3ILTB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, trichlormethiazide
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 89
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB02
3H6UA 4WEDA 4IB2A 3SEYA 1II5A 3G3FA 4IO7A 1H45A 5H8NA 1LFIA 1QUKA 1OQGA 3FD3A 4JSDA 1DSNA 3MZBA 1LAFE 1N0TA 3PUYE 5ICTA 1TFAA 4DDDA 1H3DA 3V5AA 1AIVA 2XXYA 4MBPA 3SEUA 3TAJA 4O3BA 3UORA 2H9BA 1RYOA 2ABHA 4WXJA 4DZ1A 2RCAA 1B5HA 4F1YA 5B70A 5I2NA 3N26A 1PBPA 4OQOA 2ZMBA 1SW4A 1P1QA 2R6GE 2O68A 3USDA 1SW2A 3VLWA 2REGA 2I49A 3LSLA 4BDOA 4FEBA 4G68B 4KCDA 1MXZA 4U23A 2XXTA 1SW1A 2ALUA 2DXRA 3K6XA 3TFLA 1Y4TA 3H6WA 4BDNA 1YCJA 4GWOA 1USYE 4DIGA 4O3AA 1SYIA 2FYIA 1P99A 2X26A 2DOJA 1B51A 1LSTA 1GGGA 4I8CA 3PD9A 1OLCA 1FTLA 4RA1A 2I48A 3K1PA 3LBSA 2V3QA 1ZLQA 2QL3A 1MRPA 5IKBA 5H8QB 3MC2A 3U92A 4RJZA 1Y20A 4EQ7A 1LCTA 3FATA 1ANFA 1D3KA 4EQBA 1QVSA 3K02A 2UVHA 5AE4A 1Y1MA 4X1DA 4QSEA 4KFQA 1N76A 2OWSA 3RPWA 1NNKA 2XXWA 2AIXA 2HZKA 4H6DA 1MY1A 2D3IA 1SQYA 3PPQA 1USYH 3GXAA 4G68A 4KYEA 2I4CA 5DVFA 3Q28A 3W15C 2E0SA 2HXWA 2VGQA 5I57B 3KG2A 2RC7A 1Y4CA 4AB6A 4E0WA 1LAHE 5CI5A 1Y3NA 3IX1A 1BIYA 1O64A 1UTHB 3ONMA 1O7TA 3U72A 4NF6A 3OD7A 2REJA 1ZKBA 2NWJA 2O1MA 1JEVA 4R75A 2HQ0A 3SETA 4YMBA 1AL3A 5DT6A 4GL0A 5L9MA 4QFNA 4OVJA 4OFLA 3TTKA 1B3FA 1QKAA 1F9BA 4ZDMA 3OEMA 4ND9A 4UACA 4OFJA 2R71A 3IB0A 1JW4A 3H6TA 2OK2A 3PPNA 2QPQA 4GRKA 4LVQA 3E4RA 4G77A 4QRZA 4JXIA 3TDJA 4NE4A 4XKQA 4YB5A 5I57A 4I62A 5FHMA 1EZOA 1Z7NE 1B46A 1MQIA 4ZECA 4F29A 4EXKA 2DS9A 3C33A 4R6KA 4ZEIA 1N7XA 5JEIA 4DCYA 4OESA 4FECA 1MXYA 3ZSFA 2QJEA 4QF9A 3UA8A 1UTHA 2X7PA 4ZEBA 3QUJA 4F3SA 1SVXB 3I5OA 1R9QA 2UVGA 1IIWA 4P0IA 1I6AA 3MBPA 3E9XA 3CG3A 3N5LA 3D4GA 1FQFA 3KN7A 3BFTA 3SKPA 1OIBA 1YPNA 3O28A 4H67A 4ZEFA 3OSRA 1B4ZA 3G3IA 1LAXA 2H4IA 2VHAA 4RPNA 2DWJA 1EZ9A 1NH8A 4H5GA 3OXNA 3GZGA 3FXQA 2UYEA 2GHAA 1MXVA 2B3FA 1GR2A 1I69A 3SEVA 2DVCA 2HZLA 4OZ9A 3ZKKA 4F3BA 4GD5A 1P1UA 3SDFA 3I3VA 4C0RA 2GFEA 1D4NA 1B5JA 1B58A 3OO6A 1R6ZA 2Y7KA 4YKJA 3VVDA 1MM7A 4H5FA 1L5TA 5CRYA 5I84A 3IORA 2HAVA 4KCCA 1GVCA 5CMBA 4G8HA 1PB8A 3BFUA 