3HY2A

Crystal structure of sulfiredoxin in complex with peroxiredoxin i and atp:mg2+
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVDPTEIIAFSDRAEEFKKLNSQVIGASVDSHFEHLEWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVSPAGWKPGSDTICPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Protein Engineering of the Quaternary Sulfiredoxin-Peroxiredoxin Enzyme-Substrate Complex Reveals the Molecular Basis for Cysteine Sulfinic Acid Phosphorylation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 53
structure length 185
sequence length 185
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hy2A00
1Q98A 2RLIA 2ZNMA 3MAKA 4YQUA 1VRSD 4E8EA 2I81A 4OO4A 3NIVA 3ME8A 5HQPA 3KZQA 2HXKA 4WR4A 3HKRA 2DJ0A 4IJ3A 3TOUA 4KGIA 2K9FA 1TRWA 4IP6A 3N5OA 4KCAA 1IYIA 4HZ2A 3GV1A 2L6CA 3WYWA 1MEKA 2DBCA 3D5JA 3LFLA 3LEFA 2E0QA 2NDOA 2CZ3A 2LV3A 1JLVA 3FRCA 3QCPA 5ECNB 5HR2A 4DSSA 2FGXA 5G5FA 2WB9A 5F05A 3FR3A 4TR1A 1F3AA 1A2JA 1N8JA 1BX9A 2I3YA 3HD5A 4NAXA 5CO3A 4OCEA 5JCUA 5IQYA 3HZ4A 1PQNA 4F03A 4K9ZA 2PVOC 1FHEA 1O6JA 1RW1A 1B9YC 4NWYA 2AV4A 3E3EA 6GSUA 2FWHA 2K6VA 4L5LA 4AJ8A 1K0OA 1K0BA 2WJUA 2BTOT 4KB3A 3ZVJD 1OKDA 2GGTA 5G30A 1XOAA 2GZYA 4N0VA 2FNOA 3F4TA 1EEJA 1V57A 1HYUA 3Q18A 1YKAA 4OMVA 3TJKA 1K0DA 1EV4A 1GSYA 2VCZA 4D73B 2YV7A 3VLNA 2IFQB 2VL9A 4ZL8A 4POKA 4V1Ag 3IOSA 5J4UA 1KTEA 4DEJA 4RI6A 5FHIA 4QQ7A 3J7Yk 1PGTA 3UIWA 2XHFA 3HJPA 4MF7A 1SL0B 3DVXA 3EC3A 5IMCA 9GSSA 2XPEA 3D6IA 2PERA 1ZGNA 4YAVA 1CQGA 3VURA 2L5OA 1K0NA 5D9WA 3I43A 5KN2A 1DE2A 2HI7A 1S3AA 4MPGA 1GL8A 1VGLA 1YDKA 4EC0A 3FR9A 2YWOA 4CW9A 4ZBDA 2YWMA 2OA7A 3W8JA 3LXZA 3GA4A 3CSIA 2LKUA 4N0ZA 3AY8A 2HFDA 4OFTA 2K8VA 1YF1A 2M46A 3LYPA 1XPVA 3J7Yb 4FIWA 1X9WB 3F3QA 1XVWA 1AW9A 3Q74A 3F8UA 4TKYA 2LTKA 4DSSB 1A8YA 4BVYA 2PPTA 2DIZA 5JWRB 3EURA 3TOTA 2C4JA 3QAGA 5CYYA 1JFUA 1XFLA 4ZB9A 4NHZA 1ERTA 2FA4A 2O89A 3M9KA 3BBYA 5DCHA 4O32A 1EWXA 3EU4A 4V2LA 4EO3A 2VL2C 2VL3A 4OCFA 2DMLA 2MZCA 1DUGA 1SK0A 3GRXA 5AISA 4JEDA 1HQOA 2C3NA 4EE0A 2JZRA 