3HVXA

Escherichia coli thiol peroxidase (tpx) resolving cysteine to serine mutant (c95s) with an intermolecular disulfide bond
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLATEIDNTVVLSISADLPFAQSRFSGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAVLKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli k-12
publication title Structural changes common to catalysis in the Tpx peroxiredoxin subfamily.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol peroxidase
total genus 52
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hvxA00
4KSOA 3HVSA 1ZGNA 4G2EA 4L5OA 1X5DA 4EXJA 3HVVA 1B8XA 3TJBA 1JZRA 3LEFA 2NDOA 1R26A 1K0BA 3JCML 4LL4B 3NIVA 1EOHA 1Y25A 2VCWA 4PURA 1XVQA 5DQYA 3TOUA 1X0RA 2TRXA 2AUVA 3HD5A 2OACA 3FY7A 5D9TA 2OJLA 1WPIA 5FHIA 2GTUA 2MMZA 1TI1A 4PNGA 4FO5A 5DJMA 4ML6A 3LXZA 3IRAA 4MZWA 2V6KA 2FWGA 4EUYA 4DVCA 3UOMA 2H01A 2VLVA 4N30A 4IN0A 3TB2A 2YWNA 1NHOA 2OBKA 3CXGA 2HYXA 4GSNA 4IS0A 4BVXA 3GA4A 2GGTA 1X9WB 2R2JA 1SK0A 1AXDA 3GX8A 3ZL5A 1UVZA 2X99A 6GSWA 1EGRA 5G2ZA 4N11A 2VM2A 1M99A 5HR1A 2OE1A 1THXA 1GSSA 3GL3A 3HXSA 2FHEA 3ZLPA 6GSXA 2E7PA 1A2JA 4TW5A 3GKNA 1BAYA 1OC8A 4I2TA 4AF2A 2ZNMA 1GLPA 2HZFA 4MF6A 4HJ2A 3DIEA 1G0TA 3GTUB 3O76A 3KH9A 1O7UA 1IYHA 2ES7A 3LORA 2DLXA 5CP1A 2M80A 3S9FA 4WF4A 3UVTA 2VCZA 3UL3A 5D9XA 5JCGA 1GTAA 4MF7A 1BX9A 3ZYWA 2PU9C 4IGJA 3H4KA 2H8LA 1K0OA 2MBSA 1GSYA 3W8SA 3HJOA 5DQSA 4I5QA 3KMNA 2OE0A 1A8YA 4I2UA 1GL8A 3CYNA 1OC9A 5A4UA 1M7TA 3ED3A 2LV3A 5G30A 4ZILA 3G9BA 6GSSA 3EINA 2B5YA 2B5XA 1H4OA 3D4MA 4HZ2A 3DVWA 4PNFA 5HQPA 4ZBBA 1F6MC 1FW1A 3TJJA 2G2QA 2H66A 1TRUA 1O81A 1YEPA 2H1DA 3GTUA 3LG6A 5ECKB 2PPTA 5G5EA 5H5QA 4HQZA 1GP1A 4RUVA 1F37A 3KGKA 4IQAA 1V40A 3KZQA 5HFGA 3GYKA 2GQKA 3KH7A 2P31A 5D8IA 2LJRA 2L6DA 4TKYA 1GULA 4PQHA 3GKMA 4HQSA 1R4WA 4PX1A 1DE2A 5DCHA 2TRCP 1OVNA 1SK1A 4JZQA 5B6NA 3UMAA 5IM9A 4KAEA 5FT3A 2VLTA 1GUMA 3L9SA 3IK7A 4WETA 4RQXA 2AYTA 3J7Yk 3IK9A 2CQ9A 2I1UA 4HU7A 14GSA 2CT6A 3F63A 4KSMA 2A2RA 3TOTA 3I6AA 