3ID8A

Ternary complex of human pancreatic glucokinase crystallized with activator, glucose and amp-pnp
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
453
structure length
450
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 169
structure length 450
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3id8A01
1E4GT 3R8EA 3WEEB 4BRLA 4FO0A 3G25A 1NLVA 2YHYA 2FLOA 2P9UA 4QS8A 3AY9A 2WUSA 2Q1NA 3BP8A 3WEEA 4BROA 5ADXA 5I9EB 1HLUA 5TKYA 3MMVA 1GLEG 3I8BA 1WOQA 2NRHA 3HI0A 1V4SA 3H3NO 3WXLA 3QFPA 1JCGA 4QS9A 2D0OA 2A3ZA 3A8YA 4O8KA 3VESA 3LDPA 1YXQA 5AQVA 2FF3B 2P9LB 2HOEA 4BR4A 5JLFA 2VYPA 4FWNA 3VEVA 2FXUA 5AFUH 3VEWA 4BRFA 2W41A 3HSCA 3QICA 4EIAA 3IUCA 5EOYA 1BWFO 1T44A 3LDLA 1NBWA 3LM2A 3FE1A 1SZ2A 3D2FB 2P9LA 4MLEA 3F9MA 2D1KA 3MN9A 4EFHA 3EN9A 5BPMA 1YAGA 3UKUB 3ZEUB 3C7NB 2QWOA 3CJAA 4BRMA 2P9NB 3D2FA 4B1YB 2ZF5O 1J6ZA 4PKHA 3AARA 3U9DA 5AQIA 4PKGA 3VF6A 4HTLA 2E1YA 3WQTA 2AA4A 2BUPA 1NGBA 5AQXA 4JN4A 3W3DA 3L0QA 3WT0A 5EX5A 1NGEA 4GY2B 1Y64A 3C7NA 3ZEUA 3H46O 4BRDA 4EAHD 1NWKA 2P9KB 4WQ5C 4FPBA 5CE3A 3SLCA 3C0BA 4AM7A 4CZMA 3SMPA 3A5LC 4K42A 3EKUA 1SQKA 3VENA 4B9QA 2HF4A 4ISEA 5BRDA 1U2VB 4XEIA 5AQLA 3QBXA 5EY4A 2P9KA 5KQ8A 4H5WA 2HMPA 2IVOA 4MLHA 3IFRA 3W0LA 1MWMA 2GEMA 1QHAA 1YVNA 4H5VA 3VGKA 1GLFO 4CZKA 3FZKA 3DXMB 2CH5A 4J8FA 3QBWA 1U2VA 4A61A 4BRNA 2Q36A 3S41A 4H0YB 1MA9B 1NMDA 3FFKB 2QWQA 1C0GA 2YI1A 2YHWA 4JAXA 3BF1A 2CGLA 4PKIA 2EWSA 4JD2B 5FPEA 1RFQA 4CD1A 1GLJO 4K43A 2Q97A 4DCHA 1TUUA 1NGGA 5ADXH 5KPZA 1QQNA 3TU5A 3MCPA 4A62A 4BQZA 2Q0RA 4DB3A 4XH4A 3H3OB 4WQ5A 3LDNA 2IIRA 4JD2A 4CZIA 2Q2RA 4FSVA 2A42A 3BEXA 2QWMA 3R6MA 1Z6RA 1BU6O 5AQTA 2YJFA 2VCPA 2V7YA 5BRHA 1BOTO 4B1XB 4A2AA 1K8KB 3O1WA 2A6AA 3ULEB 3B8AX 3UKRB 3DAWA 4WYBA 3ZX2A 3TPQA 4DQ8A 2BTFA 4BRPA 5LY3A 3VGMA 4QS7A 1BG3A 1K8KA 5AQPA 4YDUC 1NGJA 3ULEA 3UKRA 3GG4A 4XH5A 4IZ9A 3SK3A 1Z05A 1MDUB 3WXKA 3A5MC 2CGKA 4FL9A 3CETA 3DJCA 3A5OC 3UE5A 4A2BA 5FPDA 3WQUA 3WUHA 2W40A 1RDWX 