2PU9C 5ENUA 1YQ1A 5IMVA 2O7KA 1W89A 3HVSA 4YH2A 1F37A 2KP1A 3IDVA 2REMA 3MDKA 1SKWB 1O8WA 3F6DA 4KSMA 4WKWA 5F0GA 3PH9A 1RQMA 5ID2B 3F3RA 2WRTA 4DVCA 4DSRA 1B4PA 5CRWA 5IPHA 4TVEA 3KCMA 5H5RA 1AAZA 2YWNA 2H0IA 3K8NA 1BG5A 3FW2A 1XWAA 2OADA 1A2LA 2H1AA 5DQYA 2LQOA 4TW5A 4O92A 2L5LA 3ED3A 4P3YB 2L4QA 2B5XA 3HZ8A 3RHBA 1Y6EA 2I1UA 22GSA 2HZEA 2HE3A 2AUVA 4BPYA 1H4OA 2RUEA 2AYTA 4XRDA 1H75A 3PGTA 4KH7A 3O3TA 4ACSA 4Q5RA 1PKZA 2F9SA 1G6YA 3DRNA 3ZREA 1WRYA 1TI3A 2EIRA 3DKSA 3IR4A 1A24A 4LL4B 3ZTLA 4GXZA 3QFAC 3FZ5A 2DJJA 2NTOA 2X8CA 3TKPA 1XWCA 2NBSA 12GSA 1BAYA 1I5GA 1THOA 4J2FA 1X5EA 4OFNA 5JCWA 1TRUA 5AIXA 2WGRA 4L8EA 2LSTA 3SBCA 2CV4A 3BCKA 2OE3A 5IPGA 1SJ6A 5DDLA 4RQXA 1U3IA 1NM3A 3D21A 4QL7A 1GNEA 2JSZA 1ON4A 1U88A 1X9MB 2FHEA 4XS4A 2G0FA 2H30A 5ELGA 2V6KA 4MZCA 3RBTA 2H0HA 2F51A 2A2SA 1Z5YE 5A4VA 3GTUA 2C0EA 4POLA 3ZYWA 4TXVA 4NPBA 1GULA 3DIEA 1K0AA 2GSSA 2CVKA 1M0UA 3ZIVA 2IMKA 1NHOA 3VWWA 4NXIA 4MP4A 3H79A 4POMA 2MBTA 1FW1A 1GUMA 2IMEA 5CREA 3QAVA 3U6VA 6GSWA 4ZIJA 1XW6A 1ZMAA 3WT2A 1SKSB 4OD7A 3GKMA 2CT6A 2OE0A 3FY7A 1MDKA 3EE2A 3LG6A 2V32A 4AGSA 1A8LA 1OAZA 5HFKA 1MD4A 1YY7A 2LJRA 2CZ2A 2C3QA 1PKWA 2Z9SA 3SWLA 1SK1A 3GL5A 1ZYQB 4Q5QA 5ECHB 4KE3A 3CSHA 3JCML 3VWVA 2DSAA 4TXOB 2HLSA 2YOIA 2N5AA 1YEXA 4WEYA 3ZZXA 18GSA 2C0DA 4WF4A 1ABAA 10GSA 3BJ5A 1T8EB 3RHCA 1FB0A 4HQZA 1QK8A 3QFBC 3TKQA 2KLXA 2VD0A 5J9CA 2H1BA 2YJHA 1WWJA 3IK9A 3P7XA 2F8FA 2H0GA 1ILOA 1Z6MA 2ZUPA 5B6NA 3WGDA 3GIXA 1SJZA 5H5SA 1WOUA 3TJGA 5JCGA 1BEDA 1R5PA 3KJYA 3GSSA 3OR5A 3CRUA 5EPFA 4I97A 1XVQA 4GTUA 4L5OA 2AB6A 1O81A 3KXOA 3VI5A 4IKHA 2CA8A 3D0ZA 1X5CA 5B8AA 1SYXA 2PVQA 1B48A 2DJ3A 4KSOA 4JBBA 2PMTA 3QR6A 2HSYA 2GDRA 1G7OA 1WJKA 6GSTA 3E9JB 3ZMLA 1FB6A 3RDWA 4LMVA 4MA9A 3ISOA 4ECJA 4WBJA 5IMDA 2MMZA 3QD9A 3GSTA 4F0BA 3KH9A 1C72A 3PINA 1XW5A 1LU4A 4PXOA 3ERWA 2HT9A 4GCIA 3ME7A 2H73A 2LS5A 1M2BA 1PRXA 2CAIA 3TKSE 2JU5A 4MJBA 1A2MA 5LCZA 1A0RP 4G10A 4KUNA 3ZRDA 1A0FA 2P0GA 4N30A 1M7TA 1PL2A 3N9JA 2H1GA 1T1VA 1GUKA 4GRFA 4CHSA 3CYNA 