3I79A

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
463
structure length
455
Chain Sequence
AIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKEQISVDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Toxoplasma gondii calcium-dependent protein kinase 1 is a target for selective kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Toxoplasma gondii
total genus 154
structure length 455
sequence length 463
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2009-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3i79A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3i79A01
1OI9A 4DBNA 3BU6A 4F7JA 2GQRA 4GT4A 4C38A 3Q4UA 1AGWA 1YXVA 4U0IA 2J6MA 3EQFA 4NCTC 1BX6A 2VTTA 2X1NA 3F9NA 4Q9SA 3OBJA 4FSMA 3RHXA 4AAAA 4O22A 3ROYA 1J1BA 4I93A 3GFWA 3WIGA 5E8XA 5HKMA 4YSMA 1JAMA 4ZTNA 4EHVA 4V04A 4LL0A 2JAMA 3V8SA 5BUIA 1DAWA 4BI2A 4BZDA 3IK3A 3U9NA 3BV3A 4LOPA 5HVJA 4CQGA 3L8XA 2PUUA 4E6QA 3R63A 1AQ1A 1VYWA 4FC0A 3PPZA 4UY9A 4ZY5A 2R3LA 2VUWA 3BLQA 5AADA 2ZB1A 2FVDA 5C27A 4YMJA 3T9TA 2P2HA 3RHKA 4CTBA 3LFBA 3BWJA 2V5QA 2W1EA 4OT5A 4ZIMA 1DM2A 3IDCA 1KSWA 4Y5QA 2UW8A 4BTKA 4JI9A 3LJ1A 5EDPA 4YNOA 3RKBA 1DAYA 3R1NA 1YDSE 4XNEA 4IB5A 3A61A 1JBPE 3V6RA 2PZ5A 5A46A 5AUUA 2VTQA 3AC5A 3PJCA 4MHAA 3NW5A 5EDRA 5J9LA 2XZSA 3UJGA 1OBGA 3DAKA 3M11A 3KXHA 3HNGA 1Q99A 2FSTX 3PVWA 5C4KA 2GHLA 1YKRA 2R3IA 3ZRMA 4ZY6A 2H6DA 4QOXA 4IW0A 3RP9A 4A7CA 2YM4A 4AZTA 5C8KA 2R5TA 3A60A 3PE2A 4UWCA 5TT7A 5I9XA 4QMTA 4MBIA 1PMEA 2BKZA 4G31A 3G9LX 5EM7A 2EB2A 4PL4A 5AX3A 3OTVA 2YHVA 3A8XA 3PZHA 4D2RA 2I7QA 4GJ2A 3C0IA 4YUQA 4FIIA 3UPXA 4FIHA 3TDVA 2C6KA 3EYHA 3G90X 1YXSA 3F69A 2C6EA 3R21A 4FF8A 2PMNX 4ITIA 4BN1A 5CF4A 3PG1A 3RCDA 3PG3A 3UDBA 4QP9A 3QKMA 1Q8YA 2PYWA 4RJ3A 3NPCA 2LAVA 4YJUA 3GQIA 3BPRA 3ZLYA 3EQBA 5KMKA 1WBWA 3IG7A 5E8WA 3BYUA 5K0KA 4XEYA 2I0YA 2WOUA 4JR3A 4D9UA 2IVTA 4FV2A 4EK6A 1P14A 1ZZ2A 4DF3A 4EHGA 2ZDTA 2JIIA 3H9OA 3LFEA 2DQ7X 3QCYA 4U5JA 2QC6A 3HMOA 5JGBA 4FG9A 2H34A 4UV0A 5BYLA 2HAKA 