3HWLA

Crystal structure of t4 lysozyme with the unnatural amino acid p-acetyl-l-phenylalanine incorporated at position 131
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
161
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFCQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDCVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAANLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Site-directed spin labeling of a genetically encoded unnatural amino acid.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 161
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2009-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3hwlA00
187LA 1KS3A 4I7SA 175LA 144LA 1D2WA 2B74A 1L44A 1LYJA 186LA 1G0JA 102LA 1OVHA 1DYCA 4I7MA 1OWZA 123LA 1L15A 1C6CA 198LA 3HU8A 108LA 214LA 2Q9EA 2B6ZA 1C6BA 218LA 3PDSA 176LA 4ARPA 152LA 3C7YA 248LA 205LA 3DN2A 1QTZA 1QUOA 5I14A 160LA 199LA 1G0GA 4LDOA 1L23A 3C82A 1LYIA 1C68A 4W54A 1G0KA 1PQMA 1L58A 4EJ4A 2RAZX 4I7RA 1QUDA 1ZWNA 3L64A 4EKRA 4W58A 142LA 1LWKA 3HT7A 1L26A 253LA 2RBOA 1L81A 2ANXA 3C81A 200LA 223LA 1T97A 1L63A 6LZMA 3CDTA 2B72A 1L25A 3OE8A 1L89A 128LA 2CUUA 3HWLA 1LI3A 2RBNA 227LA 172LA 141LA 3DN1A 127LA 1DYEA 241LA 1C6FA 4PK0A 1SWZA 195LA 104LA 147LA 1L24A 4I7PA 1L83A 1C65A 2B6WA 162LA 1L76A 1CU3A 2B70A 1SX7A 1P6YA 1T8AA 2HUMA 1CUQA 1LLHA 3QAKA 111LA 239LA 122LA 261LA 1LW9A 1QT6A 3C8QA 1C6MA 1L16A 1QS5A 4W59A 1L93A 247LA 143LA 1L05A 1L30A 4GBRB 1L20A 120LA 2RB1X 1L27A 1DYGA 2RBQA 3ODUA 2QB0B 1TLAA 183LA 2HULA 1P2LA 1CV4A 256LA 125LA 224LA 3GUNA 3SB9A 1CU5A 1L50A 1EPYA 1LYHA 3HH4A 148LE 1LPYA 3FADA 1L07A 201LA 3DMVA 215LA 2B6YA 4EKQA 189LA 1P3NA 235LA 1SSYA 4EPIA 3DKEX 4ZPUA 1D9WA 126LA 185LA 1C6HA 1L72A 1QS9A 2NTHA 1L46A 1L35A 166LA 1C66A 1L49A 3UONA 3DMXA 163LA 171LA 129LA 145LA 3GUMA 3RZEA 139LA 159LA 238LA 1LYFA 155LA 3SBBC 4EKPA 1L65A 1L00A 1L39A 1L60A 1LWGA 3OE0A 3HUKA 1QT4A 2NTGA 226LA 259LA 2O7AA 113LA 1C63A 4AQNA 4DAJA 3C8RA 158LA 243LA 1LYEA 1SSWA 3V2WA 146LA 4LDLA 140LA 3SB8A 3VW7A 4EKSA 3GUIA 1L03A 1WTHA 1L01A 3GUKA 4YXCA 177LA 1D2YA 4PJZA 2LCBA 1L04A 110LA 1C6LA 2ANVA 4YX7C 1LGXA 1KY0A 1L61A 3C83A 1L14A 1L13A 237LA 3SN6R 1QSBA 1ZYTA 1CX7A 