The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
20
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JU5 C; 4HCK A; 2DL3 A; 1WYX A; 1WI7 A; 2FG0 A; 2JMA A; 2EQI A; 3NGP A; 5IXB A; 1H92 A; 1OOT A; 1T0J A; 2J6F A; 4Z8A A; 2K7A A; 4CC4 B; 3H41 A; 4RTY A; 1GCP A; 2YUO A; 2YSQ A; 2M51 A; 3SEM A; 3U23 A; 3VRZ A; 4J9E A; 2YUN A; 2ENM A; 1UJY A; 1U3O A; 1FMK A; 3H0I A; 1RLQ C; 1YWP A; 4Y92 A; 3FJ5 A; 1AZG B; 2OAW A; 2DVJ A; 1CSK A; 2CH4 A; 4AG1 C; 1U06 A; 4LE9 A; 1RLP C; 3EG3 A; 2A28 A; 3H0F A; 2RQR A; 1AZE A; 4AFZ C; 1SEM A; 1NYG A; 3I9Q A; 4J9G A; 4J9F A; 1KFZ A; 1WXU A; 2EGC A; 3KFV A; 2W0Z A; 1YP5 A; 4LN2 A; 3REB B; 1A0N B; 2KT8 A; 3VS3 A; 1QKX A; 4RTX A; 1K4U S; 2GNC A; 1X2Q A; 2FO0 A; 2JXB A; 2LJ3 A; 1AWJ A; 2PNI A; 1U5S A; 1KSW A; 2D0N A; 4WCI A; 2HDA A; 2CDT A; 2CT4 A; 1CKA A; 2BZY A; 1BBZ A; 2CT3 A; 2JM9 A; 1Y57 A; 3UA6 A; 2ABL A; 1BB9 A; 2J6K A; 2O31 A; 1K1Z A; 2M0Y A; 2L3P A; 1TUC A; 1KJW A; 2RQW A; 4F16 A; 1YWO A; 2DM1 A; 2J6O A; 1NYF A; 1TG0 A; 4JJD A; 4ESR A; 1NLO C; 4GBQ A; 1QKW A; 2DJQ A; 1OV3 A; 2PZ1 A; 1MV0 B; 2L2P A; 2EYY A; 3LH5 A; 2ED0 A; 4JZ4 A; 1VYT A; 2KRN A; 1ZBJ A; 3EHQ A; 4OML A; 2L0A A; 1GFD A; 2LQW A; 4HVV A; 2CRE A; 1AVZ C; 3EG2 A; 1SPK A; 3VS7 A; 1X43 A; 1W70 A; 2LCS A; 1EFN A; 1SRL A; 2P4R A; 4D8D A; 1M3B A; 4DEX A; 3THK A; 4CC7 A; 1CKB A; 2CH4 W; 1SHF A; 2CUD A; 1UTI A; 5GJW B; 1GCQ C; 2AKL A; 2VWF A; 1UJ0 A; 3M0S A; 1UEC A; 2RMO A; 2EGE A; 1XOV A; 1UGV A; 2LJ1 A; 2LJ0 A; 4K11 A; 2KBT A; 2O88 A; 2YUP A; 2MIO A; 2VKN A; 2FRW A; 2K6D A; 2V1Q A; 1NLP C; 1NEB A; 2EYZ A; 3M0U A; 4A63 B; 2DL8 A; 4ORZ A; 1HD3 A; 2W10 A; 1RUW A; 3H0H A; 2DYB A; 1PRM C; 1AWX A; 1PWT A; 5IHK A; 2GQI A; 1ZUY A; 2ED1 A; 2YT6 A; 2ROL A; 1JXO A; 3REA B; 2JTE A; 1SSH A; 1QWF A; 1GBR A; 1M27 C; 1MUZ A; 2K3B A; 4JJB A; 1X27 A; 4QT7 A; 1Z9Q A; 1KIK A; 1OPK A; 1M30 A; 2KYM A; 3VS4 A; 2RN8 A; 3VS2 A; 1I07 A; 1YN8 A; 1GCQ A; 2JT4 A; 1QLY A; 2CUB A; 2F2W A; 1PNJ A; 1ZUU A; 3SHW A; 4RTZ A; 2V1R A; 1M3C A; 1RI9 A; 2X3W D; 2JS2 A; 3I5R A; 1G83 A; 2D8J A; 1JQQ A; 2AZS A; 3PVL A; 1QWE A; 4AG2 