The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conformational similarity in the activation of caspase-3 and -7 revealed by the unliganded and inhibited structures of caspase-7.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Caspase-7
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| total genus |
18
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2009-07-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2H65 B; 2H4W B; 4DCO B; 1SC1 B; 3EDR B; 3KJQ B; 1RWO B; 1RWN B; 2XYG B; 2QLF B; 2H51 B; 4DCP B; 3R7N B; 2CJY B; 3R5J B; 1RWV B; 2QLJ B; 4ZVT B; 1F9E B; 2C1E B; 2C2M B; 2QL5 B; 3D6H B; 3R7B B; 3NS7 B; 1RE1 B; 2H48 B; 2XYP B; 1PAU B; 3R6G B; 2HBZ B; 3GJR B; 1RWP B; 3P4U B; 4ZVP B; 1SC3 B; 2Y0B B; 2CDR B; 2QL9 B; 3GJQ B; 1QTN B; 1RHQ B; 1RWW B; 1RHJ B; 2DKO B; 1RWX B; 2QL7 B; 3RJM B; 2H5J B; 5IC6 B; 4DCJ B; 5K20 B; 2QLB B; 1ICE B; 4ZVO B; 2CNO B; 1I3O B; 1RWM B; 4ZVR B; 2C2O B; 2CNL B; 3GJS B; 2C2Z B; 1RWK B; 4LSZ B; 4ZVU B; 3EDQ B; 2H54 B; 3QNW B; 4ZVS B; 1IBC B; 2H5I B; 3GJT B; 2C2K B; 1NME B; 1RHM B; 2FQQ B; 2HBY B; 2P2C B; 3KJN B; 2HBQ B; 2XZD B; 3SIP B; 3R7S B; 2HBR B; 1I51 B; 2XYH B; 2CNK B; 1QDU B; 3R6L B; 2CJX B; 4ZVQ B; 1GFW B; 1RHR B; 3D6M B; 3D6F B; 2Y1L B; 1RHK B; 3IBF B; 3KJF B; 1SC4 B; 2XZT B; 1RHU B; 1BMQ B; 5IC4 B; 3P45 B; 4JB8 B; 3IBC B; 1PYO B; 2CNN B; 2H4Y B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4LF5 J; 1N36 F; 3IRW P; 2Q79 A; 5IQ6 A; 3H5U A; 1QSS A; 2EK6 A; 4YR3 A; 2D1C A; 2P9C A; 1RWV B; 5J2P B; 4PZV A; 2QSF A; 4UOH A; 4NXM F; 1RT3 B; 4CNZ A; 3W1Y C; 3ZZU A; 4C97 A; 1R8C A; 1GTH A; 2HGL A; 4ZIW A; 2WVF A; 4K50 A; 1HHS A; 1I3O B; 2EFP A; 3RBD A; 2B3T B; 2Q6B A; 2C2O B; 4AXJ A; 3KLF A; 2DRA A; 2J9C A; 1HWU A; 1ROF A; 3TJ8 A; 5DGB A; 2HHH J; 1TUW A; 2I6W A; 3I5C A; 2IDE A; 3G6V A; 3GWC A; 1VBZ A; 3JTO A; 3LGH A; 4YHH J; 1X5O A; 3FUY A; 2EPI A; 3CXC R; 3SDE A; 2RUG A; 2YWW A; 1YRX A; 3HHL C; 3KHH A; 