3CJ1A 4FWKA 1JCEA 3CJ7A 4CBXA 3ATUA 2ZWHA 3GDQA 5FPMA 2Q0UA 3RSEB 5AQZA 3CIPA 1NGDA 3OHRA 3H1QA 1HKCA 3LDQA 4B1VA 2QWRA 4FWLA 2I7NA 2P9IB 1SAZA 3VGLA 2D4WA 4BRHA 3HM8A 1HUXA 5AZIB 3CERA 3CJBA 3H45C 4BREA 1JCFA 3FZHA 4M7YA 4RWTA 4BR9A 3FZMA 3O80A 2Q31A 2FSNA 4H5NA 4YDUA 4C23A 5ELZA 3VF4A 1NGAA 4BG9A 2P9IA 3UKUA 4BC3A 4FWMA 5E84A 5AZIA 3A0IX 2P9NA 1D4XA 1G99A 4RTFD 5AQQA 5F0XA 1IG8A 1GLDG 2ITMA 3EO3A 3QMLA 3HBTA 2E2OA 3MN7A 3FZLA 3O1BA 3EKSA 4B1UB 4CD3A 3R9PA 4DHYA 3CJCA 2CGJA 3MDQA 4FWRA 1Q18A 4IO8A 3O8MA 2HF3A 4H0PA 5BN9A 4H0XB 3L4IA 2V7ZA 1NGIA 1ATSA 3U4LA 3ZETB 1YUWA 4HWIA 5AQYA 4BRCA 3JS6A 3CQYA 1V4TA 5AQHA 3VOVA 3VEYA 3WXJA 3CHWA 2P9SB 2CH6A 5B8HA 4MO5A 5JLHA 1GLLO 1XUPO 2DPNA 1U6ZA 1ESVA 2NZTA 1NGCA 3VEXA 4BGAA 2FSJA 5AQOA 2IVNA 3D2EB 4FWQA 2QWNA 1LOTB 1X9JA 3DXMA 1HKBA 2P9SA 3MK6A 4XH1A 3EZWA 1BA0A 2GELA 4PL7A 1GLBG 4BC2A 1X3MA 4BC5A 4H0OA 4H0TB 2GWJA 1DEJA 4BR5A 3D2EA 1TYQB 4F9OA 2E1ZA 3CI5A 3LM9A 5AQNA 5AQJA 3FGUA 2YCHA 4CZGA 2I7PA 2AP1A 2ASOA 1OKJA 3BF3A 4CBUA 3O6WA 4JNEA 1TYQA 4BRQA 3VF2A 4CBWA 3GBTA 1MWKA 1HKGA 1T6CA 5AQSA 5LJVA 4CZEA 5AQGA 2OANA 3CQXA 2NLXA 5KPTA 4BC4A 2P9UB 5AQMA 3MN5A 4FWPA 1QQMA 2GWKA 5LJWA 1XC3A 3M1FA 1KXPA 1KAZA 4IJAA 4K41A 1DKGD 4BR7A 3HTVA 3D7EO 5BREA 2E2PA 1QZ6A 3CJ9A 2ASPA 4K25A 1QQOA 4FWOA 2E2NA 3IDHA 5JMVA 1CZAN 3UB5A 1BUPA 4CZHA 3H1VX 4PL8A 1ZXOA 3H6EA 1IJJA 4M7XA 1HX1A 4CJ7A 5BPNA 2E2QA 2E20A 4CZFA 1ATRA 1X3NA 1ATNA 3KVGA 2F9TA 3ATVA 5BRFA 1NM1A 3AAPA 4H0VB 1S3XA 3RSEA 5AZJB 3GL1A 1P8ZA 5AQKA 2GTDA 2PBDA 4BR2A 1RGIA 3I33A 3ZX0A 3HZ6A 5AQWA 3BUZB 2V52B 2VWBA 4Y0WA 4CZLA 5AR0A 4E1JA 1NGFA 3ID8A 2H3GX 3IMXA 1KAXA 3L6QA 2GUPA 2D0PA 5AQRA 5AZJA 3SJHA 3AAQA 3J8AA 3VETA 4WQ4C 3DXKB 4BVOA 5FPNA 4MO4A 3MN6A 4CI6A 4BQLA 2A40A 2PAVA 4CZJA 5JICA 4GNIA 5E26A 1BA1A 1HJOA 1HPMA 3VEOA 3DWLA 3O4WA 3P4IA 4FOIA 4BG8A 3VPZA 4H5TA 3DXKA 5F2RA 4B1ZA 2YJEA 4O5FA 2QXLA 3KHYA 4FPAA 1DGKN 4RCHA 5AFUA 4BRGA 3VEZA 3LL3A 4I6MB 3U8XA 2ZGZA 