3ID8A

Ternary complex of human pancreatic glucokinase crystallized with activator, glucose and amp-pnp
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
453
structure length
450
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glucokinase
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 169
structure length 450
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3id8A01
4DQ8A 2KHOA 3CQXA 5E26A 5AZIA 1OKJA 4H0PA 5BN9A 2W40A 1NGEA 1GLAG 3S41A 2P9LA 4BGAA 4B9QA 2D0OA 2NRHA 5KQ8A 1NGJA 2CH6A 1TUUA 1D4XA 4KBOA 5ELZA 4FWMA 2FSKA 4K43A 4YDUC 2Q2RA 4M7XA 3ZEUB 3MDQA 3MN9A 4BRHA 1KAYA 3CI5A 3VERA 2GEMA 4HWIA 1WOQA 3CJ1A 1CZAN 4CZLA 4BG8A 1NLVA 1BG3A 5KQDA 4A61A 4IJNA 4BRDA 3CJ9A 3CJ7A 1T6DA 3QICA 1EQYA 2P9NB 5AQYA 3WXLA 1QHAA 3U8XA 2GTDA 4CBWA 4EAHD 3UKRA 3O4WA 2V7YA 4H5VA 3ZETB 3ZX2A 1NM1A 4CBXA 4BRFA 1R59O 3WT0A 1Z05A 2E2QA 5JLFA 4MO4A 2A40A 1P8ZA 3LDQA 3BF1A 5FPDA 4H03B 5AQUA 3M1FA 2E20A 5AQPA 2IIRA 4EHTA 1NGBA 1ATSA 4FPAA 1RFQA 5AFUH 3ID8A 2Q0UA 3QFPA 2PBDA 2H3GX 3BUZB 5AQJA 4A2AA 4BRGA 1J6ZA 1Y64A 4BRKA 1E4FT 2AA4A 5F1XA 1RGIA 2Q31A 3CERA 1DEJA 3A5LC 3MN5A 2D4WA 3VEYA 3O08A 4IO8A 5F0XA 1KXPA 1SZ2A 3H3NO 4FOEA 2BTFA 3DXKA 3CQYA 2QWLA 2D1KA 3UB5A 3IUCA 2A41A 2AP1A 4IZ9A 1TUYA 2EWSA 1NWKA 4CZGA 1RDWX 3IFRA 5BR9A 4BRQA 2P9PB 5BPMA 2QWOA 4H0YB 3IMXA 2E1YA 4K41A 4BRAA 4FWOA 4I6MB 4PKHA 3R9PA 4JD2A 2ZWHA 1IG8A 1BUPA 4WQ5C 2V7ZA 4XH1A 4ISFA 3C7NB 3ZX3A 1TYQA 2E1ZA 3O6WA 4H5NA 3MMVA 4XEIA 5AQTA 2ASOA 4CZEA 3AAQA 5E84A 2HF4A 3VF2A 3WXKA 2DPNA 3DXMA 2F9WA 5AZJB 4PKIA 4EFHA 3KHYA 1NGGA 5AQHA 4YDUA 5EOYA 3WEEB 3C0BA 3H1QA 4BRCA 2YHWA 1JCGA 2E2OA 2GWKA 2WUSA 4F9OA 1JCFA 4PL7A 3H6EA 3HTVA 4IXCA 2P9IB 1ATNA 3H1VX 3LDOA 3KVGA 4BRMA 2QM1A 3TPQA 3VENA 3O5BA 4JN4A 5FPEA 3DWLA 4RCHA 4A2BA 1C0FA 2IVOA 5LJVA 3BEXA 1HUXA 3SK3A 1K8KA 3VESA 2HOEA 2YJFA 2QXLA 3QBXA 5AQLA 1X3MA 4H5TA 5AZIB 4JHDA 3VEZA 3LDLA 5BPNA 2P9LB 2NZTA 4BQZA 2IVNA 4CZIA 1C0GA 3QFUA 4CBUA 4BC3A 4RTFD 3RSEA 2YJEA 2HF3A 