3HJPA

The crystal structure of bcp4 from sulfolobus solfataricus
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
b'MVEIGEKAPEIELVDTDLKKVKIPSDFKGKVVVLAFYPAAFTSVSTKEMSTFRDSMAKFNEVNAVVIGISVDPPFSNKAFKEQNKINFTIVSDFNREAVKAYGVAGELPILKGYVLAKRSVFVIDKNGIVRYKWVSEDPTKEPNYDEIKDVVTKLSLE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Exploring the catalytic mechanism of the first dimeric Bcp: functional, structural and docking analysis
rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin, bacterioferritin comigratory protein homolog
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 47
structure length 158
sequence length 158
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hjpA00
1GSDA 3BD2A 1GWCA 4GSNA 3H1NA 3TRQA 4J56E 5D9XA 4QL9A 4EO3A 5HFKA 3GN3A 1X5CA 5ECHB 4MF6A 6GSWA 2LRNA 5G1KA 4X1UA 1ZOFA 5DJLA 1GSFA 1Y25A 4GXZA 5JCUA 2VAFA 5G31A 1WMJA 2L5LA 5DDLA 2K8SA 1ILOA 2ZCTA 4G10A 5EVOA 1K3LA 4ZBDA 2KHPA 4YAVA 3F4SA 1SK1A 3IDVA 2C0DA 1G0TA 2PGTA 3CSJA 2DBCA 3EU3A 3KTBA 4Q5RA 3APQA 5IMCA 4GSSA 3QOUA 3O3TA 3CMIA 1OKTA 2GSTA 3ME8A 2HYXA 1EGOA 3KCMA 5IIZA 2AHEA 4GLTA 1WIKA 1SL1B 3EU4A 3F4RA 5F05A 1BQ7A 1EOHA 3A5WA 3IAS2 2JU5A 2X8CA 4TR1B 2H0GA 2ZNMA 4ECBA 1JLVA 5FWGA 2P5QA 3L9UA 1GLPA 3QDNA 3VPQA 4POLA 2GT5A 4IS0A 1R5AA 4JR4A 2EIQA 2L59A 3GNJA 3HKRA 1XWAA 2YWNA 2H75A 3CSHA 1Z6MA 2PU9C 1USBA 3C73A 3HJPA 1JFUA 2VL9A 2DIZA 1GSSA 1QXHA 1PSQA 3CSIA 5J9CA 2LV3A 4KH7A 1PL1A 1R5PA 3HJMA 5D73A 1S3AA 4I6XA 4TR0A 1QQ2A 5ELGA 4J2FA 3FW2A 4KSMA 2VL2C 3ME7A 6GSTA 2RM5A 2HSYA 1X9WB 1KBNA 1T1VA 3FR9A 3ZREA 2V6KA 4DEJA 5LNKe 4EL1A 3TKSE 2X99A 5C04A 3GKNA 1IYHA 2ES7A 3FZ9A 1RW1A 2VCXA 5HFGA 3G9BA 1B4QA 1YQ1A 2H19A 2B1KA 3ZVJD 2IPAA 3MNGA 2K6VA 1H4OA 3VI5A 1TU8A 5F8BA 5HR0A 2YV9A 5ECPB 1K0MA 3HDCA 1A2LA 1CQHA 1M9BA 3TOUA 4YQMA 3TJJA 4KGIA 3UBLA 5ECOB 1W89A 3C7MA 2LQQA 1A24A 3CTFA 1ABAA 2GQMA 4WR4A 2WZ9A 2A2RA 4IVFA 7GSSA 4K0GA 4NPBA 6GSSA 1O6JA 3CTGA 2ZUPA 3KP8A 2CT6A 3PINA 4MJAA 3OR5A 4OCEA 2Z9SA 3WGEA 1YEXA 4POKA 4XS4B 1XFLA 2XPDA 