C; 2RPN A; 4LUE A; 2J05 A; 2A36 A; 4E6R A; 1T3S A; 2YUQ A; 4JZ3 A; 2DIL A; 1X2K A; 2MOX A; 3A98 A; 1AEY A; 2JW4 A; 2GBQ A; 2X3X D; 3VS6 A; 2EKH A; 1I0C A; 4OMQ A; 4CC3 A; 4F17 A; 2SRC A; 2RNA A; 1IO6 A; 1PRL C; 2KRS A; 1UDL A; 3TSW A; 1N5Z A; 2LX7 A; 4OMO A; 1LCK A; 2QDL A; 2J06 A; 1UE9 A; 5EC7 A; 4F14 A; 5IHI A; 2LNH B; 1WFW A; 2BZ8 A; 2GTJ A; 2DL4 A; 1HSQ A; 2C0T A; 1BU1 A; 4GLM A; 3UA7 A; 2OI3 A; 1H8K A; 1GFC A; 3ULR B; 1V1C A; 1NG2 A; 3RBB B; 1E6G A; 1SHG A; 2LMJ A; 1AOJ A; 4AFU C; 1VYV A; 5L23 A; 2JS0 A; 3UF4 A; 4FSS A; 2BZX A; 1Y0M A; 2EYX A; 3PVQ A; 2OJ2 A; 3QWY A; 1ZUK A; 3EG0 A; 1GBQ A; 1AWO A; 1JO8 A; 2DRK A; 2YDL A; 4CC2 A; 2DRM A; 4M4Z A; 2KXC A; 4EIK A; 2DL5 A; 1E7O A; 4AFQ C; 2CSQ A; 2KXD A; 2J7I A; 1NEG A; 2KE9 A; 1B3Q A; 2XMF A; 3M0P A; 4J9B A; 1E6H A; 3RNJ A; 3O5Z A; 1PKT A; 3TSZ A; 4OMN A; 4RUG A; 1ABO A; 2BTT A; 2ECZ A; 2K9G A; 2ROT A; 1PKS A; 1WIE A; 4J9I A; 1ZSG A; 1QCF A; 2E5K A; 1AD5 A; 1PHT A; 2KYB A; 1GL5 A; 1WDX A; 1HJD A; 2GTO A; 2DF6 A; 2LP5 A; 3GBQ A; 4RTV A; 2EW3 A; 3CQT A; 1M8M A; 3NHN A; 1TUD A; 3VS5 A; 2B86 A; 5ECA A; 1K0S A; 2DMO A; 1BK2 A; 1ARK A; 3EGU A; 1JEG A; 2DA9 A; 2KRM A; 2DL7 A; 2L3Q A; 2F2V A; 2KGT A; 2AZV A; 2A37 A; 2NWM A; 5I22 A; 2DE0 X; 2G6F X; 2D1X A; 1M3A A; 2FEI A; 2DNU A; 3M0Q A; 3I5S A; 2O9S A; 2SEM A; 2PTK A; 3ZL7 C; 3TVT A; 2F2X A; 1OPL A; 1K76 A; 2AK5 A; 4Z89 A; 2RQT A; 2HBW A; 2MCN A; 3EHR A; 5HCK A; 1UUE A; 4KRT A; 1UHC A; 1W6X A; 5GJV B; 1SRM A; 4ZNX A; 4DEY A; 2C0I A; 3M0T A; 1ZLM A; 1JXM A; 1FYN A; 1UFF A; 3VRY A; 2HCK A; 2K2M A; 2EGA A; 1UG1 A; 2DBK A; 1I1J A; 2DX1 A; 4AFS C; 1K0X A; 5FW9 A; 3UAT A; 2A08 A; 1GRI A; 2EBP A; 3EG1 A; 3IQL A; 4JPB W; 2ESW A; 2EPD A; 3C0C A; 4LUD A; 4RTU A; 1J3T A; 4RTW A; 1VYU A; 1ABQ A; 2H8H A; 1X69 A; 1UHF A; 3QWX X; 4OMM A; 1S1N A; 4J9H A; 1OEB A; 1WLP B; 2C0O A; 2HSP A; 2JM8 A; 1WXT A; 4J9C A; 1H3H A; 5IXF A; 2KEA A; 2I0N A; 2FRY A; 1T0H A; 1YNZ A; 3I35 A; 4IIM A; 4RTT A; 2RQU A; 2FPE A; 3JV3 A; 5IH2 A; 1Z9Z A; 2K79 A; 5FWC A; 5I11 A; 4D8K A; 4IIO A; 2RF0 A; 3NMZ C; 3M0R A; 2D8H A; 2AKK A; 5FWB