 4TR1B 3TKSC 2TIRA 5IMAA 1F3AA 3ZREA 4N0VA 2DJ0A 2IMDA 4POMA 1E6BA 6GSXA 1B4PA 4FIWA 5GSSA 2B7KA 3GN3A 5JCWA 2F8FA 2EIOA 3DVXA 2DJJA 3TJKA 1B9YC 4L0UA 4IQ1A 4YAPA 5H5QA 5IO2A 5IOXA 3N5OA 1ERVA 22GSA 3CRUA 4AF2A 2VCTA 1SKRB 1EZKA 3FYGA 3Q18A 1J08A 4ML1A 4V1Ag 3L0HA 1N8JA 2DJ2A 2E2MA 2PN8A 3CYNA 3LG6A 2VCXA 3L9UA 1XFLA 1W89A 4XRAA 3FR6A 4TR4A 5D73A 1R26A 1TW9A 4MJBA 2H74A 5CYYA 2L4QA 5DCHA 5J3RA 2YPMA 3QD9A 2OADA 4J57E 2OACA 2GZYA 4KA0A 4OFMA 1YKAA 3FR9A 4G2EA 2IPAA 3UVHA 1HYUA 11GSA 1TRSA 3TOTA 1XZOA 2H8LA 3DXBA 1XIYA 2X64A 1OAZA 5IMFA 3O76A 4FH8A 1O7UA 4DSSA 5ECMB 5B8BA 1FOVA 2LJRA 3TRQA 2DJKA 3GX8A 1K0MA 3I9V2 5F8BA 1FG4A 3D4TA 4K7IA 1EGOA 4ZBDA 1T8EB 2H76A 4G9HA 5C04A 1X5DA 5B6NA 3U5RE 1SYXA 3TKSA 4AGSA 2VCZA 4F2IA 1FW1A 2C0DA 1GTIA 2GQKA 2DIZA 3F4SA 3F4TA 4ZL7A 2H1AA 2AB6A 4RQRA 3KTBA 3GUSA 5DALB 3UOMA 3UEMA 1GNWA 2P31A 4EVMA 2K8VA 4I6XA 1OE7A 2FHEA 1JHBA 3VURA 4DSRA 5A5KA 1XW5A 2V6OA 2DSAA 1YY7A 2GSQA 4XRDA 2L5OA 3TKPA 3S9FA 3HZ8A 2VL3A 2R3XA 1PX7A 3ZFBA 2IIYA 3M9JA 4F03A 2RIIA 1G0TA 2HSHA 4I2UA 4ECBA 1WOUA 1PSQA 1R4WA 4HZ2A 4Q5FA 5DALA 3ZMLA 2GQMA 1X9WB 2L5LA 1SK0A 4AJ6A 4LLRA 4MABA 2CAQA 2QSIA 2XPEA 3EE2A 1LU4A 3P90A 3D5JA 4IJIA 2V2GA 1K3OA 3N9JA 1EP7A 2FY6A 4TXOB 3LYPA 3KIJA 3MAKA 2FA4A 4KDYA 3ZRDA 1G7EA 3HDCA 4TR0A 4JBBA 2E7PA 2K9FA 3HA9A 3D6IA 6GSWA 4POKA 2V41A 3F63A 1ZZYA 4NV2A 2A2RA 2N5FA 3QOUA 3VK9A 2GDRA 2QC7A 5G5EA 3APOA 2YCDA 3IPZA 1PKZA 5KN0A 1DE2A 1X9SB 3IV4A 2GT6A 4EF0A 1JZOA 3WGXA 2LNSA 1LBKA 3FW2A 3QPMA 2LQQA 1SL0B 4PUAA 4TXOA 1JZRA 1SK1A 4O7HA 2C3QA 1M9BA 5FWGA 3J7Yb 1FAAA 2G0FA 2O87A 5IMVA 2I81A 4Q5QA 3G7IA 2DBCA 3CSJA 4MA9A 4FYUA 5F05A 1EV9A 3P2AA 4P3YB 1TU7A 1U6TA 2B6MA 1OC9A 2PVOC 2L6DA 4KSOA 4BPYA 5AN1A 8GSSA 1ZCPA 1PKWA 5C00A 1IYHA 2YWNA 5D9WA 1BAYA 3GSSA 2WULA 3KEBA 3GHAA 