1A06A 1H07A 3A4PA 1OKZA 2X7OA 4I5PA 4FKRA 1Y91A 4FSZA 5LJJA 3TNHA 2IO6A 4IJ9A 2VWBA 3TIZA 4FV0A 4WRSA 3WF5A 1R39A 3LFDA 3GU4A 4G3EA 2YCRA 3U51A 2BIKB 4AFJA 3OROA 4R3CA 2Y9QA 5ACBC 3DBDA 3O51A 4G9RA 4AN3A 2W96B 4KAOA 4JJRA 2C4GA 4GIHA 1IG1A 4BCHA 2X0GA 2PZIA 3BYOA 3UC4A 2YZAA 3U4UA 1H1QA 4F0FA 5FBOA 4YHTA 2IZRA 3IOKA 5EQYA 4WG5A 1W84A 2E9OA 2PL0A 4RJ5A 4FKQA 3H0ZA 2YAAA 4NJDA 5DIAA 1Z9XA 4IC8A 3WIKA 3F2NA 3I1AA 3Q96A 1YI6A 1ZLTA 1G8SA 4QYYA 3D7TA 2OIDA 3FMKA 2Y6OA 4PX6A 4M66A 2EXEA 4JAJA 4M69A 3LW0A 2P4IA 3QQJA 4X3FB 5J7BA 4M13A 3VBTA 5AWMA 5M06A 3QRUA 3KK9A 3UO6A 4IM3A 4X21A 1GY3A 1OL1A 4BBEA 4L01A 3R8LA 2HW7A 2OJFE 3PY1A 4ZAUA 3NW7A 3QWKA 4QP4A 4V05A 3VBQA 4DFYA 1M7QA 5L8LA 5L2SA 2PK9A 2VWXA 5CU0A 2X8EA 4LI5A 3NX8A 2LGCA 3NNUA 2OXDA 5HZNA 4QTDA 2HZ0A 2PVHA 3DGKA 1HCKA 4GVAA 4RQVA 2HZNA 3F5XA 1MRYA 4KS8A 2X7GA 3UZTA 2W5HA 2QOFA 2YM7A 2GFCA 2XYNA 3G0EA 5EM8A 5TE0A 3TZMA 4DGMA 3WZKA 3L9PA 4OAVB 1PXIA 1U4DA 3NW6A 3Q9XA 4J8MA 3RVGA 5AP0A 5JN2A 3VUTA 1MRUA 4IVDA 4FV6A 1WBTA 3L9MA 4CT1A 4FZFB 4HYHA 3VO3A 5L2TA 3Q9WA 4WG4A 4P5ZA 1PJKA 1Z5MA 3P0MA 2B9IA 5GINE 3R9OA 1M2PA 3D5XA 5GNKA 4JNWA 3DPKA 4E73A 3R7GA 2C3KA 2PMLX 3CTHA 4ANOA 5AP4A 4F9BA 3G6HA 2YN8A 3CE3A 1F3MC 1UU3A 2I6LA 2JKQA 3Q2MA 4E7WA 1BKXA 4BIDA 5IU2A 2F4JA 3LCSA 1ZY4A 3OWKA 3DB8A 2C6OA 3E63A 4TNDA 3ZLSA 4NT4A 4F1MA 4MNEA 4UBAA 4FK3A 5TOZA 4R1YA 3TZ9A 3MFRA 3NIEA 3DXNA 4C36A 2BIYA 4BWKA 3T3VA 4EUUA 1FVRA 3FMEA 3QYZA 4ALVA 3SV0A 1IA8A 1UNLA 5FRIA 1JSUA 2X2KA 4I3ZA 2CNQA 4TY1A 3A62A 4AUAA 3C4ZA 4GS6A 3IO7A 4ITJA 4FKTA 5IA5A 2ETRA 3MA3A 3BYMA 4ZS0A 3EQHA 5IUHA 5ACKA 4QPMA 3GOPA 2JBPA 4I0TA 3CD8A 5HCZA 4YZDA 4C3FA 4FKIA 3TWJA 2QD9A 4BI0A 4QQ5A 4IB3A 4F6WA 5GIOE 3EIDA 5DRBA 4EBWA 3OUNB 3G0FA 4GYGA 4FODA 4PMTA 2B53A 4C4FA 4KIOA 5JH6A 3U6HA 5CASA 4D4SA 2CN8A 3TUBA 3QFVA 1XH9A 5EH0A 5ETIA 5AUWA 1FMOE 3C50A 2C0IA 4EH3A 1NXKA 4HVSA 3KXZA 5FXQA 1PXLA 2OW3A 1SVHA 1MP8A 3JVRA 4HPUE 4IX4A 4U45A 4C4GA 5JGAA 1OECA 3C5IA 4DH3A 4H36A 3QD3A 2J7TA 2A1AB 