3HN0A

Crystal structure of an abc transporter (bdi_1369) from parabacteroides distasonis at 1.75 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
DTVIKVSVLRGPSVIAFADWLENPPIIDNKKVQVKVVDSPDLAQALLIKQETDIAVLPMINAANLYNKGIKIKLAGCPIWGTLYLVEKTPLKEPALYVFGNGTTPDILTRYYLGRQRLDYPLNYAFNTAGEITQGILAGKVNRAVLGEPFLSIALRKDSSLRITADLNHLTDNDTLGFAQTAVVYTPTMEKYRIAFEDALRASCQKAVRYPKETIHSLEEHGIFAQGALTPKSIERCKIYYLSAIEAKDAVMGFLRLIEQYEPKAVGGRLPDAGFIPEKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of Nitrate transport protein (YP_001302749.1) from Parabacteroides distasonis ATCC 8503 at 1.75 A resolution
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Parabacteroides distasonis
molecule keywords Nitrate transport protein
total genus 87
structure length 280
sequence length 280
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hn0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hn0A02
4YB5A 1URDA 5EHMA 1VFEA 4NF6B 5CRYA 3S9MC 2AIXA 1DMBA 4R2BA 1P1WA 4GFRA 1MDP1 3RN8A 1SD3A 3K4UA 4UA8A 2PVUA 2DE4A 3V83A 3EN3A 2PT2A 3TFLA 3QSLA 2V84A 1ZMGA 4ZZAA 1D9VA 5F1QA 4IO2A 4AQ4A 3PPRA 3U92A 1OMPA 1EZOA 1ZTYA 2OLBA 2QMXA 3TTNA 1I69A 3LUYA 4OMBA 1GR2A 2QS2A 4EUOA 3T9UA 1YTVA 1PBPA 4LUBA 4YU0A 5H8HA 2G29A 3B6WA 3T96B 3PD9A 4KYSA 3MWBA 3M3KA 1MQJA 3G7WA 4JB7A 2QL3A 1JW5A 2QSXA 1LFGA 5L9MA 2Z8FA 1VFDA 3IB2A 3K02A 4NWDA 5KZTA 3M3FA 1VE4A 4QFOA 5DEXA 3BBRA 1BKAA 3C9HA 3LSLA 1JVXA 5CBSA 2ZYOA 3E13X 2QMWA 3E4RA 3H06B 3THIA 4DE8A 1DOTA 1QULA 2F36A 5I2NA 2Y7KA 1A8EA 2RC9A 5CBRA 4JSDA 4JXIA 5TU0A 2OWSA 1GGGA 5A5XB 2XXQA 3MVYA 1Z7ME 1Q35A 3IR1A 3T9VA 5BUUA 2Y7WA 1DTZA 1MXUA 4F2QA 1B0HA 3RPWA 2DYXA 1Q1KA 1MM7A 3G3IA 3CRBA 2HCAA 3FASA 1Y1ZA 1LBCA 4R74A 4KD5A 1LCTA 3CG1A 3CVGA 3LC8A 2HAUA 3TZAA 4OWDA 4ZS9A 3KN8A 1B2HA 4IB2A 4C1TA 2YPNA 1ZU0A 