A; 4OMP A; 1T3L A; 4X1V A; 3VS0 A; 2CSI A; 4HVU A; 1WX6 A; 1VA7 A; 3R6N A; 4R0K A; 2IIM A; 2LZ6 B; 2LQN A; 2EVR A; 4HVW A; 3VS1 A; 1WA7 A; 1ZX6 A; 5IHN A; 1MV3 A; 1W1F A; 1YCS B; 2KT1 A; 4JJC A; 2KR3 A; 2HEQ A; 2RQV A; 2L3S A; 2KRO A; 1WXB A; 1NM7 A; 2DBM A; 2DLP A; 1X6B A; 4J9D A; 2FPF A; 1G2B A; 2KNB B; 4Z88 A; 2JMC A; 2FPD A; 2O2O A; 2GGR A; 2NUZ A; 2O9V A; 1K9A A; 4LNP A; 1B07 A; 3PE0 A; 4HXJ A; 1AWW A; 2VVK A; 2EYW A; 3NPF A; 1X6G A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M75 C; 4HCK A; 3M5A A; 3CCJ A; 4JJN K; 3PMT A; 4EMH A; 2JMA A; 3QII A; 5AT1 B; 2FHD A; 4PLI A; 5CAI A; 3EGD B; 4CC4 B; 4LDV A; 3CME A; 2BE7 D; 2YUO A; 2EKO A; 2M51 A; 1N8R C; 2L8D A; 1M2V A; 1UJY A; 2EIF A; 2OAU A; 1FMK A; 4MZP A; 2DTH A; 2LQK A; 3VJP A; 1KQS A; 3CCU Q; 1KK7 A; 1RAD B; 2OAW A; 3EGX A; 2JOY A; 2CZ0 B; 5CCA A; 1CSK A; 4E7J A; 2CH4 A; 4AG1 C; 1U06 A; 4LE9 A; 4NL2 A; 2JN0 A; 1RI0 A; 2DEU A; 3V7R A; 3M4G A; 4WTO B; 3VV0 A; 1BIA A; 2JTM A; 2HMA A; 1QW1 A; 2QGF B; 2RHZ A; 1NYG A; 2KVQ G; 3M53 A; 3PFS A; 4J9G A; 1WXU A; 1WHH A; 2R58 A; 2W0Z A; 1KD1 C; 2KT8 A; 3VS3 A; 3PGG A; 1XJW B; 4J7F A; 2FO0 A; 2QA4 Q; 1D1A A; 1U5S A; 2D0N A; 3RER A; 3TU4 K; 4ELY C; 1G3T A; 3L2Z A; 2JJ9 A; 1BBZ A; 3WXM B; 4PJL A; 1BB9 A; 4LDU A; 2J6K A; 4PLL A; 4ME7 A; 2E10 A; 5FRN A; 1R77 A; 1XTD A; 1YWO A; 2YHT A; 1G5V A; 1VQN A; 3G1J A; 4KUL A; 1K73 C; 3QHS A; 4OB0 B; 4ZGD B; 1M1K R; 5CK9 A; 2COY A; 2EYY A; 1RAH B; 2ED0 A; 4JZ4 A; 1VYT A; 2VC8 A; 2KRN A; 3O8V A; 1SKU B; 2KSS A; 4J8O A; 1OUL A; 1Q82 R; 3CXC P; 3OS0 A; 2LQW A; 3JB9 F; 4M78 B; 1SPK A; 1TS9 A; 2XHC A; 1EFN A; 4D8D A; 1M3B A; 2QEX T; 2E6N A; 3GPL A; 3THK A; 4XTX A; 1CKB A; 4CC7 A; 3OS1 A; 3JB9 D; 1VQP A; 2CUD A; 1UTI A; 4ZGE B; 3MEA A; 4B9W A; 5GAM f; 5A2Q E; 1UGV A; 1KC8 U; 3GNG A; 2YUP A; 2MIO A; 4F04 B; 3ZFJ A; 2K6D A; 1X75 C; 1NEB A; 3X24 B; 3G71 A; 3FB9 A; 2EYZ A; 3M0U A; 4A63 B; 2DL8 A; 2RD1 A; 4QQG A; 2QXF A; 2VGM A; 1VQ8 Q; 4J7I A; 1RAG B; 3CCU T; 4JRI A; 2MAM A; 1PWT A; 3QBY A; 2CP3 A; 2XD0 A; 3CCR A; 2ROL A; 5D6Y A; 5CQY A; 3HTR A; 2JTE A; 1ZSZ A; 