The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
b'EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
|
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
20
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| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QKW A; 1YWO A; 3VRY A; 4Y92 A; 1YCS B; 1W70 A; 2KR3 A; 1UTI A; 2ECZ A; 3VS1 A; 2O9V A; 4CC2 A; 2FO0 A; 1PRM C; 2DA9 A; 1JXM A; 2DBK A; 2LQW A; 3JV3 A; 4JZ4 A; 1AWJ A; 3VS4 A; 1T3S A; 2FRW A; 1AVZ C; 2LX7 A; 1UG1 A; 2W0Z A; 4EIK A; 1M27 C; 2CH4 W; 1TUC A; 4KRT A; 4Z8A A; 2LCS A; 2DMO A; 4J9F A; 2AZS A; 2O9S A; 2EKH A; 1Z9Z A; 1AZE A; 2K6D A; 2RQW A; 4CC3 A; 2HCK A; 4AG2 C; 2GTO A; 1NYG A; 2FEI A; 2RNA A; 1WA7 A; 3GBQ A; 4AG1 C; 1AOJ A; 4RTT A; 5I11 A; 1WI7 A; 3UA6 A; 2EYZ A; 2KRM A; 2NWM A; 2CT4 A; 2V1Q A; 3NGP A; 1G2B A; 2VWF A; 1ZUK A; 2ROT A; 1NEB A; 1VYU A; 1E6H A; 2L3S A; 2DF6 A; 2FPD A; 5FWC A; 2KEA A; 2ED1 A; 1GRI A; 1ZBJ A; 3VS3 A; 1CSK A; 2RPN A; 2JT4 A; 1NG2 A; 2KNB B; 3CQT A; 4LNP A; 4J9I A; 3REA B; 2PTK A; 2RQV A; 1UGV A; 2DM1 A; 5FW9 A; 1K0S A; 2DRK A; 2P4R A; 4OMN A; 1WXU A; 1UE9 A; 2J7I A; 3O5Z A; 2CT3 A; 2EBP A; 2JS0 A; 2SEM A; 5ECA A; 1QKX A; 4IIM A; 1QCF A; 2BZX A; 2J06 A; 2DL7 A; 2K3B A; 2YUO A; 3I35 A; 1IO6 A; 3ULR B; 3M0T A; 1UFF A; 2NUZ A; 4GLM A; 2AK5 A; 3M0U A; 2KXC A; 1EFN A; 1J3T A; 3U23 A; 3H0F A; 4OML A; 1PHT A; 2A37 A; 2M51 A; 1GFD A; 1PRL C; 4HVW A; 2JS2 A; 1KIK A; 2X3W D; 1SEM A; 1B07 A; 2OI3 A; 4DEX A; 1U3O A; 1GCQ A; 1W1F A; 3TSW A; 1SPK A; 1W6X A; 5EC7 A; 1JXO A; 1M3A A; 4AFS C; 5IH2 A; 4OMQ A; 1RUW A; 2O2O A; 2D1X A; 4IIO A; 5HCK A; 4J9H A; 3NPF A; 2EVR A; 2O31 A; 1H3H A; 1VYV A; 1GBR A; 4DEY A; 1OV3 A; 2FRY A; 3PVQ A; 3PVL A; 1SRL A; 2AKL A; 4OMP A; 2JMC A; 4JJB A; 1AEY A; 5I22 A; 1GL5 A; 2EGA A; 4QT7 A; 2DL3 A; 2LJ0 A; 2MOX A; 3REB B; 4F14 A; 4RTU A; 1RLQ C; 2HDA A; 2JXB A; 4J9G A; 2PNI A; 1QLY A; 1ZX6 A; 1OOT A; 3M0Q A; 1WIE A; 2GGR A; 2DBM A; 2OAW A; 5IHK A; 1M3B A; 3QWX X; 3C0C A; 2GBQ A; 4OMM A; 1JO8 A; 1UUE A; 5L23 A; 1VYT A; 1AZG B; 2AZV A; 1H8K A; 2A36 A; 4RTZ A; 1GCP A; 2LP5 A; 3TSZ A; 1HD3 A; 3A98 A; 