The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
b'KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conformational similarity in the activation of caspase-3 and -7 revealed by the unliganded and inhibited structures of caspase-7.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Caspase-7
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Hydrolase
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| total genus |
18
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2009-07-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C2K B; 2Y1L B; 2XZT B; 2CNO B; 3R6L B; 2XYG B; 5K20 B; 2H54 B; 1RHR B; 1RHM B; 2H51 B; 3P45 B; 1RWP B; 1PYO B; 4DCP B; 3D6H B; 2H65 B; 3KJN B; 1RWM B; 2C1E B; 2C2O B; 3KJQ B; 1RHJ B; 1RWW B; 4ZVP B; 1RWN B; 2H48 B; 3D6F B; 3EDQ B; 2CJY B; 3GJQ B; 3SIP B; 2XYH B; 2HBR B; 4ZVS B; 4ZVU B; 1RWX B; 3R7N B; 2P2C B; 3GJT B; 3R5J B; 4JB8 B; 3R6G B; 3EDR B; 2C2M B; 2XZD B; 2CNN B; 2QLJ B; 2QL9 B; 1F9E B; 1I51 B; 4LSZ B; 1RWV B; 2H5I B; 3IBF B; 1QDU B; 3QNW B; 3R7B B; 2HBZ B; 2QLF B; 2CNK B; 3KJF B; 3RJM B; 3IBC B; 1I3O B; 1BMQ B; 2QLB B; 1NME B; 3GJR B; 4ZVO B; 1RHQ B; 2CNL B; 1RHK B; 2H4W B; 2H4Y B; 3D6M B; 4ZVT B; 2XYP B; 1RWO B; 2C2Z B; 2CJX B; 2CDR B; 2HBY B; 1IBC B; 4DCO B; 1SC4 B; 1RE1 B; 2HBQ B; 1QTN B; 5IC6 B; 1SC3 B; 1ICE B; 3NS7 B; 1RHU B; 3P4U B; 2QL5 B; 1SC1 B; 1PAU B; 3GJS B; 2Y0B B; 5IC4 B; 4ZVR B; 1RWK B; 2FQQ B; 3R7S B; 2DKO B; 4ZVQ B; 4DCJ B; 1GFW B; 2QL7 B; 2H5J B; #chains in the Genus database with same CATH topology 5D3G A; 3PR4 A; 3KNA A; 1FFG B; 5C25 B; 1WG4 A; 2Y1J A; 2HGL A; 3OVB A; 1BE4 A; 4OJ1 A; 2KVI A; 1X9S A; 4IDK B; 1Q95 G; 2HFZ A; 4QYZ J; 3TWZ A; 4F3M A; 2MGZ B; 2CJQ A; 2NPI A; 2B4V A; 4EEY A; 1FRJ A; 3UO0 A; 1C1B B; 4NLO A; 1QSS A; 3THP A; 1ZA1 B; 2QX0 A; 4MAK A; 2A6M A; 5D15 A; 6FDR A; 3H90 A; 4C2M A; 4Q0B B; 4ZVT B; 4FXD A; 4DJB A; 5KFJ A; 2DNR A; 3DMJ A; 1A9N B; 3FCH A; 2AIR B; 3W60 A; 7FDR A; 4P75 A; 1NPR A; 4CLS A; 1S12 