The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
KYDWFEFFLNCGVDVSNCQRYTINFDREQLTEDMMPDINNSMLRTLGLREGDIVRVMKHLDKKFGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Regulation of clathrin adaptor function in endocytosis: novel role for the SAM domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Actin cytoskeleton-regulatory complex protein SLA1
|
| molecule tags |
Endocytosis
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
27
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KW4 A; 2QAR A; 1X9X A; 1PK1 A; 2QKQ A; 2ESE A; 2QAR B; 5KNI A; 3SEN A; 1PK1 B; 2EAP A; 2DKZ A; 2KIV A; 5L1M A; 2K60 A; 4NL9 C; 5J8Y C; 2E8N A; 1JI7 A; 5JRT A; 2DKX A; 1SXD A; 2F3N A; 1UCV A; 3SEI A; 1V38 A; 3TAC B; 2ES6 A; 1DXS A; 3KKA C; 3IDW A; 1LKY A; 2QB1 A; 2E8M A; 2EAO A; 2LPE A; 1LKY B; 4NL9 A; 5J8Y A; 1SGG A; 5JTI A; 2K4P A; 1PK3 A; 2B6G A; 1UQV A; 1SV4 A; 3KKA A; 3TAD C; 1V85 A; 3HIL A; 1COK A; 1WWU A; 4PZN A; 4MHV A; 4RQM A; 2KSO A; 3BS5 A; 3TAD A; 2L5Y A; 2EAM A; 1WWV A; 2KG5 A; 5F3X B; 3BS5 B; 1OXJ A; 1RG6 A; 2EAN A; 2QB0 A; 3BQ7 A; 1F0M A; 4PZO A; 2QB0 B; 1SXE A; 4NJ8 A; 1X66 A; 2D8C A; 1X40 A; 2GLE A; 4RQN A; 2F44 A; 2D3D A; 1SV0 C; 1B4F A; 3H8M A; 2KE7 A; 3K1R B; 2JV3 A; 2KMD A; 2KSO B; 2DL0 A; 2YTU A; 1Z1V A; 2Y9T A; 3BS7 A; 4IS7 A; 2F8K A; 5JU5 A; 2E8P A; 1B0X A; 1SV0 A; 2E8O A; 2FE9 A; 1OW5 A; 2Y9U A; 2LMR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3F2B A; 2GOL A; 4M6W A; 2QKQ A; 2ZXH A; 1Q46 A; 5T14 A; 2JRZ A; 2KKV A; 9ICJ A; 1NKC A; 2A1J A; 5J8Y C; 4IQT A; 2ASD A; 3IM1 A; 1RXV A; 2HOQ A; 1P7D A; 3GIK A; 2N1R A; 3SEI A; 4QWB A; 4KLD A; 2W9A A; 4F2S A; 2BDU A; 4EX7 A; 4HYK A; 3V7L A; 1KFD A; 3MGI A; 1WCN A; 2FMQ A; 9ICG A; 3TAP A; 2ZIW A; 2XVT A; 3CYM A; 1QSS A; 5DB7 A; 2LKY A; 1HUO A; 4BX9 C; 4LJX A; 3TAD C; 3M7D A; 3RB6 A; 8ICQ A; 3B0Y A; 4Y2J A; 2Y0S C; 3MR2 A; 2IHN A; 4NM2 A; 1ZQO A; 4DL3 A; 4UB5 A; 2CN1 A; 4OCZ A; 4Z6F A; 1ZQJ A; 4Q8E A; 1N2X A; 3GIM A; 