3HPX | Genus

Total Genus 148

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	148
sequence length	407
structure length	407
Chain Sequence	IVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Removal of the C-terminal regulatory domain of alpha-isopropylmalate synthase disrupts functional substrate binding pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-isopropylmalate synthase
molecule tags	Transferase
source organism	Mycobacterium tuberculosis
total genus	148
structure length	407
sequence length	407
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date	2009-06-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00682	HMGL-like	HMGL-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3hpxA01

1DJQA 3PUOA 5DLCA 5FI8A 4Y6GA 1JUEA 3HF3A 2DJXA 1PIIA 1TRDA 1W3TA 4YLWA 3CC1A 2W0UA 5DELA 1LORA 3I6RA 3W1RA 3GXPA 3LI0A 4NZJA 3NM3A 5G1YA 2DZUA 1GVOA 1L6YA 1TJRA 2CLFA 2JK2A 1I2QA 3W2MA 1I45A 4GE8A 3UZ5A 1DL3A 3MP4A 1Z41A 4O4WA 3B0PA 5DXYA 2TYSA 4WD0A 4NZFA 5DCBA 3QSTA 4UFHA 3SGZA 2LLEA 3FIGA 1AK5A 5CPLA 3G1FA 3QQ0A 2VFGA 4O15A 2W6RA 4MIMA 2DJLA 4FNQA 4OV9A 1YPIA 1ZENA 3GK0A 4FIQA 1C29A 1YTEA 3DFOA 1SW0A 5HUOA 3DH7A 4AXKA 4DPPA 3DENA 1W8SA 2E6DA 1UASA 1C9DA 4XTDA 1PVNA 3MJYA 3L67A 3TAKA 2J24A 2ZCGA 2E5CA 3CHVA 3L5MA 3MUXA 3KVKA 4IGHA 1DJNA 1ICQA 3L9CA 3M0ZA 5F1UA 3TJXA 4IMGA 2CZFA 1M7PA 3V75A 1B4KA 2A4AA 2YCEA 3TSMA 1UJPA 4X22A 1ZAHA 4UTJA 1I2RA 3NVTA 3NO5A 3R12A 1TPFA 4X9SA 1G4PA 4PTNA 5F1VA 4ZMGA 3W73A 4RCXA 4UUIA 3KRUA 4JX6A 2W79A 3R89A 1WXJA 3FYPA 4Z1DA 3FS2A 4DEFA 2NX3A 3GAKA 4QITA 1F74A 4ZQNA 3LI1A 4XKYA 2GJNA 3L65A 4LS1A 4CCCA 4QSHA 5D2YA 4UC5A 2TSYA 4E0CA 5LHFA 5I3FA 2BZNA 2H3BA 3BG3A 4O12A 3NQ8A 1FQ0A 1MEIA 1A50A 2X16A 1X8FA 3E12A 5D05A 3TDFA 4A21A 1P1XA 5IBXA 3GXTA 3WK2A 3STFA 1LBMA 4RX0A 4N02A 2Y63A 3A21A 1B3OA 5EKYA 4ADUA 5AN7A 