4U1ZA 4OFOA 1UIUA 2F7AA 1US5A 4NWCA 4DZ1A 2A5TB 2BJJX 1B0LA 4G68A 2Q8JA 4OEUA 4GD5A 2I49A 3I3VA 2F35A 3H7MA 2Z8DA 1S9TA 2XXRA 2H9BA 4KCCA 3TDJA 4GQOA 3VVDA 1QUJA 2O6AA 4JSOA 5HBCA 5K2YA 1AOVA 2RKMA 4WEPA 5AA3A 2ZXTA 1R1NA 5JK4A 4F39A 1T0KA 4ECFA 2O84X 3K00A 2UVGA 1A8FA 1B6HA 4R75A 1B4ZA 4F2OA 3T9XB 3TEPA 3U94A 5K2XA 3PMWA 3FV2A 2Y7IA 1IITA 1XT8A 1LB8A 3QUFA 2HFBA 3VVEA 1MY4A 1LAFE 3PV0E 1JW4A 4Q0CA 4KHZE 2RINA 2ZYMA 2F5XA 3U1OA 3N26A 4QRZA 3ONMA 1URGA 3KOSA 5FHNA 2UVIA 3EHUA 3H6WA 4HCWA 1B58A 4RK2A 3G3FA 3TTLA 2I0CA 4BDQA 2AYSA 3BKIB 1CB6A 3C31A 4NTLA 2Q2AA 4U22A 5DVJA 4FATA 4U4XA 1N84A 5ELVA 3Q26A 3EHSA 2P0SA 4ELOA 5AA2D 5I2KA 4OZ9A 3OOAA 3TYHA 1Y4TA 3RT8A 1MY1A 3KJTA 3S4UA 2H4IA 3VV5A 3W9VA 2UXAA 1H43A 1CE2A 1OLCA 4MLVA 3R7XA 3IOUA 2DSFA 2GFEA 3H3GA 3RUMA 2Z8EA 4ZEBA 1N3WA 4AB6A 4PFYA 2I4BA 2O69A 3G3GA 1LGBC 4ZZEA 3DP4A 3N94A 1SW2A 4NF8B 3CFXA 4HTGA 3V89B 1A99A 4LQ5A 3I5OA 3EQ1A 3OO9A 3IJXB 1P1OA 4DXUA 2ESNA 4NEDA 3JYRA 4E0XA 3ECRA 2CMOA 3BFUA 5CMBA 5B7DA 4DIGA 2I3WA 1FQEA 3O66A 3PUXE 3MP8A 1N76A 3LSXA 4QFLA 3S9NC 3TTMA 3MQ9A 1XVXA 2AL5A 5EHSA 2E0SA 5ISUA 4R6YA 4EF1A 4EF2A 5J1DA 3SEXA 4GXAA 3H03A 4G2ZA 1XOCA 2O51A 5DT6A 2THIA 4YICA 4DLDA 2ZYNA 3TPAA 2YLNA 1MPDA 4GOTA 1FW0A 5CM6A 4RPNA 4R9GA 4I62A 1EH3A 4OEVA 2VD3A 1RYXA 1TT1A 5IKBA 2F7BA 1UTBA 1MH4A 4O3BA 3RTWB 3FZVA 5TPAB 2NWJA 5IAIA 4GF8A 3IAZA 2V3UA 2F7CA 2GH9A 3PPQA 5H8QB 1I6BA 3FV1A 5I84A 1Y3PA 4MF3A 1MS7A 4JWYA 3C4MA 2IA4A 3USDA 1H45A 5H8FA 2QS1A 1HSJA 2HZLA 1M5CA 3H6TA 2A5TA 1AIVA 4U1OA 3UP9A 4BDLA 4G8NA 4KYDA 2RF1A 4HS7A 4LA9A 4M4GA 1PDAA 3N6TA 3MJNA 5CMMA 1ZIUA 4P11A 1SW4A 3U93A 3MP6A 4POXA 1D9YA 2DOJA 1B51A 1MQIA 2DQVA 4XKNA 1JNFA 3SEVA 1O7TA 2XXVA 4R73A 5FTHA 2H98A 4TLLB 5F7VA 4F3GA 1NNKA 4EXLA 1IXIA 4H0WA 3FIRA 3M8UA 1IIWA 2UVJA 1M5BA 1FTMA 2HZKA 