3HN0A

Crystal structure of an abc transporter (bdi_1369) from parabacteroides distasonis at 1.75 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
DTVIKVSVLRGPSVIAFADWLENPPIIDNKKVQVKVVDSPDLAQALLIKQETDIAVLPMINAANLYNKGIKIKLAGCPIWGTLYLVEKTPLKEPALYVFGNGTTPDILTRYYLGRQRLDYPLNYAFNTAGEITQGILAGKVNRAVLGEPFLSIALRKDSSLRITADLNHLTDNDTLGFAQTAVVYTPTMEKYRIAFEDALRASCQKAVRYPKETIHSLEEHGIFAQGALTPKSIERCKIYYLSAIEAKDAVMGFLRLIEQYEPKAVGGRLPDAGFIPEKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Parabacteroides distasonis
publication title Crystal structure of Nitrate transport protein (YP_001302749.1) from Parabacteroides distasonis ATCC 8503 at 1.75 A resolution
rcsb
molecule keywords Nitrate transport protein
total genus 87
structure length 280
sequence length 280
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hn0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hn0A02
1A8EA 3IORA 2ABHA 3DP6A 2QSXA 4F3SA 3HCQA 4PFTA 4UA8A 4U1OA 1MY4A 1B52A 1N3WA 1LAHE 4FIMA 1CE2A 3HV1A 4GOTA 3IK6B 3MZBA 2ZYOA 4GXAA 4JWOA 4F18A 1USYE 2QMWA 2D21A 3TEPA 2F5XA 3EPEA 4GF8A 1S50A 3DP4A 3K6VA 3RN8A 2W7YA 1R9LA 3TELA 3U72A 2OBGA 1MPCA 2QS3A 1NFTA 3T9UA 2REJA 3IB0A 4ELRA 2DWIA 3G3IA 4U1ZA 4PFUA 3LSXA 5AA4B 2M8CA 1T0KA 1B4HA 4F31B 3PUXE 1NNPA 1JW1A 1URSA 1IEJA 1MRPA 4Q30B 3IB2A 3QUFA 2VGQA 4R9FA 5H8NA 4C1UA 3MBPA 2HZKA 4GL0A 4R9GA 4NF4B 4FAJA 3BFUA 4F19A 3FV2A 2R6GE 2CMOA 4NTLA 3K01A 5TPAA 1SW4A 4R74A 3PPQA 3EHUA 3FUZA 3O9PA 4G4PA 3PMVA 4NE4A 3OMBA 2QMXA 2YLNA 1LAGE 2ZNUA 1LLSA 5CMMA 3TYHA 2ONKE 1MS7A 5J1DA 3MP6A 3S4UA 1TXFA 4MFIA 3SEUA 4YB7A 5H8QA 3OSRA 1UIVA 3TTMA 1MH3A 4POXA 5JK4A 4PETA 4ZDMA 1PB8A 1IXCA 2UXAA 2RC7A 1OLAA 4GFRA 3MVZA 4K3FA 3O6GA 3FJ7A 1XOCA 2I4BA 3ONMA 4G8MA 4RK2A 5JTYA 3H6UA 4G77A 3UP9A 4F1YA 2XXWA 4ND9A 2P0SA 4LP2B 