1KBNA 1GH2A 5IO0A 4MDCA 2MMOA 3D4MA 1EP8A 1XWKA 2YCDA 3CMIA 3CBUA 3IK7A 3HXSA 3A2VA 3KM6A 2FWGA 4MH3A 2B1LA 2NVLA 3HJMA 3L78A 3IPZA 5CRDA 3TKSC 3GX0A 4KAEA 5EY6A 3DD3A 2DJ2A 1TJDA 5D8IA 3IV4A 2GT5A 4TR0A 3A3TA 4HZ4A 4IQ1A 2VCXA 4MLYA 5AN1A 3UOMA 5D93A 3KMOA 3TB2A 4J56E 3KMNA 3HCZA 4I2TA 4PNGA 1GTAA 3IXRA 5HFIA 3HA9A 2R2JA 3HVXA 4X43A 2B1KA 4FYUA 1TP9A 5DAKA 2LNSA 3LGCA 3CSJA 3WGXA 2FY6A 2HRFA 5IO2A 5ELAA 5KN3A 1XOBA 3C1RA 3IA1A 4KA0A 17GSA 2GZPA 2AAWA 2C3TA 3EMPA 2FD3A 1WMJA 2KUCA 2L59A 3A2XA 3FK8A 2R4VA 4K7OA 3APQA 1G6WA 3TRQA 4IS0A 1W4VA 1Q4JA 4GQFA 1FVKA 2YJ7A 5HR0A 1M9BA 2B3SA 1V98A 3WGEA 1YKCA 2YANA 1S3DA 4LLRA 4ECBA 4HDEA 3GFKA 1J0FA 3QPMA 4HJ2A 1VF1A 5G2ZA 5CRGA 2LJKA 3IE3A 2PBJA 4MF6A 5D9TA 4PURA 5E59A 3VWUA 2I4AA 2VM2A 4G2EA 4TR1B 4O5RA 2VCVA 5D9XA 4K7IA 4EF0A 3HJOA 4K7NA 2FA8A 1SK2A 2M72A 3GUSA 4HJMA 4KW6A 3IAM2 1V2AA 2YPMA 1M99A 2H8LA 3LXTA 2EIOA 3ZFBA 2H6YA 3CTFA 2GSRA 6GSSA 2FWEA 3I6AA 1PA3A 4K6XA 4ULXA 1OC3A 2B5EA 1GNWA 4F82A 3M0FA 2B6MA 2C1YA 2H76A 2IPAA 4XTSA 5FT3A 1AC1A 4GWRA 2JSYA 3LYKA 1EOHA 4FYBA 2I9HA 4HU7A 1XXUA 3ZMKA 5HR3A 1GSUA 3Q6OA 5C00A 3FZ4A 1HNAA 1ZZYA 1GRXA 4ZB6A 3TGZA 6GSYA 2ON5A 4EDZA 3P2AA 5IIZA 2E7PA 2YZUA 2YN1A 3ZFLA 2A4VA 3HDCA 2LUSA 5E4WA 4O7HA 3IAS2 2CVBA 2GLRA 2OBIA 3DWVA 4MABA 3ZL5A 4HEA2 3D22A 4ZL7A 1TK0B 3BCIA 1V58A 2IMFA 4PUAA 1ERUA 1K3LA 2WULA 3Q19A 3UJ1A 1XW9A 4CDOA 4WR5A 1E6BA 5ECQB 2RM6A 4EDYA 4GSSA 1TDIA 5DALA 4ECIA 1ST9A 2WS2A 5DJMA 6GSVA 1R5AA 2LRNA 4XHMA 3QDNA 5IOXA 4K0NA 1T3BA 2O85A 1N2AA 5GAPD 3F4RA 5GSSA 2WFCA 5F8BA 1B9XC 4ZBBA 5ECSA 2NPBA 5J41A 5IMZA 4GF0A 1F2EA 3FYGA 4JRRA 3S9FA 3C71A 2GQLA 1O8XA 5LNKe 3O76A 1X5DA 1XCCA 1XZOA 3QAWA 5IMFA 2IWTA 2CQ9A 3CTGA 3GL3A 1GSFA 4EXJA 3HVVA 2C8UA 4PQHA 2YV9A 5F07A 3GNJA 4K0GA 1FAAA 2P5QA 1TK5B 1ERVA 3FEUA 4E8HA 4K2DA 1J08A 4TOPA 5B7CA 2R5GA 5D73A 3FZAA 5GZZB 3ZIJA 3C1SA 4LA1A 4ZILA 4MJCA 1YF0A 2C0GA 3TCOA 2ZCTA 5COHA 3CRTA 5LD0A 1XBSA 1NSWA 4MJAA 1DBYA 1AUCA 5CNWA 3KEBA 1TK8B 6GSXA 1TRSA 2IN3A 1QXHA 1Z7PA 3C8EA 