3OO6A 4DDDA 4Q5TA 5H8SA 3Q28A 4KQPA 3UK4A 3GBBA 1N7XA 5AA2A 2ONRA 4X1BA 1POY1 4F18A 3E3KA 3B7DA 4H5FA 1A40A 2ONKE 3KBRA 4G4PA 2RCBA 2ABHA 3HN0A 3KGCA 5KDTB 3ZKKA 3K2DA 3KEIA 5I57B 4GLIA 1NL5A 4KFQA 4NF4A 3W9WA 2Q89A 3F11A 4F31B 2Q88A 4PQJA 4PFUA 3PU5A 3IL1B 2PBWA 1B1XA 3MZ1A 5JTYB 2CZLA 2QS4A 1SVXB 5TP9A 2HAVA 2D3IA 4EQBA 3SESA 2ZYKA 1FTKA 3SEYA 5H8NB 4POWA 1TFAA 1SYHA 1XC1A 4K3FA 4G77A 3IX1A 3VFJA 4ZECA 4RNSA 4ELRA 1B32A 4LZ7A 3A3CA 3IO6A 4LQ2A 3FJMA 5ITOA 4F19A 2X26A 4YMAA 1ZBMA 4ELQA 1Y4CA 1NMUA 4GL0A 1URSA 5I56B 2XX7A 3DELB 3QIMA 3SETA 3OEKA 1MH3A 1P1NA 2B65A 3Q27A 4L17A 3KFMA 3TTKA 2DWJA 2XX9A 1OLAA 4YZZA 2QJEA 2QPQA 1O64A 4N6PA 1ZKBA 3T9HB 3FVNA 1B9JA 4BDMA 3PUYE 3MVWA 4DXBA 3O6HA 2GRVA 3DLNA 4Q30B 1XVYA 3TAJA 3FATA 1LLSA 5FTIA 1XHYA 4IO5A 3HHGA 2OCUA 2RC7A 3N5LA 3CFZA 3D4GA 2I3VA 4Z0IA 4GL8A 4ESWA 3TCGA 1MRPA 4OQOA 2OK2A 3RTFB 4E0WA 1FTLA 1P1QA 2E1SA 4JWOA 2OWTA 4EXKA 1GVCA 3HV1A 5BWJA 1AMFA 4P0GA 2Y84A 3KSXA 2XX8A 1M5EA 4QSCA 2HEUA 1IUDA 3KN7A 5DVIA 1MXVA 4H8JA 5H8QA 3C33A 3SEUA 1PB7A 4EDPA 1ATGA 4OERA 5I59A 1FQAA 4LP2B 3L6GA 2DXYA 1WODA 4BDNA 4I9DA 4YKJA 3GBAA 3UGWA 3HO7A 1B46A 3OSQA 3O9PA 1B5IA 1UIVA 2FYIA 3FJGA 1GV8A 2LAOA 1PBQA 4MH5A 2WKYA 1SDXA 2IEEA 4FEBA 3PUVE 1KWHA 3KN3A 5I58B 3O97A 3UA8A 3H6VA 2M8CA 1NFTA 4ZDMA 2W7YA 5AA1A 2B3BA 4PETA 4OETA 1HSEA 4MBPA 3TTRA 4N13A 4BDOA 3AXFA 2KLFA 2VHAA 3IB0A 5L9OA 4LZ5A 1IXHA 4OYVA 1RYOA 3K01A 3MAMA 3UN6A 1N04A 3KOTA 1UQWA 1LBBA 3QAXA 2O1MA 5ITPA 1XS5A 2I58A 3LSWA 3TMGA 1SI0A 1LSTA 3GXAA 3PMXA 4YKIA 4IGTA 1JEVA 1B40A 4NF6A 2DWIA 1S50A 1A55A 3PPOA 3C32A 4DXCA 3S9LC 5I57A 4TQUQ 4KCDA 2DE2A 3U8QA 2XXHA 1B5HA 1MQHA 3WAFA 3PPPA 1B1HA 2PX1A 3OD7A 3QUJA 4PP0A 1ELJA 1EZPA 1MPBA 3SKPA 3PGFA 4YB7A 1B7HA 2XD2A 1FQFA 4H6DA 1MXZA 1B4HA 4HW8A 1QVSA 5H8NA 3K1MA 2DE3A 