3HQ1A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis leua complexed with citrate and mn2+
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
626
structure length
573
Chain Sequence
TIVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAVIKGGVAYIMKTDHGLSLPRRLQIEFSQVIQKIEVSPKEMWDAFAEEYLAPVRPLERIRQHVDAADDDGGTTSITATVKINGVETEISGSGNGPLAAFVHALADVGFDVAVLDYYEHAMSAGDDAQAAAYVEASVTISKTVWGVGIAPSITTASLRAVVSAVNRAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Probing the active site of M. tuberculosis LeuA
rcsb
molecule keywords 2-isopropylmalate synthase
total genus 195
structure length 573
sequence length 626
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date 2009-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF08502 LeuA_dimer LeuA allosteric (dimerisation) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3hq1A01
3.30.160.270 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Double Stranded RNA Binding Domain Double Stranded RNA Binding Domain 3hq1A02
2QCGA 1I2OA 1RV8A 3IGUA 4IX0A 1P1XA 3HF3A 2ZRXA 4UTIA 3TNOA 2WSYA 5TIMA 4E0CA 1H51A 3NEVA 2YCEA 3PSWA 1A5CA 4ZQCA 4O53A 5HWJA 1DQWA 1FY6A 1SZFA 1VRDA 4OE7A 3LCHA 3G0UA 1VGAA 4NJGA 4K37A 3G3DA 2ZYFA 3T40A 2A7PA 4GRSA 2ZDRA 4M5PA 2JGQA 5CZ0A 3CU2A 4TR9A 1DV7A 1TPDA 2FB3A 4K6AA 3Q2DA 2FB2A 4L4LA 5CPNA 3EKZA 4ORMA 2J6XA 5LNRA 3P67A 4Z1AA 1ALDA 3LGEA 4EVZA 3KFTA 2RDWA 3QSTA 1F74A 3EWBX 1P5BA 5AYZA 2GQAA 1RQEA 1DORA 3QZEA 5BMWA 5E93A 1GVOA 1H7XA 2V30A 1HL2A 2B0MA 3MBDA 2FPVA 4BI7A 4I7UA 3MP4A 1TPC1 1KM4A 1H1ZA 1H50A 3HG2A 3O05A 4OWGA 2YX0A 3OIXA 3H55A 1Q6QA 2R8WA 3W2UA 4PH6A 4Z0JA 1XFBA 3W74A 3W76A 2P10A 2KZHA 1EUNA 4XKYA 3BG3A 1VYPX 2CLFA 4IXXA 3SI9A 4I9AA 5G4EA 1F6KA 2J9YA 1GVFA 