3FLCO 1TUYA 4NO7A 4BRKA 4H5RA 3QDKA 2ASMA 1XQSC 2YHXA 4KBOA 3EL2A 4AM6A 3GOIA 2E8AA 1H1VA 2FF6A 4L3QA 3WXIA 1ZBSA 3JXUA 4JHDB 4I6MA 5AQUA 3ZETA 3M6GA 3ZX3A 1E4FT 4ISFA 4BRIA 3U9ZA 1KAYA 1WUAA 2QWLA 1S22A 4FOEA 4IXCA 2E88A 2P9PB 4ISGA 1C0FA 4BRAA 4EHUA 3ENOA 5BN8A 3VERA 4M63C 4FWSA 1T6DA 5KPRA 1QZ5A 4JHDA 3FR0A 4WQ4A 2FSKA 4BVPA 2F9WA 3KZBA 2V51B 5EXWA 2QM1A 2P9PA 2QW9A 4H03B 4IJNA 2IVPA 3ENHA 3QB0A 3QFUA 1GLAG 4Z94A 1GLCG 4LC9B 1BDGA 5EVZA 1NGHA 2A41A 5BPLA 2UYTA 4BGBA 1LCUA 3GE1A 5AQFA 1BO5O 4B1WB 1R59O 3O08A 4BR0A 2QWPA 2A5XA 5KQDA 2ZGYA 5BR9A 4NB4A 2KHOA 3FZFA 2J4RA 4EHTA 3LDOA 3SMSA 4IWVA 5F1XA 3A5NC 1EQYA 3M3ZA 3O5BA 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGJA 3V9WA 1RT3A 4QS8A 2XO7A 4GV3A 1GOCA 3SBTA 3KLGA 1RT4A 4LH5A 3WEEA 4DMNA 4B9SA 3T1AA 3V81A 1HLUA 1CZ9A 3MMVA 1S6QA 3I8BA 4CHPA 1V4SA 4CJPA 4QAGA 3NGYA 4B8CA 3NE6A 4FLXA 3WXLA 1FW6A 4ILHA 2ETJA 1A5WA 5IT9O 3LDPA 3G4SN 2FF3B 1YJNN 3L3VA 4JRQA 4BR4A 4HUGA 4IG0A 1I3AA 4KI6A 2UXCK 4ZHRA 5GAHP 1SKRA 4DLEA 3MEEA 2W41A 2IS3A 4DR4K 1SZ2A 4WF9L 2KFZA 2P9LA 2WOMA 4Z4FA 1YIJN 4H4OA 5CZ2A 3B6PA 3ZEUB 1Q9YA 4IKFA 2VQEK 4JKGA 3D2FA 4IFVA 2ZF5O 4PKHA 1N34K 3U9DA 5CY4A 2E1YA 1NGBA 5AQXA 3W3DA 3L0QA 4GY2B 1Y64A 3JAMO 1NWKA 2P9KB 1ZBLA 5CE3A 4K42A 3HOSA 5KGWA 3DLEA 4PUOA 3SQ0A 1HPZA 5DK5A 4XEIA 4E1MA 3Q7CA 3QBXA 4E7HA 4CIFA 3ASMA 4FJLA 4NXNK 3LALA 4CZKA 3OYCA 3AGKA 1VQPN 4A61A 1MA9B 2XY5A 3V9UA 3DLGA 2VG6A 3ZT4A 2NRXA 1KSPA 1B9FA 4JD2B 5FPEA 3L2RA 4K43A 4YOYA 1NK0A 4ICLA 4CHZA 1TUUA 5ADXH 5DM7L 3TU5A 3ZSOA 4A62A 5C25A 5FROA 3LANA 4DV4K 4ELVA 1U49A 3DI6A 4HVJA 1Z6RA 1BU6O 1VSDA 5AQTA 3KKSA 2V7YA 5FRNA 1BOTO 3LZJA 1ILYA 3C95A 3P83D 3B8AX 3UKRB 3K2PA 2YHBA 4IDHA 4DV0K 4YOUA 4DR2K 3L2QA 1SS6A 3SUNA 2Z1HA 4WYBA 4AHVA 3AGRA 3VGMA 1K8KA 5AQPA 3F5TA 1IG9A 3AVLA 3L3UA 3ULEA 1OVYA 3SK3A 1Z05A 4UQGA 3ITHA 3SV3A 2Y1IA 1VQNN 1KVBA 5FPDA 3E9OA 1LAWA 2F96A 3WUHA 1OH7A 1RDWX 2YKNA 4CVNE 5KRTA 3HOTA 3THWA 4GKJK 2O8FB 