4N9CA 1L6SA 1OYCA 2Z6IA 1XBZA 3KRSA 1X6UA 1PCKA 2FPYA 1WX0A 4Q32A 2C0AA 3S5YA 5CZJA 4HHPA 5I3IA 4DF0A 4MZ8A 3DFQA 1SO6A 5HULA 3GB6A 2ZFAA 4LRSA 3PBVA 4O10A 2ISWA 3PULA 2ZZ2A 5C55A 4GWEA 4TMBA 3TQKA 2YR1A 1OK4A 3LLFA 3N34A 3W1XA 1TMHA 4JN6A 2ALDA 3ABOA 3UD6A 4EF8A 5D33A 1G69A 2CFFA 4ZL1A 3OIXA 1UB3A 3OBKA 4MZYA 4AEOA 2CU0A 8TIMA 1W3IA 1G7UA 3P74A 3CB8A 5EYWA 1AG1O 2ZA2A 3QPZA 4K6AA 1MZHA 5KINA 4D2JA 4FIRA 1LOLA 1RQBA 1LM1A 2YXGA 1AW2A 1W37A 5ABTA 1K8ZA 3LV5A 3PVFA 5K9XA 2VKZG 4UNKA 1H7OA 2P10A 1S3HA 2X1RA 3NQMA 3LM7A 3DI1A 3H54A 2J6XA 3I7QA 4WXZA 4MUZA 1VC4A 2Y85A 3G0SA 3BW2A 4LV4A 5HJLA 2XN1A 1GEQA 4IWWA 2JGQA 1NF7A 4UMCA 1HO4A 1KM6A 4IMCA 3BGJA 4X2RA 1BTMA 2GQ8A 4NJIA 3EWZA 1DVJA 1EP1A 3BPWA 3HG2A 4GUIA 4UFJA 5D2XA 3TC7A 3EEGA 3PC0A 4JTIA 2BLEA 4RXFA 4LTSA 2QDGA 2VFFA 5HUPA 3PUDA 3W2UA 4ZQRA 4JTLA 2B7PA 2Y7GA 4HPXA 4NUWA 3W1LA 5G2WA 5K4XA 4OBTA 3C52A 1FUYA 3E02A 5LNUA 3B8DA 3F4NA 1ML1A 2ZA1A 2QCLA 1TJPA 4CCEA 4NNBA 2D73A 1VHCA 4UR8A 3O1NA 5HWJA 4O8RA 3SFKA 4FXRA 3KAOA 3RNDA 3W84A 3W87A 1XBXA 4HNVA 4JTEA 4LUJA 2NXIA 3S1UA 2G96A 3PAJA 3G1AA 1PE1A 3QZEA 3G3MA 1H63A 2VEMA 1PV8A 1LOQA 3BK0A 3KX6A 3SJ3A 3G1XA 4KWVA 1Y0EA 1AW5A 2Y7EA 4IUOA 2GVLA 2ABAA 1XM3A 2TPSA 2G5WA 4WJEA 2QAPA 1THFD 1W31A 1F2JA 3M47A 4AB4A 4AWSA 1WBJA 3CIWA 4MFEA 1LP6A 3STEA 2NXGA 3LTSA 1EUNA 2E6YA 2NZLA 3BARA 5G2IA 1N55A 4HSOA 3THAA 1SSGA 5H2ZA 2V9DA 3GAYA 3KFTA 1L6WA 3THQA 3M5VA 3R13A 3NDOA 2X1TA 1RVGA 2WKJA 4BI7A 1OX4A 3BV4A 5FF7A 3MWAA 5LKYA 2HSAA 1F73A 3DI0A 4NX0A 3IV3A 3W74A 4CQAA 3S5NA 1VLWA 3IGSA 4RZ4A 3O06A 3M1ZA 3W76A 5F2GA 1TPWA 4OHQA 4JYFA 3I7RA 4BK9A 5LNWA 3O63A 3HGSA 1DKWA 3BLFA 4LVBA 1EEPA 3DFSA 2PE4A 3PY2A 3ZWSA 4FHAA 2ZTJA 1LRQA 1SU5A 4WQ6A 3DHFA 4JY9A 4MPQA 3AO0A 3OVRA 1TV5A 3WJYA 3M6YA 3N3MA 1A5SA 1UUOA 1SZNA 4UMAA 5HWMA 1OFPA 3NQCA 2Z2UA 4N6FA 1QR7A 3FYOA 2Q8LA 4JX5A 