2H6XA 1ACVA 1GSSA 1AQVA 2B7JA 4X1UA 3GX8A 3C7MA 1MDJA 3EWLA 4QL9A 1F3BA 3HYPA 1OKTA 2C80A 2H6ZA 3HHVA 1Z6NA 4F2IA 1K3YA 4KDXA 4L0WA 1DSBA 2H72A 4RUVA 4HU9A 5B8BA 1RK4A 4EVMA 4IHUA 1G0TA 4GLTA 4LMWA 5DQSA 3APOA 4HI7A 3ZVJA 3GMFA 1TXXA 2OJLA 3E0UA 3UAPA 1TOFA 3TJFA 3M1GA 2X8GA 5EL8A 4TRXA 5DCGA 1GLPA 2LRTA 1KNGA 2JL4A 4DSQA 2PGTA 2LNTA 4HOJA 1S3CA 3BOAA 3F0IA 8GSSA 4EL1A 3TRXA 2WCIA 3IHQA 20GSA 5DALB 2HZEB 3PR8A 1PMTA 1JHBA 1SJIA 1AQWA 4JR4A 4HUAA 5CRHA 4KX4A 1JLWA 4KCEA 3CXGA 4G19A 5J9BA 2WZ9A 4MMMA 1AXDA 3NZNA 4V2NA 2QKEA 1U3AA 2BJXA 2HYXA 1SL2B 3GURA 1K3OA 2E2MA 4G9HA 1X0RA 5GAND 1NW2A 2GVPA 2QGVA 3DEXA 2VCWA 3F9UA 2VIMA 1EOGA 4Q5NA 4ECCA 1EV9A 3UVHA 2MYGA 3F4SA 2AJQB 2YWIA 2TIRA 4BWSA 4I5QA 2VCQA 5ABRA 2ALBA 1YZXA 3U5RE 2F8AA 4GQCA 4F0CA 4MZWA 1HD2A 1U87A 4D73A 5CAXA 1OE8A 1FOVA 2IFQA 4XS6A 3M3MA 2DJKA 1UC7A 1R7HA 2L4CA 1BQ7A 3KH7A 1WP0A 1O7UA 1PD21 4XS4B 2DMMA 5ECPB 3VFIA 1SD8A 4MJEA 3UVTA 2VL2A 4Q5FA 3IBHA 3GH6A 2GSQA 3US3A 4IELA 1JZOA 1O73A 1K0CA 4IBPA 5HFGA 3GTUB 3GKNA 19GSA 1OC8A 4AJ6A 3GYKA 2VM1A 1WIKA 5ECLB 4JZQA 1OE7A 5JWOB 4FO5A 2LQQA 3M9JA 5ECIB 2CAQA 3KGKA 3WT1A 2OE1A 3FR6A 5FWGA 3GN3A 11GSA 5J3RA 2LRCA 1TU7A 1AIUA 3KTLA 5G31A 16GSA 3UL3A 4YQMA 3GHAA 1MD3A 5A5KA 3TKRA 4J57E 4AF2A 3HY2A 2YP6A 4JR6A 4NMUA 3L9SA 3TRPA 3KP8A 2DJ1A 1TRVA 4RI7A 4V2MA 1YEPA 1F6MC 1XWBA 3TDGA 2K8SA 2GTUA 2IIYA 1BYEA 1J9BA 3VI7A 2G2QA 4IW9A 2HRNA 4ZB8A 2H75A 4IP1A 4MCUA 1EGRA 3V1WA 2GS3A 2MMAA 4AJ7A 3LORA 4IVFA 4ML1A 3TUEA 2V2GA 1SL1B 3M8NA 4ZL9A 1AQXA 1JZDA 4NV5A 2VOCA 5IMAA 2DLXA 4IJIA 4IQAA 2R6KA 2H1DA 1ZL9A 4NHWA 3W8SA 2VAFA 4I8BA 2VLVA 4YAPA 3RPPA 3KIJA 2PN8A 3IC4A 1UVZA 4KDYA 2KOKA 3DMLA 5ECKB 2ES7A 3MWHA 1GSDA 2X8HA 1KEBA 1WPIA 5DBQA 5ID2A 4ML6A 5ECOB 5GSTA 2VLUA 4LL1B 2GQMA 2JZTA 3TJBA 2O8VB 4F9ZA 3O6TA 1R4WA 3TJJA 2B7KA 3H1NA 5A4UA 13GSA 4NV2A 1B8XA 1VF3A 3MSZA 1GTUA 3LWAA 4ZBAA 4WBRD 3NOFA 3C73A 4N11A 3GKKA 2R37A 5G5EA 2TRXA 3QMXA 3L9UA 3R2QA 4BL7A 1TTZA 3KTBA 1LJRA 1USBA 3H8QA 4FYCA 5ECMB 4PX1A 2FUG2 4BA7A 