3NIVA 2CA8A 5J9CA 2H70A 4Q5RA 7GSSA 4TRXA 2WDUA 3IBHA 3I69A 1X9MB 4QL9A 1MDJA 4TOPA 4PX1A 1RK4A 5H5RA 5KN3A 2PUKC 3VWVA 1V9WA 1GWCA 4PNGA 1PRXA 5JWQB 3FHKA 2VUPA 4MPFA 1XOBA 3OR5A 4ZB6A 1V58A 1BEDA 1BYEA 4HU9A 5KEJA 2R2JA 4JRRA 2H71A 3D22A 2OE0A 2MMAA 3UAPA 2IWTA 1A0RP 1F9MA 5EL8A 5DQYA 4GQCA 2LS5A 3WGEA 3SWLA 2YN1A 2H0GA 2O8VB 2O7KA 5JWRB 1GSSA 2NTOA 3KP8A 1GNEA 4ILFA 1T4YA 4POLA 2MYGA 4O5RA 5IO0A 4FYBA 2H1DA 5ECLB 4F82A 1GLQA 1AAZA 1VF3A 2O89A 5B6MA 4OFNA 2H0HA 2B5YA 1PMTA 2XBQA 1DE1A 2YV7A 3EWLA 1Q98A 1XWCA 2K8SA 2C4JA 4JZQA 2D2ZA 1YDKA 4EUYA 1PQNA 4O32A 4HEA2 4PQHA 3C73A 3QAVA 2KHPA 1Z6NA 1ERTA 3VWUA 1V57A 2WZ9A 5G5FA 5E4WA 2H30A 2C0EA 2NBSA 1THXA 2KUCA 3MDKA 1OC3A 3LORA 2JADA 4CHSA 3AY8A 3TCOA 2GTUA 2A4VA 3E9JB 1JLVA 4ECJA 5ABRA 1Z9HA 2L6CA 3IR4A 1MDIA 1WRYA 4TR3A 1A2MA 3IAM2 3EC3A 4MJCA 1ZMAA 2WCIA 1DSBA 1JLWA 5G1LA 3GKMA 1GSFA 2RUEA 1A2JA 2I3YA 2RUFA 1FB6A 2DIYA 5F0GA 4L5LA 4IVFA 4OCFA 4KAEA 4Z7XA 1TXXA 1HNAA 4GSSA 3UBLA 5IMDA 4ULXA 3TKRA 9GSSA 2WB9A 4OCEA 3O6TA 2LRTA 1M2DA 4F9ZA 3HZ4A 3ZTLA 3JCML 2VCWA 1MD4A 2LUSA 3WGDA 2B5EA 6GSTA 4PURA 5CRHA 2AJQB 3VPQA 3TJGA 4IS0A 3LGCA 2GVPA 2KP2A 1T7PB 3EU4A 4ZXGA 3HY2A 3KGKA 2AUVA 1ZYEA 4MPGA 3ZVJA 1T3BA 5IMZA 4ZL9A 5ECSA 2HLSA 1DBYA 2IL3A 1XW6A 2YWMA 2VCQA 4ZBAA 3UIWA 3M9KA 1Z3EA 2M80A 1EV4A 2IMIA 3BBYA 5IMCA 3P7XA 4OWYA 5A4WA 2JZSA 3SBCA 1KNGA 2J23A 3HXSA 1G6YA 1AXDA 1F37A 1ZOFA 1A8LA 4WEYA 2H6ZA 3ERGA 3H8QA 3ZFLA 17GSA 5CREA 2H75A 2I9HA 2DJ3A 1YKCA 3C71A 2B5XA 2DLXA 1YQ1A 4MF6A 1K3LA 4ECIA 2XPDA 1GRXA 1BG5A 3TDGA 5IQYA 3LFLA 2GSTA 3GL3A 1FVKA 5H5SA 3C8EA 3W8JA 4HI7A 1S3AA 3M3MA 4TKYA 1QMVA 3H1NA 1X5EA 2E2GA 3M8NA 1K0OA 2C0GA 2LNTA 1Z7PA 16GSA 3HCZA 1FB0A 4HJMA 1OE8A 3LQ7A 4E8HA 2KP1A 3G9BA 4TR1A 4XHMA 1WE0A 3M0FA 4LL4B 1SKWB 1A8YA 4KB3A 3H4KA 