4PL8A 3UKUA 1DKGD 1ATRA 3HSCA 4CD1A 3EO3A 1S3XA 3CJAA 5AQXA 4E1JA 4M63C 3BF3A 2A5XA 2GWJA 5F2RA 1NGCA 4NO7A 5AQZA 5AQIA 1T44A 4B1ZA 3JXUA 4IWVA 3GG4A 5FPMA 1G99A 5EX5A 3VGMA 4AM6A 5KPTA 1GLCG 3QB0A 1XUPO 4H5RA 3H46O 2P9KA 1IJJA 5EY4A 3HM8A 3LDNA 3SLCA 3UKRB 4FWKA 2GELA 3WQTA 4ISGA 3ULEA 2CGJA 3GOIA 2P9UA 2ZGZA 4FPBA 4M7YA 3VEOA 3VGKA 4C23A 4ISEA 1BU6O 3LDPA 4FWLA 5AQRA 3EN9A 3UE5A 2FSJA 4RWTA 3AARA 1JCEA 4H0OA 2NLXA 2GUPA 4IJAA 4WYBA 5AR0A 3L0QA 3SMPA 1KAZA 5KPRA 3VOVA 5BRHA 1GLJO 1HJOA 2HMPA 2VCPA 5BPLA 3R6MA 1BA0A 4BG9A 2F9TA 1MWKA 2FF3B 1HKCA 4J8FA 3FE1A 1ZBSA 3VETA 4WQ5A 1LCUA 2J4RA 5LJWA 4XH5A 2BUPA 3HBTA 4WQ4C 5EXWA 3GBTA 1HPMA 3O8MA 3D2EA 3WQUA 2YHYA 3DAWA 3VPZA 4BRLA 2FF6A 4CZHA 2P9SA 4Y0WA 1T6CA 1Q18A 4FWSA 4K25A 3DXKB 1KAXA 4BREA 2CGLA 4DHYA 5I9EB 4H0XB 2FXUA 3VF6A 4AM7A 1GLDG 3OHRA 4B1WB 4CZFA 1BWFO 3JS6A 3ENHA 3ATUA 2E8AA 5LY3A 4JD2B 3VEWA 1NBWA 3L6QA 1QZ5A 2Q1NA 1TYQB 2IVPA 5B8HA 4O8KA 3VF4A 4FWQA 5CE3A 1H1VA 3F9MA 2CH5A 4FWNA 1WUAA 4L3QA 4BR4A 3DXMB 1BA1A 3QMLA 4BVPA 2CGKA 2Q97A 4B1VA 3BP8A 4BRNA 2A3ZA 3W3DA 3D7EO 5AQVA 5AFUA 1GLBG 2FLOA 3D2FA 3M3ZA 3CIPA 2D0PA 2QWRA 3VEVA 4FWPA 1NMDA 1BDGA 4BR5A 3J8AA 3ATVA 4QS8A 3SMSA 3P4IA 3KZBA 1YUWA 1ZC6A 4CZKA 2QWQA 1X9JA 1QQMA 3ZX0A 4BC2A 4O5FA 1QQOA 1K8KB 3AY9A 3EL2A 3MCPA 5BRDA 5JICA 3U4LA 5ADXA 2E2PA 4JHDB 5EVZA 3LM9A 2YI1A 1QZ6A 4HTLA 1U2VA 3FZFA 4H0TB 3SJHA 3FLCO 3RSEB 4BR9A 3IDHA 3UKUB 2E2NA 3W0LA 3GE1A 2V51B 3GDQA 3FZLA 2VWBA 1Z6RA 4B1YB 4BR7A 4MLEA 1S22A 1QQNA 1NGDA 3ZEUA 3I33A 3CJCA 5BN8A 2A42A 3H3OB 3LM2A 4CZJA 4FL9A 3U9ZA 4Z94A 4EHUA 3FR0A 1X3NA 1XQSC 5AQNA 4B1UB 4WQ4A 1SAZA 3WUHA 2P9KB 4CZMA 1XC3A 2I7NA 1NGHA 3A8YA 3I8BA 4BC4A 4BR2A 2YHXA 4BC5A 2P9NA 3ULEB 2ZF5O 2QWPA 2P9UB 2QWMA 2QWNA 2YCHA 3VGLA 4GY2B 3WXIA 2QW9A 3ZETA 3EKSA 2E88A 2W41A 4LC9B 5AQFA 4DB3A 3A5MC 3TU5A 4BROA 1GLLO 1U6ZA 1NGAA 3G25A 3HI0A 1LOTB 2ASMA 5AQSA 4CD3A 2OANA 3QDKA 3HZ6A 4FSVA 1DGKN 3EZWA 3GL1A 4FWRA 5KPZA 5AQMA 3FZMA 5JMVA 5AQKA 