1NYF A; 1LCK A; 2LQN A; 1WYX A; 1TUD A; 2D8H A; 1PWT A; 4M4Z A; 4ZNX A; 1Y57 A; 2RN8 A; 2I0N A; 3EG1 A; 1K76 A; 2RQR A; 2EW3 A; 2KT1 A; 2ESW A; 5IHN A; 1M3C A; 4LUD A; 4RUG A; 4A63 B; 1UJ0 A; 4X1V A; 4RTY A; 1I0C A; 2ENM A; 2KXD A; 3EG0 A; 1ZSG A; 3SHW A; 2KRN A; 2ROL A; 3PE0 A; 2JTE A; 2DL8 A; 1ZUU A; 4CC4 B; 3H0H A; 2L2P A; 4LUE A; 3VRZ A; 3VS2 A; 2PZ1 A; 1E6G A; 2KE9 A; 1SSH A; 2CH4 A; 1ARK A; 3EHQ A; 2DRM A; 1WX6 A; 3H41 A; 1CKB A; 2J6K A; 3EHR A; 2EYW A; 1UHC A; 1M30 A; 1YNZ A; 3SEM A; 3EGU A; 4R0K A; 2J6O A; 4JJC A; 2CUB A; 2FG0 A; 2FPE A; 2DNU A; 2DL5 A; 4K11 A; 3TVT A; 2F2W A; 3RBB B; 4FSS A; 1K1Z A; 4JZ3 A; 1HJD A; 1GBQ A; 2E5K A; 1H92 A; 3RNJ A; 4Z89 A; 3UF4 A; 3M0S A; 2L0A A; 2DL4 A; 2OJ2 A; 2G6F X; 1NLP C; 1X6B A; 3FJ5 A; 1OPK A; 2C0I A; 1JU5 C; 1X43 A; 3ZL7 C; 1X2K A; 2HSP A; 2K2M A; 3EG2 A; 2KYB A; 2RQU A; 1S1N A; 3VS5 A; 3IQL A; 4F17 A; 2BZY A; 1GFC A; 2DVJ A; 3I5S A; 1ZLM A; 2GTJ A; 2KRO A; 3UA7 A; 1RI9 A; 1ABQ A; 2EQI A; 2SRC A; 4JJD A; 4HVU A; 2IIM A; 2YT6 A; 1AWX A; 2RQT A; 1N5Z A; 4AFZ C; 3VS6 A; 4D8D A; 1YN8 A; 1FMK A; 2FPF A; 4Z88 A; 1MUZ A; 4RTV A; 1RLP C; 2EYX A; 2XMF A; 2A08 A; 2J05 A; 1I1J A; 2K9G A; 3M0R A; 1ZUY A; 4WCI A; 1YP5 A; 2YUP A; 1BU1 A; 5GJW B; 1VA7 A; 4LN2 A; 1AWW A; 2YUN A; 1SHG A; 2K7A A; 2EYY A; 4AFU C; 4J9D A; 2EGC A; 2KT8 A; 2MIO A; 2M0Y A; 4ORZ A; 1TG0 A; 2EPD A; 1T0H A; 3NMZ C; 2YUQ A; 4J9E A; 2BTT A; 1WDX A; 1CKA A; 2X3X D; 1QWF A; 2W10 A; 4F16 A; 2C0T A; 2ABL A; 1PKS A; 3THK A; 2JMA A; 4LE9 A; 2CRE A; 2YSQ A; 1SRM A; 1PNJ A; 3M0P A; 2KGT A; 1AWO A; 1NLO C; 2DIL A; 1WFW A; 2L3P A; 2KYM A; 2O88 A; 3I9Q A; 2VVK A; 4GBQ A; 1OEB A; 2CSI A; 2RMO A; 2LNH B; 1JEG A; 2L3Q A; 1Y0M A; 3LH5 A; 1Z9Q A; 4CC7 A; 1UEC A; 4RTX A; 1T0J A; 1OPL A; 1T3L A; 2F2X A; 4HCK A; 3NHN A; 1B3Q A; 1UJY A; 4ESR A; 2GNC A; 1KFZ A; 1BB9 A; 1ABO A; 2LJ1 A; 1GCQ C; 5GJV B; 2VKN A; 3QWY A; 2J6F A; 3VS7 A; 2H8H A; 1WXB A; 2HEQ A; 1UDL A; 2MCN A; 5FWB A; 4E6R A; 2B86 A; 1QWE A; 1X69 A; 3VS0 A; 2D0N A; 4AFQ C; 2CUD A; 1FYN A; 4OMO A; 5IXF A; 1XOV A; 3UAT A; 3EG3 A; 2C0O A; 1MV0 B; 1G83 A; 1I07 A; 2DJQ A; 5IXB A; 