2H72A 4OMVA 5IPHA 4V2MA 2AV4A 20GSA 3FZAA 3TOUA 1M0UA 1XWGA 1UVZA 4V1Ap 5L71A 4KSMA 2LTKA 1PL1A 1QUWA 3PGTA 1SYRA 4RUVA 5D93A 2REMA 3ME8A 3H93A 2YP6A 3G7YA 3C1SA 1TRUA 6GSUA 2YV9A 3H79A 2K6VA 2K18A 1WWJA 1M9AA 4GWRA 2ES7A 5LCZA 1SK2A 4GLTA 1SL2B 4PUFC 3ME7A 4KW6A 4ACSA 1GH2A 4I5QA 3LYKA 2H19A 3EVIA 3LWAA 1K0BA 1T00A 2N5AA 1RQMA 3PINA 3GKNA 3L78A 2IJYA 2LRNA 4K7OA 4YQMA 2C3TA 1H4OA 2NVLA 2M72A 3P8WA 1SL1B 1LJRA 5J9BA 1WJKA 3FK8A 3VPTA 2VLVA 3DVWA 4HZ4A 3ZL5A 3IDVA 2OBIA 1SD9A 3GURA 2C8UA 1THOA 4HU7A 2YWOA 4FO5A 4MZCA 4RI6A 5ECQB 2CVDA 1AC1A 2H1GA 4WBJA 2VCVA 4DEJA 2RM6A 4BVXA 2VLTA 3WD6A 2DJ1A 5D96A 2DMMA 2H6YA 4X1UA 5GSTA 3RBTA 3HD5A 1XCCA 4XS1A 5ECKB 2VO4A 1SJZA 1XWAA 5A4UA 3NZNA 2TRXA 1GL8A 1URMA 5J5NA 3Q6OA 5GAND 4WF5A 1AUCA 4K2DA 3Q74A 1UN2A 1TK5B 3KXOA 3BD2A 3ZMKA 1M2BA 3ZLPA 4HDEA 2IMKA 5FT3A 1AIUA 1OKDA 2VD1A 3D21A 1Z6MA 1KTEA 1HQOA 3UL3A 2FD3A 3GYKA 2CVKA 1TI3A 3GKXA 4KCEA 5ECHB 3BOAA 2BJXA 4POBA 2R6KA 4G10A 4MLYA 4ID0A 1TK0B 5EPFA 2IFQB 5DDLA 1O8WA 2HE3A 4OFTA 3BCIA 1W4VA 2CV4A 1I5GA 3A2XA 1GSUA 4EKZA 4Q5NA 2PGTA 1PX6A 1T4ZA 1R5AA 2WGRA 4EO3A 5ENUA 4JEDA 1EEMA 2PERA 3V1WA 12GSA 3CTGA 4G19A 4TN8A 1Z5YE 3DIEA 4PXOA 4WR4A 1TOFA 2CAIA 5HFGA 2HXKA 4MCUA 1B9XC 3UMAA 2ALBA 2MMZA 3EMXA 3GTUB 4IQAA 5AISA 3CBUA 4ZIJA 3RPPA 5JCGA 5JWOB 1T1VA 2HSYA 1BQ7A 3US3A 4GXZA 2Z9SA 1VF2A 4KUNA 1MEKA 2HT9A 5ECOB 5F06A 4LMVA 1WPIA 3CRTA 2FLSA 2C0FA 1O81A 3I43A 3BJ5A 4KDXA 1PGTA 3FZ9A 3RAZA 2X8HA 4V2NA 2VL2C 2V6KA 1HNBA 3GTUA 1PN9A 1N2AA 3A5WA 3ISOA 3E0UA 1TI1A 4ML6A 4YQUA 2JSZA 3HYPA 4BWQA 2PU9C 4I2TA 4IW9A 1TK8B 3NOFA 2YZUA 2LV3A 4N10A 1SJ6A 3KCMA 2FUG2 1ERWA 2DC5A 2QGVA 2TRCP 2F3MA 2H73A 2LKUA 4QQ7A 2AHEA 4LMWA 3KD0A 5B8AA 2LEGA 5DVBA 1EP8A 1O8XA 1XBSA 5DJMA 1ZGNA 2YJ7A 3FZ4A 4YH2A 4O92A 5AIXA 1TRVA 4DSQA 5CNWA 