2B3FA 3H3GA 1URDA 4OFJA 4QFNA 3GLBA 3BKIB 4NF8B 3ZKKA 4LATA 1OVTA 2Q8JA 2XXUA 3KEIA 1B5JA 3K1NA 2OK2A 3L6HA 1B32A 3OO9A 4JBZA 4XIGQ 1AH5A 1XHYA 4MLQA 4R6HA 4OERA 5I56B 3ECRA 3G3HA 2BJJX 4ESXA 2DVZA 1TFDA 5IAIA 3FATA 2I0BA 5ELVA 1LB8A 2UVHA 3W9VA 4TLLB 2Z8DA 1AIVA 1MDQA 3PD9A 2QS1A 4IY5A 4MF3A 1NH8A 4X1BA 1B0HA 1ZTYA 5I2NB 3C35A 1MXYA 3K6WA 2PVUA 4GD5A 4JWXA 3TTLA 2P2AA 4OVJA 2Y7RA 1ZMGA 2HAUA 2F35A 4OENA 3MP8A 1FQCA 4HS7A 4OXVA 3QSLA 3VXBA 4IO4A 3EHSA 5TP9A 2NXOA 2ZNTA 4TLMB 2DXYA 4QFLA 1B3HA 3PUZE 1GVCA 4JWYA 4EQ9A 1N84A 1Y9UA 4FEDA 2O1LA 3PMWA 3TKDA 1Y4TA 3V5AA 5CMKA 3KN7A 1TT1A 1H45A 3HHFA 3TDJA 5AA2A 3TTNA 1B3FA 1IZ1A 1ANFA 4IO6A 2XXRA 4EQBA 2ZXTA 2O7UA 3VLUA 3TMGA 3G3JA 4KYDA 4U4XA 2V3TA 4P11A 1FQDA 1L5TA 3ZSFA 3ODBA 1ATGA 3E4RA 1MDP1 1FTMA 1JNFA 3V8XB 3MW0A 2QJEA 3K6UA 3PGFA 4OMBA 3QIMA 3PPNA 1Z7NE 3VV5A 1US4A 3TODA 4F1VA 3E9XA 2AL5A 3ILUB 2H99A 2X7PA 3N26A 4LQ5A 5F1QA 4ZE8A 3U1OA 3O66A 2F7BA 2VD2A 2V3QA 2F34A 4NF4A 4ZZEA 2O84X 3LUYA 4JSOA 4LUBA 1SBPA 2Y84A 3IOVA 3CG3A 3RNNA 4ESWA 3U92A 4NF5B 2WKYA 2ZYMA 4FATA 2Z8FA 1N04A 1Q35A 3F11A 4AB5A 3H6VA 4TOZA 3T9HB 3OOAA 4G68C 3EHTA 4PE5B 3PMXA 5I58A 3FVGA 4EDPA 2NUVA 1UTHB 2PT1A 5FHOA 3A3CA 3VVDA 2DQVA 4JB7A 3IX1A 4DE8A 1MG1A 2A5TA 1YTVA 2VHAA 3RTWB 2I48A 5DTBA 1VFEA 4FJPA 3TUSA 1JEUA 3MZ9A 3S9NC 1MPBA 3LC8A 1UIUA 3IOWA 2HFBA 4E0XA 1MXUA 2DE2A 3JZJA 4WKMA 1QVSA 3FGSA 2Q2CA 3GZGA 2QS2A 5H8SA 2DWJA 2XXIA 4F3GA 1D4NA 3FV1A 3KN3A 1B5IA 4P0IA 3MUQA 3W15C 4RA1A 2VP1A 1NL5A 1OVBA 4YMBA 2XXHA 4U4SA 1JEVA 4C1TA 1MH4A 2H5YA 3SEXA 4RXLA 3P7IA 5TU0A 3FXQA 2UYEA 4LZ7A 2QPQA 3OENA 1LFIA 4UACA 1IXIA 4EQ7A 2OCUA 1B6HA 5DVJA 4ZEBA 1XS5A 1MY3A 3OELA 5H8FA 3TQLA 3KZGA 4KI0E 4IGTA 3OEKA 5CMBA 3VXCA 3K2DA 1MY2A 1LBBA 3L6GA 4G8NA 4NF6B 2DE4A 3C4MA 4R2BA 2OWSA 5EHSA 1O7TA 1VSOA 