2BRL A; 2GHP A; 3AH6 A; 4C8Z A; 4AFF A; 1Q81 T; 1OY6 A; 3AOD A; 1G3O A; 4CTA B; 4DCP B; 4CLY A; 1YI2 S; 2IRU A; 4ZJO A; 3L09 A; 4CO0 A; 1RE1 B; 3IG1 A; 1S0O A; 1FE0 A; 4I6W A; 4QCL A; 2NRE A; 2IYI A; 4USV A; 4DL2 A; 1O51 A; 4P52 A; 4NLS A; 2OP5 A; 5EGY A; 3LP2 B; 4OI4 A; 2ZD1 A; 2VQE F; 4P2M A; 5IV3 A; 1OY8 A; 2DRD A; 5K20 B; 1HR0 J; 1P1L A; 2GML A; 1C4A A; 2B9X A; 3D66 A; 1TL5 A; 4UZC A; 1WF1 A; 1OYE A; 1N6Q A; 2GA7 A; 2P6T A; 1RTJ B; 3RR8 A; 1BQN A; 4AL7 A; 1GTE A; 1XQI A; 3V2U C; 3T1Y J; 3PYF A; 3BPS P; 1NU4 A; 1FX2 A; 1N48 A; 3JSM A; 2UVU A; 3UCG A; 1T05 B; 3GIM A; 4TY9 A; 2EG2 A; 1KQK A; 4WFZ A; 4PAB A; 1V3Z A; 4PRF A; 5FD1 A; 1TAU A; 3U1L A; 1U6F A; 1JLE A; 1T7P A; 3F73 A; 4HT7 A; 1HYS A; 3R5A A; 2A1B A; 1ZPW X; 4B3O A; 1O6X A; 2HWT A; 4YB5 A; 1P27 B; 4OMF G; 1YSJ A; 1ZAV A; 5IT4 A; 3JSR A; 1FRI A; 3M30 A; 4A8M P; 1WOS A; 2QG9 B; 4URQ U; 2QMW A; 4KKO A; 2VBY A; 1FEE A; 2YKQ A; 1I6J A; 5HLF A; 3O6Q A; 4NCG B; 4BHQ A; 4IDK A; 4NML A; 2XEX A; 5KOX A; 3UNY A; 4H54 A; 1PIE A; 2QIF A; 1SQG A; 4Z2X A; 3F56 A; 3J7A 1; 3HD1 A; 3E8O A; 4MJK A; 1M1H A; 1SUQ A; 1NHU A; 1U48 A; 3T5L A; 2CPI A; 2DNG A; 2AEM A; 3HHL B; 4FKY A; 3JTN A; 4Y34 A; 1WG4 A; 5F3Z A; 4IG0 A; 3Q24 A; 5DM7 Q; 3NL0 A; 1QD1 A; 3ZC4 A; 3D54 A; 1FF2 A; 3RB6 A; 2J7W A; 1RT5 B; 2V69 A; 1VIS A; 2BE2 A; 4JI4 J; 3FSI A; 4I7F A; 5DGA A; 2NZ4 A; 2G1D A; 1CSJ A; 2Y9H A; 4RX6 A; 4V1A k; 4MFB A; 4A8Q A; 1P1T A; 1NKC A; 1RA6 A; 5T7L B; 1RAG B; 2C1E B; 5F8L A; 2X51 A; 2W4D A; 4RBU A; 2WVD A; 3NKY A; 3TUP A; 1CJV B; 3TYT A; 3EE3 A; 1E6V A; 2AT1 B; 3EM1 A; 1Q79 A; 2MXY A; 3FMW A; 2JOQ A; 2CZ9 A; 2QLX A; 4J7C A; 1XER A; 2D9P A; 3TEH B; 1FES A; 4CQ1 A; 4JI6 J; 2XMV A; 3J81 U; 2XBP A; 4KHP J; 2NLW A; 3QLH A; 5E3C A; 4OZL A; 2ZBC A; 3TAM B; 2M3D A; 4WFY A; 3ZXW A; 4J90 A; 2CQ2 A; 1QE1 A; 1PCA A; 4CO3 A; 3NS5 A; 1OJ4 A; 5HQM A; 3FBF A; 3EYZ A; 2IJF A; 4A4J A; 2YX7 A; 5L9X A; 2M8D B; 5EX0 A; 4K59 A; 3Q8Q B; 5T14 A; 