1MD3A 1XW9A 2V41A 3IRAA 4LA1A 3LXZA 2FUG2 1EEMA 2N5BA 4GQFA 4GWRA 4ZBBA 2LNSA 4EE0A 1GUMA 3HXSA 5CRWA 2RUEA 4LL1B 2IL3A 1V58A 2X64A 4HQZA 3QAVA 2YZHA 1TI3A 2RIIA 2MYGA 2CZ2A 2VO4A 4YH2A 1AIUA 1THOA 1F37A 4WEYA 2YZUA 3UL3A 4L0UA 4TXOB 2I81A 3TCOA 18GSA 1PD21 2IIYA 3GKKA 3LFLA 1T7PB 3IAM2 3VWWA 4GF0A 2R6KA 1O73A 4XIHA 3ERWA 1HQOA 3F63A 1M2BA 5KN1A 4MP4A 3WT1A 2FWGA 2B7JA 2HSHA 2L5OA 4Q5NA 4EKZA 1AQVA 1T4ZA 4BVYA 10GSA 3BJ5A 3ZZXA 1EOGA 2GS3A 4K2DA 3EMXA 3NIVA 3UAPA 4MMMA 4O5RA 4POBA 3A2VA 5F06A 1U88A 4GRFA 5D9TA 4N0ZA 3KJYA 4DSRA 4K8MA 2L57A 2FCHA 3QFAC 2HZEB 1XVQA 2VLTA 4HS1A 1FO5A 2DJ1A 2OBIA 4OD7A 4GQCA 1DBYA 5ELAA 4PURA 2B3SA 2PUKC 5KN3A 3MSZA 1X5DA 5GZZB 3DYRA 5IMFA 3HVXA 4JBBA 3KD0A 2GSSA 3G7YA 4MPGA 4K7NA 1WWJA 3KTLA 1ZMAA 4F9ZA 2VOCA 2C3QA 2LJKA 3M0FA 1I5GA 3I6AA 5ECMB 5J41A 3APOA 2MMNA 5AIVA 4PX1A 2VD1A 4MZBA 1FAAA 4KDYA 3R2QA 5CRHA 3C8EA 3ZFBA 5AN1A 3CRUA 3IC4A 1LU4A 3SWLA 1CQGA 5IMZA 2F8AA 3HZ8A 2GSRA 3IE3A 2K9FA 4JR6A 2RM6A 2P5RA 5ID2A 5HFIA 1S3CA 2HLSA 3F3QA 3GV1A 5EY6A 1FVKA 4OO5A 1PMTA 2PERA 4MA9A 3TRPA 1WOUA 3PR8A 4IELA 2VUPA 3GURA 2F9SA 4N30A 3GUSA 2WULA 1TW9A 3GRXA 1XW6A 3L9VA 1U3AA 2YWMA 3VI7A 14GSA 4QL7A 2VCQA 3UVTA 1FHEA 4HJ2A 5ECIB 4D73A 5C00A 4OCFA 3TJBA 2O85A 2KOKA 2RUFA 2YJHA 5G5FA 1HYUA 3Q74A 4WKWA 3WGDA 1AQWA 2C0GA 4IQAA 5CRGA 1O8XA 5B8AA 3TJGA 5DVBA 5HR1A 4N0VA 1XVWA 2E2MA 1R26A 1XCCA 5D96A 5KN2A 3ZL5A 1F9MA 2H72A 5G1LA 3GMFA 4WF5A 5KEJA 13GSA 4TR1A 1GSYA 4XS6A 1T8EB 2YV7A 1WJKA 3MWHA 3IA1A 2H01A 2MZCA 3GX8A 2OKAA 4NHWA 4ACSA 4XCSA 2CAIA 2JADA 3BCIA 5ECNB 3LYKA 2R37A 4HUAA 3VLNA 1OYJA 3C1RA 3FYGA 3H79A 3TUEA 3TDGA 1HD2A 2I9HA 3LSZA 4L5OA 3RHBA 2H71A 1JHBA 4MLYA 1EP7A 2LSTA 2VM2A 2H6XA 1TK5B 2YWIA 5DAKB 5HR2A 4V2NA 1GSQA 2M80A 4F03A 2JSYA 3QR6A 4IW9A 2OE0A 3GA4A 1ML6A 2H66A 1PL2A 3ZYWA 1M7TA 3DVWA 1WP0A 3U6VA 5G2ZA 3IK7A 3TKSA 5CRDA 1OKDA 5ECLB 2HZFA 4HQSA 4CHSA 1WRYA 2L4QA 2IFQA 1AC1A 2BJXA 2LKUA 3RBTA 2CVBA 3IR4A 5D9WA 3ERFA 1YZXA 1IYIA 1GULA 1U6TA 5L71A 4FO5A 1QMVA 2E2GA 1NM3A 2E7PA 4KW6A 3CXGA 