2CSQ A; 3R6N A; 1NEG A; 1BK2 A; 2KBT A; 1U5S A; 1X6G A; 4RTW A; 2GQI A; 3KFV A; 2DX1 A; 1MV3 A; 2QDL A; 1X2Q A; 1E7O A; 1V1C A; 4HVV A; 1M8M A; 1NM7 A; 1K4U S; 1HSQ A; 1WXT A; 1WLP B; 2K79 A; 1X27 A; 2YDL A; 2V1R A; 5IHI A; 1KSW A; 1SHF A; 2EGE A; 1K9A A; 2ED0 A; 2AKK A; 4J9B A; 2RF0 A; 1PKT A; 2HBW A; 1KJW A; 1AD5 A; 2A28 A; 2DLP A; 4JPB W; 2BZ8 A; 4J9C A; 2LMJ A; 1U06 A; 4HXJ A; 1A0N B; 1UHF A; 2DE0 X; 3I5R A; 2JW4 A; 2LJ3 A; 2JM9 A; 2JM8 A; 3H0I A; 2F2V A; 2LZ6 B; 2D8J A; 1YWP A; 1JQQ A; 1K0X A; 2DYB A; 1BBZ A; 2CDT A; 4D8K A; 2KRS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5LJ3 e; 3CC7 Q; 3MET A; 1MHN A; 2DKG A; 1UTI A; 1ACM B; 2ECZ A; 3EFO A; 3TCJ A; 1U1S A; 2O9V A; 2FO0 A; 3CCQ Q; 1Q81 R; 2EQK A; 1JXM A; 3OMC A; 1JJ2 P; 4C92 G; 5DM7 R; 2DER A; 4JZ4 A; 8AT1 B; 5I2M A; 4DOW A; 3SWN C; 3CCR Q; 2FRW A; 2W0Z A; 1UG1 A; 1YFN A; 1I5L A; 2QQS A; 1BCM A; 2X35 A; 5GAN 4; 3QDR B; 2YLC A; 2LCS A; 1QVP A; 3A1P A; 2QQA A; 5CR2 A; 1Z9Z A; 2MI6 A; 2D9T A; 4J7I A; 2NUT B; 2BIV A; 2GTO A; 2RNA A; 1WA7 A; 3M5A A; 2RHI A; 3MPU B; 1G3T A; 2EYZ A; 4GY5 A; 2EKO A; 2M16 A; 2NWM A; 3NGP A; 1KC8 R; 1ZUK A; 1E6H A; 1NJI U; 2L3S A; 4FYV B; 5KH6 A; 1OX9 A; 1PG5 B; 1NZ9 A; 2NUT A; 3G6E T; 2DIQ A; 4J9I A; 1FXX A; 3REA B; 2K4Y A; 1UGV A; 3QZ9 B; 5FW9 A; 2MWP A; 3UDC A; 5GAO n; 4M7A B; 4C8Q D; 2XDD A; 2QGF B; 2E5Q A; 4FM4 B; 3URG A; 3CXC A; 4E7H A; 4IIM A; 1QCF A; 5GAM g; 4M7D C; 2DL7 A; 2V8K A; 3ULR B; 3BDU A; 1YHQ Q; 1VQK T; 2NUZ A; 4GLM A; 1Q81 C; 1HK9 A; 4AMC A; 2QAZ A; 1Q86 R; 3H0F A; 3RIR A; 4KT0 E; 1PD1 A; 4OB2 B; 3VYH B; 3TU4 K; 2DD4 A; 4DBR A; 4R55 A; 2JS2 A; 4QQ6 A; 1KIK A; 1Q82 C; 2X3W D; 1SEM A; 2OI3 A; 1VQ5 T; 3TSW A; 4KGX B; 5LJ3 g; 1SPK A; 4RKU E; 2D6F A; 3E9F A; 1QVG P; 4ELZ C; 3CBP A; 4OMQ A; 5GAO l; 5GMK m; 3VKI A; 1RUW A; 3KUF A; 3G4S T; 2MK5 A; 1VYV A; 3P8B B; 4DEY A; 2QEX Q; 5CAI A; 2MPX C; 3CME T; 1WNL A; 1AEY A; 1G5V A; 5I22 A; 2JNG A; 4QT7 A; 4ZN3 A; 3OYI A; 2MOX A; 2MWO A; 2JXB A; 1G3Y A; 4BDY A; 1BI3 A; 1OOT A; 3HHT B; 4IUU A; 1WIE A; 4Y91 A; 5L8R E; 3NTI A; 2DBM A; 3S3M A; 3L2Z A; 1VQ6 T; 1M3B A; 2M9U A; 5GAM