3FCW A; 1J5O A; 4QYZ K; 4RU9 A; 2JVR A; 1EQ0 A; 4A8W A; 2FJE B; 1UMJ A; 3W2W B; 2ZWO A; 2ASD A; 2WBR A; 1MRO B; 1M5H A; 3C15 B; 2ZIT A; 2W25 A; 2QFI A; 2Y0S D; 4DQP A; 1RHQ B; 4B9T A; 2C2D A; 2RH3 A; 4UF4 A; 4ELU A; 2AEJ A; 4CO5 A; 1KS2 A; 3RG6 A; 2I0X A; 4C8Y A; 2W2P P; 3MMA B; 2V8P A; 4O0I A; 2XG8 A; 3WIV A; 1R0A A; 2RIJ A; 1VQ7 S; 3X3U A; 1RWK B; 1H2T Z; 3DRR A; 3GPA A; 5L39 A; 1Q7L B; 4I2P A; 2H3E B; 3KFW X; 4MYT A; 3PIO Q; 3R97 A; 2VD3 A; 4TQR A; 2ASJ A; 4C0O C; 5FJ4 A; 3B6B A; 2MZ1 A; 2GJI A; 1TKX A; 4ED4 A; 4DL6 A; 4I0W A; 3FFI B; 2VV5 A; 2JHE A; 2O3D A; 5LMU J; 3NXZ A; 3GIK A; 4C0B A; 4N7T A; 4WK1 A; 4CIO A; 5ETS A; 1PJ6 A; 2WON A; 4C8N A; 2KFN A; 1UEU A; 2BJE A; 3R1L A; 5ETT A; 2L08 A; 2OPR A; 1K0V A; 2H51 B; 4UST A; 1KRP A; 1KN6 A; 3TA1 A; 1XTZ A; 2QL5 B; 2GVZ A; 2YPZ A; 2DO0 A; 5H9E J; 4J9R A; 5C5J A; 2UUA J; 1SL0 A; 1C0U A; 5KFC A; 1RYR A; 1W2B R; 2XHC A; 2I9S A; 1VJQ A; 4NPO A; 4ZN3 A; 3CUN A; 1KSP A; 3RBX A; 1RAJ A; 4O3O A; 2UXC J; 2RF2 B; 3BYR A; 3PFO A; 3RRH A; 2J6U A; 1WC5 A; 3OT9 A; 5DS7 A; 2HSE B; 3G71 S; 1AA1 B; 1RAD B; 4B08 A; 1FJ7 A; 4RO0 A; 4ZPB A; 2LQ9 A; 3IFE A; 4WPA A; 5LSR A; 1S1U A; 5L1L A; 3VQS A; 2H5I B; 1Q86 T; 2QT7 A; 2XMA A; 2MZT A; 2UUW A; 2W2M P; 1T9Y A; 2KVQ E; 3NOC A; 3QT8 A; 4UQG A; 2ATC B; 4JI7 F; 3HCX A; 1GNK A; 4NCA A; 1S1W A; 2EC0 A; 2HHX A; 1QVF R; 4ZP8 A; 1CQM A; 4O3S A; 1UA0 A; 1JLQ B; 1S6Q B; 1H74 A; 3I5A A; 2EWH A; 1KP6 A; 4RW4 B; 2F4F A; 4GC7 A; 3ONQ A; 2F8H A; 5KG5 A; 4NYO A; 1DLO A; 1V3S A; 1S72 S; 2PEH A; 2LDY A; 4Z7Y A; 1T11 A; 3CIZ A; 1S4F A; 2OEM A; 4YEA A; 3M8Y A; 4PAA A; 2BQR A; 5B0G A; 1VBK A; 3CJ4 A; 4A8S A; 2DR7 A; 2EKY A; 2IJR A; 3M32 B; 2UUB F; 1G2E A; 2DH9 A; 3HVW A; 2NUU G; 4K8R A; 2JZ5 A; 3KLE A; 4X4Q A; 3KK3 A; 2HVE A; 2BJ1 A; 1AB8 A; 2E5L J; 1LQ9 A; 5KT2 A; 1JLG B; 1X31 C; 3M9N B; 4DMZ A; 1UKU A; 2XSJ B; 3I87 A; 1VRT A; 4S0M A; 3E01 B; 3DU6 A; 3TRG A; 4R5P B; 4N47 A; 4KR0 B; 4IG3 A; 1C0T A; 