The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Protein binding
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| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
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| total genus |
20
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| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RN8 A; 5L23 A; 2NWM A; 2X3X D; 3H0I A; 1WDX A; 4LUD A; 3JV3 A; 2BZX A; 1HSQ A; 4OMQ A; 1IO6 A; 1UTI A; 2RF0 A; 4J9G A; 3NPF A; 2LNH B; 4CC2 A; 3CQT A; 1JU5 C; 4RTX A; 2F2X A; 2FEI A; 1UDL A; 2DL4 A; 2W0Z A; 3IQL A; 4WCI A; 3VRY A; 2A37 A; 2LJ3 A; 4HVV A; 1KFZ A; 2DL3 A; 1RUW A; 4AFU C; 3VS5 A; 2FPD A; 1QLY A; 2DA9 A; 3EG1 A; 2DF6 A; 2HBW A; 2J06 A; 4E6R A; 2CSQ A; 2FRY A; 4DEY A; 1SHF A; 4OML A; 4ZNX A; 2DBK A; 3A98 A; 1X6G A; 1T0J A; 5FW9 A; 1OPK A; 2OI3 A; 1I0C A; 4CC7 A; 3M0P A; 3C0C A; 4J9C A; 1Y0M A; 4GLM A; 1WXU A; 2VKN A; 2RQT A; 2EYZ A; 4CC4 B; 2ECZ A; 1OV3 A; 3EHR A; 5ECA A; 2K2M A; 5IXB A; 4HVU A; 2FPE A; 2K7A A; 2K79 A; 2AZS A; 1AD5 A; 2A08 A; 1M8M A; 2HDA A; 1S1N A; 4J9H A; 1V1C A; 1CKA A; 2CUD A; 2KXC A; 2MCN A; 3I9Q A; 1M30 A; 2K9G A; 1AOJ A; 2YSQ A; 2DL5 A; 3VS1 A; 2GQI A; 1GFC A; 3H0H A; 1VYT A; 2ROL A; 1QKW A; 2ESW A; 2F2V A; 3H41 A; 3M0U A; 2CUB A; 1BB9 A; 1AWJ A; 4D8K A; 4GBQ A; 3EGU A; 2HCK A; 2JS0 A; 2KRO A; 4F16 A; 2KRN A; 2J6F A; 2M51 A; 1BU1 A; 4IIO A; 1JXO A; 2L0A A; 1AWX A; 2VWF A; 1JXM A; 3EG0 A; 1H3H A; 2HEQ A; 3PE0 A; 1NG2 A; 2AZV A; 1B3Q A; 2KR3 A; 1I1J A; 2SEM A; 4LE9 A; 1E6H A; 2H8H A; 1UUE A; 1MUZ A; 1ABO A; 2YUQ A; 1GCQ C; 2KE9 A; 1X6B A; 2YUO A; 4Z88 A; 2M0Y A; 5IHK A; 2EGC A; 2YUN A; 1U06 A; 4J9I A; 4M4Z A; 2RQV A; 1GRI A; 2RQR A; 4RTW A; 2EW3 A; 3M0T A; 5FWB A; 3U23 A; 2HSP A; 1WFW A; 1GBQ A; 2ABL A; 1UHF A; 2DYB A; 2JTE A; 2RPN A; 4IIM A; 3R6N A; 1X2K A; 2ED0 A; 2G6F X; 1UG1 A; 1ZBJ A; 1BBZ A; 4J9E A; 1G2B A; 4JPB W; 1ZX6 A; 2DJQ A; 5GJV B; 1M3A A; 