5TKYA 3WXJA 3D2EB 1YVNA 4FOIA 4B1XB 4BR0A 1HLUA 2P9SB 1MDUB 5FPNA 4BGBA 1MA9B 3A0IX 3R8EA 1YXQA 3A5NC 1V4SA 1E4GT 1GLEG 2VYPA 4JNEA 3U9DA 2I7PA 4BQLA 4CJ7A 3H45C 3FZKA 3FFKB 2PAVA 2ZGYA 3CETA 2ITMA 1HKGA 3O1BA 1V4TA 3FZHA 2Q0RA 5ADXH 1ZXOA 2P9PA 3B8AX 5AQQA 5AQGA 3LL3A 4BRPA 4I6MA 2A6AA 4FO0A 1HX1A 1NGFA 4H0VB 4PKGA 5BRFA 1GLFO 3O1WA 2Q36A 3C7NA 1BOTO 1MWMA 2ASPA 4JAXA 1NGIA 2FSNA 3DJCA 2UYTA 1BO5O 4GNIA 4XH4A 3MN7A 3D2FB 4CI6A 4MLHA 5AZJA 3MK6A 3A5OC 4H5WA 1YAGA 3CHWA 4DCHA 4QS9A 3WEEA 4EIAA 3O80A 4A62A 3MN6A 5AQWA 4MO5A 4K42A 3M6GA 3EKUA 2P9IA 3AAPA 3ENOA 5BREA 2V52B 1SQKA 4QS7A 5AQOA 3QBWA 3L4IA 1ESVA 3FGUA 4NB4A 5JLHA 3VEXA 3CJBA 4BVOA 4BRIA 1HKBA 1U2VB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSVA 4DQ8A 5E26A 3NGIA 4AQYK 5BN9A 4GV3A 2W40A 3THYB 3S41A 5J2NA 1VK0A 2D0OA 5KQ8A 2DTUA 4W5OA 2YKNA 1ASWA 1SKSA 4NXMK 4DR2K 5HRSA 4KTZA 3QINA 3J7YP 4GMJB 3QEIA 1J5OA 5AJ3K 1S1TA 4BRHA 4LSNA 2UXDK 3OYMA 2HHSA 3SPZA 3HT3A 3VTHA 1NLVA 3HPGA 4H4OA 3BGRA 4FJGA 3OYJA 4JKBA 2G8VA 4M3ZA 2P9NB 3CCSN 3U8XA 2GTDA 4I2PA 5E41A 1WSHA 3O4WA 3TAMA 2V7YA 4H5VA 3ZT2A 3ZX2A 1NM1A 5KRTA 5J2QA 2XY8A 4BRFA 3WT0A 1LW0A 1J53A 2WOMA 4LH4A 1KFSA 3T19A 4M3WA 1DTTA 3CFPA 1P8ZA 4LF7K 3BF1A 4H03B 3J80O 3V1OA 4LFCK 3HVRA 2E20A 4Q0BA 2OTJN 1RILA 1RFQA 5AFUH 3BDPA 3C6UA 2Q0UA 3HOTA 4CJRA 1RDUA 5F1XA 4N76A 2HHWA 4KB0A 3ALYA 2OTLN 1DEJA 3A5LC 3MN5A 3VQPA 3L3VA 1K73O 5F0XA 1SZ2A 5KGWA 3DXKA 1WBBA 4IOAL 3NBPA 2O8BA 3ULDA 3CQ8A 2QWLA 2D1KA 3UB5A 1VQKN 2RPIA 4DTSA 2WBNA 4C8NA 4FM0A 4B08A 1N32K 2B6AA 4M3TA 1IKVA 4FJ7A 4KHPK 2G8KA 4IFYA 1HQEA 2QWOA 5HLFA 3RMDA 4Y1DA 4NLCA 3THXA 2ZWHA 4XH1A 3OYDA 4E89A 1KVBA 4BE2A 2EX3A 3ZX3A 2WTUA 3O9UA 3AO4A 4ZTFA 4DTNA 2HBLA 4Z4GA 2ASOA 1L3SA 2ZJQL 2VG6A 5E84A 4IDHA 2DPNA 1YJ9N 3PX6A 1Z25A 4EFHA 4CF1A 5GAEP 1NGGA 4FJJA 5AQHA 4FXDA 3C0BA 3H1QA 2YHWA 4F9OA 2E2OA 4PL7A 4JK9A 3HTVA 2ITGA 2P9IB 3C6HA 4BRMA 3VENA 3DWLA 1BGXT 4RCHA 2Y1IA 3BEXA 3OYNA 4DQSA 1KRPA 2HBKA 3LWLA 4X64K 