2N5FA 1A8LA 2I4AA 1VF1A 1F2EA 1GP1A 1OAZA 2O8VB 4I97A 3WD6A 4KSOA 3E3EA 1SKRB 6GSUA 3FRCA 2O89A 4QQ7A 3L78A 2XC2A 3HHVA 3HVSA 2M72A 3ZMLA 3KZQA 1TKDB 4NMUA 2AYTA 4HU7A 3M3MA 3TKPA 2REMA 5DQYA 3A2XA 4I8BA 3LQ7A 4Q5QA 1OE7A 2FNOA 4X43A 4ZIJA 2WFCA 3DVXA 3Q18A 3EVIA 1EV4A 3GHAA 4KB3A 2LQOA 3HVVA 5DALB 4ZL7A 2CZ3A 2FGXA 2YCDA 2OE1A 2CAQA 5GAND 3ZITA 4MZCA 4H86A 1M0UA 4J57E 2F3MA 3VWXA 4DVCA 1JZWA 3QD9A 1YF0A 1PKZA 3TKRA 2X8HA 3GSTA 1BG5A 1LBKA 1ZZYA 4E8EA 1PA3A 4LLRA 2OADA 1YKCA 1ZGNA 2KLXA 1QGVA 2PPTA 5IOWA 1PQNA 2FWHA 3BCKA 1X9SB 1MTCA 2C3TA 1U87A 1TRUA 2WB9A 2PVQA 2KP1A 2JZTA 2NVLA 1PN9A 3KEBA 4ILFA 5INYA 2MBTA 4KE3A 4E8HA 1OVNA 5F07A 3VFIA 4KAEA 8GSSA 3I69A 4MF7A 1TK0B 4MPFA 3IHQA 1TJDA 4ZB8A 3GX0A 4OO4A 1AAZA 4IBPA 4P3YB 1VF3A 4YQVA 4XRAA 3RHCA 3HCZA 2EC4A 1HNBA 4ECIA 1SD8A 4TN8A 2O87A 3G7JA 2JACA 1NSWA 4RQXA 2H0HA 1SYXA 4NV2A 4TXVA 1PX7A 4XTSA 5B6MA 1A0RP 1SENA 5ENUA 2YP6A 4IN0A 1DE2A 5H5RA 9GSSA 3WT2A 1JZOA 4JEDA 3P8WA 1XIYA 2HRFA 2N5AA 3C1SA 5ECRB 2CX4A 4XHMA 5IPGA 1ON4A 3EC3A 3HD5A 3KMNA 1SL0B 3D22A 4WR5A 2GVPA 4EXJA 1GSUA 4EUYA 5JWQB 3E9JB 1SKWB 2GZYA 3IBHA 1MDJA 1PRXA 5CP1A 4AGSA 4HDEA 3I43A 4ULXA 1GNEA 4TOPA 3GKXA 2PMTA 1RQMA 5JWOB 1J08A 1WE0A 3GTUA 3KH7A 3ZIVA 1XBSA 1SK0A 4JRRA 1SK2A 3I9V2 2TIRA 1ZL9A 1G6YA 2RLIA 2XHFA 3F6FA 4O7HA 1GUKA 4V2MA 3HZ4A 1KEBA 1Z3EA 4FIWA 1GH2A 2H1AA 1XXUA 1PKWA 1W4VA 1GSEA 2B6MA 1T00A 4ML1A 4OFTA 2KP2A 1F3BA 1A23A 1GTUA 2E0QA 5HR3A 3J7Yk 1K3YA 4IQ1A 5D9VA 1ACVA 1YDKA 3M9JA 2MBSA 1NHYA 3GFKA 3DEXA 5DJMA 3FZAA 1R4WA 4I5QA 2WDUA 1MEKA 3H93A 4WXTA 5G30A 5EL8A 4K6XA 4F0CA 2C3NA 1X0RA 2GGTA 5IMAA 1BEDA 3LEFA 1F3AA 3U5RE 1Z7PA 4K7OA 3EMPA 1Q4JA 1TTZA 1UA5A 2ON7A 3FZ4A 2FWFA 1WPIA 1B4PA 2IMKA 4MK3A 3ED3A 4MJCA 1GL8A 4ID0A 4HJMA 3DRNA 1ST9A 2VCTA 16GSA 1N8JA 1VF4A 2XBIA 3LG6A 4PQ1A 3SBCA 4ML6A 4TW5A 3UJ1A 4EC0A 2H0IA 2YPMA 3TKSC 4MCUA 3F3RA 1Z9HA 1JZRA 4BWQA 2VLVA 3ZMKA 1AW9A 3GYKA 2GT6A 2OJLA 1A0FA 4K7IA 2LEGA 3HYPA 1TK8B 4GCIA 1Z7RA 1URMA 4FH8A 4KCEA 1M2AA 4BVXA 4MH2A 4MF5A 5CREA 2NPBA 