1TUD A; 3VS2 A; 1WIE A; 2JM9 A; 3NGP A; 4KRT A; 5I22 A; 1TUC A; 1Y57 A; 1FYN A; 1QKX A; 1EFN A; 2YUP A; 1KIK A; 3M0S A; 1HD3 A; 1PHT A; 2DNU A; 2LP5 A; 2RMO A; 3M0R A; 4HCK A; 3EG2 A; 2GNC A; 1ZUU A; 2A36 A; 2C0I A; 5IHI A; 2O9V A; 2ED1 A; 2JS2 A; 2MIO A; 5FWC A; 3QWY A; 2ENM A; 2CT4 A; 2DE0 X; 3RNJ A; 2LX7 A; 3FJ5 A; 2O88 A; 2PTK A; 2JT4 A; 2O31 A; 1KSW A; 4ESR A; 2EGE A; 1MV0 B; 1OOT A; 5IXF A; 2JW4 A; 3UF4 A; 1SHG A; 1K0X A; 2FRW A; 1H8K A; 1NM7 A; 4LUE A; 4Y92 A; 2JMA A; 1NYF A; 2LMJ A; 2KT8 A; 2RQW A; 2F2W A; 3EG3 A; 2I0N A; 5GJW B; 3TSZ A; 3VS4 A; 2LZ6 B; 2CDT A; 3NHN A; 2PZ1 A; 2KXD A; 2J6O A; 1X27 A; 4JZ3 A; 1UFF A; 4R0K A; 3UAT A; 1M3C A; 1Z9Z A; 2L3P A; 4K11 A; 2L3S A; 4JJC A; 2DLP A; 1K0S A; 1NEB A; 3EHQ A; 3M0Q A; 2KRM A; 1VYU A; 1A0N B; 4RTV A; 1AZE A; 2BZY A; 3ZL7 C; 1GBR A; 4J9D A; 1PRM C; 3I5S A; 2EYY A; 2RNA A; 1OPL A; 1YWP A; 2DL8 A; 1SPK A; 2J6K A; 3I5R A; 2KEA A; 4DEX A; 2D1X A; 2KT1 A; 2DM1 A; 3TSW A; 1T3S A; 1XOV A; 2DMO A; 1I07 A; 1AWW A; 2SRC A; 2IIM A; 3SEM A; 2AKL A; 2CH4 A; 2BZ8 A; 5HCK A; 2K3B A; 1QCF A; 1SSH A; 2C0O A; 2O9S A; 2LQN A; 4ORZ A; 3PVL A; 4OMP A; 3KFV A; 1YP5 A; 1JEG A; 2JXB A; 1SRL A; 4X1V A; 2OAW A; 1ARK A; 2L2P A; 4JJB A; 2EKH A; 2VVK A; 2PNI A; 2EGA A; 2KGT A; 3SHW A; 1QWE A; 4F17 A; 1YN8 A; 2K6D A; 1ZUK A; 2DBM A; 1WXB A; 1X43 A; 1G83 A; 1RI9 A; 2CT3 A; 1NLP C; 1Z9Q A; 2DX1 A; 1T3L A; 4D8D A; 1N5Z A; 3LH5 A; 3VS0 A; 4HVW A; 2EQI A; 1NLO C; 1QWF A; 3H0F A; 1UEC A; 4AG1 C; 2C0T A; 1WI7 A; 1UJY A; 2YT6 A; 2B86 A; 2P4R A; 2RQU A; 1NEG A; 2MOX A; 2D8H A; 1AZG B; 1RLP C; 5IHN A; 4CC3 A; 2KYB A; 1YCS B; 1M27 C; 4RTY A; 4JJD A; 2YDL A; 2AKK A; 2EYW A; 4RTT A; 4F14 A; 4FSS A; 4OMN A; 1SEM A; 2V1R A; 1GCQ A; 1ZUY A; 1UGV A; 2J05 A; 1ZLM A; 3VS6 A; 1PKT A; 1BK2 A; 2LQW A; 1WYX A; 5EC7 A; 3O5Z A; 1TG0 A; 1W6X A; 2QDL A; 4RTU A; 1ABQ A; 1MV3 A; 3VS3 A; 4A63 B; 3TVT A; 1SRM A; 3UA7 A; 2KRS A; 2LJ1 A; 3RBB B; 