4WKWA 2NTOA 3VPTA 4ECIA 2O7KA 4AJ8A 5LD0A 2P5QA 4K7OA 1ZCPA 4K7NA 1EV9A 1S3AA 2VOCA 5IMVA 4D73B 1A8LA 2PN8A 2HRNA 5EY6A 2RUEA 2H6YA 5D9WA 4YQMA 2PBJA 5B8BA 1MDIA 3RPNA 3TKRA 2VD0A 4YAVA 2C0GA 4MK3A 3TUEA 5IOXA 3KXOA 3TJGA 1X9SB 4TRXA 4V2MA 3FYGA 1K3LA 3KJYA 2NPBA 5DVBA 1XW9A 2LUSA 5COHA 2E2MA 2FNOA 3TJKA 4O7HA 3KM6A 3MAKA 4ML1A 2YANA 3A2XA 1SL2B 2GQLA 1O73A 1T7PB 3BOAA 1AAZA 3I9V2 4OCEA 2XPEA 3FK8A 1EEJA 3TKPA 3DGQA 2HSYA 1AW9A 2KOKA 2C8UA 2V32A 5D73A 4IP1A 1BJXA 4TOPA 2H30A 2YWOA 2FCHA 3TKSE 4AJ6A 4MJCA 1MEKA 3F3QA 3D6IA 4KB3A 2IJYA 1GLQA 4ZL7A 1ABAA 1GUHA 5CRWA 2GLRA 1Z7RA 3GIXA 3SBCA 2QC7A 2IMIA 1WE0A 2IN3A 3QAWA 4AGSA 1GSQA 2LRTA 4PQ1A 1XWGA 2EIRA 2PWJA 4PUAA 4BPYA 4ZIJA 5F06A 3N9JA 1VF3A 3E9JB 2B7KA 4POMA 3PINA 2B5EA 4BWQA 3VFIA 3QFBC 5F07A 2WB9A 2H75A 1AC1A 2M46A 3C1RA 5FWGA 5EVOA 1SKSB 2PGTA 1K0MA 2IMFA 2CVBA 2G0FA 3RDWA 3GKKA 1PGTA 2CX3A 3DMLA 4RQRA 2QKEA 1RW1A 2VD1A 4HUAA 2WDUA 2PMTA 2L4CA 2YPMA 4JEDA 2K6VA 2JZTA 4K6XA 3G7IA 2CVKA 4K0GA 3P90A 1H75A 2IIYA 4EE0A 3RPPA 2IWTA 3UJ1A 2GVPA 7GSSA 4KH7A 4OO4A 4GF0A 2M72A 1B9YC 1X5EA 2HZEB 4L0WA 3KCMA 2EC4A 2CX4A 3H79A 3KTBA 1K3OA 5IPGA 3L9UA 2O89A 1GH2A 2GQMA 4TXVA 3IE3A 1KTEA 5E4WA 5AIXA 5EPFA 3QR6A 4MPGA 3HJMA 3IR4A 5A4WA 4POLA 1ERTA 4I97A 3GH9A 5DBQA 1OE8A 3IBHA 1KBNA 2DJ2A 1EZKA 2JSZA 3V1WA 3TRXA 3IPZA 5D9VA 1MD3A 1ERUA 1F9MA 1WWJA 2X64A 4OD7A 4RI6A 3KTLA 3GNJA 1YJ6A 3RHBA 1AUCA 1TI3A 5AN1A 4TN8A 3LSZA 2HZEA 5KN1A 1CQHA 3FR9A 3WT1A 2AJQB 3ZMKA 3DEXA 4O92A 4HZ4A 4YQVA 1TJDA 1T1VA 4XHMA 2WJUA 17GSA 1PMTA 1XBSA 3FHKA 3QAVA 1XPVA 1UA5A 2QGVA 1T8EB 4Q5FA 4L0UA 1YY7A 1MDJA 4FIWA 2FWHA 1GWCA 1ST9A 3VI5A 1A24A 3LJRA 1R5AA 3EVIA 3D22A 3M3MA 3J7Yb 3KP8A 4XTSA 1G6YA 3A2VA 3H93A 4WR4A 1XIYA 1ZL9A 2YWMA 1J9BA 2AAWA 3G7YA 11GSA 19GSA 4ZB6A 3HJPA 3M1GA 5CYYA 5ID2B 4RI7A 4F9ZA 4HOJA 1SK2A 5ELGA 5GAPD 4F0CA 5ECSA 1PN9A 3UEMA 2HT9A 4KCEA 4H86A 4X1UA 1SD9A 2ON5A 3UBKA 1FHEA 2HLSA 5J9BA 1FVKA 4MLYA 3F4SA 1BG5A 2V2GA 4O32A 2N5AA 1Q4JA 6GSYA 4ECJA 5ENUA 2CV4A 