f; 4KUI A; 5KYW B; 2ZGW A; 2M0O A; 4OMM A; 3OS5 A; 2VGN A; 3HPW A; 1H8K A; 2YRC A; 3NFC A; 4NOY A; 2NYS A; 3P8D A; 1QVF A; 5A0L A; 1D1C A; 3QSU A; 2LQN A; 3SD4 A; 2VGM A; 5FRM A; 2RO0 A; 5GAO q; 4ZNX A; 4M7A A; 1VQ7 Q; 4XU3 A; 1WJQ A; 2EW3 A; 3VYG A; 2KT1 A; 4LDY A; 1UEB A; 5AYF A; 1EX4 A; 1ZSZ B; 5A0G A; 1ZSG A; 2E65 A; 2E64 A; 2KRN A; 2JTE A; 2DL8 A; 1ZUU A; 3QO3 A; 2COW A; 4BI3 A; 4CC4 B; 1YCY A; 3CCL T; 3VS2 A; 1E6G A; 1C0M A; 3CMA T; 3QBY A; 1YIJ A; 2DRM A; 3CCJ A; 4TVR A; 2J6K A; 3E1S A; 5C6S A; 2QYZ A; 2EQJ A; 2J6O A; 3RER A; 2O4X A; 3A8G B; 4JJC A; 3MJX A; 5CKF A; 4OGE A; 1NPP A; 4K11 A; 3TVT A; 2F2W A; 1HJD A; 1GBQ A; 3LWH A; 2RK2 A; 2E5K A; 1B7T A; 1H92 A; 3M55 A; 4O6J A; 3UF4 A; 2X51 A; 2DYI A; 2LC4 A; 1QMC A; 3G4S A; 2G6F X; 4KGZ B; 1X6B A; 2XD0 A; 1IHV A; 2EQM A; 2LT1 A; 2XG8 D; 1X2K A; 2L5Q A; 1M8V A; 2KYB A; 1YJ9 T; 1NJI C; 3CCE T; 1PSF A; 4FW1 A; 4XU0 A; 4F17 A; 4OF1 A; 4JLG A; 1GFC A; 2GTJ A; 5J39 A; 2QA4 A; 1RAE B; 4BAC A; 1KQS A; 2QI2 A; 4PJL A; 2EQI A; 2QTX A; 4JJD A; 2VV5 A; 1N8R C; 4M75 D; 4X9D A; 2IIM A; 3MP8 A; 1N5Z A; 1VOM A; 2YRD A; 4B9W A; 1I4K 1; 2HL5 C; 1RLP C; 2EYX A; 1VQ4 A; 1Y96 B; 2RJE A; 2K57 A; 4FT2 A; 3WXM B; 2K5F A; 2IPO B; 2YUP A; 1VQL T; 1VA7 A; 2F69 A; 1AWW A; 2YUN A; 3A8O B; 2KT8 A; 2MIO A; 2DJZ A; 2JTM A; 1TG0 A; 1XJW B; 2EPD A; 4JJN K; 3NMZ C; 1OYX A; 2A3L A; 4M7D F; 1VQK A; 3J7A F; 4F16 A; 1N8R R; 2C0T A; 1PKS A; 3THK A; 2JMA A; 1BI2 A; 2CRE A; 3V8J A; 1SRM A; 3CC2 T; 1UB4 A; 1Q7Y C; 2QK0 A; 4M75 A; 1VQN Q; 3CCS Q; 2O88 A; 2DZ9 A; 2QEX A; 2PUK B; 3I9Q A; 4N4H A; 4E7K A; 4E7L A; 2ZPG B; 3CCU T; 1OEB A; 1WHM A; 2QEX T; 2LNH B; 3BE3 A; 3CD6 Q; 5GAM d; 2O4X B; 2LRQ A; 1T0J A; 3M9Q A; 1T3L A; 4HCK A; 2R58 A; 1B3Q A; 1K9M U; 2GNC A; 2FL7 A; 3FJP A; 4PFZ A; 3M4G A; 5GJV B; 5KCO A; 4N4I A; 2GCX A; 2K3Y A; 5LL6 S; 1H3Z A; 1UDL A; 3MP6 A; 3C12 A; 4LDU A; 3CC4 Q; 3VUB A; 2B86 A; 3VS0 A; 4B9X A; 1FYN A; 3EH2 A; 9ATC B; 5CKE A; 3UAT A; 3L1A A; 2C0O A; 4UC4 A; 1U8R A; 2DJQ A; 4C92 F; 4C0D C; 1NEG A; 4C8Q F; 2HBP A; 2OTJ T; 4PNO A; 1U5S A; 3M4Y A; 2FHD A; 4RTW A; 1X2Q A; 4LD6 A; 2P0K A; 1WJS