3FFSA 1VCGA 1F6PA 4KWWA 1YXYA 1JUBA 2OJPA 1SPQA 4N02A 5G2HA 1NEYA 3M9YA 5J5DA 1NFBA 3DKLA 3C2FA 3S5NA 2X2GA 3CQ0A 3EEGA 3L68A 5EBUA 3W72A 1EUAA 1CW2A 3CLMA 3LLFA 5IBXA 1T96A 2WSQA 1H61A 2PC4A 1GTEA 3W7MA 2Y89A 4BI5A 1SW7A 4BI6A 1JUEA 1QOQA 3PC0A 4A29A 1W37A 2V2HA 1PCWA 4K36A 4E2DA 2ABBA 4GUIA 1SZNA 3NL5A 2J27A 2BWGA 2QCHA 4IX2A 3A5FA 4JTEA 4NUWA 3ZWSA 1SFLA 2Y63A 3GDMA 4OBTA 1W3IA 1TV5A 3P8JA 2HSAA 3GX9A 1K8ZA 2TYSA 5C6MA 1DBTA 2VKZG 3S6DA 3W7IA 1KM0A 3TX9A 3P84A 5DXXA 5LHFA 1OFPA 4NJIA 3QC3A 2G5WA 1WXJA 2R14A 2C0AA 4GWEA 3R8RA 1LRQA 4LV4A 2Z2UA 3IV3A 2RH9A 1JRBA 1HTIA 5BOOA 4O10A 5CKSA 1THFD 3TAOA 3W7JA 5K9DA 3PBWA 5K4XA 3LCWA 5E1QA 1FDZA 4LVGA 4UTMA 3T7VA 1P0NA 3ZFHA 2DU2A 1JUKA 1EB3A 3UWYA 5LKYA 4FNQA 1B9BA 2QDHA 3LTSA 4JTIA 1K02A 1Q6RA 1OF8A 1X1OA 4M19A 5G5IA 5F1VA 3NXFA 2C14A 3TXVA 4N9EA 3UPBA 3W1UA 1H62A 4A22A 1OABA 3A23A 1UB3A 1NAL1 3MI6A 1JULA 1SSDA 2VFHA 3MYOA 5F4WA 4LVAA 4IMEA 4IGHA 5HULA 2DJLA 4NX0A 5HR6A 1RPXA 4R53A 3G1HA 2E5BA 3B06A 3MHFA 4MZ1A 5FEZA 1QNVA 3KVLA 3LXCA 1OJXA 2P0OA 1BWKA 3GXTA 1L6YA 1TREA 3B04A 1EP2A 2V2DA 5BNKA 1PHWA 3B05A 3S1UA 3P82A 5F2IA 4AAJA 3TV8A 1UUMA 1FXQA 5D2YA 3TUUA 4UTTC 4JTJA 4JY8A 4NXSA 3M1ZA 1YDVA 4YCOA 3W7LA 2A7NA 3OEXA 3P80A 1XL9A 2QEZA 3WJWA 2OCZA 4YXGA 1DQXA 4U28A 3TC6A 2NV2A 2ZTJA 3GAYA 3BW3A 2CLKA 2YPIA 4JTLA 1PIIA 4EWND 2DZXA 2D73A 1FCUA 1W1ZA 3CWNA 3SSJA 3USBA 4N9CA 3CM4A 2GJLA 4XQ6A 2VFGA 2DZWA 2NX9A 2H8XA 4K38A 3PWAA 1TPWA 3MYPA 1QCWA 3HOJA 1NVMA 4OV4A 3W7OA 3SECA 3LHWA 4ZQPA 5D2XA 1T8XA 4ML9A 1F73A 4RK8A 4UFJA 3TSDA 5D2WA 1O4UA 1KBIA 1TIMA 4FNUA 3S5YA 3NM1A 2ZZ7A 2QCFA 1C29A 5KITA 5FEWA 1ZENA 2BZNA 3TCEA 3LI0A 3CTLA 3G8RA 3L5MA 4U4MA 1TYGA 3LV5A 1GYNA 3C0JA 3NQGA 3RU6A 4IOTA 1WYIA 3RNDA 2ZA3A 4NJJA 