4GXJ A; 1TVA A; 1F0M A; 3UMG A; 3QU4 A; 4UB3 A; 2R8J A; 3OJS A; 9ICH A; 1N60 A; 1KSP A; 2E3T A; 2W8K A; 2AXT U; 3HJE A; 1UPH A; 4UB2 A; 4ECY A; 4ECX A; 3QUC A; 4NLN A; 2PFO A; 3SD7 A; 3LYS A; 4I2F A; 4M04 A; 4M9N A; 2W43 A; 4QZB A; 2A3V A; 4KLT A; 4P0Q B; 2ZUB A; 4UAV A; 3OHA A; 2Y9T A; 4G3I A; 3EWA A; 3SV4 A; 4DCC A; 4KLJ A; 2GH1 A; 2I1Q A; 3D2Q A; 3AU2 A; 3GZF A; 1RQL A; 2JEI A; 1L7M A; 5CHG A; 4M9G A; 3K1Z A; 4MFF A; 2JHD A; 2LM1 A; 2QAR A; 2VAN A; 1S0N A; 8ICH A; 5AKL A; 1PK1 B; 4F5R A; 2K60 A; 3Q8R B; 4DFM A; 2C22 A; 1D8B A; 7ICS A; 5F9N A; 4P4P A; 1JX4 A; 5AKI A; 3ZDB A; 5KG6 A; 5DQG A; 3WKC A; 3KTQ A; 4F4Y A; 4YXJ A; 4E0D A; 4RUC A; 1BNP A; 4US8 A; 3WK4 A; 4BJQ A; 8ICJ A; 4IQU A; 3KOO A; 1UT5 A; 2ZUD A; 5KT7 A; 7ICF A; 4JV2 A; 2EH9 A; 1QSY A; 1ZQZ A; 5AKX A; 3HT3 A; 1ZJN A; 2W9C A; 5KT6 A; 1AQ6 A; 1N62 A; 1T94 A; 3HWT A; 2WB1 C; 1RYS A; 3MAB A; 4F4W A; 4EZ6 A; 3RJH A; 5J2K A; 5AK5 A; 3AEV A; 3TKA A; 5B66 U; 4YN4 A; 4J9R A; 5K4L A; 1MSW D; 4QZH A; 2FDR A; 1WYG A; 5DQI A; 4RQ0 A; 2BCU A; 4RQ4 A; 5KG2 A; 2KEY A; 1SZP A; 4QZ9 A; 4RQ2 A; 3EPI A; 2BKE A; 4KX3 A; 2MAX A; 4F4K A; 3N7S C; 1TFR A; 4UB4 A; 3QUT A; 1KFS A; 2JXJ A; 5G5G A; 1B4F A; 3PX6 A; 3H8M A; 2ZTE A; 1Z00 B; 5KFF A; 4Y2X A; 5CJ7 A; 4ECZ A; 2KSO B; 3E2E A; 1Z1V A; 3BQ1 A; 1A77 A; 3O0F A; 4KLG A; 4C7Z A; 3CW2 C; 3N7R C; 3NRZ A; 1Z19 A; 1S0M A; 3RFA A; 5DGB A; 4UAU A; 5HP4 A; 3SAF A; 5IIJ A; 1TKD A; 3PSF A; 3TAQ A; 3DDH A; 1SWW A; 2E1E A; 1H38 A; 2Q0Z X; 1UT8 A; 4RQ6 A; 4G9B A; 2WTF A; 2OXO A; 4Q43 A; 4Y2R A; 2FI1 A; 1V9P A; 2FMS A; 3C2L A; 3RH5 A; 3IDW A; 2D6F C; 5ALI A; 3M8S A; 5E79 U; 3KD3 A; 5JTI A; 3GIL A; 1S8O A; 4RQ8 A; 4CF4 A; 5C0Y A; 2RDJ A; 4GFJ A; 4ZH4 A; 5D49 A; 4IQV A; 3QEA Z; 5J2I A; 2WF5 A; 2YML A; 4J9O A; 2NYV A; 4OO1 J; 3KFU F; 2FJ6 A; 2DFL A; 5ALR A; 5J0W A; 3TFR A; 5KTQ A; 9ICN A; 4KLH A; 3GIJ A; 3KZI U; 4YR0 A; 2BPF A; 2C2E A; 2VKQ A; 2H3Q A; 4PL2 A; 1BPX A; 3RF9 A; 3PMN A; 2XCA A; 5J0Y A; 1XSP