1SI1A 3K1PA 5ICTA 3JV9A 5HM4B 2UVHA 4YKKA 2RC8A 3H4ZA 1JETA 2B3FA 4FJPA 2NVUB 4JBZA 2ZNTA 5KCJB 5I56A 4UACA 4Z7EA 3VVFA 1BP5A 2XXUA 1N0TA 2XHDA 2H5YA 5H8HB 3RGYA 3S2VA 2DVZA 2V25A 4F3BA 2ALUA 3OELA 1MXYA 4QHQA 4RY1A 3MUQA 4M1VA 3OXNA 4ESXA 1FQBA 1M5DA 3K6VA 3LBSA 4YAHX 1FQCA 1F9BA 5DEXB 3K6WA 3TCHA 1NNFA 2Z22A 1PB9A 1LFIA 2Z23A 5A5XA 3OSRA 4ZEKA 1QUIA 1NKXA 4TLMB 4OENA 3VLUA 1WDNA 1BLFA 3K1NA 2GHAA 5I2NB 3P7IA 4QF9A 4RXLA 2V93A 2PYYA 2R9JA 2ZNUA 3GZGA 4XTCQ 3R6UA 3SERA 3KSJA 3MBPA 3TQLA 3DP6A 3MVZA 4IO6A 3N6UA 4ZEIA 3A3UA 2P2AA 1I6AA 1R6ZA 3G3HA 4I1DA 3PUZE 2UYFA 4X9TA 4FE8A 1JW1A 3HPIA 3OEMA 2OZZA 3RQTA 3CFLA 1SYIA 1A7LA 3JZJA 1B7ZA 5HPQA 1A54A 3HHFA 1OVBA 3C34A 4ZEDA 4YB6A 3SEWA 3T66A 4XKPA 1R9LA 1QW0A 3I6VA 1B3GA 3PPNA 5LOMA 3VLVA 1P1UA 3FJ7A 4XKRA 2O7UA 1TFDA 3TKDA 1MY0A 2VD2A 3U72A 4RK9A 2F6PA 4F1VA 2AL4A 3TODA 4GXSB 1TWYA 3Q25A 3ILTB 1L5TA 4F1UA 3CSGA 3W15C 1VSOA 2VP1A 3TCFA 3OMBA 4IY6A 4PE5B 1EZ9A 3MZBA 4KI0E 3RNNA 3IO4A 1B3FA 4RYAA 2F97A 1R9QA 1DSNA 4JDFA 4G68C 4ZE9A 3O2AA 2P1SA 4H67A 4C1UA 1LCFA 1LAXA 1EU8A 3ZS6A 3SDFA 3L6HA 1QUKA 4FORA 4OFLA 4XKQA 2A5SA 5DVFA 1LAHE 3VE1B 2REJA 1NNTA 4KR5A 2O68A 1QJMA 1MQGA 4U4SA 1MQDA 4FIMA 3T22A 3O28A 4WEDA 2ONSA 4ELPA 3VDFA 2X7PA 2FNCA 3V5AA 4X1DA 5I2KB 4LONB 2DWHA 5FHMA 4NF5B 3FVKA 1QKBA 4I8CA 5KCJA 4NF8A 2NOOA 3M3LA 1N3XA 1O63A 1Y20A 4PFWA 4ZE8A 4QFPA 1AH5A 2O7IA 1YAEA 4DCXA 1DTGA 3Q29A 3LR1A 3PUWE 2XXXA 4RA1A 3RY3A 2XXYA 3RLFE 3B6QA 2NUVA 3B6TA 4H65A 2XD3A 4G8HA 1M5FA 2XXTA 1GTKA 2DVCA 4QSEA 1D4NA 1SBPA 5ICQA 4QFNA 2DWAA 2H25A 4WXJA 5L9SA 1B3LA 4OESA 4OTEA 1VR5A 3LSFB 4R6HA 1H3DA 1JEUA 4F29A 3RT6B 3HCQA 3O6GA 2PMSA 2O1LA 4MLQA 4P0IA 4X48A 5TPAA 2Y7PA 5AA4B 4GIZA 3MW0A 5JEIA 2UYEA 4OFJA 3OO8A 1SW1A 3ODBA 2Q9TA 1FCKA 2D21A 2REGA 4ISUA 3E9XA 1UTBB 1YCJA 4RPOA 1OQGA 