4OO4A 5HFIA 4NHWA 3IHQA 3GFKA 1X0RA 4I8BA 1E2YA 3KMOA 2KOKA 3QDNA 2JACA 5G2ZA 3EU3A 4OD7A 1GSQA 4K7NA 2FGXA 5AGYA 1S3DA 1TRWA 3DYRA 2VAFA 5D9VA 3TKSE 2R5GA 1S3CA 3TRPA 3G7JA 3ERWA 2VL2A 2X8GA 3VI7A 4NWYA 1TKDB 2HRNA 1CQHA 4YQVA 2MZCA 4X43A 1Z7RA 2FWHA 2H66A 2HZFA 3VWWA 19GSA 1VRSD 4MF7A 1SKSB 2FWFA 2NPBA 3VI5A 1JFUA 2GGTA 2QKEA 1AQXA 2JZTA 4IGJA 4E8EA 3QR6A 1TDIA 3KMNA 4EC0A 1GUKA 2E0QA 1V2AA 2B1KA 2C80A 2ZCTA 2NDOA 5HR3A 3TB2A 3HKRA 4XS6A 2MBSA 3GX0A 1VF1A 5ECRB 4EDYA 2HI7A 4WXTA 5KN2A 1MD3A 3A2WA 4GF0A 1A2LA 2LQOA 3DGQA 3W6GA 1SD8A 2P5QA 3EYTA 2EC4A 5E59A 2CQ9A 2ON5A 3LEFA 3QFBC 3CSIA 2GQLA 3I6AA 3HJPA 2IN3A 3DMLA 4K1FA 4EE0A 2JZRA 1ILOA 1QQ2A 1PL2A 1U88A 2X99A 4GQFA 4D73B 2AYTA 4NPBA 2MMOA 1TTZA 5ID2B 3HVSA 4N30A 4IP1A 2OJLA 2GS3A 3PH9A 1EEJA 2M46A 4ZL8A 3D0ZA 2ZNMA 3L9SA 4NV5A 1XPVA 3EURA 5G31A 1A24A 5GZZB 4HS1A 4IBPA 1EWXA 1TP9A 3KP9A 3R2QA 3KH7A 4KGIA 2WFCA 4L5OA 4FYCA 3GH9A 5DJLA 3TJJA 3UJ1A 2YWIA 1Y6EA 5KN1A 3RPNA 1QK8A 4D73A 3ZZXA 3HHVA 1JZDA 1R7HA 2LSTA 1HNCA 5DQSA 1XW9A 4MZBA 1VGLA 4KE3A 3TJFA 1A23A 1XXUA 1BJXA 3MNGA 5LD0A 4GSTA 3EINA 4LA1A 4TVEA 1J9BA 3TRXA 3FY7A 4V2LA 2HZEB 3PR8A 4L8EA 3APQA 2BTOT 1C72A 1XWKA 2OE3A 4GRFA 2MMNA 3J7Yk 1K0DA 3DD3A 1V40A 1ST9A 2P0GA 2V32A 3FZ5A 5HR0A 1TU8A 3WT2A 3LJRA 2EIRA 3UBKA 4GTUA 3IK9A 4CW9A 2B7JA 5HFKA 1U3IA 3IAS2 4NAXA 2ZUPA 1MTCA 2FA8A 3GA4A 4YAVA 1OVNA 3KH9A 13GSA 3GSTA 4DSSB 3IXRA 1UC7A 2HZEA 3F3QA 3IC4A 2CT6A 1B4QA 1KBNA 1U87A 4MDCA 2R37A 3ZIJA 3TKQA 1GLPA 4ISDA 3CSHA 4MP4A 3W8SA 2DMLA 3BCKA 1WMJA 2I1UA 4JR6A 2VL9A 2B3SA 5CRWA 3IE3A 4K8MA 1ACVA 1GUHA 4WBRD 3ZIVA 2YJHA 2BMXA 3RHBA 4XS4B 4JU5A 1YEPA 5HQPA 2LRCA 1GSEA 3O3TA 1F6MC 4K6XA 1NSWA 2CZ2A 3KZQA 5ECPB 1GP1A 1KEBA 4WF4A 3K8NA 2EIQA 1EOHA 1UA5A 2G2QA 2VD0A 1F2EA 1PD21 4KX4A 3GNJA 2C1YA 2VM1A 