1C9DA 3W2JA 1TTPA 4X22A 3MHGA 1GOXA 5HWMA 1J4EA 1JCLA 3ELFA 2XN1A 1ZFJA 3W2NA 2CZEA 3HG4A 2V5LA 2EKCA 4N9BA 1Z42A 2YSWA 4MKNA 2Y7DA 4ZZ9A 3NQDA 3EB2A 3A22A 3ABSA 4IJBA 4TMBA 1R2TA 1IXNA 5E0KA 1J2WA 4NQ1A 4B5NA 5I3JA 1J5TA 3M44A 2VC6A 3W1LA 3EWUA 3O1NA 4QM1A 3HGOA 3D0CA 3A9IA 5F2LA 1JVNA 1UJPA 2WSRA 4H3DA 5CPOA 2ABAA 3C2EA 5I3FA 3UYCA 3FIGA 1VCFA 3B0VC 2R94A 1A53A 1OX5A 3NQEA 3E96A 3TKFA 1XM3A 1LLWA 3LTYA 4D2JA 5EPDA 4LU0A 4GE8A 4MJZA 3W1NA 3W7CA 1OFQA 4A2SA 4RLIA 5EY5A 4JYDA 3G18A 4MZ8A 4LVDA 1PV8A 3F03K 4LC8A 3NQMA 2ZFAA 1IXQA 3WJSA 3G8EA 2YDAA 3A5VA 1F5ZA 3GXPA 1K7XA 2QAPA 3G3MA 1UBSA 2Y88A 4AHPA 4AXKA 1KFJA 4EOUA 1X1ZA 1WOBA 4A3UA 3W75A 1TTIA 1NSJA 4UTTA 5I3GA 3FJLA 4PTNA 1GVRA 3GKFA 2IQTA 3DFSA 4ZL1A 3QM3A 5CSSA 4IXHA 3C6CA 3KXQA 2VOMA 2OT1A 3TJXA 5LNSA 1TV8A 2V5BA 3L0KA 1F7BA 4KFOA 3INPA 3KHJA 4WY0F 4FX7A 3P62A 1ZAIA 3I65A 1G7VA 2QR6A 3CHVA 1A50A 3QH2A 3W1MA 3DI0A 3TH6A 4JX6A 3FOKA 4Z08A 4WY0A 4H4IA 4TIMA 4NVTA 3M7WA 1AMKA 1SU5A 2CLOA 3C2VA 1MZHA 3FJ6A 4JN6A 1I8JA 1FWRA 3UNDA 3W83A 2HS8A 2J24A 3W7KA 1DJQA 3DENA 3E12A 1KFKA 4N6FA 3UZ5A 4WQ6A 4HIBA 2NLIA 4XTIA 5FI8A 3VCRA 4X2RA 4FF7A 2XN2A 1TJPA 4R33A 1PL9A 3P8IA 2CZDA 2AQWA 3IVTA 3L67A 2PRLA 3PBVA 5K9CA 5F2MA 2NXIA 1Z48A 1F05A 5AYXA 3O06A 1D3GA 2QUTA 1KTNA 1QO2A 4CCDA 4HSOA 1OFEA 1LRNA 3HB9A 4O1CA 1R2SA 3QRHA 5CPMA 3DZ1A 3EWWA 5C5YA 5AHIA 1W0MA 3DBPA 3TROA 3PUOA 4N2YA 3P61A 1FDJA 1BKSA 3L0GA 4E2BA 1Q3NA 1SR9A 2A6NA 4AVFA 1B57A 2GQ8A 3BG9A 1YLVA 3HPZA 3W7QA 3EXSA 4GFSA 4Q4KA 4E38A 3F4WA 2NUYA 3I6RA 3DFPA 5LGXA 1I4NA 3S1VA 4RR4A 1KA9F 5DCBA 2AAMA 3FKRA 4MYAA 4LS0A 3LX9A 2RKXA 2CLLA 2GUUA 3WK3A 1VPXA 4WX2A 4UUIA 1LM1A 5AOUA 3U8GA 4CLMA 3G1VA 1EIXA 2WNZA 3GKAA 4Z1CA 4O4VA 4FNSA 1YTDA 1OVDA 5AHLA 