3VBWA 3HV6A 4GIIA 3NNVA 5A4TA 2W99B 2C1BA 3P78A 4GFOA 4XG9A 3MH0A 4O0WA 4TWCA 4YZ9A 5HU9A 4FX3A 1YW2A 5J1VA 5IEYA 2IPXA 4LM5A 2Y6MA 3UIUA 2B54A 3I0OA 2R0UA 3GQLA 3OXTA 4MH7A 3QD0A 4FNZA 5E91A 2YACA 3AC2A 5KMNA 4NCTA 4IADA 4LRMA 4ZSLA 2QG5A 4QMPA 4OGRA 2XIYA 1YOLA 1WVWA 3R0TA 4MWHA 3RWQA 2BUJA 3QALE 4B8LA 1SM2A 4H1JA 4LV8A 4C33A 3COMA 4BDIA 2WHBA 3SQQA 4BDFA 4PL5A 4CMUA 4J8NA 3FC2A 3JR1A 5KNJA 1FPUA 2E9UA 2ZVAA 3KRLA 3CC6A 5CQWA 5AX9A 2VTHA 3KMMA 5KZIA 3IGOA 3FLWA 4IWDA 2J5FA 2XM8A 1XR1A 4K11A 5IQCA 4F6UA 2OZAB 1O9UA 3ET7A 1ZMWA 2BRHA 4LFIA 3HGKA 2BILB 3EOCA 1U46A 2W1IA 2EWAA 2JFMA 3F7WA 3NNXA 4OTDA 2ESMA 3TNQB 2WTKC 2ERKA 4BGGA 3U4WA 4P7EA 4FIEA 1XBBA 2XNGA 3F3ZA 3R28A 3LCOA 4H58A 2F7XE 5FTQA 3H0YA 3Q60A 4EH2A 3VQHA 4IZ5A 4AT4A 3ZRKA 4H39A 1RDQE 2PSQA 2WQNA 3OWLA 4JQ8A 4W4VA 1JOWB 3V3VA 1BL6A 3ACKA 4FZDB 2OKRA 4YJPA 4EOLA 4RIXB 4O7SA 4CLIA 4R6VA 5IF1A 2XUUA 3I7BA 5EI8A 1QPJA 1ND4A 4XOZA 5E8YA 4ALWA 4O7TA 3CS9A 4CCBA 3P4KA 1H4LA 1WFCA 4PMMA 1Q8TA 3KB7A 5I9ZA 1IA9A 3ENMA 1P5EA 3R1SA 4E4NA 3OFMA 1B6CB 3LXNA 2F7ZE 1OITA 2OK1A 2A19B 2UVXA 2XF0A 4YTFA 3DZQA 4G9CA 3GC8A 1GOLA 4R78A 3D5WA 5HBEA 3VS4A 5IA1A 5BVFA 4DHFA 5C26A 4QMMA 2Y4IB 1NVQA 1XBAA 3R04A 4A4LA 4GYIA 4ZTLA 1PXPA 3R83A 4JRVA 4BCFA 5I9WA 3TG1A 2P3GX 5IDPA 1L8TA 3C7QA 4F7LA 4O7LA 1XQZA 3A7GA 5E92A 1I09A 4I0RA 4AW2A 2QLUA 3FLYA 1Y8GA 3VBYA 3RM6A 4NL0A 3EJ1A 3VC4A 3LFSA 3FKOA 5LMKC 2UW5A 4CKRA 2IVSA 2UZWE 4O81A 5KE0A 3I7CA 4GJ3A 4LOOA 5FEEA 4ZLOA 4OAUC 5CSPA 3OW4A 4AA0A 2VTRA 3CKWA 2GTMA 4O1PA 4Q5EA 2B7AA 4RZVA 3UVPA 4A9UA 3ZH8A 5M51A 3NDMA 3VF9A 3HZTA 4B99A 5KUPA 5AV4A 3B8QA 4MD8E 4UXQA 5EYMA 2JKOA 4QMYA 3WF6A 1ZAOA 2XCHA 2C47A 3QQLA 3QTUA 4BZNA 3F6XA 1ZY5A 4HW7A 2GQGA 5I9VA 1DI9A 3EFLA 3Q52A 4F1OA 4O7VA 3QKKA 1ATPE 4IQ6A 4B9DA 1YQJA 4C35A 3IW8A 3MH3A 2ERZE 3DNEA 2O63A 2XIKA 2QR7A 4XLIA 2NRUA 5DVRA 3PY3A 4JS8A 4RLKA 3PXQA 5DMZA 4FV8A 4RVLA 4TWPA 5CI7A 4DFLA 4LGHA 5HTCA 3W33A 3G33A 3F88A 3FZRA 4OTFA 5AR7A 1O6KA 4QMUA 2I1MA 4GW8A 