A; 2H3V A; 4UAY A; 2BCS A; 2AQ0 A; 5KG3 A; 2GO7 A; 5EWG A; 2KIC A; 3HW8 A; 3QNM A; 7ICJ A; 3ZI4 A; 1CEZ A; 5IIN A; 4DFP A; 2YQE A; 3SR6 A; 1KDH A; 3L5K A; 1S76 D; 2KJ8 A; 3MDC A; 2BHN A; 1S97 A; 4ECR A; 2NRV A; 4PPX A; 3NVZ A; 4IL6 U; 2KZ3 A; 4IS7 A; 1EXN A; 3ZD9 A; 1L5U A; 4EBE A; 1ZQG A; 1NOM A; 4C80 A; 4QIW C; 2MRL A; 1TAQ A; 5DLF A; 4UBB A; 2C2D A; 4UB8 U; 3AQF A; 3JPR A; 2IOF K; 4EEL A; 3SEN A; 2ALZ A; 2MUT B; 2BQR A; 4B9V A; 4TUP A; 4KMU A; 4OJP A; 1NZP A; 2AQ4 A; 2QB1 A; 5C5J A; 4C8K A; 2PFQ A; 1Q3U A; 3RJK A; 5J8Y A; 2P6R A; 5J2J A; 4DLG A; 5EOZ A; 1IV8 A; 4RU9 A; 1SV4 A; 5CEH A; 5KFV A; 3T5H A; 1PUZ A; 8ICI A; 2BDP A; 3UXO A; 4KIT B; 2NRW A; 2AGQ A; 2KHV A; 3GQC A; 1KQQ A; 4BUG A; 2XY6 A; 2KSO A; 3TAD A; 5AI5 A; 1S9F A; 3ZDC A; 2Y0S F; 3RB3 A; 4B9N A; 8ICX A; 2KP7 A; 2EAN A; 3BZC A; 4O3S A; 4O5E A; 7ICK A; 3I1Y A; 4C8O A; 2QB0 B; 1HUZ A; 1ZOL A; 3RJE A; 2KFZ A; 4KLM A; 3C28 A; 2PMZ F; 1C7Y A; 2KKP A; 3PV8 A; 2NO5 A; 1GO3 F; 2ZIX B; 1WCL A; 4RQN A; 5AM5 A; 4Q8F A; 4F5N A; 3ONN A; 5KG0 A; 2ZTC A; 2V4R A; 4DSL A; 2OCE A; 1O03 A; 4R63 A; 1RXW A; 9ICT A; 1XC9 A; 3N97 B; 3K75 D; 4DOA A; 4MF8 A; 2W54 A; 3ZD8 A; 4P4M A; 5AKK A; 1RM6 C; 1OW5 A; 5KFC A; 4KLS A; 5KFY A; 3OSP A; 3UQ0 A; 3T3F A; 3RB0 A; 1ZET A; 2ESE A; 1PVQ A; 3C23 A; 5ALF A; 1NK7 A; 5L1M A; 9ICI A; 2ZXI A; 1X9M A; 1FEZ A; 4ELV A; 3PR5 B; 2E8N A; 4EEK A; 3V6H A; 1JI7 A; 5J2A A; 4PHE A; 3DEE A; 4B9U A; 8ICS A; 1JRP A; 9ICB A; 1A76 A; 1MA7 A; 8ICP A; 3H8J A; 3EYZ A; 3BJY A; 8ICN A; 4CRX A; 5KT5 A; 4O3M A; 3DV9 A; 4DQS A; 2J6T A; 3KHG A; 4QJF B; 1FFV A; 1CRX A; 5KFK A; 1MQ3 A; 3JPQ A; 2OEH A; 3QU2 A; 8ICV A; 5KT3 A; 4DQR A; 1WG8 A; 3WKE A; 3RB4 A; 4IRK A; 1XSL A; 4KN7 A; 3QUB A; 1WWU A; 1J2M A; 3ETL A; 5KFJ A; 8ICY A; 2R18 A; 1IM4 A; 1UHU A; 2F2A B; 4P0P B; 1WWV A; 5ALY A; 5JUM A; 2G07 A; 3A0B U; 1ZQN A; 5KG5 A; 4R8U B; 3JPT A; 5AI0 A; 2HDO A; 1L3T A; 3C1Y A; 3M9M B; 2HOI A; 3PY8 A; 5DDM A; 3AL0 B; 2NO4 A; 1VJ5 A; 2ASL