3HY2A

Crystal structure of sulfiredoxin in complex with peroxiredoxin i and atp:mg2+
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVDPTEIIAFSDRAEEFKKLNSQVIGASVDSHFEHLEWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVSPAGWKPGSDTICPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Peroxiredoxin-1
publication title Protein Engineering of the Quaternary Sulfiredoxin-Peroxiredoxin Enzyme-Substrate Complex Reveals the Molecular Basis for Cysteine Sulfinic Acid Phosphorylation
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 53
structure length 185
sequence length 185
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hy2A00
1B48A 2J9HA 1Y6EA 2GQKA 2N5BA 4FIWA 1TW9A 3H8QA 3CYNA 4HU9A 4EE0A 4WF4A 1JHBA 4ZBDA 1GL8A 1Z6MA 1AQXA 2VO4A 3VI7A 1XVWA 4BWQA 4D73A 1ABAA 2R37A 3KTLA 4V1Ag 3DEXA 1QXHA 1WMJA 3ZIJA 1U3IA 1EGRA 2VCZA 2EC4A 5EPFA 4H86A 1B4QA 2D2ZA 3PGTA 3OR5A 2X64A 1SYRA 5D9WA 5GSTA 4HJMA 3PR8A 3QPMA 2ZCTA 2ALBA 5IO2A 5ECSA 3UARA 2B7JA 4I6XA 3RHBA 2YPMA 4DVCA 5G5EA 3ME7A 5INYA 3KH9A 4WXTA 2REMA 2WS2A 3ZTLA 3A2VA 2VUPA 5CRWA 3GH6A 3SWLA 3TKPA 4GWRA 5F8BA 2GS3A 3IHQA 2OBKA 4MPGA 2VIMA 3EU3A 1F3AA 2RM6A 4IN0A 2FNOA 4F0CA 3JCML 3WGXA 1PMTA 3L9VA 2DJJA 1O81A 2FUG2 1FG4A 2F8FA 3LSZA 3CBUA 4IVFA 1FVJA 1FHEA 2C0GA 1FOVA 2DBCA 3IBHA 3DXBA 4ML1A 1A2LA 1ZGNA 1E2YA 9GSSA 3TJJA 1R4WA 3BCKA 1T7PB 1SK0A 2HZFA 3GUSA 1R7HA 4IS0A 3A2WA 4NV2A 3TKSA 2IWTA 2LRTA 3L4NA 1A24A 4ISDA 3PH9A 3MDKA 2OE1A 1ON4A 1FO5A 2LQQA 1EV4A 1YZXA 4MLYA 3KIJA 2C0FA 1ST9A 3DIEA 3WYWA 2WFCA 3DKSA 4PX1A 4PURA 3TOTA 5D93A 2CAQA 3ZL5A 2JZSA 3KP9A 5GSSA 2CVKA 4L5OA 5DJLA 4N0ZA 1VRSD 5JCWA 5AISA 1SL1B 2VLUA 3UOMA 1Z7PA 2L59A 5J4UA 1OYJA 5D96A 1Z9HA 5IMFA 3EINA 1V40A 5J41A 1TJDA 1YDKA 5C04A 1XWCA 1O73A 1TRVA 3P7XA 4GSTA 3QR6A 3TRXA 1BYEA 3KJYA 4YQMA 2KOKA 1ERVA 3FZ5A 2A4VA 1AUCA 2MMAA 5LD0A 2H30A 4I8BA 4JBBA 4HI7A 1PA3A 1JFUA 4ILFA 4GRFA 4I5QA 2H71A 3FKFA 5IOXA 4BVXA 3VURA 3TJFA 1MD4A 2YANA 1JZOA 1M9BA 2N5AA 2V32A 2V6OA 6GSYA 2K8VA 5HR0A 1H4OA 