4H6DA 4IO3A 3IAZA 5JEIA 3OO6A 1A40A 2GRVA 5CM6A 1KWHA 3JYRA 1UTBB 1YPNA 5AA1A 1OQGA 1J1NA 4EUOA 2PMSA 3R6UA 5I2KA 4O3BA 5DVFA 1RKMA 1ZU0A 1N7WA 1A7LA 4ZECA 4EXLA 4ZS9A 3T22A 5CRYA 2O7IA 1H3DA 3MVXA 1EU8A 2DVCA 5CC2A 5CBSA 4XXUA 1B58A 1RYXA 2DWHA 2F97A 2VD3A 5KCJA 2F7AA 4YKIA 3RQTA 1DPPA 4MLVA 3CFZA 3CRBA 1JQFA 5FHMA 3H7MA 4QHQA 1SI0A 3VVEA 5CI5A 1H44A 1JW5A 1QKAA 4IGRA 1M5FA 1H43A 3V89B 1DTZA 3G3KA 4ZEDA 2DSFA 2H4IA 3RTFB 2X26A 4U21A 2V93A 1O63A 2QS4A 2Z8EA 1ZBMA 3C36A 1Y3NA 2F6GA 3FVOA 3CIJA 1MM6A 2UVJA 4QFOA 4TQUQ 2XXQA 1P1QA 3IOUA 1LAFE 3IR1A 3I6VA 5BWJA 3DM0A 4RY1A 2Y7IA 3FXRA 4NMYA 2F78A 5K2YA 4H5FA 2E0SA 2ONSA 3G3GA 5KDTB 4X1DA 2FNCA 3BFTA 5L9MA 3UGWA 4OFOA 1NNKA 4GL8A 4C0RA 1YAEA 3LSFB 1SD3A 1QULA 5L8DA 4YB5A 5H8HA 1Y3PA 4HCYA 3ZKLA 2H9BA 3CFXA 4IO7A 2O68A 1B5HA 3K1PA 2OZZA 3CSGA 4QFPA 4R73A 4IY6A 1US5A 1NH7A 4YB6A 4R6YA 3FVKA 2P1SA 1PDAA 4DZ1A 2I58A 1M5CA 4GLIA 5DT6A 3GXAA 4WEPA 3W9WA 5ISUA 2XX7A 4KCCA 5I57A 1FW0A 1TWYA 2AL4A 3FD3A 3M3KA 3UN6A 1Y3QA 1MXWA 5DEXB 1GV8A 4BDNA 2XXYA 2I49A 1M5DA 4H0WA 1FQBA 3FZVA 4YZZA 2AYSA 1D9VA 1I6QA 3VFJA 3N5LA 3KN8A 2B65A 2XX8A 2GFEA 4ISUA 2DE3A 1SVXB 3Q26A 2I0CA 1B3EA 3KJTA 4ZE9A 5FTIA 2V84A 1Y1MA 3O29A 1A99A 2DS9A 3RLFE 3KSXA 4WEDA 5A5XA 3R7XA 4GWOA 3B6QA 1UQWA 4GXSB 4XKQA 3FIRA 1PB7A 1MQJA 3CI8A 3B7DA 4Z0IA 3TAJA 2B3BA 1QKBA 3FXUA 1MXVA 1BKAA 3CFLA 5H8NB 2AIXA 3BBRA 1D3KA 2PYYA 3TTRA 3OO8A 1BLFA 1B3LA 3LSLA 3QXMA 4OESA 5TPAB 4R75A 5BUUA 1Y4CA 2NOOA 1R6ZA 2NVUB 4O3CA 1IITA 1FTOA 3KOSA 4LQ2A 3Q27A 3RPWA 3EQ1A 2ZMBA 2DP8A 3PUVE 1VE4A 3IL1B 4RYAA 3KOTA 2DXRA 3VLWA 3V83A 2DWAA 5AA4A 1PBQA 4OZ9A 3C32A 1LBCA 3H6WA 4N13A 2XD2A 4YAHX 1MQGA 3N6UA 4H5GA 1OMPA 3PD8A 3QYTA 3RGYA 4DCYA 3CVGA 3SEVA 4BDOA 4H67A 1FQEA 2G29A 3PV0E 4NWCA 1NMUA 1JVYA 2FA7A 3RT8A 4I1DA 2X7QA 1POY1 