5SWUA 1SZEA 2E1DA 3LCGA 2QDGA 2NWRA 4RZ6A 3W1AA 3IRDA 2CFFA 4HPXA 2QKFA 5IM51 4WD0A 2H6RA 3DHFA 5J5RA 2FJKA 5FESA 4NNCA 3GIYA 1VC4A 4N9DA 4O13A 4RZ4A 4XUGA 1K8YA 3O6DA 3NQCA 2CLEA 2W79A 2BXVA 4O54A 1EA0A 4C1KA 3RLUA 3BLIA 2Z6JA 2Y62A 3SFKA 4CQ9A 4Z1DA 3W7GA 5GVJA 3WJZA 1FUYA 3MMTA 1B4KA 1B3OA 1ZAHA 4RJEA 4CCCA 2C13A 1RQBA 4ONVA 4UFLA 4DELA 2NXHA 3EX2A 3M5VA 3KRUA 4IWWA 3GK0A 4PA8A 3W9ZA 1WDWA 2WKJA 3KAOA 3PBYA 3WJYA 3W22A 1XI3A 1TPFA 5HNRA 1W54A 2B4GA 4JTFA 4JTTA 2A0NA 2BTMA 2FTPA 2HS6A 5DN1A 2BX7A 3PVFA 3WK1A 4WXYA 5CSRA 3PB0A 4C1LA 5AFDA 3TU9A 3NVTA 2W6RA 4JYFA 1EPXA 2B7QA 3M0ZA 4S2CA 1JJKA 2Q8ZA 4N4PA 1OYBA 2CW6A 1GG1A 1OX6A 1O95A 1OK4A 1Z41A 4FB7A 2UV8G 3C3NA 4GXMA 3TE9A 1QDSA 4DPPA 1UASA 4NNBA 4O11A 4Y90A 4LW7A 1TTQA 4O1BA 1OFRA 2TPSA 3M43A 3S1WA 3OBKA 5FF3A 3SW6A 4MZYA 4DEFA 4MOZA 4QITA 3OG3A 3MWAA 2VXNA 3MP3A 4WOZA 1VHNA 2LLEA 1YADA 1JQXA 2GQ9A 4Z1BA 3PB2A 4FX6M 1R2RA 3IGSA 3ANYA 3S5ZA 4ICNA 4QISA 5AC8A 1LOQA 4K39A 4UFKA 2I9EA 5ABTA 1IXPA 1JQVA 1SFJA 2GVLA 1S5WA 2QCLA 3PG8A 1S5TA 4AWUA 5MHBA 4JYEA 4QAIA 3DI1A 3TQ0A 4R34A 2CWNA 3LCXA 3RLVA 1GT8A 2A2IA 3STEA 3E9AA 1Q45A 3P5ZA 2V2CA 1GZGA 1LDCA 3LI1A 1O5XA 5DCEA 1W56A 2AGKA 4O17A 1KW1A 4JTUA 1GVQA 3DXIA 2YZRA 3FYPA 4WJEA 4QJ1A 3R5EA 2NZLA 1P4CA 3CC1A 3P60A 2PURA 4UR8A 4ZQOA 2VFDA 3EXTA 1GVSA 3I7SA 2E6FA 1I2RA 4JD4A 4AHOA 1QPQA 5HINA 3MJYA 1HG3A 3TAKA 3LHUA 3RF9A 4LVBA 1LROA 3M5XA 3GVGA 3W87A 4DF0A 5FF0A 3HBLA 5EKYA 3QYQA 1LCOA 4HNUA 2J9ZA 2C3ZA 2FLIA 3NAVA 4KWVA 3JS3A 4O12A 1VYRA 4MIMA 5FF4A 2DJXA 3EWXA 4FX8A 4NJHA 1LYXA 4UTJA 4X9SA 1GEQA 1VCVA 3P7YA 2FIQA 2RFGA 1W5OA 4AWSA 3UD6A 3LV6A 1GPWA 2ZRWA 4LRSA 3EXRA 3TK7A 2FDSA 3B0PA 2QUVA 3NQVA 4JTKA 2ZRUA 3CWOX 1E51A 3P5YA 1OYCA 2ATSA 5T26A 4JEQA 