5CO7 A; 5GAN 6; 1QWF A; 1GBR A; 5LJ5 d; 3OS5 A; 1M30 A; 2QA4 T; 1ZA2 B; 2RN8 A; 1YN8 A; 2AHJ B; 2JT4 A; 2LVM A; 1ZUU A; 4HCB A; 1M3C A; 4B9X A; 2P0Q A; 1JQQ A; 1QWE A; 2RPN A; 1VQM Q; 2J05 A; 1WHL A; 1NZ9 A; 5C0M A; 2NYS A; 2K3Y A; 4JZ3 A; 2DIL A; 4M7A B; 2DAQ A; 3I56 Q; 1OI1 A; 1FX7 A; 4FIB A; 3CPW P; 2WAC A; 2YWW A; 3M4Y A; 1N5Z A; 3CD6 Q; 4N4I A; 2Y90 A; 3JCM b; 1MMD A; 3LX7 A; 1VQ9 T; 2J06 A; 5EC7 A; 3BY7 A; 4F14 A; 4XQ3 A; 3CCM A; 2E64 A; 2GTJ A; 2PVG B; 4M78 G; 2KMT A; 4XTY A; 1S72 T; 3UA7 A; 2K5L A; 1YIJ Q; 2XDD A; 2NUT B; 3RKY A; 1IHV A; 1V1C A; 4CRI A; 3RBB B; 2LMJ A; 1VYV A; 2VXE A; 5L23 A; 2VYT A; 4FSS A; 2BZX A; 3EG0 A; 2XID A; 2DRK A; 1KC8 C; 3RIR A; 2DL5 A; 4GY5 A; 2KXD A; 5KE3 A; 2J7I A; 2BKD N; 2FVU A; 3OSS C; 3VU3 C; 1NEG A; 1B3Q A; 3L2W A; 1W4S A; 3VUZ A; 4QQ6 A; 2FZC B; 1PKT A; 3LW5 E; 4OMN A; 3CC2 T; 2QYZ A; 3MP1 A; 1YJW Q; 2K9G A; 2ROT A; 3CCL Q; 2DTI A; 3P8H A; 3CEY A; 1ZSG A; 1KQ1 A; 4BAC A; 1PHT A; 2KYB A; 1BIB A; 3A8H B; 2EW3 A; 3A8O B; 4FM4 B; 1VQ4 A; 1O75 A; 3VS5 A; 2B86 A; 3JCM d; 5ECA A; 2RA2 A; 3EFR A; 5D6W A; 2QG9 B; 5FRM A; 1K0S A; 1JEG A; 1QVF S; 1U8R A; 4M77 E; 1LOJ A; 5LJ5 h; 4DQ2 A; 3M55 A; 1IGQ A; 3LYI A; 2A37 A; 2NWM A; 3CMA A; 2I2L A; 2DE0 X; 2D1X A; 2FEI A; 1YCY A; 2DNU A; 5EG2 A; 1FMW A; 2O9S A; 3PMI A; 4M7A E; 1VQM T; 3TVT A; 2F2X A; 2MPX C; 2X4W A; 1RAB B; 1K76 A; 2DZ9 A; 3CC4 T; 2X4J A; 4Z89 A; 4BE0 A; 5GAN 3; 4M7A G; 2RO0 A; 2RI3 A; 3ER0 A; 3I56 T; 2OTL T; 4QW2 A; 2O4X A; 4JRP A; 4JDS A; 1ZLM A; 1JXM A; 1UFF A; 2LT1 A; 1IHW A; 2P84 A; 2EQJ A; 4M7D F; 3CD6 T; 4J6W A; 2DBK A; 1I1J A; 3C12 A; 1WHM A; 3KXT A; 1K0X A; 5FW9 A; 3JCM J; 2E3H A; 4C92 C; 3CCS A; 4ZN1 A; 2DEQ A; 3IQL A; 2KK4 A; 2LQ8 A; 4FYV B; 4M7D D; 2JUF A; 3L2R A; 3L1A A; 4RTU A; 4C0D B; 3LGF A; 1W2B S; 3MCA B; 3S3M A; 2CKK A; 1QVG P; 2ZGW A; 3G7Z A; 1IGU A; 2C0O A; 2JM8 A; 1YBY A; 3OYY A; 3LLR A; 1NPP A; 2GQV A; 5LL6 S; 4IUV A; 3HL8 A; 1ZA1 B; 2OX7 A; 1K73 R; 2KEA A; 1WJR A; 1YNZ A; 2L5Q A; 4EPC A; 4LDY A; 5GAN 8; 4C8Q C; 4A4H A; 4ELZ C; 2RJC A; 2F5T X; 2K79 A; 2PVD B; 4D8K A; 3G6E T; 