3ILTB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, trichlormethiazide
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 89
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iltB02
3V89B 3VLWA 4HS7A 1FTJA 4U1ZA 3Q28A 2HEUA 1P1QA 2UYEA 4LZ8A 4JSOA 4DIGA 3KN3A 3OO9A 3SERA 2XX7A 2F7BA 3FV2A 1AIVA 1MQJA 3FVKA 2ZYOA 3MVWA 1QUIA 3OSQA 5I59A 1F9BA 5JEIA 4ZEBA 5L9SA 2F5XA 1XS5A 1OQHA 4LP2B 4JSDA 4OQOA 4Z7EA 2DE3A 2OLBA 1D9YA 3SEXA 1NH7A 1PDAA 1OLCA 4WKMA 4X1BA 3JYRA 1GGGA 5CMBA 4WEPA 4OESA 4I9DA 4Q30B 3CIJA 1B40A 3FJGA 3I3VA 1XVYA 2OCUA 3TTRA 3PUXE 1B3LA 5H8HB 4LATA 2ZYKA 4BDOA 2GH9A 2DS9A 3IOUA 4GOTA 4IO7A 5DTBA 3ZKKA 4RXLA 3IOVA 3LR1A 5AA4A 4GIZA 2V3UA 1NFTA 2I6EA 3R26A 1N3XA 1NNPA 2ABHA 1UTBB 5CRYA 2QPQA 1QW0A 3H7MA 1EH3A 3FVOA 1PB9A 1MQGA 3KZGA 4IO6A 3Q26A 1H45A 3EHUA 4KPTA 4RA1A 2O7UA 2Z8EA 3O6IA 1B52A 4BDLA 3A3CA 4GXSB 5CM6A 1JEUA 3ECRA 3T96B 3Q25A 2ESNA 3RT8A 5CC2A 4KQPA 3ODBA 3MW0A 2I49A 4H8IA 3G3JA 2DXYA 3GBAA 3FVGA 2A5SA 5I2KA 5TP9A 2WKYA 2PVUA 3TELA 1VE4A 3C31A 3UORA 2VGQA 4PFYA 4RPNA 3VXCA 3KJTA 4OERA 4GVOA 3S9NC 1B6HA 4HTGA 4KR5A 1MXXA 2GHAA 3TCGA 4LVQA 3QAXA 2NWJA 3SKPA 2W7YA 3WAEA 1QULA 2O84X 4QFPA 4U4XA 4P11A 5IAIA 4NWCA 5JTYA 3S9LC 1A40A 3G7WA 3IX1A 3N5LA 3OOAA 2GFEA 3PPRA 4BLAA 2XXUA 4ZEDA 3V5AA 5BUUA 2XXYA 3TDJA 4ND9A 3GXAA 4M1VA 1OIBA 2F78A 1B1HA 4YKIA 2DOJA 4YB5A 1MXUA 2XXHA 3M3KA 4PE5B 2Q8JA 2XXQA 3ILUB 2NUVA 2ONRA 2X7QA 4NF5A 3IJXB 4FE8A 4BDQA 3PMWA 2DXRA 1SDXA 4Q0CA 2QS2A 4PFWA 4NF6B 4GF8A 3MZ9A 3MVXA 4GRKA 1ZIUA 3LSXA 1B05A 1NNFA 1B3FA 4OFJA 1IXCA 4LZ5A 2QL3A 1NNTA 3TQLA 2AL5A 1MRPA 1MXVA 4UA8A 2YPNA 4KI0E 2ZMBA 3U1OA 3FXQA 4WEDA 1M5EA 5H8QB 1VR5A 5TPAA 5AE4A 1FTLA 2F6PA 3FXUA 1BTJA 4ESXA 1IXHA 2XXRA 1FQAA 2RKMA 3IAZA 3L6GA 4DXCA 5DVJA 4KCCA 2OWSA 2D5WA 