3C7WA 1P5CA 3DMZA 4I7TA 4LDEA 2RBPA 180LA 169LA 1PQDA 1C6GA 1P64A 3D4SA 1C6TA 1PQJA 1XJUA 5LZMA 211LA 174LA 196LA 130LA 1L0JA 1QTBA 3NYAA 1LYDA 4W56A 3JR6A 3CDVA 3HH6A 3C80A 1L45A 1L99A 233LA 2OU8A 4ARMB 1L47A 4LZMA 225LA 3CDQA 1C60A 131LA 3HTFA 1L79A 1L37A 1C6IA 3GULA 228LA 3C7ZA 161LA 258LA 1OVJA 184LA 3G3XA 2IGCA 1C67A 137LA 1L67A 3HDEA 2OTZX 3DN6A 1OWYA 168LA 164LA 178LA 2OEAX 216LA 2Z6BA 1T6HA 4IAPA 231LA 1PQKA 1L18A 1QSQA 1QT8A 1G0LA 1C6KA 1JQUA 2QARC 3GUJA 2O79A 1L74A 1L54A 222LA 2RH1A 1L02A 4I7OA 1L38A 1C6JA 112LA 2LC9A 188LA 3PBLA 173LA 3HT8A 1L96A 2RBSA 3HUQA 1QTVA 1L28A 1L48A 1QT3A 2RAYX 1QUGA 1LGUA 1CV3A 170LA 181LA 2L78A 1JTMA 1L70A 4I7LA 190LA 1G0PA 1L0KA 3HTGA 2B75A 1L11A 1LI6A 3HUAA 107LA 4DKLA 1D3FA 2Q9DA 4EPFA 4GRVA 219LA 257LA 2F47A 1LGWA 1CV6A 4W57A 251LA 3F8VA 1KW7A 212LA 1QTDA 3GUPA 1L40A 232LA 206LA 3RUNA 236LA 221LA 3HH5A 1C6AA 150LA 1L06A 119LA 2B6TA 1DYAA 2B6XA 182LA 1G1WA 1L19A 1L62A 2RB0X 1L95A 115LA 7LZMA 1P46A 1XJTA 255LA 149LA 1L66A 4W53A 1CX6A 2B7XA 1KW5A 1L77A 1L51A 1L73A 1SX2A 4I7KA 1L94A 2A4TA 118LA 3OE9A 1PQOA 1CU6A 1C6DA 210LA 191LA 1L75A 1L82A 244LA 1L34A 3SB6A 1CV5A 151LA 3F9LA 197LA 3CDOA 1ZURA 1L92A 138LA 3DNAA 3HTBA 3G3VA 1DYFA 1L87A 1L36A 1G07A 1L12A 1G1VA 4YXAC 229LA 1CVKA 3EMLA 1L68A 252LA 3HT6A 3HTDA 1P36A 1CUPA 1G06A 1C6EA 1L71A 1QUHA 157LA 4K5YA 246LA 1QTHA 1C6QA 1CV1A 1L64A 4E97A 1C6NA 1L53A 250LA 1L52A 1K28A 4W51A 1I6SA 1LI2A 1L10A 1OV5A 1SWYA 242LA 3HDFA 1L59A 4DJHA 1L57A 1L17A 3OE6A 1KY1A 167LA 1KNIA 3FA0A 4I7NA 4ARQA 1C61A 2B73A 1JTNA 1L55A 1L43A 209LA 1D3MA 254LA 3K2RA 3NY9A 4I7QA 4OO9A 1P2RA 3SB7A 3C8SA 2OU0X 3SBAA 4ARLA 234LA 1OVKA 1C6PA 109LA 1L41A 1C64A 1L91A 3DN3A 2OE4X 2RBRA 4ARJA 1T8GA 260LA 1L80A 220LA 1CV0A 1DYDA 1L98A 1L09A 3NY8A 4S0WA 3G3WA 1DYBA 1L29A 3HU9A 1T8FA 1CU0A 1LYGA 2HUKA 1C69A 3CDRA 240LA 1C62A 1CU2A 1XEPA 3L2XA 3DN4A 1QT5A 1D3NA 1L31A 3SB5A 1P7SA 1L21A 1L22A 2O4WA 4W52A 2LZMA 1L86A 1L88A 165LA 2F2QA 114LA 1QT7A 3HT9A 249LA 3LZMA 1L42A 2OTYX 1L69A 1L85A 2OU9A 103LA 1L08A 1L33A 4EXMA 3HH3A 2OE9X 3DN8A 3DN0A 4I7JA 2F32A 245LA 213LA 2RB2X 230LA 1L32A 1OV7A 262LA 1L56A 1NHBA 156LA 1D3JA 4ARQB 1OYUA 1G0MA 1L97A 3V2YA 2OE7X 1L90A 