2RF1A 4QRZA 5JTYB 5F7VA 3CG1A 3TCHA 3SETA 1H76A 4BDRA 2O6AA 1SQYA 3HPIA 4HW8A 4Z7EA 1AL3A 3OD7A 3TTKA 1SYHA 4F29A 2Y7KA 2I4CA 1A55A 1MXZA 1SW1A 3DELB 4POWA 3G7WA 2RC8A 3D4CA 3HN0A 5B70A 1B0LA 3FASA 2IEEA 3K00A 1IIWA 4YKPA 3ILTB 4XKNA 3H06B 4N6PA 4KPTA 1DPEA 1EH3A 2HEUA 1CB6A 1LSTA 4QF9A 5M2VA 4IO5A 1DSNA 4XKPA 4OEVA 3S9MC 3QUJA 4G68B 1WODA 1OLCA 3FJMA 3PPRA 1BP5A 4XTCQ 2D3IA 1MPDA 4U22A 1B1HA 3AXFA 4R72A 2H25A 3UK4A 3A3UA 3WAEA 1ZKBA 4FECA 3TCFA 1I6AA 3QAXA 4NF8A 4GIZA 2HCAA 3FJGA 2D5WA 5FHNA 4ONYA 2XHDA 3LR1A 4F39A 2LAOA 1B46A 2YPNA 2R71A 3Q25A 5EHMA 1VFDA 3C9HA 4PFWA 2GHAA 4ECFA 1PBPA 3S9LC 5K2XA 2UYFA 2V25A 1SI1A 1FQAA 1B40A 3Q28A 2O69A 1JVXA 5AE4A 5LOMA 4NEDA 1MY1A 3T96B 5TP9B 5CBRA 4IB2A 4LA9A 1S9TA 4QFKA 1JETA 1MY0A 4KCDA 2XXTA 3T66A 5I56A 4BDLA 2Q88A 4YKJA 3RUMA 1NKXA 4KYSA 3S2VA 3QK6A 3IJOB 2I3VA 5AA2B 3VLVA 2Q9TA 3PU5A 1DOTA 1B9JA 1I69A 1OIBA 2F6PA 2XXPA 3K1MA 1QUJA 1GTKA 1B7HA 5I2NA 3Q29A 1M5BA 2Q2AA 1FTJA 1PC3A 1XT8A 4BLAA 3HSTA 1F9BA 4ZEFA 5I59B 3SESA 1QUIA 2F36A 1LGBC 3GBAA 1USYH 3TZAA 1WVJA 1YCJA 3IO4A 4ELOA 4AQ4A 3SEYA 3DP8A 3UA8A 4MBPA 2ZNSA 2O51A 3KSJA 4OFLA 2ZYNA 4ELQA 1M5EA 1P1UA 3E13X 2REGA 4G2ZA 3LBSA 4RPOA 5HM4B 3OO7A 4ZZAA 3MVYA 4XKRA 3T9XB 3MC2A 1R9QA 4GQOA 3WAFA 2RCBA 3D4GA 4BDQA 1POTA 3HO7A 1HSEA 3MJNA 2ALUA 2PX1A 2DYXA 4M1VA 2RKMA 3SDFA 1GR2A 4E0WA 4O3AA 1XVYA 2OWTA 3KBRA 3O6IA 2Q89A 3EF7A 3EN3A 3I3VA 1P1WA 1Y1ZA 1B7ZA 3E3KA 1B2HA 1BTJA 4KR5A 3IJXB 4RK9A 3B6WA 1LB9A 2Z23A 4RPNA 1O64A 3T93B 4YKKA 1PB9A 3C31A 2IA4A 3PUYE 1EZ9A 1LCTA 3JV9A 5I58B 4LONB 2UVGA 3O2AA 1LAXA 4RNSA 1P1OA 3GBBA 2ESNA 1SW5A 3KGCA 1FQFA 4M4GA 2A5TB 4YMAA 1NNTA 4F22A 5AA3A 3N94A 1DTGA 1Z7ME 1TFAA 1WDNA 2Y7PA 4NWDA 3I5OA 4DDDA 3KG2A 4NF5A 1Y20A 3OEMA 4IO2A 1XC1A 4F3PA 4GVOA 1Q1KA 4LZ5A 2Y7WA 2HAVA 1HSLA 1SDXA 