2J7I A; 1AVZ C; 1K4U S; 2EVR A; 1KJW A; 3PVQ A; 1PWT A; 1GL5 A; 1W1F A; 1HJD A; 1B07 A; 2CH4 W; 1M3B A; 4EIK A; 2D8J A; 4LN2 A; 2EPD A; 2XMF A; 1RLQ C; 1UJ0 A; 3NMZ C; 3REA B; 4RTZ A; 2A28 A; 1U5S A; 2V1Q A; 1W70 A; 1GFD A; 3REB B; 4HXJ A; 1FMK A; 3I35 A; 1AWO A; 1X2Q A; 1J3T A; 2FPF A; 1E7O A; 2GTJ A; 2O2O A; 2LCS A; 2ROT A; 1CSK A; 3THK A; 1GCP A; 1WXT A; 1PNJ A; 1WX6 A; 4OMM A; 1U3O A; 3QWX X; 1LCK A; 1K9A A; 2W10 A; 4RUG A; 2L3Q A; 1AEY A; 1JO8 A; 4Z89 A; 2KBT A; 2FO0 A; 1UHC A; 3VS7 A; 1PRL C; 2DRM A; 3VRZ A; 2CRE A; 1K76 A; 2JMC A; 4QT7 A; 1CKB A; 4JZ4 A; 4AG2 C; 2FG0 A; 2D0N A; 4J9B A; 1WLP B; 3ULR B; 1JQQ A; 5IH2 A; 2KNB B; 4AFS C; 1E6G A; 1WA7 A; 2AK5 A; 2DRK A; 3UA6 A; 2DL7 A; 2EBP A; 1UE9 A; 1OEB A; 2EYX A; 2DVJ A; 2GBQ A; 1VYV A; 1T0H A; 2GGR A; 2KYM A; 2OJ2 A; 1YWO A; 4J9F A; 2X3W D; 2GTO A; 4Z8A A; 2LJ0 A; 1NYG A; 2BTT A; 2CSI A; 1PKS A; 2DIL A; 4AFQ C; 1ZSG A; 2JM8 A; 1VA7 A; 4AFZ C; 1X69 A; 4OMO A; 4LNP A; 3GBQ A; 2E5K A; 2NUZ A; 1YNZ A; 5I11 A; 1H92 A; 1K1Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5L23 A; 2LDM A; 3CCM Q; 5A0G A; 2NWM A; 5GAO q; 3H0I A; 1BI1 A; 1WHG A; 3JV3 A; 1W2B S; 1YJN Q; 1QP3 A; 2RHU A; 1HSQ A; 4WTO B; 2RF0 A; 4PFZ A; 2EQM A; 5HK3 A; 1UDL A; 3CME T; 3JCM c; 2AT1 B; 3IQL A; 1VQO T; 3VRY A; 4L6V 5; 2LJ3 A; 4HVV A; 5LJ5 d; 4NL2 A; 1VQK A; 2FPD A; 4OB3 B; 2IPO B; 2EFI A; 3EAE A; 3M58 A; 4DEY A; 3OBY A; 4A4K A; 1SHF A; 5GAN 3; 2LQK A; 1YJ9 A; 4OML A; 2DXU A; 2O4X A; 1OPK A; 2OI3 A; 4CC7 A; 2DZ9 A; 2RI2 A; 3J80 E; 4QVD A; 3I56 A; 4BI4 A; 1B7T A; 3M53 A; 4GLM A; 4C5I A; 1WXU A; 2FZK B; 3JCM f; 1G3W A; 5LJ3 g; 1G3T A; 1K8A R; 4OMF B; 3EHR A; 4M78 B; 2K2M A; 3VJP A; 4IUQ A; 2AZS A; 1TTH B; 4FYV B; 1V29 B; 2HDA A; 4N0A A; 1JRI A; 1S1N A; 1VQP Q; 1MMN A; 3CCU T; 1O75 A; 3X25 B; 1AOJ A; 1TU0 B; 2A3L A; 4KBM B; 1FMW A; 1GFC A; 2XU8 A; 2DIQ A; 4J6X A; 3H41 A; 1WJS A; 1SF9 A; 4M7A D; 4F16 A; 3I55 T; 2DTH A; 2M51 A; 2CYZ B; 4XTX A; 2JVV A; 3C94 A; 1WHL A; 2L0A A; 2CS7 A; 3G4S T; 4M7D E; 1ZQ1 A; 3MP6 A; 1SG5 A; 3EG0 A; 1H3H A; 3FC3 A; 2HEQ A; 1NG2 A; 2KR3 A; 3V7C A; 4LE9 A; 1I4K 1; 1MHN A; 2H8H A; 1MUZ A; 1GCQ C; 4IUT A; 4C5E A; 1X6B A; 4Z88 A; 4F7U E; 2RO0 A; 2OTJ Q; 3LX7 A; 2YUN A; 4MDW A; 4J9I A; 4KH1 B; 1I81 A; 2XG8 D; 4M7D G; 2AHJ B; 4RTW A; 2D0Q B; 4XU0 A; 4DA4 A; 3KBG A; 3CXC A; 2ED0 A; 2G6F X; 4C92 G; 2K57 A; 3VUB A; 1BBZ A; 3CCL Q; 4C5H A; 2WAC A; 4JPB W; 4PJM A; 5GAO m; 2JM9 A; 2A7Y A; 4PJO G; 5I22 A; 1I5O B; 3MO8 A; 4C8Q G; 3CPW A; 3HKS A; 2YUP A; 1KIK A; 4FM4 B; 2LP5 A; 4LXC A; 5J3B A; 2X4Y A; 4PL6 A; 1ZUU A; 2A36 A; 2F5K A; 2ED1 A; 3CD6 T; 3RKW A; 4KUL A; 3HRS A; 5C0M A; 5FWC A; 2OAU A; 1VOM A; 3JB9 J; 2O88 A; 2JT4 A; 1VQK Q; 1OOT A; 2ZPH B; 1H8K A; 4Y92 A; 4RCC A; 1NYF A; 2LMJ A; 2KT8 A; 1YIT T; 2YHT A; 1ACM B; 3TSZ A; 3OS0 A; 2XHC A; 2ZPG B; 2KXD A; 4MZP A; 1UFF A; 3UAT A; 1Z9Z A; 4K11 A; 2JN0 A; 4MMK A; 5GAN j; 2DLP A; 1K0S A; 3L2R A; 3EHQ A; 3G4S Q; 1VIF A; 4QVC A; 1VYU A; 4BI3 A; 3TRE A; 4ZTJ A; 1PRM C; 2EYY A; 5KYU A; 2IG0 A; 1OPL A; 3I56 T; 2X4J A; 1IZ6 A; 2K3X A; 3CC4 Q; 2ZPE B; 2J6K A; 1SPK A; 2M9U A; 1U1S A; 3I5R A; 1QVG P; 4PLL A; 5CQX A; 1AWW A; 2SRC A; 3SEM A; 2LTO A; 1VQN T; 5HCK A; 2HBP A; 3QYH B; 1QCN A; 1QCF A; 5FRN A; 3R6O A; 1SSH A; 2O9S A; 3JB9 G; 4M77 D; 2YRV A; 5J39 A; 1OU8 A; 3RIR A; 3G71 A; 4OMP A; 1YP5 A; 1Q81 U; 2Y4X A; 2XID A; 4ANJ A; 1ARK A; 2L2P A; 3T9N A; 3FEO A; 2PU9 B; 2XD0 A; 2EKH A; 2VVK A; 2EGA A; 1K9M R; 4F7U B; 3HHT B; 2K6D A; 1K8A U; 2VB6 A; 1MMG A; 4M78 F; 1RAD B; 2DFU A; 5LJ3 h; 2EJF A; 1G83 A; 3EGX B; 1YCY A; 3J7A F; 3MP8 A; 1NLP C; 2RI5 A; 3OYK A; 4C92 E; 1FXX A; 3SWN B; 4D8D A; 3E19 A; 3LH5 A; 2OTL A; 4C92 F; 2LVM A; 4TVR A; 3H0F A; 1D1B A; 4AG1 C; 4E7J A; 2DAQ A; 2P4R A; 1KD1 C; 3MEU A; 2VC8 A; 4QQG A; 3CD6 Q; 3M4Y A; 1RLP C; 1Q86 U; 4JJD A; 5LL6 S; 4F14 A; 5CKH A; 2V1R A; 1GCQ A; 1ZA2 