2P51A 3R1XA 4CBXA 1W7AA 3E66A 3RTVA 4KHYA 3I8DA 3S3MA 4OX9K 4CK3A 2OPRA 2YHAA 4M3UA 3P1GA 4DUYK 4IDKA 3LDQA 3SYZA 4ZTFA 4FWLA 2I7NA 2P9IB 3LPTA 2D4WA 4KH4A 1JCFA 3LP0A 1ASUA 4OPHA 3O80A 3N4QA 5C2FA 3CXCM 5GIPA 4BG9A 3UKUA 4DTXA 5M1FA 2A1SA 3SUPA 2P9NA 1D4XA 1G99A 4JKBA 1KCFA 5F0XA 1GLDG 2RKIA 4Z0UA 4CEZA 3R9PA 3CJCA 2CGJA 4FWRA 4JK8A 2HNDA 1Q18A 4DQSA 4M3XA 3MXMA 2HVHA 1GOBA 2V7ZA 1NGIA 2DFHA 4ELUA 1VQ6N 1HYVA 5GAGP 4M3TA 3JS6A 4PWDA 1VRUA 3WXJA 3SAFA 3CHWA 2O8EA 5B8HA 4JKHA 5J2NA 4FLVA 3CC7N 2IVNA 2E4LA 4FWQA 1SKWA 1BI4B 3F2KA 1HKBA 1UAXA 2P9SA 1BA0A 4DTJA 4G9ZA 1VK0A 2HSTA 4AHCA 1CLQA 1FK9A 1SL2A 1DEJA 3O9QA 3CMEN 3EZ5A 5AQJA 4CZGA 4YORA 4WFBL 2ASOA 3BF3A 4NXMK 3DRSA 2D0AA 1RT2A 3TI0A 1VSEA 4JI6K 1RDCA 4C8KA 1NK4A 3IKMA 3S3OA 2GV9A 1VQ7N 5AQMA 3MECA 5JVGL 1QQMA 4FJIA 1XHXA 3KIOA 1KC8O 4K41A 1DKGD 3HPGA 1TK8A 3QINA 3PX0A 1VQ8N 2UUCK 3J7ZO 2E2PA 3OY9A 3EY1A 1QQOA 4FWOA 1CZAN 3TAFA 4Y1CA 1RT6A 4KH6A 2FBVA 1NK9A 5HOOA 1NOYA 1N33K 2E2QA 1Q82O 2NUBA 3KVGA 2YV0X 2QI2A 5KTQA 2ZJQL 3ATVA 1VSLA 1BCOA 2D0CA 2RE2A 1QSLA 5BRFA 3L8BA 3ZT1A 4EZ6A 3RSEA 2PY5A 3PUFA 5HRRA 3GL1A 1J53A 3SI6A 4J2DA 2PBDA 3ZX0A 4JI5K 3HZ6A 1ASWA 3BUZB 4NLCA 1L3TA 4J2EA 4FM2A 4Y0WA 3CMAN 5AR0A 4E1JA 3ID8A 2H3GX 1NK7A 2GUPA 2ZJRL 3NVMA 3AA4A 3AAQA 1BHLA 3DXKB 3VQPA 1BL3A 4GNIA 5E26A 1HJOA 3D45A 3THYA 4N76A 4IEIA 2IC3A 3QEPA 4PHTX 2P5OA 4OPKA 3RMCA 3ZT0A 1XMOK 3EEQA 3KD1E 4ELTA 2VWJA 2QXLA 4FPAA 3SJJA 3VEZA 1REVA 1KFSA 2OA8A 3VQ9A 2WFBA 2NRWA 3EL2A 3ZSZA 3SNNA 3M8PA 2FF6A 1BQNA 1WSIA 4FJNA 3P31A 1QVFM 3ENBA 3E01A 4W5QA 5AQUA 4I6MA 1TKDA 1E4FT 2IAJA 1WUAA 4FOEA 4IXCA 1Y97A 2E88A 4EHUA 3ENOA 1XC9A 3C6TA 4FWSA 3J81O 3WXMB 4JHDA 2NRRA 1T05A 1QVGM 4HHTA 1X9WA 1VQ4N 1WNSA 4BVPA 4CJLA 1NJZA 1JXEA 4NCBA 4KHPK 2HBLA 4H03B 4X62K 5FDLA 2HHHK 5JS1A 3CG7A 5EVZA 5J1EA 2A41A 4N47A 3KK3A 5AQFA 4N5SA 3KLIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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