A; 3S6E A; 4X2B A; 4XDC A; 2FC9 A; 3U1L A; 3RB0 A; 4W90 B; 1LQ9 A; 4LVO P; 2FVC A; 2BEF A; 4KFB B; 1HWI A; 3GJS B; 5J2Q B; 5JVH Q; 2W4P A; 2X7I A; 4KRW A; 3KK1 A; 3DM2 B; 4IQX A; 5ETQ A; 2HVI A; 4PG5 A; 3FQK A; 4O44 A; 3MCN A; 4ELV A; 3DU5 A; 2HHV A; 5GAH I; 3G82 B; 2QJ3 A; 2WON B; 5IT0 A; 1WHX A; 2KT2 A; 2HVE A; 3OLA A; 3OR2 A; 2M2B A; 2CQ2 A; 1N88 A; 5KOW A; 3B8H A; 3I55 S; 1RKI A; 1N6Q A; 3ZTO A; 2CZV C; 2MYF A; 1U2F A; 3C46 A; 2BE7 D; 2GV1 A; 1SQE A; 3K5L A; 1ULR A; 4YR3 A; 1VJQ A; 3RW7 A; 3BGO P; 1S9G A; 2CPD A; 1NK6 A; 4NLX A; 3PRB A; 4QIF A; 4ANE A; 1C1C A; 4ZVE A; 4LBP A; 2QGF B; 4I7F A; 1U1R A; 3R5A A; 4A8Q A; 1YRU A; 2X1G A; 3AQP A; 5JJB A; 2KDO A; 2D1C A; 3H5U A; 1BUX A; 1XTZ A; 3VGU A; 2HYI B; 3JSB A; 2E5H A; 3VCD A; 1CQM A; 1SV5 A; 5F0W A; 4QZV B; 1O51 A; 4K4Z A; 5K20 B; 1QM9 A; 4J9L A; 3DI6 A; 1JNZ B; 1WF2 A; 2UUC F; 2CQC A; 2VOD A; 1SQF A; 2UUC J; 1S1W A; 4P72 A; 3QYY A; 3M8P A; 1B64 A; 3VAL A; 2GFF A; 2OSQ A; 2VZ9 A; 1Q8L A; 3NOC A; 4I69 A; 2ZDP A; 5LMU F; 1NND A; 4QW9 A; 2VG6 B; 4DSL A; 3T1A A; 5KFA A; 4KGV B; 3IMQ J; 3ZO7 A; 1JJ2 R; 1UCN A; 2VIC A; 3E01 A; 5A6P A; 4KHM A; 3WQP A; 4C97 A; 4K0K F; 4CLY A; 2QA1 A; 2AGO A; 2PD1 A; 2ZOF A; 1KQS R; 2H4Y B; 4HEA 9; 2HLT A; 2CJX B; 1VC5 A; 2WHO A; 5EUH A; 1RE1 B; 1UWA A; 2HMI B; 2GNK A; 4X62 F; 2XCA A; 1XMO F; 4DL6 A; 3TAP A; 3A8J A; 5BJR A; 5M2U A; 4X62 J; 4X4P A; 2IVF B; 1XMO J; 1WI6 A; 2LLZ A; 5KFH A; 1HWL A; 3MEG B; 3VAJ A; 1HFE L; 1UJ6 A; 1VYA A; 3R9L A; 1D1U A; 4NI2 A; 4R25 A; 1N8R T; 5E3Q A; 3TX8 A; 2OPS B; 4ZHR B; 2VFU A; 2N3L A; 1WOR A; 2GVD A; 4MKB A; 2F9D A; 1QSL A; 3NMA A; 4DZ6 A; 3PXG a; 4PKD B; 4CYU B; 3SV3 A; 1IUJ A; 3K7R A; 4KJI A; 3M8S A; 4ENO A; 3IR7 B; 3OV7 A; 5HAT A; 1ELO A; 1ZOT A; 5C2G A; 3IGN A; 3N01 A; 3SCK E; 3M2U B; 3I9Z A; 2ZJP Q; 4YDX A; 4NLS A; 3TUP A; 3U1N A; 1T05 B; 2ZVI A; 3TRG A; 2ZJQ Q; 1JX4 A; 2KM8 B; 4X84 A; 1TK8 A; 2J8A A; 4OHW A; 2G2Z A; 2HKE A; 3PW0 A; 2MY8 A; 4QIW D; 4N47 A; 5HMW A; 3DLG