4GKKK 5BPNA 2P9LB 1B92A 2NZTA 1U49A 3WNHA 1C0GA 1N34K 4BC3A 4M3XA 1HJRA 4PL8A 3SBTA 3HSCA 4CD1A 3EO3A 4E1JA 1I3AA 4AHSA 1NU0A 1NJIO 3VQ9A 3CCEN 4B1ZA 3JXUA 3I55N 3V1QA 1TAUA 4YOYA 4YOWA 4FM2A 3VGMA 3PO4A 4F2RA 2KFNA 4HVJA 3ZSWA 3G4SN 4DQQA 3H46O 4F3TA 3CMEN 4DF4A 3CCQN 4FJ5A 2YX6A 4CJTA 3UKRB 2O8DA 2UUBK 2CGJA 4DR3K 3VEOA 4Z0UA 4JI4K 3KLIA 4ISEA 3CPWM 4PWDA 1RBRA 3SMPA 4WFBL 3VOVA 2G8WA 3DLHA 4E19A 2HMPA 5GINA 2VCPA 5BPLA 1JKHA 3PIPL 3OS2A 2FF3B 1D5AA 1M90O 1WSIA 4WQ5A 2J4RA 3QLHA 1NNEA 1NOZA 1T8EA 3HBTA 1YVUA 2EHGA 1WSGA 3D2EA 1BQNA 2FC0A 4KREA 3AGRA 5HRRA 4PY5A 1KAXA 3OS0A 5SZTA 1OVYA 4DHYA 5JS1A 5I9EB 4H0XB 3OHRA 1VSJA 3CC7N 1FKPA 5LY3A 4DQIA 3VQDA 1RCHA 4JD2B 1TKTA 4DU1A 1VQON 1TYQB 3R1XA 3RMAA 4Z4HA 3MCAB 3NF8A 3F9MA 4BR4A 2HMIA 3MAQA 3BP8A 5M1PA 2OPRA 3W3DA 3M3ZA 4DV2K 3CIPA 3AVFA 2QWRA 1NMDA 4FLVA 1VQ8N 1EP4A 3J8AA 1RDAA 4WE1A 3VQEA 3KZBA 1ZC6A 1X9JA 3U3GA 3EY1A 5DM6L 4BC2A 1K8KB 3EL2A 5BRDA 5ADXA 3KLEA 2GV9A 4CHNA 5EVZA 2G8FA 1HQUA 1QZ6A 1U2VA 2X74A 5GADP 1IBKK 3FZFA 3SJHA 2PFUA 4KHUA 3THYA 3OTOK 1XWLA 3UKUB 3DOLA 2FBXA 4DV1K 3W0LA 3PIOL 3HVTA 2RN2A 3GDQA 1YTUA 4IFEA 4GKJK 1Z6RA 3C6TA 1S22A 1DT9A 3K58A 4JKDA 1KTQA 4NCGA 5DMRA 3HXMA 1VRTA 3U9ZA 4J2AA 4F8RA 4DV0K 2W6LA 5K14A 5AQNA 1LAVA 4WQ4A 1LAWA 4UQGA 1JLAA 3CFOA 3ENBA 4JRQA 2I7NA 3OYLA 2P9NA 2ZF5O 4NYNA 2QWPA 3CCMN 3T69A 5IT9O 4KRFA 1XMOK 4CEBA 4OGEA 3HYFA 4JYAK 3HPHA 4AHUA 4KI4A 3M5RA 1UOCA 5C42A 5FRNA 4E1NA 4JI5K 3V6DA 4W5TA 3HP9A 3CC4N 4PUOA 5AQSA 3ZSZA 4FZZA 4OJRA 3HZ6A 4FSVA 4LY7A 5KPZA 1A5VA 4CIGA 3VQ4A 5CYMA 4CJVA 1Y97A 4B1XB 3SAGA 1KVCA 3LP3A 2QA4N 4ICLA 1MDUB 5FPNA 4X66K 3KWGA 1MA9B 4BGBA 3A0IX 5I42A 3A5NC 5CZ1A 1Q7YO 1GLEG 1SL0A 2ETJA 1WSFA 3DRPA 3AO2A 3H45C 5M1KA 3FZKA 4B8AB 3CETA 4JI6K 4KTQA 2HNDA 2F8SA 3O1BA 1QVGM 4PHTX 1W2BM 3C95A 3A2FA 4RW9A 3L4QA 4BRPA 5KTQA 3TTFA 1HX1A 3AA3A 4KTWA 3KTQA 4AHVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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