A; 3PSP A; 3BQT A; 3U26 A; 4FBU A; 5ALZ A; 3G6X A; 8ICM A; 3RTV A; 3K1R B; 3F2D A; 1T3N A; 4Y2S A; 3EUB 2; 1RYU A; 3PX0 A; 1M6Y A; 1PVR A; 7ICE A; 5KFM A; 1ZRM A; 2OHF A; 1A0P A; 5KFH A; 5ALO A; 4ZOH C; 3T5J A; 5AKE A; 4RNN A; 2PFP A; 1DGJ A; 4O3P A; 4UQG A; 3QX7 A; 4CF3 A; 5KFE A; 2K4H A; 3PW7 A; 1D8L A; 4K4I A; 4IRC A; 4O3O A; 4OJO A; 1CI4 A; 1XO0 A; 4Z6E A; 4Z6C A; 4NLG A; 1NZB A; 3MGV A; 2KJ9 A; 2O6K A; 1V38 A; 3TAC B; 4KTQ A; 2K8C B; 1BNO A; 4Y2U A; 3BQ2 A; 7ICM A; 2HSZ A; 4BDP A; 4C8N A; 3KBB A; 3MBY A; 5KFN A; 2JGA A; 4YP3 A; 5EE3 A; 4ECQ A; 3RJJ A; 1RDF A; 1UQV A; 2CPR A; 4NY8 A; 2W03 A; 2F1H A; 3C21 A; 2HW3 A; 4Y2P A; 3JPN A; 2XGQ A; 4PHP A; 3THV A; 5DGA A; 4GXI A; 2PFN A; 1ARO P; 3LVV A; 8ICK A; 4C0Z A; 1D8Y A; 3BS5 A; 4DF4 A; 4GLX A; 3NVY A; 4TUR A; 3MR3 A; 1LB2 B; 1ZQA A; 5J0O A; 8ICO A; 9ICR A; 5KL8 B; 5KFG A; 4JB3 A; 3Q8P B; 3NS1 A; 3V7J A; 4Y2V A; 2H5X A; 2YMQ A; 1ZQT A; 5CB1 A; 4J9M A; 1RYR A; 1L7N A; 1XWL A; 5J2D A; 2K8B B; 3NVW A; 2KZM A; 2PKE A; 2ZIU A; 1JIH A; 4ED1 A; 4Y2Y A; 2KFN A; 2IBK A; 1T3Q A; 1SV0 C; 3SI8 A; 2LYB A; 2JEG A; 4F72 A; 3AQE A; 2JZB A; 4NWI A; 2YTU A; 5L1L A; 3C5F A; 5J2B A; 4CF5 A; 1Z4O A; 5L1K A; 5AI9 A; 4I2A A; 3UM9 A; 4F5P A; 3PZP A; 1B22 A; 1NK5 A; 3QYP A; 3ICX A; 4I2J A; 3PNC A; 1DOQ A; 5J2C A; 2LMR A; 4YD2 A; 3MFI A; 4DSE A; 8ICZ A; 5AIA A; 1KN5 A; 2LHT A; 4B9T A; 3H8S A; 4F8R A; 3TFS A; 3SQI A; 4QIW F; 5AKG A; 3PST A; 2A1A A; 3MR5 A; 2M0N A; 1SXD A; 4LVS A; 4QZG A; 5KFT A; 3KKA C; 4KN4 A; 3PX4 A; 4UW9 A; 3R9K A; 2YMM A; 4EYH B; 1LKY B; 2K8A A; 2FPK A; 1SGG A; 9ICF A; 3EPG A; 2AJQ A; 3WKD A; 2DBY A; 3IG8 A; 4F50 A; 5KAF U; 3PW5 A; 2KVS A; 5J29 A; 1YZ7 A; 1U48 A; 3BZK A; 2VA3 A; 3RJG A; 3RJF A; 5J2E A; 3BQ0 A; 2HHQ A; 3MC1 A; 4XUS A; 3NTU A; 2CRX A; 4YR3 A; 3H0M B; 2NV3 A; 2WF7 A; 5KG1 A; 3C1Z A; 1URJ A; 2AHO B; 5ALW A; 5KL1 B; 4DS5 A; 1L7O A; 1RPL A; 3RBE A; 4I2E A; 5ALE A; 1ZQR A; 8ICT A; 1XO1 A; 5DB6 A; 4ECS A; 2D3D A; 2XY7 A; 1FIQ A; 2XC9 A; 1ZQF A; 5KFA A; 5ALU A; 4RZR A; 3FC4 A; 2B0C A; 1XS9 D; 2HBJ A; 7ICQ A; 2WFA A; 3LK9 A; 1X9S A; 7ICO A; 4NLC A; 3FYH A; 4I2G A; 1U49 A; 2FE9 A; 5III A; 2ZJ5 A; 1NNL A; 4I2B A; 5J0Q A; 4XA5 A; 3MGH A; 3M6Z A; 3EZ5 A; 3TI0 A; 3QZ7 A; 3D6J A; 1SWV A; 2RLT A; 4C4R A; 2UVW A; 2KIV A; 2VJ5 A; 2KTQ A; 4DL7 A; 2NRZ A; 1JAL A; 1UA1 A; 2Z7J A; 2ZJA A; 4XRH A; 1BPZ A; 2KHQ A; 2R8I A; 2ES6 A; 3KHR A; 2XCP A; 4YR2 A; 4DQQ A; 1CUK A; 2F77 X; 5HHH A; 1FFU A; 1PK3 A; 3AM9 A; 3PML A; 7ICG A; 4NM1 A; 3SZ2 A; 4CE6 A; 2FLP A; 3G6Y A; 5AHX A; 2C2R A; 4MEY A; 4ED6 A; 4DOB A; 2B21 A; 1ZD4 A; 2LYA A; 1OUQ A; 3N4M B; 3UQ2 A; 4NV0 A; 3HKZ C; 5KG7 A; 5AM3 A; 1JXL A; 2HHV A; 4YCX A; 1L3S A; 2L5Y A; 1DGS A; 4BWM A; 2G08 A; 4GIB A; 5DBA A; 3GV5 B; 2BR0 A; 4YG2 A; 3UPQ A; 2ZIV B; 3RAQ A; 2NRX A; 1BPB A; 3NUQ A; 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2F8K A; 1SV0 A; 5D46 A; 1HIW A; 3QE9 Y; 9ICA A; 4FZN A; 3H4B A; 2KVC A; 4RPZ A; 2NRT A; 1L3V A; 2C28 A; 1JN3 A; 1O08 A; 5BPC A; 3G6V A; 4M6W B; 9ICU A; 2HHW A; 5KFR A; 1VDV A; 8ICE A; 4F4Z A; 2UVR A; 2YY6 A; 5CR0 A; 2A1J B; 3SAG A; 5FP0 A; 5KT4 A; 4J9N A; 1QSL A; 4C4S A; 5DBC A; 4DL6 A; 3QU9 A; 2ATL A; 4QWE A; 4FFD A; 1T8E A; 1D9F A; 4QZ8 A; 3OJU A; 9ICW A; 2DWQ A; 2K4P A; 4P4O A; 2MSN A; 2B6G A; 4X5V A; 5KFW A; 3VC8 A; 2ZIW B; 3KKA A; 4ICA A; 3KZX A; 2FLN A; 4O3N A; 4JV0 A; 3T79 A; 4LZG A; 3WKA A; 4UB6 U; 4DFK A; 1N56 A; 4ED2 A; 7ICT A; 1U9L A; 4EBC A; 4KMO B; 1D9D A; 3Q8M A; 3NVV A; 1FO4 A; 1KLN A; 4QZC A; 3MR6 A; 4BXO A; 1X2I A; 5KFS A; 4RNO A; 4UAS A; 4MFA A; 4PHA A; 4UAZ A; 4DWI A; 1XU4 A; 1N5W A; 4P2H A; 4CDG A; 3V7K A; 1QCK A; 7ICU A; 5AKJ A; 9ICX A; 2WB1 F; 1U45 A; 3I28 A; 4J9K A; 4I2C A; 5JU5 A; 1B0X A; 4IR1 A; 5IIM A; 5D4B A; 2WHE A; 5ALH A; 4R65 A; 5A0L A; 3T5K A; 2Y9U A; 3JPP A; 8ICR A; 4EBD A; 5DB8 A; 1NK6 A; 1B43 A; 2WF8 A; 5J0U A; 4UAW A; 2MUT A; 2W55 A; 2QAR B; 4MFC A; 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