A; 2AT1 B; 2PQW A; 3P8H A; 4XTY A; 3QII A; 1BI0 A; 1HSQ A; 4NL3 A; 2K79 A; 3AHU A; 1X27 A; 1YIT Q; 4FYY B; 4HA8 A; 4OB3 B; 2V1R A; 2VUB A; 3CD6 T; 2EGE A; 2F5T X; 2QQR A; 3VUZ A; 1PKT A; 4PKC C; 1B34 A; 4JS5 A; 4M75 C; 2BZ8 A; 1KC8 C; 4J9C A; 4JUV A; 4KGV B; 1A0N B; 3PIO A; 2JW4 A; 1OZ3 A; 2JM8 A; 5GMK l; 2P4T A; 4OGC A; 1ZSZ A; 4F7U G; 2XIC A; 4JRK A; 3OYD A; 1K0X A; 3LLR A; 4C92 C; 4ANJ A; 1KD1 R; 4JRP A; 4HCC A; 3PFS A; 1VQN A; 2KR3 A; 2DVE A; 4DBH A; 1ZA2 B; 3CC4 T; 3OBY A; 4OB1 B; 4J8O A; 2DA9 A; 4JRQ A; 4N4G A; 4RG2 A; 2LQW A; 4FL6 A; 3JV3 A; 2L8D A; 1IRE B; 4PJO C; 3VS4 A; 3N5B B; 1T3S A; 5GMK e; 1M90 R; 3JCM b; 3CXC P; 1M27 C; 4BE0 A; 1VQK Q; 4QQG A; 4DOV A; 3OY9 A; 4M75 E; 1D3B B; 2DMO A; 1D1A A; 4A4G A; 2O9S A; 4XQ3 A; 1AZE A; 2HL3 A; 4ELY C; 3PGG A; 5GAO r; 5GAO p; 4AG2 C; 2FEI A; 4MZP A; 1BIB A; 4AG1 C; 4J7F A; 3C94 A; 2QGG A; 4J83 A; 5CO7 A; 5FU7 B; 1JJ2 A; 3RR6 A; 3UA6 A; 3S6W A; 1TU0 B; 1K73 R; 3L2U A; 2NUP B; 5FRN A; 2V1Q A; 4EMK C; 1G2B A; 3JCM J; 2VWF A; 5CQY A; 4IUV A; 2ROT A; 3QJY A; 4M7D D; 1GRI A; 1I81 A; 3VS3 A; 3CCM A; 1QP2 A; 2V26 A; 5LJ5 f; 1M1K R; 2QA4 Q; 1K0S A; 2DRK A; 4OMN A; 3JB9 H; 2HNI A; 1D0Y A; 2KDS A; 3JB9 G; 1QKX A; 4C8Q E; 2KQW A; 2BZX A; 4M75 G; 3PIP A; 2K3B A; 3UPU A; 3WVD B; 1MMG A; 3JCM X; 4M78 E; 2B8A A; 3M0T A; 4MZM A; 2KXC A; 1VQ7 T; 2OX7 A; 3X24 B; 3QYG B; 4E7J A; 2KK4 A; 1H64 1; 2A37 A; 4DQ2 A; 4NL2 A; 2FVU A; 3OYL A; 1JB0 E; 2M51 A; 1YBY A; 1MMD A; 1YJW A; 4PJM A; 4NS5 A; 3RDV A; 4BY6 C; 4DEX A; 1MMN A; 1U3O A; 1GCQ A; 3I55 A; 1TS9 A; 1W6X A; 5KYW A; 1M3A A; 3OB9 A; 1KG1 A; 3ZFJ A; 3CC4 A; 5D6Y A; 2R57 A; 2Y4X A; 2O2O A; 2XKO C; 3JB9 J; 1QW1 A; 2EVR A; 3DB4 A; 3OYK A; 2LX9 A; 1OV3 A; 3PVL A; 2JMC A; 1K73 C; 3BY7 A; 2O01 E; 3EGX B; 1R0C B; 4XU2 A; 5I21 A; 2EGA A; 2DL3 A; 2K2V A; 4YTL A; 2CP7 A; 3A8L B; 4F14 A; 2E4H A; 4RTU A; 2QA4 T; 1N9S A; 4ME7 A; 4BB7 A; 1YJ9 A; 2PNI A; 1XQH A; 4PJO E; 1N6A A; 3JCM Q; 1R77 A; 2OAW A; 4QQD A; 3HFO A; 5GAN j; 2ZPI B; 5IHK A; 4KH0 B; 3G4S Q; 4XTW A; 4J6W A; 1JO8 A; 1WHG A; 1VYT A; 2AZV A; 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