1QUJA 4R72A 5L9OA 3DP8A 3OO7A 2H25A 2O1MA 2QS1A 4YKKA 1RYOA 1US5A 1UTHA 4LA9A 2Y7WA 2UVIA 2O51A 3VVFA 3TUSA 4OZ9A 4FAJA 5JK4A 1B46A 3CI8A 4MFIA 1XOCA 3IB2A 5H8FA 3OO8A 1ZMGA 3FD3A 4P0GA 3D4GA 4BDMA 3MC2A 3PD8A 3SETA 3EF7A 1BP5A 3C32A 4F1YA 1RKMA 4H67A 1SW2A 3MZ1A 3FASA 3S9EA 4U2RA 4IGTA 4JDFA 1R6ZA 1MH4A 3QUJA 1Y9UA 2HAVA 1GVCA 1LAFE 5H8FB 1N04A 4RPOA 3TCFA 5DEXA 1D4NA 2DWAA 3KN8A 3TKDA 2REJA 3I5OA 3PGFA 2I0BA 4THIA 3W15C 4OVJA 5KDTA 3B7DA 1ZJLA 1QJMA 2ONKE 1H44A 2UVGA 4NTLA 4WXJA 4HW8A 4HCYA 2Y84A 2HQ0A 3S4UA 2A5TA 3H03A 5DEXB 1LFIA 1NL5A 4AB6A 2DP8A 3BBRA 3RY3A 5AA3A 4DXUA 1MS7A 5H8SA 1JQFA 1MY4A 1POTA 5KDTB 4F18A 1L5TA 4YKJA 3O29A 4M4GA 1TT1A 4OFLA 1MQDA 3P7IA 1ZLQA 4GD5A 2QMXA 1B4HA 4JB7A 4F19A 1B0LA 4XKQA 4JWOA 4YMBA 3LC8A 2P2AA 2HAUA 2B3FA 2HCAA 3CSBA 3K6VA 3VFJA 3IJOB 3FZVA 3W9WA 3FUZA 5ICTA 1EZPA 2R71A 4I62A 2O7IA 3CFZA 5J1DA 4JXIA 2VOZA 1O63A 4LONB 1XC1A 2YJPA 5I56B 4H6DA 4XKPA 4E0WA 1MDQA 3R6UA 3O9PA 1IEJA 1OLAA 1MH3A 3CRBA 1UIUA 2DE4A 3PUZE 1OVBA 3C34A 3VV5A 4F2QA 3O28A 1WVJA 5DVIA 2DWHA 1YPNA 1MDP1 4EXKA 3S2VA 2XD2A 3SESA 3M8UA 1AMFA 4N6PA 1VSOA 4F3BA 3FVNA 4OETA 4F1UA 3PPPA 1Y1ZA 3HV1A 4XKNA 2REGA 4XKRA 4MF3A 3T9XB 5ISUA 3O6HA 3TODA 5LOMA 2OWTA 4KHZE 1M5BA 1FQDA 4GQOA 4NF4B 4TOZA 5L9MA 2QJEA 3E9XA 1UIVA 4O3BA 5I2NA 5ITPA 3OEMA 1LB9A 2I3WA 5KZTA 3UGWA 3GZGA 4R74A 4ELOA 4ONYA 1ELJA 3O2AA 2DQVA 5AA2D 3OSRA 5I59B 5FHOA 1MY3A 3K1NA 1JEVA 2RC9A 3TAJA 3VVEA 4NWDA 3T9HB 4R73A 5I57A 3K1PA 2HZKA 4XXUA 1EZ9A 2O68A 4QF9A 1I6BA 2VP1A 3CFLA 4F31B 1ATGA 4MLQA 3FGSA 1JNFA 5KCJA 3B6WA 2AIXA 5A5XA 4GXAA 3O97A 3VLVA 2Q88A 1JW4A 1FCKA 2ZYMA 4Q8RA 3MWBA 4OMBA 4MLVA 4KCDA 1MQIA 1LAHE 3RLFE 4OTEA 2KLFA 5CMMA 3IK6B 1FTOA 2RINA 3DP6A 3UIFA 3FATA 5AA4B 4MH5A 2Z22A 1O7TA 1R9LA 1S7YA 2PBWA 1SI0A 1NKXA 