2P0GA 1PL1A 1JZWA 2R3XA 2GTUA 2GSSA 1U87A 3D0ZA 1PKZA 3WT2A 1J9BA 1DSBA 2PERA 3GX8A 1WE0A 3ME8A 2R4VA 1DE1A 4HUAA 4IJ3A 3ERWA 5DDLA 4CW9A 4JZQA 4WEYA 4QQ7A 1SL2B 5B8BA 5DVBA 3KH7A 1F3BA 2E0QA 2TRCP 1G0TA 4J56E 2IMEA 1T8EB 3MAKA 1BQ7A 3FHKA 3K8NA 1R5AA 2DC5A 4MZBA 2NVLA 3DWVA 3KMNA 1EP8A 1V58A 4O7HA 5KN3A 1OKTA 3GL5A 3D5JA 2B7KA 3VI5A 3HJPA 3CSIA 2XPDA 4K2DA 2JL4A 1N8JA 4YAVA 2LQOA 3HY2A 4MJAA 5AGYA 3UMAA 1J0FA 5ELAA 4KDUA 3O3TA 4K1FA 2LSTA 1K0AA 4JEDA 4IJIA 2GQLA 2CVBA 4POLA 3ZRDA 2H01A 3IA1A 1YF0A 3HD5A 3LYPA 2F51A 16GSA 3AY8A 2H74A 5J9BA 2LRNA 3HDCA 4F03A 3J7Yb 4Q5NA 4FYBA 5D9XA 2DIYA 3V1WA 2L6DA 3TB2A 3UEMA 4J2FA 1I5GA 1XOAA 1A0RP 1Z5YE 1HQOA 2VCXA 4RQRA 3LGCA 5DCHA 3ZFBA 3IAM2 2B1LA 3QAWA 1GTUA 1XW5A 2F3MA 4Q5QA 3TRPA 1HNCA 2H76A 1YEPA 3P2AA 3RAZA 2BMXA 4ZB6A 4HDEA 5KN0A 3TOUA 1MDKA 5FHIA 4P3YB 1USBA 1YQ1A 4XS6A 4IBPA 1OVNA 2B3SA 3LJRA 5ECMB 2KUCA 2WRTA 4NXIA 4KDXA 2YZHA 5DQYA 1XW6A 3GN3A 3QCPA 2DJ0A 2E2MA 3O6TA 4TRXA 2MYGA 3GNJA 3F4TA 3E0UA 3EURA 4OO4A 3I69A 19GSA 13GSA 2L4QA 4O32A 1X0RA 3GL3A 3L78A 4WR5A 1BAYA 2B5XA 3QAVA 2FWGA 4E8HA 4TR3A 2IFQB 1UVZA 2IMDA 2L57A 3F3QA 4PGTA 4O92A 4YAPA 3GKXA 1GLQA 22GSA 5LCZA 4HQZA 4N0VA 1K0DA 4ZBBA 2CZ2A 5ECIB 4NWYA 2MZCA 2H1AA 1FB0A 2FD3A 2C3QA 4MJBA 1GULA 4V2MA 4QL7A 4YQVA 4N10A 2FGXA 1M0UA 2B6MA 2L6CA 2AAWA 2M72A 1K0NA 2HT9A 3IK7A 1A2JA 3F63A 3GFKA 1CQHA 1GP1A 1K0OA 3LWAA 1HNAA 2KP2A 1AQVA 4OWYA 5ECNB 4OFNA 1UA5A 2OJLA 3EYTA 3GMFA 5EL8A 1M2AA 3M8NA 4IKHA 1GTIA 2HSHA 2VOCA 4ZL9A 3KMOA 5COHA 3CMIA 3KGKA 5CRHA 1T00A 3D6IA 2XPEA 4G10A 1ERTA 1XCCA 3ED3A 3E3EA 2OA7A 4IHUA 1EP7A 2C0EA 1PKWA 3BOAA 2AJQB 4ZB9A 4MJEA 1SKRB 3H93A 4KB3A 4PQIA 2QKEA 7GSSA 2RM5A 2VD1A 3Q6OA 10GSA 2CT6A 2IMKA 4ZXGA 4YQUA 5CNWA 3GIXA 3GKMA 2CX4A 1ZZYA 3FK8A 3HA9A 4BWSA 5G31A 2G0FA 2BTOT 4CHSA 3D4MA 4XRDA 1THOA 4AGSA 5H5RA 4E8EA 3U6VA 3G7IA 3IV4A 4ECJA 4MMMA 2LUSA 18GSA 2I9HA 3APQA 4MABA 4V2NA 2FCHA 1JLVA 1WWJA 2PUKC 1ACVA 4GQCA 3NZNA 1HYUA 3ZFLA 1WRYA 1GUMA 2OACA 1PX6A 1QQ2A 2QC7A 1ZYEA 3QOUA 5ECHB 