4QIF A; 1JNR B; 5L9N A; 3MCM A; 3LAN A; 3RRG A; 4C9D A; 2BBE A; 5DO2 A; 3KUE A; 2UUC F; 2J9E A; 4KE5 A; 2X3G A; 3BKF A; 5A6P A; 2K06 A; 1UFK A; 4DR2 F; 1QAI A; 3DHX A; 3R6G B; 2DNM A; 2DNO A; 3HVR A; 4LRC A; 2DHS A; 4FDF A; 2DRB A; 2BJ9 A; 2B4U A; 3M2U A; 5IFM A; 5K14 B; 4ILL A; 1JNZ B; 4ED0 A; 1VHF A; 4YY3 J; 5LMN F; 4PG5 A; 4FXD A; 5CQG A; 1RAC B; 1JLC A; 4MK7 A; 1R7I A; 3N6N A; 2OIH A; 3TQE A; 2APO A; 3UPF A; 1GMW D; 5DJB A; 3PKY A; 1MU2 B; 3PO4 A; 3TZY A; 2JDJ A; 2B7B B; 2FVR A; 1RTI A; 3NP5 A; 1WDD A; 3C2P A; 3EGW B; 3TX0 A; 4PXD A; 1SXL A; 2CQB A; 2OI2 A; 1F9F A; 2RDJ A; 3AAW B; 4DWI A; 1WDT A; 4IO1 A; 4ICL A; 3W2V B; 2P9E A; 4ZJQ A; 4DV3 J; 4X2B A; 4E98 A; 2DCU B; 2D74 B; 2ZM6 F; 2DXF A; 2BRK A; 5B08 A; 3K58 A; 1FKA F; 1LKZ A; 2FJX A; 4UZB A; 3OVS A; 4OIX A; 2IM1 A; 3HHE A; 3J7Y I; 5KFU A; 3QZ8 A; 3P6Y C; 4M5K A; 3I4P A; 1X4A A; 2AJF E; 4RW6 B; 2KL8 A; 4F4Y A; 2YWE A; 2KYZ A; 4HHU A; 2VUG A; 1RT2 A; 3CCT A; 3SQG A; 2AYE A; 2CKW A; 4IUF A; 2WBM A; 5KT5 A; 1RYS A; 1YHQ S; 2ZBR A; 3QWP A; 1S6P B; 2PEB A; 2V68 A; 2E5G A; 1HNV A; 3NNH A; 3KMS A; 1T3O A; 1JIH A; 4DG1 A; 2OUG A; 4JI2 J; 3NMR A; 4IR9 A; 3QO9 A; 2DEI A; 2R2U A; 4MKY A; 4DEZ A; 1JK9 B; 2JVO A; 4A8Y A; 4NLR A; 4NI2 B; 4RW7 A; 2GV1 A; 1YJW S; 2BV3 A; 1X9M A; 5EHH A; 2XZT B; 1F6T A; 2DBB A; 3P45 B; 1IJE B; 1YJ9 S; 1WHW A; 2CQG A; 4FVM A; 2VC1 A; 4ZPC A; 4OI3 A; 4P6Q A; 3KNA A; 5KFV A; 2RQK A; 2I5J B; 2M2B A; 4HR2 A; 4ZIT A; 1PAU B; 3HSD A; 2E5H A; 2OML A; 2FB0 A; 1UFL A; 1K73 T; 4K4T A; 2YQ1 A; 5KFG A; 1Q8L A; 2RKI A; 2POK A; 2ZC4 A; 4KV8 B; 2HHW A; 4LMZ A; 1OS5 A; 2VIH A; 3IO1 A; 3DXB A; 2NXU A; 2XUL A; 4P71 A; 4ZN1 A; 4NLW A; 2YH0 A; 3RU0 A; 4LF5 F; 1HQU B; 2HGM A; 4EFA C; 3LH2 S; 4LRF A; 3CJT A; 1YG0 A; 4PXB A; 1HWL A; 3EZU A; 4CRJ A; 4K2X A; 4TY8 A; 3H0P A; 2BZ2 A; 3QMQ A; 2R7R A; 4PQU B; 4NA3 A; 1IKX A; 2HNY B; 4LIR A; 1PYO B; 3B4M A; 2I38 A; 3I31 A; 2PC6 A; 3D3C J; 2FGC A; 4OL8 A; 3I96 