3FGSA 3C35A 3QK6A 3PUVE 1LFGA 3VVFA 3TKDA 1QJMA 3LSFB 4E0XA 4OERA 1US5A 1MXXA 3TMGA 3M3LA 2ONRA 4R73A 1OQHA 3Q29A 3QXMA 4KQPA 3RY3A 3O9PA 3EF7A 4HS7A 5ISUA 4LZ8A 2I6EA 3IO4A 3IAZA 1H43A 1TWYA 1Y3QA 3T9VA 4BLAA 1UTBB 3A3CA 3B6TA 1Y1ZA 4GVOA 5DEXB 3PUWE 3DP4A 4GL8A 4O3CA 1B0HA 1MH4A 1RKMA 3I6VA 1FQBA 2QMXA 4RYAA 3D4CA 1IUDA 2XXHA 3UIFA 4N13A 3FJ7A 2XX8A 2W7YA 4G4PA 1NNTA 4KI0E 2VD2A 4X1BA 3KOTA 3SESA 5I58B 1UIVA 4JWOA 5BUUA 1ZTYA 2P2AA 3PMVA 3MP8A 4OYVA 5H8FB 2R9JA 2WKYA 3KJTA 3OSQA 3Q27A 3T66A 2FNCA 2H5YA 1FW0A 5CBSA 3CFZA 1HSLA 4FE8A 4LQ5A 5JTYB 3G3JA 2LAOA 5LOMA 1R1NA 3C34A 1RYXA 2M8CA 1UTBA 5KDTB 3CIJA 3HHGA 2PT1A 2XXUA 4NF8B 4EXLA 5HM4B 3FXRA 3FV2A 1XVXA 5FHOA 4RY1A 3VLVA 1QUIA 2XD2A 4UA8A 4IGRA 1URSA 1FTKA 3DELB 5EHMA 3M3KA 3HHFA 3MVXA 3ECRA 4K3FA 2OCUA 4TOZA 1A8EA 4F31B 4F3PA 1NMUA 5TP9B 5CMKA 2AL5A 3IOUA 3UN6A 3MQ9A 3R6UA 3JV9A 3ILUB 2ZYOA 1B7UA 2IA4A 3VXCA 4HW8A 5AA4B 5B7DA 3EHTA 3K6VA 3RQTA 4G8NA 3O6GA 4QFOA 3SEXA 3A09A 1LB9A 4FIMA 1AH5A 4ECFA 3RN8A 3K00A 5H8FA 1B05A 1Y9UA 2Z8FA 3IL1B 5TPAB 2I3WA 3CVGA 4I1DA 1NH7A 2RF1A 5I2KB 1B1XA 1FQCA 5JTYA 1VR5A 2PX1A 1B7HA 3VDFA 3W9WA 5KDTA 3TCFA 3TZAA 1B52A 1FCKA 3TEPA 4GIZA 1SI1A 1Q35A 1QKBA 2YJPA 4FJPA 1NNFA 3TTNA 1Z7ME 3DLNA 2Y7PA 4OETA 2F7BA 3KN8A 4QFPA 2GHBA 4MFIA 5IAIA 4MLVA 5TP9A 4Z0IA 2PBWA 2BJJX 1B3LA 5AA2D 3S4UA 1UQWA 3PUZE 4YKKA 3ZKLA 3HCQA 5AA4A 3H03A 1EH3A 1US4A 1ELJA 2ZYNA 3MPKA 3RLFE 2O84X 2VOZA 3V89B 4H1XA 3E13X 4C1TA 1B0LA 2OBGA 3TQLA 4ZE8A 3ODBA 3BKIB 5EYFA 2QSXA 5J1DA 1GTKA 3S9EA 3M3FA 5I2KA 3OO8A 4U21A 2O1LA 1NFTA 3H6VA 1MDP1 4R72A 5I59B 4OXVA 2RKMA 1A7LA 3IB2A 2F36A 2XXQA 1CE2A 1FTMA 1VE4A 3DP6A 2H99A 4IGTA 2P0SA 1PB7A 3IOWA 2O51A 1DPEA 3W9VA 3M8UA 4YKIA 2QS2A 3JZJA 4DE8A 4M4GA 2A5SA 3MP6A 5H8QA 1JETA 3TUSA 3TCGA 1GV8A 4PETA 1SI0A 2A5TB 3OO7A 4U2RA 1TXFA 1N7WA 1PEBA 3KOSA 3HPIA 4TQUQ 1ATGA 5CMCA 3O29A 1BKAA 1VSOA 5M2VA 3CR9A 2B3BA 3VXBA 1PB9A 1MG1A 1P1OA 3KJ7A 3TTMA 5CMMA 4QFKA 2Z23A 3QAXA 2Y7IA 1LB8A 1JEUA 5I59A 3S9LC 4OENA 3H3GA 3K1MA 4F39A 1A55A 4THIA 4F2QA 1QW0A 2XXIA 2F34A 1MY3A 3T9XB 5DVIA 