1P37A 3FI5A 4W55A 4ARMA 217LA 1PQIA 192LA 1QTCA 3GUOA 1G0QA 1L84A 1CTWA 1B6IA 1P56A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AZ4A 4I7SA 2ZWBA 5A3ZA 3A93A 1GEVA 2GV0A 1IR8A 3N9CA 4I7MA 2YBMA 1L15A 4KT3A 2Q9EA 1WTMA 4TSCA 176LA 4HJZA 5LAFA 4RW2A 1QTZA 3W6CA 1EQ5A 4LDOA 1L23A 4WLYA 3WPLA 1LYIA 1C68A 1B7RA 1L58A 1ZWNA 3SP3A 3W6EA 4W58A 1B0DA 3WVYA 4EOFA 1LJNA 1LHMA 1LZ6A 3HT7A 1L26A 2IFFY 3IJUA 1XGUC 2RSCA 3TMWA 1DZBX 1GBSA 4WLDA 1B2KA 4YENA 3HBHA 3DN1A 1C6FA 147LA 1L83A 1C65A 1ZVHL 3WW5A 4CFPA 1MLCE 4NGJA 1GB6A 1LJFA 2B5ZA 1P6YA 3CSRA 2HUMA 1HERA 4CGEA 3N9EA 3QAKA 2MEHA 3C8QA 1HF4A 1HEMA 4DD2A 1GF0A 1QS5A 2MEBA 4GN4A 3BKHA 120LA 2RB1X 2MEIA 1D6PA 256LA 224LA 1CU5A 2I6ZA 2DBTA 3HH4A 5HNLA 2ZQ4A 4H9EA 2FYCA 201LA 4IATA 2B6YA 4YM8A 4L41A 1GAYA 1L72A 1QS9A 1L49A 1C45A 1LMPA 3DMXA 4YEMA 4QGZA 1LZ5A 4TSBA 139LA 238LA 3SBBC 2YDGA 1LJ3A 1L00A 4HPEA 1LWGA 2BQAA 4LFPA 113LA 1C63A 4ET9A 1IOQA 1BB4A 3WXTA 2MEFA 4YOPA 3V2WA 3SB8A 1YAPA 4GN5C 1REMA 4LT3A 4YXCA 1JTTL 1CJ6A 1B5ZA 4DDAA 4RLNA 4DD0A 4DYGA 1GEZA 5LVHA 2ANVA 1LZDA 2VB1A 1OUBA 3SN6R 1XEKA 1LOZA 4DDCA 2CGIA 3DMZA 3C7WA 2MEGA 3D4SA 1C6TA 1PQJA 174LA 1C7PA 1KXXA 1OUGA 3WPKA 9LYZA 1HENA 1L99A 2OU8A 3WUAA 1L47A 1WVVA 3WL2A 225LA 4WLXA 1QTEA 5K7OA 4YEOA 1C6IA 1L37A 3AZ7A 1BVKC 3HDEA 1F0WA 1LSPA 1JJ0A 4IAPA 1F6SA 1PQKA 1QT8A 3T36A 1JQUA 5HLLA 2Z37A 4DDBA 1L38A 4BS7A 1OUFA 4ZEEA 3QY4A 4XADA 2LC9A 3PBLA 4H8YA 1L96A 2RBSA 1IP2A 1QTVA 4O34A 4XJBA 1IOSA 1JTMA 1YANA 3HTGA 2B75A 1LI6A 4HP0A 3HUAA 1BWJA 1LSAA 1LGWA 1CV6A 1DI4A 251LA 212LA 1IWVA 3GUPA 1JISA 2ZQ3A 1YAQA 4NSGA 5KJ9A 4FJRA 1J1XY 1L95A 7LZMA 3WU7A 1P46A 255LA 4W53A 132LA 1T3PA 118LA 3OE9A 2HUBA 1LSBA 2DQJY 191LA 3QE8A 1WQPA 4ETCA 3BKVA 151LA 3HBDA 1VDQA 3HTBA 1GFKA 1GE4A 1QTKA 1LZRA 1IWYA 3AGIA 1CVKA 1UIEA 2IHLA 1Z55A 3E3DA 4NG1A 5LIOA 1G06A 1QUHA 1LHKA 4LGKA 3ZVQB 1L64A 3CSQA 1HC0A 2CJLA 1L52A 2YBHA 1LMTA 4OOOA 1QQYA 5KXXA 242LA 1BVXA 3WUNA 1L17A 1GHLA 3FA0A 2HEFA 4ARQA 4LYZA 1D3MA 2Z39A 3SB7A 1BB5A 4Z41A 1HFYA 234LA 1LYOA 1L41A 2RBRA 4IASA 1GBZA 1D9UA 1DI3A 3T6UA 1DYDA 1L98A 1L09A 4S0WA 2YSSC 2DQCY 3AZ6A 1YKZX 1CU0A 3TXJA 5C6LA 2DQEY 2HUKA 2EQLA 4DD3A 1LZGA 3ULRA 1CU2A 3TXIA 1JTOL 2Y8PA 5APFA 1MELL 