4EO3A 4MH3A 3WYWA 4JRRA 4GWRA 10GSA 1K0NA 1Q98A 4ZL9A 1TDIA 2VCTA 4Q5QA 1EP7A 3BD2A 5CNWA 3WD6A 4ECBA 2OKAA 1RQMA 3GV1A 2NBSA 3QD9A 5IQYA 2JU5A 4QL7A 1T4YA 4F2IA 3CTGA 5ECQB 2H0HA 5ECIB 1PKWA 4EDYA 2E2GA 1ERWA 2GSSA 5L71A 5ID2A 3BCIA 2KP2A 1QGVA 5H5SA 3GSTA 2L6CA 1X5CA 5IMCA 4TXOB 3KP9A 4TR0A 1Y6EA 1NHYA 4HI7A 1YKCA 4V1Ag 3HA9A 3LXTA 2HRFA 3WGEA 1O6JA 1EWXA 1SD8A 3FEUA 5LCZA 2JZRA 5B7CA 1T3BA 1G7EA 22GSA 2I81A 4DEJA 4CHSA 1YF1A 5G31A 2Z9SA 4OFNA 4JBBA 3A3TA 3FW2A 4ACSA 4WBJA 2B1KA 1MD4A 1SL0B 4YAPA 3BJ5A 1DUGA 4IBPA 3GX0A 1GTUA 3ZREA 2DJJA 2E0QA 5GSTA 2ALBA 4PXOA 9GSSA 4NHZA 3C71A 1FO5A 2C80A 1O8WA 4GSTA 2PVQA 1TK5B 3W6GA 2H71A 2YNXA 2H6ZA 3TCOA 1SJ6A 4TXOA 3QMXA 1HNAA 1EV4A 3ZFLA 2ON7A 4K1FA 3HVXA 3APQA 2OBIA 5F05A 1PSQA 5DCGA 4OMVA 3ZIVA 4BWSA 2FGXA 2JL4A 4WBRD 2K18A 1GNWA 4HDEA 3C73A 3HHVA 2WFCA 4BA7A 1A2MA 5IMAA 1SENA 3TKQA 2NVLA 3GKXA 3ISOA 3ZITA 1VF4A 2JADA 2GZYA 2GZZA 3MNGA 2GZPA 4IKHA 2VM1A 2DBCA 3F6FA 2K9FA 4MCUA 4YQUA 1NM3A 2XPDA 5HFIA 4MA9A 1TW9A 3EMPA 1K0CA 3UARA 1XWAA 1XOAA 1VF2A 3HZ8A 2WGRA 2YWIA 1JLVA 2AV4A 2L4QA 1WP0A 1TRVA 2KP1A 3F9UA 1V2AA 1G6WA 3IA1A 4I8BA 2YJHA 2MMNA 1PA3A 2OE3A 2H72A 3E0UA 1MTCA 4KCAA 4MABA 4ISDA 2VAFA 5GSSA 5D93A 3U5RE 4ECCA 1YEXA 4HS1A 2WS2A 2B6MA 3N5OA 3TRQA 2LS5A 4EL1A 2J23A 3GRXA 1I5GA 1J0FA 1JHBA 1SKRB 2LRCA 4ZB8A 3ZVJA 2HFDA 2DMMA 4XS6A 1SJZA 4MDCA 2WZ9A 2F3MA 5F8BA 5J9CA 2GSQA 1TK8B 3RBTA 3KEBA 4WEYA 1GSDA 2YCDA 1QXHA 5ELAA 1GRXA 4Q5RA 1ZMAA 3FZAA 4V2NA 1UC7A 3HDCA 1B48A 3MDKA 3LFLA 1F2EA 1PL2A 3UBLA 4K9ZA 4F0BA 2BTOT 1SU9A 1FOVA 1PQNA 1W4VA 4YH2A 3E3EA 4KGIA 2VUPA 3I43A 4PUFC 5KN3A 1K0AA 4K7IA 4MJEA 2YZUA 1TKDB 3P7XA 3CBUA 1ACVA 3K8NA 2EIOA 3MWHA 4ZB9A 4GSSA 2VL2A 4MPFA 1PX6A 1Z7PA 2HSHA 1DSBA 2O87A 1YZXA 2TIRA 4D73A 2CVDA 2GDRA 5CRHA 1Z3EA 2HI7A 2LQQA 5CRDA 2CA8A 2PVOC 3RAZA 1U88A 4J2FA 5F0GA 3ZRDA 3IV4A 4N0ZA 2V6OA 4OWYA 2L5OA 6GSTA 4WF5A 2DSAA 3GMFA 4FH8A 2VO4A 4BVYA 5JCWA 1X9MB 4MZCA 1WIKA 1G7OA 3NOFA 2H0GA 1M9AA 3D21A 4ZBAA 5J3RA 3MSZA 3C1SA 