B; 2FPH X; 1FWP A; 2MLZ A; 3MMB A; 4PQU A; 3TQE A; 1NB7 A; 4TYA A; 2QA2 A; 1S9F A; 4TQR A; 1EP4 A; 2G9O A; 1UEV A; 2Q79 A; 4HAC A; 1E6Y B; 1VS3 A; 2OHD A; 4MFB B; 3A3O B; 4MT1 A; 1YVF A; 1XIQ A; 3LP0 B; 4CZC A; 2VG7 B; 1VC6 A; 3QNW B; 2XY7 A; 4F4A A; 2KKH A; 1CJK B; 3I0R A; 3CSK A; 4JV2 A; 4TKT A; 1KHV A; 4OI4 A; 3GIK A; 1SXL A; 4YB1 P; 1TL7 B; 4AXJ A; 2N3O A; 3UR0 A; 2YKP A; 2IRU A; 3K5O A; 1D9D A; 3R2C J; 3N6M A; 1WOO A; 1XQI A; 2JEJ A; 1YDL A; 3KLI B; 1YJU A; 4QU7 A; 4UZC A; 1TKZ A; 2AW0 A; 4M94 A; 2YX1 A; 1HIY A; 1WAC A; 4ZLJ A; 5IM0 B; 3L4B C; 1SJR A; 4DSK A; 4J91 A; 2FQQ B; 1HW8 A; 3NWR A; 1T7P A; 4K4V A; 4JI3 J; 2IC3 A; 3MMJ A; 2AYM A; 3RW6 A; 3HO1 A; 2MQO A; 1TR0 A; 3UN2 A; 3BBC A; 2MQL A; 2W9C B; 1IKY A; 1FHT A; 3FFI B; 3NGR A; 3TZW A; 2HS3 A; 1VRQ C; 5ETN A; 4DI6 A; 1BD6 A; 3W64 A; 1WSR A; 1CUL B; 3BSC A; 3W9J A; 4GO7 X; 1S6U A; 4LSZ B; 4G1I A; 4NEY A; 2V94 A; 4DUT A; 4RW6 A; 1QTM A; 4F0K A; 3MR6 A; 4OI3 A; 2DGX A; 3V81 B; 1K8A T; 2FGO A; 3CCR S; 1VQP S; 2JEF A; 1F1B B; 4C3K A; 2YH0 A; 1BQX A; 2MQP A; 3HHL A; 3DN9 A; 4LQ9 A; 3EZ5 A; 3ENW A; 2YBV A; 5KG2 A; 2DGT A; 4A8X A; 1MRO A; 3GSD A; 2Z2Z A; 1VBX A; 1ZPW X; 4TN2 A; 1V3S A; 3GFY A; 2IBO A; 2IRX A; 4X4S A; 2IPO B; 2AKW B; 4RW9 A; 3SCJ E; 4HDH A; 2E29 A; 3DDK A; 3I31 A; 4LFB J; 1FVS A; 1NRK A; 3KK3 B; 2F4F A; 5DET A; 4Q0B A; 1N5Q A; 1RHR B; 1VQ9 S; 3Q2S C; 2UXD F; 1QAI A; 4K5S A; 2ZH1 A; 4J9N A; 1S6P B; 4LRB A; 1X4A A; 2VBY A; 4P2X A; 2UXD J; 3TEH B; 3W5Z A; 4YB5 A; 4OYP A; 5ITH A; 4UQG A; 4NA1 A; 3MM6 A; 4ED0 A; 2F8M A; 1TFY A; 2POK A; 4B9U A; 5F3T A; 3NLC A; 3VAK A; 3AOA A; 3PIP Q; 4MK7 A; 2ACM A; 3Q0A A; 2IMW P; 4OYB A; 2C2D A; 1IVZ A; 5GAG I; 3DCA A; 5KFL A; 1HNV B; 4L3N A; 1SKR A; 2UUB F; 3E3X A; 1RAD B; 2UUB J; 1LNQ A; 3G82 A; 3IBC B; 2YY3 A; 4DBQ A; 4BDP A; 3NCP A; 2WON A; 1R8H A; 4NYZ A; 4ZVO B; 4PYD A; 3ZZP A; 4F4Z A; 2WB4 A; 4FVC A; 1NEE A; 3MR2 A; 1RT2 A; 3CJ5 A; 1WEY A; 1PKU A; 4I2Q B; 4DCO B; 1GEH A; 4A8O A; 4QYZ K; 2BYC A; 2UVU A; 2M5Y A; 5IT4 A; 3NEK A; 2GIQ A; 1RCX B; 2XSF A; 5GAD U; 3VF0 B; 1OJ4 A; 3KNG A; 4FVM A; 5B08 A; 4FF2 A; 2DNL A; 1TV6 B; 3MPV A; 3BQ1 A; 3C66 A; 4O3N A; 4A47 A; 4DPO A; 4FS2 A; 2YXL A; 3O44 A; 4ZVP B; 2XCP A; 1Q4R A; 3PYG A; 5E5N A; 2HUR A; 4ZVU B; 2FY8 A; 3A12 A; 3AOB A; 2DIV A; 4JI0 F; 1RT7 B; 2ABY A; 1JLA B; 3QZ8 A; 1MWQ A; 1RLC L; 2GHV C; 2OD4 A; 1U2R A; 2NXU A; 2DCL A; 3MEC B; 1M0S A; 4I4B A; 1N52 B; 2P6S A; 3N4W A; 3M9O B; 4HTI A; 2VFS A; 3OTO J; 1UPP A; 1WOP A; 2ZC3 A; 2IM2 A; 5F9N A; 1WEX A; 1YJ9 S; 2FJX A; 4WE1 B; 2AJ1 A; 2BM1 A; 1HHQ A; 4KH0 B; 2YKN B; 3MAQ A; 2B4P A; 4KGK A; 3VAM A; 4ZA1 A; 3AXK A; 3HHD A; 1A7G E; 1VMB A; 2MY7 A; 2W1B A; 4WK1 A; 4ECT A; 1CJT A; 2EFN A; 2H5J B; 3MEE B; 1BY9 A; 2JDJ A; 5BYQ A; 2R7R A; 3UD3 P; 4PYA A; 3SBM A; 3ILJ A; 2HGM A; 3GZ7 A; 4WPA A; 4C7Q A; 2D9P A; 4XIU A; 4IG3 B; 4WFZ A; 3SIP B; 4UZB A; 4UOH A; 3VAI A; 1JLC A; 1KON A; 3NL0 A; 5KFT A; 2R9L A; 3OFG A; 4N7T A; 3ENQ A; 4ED4 A; 1M90 T; 2DR7 A; 3H2L A; 5D0E A; 2PEB A; 5HJY A; 2ZDO A; 4RW4 B; 3KG1 A; 2M70 A; 2WVE A; 5JXS A; 3AQO A; 2VJV A; 3M32 A; 2LQB A; 4O4G A; 2OPS A; 1N34 F; 3BH7 B; 3VAH A; 3I0S B; 2BJE A; 3MFH A; 4LF7 F; 1RU1 A; 4M5I A; 3BV8 A; 4CYU A; 1KTV A; 3BGR B; 2RF2 A; 4FXW A; 4X4O A; 3HVT B; 1RT5 B; 1ZM2 A; 2XGP A; 3CT9 A; 2DNY A; 5KAK A; 3GQC A; 4ZVQ B; 4CNZ A; 2EI5 A; 4X64 F; 1IR1 A; 1RTD A; 1T05 A; 4FZV A; 4X64 J; 3MDF A; 3GCX P; 4E8U A; 3DRR A; 1V5V A; 2APO A; 3QGH A; 2VDH A; 2RS8 A; 4DFJ A; 5E0O A; 3BYP A; 1TQL A; 2HG4 A; 3JSM B; 3P5B P; 2RJZ A; 4OV1 A; 3SDE A; 3N5B A; 2CVI A; 2DO0 A; 3BS9 A; 1Q16 B; 3P96 A; 5L1J A; 1FRI A; 1S6Q A; 4PG7 A; 5CAA A; 1ITP A; 4ED1 A; 4Q8F A; 3FKB A; 4LF2 A; 1F5B A; 5F8G A; 4QPX A; 3BDE A; 3DLK B; 4JYA J; 2BW7 A; 3UN5 A; 3HVA A; 5K14 B; 3B82 A; 1GXT A; 4Z7C A; 2YNI B; 4B3O B; 4CH7 A; 1J5E F; 4C8N A; 4NRT A; 3R8Y A; 1DHM A; 1J5E J; 4FYD A; 3EE3 A; 1GMU A; 2QZ8 A; 2HS4 A; 3IM8 A; 5DDQ C; 4DPY A; 3CIZ A; 2FDN A; 4DQI A; 3T3F A; 3R6L B; 