B; 2J05 A; 3VS6 A; 1N8R C; 1WYX A; 5EC7 A; 3MET A; 1PC0 A; 1RAH B; 2VV5 A; 1D0Y A; 2RHI A; 3UDC A; 4FSX A; 3VS3 A; 3RDV A; 1VQ9 A; 3CCL T; 3OYA A; 2KSS A; 1SRM A; 1X75 C; 2LJ1 A; 2J7I A; 4DOV A; 1OYX A; 1YBY A; 4ELZ C; 4OB1 B; 4AMC A; 4EIK A; 4PNO A; 4DOW A; 4GY5 A; 2E10 A; 1LOJ A; 3NMZ C; 1Q82 U; 2FZG B; 1OZ2 A; 1Q95 G; 3QHS A; 4FYX B; 1VQN A; 3MEV A; 2CP5 A; 3H8Z A; 4A4F A; 5GMK e; 4HXJ A; 1VQ5 T; 2BE7 D; 4A54 A; 5GMK h; 2X9H A; 3I35 A; 1AWO A; 1WGS A; 1J3T A; 2LRQ A; 1E7O A; 3G71 Q; 3JCM e; 3LW5 E; 3JCM h; 3CCM A; 4E7H A; 1LCK A; 4M77 E; 2GFA A; 2W10 A; 3CCQ Q; 2L3Q A; 2QA4 T; 2FO0 A; 4LD9 K; 1UHC A; 2O4X B; 4KH0 B; 1MND A; 1MNE A; 4VUB A; 3JSC A; 1PG5 B; 4QT7 A; 1Q86 C; 1CKB A; 4JZ4 A; 4J9B A; 2D0N A; 1WLP B; 2QQS A; 1C1A A; 2JTF A; 4D6W A; 3CC7 Q; 2AIR B; 5LJ3 f; 4AFS C; 2DJZ A; 4M77 G; 2AK5 A; 3CCV A; 5KCH A; 2DRK A; 2MPX C; 2DL7 A; 1KQ1 A; 3QYG B; 1D09 B; 2GBQ A; 4JLI A; 1WJQ A; 1T0H A; 2COW A; 5CK9 A; 2OJ2 A; 1M1K R; 4HCZ A; 2X3W D; 3OW2 S; 4E7K A; 3INZ A; 5FU6 B; 2GTO A; 2DXC A; 2DIL A; 5GAO p; 1ZSG A; 2VGN A; 1OQK A; 3JRZ A; 1I5L A; 5GAN 6; 4M7A B; 5DLO A; 5KYW A; 2HSE B; 1RL2 A; 4EPC A; 1UGR B; 1D3B A; 3GBQ A; 1IRE B; 1VQM Q; 2NUZ A; 2DXB A; 2GFU A; 1H92 A; 2DIG A; 3JB9 F; 1QP2 A; 1WDX A; 4ZN3 A; 3BDU A; 3CXC S; 4F7U F; 3RUX A; 3E9G A; 3NPF A; 2LNH B; 1TOV A; 3CQT A; 2XK0 A; 1M1F A; 4XU3 A; 2F2X A; 4M77 A; 4GLK A; 4M7D B; 2W0Z A; 1VQK T; 2L5Q A; 4WCI A; 1X01 A; 1Y96 A; 2JTM A; 2DXT A; 1NPR A; 1JJ2 A; 3C95 A; 2FHD A; 3PNW C; 1KD1 U; 2CSQ A; 4FT2 A; 4DBH A; 1N27 A; 3OYD A; 2EQK A; 3F70 A; 7AT1 B; 4E7L A; 2DBK A; 3A98 A; 5FW9 A; 1IXD A; 1I0C A; 3DLM A; 1XJW B; 5HK0 A; 3C0C A; 4J9C A; 5D6X A; 1FMV A; 3ZFJ A; 2VGM A; 1KD1 R; 3DB3 A; 3OQ5 A; 2VKN A; 3OYC A; 1QW1 A; 2EYZ A; 2MAM A; 2ECZ A; 3BW1 A; 3G6E A; 5ECA A; 1VQ8 A; 1M5Q 1; 2JUF A; 2K7A A; 2K79 A; 1AD5 A; 2ZGW A; 2E6Z A; 1M8M A; 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