4YLLA 1K2PA 2CJMA 2PMIA 4P90A 2B0QA 3V01A 2UW9A 2VZ6A 4FL3A 1UVRA 4X2KA 3SKCA 2YCFA 4Y46A 4JDHA 4RX7A 2PE2A 4RRVA 5HTIA 4A07A 4Y8DA 3NVMB 2VWVA 3NUYA 4Y83A 4IE9A 4Q2AA 5ANKA 4O1OA 5KMLA 2RL5A 2SRCA 3RTPA 1W7HA 2Q0NA 2YDKA 3DQXA 3MPAA 3GEQA 4P4CA 2XKEA 4KB8A 4TWOA 4IHPA 1PMUA 3HV4A 3RK5A 4CD0A 5CTPA 3V6SA 4BGQA 5E4HA 3HKOA 5HLWA 3HV7A 3DLZA 4G16A 3QCXA 2VTPA 5C4LA 4ONAA 3QHWA 4TN6A 5D7VA 5DHJA 5ANDA 3BEAA 1OL2A 4XS2A 3GU7A 3QF9A 3EHAA 3TKIA 4F6SA 3FZPA 3TL8A 4KSQA 3U8WA 2J50A 4RWIA 2BCJA 5DNRA 5B7VA 4ANLA 3UOKA 4J96A 3BKBA 4FSUA 3C0HA 3P1AA 3QCQA 4I5CA 4L00A 3OVVA 5CEIA 4LGGA 3F2AA 2O64A 3VAPA 4NTSA 3LMIA 4FSYA 2X6EA 1SNXA 4FUXA 2G15A 2VO7A 3QWJA 2X6DA 1H24A 2EU9A 5CAVA 2OH4A 3EQDA 4FG7A 4CZYB 4YSJA 1BMKA 3OZ6A 4GK4A 2YM6A 2FA2A 2C0OA 3E64A 4MTAA 4R7HA 2C6TA 4M0ZA 3F5PA 4ENXA 3FSKA 3OHTA 3FMNA 2C69A 4WBBB 2ITWA 4DAWA 1VEBA 5IH5A 2UZLA 4XV1A 2W1FA 5HG7A 3PTGA 1Q97A 3NSZA 4G6LA 4U7ZA 4AG8A 4JDIA 4ASZA 3HLLA 5A6NA 1PXJA 5LOHA 2PVKA 4AN9A 1V0OA 5CNNA 4FE2A 3EL7A 3A7HA 3BU3A 3QZIA 1JSVA 3V5JA 5M09A 1YI3A 1YWNA 4L3JA 3U6IA 2A4LA 3P7AA 4MBLA 3GB2A 2YM3A 3SXRA 4C61A 2VTMA 2WTDA 2PHKA 1YXUA 2OXYA 1Y57A 1J3HA 2QO2A 2QOIA 1WBSA 3IW7A 3KVWA 4FYOA 3KREA 3QTXA 2JC6A 4TT7A 5FP6A 2BRMA 1CDKA 4RIWB 2YWVA 4BDDA 3CQEA 1H0VA 4XHKB 3MPTA 4MEDA 1L3RE 4HOKA 1CKIA 2WIPA 4AZVA 3E62A 3BV2A 4RJ6A 2QOLA 3ZUUA 4KBKA 4CV8A 1S9JA 4M67A 4EH9A 4USEA 4MXAA 1H8FA 1UU7A 3QTWA 2HZIA 5FQDC 2YLFA 3IOPA 4HYUA 3D94A 4F64A 5TO8A 1A48A 4E8AA 5HNIX 3Q5ZA 3RBWA 4CRSA 2CDZA 1OIQA 4WNOA 2W5AA 3TTIA 2GU8A 2WQOA 4AGUA 4XBRA 3FKLA 3AD4A 5GJDA 4D0WA 1TVOA 4YJRA 3CCNA 4X6RA 4D4YA 1MRVA 4H3PA 4P2KA 4YZNA 5DEWA 4MCVA 3FI4A 5CI6A 5M4UA 2X2LA 3PSBA 3O71A 4MXYA 3V8WA 3R8MA 3O0GA 5AUZA 2F9GA 1Q5KA 4L7SA 2ITXA 4XP0A 2KULA 5EW9A 4DGOA 5LCJA 3LMHA 4HNIA 4XRLA 3GC0A 3N4UA 2VTSA 3U54A 1FGKA 3FYKX 4YJSA 4JBVA 2FYSA 4APPA 3PVGA 3ZZWA 4L8MA 5HD7A 3IW6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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