2NTOA 3WGDA 4LLRA 4ML6A 4RUVA 5J3RA 5IMCA 3EMXA 5JCGA 2MBTA 2C3NA 1SL0B 2KLXA 2LEGA 1V57A 2CX3A 2VCQA 1XBSA 4KE3A 3M9KA 5F07A 1DUGA 2JACA 3DGQA 1B9XC 1KTEA 4K8MA 1GUHA 3GSSA 5HFKA 4DEJA 2K9FA 2AYTA 3HVVA 2QSIA 1A8YA 1TXXA 4EL1A 2JADA 3C1RA 2KHPA 4XTSA 2H66A 5D73A 2G2QA 1FAAA 1NHOA 3FZAA 2O87A 3L9SA 3PINA 3CTGA 2XBQA 3G7JA 2IN3A 2H6ZA 1DBYA 4BA7A 3ZZXA 1QGVA 1SD8A 1EEMA 4WKWA 2C4JA 4DSRA 5JCUA 2P5QA 1SD9A 1R26A 2FLSA 5D9VA 1Z3EA 1T4YA 5JWRB 1SU9A 1UN2A 2IMFA 2FA8A 2VAFA 2VCWA 3ZITA 4K7IA 3QFAC 1N2AA 5CO3A 4MZCA 3F8UA 3BJ5A 6GSSA 4G2EA 3D21A 1TKDB 1M99A 1Z7RA 1VF4A 2VL2A 3EWLA 1BEDA 4N30A 2L5OA 2HZEB 3KD0A 2KP1A 2PVOC 2YP6A 3L9UA 2M80A 2H19A 5DJMA 3P90A 4PQHA 2O8VB 2DMMA 2ZNMA 1XWGA 3EMPA 1X5DA 3GRXA 2YWNA 4XCSA 3LFLA 2IJYA 1M2BA 2HRFA 2R2JA 2C3TA 1THXA 2OBIA 3RDWA 3HJMA 3RPNA 2YCDA 1G7EA 4KW6A 1K0CA 4WF5A 12GSA 2JZRA 4RI6A 5IMDA 1AIUA 3M0FA 3VFIA 4YH2A 2LNSA 1HD2A 1U88A 2VL3A 3F0IA 4ZILA 2HLSA 1GRXA 3ZREA 5HFGA 3SBCA 4MZWA 5DALB 3QAGA 3CSHA 2DMLA 1VGLA 3UIWA 2IMIA 1G7OA 3C1SA 2AHEA 3QDNA 5ECLB 2WDUA 3QD9A 1VF3A 2H0IA 2PGTA 1EOHA 3CRUA 1OKDA 1T3BA 3H1NA 2L4CA 2PMTA 2Z9SA 4CDOA 4ZIJA 1GSDA 2JZTA 1GUKA 3F6FA 5DQSA 1QUWA 3HVXA 3IAS2 4EF0A 4GF0A 4K7OA 1ML6A 3IPZA 4K0NA 2V1MA 1R5PA 3W8SA 3GTUB 5ELGA 1KBNA 1GSUA 2HSYA 5HFIA 4AJ6A 5CYYA 4HZ4A 3W6GA 1AQWA 2AB6A 1OC8A 3MNGA 4KSOA 2HZEA 2R6KA 3QMXA 5IQYA 2JU5A 5J5NA 2V2GA 5A4VA 5F05A 1K3YA 5ID2B 1PX7A 3GA4A 5IO0A 2K6VA 3HYPA 5LNKe 3HVSA 5CRDA 4ACSA 2PPTA 2H8LA 3IR4A 3WT1A 6GSTA 4HJ2A 3TKSC 4KX4A 4LL1B 3KCMA 1B9YC 5ECRB 1EWXA 2HXKA 3M1GA 5L71A 5IPHA 2I3YA 3GHAA 2X8HA 5IMAA 4TXVA 5A5KA 2VCVA 2K8SA 2YZUA 1QFNA 4L8EA 3GX0A 4KGIA 1O85A 4OMVA 2YNXA 1GSFA 5E4WA 1GSSA 4JU5A 5IMVA 1EEJA 1AW9A 2WZ9A 3RHCA 1H75A 1O8XA 1NHYA 5DALA 1ZOFA 3U5RE 2HNLA 2RLIA 3IOSA 4JRRA 3DD3A 1XIYA 3ZVJA 1NW2A 4AJ8A 5JWOB 2IIYA 1TU8A 3ZVJD 2H6XA 2WULA 1Z6NA 3CXGA 4MDCA 3GH9A 3G7YA 3GSTA 2JSYA 4MF5A 2H73A 3LQ7A 1A23A 3NOFA 4PNGA 4Q5RA 5JWQB 1XXUA 1MTCA 2TIRA 1WJKA 5IM9A 2AV4A 3DVWA 3ISOA 2DLXA 2H1BA 