3L5LA 3S9YA 1MSSA 3L0GA 3M5ZA 3BLIA 2QUUA 5H91A 2QCHA 3R5EA 3W2NA 4RZ5A 1FCUA 5EY5A 4NNAA 2C1HA 2E77A 1OVDA 2PRMA 2ZZ3A 3HGOA 4K8EA 4MOZA 4WY0B 3G1HA 3LXBA 3W7NA 3SR7A 1H60A 2R14A 4IMEA 1UUMA 3W86A 3SW6A 1CW2A 1WOBA 3W23A 3W7JA 5F2MA 3TROA 2VFEA 4DBEA 4LT9A 5DN1A 3O16A 3N19B 3C2FA 1GVSA 3BW4A 1CX9A 2C13A 2QJIA 2B4GA 3HO8A 3SI9A 2QF7A 3IIXA 2A5HA 3GDMA 3W2JA 1EIXA 4WZHA 3ZFHA 1FWNA 1B57A 1KTNA 1OFDA 1TQXA 3DXIA 3QMTA 3W9ZA 4ZVJA 2J88A 1M6JA 4HN4A 3BVJA 2B7QA 4A2SA 3TK7A 4JYEA 4MLJA 5D04C 1GG1A 4DXVA 3GDKA 3S8HA 1HTIA 3NXFA 3B0VC 1TPDA 4I7UA 4M5PA 5U4NA 3LV6A 1LOSA 5BW6A 4N4QA 2FTPA 3BGGA 2NX9A 4RXGA 4I7VA 4POCA 1XL9A 2XFWA 3C3NA 4O1AA 1GG0A 4XUGA 3HJZA 3W1AA 3LHYA 3W6YA 1B4EA 1VHNA 2Z0IA 2Y6ZA 2E1DA 3WJWA 1KFKA 4FNTA 5U7SA 4JICA 1VLIA 3FFSA 4O1BA 3WJZA 5KITA 3LCFA 4NJJA 1ZNNA 4UFLA 4BI6A 1UCWA 3L0KA 2AQWA 1X1ZA 4QNEA 1LLWA 1QOQA 4MFDA 2GPTA 4MZ1A 1FBAA 3PB2A 3O07A 1YXDA 2V5LA 1KTCA 4OGZA 4UTTC 2DU2A 4NVTA 1G6CA 3LBMA 3UPWA 2B7NA 3RFAA 1W5QA 3PG8A 3MI2A 5I3GA 2QCEA 1SQ7A 3VI2A 3T4CA 1QPRA 1H62A 5HINA 4O0KA 5BMXA 3M5YA 2ZRWA 1E51A 1OJXA 1TTQA 1KFLA 3BLEA 5I3KA 3TU9A 5EPDA 4XBKA 2Z6JA 1FDJA 1BWLA 5CZSA 1ZAIA 4AF0B 2RDUA 3NM1A 1K8YA 4N4PA 3NQEA 2ZZ1A 5LNRA 2C19A 1LTDA 1FDZA 4NU7A 4WOQA 4AH7A 2IQTA 2VFHA 2Z1BA 3KVMA 3N2MA 4UFMA 4RV8A 3A5FA 2RDTA 1VYPX 4JTSA 4U4MA 5K7JA 1IXPA 4FNPA 4LNYA 5BOOA 4NNCA 1M7OA 4I7WA 1DOSA 1GT8A 3W7HA 3W72A 1ADOA 4GXMA 5LZLA 2GVGA 3NQVA 1T96A 3UNDA 3W85A 4NJKA 4JDYA 3W7IA 1ALDA 2YFOA 1NSJA 1P4CA 1W56A 4JR5A 5E93A 2WPBA 4PODA 3PBYA 5KTLA 2P1FA 5KZMA 3AJXA 5EL1A 4LOCA 5LGXA 1JVNA 3B0UX 3DHDA 4A2RA 4HNUA 1XCFA 1OFOA 2C14A 2CLHA 3I68A 1NEYA 1OFAA 3T55A 1K7XA 3VE9A 4IX2A 1XXXA 4O13A 3UY7A 3FLUA 3MW7A 3LHVA 4LWWA 1PL9A 6ALDA 3EXTA 5J5RA 3C56A 3TQVA 3MI6A 4O11A 2V5BA 3QPYA 3TW7A 3HQ1A 3DFPA 3ZWTA 1O4UA 4UTIA 1VH7A 5LNSA 3P5ZA 5A5WA 4H3DA 