2F2QA 1GE2A 4GCCA 1GBXA 3WXUA 3LYMA 5FCPA 4H91A 1LZBA 2H9KA 2NWDX 3M3UA 2XJWA 2G4PA 5B07A 2Z38A 1DKJA 1OV7A 1QUSA 3WW6A 1LTMA 1W08A 4ARMA 1P37A 3FI5A 2LYZA 3OK0A 3GUOA 3AYQA 1KS3A 4I0CA 1B7MA 144LA 4DD7A 1GFJA 3WH1A 2BLYA 102LA 1REXA 1KXWA 2AUBA 1C6CA 1GAZA 4MSTA 198LA 1FKVA 4DT3A 3CQLA 4IJ4A 1C43A 1B5WA 1GB2A 1JJ1A 1YIKA 4WM4A 4ARPA 2BQFA 1HEWA 3C7YA 1QIOA 1EQ4A 2CWIA 1UIDA 3C82A 4W54A 4UWNA 5KXZA 3CSZA 4WLTA 1G0KA 135LA 3A95A 2MEDA 1CKFA 3GXKA 3L64A 4QDNA 4J7VA 142LA 1LSFA 3ATNA 4Z46A 6LZMA 2B72A 1O23A 1L25A 1LPIA 3TXKA 1L89A 1LMNA 2A7DA 2CUUA 4NY5A 2RBNA 227LA 3TMXA 141LA 1IC7Y 1LZ8A 127LA 4H92A 1HEOA 1L24A 2DQAA 2B6WA 4LYCA 1RFPA 4H8ZA 3G3BB 4LFXA 5I54A 1HFXA 1CUQA 1LLHA 3TXGA 1GB3A 261LA 1V7TA 2BQEA 4XJFA 1C6MA 1L16A 4W59A 4DC4A 1OUDA 5C6JA 1L05A 1L30A 4GN3A 1L20A 1QDTA 1FN5A 1JITA 2Z18A 3TMVA 5DLAA 4LZTA 183LA 5I4XA 2HULA 1CV4A 2HEBA 125LA 1HELA 2ZNWY 1LYHA 5I53A 3FADA 1L07A 1UIHA 1LSNA 3AGGG 1P3NA 235LA 3LZTA 3P66A 3DKEX 126LA 6LYTA 1JHLA 1TCYA 1YQVY 145LA 3RZEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AZ4 A;  4I7S A;  2ZWB A;  5A3Z A;  3A93 A;  1GEV A;  2GV0 A;  1IR8 A;  3N9C A;  4I7M A;  2YBM A;  1L15 A;  4KT3 A;  2Q9E A;  1WTM A;  4TSC A;  176L A;  4HJZ A;  5LAF A;  4RW2 A;  1QTZ A;  3W6C A;  1EQ5 A;  4LDO A;  1L23 A;  4WLY A;  3WPL A;  1LYI A;  1C68 A;  1B7R A;  1L58 A;  1ZWN A;  3SP3 A;  3W6E A;  4W58 A;  1B0D A;  3WVY A;  4EOF A;  1LJN A;  1LHM A;  1LZ6 A;  3HT7 A;  1L26 A;  2IFF Y;  3IJU A;  1XGU C;  2RSC A;  3TMW A;  1DZB X;  1GBS A;  4WLD A;  1B2K A;  4YEN A;  3HBH A;  3DN1 A;  1C6F A;  147L A;  1L83 A;  1C65 A;  1ZVH L;  3WW5 A;  4CFP A;  1MLC E;  4NGJ A;  1GB6 A;  1LJF A;  2B5Z A;  1P6Y A;  3CSR A;  2HUM A;  1HER A;  4CGE A;  3N9E A;  3QAK A;  2MEH A;  3C8Q A;  1HF4 A;  1HEM A;  4DD2 A;  1GF0 A;  1QS5 A;  2MEB A;  4GN4 A;  3BKH A;  120L A;  2RB1 X;  2MEI A;  1D6P A;  256L A;  224L A;  1CU5 A;  2I6Z A;  2DBT A;  3HH4 A;  5HNL A;  2ZQ4 A;  4H9E A;  2FYC A;  201L A;  4IAT A;  2B6Y A;  4YM8 A;  4L41 A;  1GAY A;  1L72 A;  1QS9 A;  1L49 A;  1C45 A;  1LMP A;  3DMX A;  4YEM A;  4QGZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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