3TKSE 4KAEA 4HZ2A 1J08A 1X9SB 3A3TA 4KNDA 1I9DA 4F2IA 4IP6A 3I43A 6GSUA 2OADA 4LMWA 2LJRA 2YOIA 1F6MC 4HOJA 1OE8A 3GTUA 2VM2A 1KEBA 1TI3A 2E2GA 4LMVA 1G6WA 8GSSA 2XBIA 3QFBC 1T4ZA 1U3AA 2ON7A 4JE1A 1A2MA 4IP1A 3S9FA 4JR6A 4X0XA 5GZZB 5ECPB 3UJ1A 1O7UA 3RPPA 4MF7A 3F3RA 5ID2A 2JSZA 2RUFA 3FYGA 4POBA 3VWUA 2C0DA 3C71A 2VLVA 1ERWA 1V2AA 4Z7XA 4EDZA 1FVKA 5IOWA 4KSMA 4IELA 2FWEA 4JR4A 1YEXA 2GSQA 2GZZA 2YJHA 3VPTA 3TKRA 3ZYWA 4GQFA 5G5FA 4F9ZA 1S3CA 2ON5A 4EO3A 2PU9C 1Q4JA 3BCIA 2YN1A 4TN8A 1GSEA 4ID0A 2H72A 2MMOA 1XVQA 1OC3A 1BJXA 4KA0A 4G19A 5G1LA 4I97A 5CRGA 5HQPA 4MPFA 3HZ4A 3VWWA 4OCEA 2MMZA 4OFTA 2PN8A 4TR1B 1V98A 1GTAA 2VCTA 4DSQA 4XS1A 3IRAA 2M46A 3KP8A 1WIKA 2C8UA 5IPGA 4HU7A 2OE0A 2DJ1A 2DIZA 1FB6A 4KCAA 4IW9A 4TR0A 3IXRA 4TXOB 3BD2A 3LYKA 2LNTA 3LXTA 5DBQA 4MH2A 5F06A 1AXDA 1WOUA 5H5SA 1JLWA 4IGJA 5AN1A 2VM1A 4L5LA 4V1Ap 2B5YA 1OE7A 1QK8A 4PUFC 2GZPA 4GSSA 3VK9A 1VF2A 3A2XA 4DSSB 4GCIA 3VWXA 4FO5A 2IFQA 1XWBA 3ERGA 2PWJA 5HR1A 5ECKB 3G9BA 3UL3A 4BVYA 2DJ2A 3CSJA 3W8JA 1EV9A 5IMZA 2RUEA 3CTFA 2FHEA 4WBJA 3FEUA 1M9AA 2B1KA 2O7KA 2GLRA 4TW5A 5HR2A 5DCGA 2QGVA 3TDGA 2EIQA 1OC9B 4PNFA 2YWMA 1TRUA 4IQAA 3IE3A 4GXZA 1YF1A 5B6NA 4O5RA 2YJ7A 2FY6A 1Q98A 2HRNA 4G9HA 5EVOA 3HHVA 4EUYA 2CV4A 3KZQA 4NPBA 1EOGA 1A8LA 2CZ3A 3GYKA 4V2LA 3VWVA 2NDOA 6GSVA 1Y25A 3APSA 3M3MA 3MWHA 3TCOA 3M9JA 3P8WA 1TRWA 1GNEA 3TGZA 2BJXA 6GSWA 2P31A 2V6KA 4POMA 1HNBA 3HJOA 4OO5A 1ZL9A 4AJ7A 1SKSB 3UBLA 2CA8A 4EDYA 4TR1A 3Q18A 1SJIA 1NM3A 1NSWA 1TI1A 1TOFA 1YKCA 2R5GA 2FWFA 2GSRA 5HR3A 2EIOA 4RI7A 3C7MA 1ZMAA 1X9WB 2HE3A 3FR6A 3F9UA 2I81A 3HXSA 2YV7A 1YJ6A 1M7TA 5CP1A 4PXOA 4TXOA 4XIHA 2GGTA 2WGRA 3LXZA 2LV3A 3TJGA 1LBKA 5A4UA 4F82A 5D9TA 1GH2A 5D8IA 4MP4A 3F4SA 1TK5B 1K0MA 4K7NA 3C73A 4ECCA 5ECQB 3KTBA 1AAZA 3IDVA 4N11A 5AIVA 4ZBAA 3WD6A 3E9JB 3N5OA 4DSSA 1ILOA 2CQ9A 4MJCA 1PL2A 3ZMKA 2X8CA 1MDJA 4TKYA 1A0FA 2NPBA 3HKRA 3NIVA 3IK9A 4GLTA 1BX9A 4ECBA 4WR4A 1S3DA 1IYIA 2FWHA 1PRXA 1V9WA 1PGTA 4EC0A 3UVHA 2HI7A 1W89A 2H1DA 4Q5FA 1X5CA 3DVXA 