2F8DA 1SW2A 5CMCA 4OQOA 4I62A 3C34A 2I3WA 4HCWA 1AOVA 1BIYA 4JDFA 5HPQA 1N3XA 3M3LA 1UTHA 3MPLA 1A8FA 3T9VA 2UVIA 2O1MA 4DLDA 4KHZE 4U23A 2KLFA 4R2FA 2RCAA 2XD3A 1XVXA 1EZPA 3RY3A 1EZOA 4N07A 3SEWA 4H8IA 5H8FB 1B3GA 1MQIA 4F3BA 5ITOA 1S7YA 3M8UA 3VVFA 1OQHA 1LFGA 4U2RA 4G68A 1MXXA 4X9TA 3HHGA 2XX9A 4DXBA 3IOTA 2RC9A 4RJZA 4PQJA 3MZ1A 4F2QA 3CR9A 3THIA 5I84A 1B7UA 1MQHA 2PBWA 2HXWA 3LSWA 4OWDA 1ZLQA 4I8CA 4ELPA 3IB1A 1P1NA 3PUWE 3R26A 1LCFA 3O6HA 3MAMA 1JW4A 2H98A 4WXJA 1AMFA 4JSDA 4H1XA 3SKPA 4EXKA 2ANJA 5IKBA 2G93A 1LFHA 5I2KB 4X48A 4YU0A 4ZEKA 3UORA 2HZLA 3O97A 5DYHA 2A5SA 4DXUA 5ICQA 4OTEA 4R6KA 4QSCA 1FTLA 3M3FA 3PPOA 4G8HA 4EF2A 5KCJB 3H03A 4NF6A 3SERA 1QJMA 2OLBA 5EYFA 2E1SA 1MQDA 4Q0CA 1P99A 3UIFA 5HBCA 2GHBA 1B1XA 4AB6A 3FVNA 4EF1A 1UTBA 3DLNA 5I59A 3TQWA 1N76A 2I6EA 5H8QB 1II5A 2VOZA 1FTKA 3TCGA 3H6TA 1A54A 1R1NA 4BDMA 1QUKA 3MVWA 3K0VA 3K02A 3U94A 4KYEA 5AA2D 4ZEIA 3KJ7A 3MWBA 1DMBA 5KZTA 1N7XA 4JXIA 3S9EA 3U93A 1PEBA 2HQ0A 4OETA 1GGGA 3OSQA 3USDA 1ZIUA 1D9YA 4OHNA 3U8QA 3K4UA 4DIGA 4F2OA 1IUDA 3PPPA 4QSDA 1B51A 1VR5A 4KFQA 2RINA 5H8HB 4I9DA 3MP1A 2XXVA 3MPKA 1URGA 1MM7A 1SYIA 5B7DA 3G3FA 4Q5TA 1ZJLA 4FEBA 3A09A 3VE1B 1IXGA 4HTGA 3IO6A 4H8JA 1IQ7A 4OEUA 2DOJA 3VDFA 2R9JA 2QL3A 1FCKA 5FTHA 2PT2A 3H4ZA 5I57B 5DVIA 3CSBA 4YICA 2GH9A 3ZS6A 4LZ8A 2CZLA 2QRYA 5KDTA 4GRKA 1QW0A 2Z22A 2THIA 1B4ZA 2OJTA 1HSJA 2F7CA 2ZYKA 4KQPA 1IXHA 3RT6B 2YJPA 4QSEA 3OXNA 3K6XA 4FE8A 2XXXA 4LVQA 4PP0A 3C33A 4PFYA 4OYVA 4DCXA 4H65A 2FYIA 4Q8RA 5ICTA 1I6BA 4FORA 3TPAA 3MQ9A 4THIA 3KFMA 4MH5A 4KD5A 5L9OA 4L17A 2NWJA 1N0TA 3N6TA 2ONRA 1ELJA 1B05A 5A5XB 4F1UA 4DXCA 1RYOA 5ITPA 1NNFA 3O28A 5L9SA 3B6TA 4P0GA 5DEXA 2V3UA 3TFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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