2AAWA 4PGTA 4EDZA 2MBTA 2H6XA 2VM2A 2H0IA 3GMFA 4XS4A 1A0FA 5D9XA 3VFIA 3D4MA 3ERFA 4IELA 2XBIA 5DAKB 2YZHA 5DBQA 3C1RA 2O85A 2PWJA 2V1MA 2HFDA 3FRCA 3HJOA 2J9HA 2HRFA 3HVXA 2JL4A 2OA7A 2P5RA 4I97A 4AJ7A 3F6FA 4KNDA 1QGVA 1GTBA 3IK7A 3GV1A 4EL1A 4KH7A 3APSA 2R4VA 1H75A 1FHEA 3QMXA 1XVWA 3GH6A 3RDWA 2ON7A 1RW1A 2PPTA 2L59A 1GUMA 4RQXA 1XWBA 5DAKA 5A4VA 2XHFA 2I4AA 2JSYA 5CRDA 1NHYA 3M1GA 4K9ZA 4H86A 4K0GA 3IA1A 3VWXA 1ON4A 1OYJA 1OC8A 1OC9B 4ZILA 2IMFA 1OKTA 4EXJA 4HUAA 1K0AA 5INYA 2HYXA 1Y25A 1AQWA 2LJKA 1JZWA 2JU5A 1F3BA 4MJAA 4OO5A 4IJ3A 2RM5A 5GAPD 3FEUA 2WRTA 4WETA 1Q4JA 4MH2A 3CTFA 4GCIA 3E3EA 1YJ6A 2L4CA 3FR3A 1QXHA 5ECNB 1EOGA 4X0XA 1GULA 3CXGA 4N0ZA 3GL5A 3DKSA 5EVOA 3DRNA 2C3NA 10GSA 4BWSA 2IFQA 3LSZA 4MK3A 4NMUA 2YNXA 4CDOA 4HJ2A 2WJUA 4PNFA 1HD2A 5CRGA 4LL1B 3ZYWA 2GSRA 3EMPA 3UVTA 1G7OA 3KM6A 4J56E 2OKAA 1O73A 1CQGA 3A2VA 1GSYA 1USBA 2VOCA 3F4RA 4NHZA 2YANA 3KJYA 6GSVA 2VLUA 4HQZA 2YOIA 2CVBA 3GIXA 2X8CA 4ZB8A 4KDUA 2FWGA 18GSA 3RHCA 3DWVA 4ZBBA 1ERUA 4MF5A 1YF1A 5AIVA 3IOSA 4L0WA 5IIZA 3F6DA 4PQ1A 3DEXA 4BA7A 5LNKe 3GRXA 2H1BA 4ECCA 1O85A 3LXZA 1FO5A 1GSDA 5DCGA 4AJ8A 1M7TA 3LXTA 1IYIA 4IN0A 5IPGA 5COHA 5B7CA 2PVQA 2OBKA 3WT1A 3Q19A 4MMMA 5D8IA 2FCHA 3TUEA 2F9SA 1QFNA 1VF4A 5ECIB 4MZWA 5IOWA 1ABAA 1FVJA 4XCSA 4KCAA 1X5CA 2XC2A 2CX3A 3C7MA 3F3RA 4TXVA 1TJDA 5ELAA 1NHOA 2B1LA 4HOJA 2WS2A 6GSSA 4IP6A 1M2AA 2N5BA 14GSA 1SU9A 2IMEA 5J41A 2F51A 1ZYQB 1K0NA 1MDKA 5FHIA 2CX4A 5IM9A 3MWHA 6GSYA 3TGZA 1PA3A 3F0IA 4BL7A 1K3YA 2GLRA 4MH3A 1V98A 1EGRA 5G30A 2PMTA 3F8UA 3F9UA 3HVVA 4NXIA 3IRAA 3TJBA 1WIKA 2H01A 2HNLA 4N11A 2GZZA 3U6VA 4WR5A 1SENA 2CZ3A 3QFAC 2FWEA 4QL7A 1AQVA 1B8XA 2GT5A 1O6JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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