A; 1RWO B; 1QAX A; 5C25 A; 1RT6 A; 2HHH F; 3BYP A; 2HQF A; 2W7A A; 3K5N A; 3K7R A; 3CC2 S; 3IN5 A; 3FKB A; 4XIU A; 2C28 A; 1ZA1 B; 2PI5 A; 2QA2 A; 5KT7 A; 4NRT A; 4YHH F; 1S59 A; 5IS2 A; 2K1R A; 2CWK A; 2V63 A; 4PPD A; 3SCK E; 1Y00 A; 1SV5 B; 2L9D A; 4XO0 A; 1FJE B; 1LNQ A; 3DI6 A; 1HHQ A; 3I5B A; 4K4X A; 1WNE A; 5CYM A; 1VQ4 S; 2A3J A; 3I9V 9; 3AB2 B; 3G9C A; 3MMB B; 1MG7 A; 3THT A; 1H7X A; 4G1Q A; 3S1T A; 1BUX A; 1SKR A; 3FNN A; 4BS2 A; 4JI5 F; 3EMT A; 3TVZ A; 1VFJ A; 2QYC A; 2R8G A; 2UP1 A; 3OVA A; 2OPQ A; 2CIM A; 2M7S A; 2JRS A; 3HHN B; 1U1R A; 4MKA A; 2PMH A; 1DAX A; 4FYV B; 4ELV A; 2GGP A; 4USM A; 3M2R B; 1Z1Z A; 4ECS A; 4IH5 A; 4ZCI A; 1YTY A; 3T1H J; 4M5M A; 4N5S A; 1R27 B; 4B9N A; 1FDB A; 4ZVG A; 5EWF A; 2XHW A; 1MLA A; 2RVJ A; 2QC3 A; 4P10 A; 3T1Y F; 2MPU A; 2LVW A; 2K3I A; 1UVK A; 4DV2 J; 2DGS A; 3DYA A; 2DD8 S; 3FRZ A; 1NZ8 A; 2V5H G; 1HBN A; 4ATN A; 3TA0 A; 2KI2 A; 2VPY B; 3IGN A; 5A0Y A; 4OZ1 A; 2G4B A; 1S5Z A; 3C66 A; 2HPU A; 2WCX A; 4LSN B; 1N54 B; 2MSS A; 3TVK A; 3GJT B; 3H25 A; 3R5B A; 1FDN A; 2P5V A; 2NS1 B; 1SBR A; 2KU7 A; 5GVQ A; 3VAH A; 4M5G A; 3QJL A; 2E7X A; 2LLZ A; 3POT B; 3CCQ S; 1IWG A; 1DQ9 A; 1VDH A; 3ZFV A; 2B6A B; 1T9T A; 1QTM A; 2J9D E; 4A48 A; 4RUH A; 1KHW A; 4LF6 J; 3G82 B; 1FWL A; 2M8H A; 5KTQ A; 1HNI B; 1YK9 A; 2C3P A; 1F3V A; 1N5Q A; 2FPH X; 4OFZ A; 3M1V A; 3KK1 B; 3QJJ A; 2CYY A; 2CPF A; 4RL1 A; 1OSD A; 2ATL A; 2OPS B; 2QJ3 A; 2AGQ A; 2W2O P; 4ZP9 A; 2IC3 A; 4LQ3 A; 1NPP A; 1TUG B; 5H9E K; 1S9F A; 4IOA Q; 3DM2 A; 4ECY A; 2L3M A; 2R7T A; 2V8G A; 1ICE B; 4ZVO B; 1F3F A; 2VA2 A; 4KFB A; 4JI4 F; 5C24 A; 3W8P A; 1ZM3 A; 1B7F A; 2X1F A; 1M1K T; 3BB5 A; 4Q7A A; 3QRR A; 4KY3 A; 4H4K A; 4KPC A; 3M6V A; 2C3M A; 3V6D A; 3G96 A; 3HVA A; 3L3C A; 5DZ7 A; 1BE4 A; 1HBU B; 5ITH A; 2YXL A; 3TX8 A; 1TV6 A; 5KG7 A; 1N8R T; 5GAD I; 2CJQ A; 2VG6 B; 4NOH A; 3O3L A; 4B3M F; 4U8Y A; 3FK4 A; 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