2ZMBA 5L8DA 3CG3A 3IK6B 3TQWA 5FHOA 1BTJA 4IGRA 3KJ7A 1MM6A 3PD8A 1IXCA 2DP8A 1FTJA 1UTHB 1MXWA 1IZ1A 1B5JA 3MZ9A 2HXWA 4R9FA 3V8XB 4F3PA 1LAGE 3QK6A 2I0BA 1ZLQA 5H8FB 1YPNA 4QSDA 4IO7A 2X7QA 3HSTA 2XXWA 1WVJA 2FA7A 1BIYA 4IO4A 3G3KA 3QYTA 3ZKLA 1B3EA 4KPTA 2ZNSA 3S9EA 3CI8A 4OHNA 1DPEA 2OBGA 3VXBA 1OQHA 4HCYA 4O3AA 4THIA 3A09A 3TELA 2XXIA 5B70A 1Z7NE 3IORA 1IEJA 5CI5A 1Y3NA 1OIBA 3FVOA 1ANFA 3FUZA 1MY2A 1IXGA 4H5GA 3EPEA 4AB5A 3DM0A 4LATA 3H6UA 3IOTA 4FECA 5KDTA 4R72A 4WKMA 3EHTA 4NE4A 1LB9A 1H44A 5AA2B 2VGQA 5DTBA 4N07A 3FD3A 3VLWA 3K6UA 4EQ7A 5JTYA 5CMKA 3IOVA 2ANJA 2DS9A 1LFHA 3IOWA 4NF4B 2F8DA 4BLAA 4U23A 4R6KA 3C35A 1H76A 1PB8A 4F3SA 4PFTA 3R26A 4NF5A 1QKAA 3UORA 2Y7RA 1SQYA 5TP9B 3OO7A 1FTOA 1Y1MA 1PC3A 4R2FA 4QFKA 2I48A 3GLBA 4F22A 1OVTA 4IO3A 4NMYA 1JQFA 1Y9UA 4ONYA 1B3HA 4FEDA 2Q2CA 2PT1A 1USYE 1B7UA 2F6GA 1MXXA 2G93A 2NXOA 1AL3A 3O6IA 2D5WA 1US4A 1I6QA 3MVXA 3FVGA 2GHBA 4YMBA 4GRKA 4H1XA 1B52A 1J1NA 1MPCA 3KG2A 3ZSFA 2QRYA 2I6EA 5CC2A 2F78A 4OXVA 1NH8A 4MFIA 3FGSA 1RKMA 3EF7A 4C0RA 2I4CA 2F34A 1II5A 3DP8A 4OVJA 2XXPA 3ILUB 3FXUA 2VOZA 5DYHA 3OENA 3BFTA 1SW5A 4FAJA 1P99A 5AA4A 3MPKA 3CR9A 3WAEA 4Q8RA 4ND9A 1USYH 4XIGQ 3O29A 1IQ7A 3CIJA 4JWXA 4RJZA 3IB1A 1S7YA 3UIFA 2R6GE 4LZ8A 2H99A 2HQ0A 4YKPA 2V3TA 1TXFA 1POTA 1JVYA 3FXRA 4H8IA 1FQDA 1DPPA 2DXRA 4O3CA 1UTHA 5I59B 1NH7A 3MPLA 2QS3A 3K6XA 1D3KA 3IJOB 3MC2A 5I58A 1N7WA 3G3JA 2YJPA 3T93B 2V3QA 1Y3QA 1MG1A 5EYFA 1MDQA 2OJTA 2R71A 3PMVA 3FXQA 4KYEA 4G68B 4XXUA 1PEBA 4F1YA 3TUSA 4DCYA 4EQ9A 4U21A 2RCAA 3C36A 3VXCA 3D4CA 5M2VA 1NNPA 4LVQA 4GVOA 4G8MA 1ZJLA 3MP1A 5AE4A 4ZEFA 4U2RA 3QXMA 3K0VA 4TOZA 1B05A 4IY5A 4BDRA 1MY3A 3KZGA 5CMCA 1HSLA 3CSBA 4GWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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