2H6XA 5ECOB 2D2ZA 1GUKA 4IELA 3FRCA 3CTFA 5AIVA 1YKAA 2DC5A 4FYUA 3IHQA 2LSTA 4XRAA 1PD21 1V57A 3DXBA 1NSWA 4L8EA 3DRNA 4L5LA 1ZZYA 2KHPA 1SKWB 2IFQB 3LYPA 4IP6A 1JFUA 5A4VA 3SWLA 3D0ZA 3F8UA 2C0DA 1AQVA 2FWFA 1USBA 5JWOB 3ERGA 4DSSB 3Q18A 1XCCA 2DJKA 2K8VA 3H8QA 1HQOA 4JU5A 2KLXA 4CW9A 2PERA 1EGOA 1TRWA 4QQ7A 2C0EA 16GSA 2J9HA 1V58A 3UIWA 3F0IA 4WXTA 2JSYA 1MDKA 3HKRA 3OR5A 1XWCA 1QFNA 1THOA 2IMKA 5HFKA 2H1BA 2X8GA 5DALB 3CMIA 4GQCA 4WR5A 2IMDA 2LRNA 2XBIA 4KE3A 1SYRA 3FKFA 1HYUA 5J41A 1WRYA 4POBA 3F3RA 4ZL8A 1T4ZA 3BCKA 5IOWA 4XS1A 4P3YB 3UVHA 3GH6A 2C3QA 5ECLB 4AJ7A 3DD3A 2IFQA 4LA1A 3VWVA 5JWRB 2B3SA 1F3AA 2H0IA 5E59A 5DAKB 3KD0A 4DSSA 1FB0A 2L59A 1EOGA 4FYCA 4NWYA 4ULXA 2GS3A 1WOUA 5CREA 1W89A 4N10A 2LKUA 3EMXA 1EP8A 5CO3A 1HNCA 2RIIA 1HD2A 5B8AA 4KDYA 1XW5A 2VCQA 2XC2A 3AY8A 2FLSA 3I69A 4HU9A 2YZHA 4MJBA 1SJIA 2VLUA 4ILFA 4IVFA 3D4TA 4CDOA 1GNEA 2PUKC 2XBQA 5DALA 4ZXGA 1XWBA 3M8NA 5ECHB 1NW2A 4G9HA 2OA7A 3IOSA 4JE1A 5AGYA 1N8JA 2HE3A 1ERVA 3Q6OA 2WULA 4F82A 4LL1B 2MZCA 3EC3A 3GURA 4XS4B 2BMXA 2YOIA 4IJ3A 3Q19A 2H74A 4MZBA 3GHAA 5DAKA 1M9BA 1XZOA 1SL1B 1VGLA 1XVWA 1ILOA 4KNDA 3ERWA 3TKSA 3VURA 1I9DA 2DIYA 4EKZA 3L78A 1QMVA 5IPHA 2B1LA 2O85A 4V1Ap 4MP4A 5DDLA 2MMOA 3LWAA 1ML6A 1R5PA 5ECMB 4KX4A 1O85A 2LNSA 1PRXA 2N5FA 3HY2A 4EVMA 2RM5A 13GSA 1C72A 2DJ0A 3CRTA 2V41A 2I4AA 3KMOA 1K0DA 5CRGA 4HJMA 4TVEA 3L4NA 4XS4A 4IJIA 4HEA2 2X8CA 2LEGA 1GTIA 2P5RA 4MF5A 1GSFA 1U87A 2C3NA 3ZVJD 1OC9B 2WRTA 5AISA 3TJFA 1KEBA 3M9JA 5KN0A 4TR1B 1U6TA 4X0XA 4K8MA 1S3CA 3APOA 3QAGA 5ABRA 4FYBA 1FB6A 4O5RA 1A23A 4GXZA 2FUG2 5GZZB 5J4UA 1VF1A 1N2AA 1JZOA 3EYTA 3VLNA 2IL3A 1JLWA 2LJAA 1S3DA 2FA4A 2DMLA 2IMEA 4LMWA 1ZOFA 3F4RA 5IMZA 2V1MA 3US3A 1YQ1A 2HXKA 3CSHA 2VL3A 3FR3A 4OO5A 3FZ5A 1RK4A 2HNLA 1WJKA 3HCZA 3PR8A 2LQOA 4OFTA 2JACA 1U3AA 1M2DA 2YN1A 3A2WA 4IW9A 2KUCA 5CAXA 2DIZA 2WCIA 4GRFA 4TR1A 4DSQA 2JZSA 1ZYQB 2YJ7A 1TK0B 3VWUA 3TRPA 4KUNA 3LGCA 1PX7A 3IDVA 1XXUA 4K2DA 2EIQA 4GQFA 4OCFA 3QPMA 3VWXA 2VIMA 3IAS2 