5HUOA 3RMJA 4O14A 3MUXA 5CG7A 1G6CA 1RZMA 3STGA 3S9YA 4O19A 4IMFA 1FWTA 1OK6A 3HMJG 1ZALA 3PULA 3HQ1A 5K7JA 3HGJA 3QW3A 4AH7A 4RXFA 3W6YA 4FNPA 2F84A 3F4NA 2TMDA 4Y6GA 2VENA 3FKKA 2C16A 4OQVA 1CX9A 1OHLA 3B03A 1MO0A 1H1YA 1TRIA 5FF7A 3O63A 5HQEA 1KFLA 5D30A 5AC6A 2JGYA 3E0IA 1DJNA 2A6LA 2C18A 2ZZ4A 4JNMA 4LUJA 5CZSA 1K7EA 1RQHA 1ZCOA 5KTLA 5AHNA 3I68A 1XUUA 4YLWA 3LRMA 1VS1A 1JCXA 1W5QA 1OFDA 1QOPA 3L65A 4JTHA 4HKPA 4JIPA 4TO8A 2WV8A 3TQVA 1SO5A 5U7SA 3G0SA 3LLDA 4OHQA 3GNDA 4XBKA 3TSMA 2PCQA 1H7WA 3CPRA 4FNRA 4L4MA 3OVRA 3L0NA 2I14A 4QIUA 1QMLA 3IIPA 4IPJA 3NPXA 3R2GA 3E02A 3LHYA 1PVNA 5AHMA 4M7SA 4UFHA 2QCCA 3LXBA 3GDRA 4IUOA 1DVJA 4XTDA 5D32A 4JIQA 2X16A 1EX5A 3DHDA 4MVAA 1NF7A 3JRKA 1OYAA 3SGUA 6TIMA 2YGYA 2Z1BA 4JTGA 3CB8A 1JCMP 1FQ0A 4ORIA 3LB0A 1RR2A 3VNDA 4DPQA 3GXNA 1YDOA 3PM6A 3GDTA 1TMHA 1PCKA 3G22A 5K3VA 2Y85A 4O0KA 4O8RA 1OFAA 1KM3A 4NZJA 3NA8A 1WX0A 1M7PA 2DZUA 1QPRA 2ZRVA 3EWZA 4RX0A 5DLCA 3W1RA 5HWNA 5DELA 1H60A 3UWWA 4UTWC 1VR6A 3EX3A 2H3DA 2E09A 4CNNA 2JKPA 1SUXA 1W31A 4RV8A 3LRKA 3DFQA 2J9XA 3HG3A 4H6KA 3NQ2A 4K7YA 1H7OA 1EWDA 1KBJA 5LNUA 2VFEA 1EWEA 1M6JA 2E6YA 2FQIA 5C54A 2WQPA 3UWQA 4Q33A 4O1DA 5U4NA 2YYTA 1L6WA 1I2QA 2W0UA 1F76A 1VZWA 3PSVA 1H7PA 3O6YX 1HFBA 3HIJA 3UXAA 4DO5A 2NWSA 3LCIA 3ABRA 3R12A 4O50A 4MFEA 1VH7A 4QQ3A 3MHUA 1ZJIA 1KFCA 3U6WA 3QJAA 1IXOA 3LHVA 3QEZA 3MO7A 4GUJA 3FLUA 4CNOA 4M6VA 3ZS4A 2B7PA 2A21A 3JR2A 1PE1A 3MBFA 3L9CA 1JR1A 1XDMA 3G0XA 3W23A 2EF9A 3N73A 1JCJA 2ZTKA 1KTCA 2YFNA 4MY9A 1FCVA 2DZPA 1PHQA 2NX3A 3L5LA 3BGGA 1K8XA 3BVJA 1LP6A 4CQ8A 3VE9A 2ZZ3A 4UCGA 1SO3A 1O5KA 1VLWA 2QCNA 3Q58A 2BLEA 4KKXA 1N8FA 4Y8FA 3DAQA 3QMSA 4UTLA 3THQA 2B7NA 1UCWA 3NL3A 1NF0A 1H7NA 2YR1A 1XBZA 5DCDA 1Q6LA 2OZ0A 3PUEA 4OGZA 