2WJUA 2YOIA 3P90A 2PVOC 2LRTA 1DUGA 4RQRA 3FY7A 2HI7A 1XPVA 3W6GA 3LGCA 3KXOA 2A4VA 1XOBA 2H6YA 3KGKA 1OC9A 1K0AA 2CX3A 2CA8A 4IGJA 1A2MA 2FA8A 5JWRB 2VD0A 3HY2A 2G2QA 3D0ZA 3QFBC 2JSZA 1O8WA 4BL7A 1X9MB 4AJ7A 3RPNA 3VURA 4EDZA 1S3DA 3NZNA 4JU5A 5IMDA 2DMLA 3D4TA 2A2SA 3GH9A 1B9YC 4TR3A 2LS5A 1QK8A 3A2WA 2IMEA 2QKEA 2XPEA 5CAXA 1VRSD 1TOFA 3J7Yb 3VWUA 3MDKA 3DXBA 3M8NA 1DSBA 1A2JA 2NTOA 3EWLA 3UBKA 1QUWA 3L0HA 2H70A 1K0BA 2H1DA 3L4NA 1GNWA 2H1BA 2V32A 1YF1A 2O7KA 2ON5A 2H74A 4V1Ag 1O81A 4L5LA 3UIWA 4K9ZA 4IHUA 4NAXA 3W8SA 4OFNA 3P2AA 3TB2A 3H8QA 3EURA 2R4VA 2MMOA 3TKQA 3TOTA 4NXIA 5IQYA 4HOJA 3P7XA 4MJEA 1GTAA 2CV4A 2P0GA 1M2DA 3FZ5A 4PUFC 2NBSA 1EV9A 4BWSA 1GUHA 3Q19A 2IMIA 4NV5A 4KX4A 1V57A 2YJ7A 4RI6A 3LWAA 1XZOA 1XWGA 4KA0A 3KMOA 2DJKA 1TRSA 3Q6OA 1ERVA 2VCVA 3IV4A 5D8IA 2YNXA 4F0BA 2HE3A 1RK4A 5ID2B 4EDYA 4DSQA 1GTIA 1M9AA 2MMZA 5FHIA 2R2JA 1Z5YE 1FB6A 4AJ6A 2GTUA 4IJ3A 2DLXA 1TI1A 1OE8A 4ZBAA 4DSSB 3LJRA 2GQKA 4AF2A 2VIMA 5AIXA 1AQXA 3US3A 3GH6A 3ZVJA 4OMVA 1TRWA 5IMVA 2PWJA 3FEUA 2F8FA 4D73B 3ZFLA 5J3RA 3G7IA 4EVMA 4NWYA 1MDKA 2HNLA 3NOFA 5IOXA 4PNGA 3EINA 4WBJA 1PGTA 3VK9A 6GSVA 1BAYA 1V40A 5AISA 1Z6NA 2X8GA 3CYNA 3KH9A 4NHZA 1GRXA 5ABRA 2PBJA 3ZIJA 1ERTA 5ECKB 3O76A 3ERGA 12GSA 2L6CA 1Y6EA 3IOSA 4HZ2A 1ZYQB 2J23A 2LJAA 1MDIA 3QPMA 4I2UA 5IM9A 5B8BA 2WS2A 2GQLA 5D93A 4ZB6A 4F82A 4XS4A 5IPHA 2PN8A 3TGZA 2EIRA 2WGRA 5GSTA 5JCWA 3M9KA 2F51A 3UMAA 1V98A 5KN0A 4MJBA 5DCGA 5LD0A 4CW9A 1FG4A 1AUCA 4L0WA 3H4KA 5AGYA 5CYYA 1BJXA 2P31A 1F6MC 1O7UA 1FOVA 2VL3A 2AUVA 3QMXA 5IO2A 3K8NA 3QCPA 4JZQA 3W8JA 1OC8A 2FWEA 2OBKA 3UEMA 4FYUA 2WRTA 1K0CA 1EP8A 2AB6A 1TU7A 2B5YA 2YANA 1AXDA 1SJIA 3BOAA 1YKAA 2K8VA 2JL4A 1QFNA 2GDRA 4MABA 3GL5A 1G6WA 4ISDA 4TXOA 1ZCPA 3QAGA 2IFQB 2VCZA 4RUVA 1V9WA 4PNFA 3EE2A 3D6IA 2H8LA 3RPPA 1XWBA 2C80A 4ECJA 3RAZA 1OC3A 5B7CA 1XOAA 2YN1A 2DMMA 1E6BA 3CBUA 1TDIA 1J0FA 2C0EA 2B5XA 4MZWA 4OFMA 1SKSB 4YAPA 4POMA 1PX6A 2QC7A 1SJ6A 1VGLA 3D4MA 1X5EA 3JCML 3F9UA 1I9DA 1U3IA 4N11A 5HQPA 3F0IA 1ERUA 4ECCA 1UVZA 