2FD3A 3RHCA 2L5LA 2IPAA 3FZ9A 3CSJA 4GTUA 1VRSD 4NV2A 3M0FA 2R37A 3U6VA 1XFLA 4N0VA 5G1KA 2LJKA 2DJ3A 2GT5A 3ZTLA 1CQGA 3HYPA 4X43A 4ZBDA 2N5BA 4NHWA 2H76A 4ID0A 4KW6A 3L0HA 2H70A 2VCVA 3PGTA 1JZDA 4TR4A 4BL7A 1OC3A 5HR0A 1TTZA 5INYA 2L57A 1A0FA 1Z6MA 5IMFA 2A2SA 1Z9HA 1M2BA 1JZWA 1O8XA 3ERFA 1BQ7A 1E2YA 5IO0A 2AHEA 3P2AA 4PQIA 2BJXA 2VL2C 2R6KA 2C0FA 3C8EA 2FA8A 1KNGA 3D5JA 4E8HA 3G7JA 4IHUA 5HR3A 5IO2A 2YP6A 2RUFA 3HZ4A 3QCPA 2YV7A 1BYEA 3CRUA 3GN3A 2I3YA 4EC0A 2LTKA 3NZNA 2B7JA 5JWQB 2QSIA 1WMJA 1FVJA 4NMUA 5J5NA 1B4QA 3R2QA 1A2LA 1K3YA 4XCSA 5IMDA 4K0NA 1V9WA 4KDXA 3CSIA 1OYJA 3KIJA 2OADA 3DKSA 4LLRA 4MJAA 2VL9A 5ECRB 1SYXA 2ZCTA 1J08A 6GSUA 4KA0A 4J56E 4JR6A 2R5GA 1TOFA 1LJRA 2K8SA 1UN2A 4NPBA 18GSA 2GSRA 5EL8A 4TR3A 4POKA 1GSEA 5KN2A 3VPQA 3GL5A 5C04A 1XW6A 6GSVA 1AQWA 3WGXA 1FAAA 1R7HA 2AB6A 1FG4A 1XOBA 4Z7XA 4XIHA 12GSA 1M0UA 3IXRA 5IIZA 2F9SA 3TDGA 3WGDA 3H1NA 1YDKA 3GUSA 3IC4A 3L9VA 1E6BA 2I9HA 5G5FA 1DE1A 2MMAA 3ZMLA 2FY6A 3EWLA 1PKZA 1V98A 8GSSA 1LU4A 1HNBA 3VWWA 2MBTA 3DVXA 3VI7A 2RLIA 4MMMA 4QL9A 4OFMA 1PL1A 4XRDA 1TU7A 2F51A 2CAIA 3LYKA 3UAPA 3P8WA 3Q74A 1AIUA 1EEMA 1QK8A 3DYRA 2YV9A 3FR6A 3ZFBA 1GTBA 4NV5A 1OKTA 3C7MA 4IQ1A 3A5WA 3EU4A 1OE7A 2CZ2A 4V2LA 2CAQA 4G19A 4DSRA 2VCXA 1OAZA 2CZ3A 3ME8A 2C4JA 1YF0A 2O8VB 1TXXA 2P0GA 3EU3A 1B4PA 5GAND 3BBYA 1QQ2A 3F6DA 3WT2A 4KDUA 5LNKe 3QDNA 3EE2A 1OKDA 1Z6NA 2H19A 2GSTA 20GSA 4NAXA 2RM6A 1AQXA 5ECNB 2LNTA 1TU8A 3DWVA 2C1YA 3ME7A 5ECPB 1TP9A 3LQ7A 3IAM2 4EF0A 5B6MA 4Q5NA 5DJLA 5KEJA 4MH2A 2R3XA 5H5RA 3ZIJA 1U3IA 2DJ1A 3W8JA 4E8EA 3APSA 4GLTA 4PGTA 1URMA 2A4VA 3GSSA 3O3TA 5D96A 3TKSC 4EDZA 1T00A 3GFKA 1Z5YE 2F8FA 1BEDA 3F4TA 4GCIA 1IYIA 2H73A 4I6XA 4NXIA 2XHFA 1A0RP 1LBKA 1TRSA 2REMA 4G10A 2H1AA 1F3BA 5G1LA 2FWEA 3QOUA 2C3TA 3VK9A 1XWKA 3FZ4A 3O6TA 2H1GA 4LMVA 1M2AA 5A5KA 5HR2A 3M9KA 2X8HA 1QUWA 1DBYA 1ZYEA 4JR4A 4F03A 1GSUA 3QFAC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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