1OC9A 4NV5A 3TUEA 3R2QA 1ZCPA 3IC4A 1RW1A 1BG5A 3F6DA 3ERFA 3GKKA 1PD21 4NHWA 3F4RA 2EIRA 4EKZA 1TDIA 4L0WA 2A2SA 3O76A 5B6MA 2LS5A 2VL9A 4HEA2 3WGEA 1TRSA 1MD3A 1URMA 2CVDA 1SJZA 1QMVA 1PSQA 1EZKA 2LJKA 1K3OA 4TOPA 1C72A 4MF6A 3LEFA 3VPQA 1F9MA 1SENA 4XRAA 3ZLPA 3EVIA 2LRCA 1XW9A 3FR3A 4XS4B 2I1UA 1MEKA 3GKNA 2H0GA 1M2DA 2H70A 2DJ3A 4BL7A 2TRXA 1F2EA 2AUVA 4I2TA 1PN9A 3US3A 2ES7A 4XHMA 1UC7A 5G30A 1GSYA 5KEJA 5AIXA 2LKUA 1FW1A 2MBSA 3HCZA 1LU4A 3UVTA 1YY7A 1X9MB 3DMLA 2I4AA 1RQMA 4L0UA 4WBRD 5KN2A 5IIZA 1DE2A 1LJRA 3FZ9A 1TTZA 3UAPA 1TU7A 3KEBA 2YWOA 14GSA 3EU4A 4MCUA 1WP0A 4FYUA 4WETA 4X43A 5GAPD 2CAIA 1X5EA 4ZL8A 1XPVA 1MDIA 2X99A 5KN1A 3TKQA 5F0GA 1S3AA 4EVMA 2HFDA 2LTKA 1YKAA 3MSZA 2F9SA 1TP9A 5DAKB 1E6BA 3FRCA 2GT5A 3DYRA 2H75A 4AF2A 1SYXA 2VL2C 1PQNA 2E7PA 3EC3A 4K9ZA 2PVQA 6GSXA 4NAXA 1RK4A 2ZUPA 1F37A 3FR9A 5J9CA 4MH3A 2F8AA 4POKA 3I9V2 2VD0A 3D4TA 3TJBA 2GDRA 3FY7A 3Q19A 4X1UA 4K0GA 2OE3A 1SKWB 2GZYA 2XHFA 3HZ8A 1ERUA 2J23A 5CREA 1VF1A 2MMNA 2L5LA 3CRTA 4GSNA 2V41A 1SJ6A 3EE2A 2YV9A 2N5FA 3C8EA 1TK8B 4GTUA 4KDYA 2P5RA 5FT3A 2X8GA 3RBTA 5GAND 2PBJA 3FZ4A 1EGOA 4XS4A 2C1YA 1WPIA 4MA9A 2LJAA 4HQSA 3H79A 2NBSA 2K18A 2O89A 2FA4A 4K6XA 3N9JA 4J57E 1XWAA 5B8AA 1B8XA 3ZMLA 2WCIA 5H5QA 5ABRA 3APOA 3GURA 3GV1A 4LL4B 1ZYQB 2RIIA 4ULXA 1T1VA 4FH8A 20GSA 2GSTA 4PQ1A 4EXJA 4KCEA 1O6JA 4HS1A 4NHZA 2H6YA 4NMUA 1K3LA 3ZIVA 2WB9A 1GTBA 4D73B 1W4VA 4TR4A 4OFMA 2GQMA 2GVPA 4MK3A 4IQ1A 4ZL7A 17GSA 4TVEA 5DAKA 2GT6A 11GSA 5ECOB 1SK1A 5G2ZA 4OCFA 1GNWA 4LA1A 1G6YA 3KXOA 1AC1A 4BPYA 2A2RA 3VLNA 3KM6A 5FWGA 2DJKA 3L0HA 1XFLA 1XZOA 4OD7A 2H0HA 3FW2A 3TJKA 2C80A 3UBKA 4PUAA 1OAZA 3Q74A 5E59A 3A5WA 5B7CA 4KUNA 1O8WA 2YWIA 1GSQA 3LORA 1TK0B 1GWCA 2XC2A 4FYCA 1U6TA 3D22A 4ZB8A 1JZDA 4RQXA 5G1KA 5CAXA 2IPAA 3H4KA 2O85A 2H1GA 1SK2A 2DSAA 5EY6A 3I6AA 2HYXA 1GLPA 3BBYA 1CQGA 4I2UA 2WJUA 2VLTA 1JZRA 4ECIA 1B4PA 1K0BA 4QL9A 2IL3A 1XOBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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