2VGN A; 4PJN A; 3NMZ C; 5CR2 A; 2QTX A; 2AKK A; 1OU8 A; 5IN1 A; 1QCO A; 3V8K A; 2K4Y A; 3GP8 A; 3RMQ A; 1WX6 A; 1M1F A; 3I55 Q; 3HKS A; 3R6N A; 1PCX A; 2QK0 A; 2EVR A; 3CXC A; 4HVW A; 4XAX B; 1ZX6 A; 3CCJ Q; 3QDR B; 4JJC A; 1XNI A; 2L3R A; 1UGP B; 4E47 A; 2F69 A; 2HEQ A; 3CME Q; 3MP6 A; 2RQV A; 1O9S A; 3OW2 P; 1YI2 A; 4C92 B; 2DBM A; 1VQO A; 3KUF A; 2CZ1 B; 1BYM A; 1YHQ T; 2L89 A; 3JCM h; 1WGS A; 4MZT A; 4PJO B; 4R56 A; 3J81 E; 2CP0 A; 2GGR A; 3BDU A; 2BUD A; 2O9V A; 4LNP A; 2LTO A; 2LCL A; 3J80 E; 3NPF A; 2HKQ B; 1DJ7 B; 2M0O A; 1RAI B; 2V26 A; 5GMK l; 1WI7 A; 3OYE A; 2EQI A; 1TH7 A; 4A4E A; 3HRT A; 1H92 A; 1QP3 A; 1B34 A; 2J6F A; 2K7A A; 3H41 A; 4RTY A; 1GCP A; 1D3B A; 4C8Q B; 3SEM A; 3U23 A; 1R0C B; 4Y28 E; 1WQ7 A; 4J9E A; 4A4K A; 5AYF A; 1LNX A; 4E7S A; 3OW2 S; 2WSC E; 4Z02 A; 1U3O A; 3H0I A; 4Y92 A; 1M1G A; 4F7U B; 4KGZ B; 2DVJ A; 3RMS A; 3A1P A; 1M2O A; 2OTJ T; 1JJ2 S; 3H0F A; 1AZE A; 5D7U A; 5LJ5 g; 1YP5 A; 4LN2 A; 4XTZ A; 3REB B; 4X9D A; 1QKX A; 1PD0 A; 1K4U S; 4O5V A; 4M7A A; 2GNC A; 2LCC A; 4E7H A; 3H6Z A; 1VQL A; 1AWJ A; 3HFO A; 2HDA A; 3X28 B; 1R0B G; 5J26 A; 2BZY A; 5LJ3 g; 1MND A; 4HA8 A; 3UA6 A; 5KYY B; 3FC3 A; 3X20 B; 3MEW A; 2O31 A; 4B6M A; 1VQ7 T; 1YJ9 T; 2M0Y A; 5CKH A; 4IUT A; 5GAO p; 3CPW A; 2QQR A; 1K8A U; 4F16 A; 1KHI A; 2J6O A; 4IUP A; 4X9C A; 4JJD A; 2K2V A; 3G4S A; 1VQ5 Q; 1QKW A; 1OV3 A; 2VV5 A; 2PZ1 A; 4XU2 A; 1OZ2 A; 1MV0 B; 2L2P A; 4RMO A; 1VOM A; 2CP5 A; 4GLK A; 3LH5 A; 2QAS A; 4PJO E; 1G3Y A; 2L0A A; 3L2Q A; 1BKB A; 1WJQ A; 3G71 Q; 4HVV A; 1AT1 B; 1UEB A; 4PJO G; 3EG2 A; 2EAY A; 2X9H A; 3BE3 A; 3VS7 A; 1X43 A; 2LCS A; 1SRL A; 3OYI A; 1YIT A; 4DEX A; 2RHY A; 3EH2 A; 3CCR Q; 1GCQ C; 4ZN3 A; 2AKL A; 1UJ0 A; 3M0S A; 1R8O B; 2EWN A; 2E4H A; 2LJ1 A; 2HQH A; 2QAZ A; 4C0G A; 3HRS A; 3M54 A; 1G3W A; 3OB9 A; 3OYB A; 5GAO l; 3CCE A; 4JRQ A; 1KHC A; 4HT8 A; 1Q7Y R; 1NLP C; 1YJN A; 1NJI U; 1MMA A; 1VQ6 T; 4F7U G; 3F70 A; 1RUW A; 4DBF A; 1AWX A; 2K57 A; 4OGC A; 2VAS A; 4HKE A; 2YT6 A; 2HL3 A; 3CCV A; 3ZBD A; 3REA B; 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