4GXAA 5BWJA 1P1WA 4JWYA 1MQDA 2O6AA 2ZNTA 2B65A 1YAEA 4H8JA 3IR1A 5H8SA 2XXRA 1LFHA 3FJMA 3O6HA 3GLBA 2H98A 3UGWA 3MJNA 4OMBA 2DSFA 5DYHA 3FUZA 3CFLA 1YTVA 3R7XA 4LZ7A 3GBBA 5CM6A 1T0KA 3VVEA 1XC1A 3U1OA 1OVTA 1JQFA 2ZNSA 4X48A 1OMPA 5DTBA 4GLIA 3MZ9A 3TPAA 3UK4A 2G93A 3EHUA 2F8DA 5EHSA 3SEWA 3H06B 1O63A 4L17A 1SBPA 3K2DA 4LZ5A 3PD8A 4R9GA 3KBRA 1ZIUA 1FQEA 4BDQA 2Z8DA 3MP1A 1B40A 2QRYA 1HSEA 4BDLA 1P1NA 3LC8A 3K4UA 2DE3A 3EN3A 4G8MA 1VFEA 4FEDA 1IXHA 4LA9A 3UP9A 1SDXA 4U1OA 5TU0A 3CI8A 5A5XB 4R6HA 1NNPA 4PE5B 2ZXTA 4DXCA 4TLMB 2O69A 2DYXA 4YU0A 4RK2A 1WDNA 1ZU0A 1POTA 4U4SA 4Q5TA 3KZGA 3PGFA 3KN3A 1IXGA 3MW0A 5CBRA 4YAHX 2O7UA 1A8FA 5ELVA 5L8DA 3MUQA 4HTGA 1POY1 2XXPA 2F5XA 3G3GA 2UXAA 1B2HA 2D5WA 1Q1KA 1B1HA 4F2OA 4GF8A 2THIA 1DMBA 2F6GA 4R9FA 4JBZA 4Z7EA 4G68C 2YPNA 2DE2A 3C31A 3MVWA 5KCJB 4AQ4A 5KZTA 4EQ9A 4YB7A 2DQVA 1BTJA 3EQ1A 3MVYA 1B9JA 2Y84A 4IY6A 1MPBA 2DWHA 5ICQA 3TODA 4PFYA 2Q9TA 4R2FA 1PC3A 3U93A 1MY4A 1ZBMA 3ILTB 1H44A 1QUJA 1N3XA 4F18A 3FV1A 2XHDA 4PFTA 3THIA 5AA3A 1OVBA 3CSGA 4MH5A 2NXOA 1LBBA 2F7CA 1SW5A 4XKNA 4ELQA 3S9NC 1URGA 2I3VA 3S9MC 1XS5A 3MAMA 4ZZEA 3ZS6A 1MPDA 3C9HA 1IXIA 2F35A 1D9VA 2G29A 2VD3A 3PV0E 1PDAA 4IO3A 3VE1B 4N07A 3PPPA 4Q8RA 4RNSA 2ONKE 4F1UA 1URDA 4N6PA 2KLFA 5DEXA 4IO4A 3JYRA 3OENA 5H8HB 4R74A 4WEPA 1MXUA 3TQWA 2XXVA 4F1VA 3V8XB 2V3TA 2VP1A 4JB7A 2ZYMA 3TTRA 3CSBA 4KR5A 1MY0A 2DWAA 4OHNA 4GOTA 2H25A 4ESXA 5FTIA 5I58A 2V25A 1FQAA 4KHZE 2Q89A 1QULA 5L9SA 3QIMA 2ESNA 2AL4A 3L6HA 1DTZA 3TELA 1B4HA 1DTGA 3B7DA 1B3GA 2P1SA 3L6GA 3QUFA 1AMFA 1ZJLA 4LATA 2NVUB 1DPPA 3PMXA 2UYFA 2AYSA 1NL5A 4DXUA 4R6YA 3G3KA 1XHYA 2CZLA 2DWIA 3WAEA 3CG1A 5ITOA 3G3HA 3KSXA 5JK4A 4H8IA 4Q0CA 1I6QA 2O7IA 4NF8A 3KGCA 4QHQA 4BDRA 4G2ZA 2HFBA 4IO5A 4NF4B 4FORA 2CMOA 5H8HA 3KSJA 4P0GA 3N94A 3U8QA 3B6WA 4XXUA 1IZ1A 2GH9A 4QSCA 4RK9A 5AA1A 3KFMA 4GQOA 4MF3A 2Y7WA 2X7QA 1WODA 2QMWA 4NF6B 2DP8A 2QS4A 1XVYA 1JW5A 3FVOA 1B5IA 3H4ZA 4ZEDA 2ZYKA 3LUYA 1PBQA 3IOTA 1J1NA 1BLFA 2OWTA 1KWHA 4KPTA 1FQDA 5DVJA 2Q88A 3V83A 1MH3A 1M5EA 3F11A 5TPAA 4F3GA 4KYSA 1NKXA 