1TPEA 4K39A 4JD4A 2ZRVA 2CLLA 1G67A 1RR2A 3NNTA 1Q6LA 5T26A 1Q3NA 2E5BA 5TIMA 3NEVA 4HIBA 1FXQA 1QNVA 3EB2A 4UR7A 3NL2A 2QCFA 3R8RA 4DF1A 4YCPA 4BF9A 4R34A 1KFBA 3B04A 3GDTA 2ZYFA 1ME8A 2JGYA 4QJ1A 1HG3A 3W1MA 3T7VA 2HTMA 1BKSA 5C6MA 1TTPA 1KLYA 5FESA 3T78A 3EWYA 2ATMA 1G4EA 1KV8A 1P5BA 1GTHA 4N9BA 3C8FA 3RK8A 4O1DA 3OVPA 3RLUA 3PBUA 1QAPA 2R8WA 4IXHA 4ZQMA 5AYYA 4O28A 5KZDA 1TREA 4JS3A 5AHFA 3HGRA 3KRZA 1B9BA 4K36A 2F7FA 5D2TA 2GQAA 3Q37A 3ANYA 1RQHA 1TPH1 1VCFA 3QW3A 4QM1A 4GC4A 4RKAA 4OU1A 3S42A 1WYIA 1OYAA 3LRLA 3DKJA 3M41A 4ZQPA 1VR6A 3GNNA 3W7OA 4LV9A 5FF2A 3LHWA 1H51A 3FKRA 3KVJA 4Z0SA 5C5YA 5D38A 1XFBA 2YDAA 2NXHA 3U8GA 4K37A 3R2GA 1U5JA 1VZWA 3B03A 3RU6A 5FF3A 2YW4A 1P0NA 2QUTA 2VC6A 2ZRUA 4IPJA 3NQDA 4WY0A 2BSLA 2QJHA 1TPB1 3UZJA 1FXPA 4ML9A 4FNUA 3IVTA 3G0UA 2Q3RA 4OWGA 1TYGA 1FWWA 3W7CA 4KWWA 3L68A 4XQ6A 1OX5A 2JBMA 3G1SA 3I65A 1Q6RA 4JEQA 2KZHA 4RR4A 3U6WA 4ICNA 3TFXA 5I3HA 3G22A 5CSSA 3STGA 1M5WA 1FY6A 3TMLA 3QSRA 1N7KA 1AL7A 3DBPA 4OV4A 5AHEA 2A6LA 4NXSA 2A7RA 4Q33A 3HPSA 3OEXA 4LU0A 3PWAA 4GUFA 3W7KA 4IPIA 3N2XA 2YYUA 1SFLA 5CSRA 3PS7A 2A7NA 1XC4A 4LW7A 1G4TA 2H8XA 3MYOA 1Q6OA 1BWKA 5I3JA 1WDWA 3UWVA 3LERA 2B7OA 1FWSA 1A5AA 2PCQA 4NQ1A 1SO3A 1LZOA 3HB9A 3GKAA 5E1QA 2WSQA 3WJXA 1VYRA 6TIMA 3UQNA 1NFBA 2CZEA 3QMRA 3W71A 3INPA 3PSWA 2YGYA 1LYXA 2RDWA 4L4MA 1SR9A 5CG7A 5AC7A 1W54A 1YYAA 3LCHA 4FB7A 2OZ0A 5BRBA 1EWDA 4DPQA 3VKJA 4IX0A 3W1QA 4ADSA 3O05A 4OE7A 2OJPA 5AC6A 2BX7A 1XDMA 4LC6A 2DZXA 3GIYA 1QPNA 5EBUA 5AHLA 1R47A 3W83A 1GVFA 1JUBA 1YDVA 1SZGA 1YXYA 3QFEA 4FO4A 4FNRA 4JTUA 4IJBA 3H55A 3GX9A 1SPQA 3FEMA 5KMYA 1DHPA 3DFNA 3UPBA 2WJZA 2R91A 2ZRYA 5AYZA 2EPHA 4ALDA 4UTTA 4R7JA 3ABRA 2NV1A 3EKLA 4DF2A 2FIQA 3GDRA 3NAVA 4UTHA 3NG3A 4WY0F 3F4WA 4JIQA 3W7DA 3IVUA 3QQ1A 1QCWA 2E6FA 3GXNA 1MXSA 3QM3A 3CWOX 3E0IA 2A1YA 3GLCA 1GYNA 1OHLA 1ZALA 4M7TA 4MLRA 3O6CA 3W88A 3M5XA 3TCEA 4MJMA 5K3VA 4AHPA 5SWUA 3QMSA 3W7EA 4AF0A 3ATYA 4JTHA 4KFPA 1TPVA 1LBLA 3O15A 2BTMA 2YYTA 3P5YA 3WFAA 1IIHA 3PUEA 4TMCA 4N9EA 5LGZA 3HGJA 1ZFJA 4MYAA 5FF0A 1OF6A 2CLEA 4JY8A 1JULA 3MO7A 4TIMA 2FPVA 4O18A 5CPNA 2V2CA 4Z08A 1HO1A 2GOUA 3S1WA 4Y9AA 1KM3A 1YDNA 3MBDA 3U2OA 1VRDA 4IMDA 2E5DA 3NQGA 2WNQA 4JTGA 3QW4B 4B5NA 4Q4KA 4FEZA 3BG5A 1K8XA 4E2BA 1O95A 1I8JA 1SSDA 1N8FA 1ZY9A 3A23A 3W2KA 3JRKA 3IIPA 3W1TA 4O1CA 4JNMA 3G3DA 3W3OA 1OFEA 3HG5A 4CLMA 4PFMA 4LRTA 3WK1A 4BR1A 5FEWA 2J9XA 4N6EA 5DXXA 3W1NA 1AL8A 4O53A 1SW7A 3QJAA 4WXYA 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2JKEA 3S5ZA 5HQEA 3NQ2A 3OG3A 3SSJA 1ME7A 3SECA 3W22A 4LVAA 4TU1A 1EP2A 5D30A 5C2XA 1T99A 2Q8ZA 3P8JA 1R2TA 3UWYA 1RV8A 3GDLA 4XWUA 3C2OA 1TPUA 2TMDA 1JQVA 2B0MA 2I9EA 2QAFA 2C15A 3HG4A 1RD5A 1GTEA 4CNNA 3TIMA 3C2EA 1OFQA 3RMJA 4JDBA 3P67A 1GOXA 1H7RA 1IXNA 3NOEA 3KVLA 3NQFA 4KKXA 4DQWA 1FWRA 2A85A 5G4WA 4YWIA 4UIOA 5F4XA 1OF8A 4ONVA 4KFOA 2EHHA 4KFNA 2CLOA 4EIVA 2V30A 2CWNA 3LCWA 3T40A 3LCXA 1VCVA 3CQ0A 1TRIA 2P0OA 3WK0A 1XUUA 3C2RA 4BI5A 5D02A 2DZPA 4O4VA 4P61A 1HUVA 4QNWA 3SY5A 3KHJA 4NXKA 3LTPA 5FEXA 4WX2A 4AHOA 2QCMA 3TXZA 4JYDA 1PHWA 4PL1A 2ATSA 4UXDA 4UTLA 2Y62A 3G24A 4DBDA 1FWTA 3LB0A 2VFIA 4J9JA 4K7YA 4UNLA 4Y90A 3P81A 3GZ3A 1U83A 2QKFA 1JRBA 3NZRA 1EX5A 3NPVA 4LUIA 1SO5A 1OYBA 3P61A 1EPXA 3C6CA 3WJSA 3P8IA 1PCWA 5D2WA 2TRSA 3NL6A 2RFGA 1JQXA 3CLMA 4EOUA 5DY2A 3S6DA 2ZDRA 2C6QA 3VCRA 4UTMA 3DZ1A 4YXGA 4PA8A 4K8HA 5DY3A 5KSWA 2NWSA 4CQ8A 3IVSA 1O60A 1H5YA 1W5NA 1KM4A 2FQIA 4W9TA 2QCDB 4S2BA 4YMZA 1XDLA 3EXRA 3Q2DA 1H7WA 3HOJA 1J4EA 3TSBA 3NQAA 3W7MA 1KM2A 1MEWA 2VEPA 1ZCOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3HPXA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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