3E0UA 5IO0A 1EEJA 2HRNA 11GSA 3N9JA 3RDWA 4X0XA 2H73A 3GL3A 2I3YA 3APSA 2OACA 1GTBA 4FYCA 1B8XA 1UN2A 2JZSA 22GSA 1A8YA 3C71A 1H75A 4BPYA 2HZEA 4G9HA 4WBRD 4GTUA 6GSYA 2OE3A 2TRXA 2H6ZA 3HJOA 2CVKA 2IJYA 3ZLPA 1M99A 4WETA 4LL4B 3L9SA 5LCZA 4XS1A 3PH9A 4IJIA 4EF0A 1HNAA 3QAWA 1KTEA 2B7KA 1TXXA 2DIYA 4TR4A 2FLSA 1THXA 2AV4A 1VF2A 3IPZA 5J4UA 1C72A 4TKYA 4ZXGA 4V1Ap 3LXTA 2DJ2A 3DGQA 3FR3A 4O92A 4KUNA 3O6TA 3S9FA 4HEA2 3ISOA 3UVHA 2H76A 2H30A 2LRCA 5F0GA 1V2AA 3LYPA 3WGXA 1XWCA 2V6OA 2AJQB 2LNTA 1K0NA 4MDCA 1T4YA 4FYBA 1JLWA 3KIJA 5J9BA 5DCHA 2MMAA 1O85A 3EYTA 4G2EA 3DWVA 5A4WA 1SU9A 4ZL9A 2IMFA 3IK9A 1K0OA 3ZRDA 4CDOA 2C8UA 2GLRA 2DJJA 2QGVA 2M46A 3FK8A 5JCGA 1KNGA 4HZ4A 1YY7A 2HT9A 2GZPA 2VL2A 1B48A 3V1WA 2HFDA 3FHKA 4ZB9A 2D2ZA 3PGTA 3KP9A 2AAWA 2HXKA 4V2LA 4F2IA 3M1GA 1N2AA 2EIOA 2DSAA 2FHEA 1B9XC 4KCAA 5A4UA 5A5KA 4AJ8A 2DJ3A 1FW1A 2DC5A 3GIXA 3F6DA 2VCWA 3N5OA 5GSSA 4HU9A 4N10A 5E4WA 5J5NA 2FY6A 2R3XA 2G0FA 4YQUA 5GAPD 4KDUA 1NW2A 1G7EA 2J9HA 1SL2B 4O32A 2YWOA 3CRTA 3GTUB 3GKMA 4K1FA 1SYRA 2FD3A 1JZDA 4IKHA 4PUAA 4Z7XA 5COHA 2B5EA 2WCIA 2GSQA 2C0FA 3LORA 3BBYA 2VLUA 1XWKA 1YEPA 2LJRA 3TRXA 1DE1A 3FR6A 2NDOA 2CVDA 4HI7A 5G5EA 5ECQB 5H5QA 19GSA 2IMDA 3VPTA 2R5GA 5DAKA 3F8UA 4PQIA 1MD4A 1TP9A 5CNWA 3MAKA 4I2TA 4PGTA 2L6DA 2LTKA 6GSXA 3HA9A 2TRCP 1EGRA 4G19A 5ECSA 1UC7A 1FVJA 1YJ6A 3AY8A 2BMXA 2I1UA 2OA7A 4TRXA 2XBQA 2ALBA 1G7OA 4DSSA 4PXOA 1Q98A 4WF4A 5FT3A 1ZYEA 3DIEA 3D21A 5E59A 3DMLA 1K3OA 3TJFA 3IXRA 1EZKA 1R7HA 4XRDA 1SJZA 1XW5A 2B1LA 2H1GA 1BX9A 3KM6A 4LMVA 3DKSA 4JE1A 1K0DA 3F4TA 2JZRA 2CQ9A 2FA4A 4L8EA 5CO3A 2QSIA 2L4CA 3GSSA 2V2GA 4LMWA 3WYWA 4Q5FA 3ZTLA 2IWTA 2C4JA 3TJKA 2VM1A 4KDXA 5EPFA 1BYEA 4ZILA 1TRVA 5B6NA 2BTOT 4IP1A 4GSTA 1GLQA 2V1MA 1E2YA 5A4VA 4KNDA 2GZZA 4IP6A 4TVEA 2LUSA 5DQSA 3D5JA 1SD9A 1LJRA 3A3TA 5DBQA 20GSA 3DD3A 5H5SA 2K18A 1J9BA 4OWYA 1T3BA 4ZL8A 2IN3A 4K0NA 17GSA 1FB0A 4PQHA 2DJ0A 3UARA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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