3EYTA 1GWCA 1BJXA 2V41A 4TN8A 2N5BA 3G9BA 3FKFA 1GSQA 1M2AA 5F06A 5AIVA 4X0XA 2D2ZA 4PQ1A 2LEGA 2HZFA 2TRCP 5KEJA 4TR4A 2V1MA 3ZITA 1GP1A 5L71A 3A2WA 1UA5A 5J5NA 4YQVA 2PWJA 2X64A 2YNXA 1QQ2A 1MDIA 1JZWA 1CQHA 1K0MA 1T4YA 3LJRA 3VPQA 3DVWA 2CX4A 1O85A 1EEMA 1Y25A 2EC4A 1PL1A 5DJLA 2H74A 4ISDA 2CVDA 4ZXGA 2R3XA 2J9HA 3D4TA 3P8WA 3BD2A 3LSZA 5A4WA 2P31A 3W6GA 3F63A 4HQSA 3L4NA 2BMXA 3KD0A 4MZBA 1PN9A 4XIHA 3I9V2 2HSHA 5DVBA 3L9VA 3UARA 1WE0A 1GSEA 3KP9A 2QSIA 5DAKB 2LJAA 2KHPA 1IYHA 2XBQA 3UMAA 2E2GA 1I9DA 2JACA 2JZSA 4MF5A 1SKRB 4HS1A 2M80A 5C04A 1URMA 5EVOA 1Z3EA 2VUPA 4TR3A 1ERWA 2H01A 3G7YA 5CP1A 5D96A 3H4KA 2B5YA 1OYJA 4XRAA 1FG4A 1U6TA 3I69A 2RIIA 2WDUA 2OACA 2V6OA 2XC2A 2IJYA 1OC9A 2C0FA 3DXBA 4WETA 3RAZA 3VK9A 3APSA 1EGOA 3G7JA 2J23A 3UBLA 2CX3A 1NHYA 4GSNA 4TXOA 1PSQA 2H71A 4V1Ap 5IOWA 2MBSA 1B4QA 1VF4A 4XCSA 1UN2A 2RUFA 1G7EA 1V40A 2N5FA 1PX7A 1Z9HA 5HR1A 1SYRA 2VD1A 3RPNA 4POBA 1XIYA 2VO4A 3EMXA 1GLQA 4Z7XA 4JU5A 1T7PB 4BWQA 5KN0A 2OKAA 3H93A 5KN1A 3FHKA 4OFMA 2H66A 4IN0A 2F3MA 5D9VA 1JZRA 2JADA 3A5WA 4WXTA 2KP2A 2HNLA 3DYRA 3ERGA 3L0HA 1QGVA 1HNCA 2L6DA 3UEMA 2PUKC 3GKXA 1V9WA 1OVNA 1Z7RA 2FLSA 2EIQA 4RQRA 4FH8A 1MTCA 3TKSA 2IL3A 4XS1A 1M2DA 4JE1A 2DC5A 2RM5A 1FVJA 4EKZA 1FO5A 4I2UA 1GTIA 4H86A 1ML6A 5IM9A 1XWGA 2A2RA 5ECRB 1SENA 4MK3A 1E2YA 1QFNA 2YZHA 2GZZA 3FZ9A 4PUFC 3QOUA 2O87A 2H19A 2GQKA 1TI1A 1X9SB 4MH2A 2VCTA 3GH9A 2IMDA 3MNGA 5INYA 3VPTA 5H5QA 3IRAA 1QUWA 1TKDB 2QC7A 2GT6A 2FWFA 2ON7A 1A23A 2VLTA 5G1LA 4I6XA 4PQIA 4GSTA 4N10A 7GSSA 1VF2A 1YJ6A 4OO5A 4PNFA 2GSTA 2AHEA 3EVIA 2P5RA 2XBIA 1SU9A 4IGJA 3G7IA 3ZLPA 5B6MA 1OC9B 2MMNA 4BVXA 3P90A 1ZOFA 3VWXA 1HNBA 2IMIA 3ERFA 4EUYA 3DGQA 4ID0A 2X99A 1EZKA 5AGYA 4KDUA 2L57A 1QMVA 4L0UA 1R26A 1T00A 2H70A 2DIYA 5JWQB 1ZYEA 4OWYA 1TU8A 4PGTA 4ILFA 4K8MA 4K1FA 3WD6A 1ZCPA 4MPFA 1SD9A 1DE1A 3LQ7A 1GTBA 3F6FA 5G1KA 14GSA 1TW9A 3UBKA 3EINA 2FCHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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