4MUZA 3LCFA 3BARA 3GLCA 1YYAA 4LNYA 2CU0A 4NXKA 1ICPA 2BSLA 1MEIA 4LT9A 3W84A 3UWZA 4ZMGA 1DL3A 3THAA 3NPWA 3S8HA 3KVKA 4S1FA 1IIHA 1A5BA 4MY1A 2V8ZA 2PRMA 1GQNA 4GBUA 3C61A 1QAPA 4OT7A 1PS9A 2QCMA 2ZQ0A 5DXYA 2FFCA 4QNEA 1IF2A 2CZ5A 1OFBA 4XBSA 1OF6A 3O07A 3N2XA 3HJZA 3QMRA 1F2JA 1R46A 2YW3A 1AG1O 3NR0A 3WJXA 1V5XA 4ADUA 3O16A 2I1OA 3SGZA 1R47A 1FWSA 2WOQA 4N6EA 1HO1A 3O6CA 2FPYA 2P1FA 3M5ZA 2JK2A 3GR7A 4QSHA 3RK8A 1BEUA 4I7WA 5K2ZA 3QQ1A 4HNTA 1FWWA 3BW2A 3YPIA 3K30A 4HT3A 3EX6A 4IPIA 3F1QA 3IIXA 3B8DA 3L5AA 3C2OA 2Q3RA 1Y0EA 3W70A 3EKLA 2E5DA 5LZLA 4UR7A 4O52A 2HTMA 1LZOA 1AL8A 1LBFA 1S5VA 5K9XA 3U2OA 3W86A 3BLFA 4TMCA 1ZHAA 5KZEA 1WA3A 5DY3A 4MPQA 4LY8A 1L2UA 4I7VA 4CCEA 3NQAA 2DZSA 2TSYA 2X1TA 1QWGA 1LBMA 1SZGA 4XZ9A 3CEPA 2B7OA 1GG0A 1WBJA 4MFDA 2CLHA 4R7JA 3STFA 5IBXC 2ZBTA 4FNTA 3G1YA 1KM1A 2E6DA 1DHPA 1TCDA 7TIMA 3I7QA 1O94A 2PRHA 3QQ0A 3Q37A 4O18A 5AC7A 1MXSA 1QO5A 2ZRYA 3PUDA 1R30A 3BV4A 3CIWA 3W85A 2G97A 4A2RA 3M41A 1BTMA 3W1PA 4JX4A 2OMAA 5C2XA 3FS2A 5EYWA 1TPVA 5L6UA 1AK5A 3MI3A 2G95A 5HUPA 1TPEA 1P0KA 2Y7FA 3LCLA 3MP5A 3NL2A 1M7OA 1WBHA 4JXCA 5G2WA 4DO6A 3S42A 3NG3A 3LHTA 4DXVA 4POCA 4OV9A 1U83A 3KRSA 1QFEA 2H8ZA 4TX9A 5KZDA 1G4TA 1C8VA 3QPZA 3VI2A 4LC6A 3DFTA 1QPOA 5FF2A 2WJZA 3NQ7A 1DKWA 5TQLA 2A1YA 2NV1A 4JICA 2QJGA 1SW3A 1M5WA 1W5PA 3UY8A 4IMDA 3T4CA 4ZQRA 2HMCA 4O28A 2X1UA 1LTDA 4HSNA 2DP3A 1YPIA 2QCDB 3O15A 2CZFA 5AHFA 3HG5A 4LS2A 3TMLA 4HHPA 3SZ8A 2A7RA 1W5MA 5G4WA 4UC5A 1LLZA 5HMSA 4JDYA 1N7KA 3W1TA 1KV8A 3P74A 5HJLA 4O0ZA 4ZQMA 4ZVJA 1V7YA 3B4UA 1OX4B 4AHQA 1SSGA 4WUIA 3C56A 4LOCA 4WZHA 2Z0IA 3G1DA 2EAWA 2O7SA 1TTJA 3IIZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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