3FVNA 3VV5A 1MS7A 2RCBA 1SYHA 3N6TA 3OMBA 1JNFA 1VFDA 4NTLA 1OLAA 1FTJA 1IQ7A 3O97A 1MDQA 2F7AA 2NUVA 1DOTA 4JSOA 2ONSA 1LBCA 1XT8A 4M1VA 3RTFB 3K01A 4WKMA 4PFWA 1TFDA 3OOAA 3K6WA 1MM6A 3S2VA 4PFUA 4XIGQ 1M5FA 2XX9A 4NF4A 4NWDA 5F7VA 3FJGA 4AB5A 2DE4A 2XXXA 3HN0A 2I0BA 3C36A 4U4XA 1MY2A 1M5DA 2UVIA 3AXFA 3PPOA 1CB6A 4POWA 3HSTA 1I6BA 2HAUA 3T9UA 4GXSB 4YB6A 4FATA 2DXYA 5L9OA 1FTOA 3T93B 2ANJA 4BDMA 3CRBA 4HCWA 4ELOA 3WAFA 4F22A 4OFOA 3RT6B 4DLDA 4ZS9A 4ZE9A 5K2YA 1HSJA 3TYHA 1TT1A 1N04A 1Y3PA 4LUBA 2RC9A 1MQHA 2V84A 2D21A 3FZVA 5FTHA 1S7YA 3PUXE 5AA2B 4EUOA 3RTWB 2UVJA 2OLBA 4RXLA 4X9TA 1IEJA 3VLUA 4OEUA 1JVYA 2NOOA 3RUMA 3RGYA 3K1NA 4XKPA 4Q30B 4NWCA 2IEEA 4P11A 3Q26A 4JWXA 1M5CA 4C1UA 2XD3A 4OWDA 2A5TA 2Q2CA 3MVZA 2HCAA 4XTCQ 2PYYA 3HV1A 4U22A 2RC8A 3GBAA 1N3WA 1SD3A 2ZNUA 4H65A 3HO7A 3PU5A 3RT8A 4QSDA 3BBRA 5I56B 2PT2A 4IY5A 2F78A 4EF1A 3C32A 3SERA 3R26A 3A3UA 3EHSA 1MPCA 1B32A 1N84A 4LP2B 3MPLA 4HCYA 2I4BA 2XX7A 3N6UA 4R2BA 3E3KA 1ZMGA 4EDPA 3OEKA 2OJTA 2F97A 4OEVA 3TTLA 1LLSA 3TCHA 5AA2A 3MWBA 4OTEA 4NF5B 2RINA 4ZZAA 2I0CA 4DXBA 3O66A 3VFJA 3FXUA 4DCXA 4KYDA 4PP0A 4YKPA 3H7MA 2Z8EA 4NEDA 2HEUA 1S50A 3T96B 1JW1A 4ELPA 2Z22A 3FASA 5F1QA 3Q25A 1AOVA 1JVXA 3FVKA 4MLQA 3IJXB 3IB1A 4KD5A 4XKRA 3FVGA 1R9LA 2PMSA 5I56A 3LSWA 1D9YA 2QS3A 1IXCA 5CC2A 3OO9A 4GFRA 4QFLA 1LCFA 3U94A 4U1ZA 1BP5A 4F19A 4POXA 2OZZA 5FHNA 1IITA 1M5BA 1LGBC 3C4MA 3IJOB 4PQJA 5ITPA 1EU8A 4RPOA 3PPRA 4NMYA 2GRVA 3PMWA 1A99A 1H76A 3IO6A 1XOCA 3T22A 1B3HA 5H8NB 4NF5A 5A5XA 3P7IA 4LQ2A 4LONB 2Y7RA 2QS1A 2F6PA 1B3EA 3O2AA 3DM0A 4ESWA 1WVJA 3KEIA 3T9HB 3IOVA 1S9TA 4ISUA 1EZPA 2V93A 1LAGE 2V3UA 4YMAA 4TLLB 3FIRA 4ELRA 4YZZA 3CFXA 4ONYA 3B6QA 4JDFA 1A40A 2Q8JA 5HBCA 1A54A 3LSXA 1B7ZA 1MQGA 3OELA 2Q2AA 3O6IA 5I2NB 2I58A 5K2XA 3MZ1A 4IO2A 3K6UA 1B6HA 2PVUA 5HPQA 4YICA 3IK6B 4FAJA 4I9DA 2DVZA 1UIUA 4IO6A 3K0VA 3RNNA 3EPEA 1MQJA 2E1SA 3DP8A 4ZEKA 3G7WA 5KCJA 2YLNA 4EF2A 2FA7A 3QSLA 3LR1A 3QYTA 1MXWA 4H0WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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