3AJ2 A; 4DV0 F; 1FA0 A; 1KFS A; 3M8W A; 2WVF A; 4JUZ A; 5A8W B; 1FX2 A; 2LDY A; 2CJY B; 1IJF B; 3W5Y A; 5IM0 A; 2KB2 A; 1KQF B; 3FZB A; 3MMC B; 5U47 A; 1RWX B; 1LW2 B; 2HFO A; 5I3U B; 4OZN A; 3LP2 A; 2NSB A; 3MFI A; 2CQH A; 1FRL A; 4G1P A; 2QYC A; 2B0G A; 1AA1 B; 3PKY A; 1HQU A; 1DQ8 A; 5EGY A; 4LJM A; 1NK9 A; 1NXI A; 3IWN C; 3ZZT A; 2QMX A; 2XMU A; 4PXD A; 1WEL A; 4F4X A; 4DEZ A; 3VQS A; 5H9E J; 3MMA A; 1IBL F; 3HSJ A; 4HKQ A; 3C6T B; 1NDL A; 3B4D A; 5F3Z A; 1UEK A; 1J5O A; 1HBO A; 4N8N A; 3NGS A; 3VQT A; 3R5D A; 1RTH A; 2V2Q A; 3V81 A; 1FER A; 2MTL A; 4P6Q A; 3TA0 A; 4IO9 Q; 5HMX A; 3DFE A; 4HLB A; 4ZPC A; 4O3S A; 3TEG A; 4CI0 B; 4FNH A; 3KWM A; 4LRF A; 2NYI A; 3MM9 B; 2FZG B; 2ZZM A; 2ZKT A; 5ETP A; 3UN3 A; 2QV6 A; 4HHU A; 3DGP B; 1WNE A; 5C42 A; 2M0G B; 2ZZT A; 2L9W A; 5KFZ A; 2HHP A; 3UPF A; 2WSC C; 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1DTT B; 2RDJ A; 4QOT A; 4MKY A; 2AEF A; 1HYS B; 5B0A A; 1UMJ A; 4KH1 B; 3QWP A; 2OMO A; 2XMK A; 4WE1 A; 2BOA A; 2HHH F; 2GQQ A; 3CVK A; 4CH1 A; 4DR3 J; 3HT0 A; 1RT4 B; 3PY8 A; 2YKN A; 2CKW A; 2XSJ B; 3RU0 A; 3FSX A; 2HND A; 3OSN A; 4LR9 A; 4OIX A; 3I87 A; 4U7U K; 3H0P A; 3UNG C; 1WWH A; 1S4E A; 3MPD A; 3MEE A; 2QL9 B; 2G0J A; 1FD8 A; 3CJK B; 2IDL A; 1S9E A; 1X7V A; 1F2H A; 1HR0 F; 2IJN A; 2JZ5 A; 4QWE A; 1HI1 A; 1HR0 J; 2J9C A; 1SUQ B; 2PA3 A; 4WP9 A; 3I82 A; 3TP2 A; 1T3O A; 4F0H A; 1JKH B; 1GMW A; 5MAO A; 4HT5 A; 1QY7 A; 1AZS A; 2G4B A; 4PUO B; 2V6A A; 4BWJ A; 3RTV A; 2XEX A; 3ENV A; 1S72 S; 3MWB A; 4ECV A; 1FJG J; 2BA9 A; 4FP9 A; 4BLG A; 3AD7 C; 1PAU B; 2BOP A; 4USJ C; 3S7R A; 2B6A B; 3EGW B; 3WIU A; 4EO6 A; 2ATC B; 2NXN A; 1YZ6 A; 4F25 A; 1URR A; 3T5L A; 4O4R A; 3I0S A; 4L76 A; 2FHO B; 3KHH A; 3D7S B; 4USU A; 1KLN A; 2YNH A; 4V19 J; 3ZZU A; 3BGR A; 2KYZ A; 3QT7 A; 3KK2 B; 1G4C A; 4DR6 J; 3QO9 B; 1DFD A; 3LGN A; 4FKY A; 2MZT A; 5HI7 A; 1WC0 A; 2JLE A; 2Z56 B; 5D0G A; 3ET6 A; 3MCM A; 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