1S9TA 4QFKA 1MPDA 2XD3A 5FHMA 4GWOA 1D3KA 4I1DA 4NMYA 3A3UA 1TWYA 4IO5A 3IL1B 1B58A 4C0RA 4TLMB 4F1VA 4FECA 2V84A 1MY0A 3PUWE 4X48A 4NEDA 3T93B 1CE2A 2H98A 1USYH 4OEUA 5B70A 1LSTA 2R9JA 2VD3A 2R6GE 1VFDA 3MPKA 4UACA 4MBPA 3F11A 2ZXTA 4DE8A 3MJNA 5I2KB 5TP9B 3OELA 1Z7NE 1IIWA 4IO4A 2V93A 4LZ7A 5K2XA 2OJTA 1Y4CA 1GTKA 4YZZA 4H1XA 5AA2A 3MVYA 4RNSA 1HSEA 5EHMA 3VDFA 2D21A 2ZNSA 3LBSA 2ALUA 3EN3A 2DSFA 5JTYB 2PMSA 3V8XB 2I0CA 1MM6A 3MP1A 2Y7PA 4OWDA 3MZBA 3QSLA 3I6VA 2F7CA 3VXBA 5CI5A 3KOSA 3G3HA 3C35A 4GL0A 1GV8A 3K01A 1Y1MA 2Q2AA 1WDNA 1POY1 1AL3A 2OBGA 3N94A 3KEIA 5BWJA 4GL8A 2RC7A 2LAOA 4IO2A 4NF5B 1ANFA 2O6AA 1NH8A 1SI1A 2ONSA 1P1WA 1N84A 5CBRA 1IQ7A 2Q9TA 2HFBA 3C33A 1MPBA 3CVGA 4C1UA 1MG1A 3DP4A 2X7PA 5ELVA 1H76A 4IY6A 1URGA 1LAXA 3M3FA 5TPAB 1H3DA 1SVXB 2V3QA 2QS3A 3MP8A 1LBBA 4QSCA 4QHQA 3IOWA 1QKAA 3TQWA 4YMAA 4YICA 2FA7A 2G29A 1B5IA 3LSLA 4ZS9A 3U8QA 1DTZA 3CSGA 4YB7A 3MVZA 2RCAA 2D3IA 3RT6B 1N7XA 1J1NA 1D9VA 1UTHB 4DCYA 3TZAA 3PUVE 1VFEA 4KFQA 2HZLA 3PMXA 3FIRA 3TPAA 3TFLA 4ZECA 4EQBA 1FTMA 3L6HA 5I84A 3G3KA 4L17A 3ONMA 3UN6A 2F6GA 5DYHA 2XXIA 2Y7IA 4ZE9A 4G68A 1ZTYA 3W9VA 1Q35A 1AOVA 4PETA 1OMPA 3Q27A 4EF2A 3AXFA 3UA8A 1B1XA 4G8MA 1BIYA 3DLNA 2PX1A 2B65A 3C4MA 5M2VA 4GLIA 3E4RA 4R6KA 3TMGA 3K0VA 1XVXA 2NXOA 4G4PA 3D4CA 1MQHA 4QFLA 4DLDA 2DVCA 1B2HA 3RUMA 2XXTA 1A8EA 3K6UA 4EQ9A 4IB2A 1MXYA 1A7LA 1YTVA 1HSLA 4TQUQ 1H43A 2PT1A 4U1OA 2QMWA 4DXBA 2HXWA 2YLNA 4E0XA 3N6UA 4R2BA 4ZZEA 2A5TB 4OXVA 3USDA 2F35A 4PFTA 3TCHA 1B3GA 2UYFA 3BFTA 4FEBA 2Z8DA 3N26A 1QKBA 5EYFA 2ANJA 2F36A 1N7WA 1LAGE 2QSXA 3IOTA 3G3GA 5I58A 3PU5A 3LSWA 3K1MA 3PMVA 3MQ9A 3OXNA 2ZNTA 4RK2A 3T66A 1IITA 4Q5TA 3CG1A 2F97A 2DE2A 3THIA 1PEBA 3U72A 1WODA 3EHTA 3H6VA 3K2DA 3KSXA 2IA4A 5HM4B 2F7AA 3IORA 1B3HA 1Y20A 2I4CA 4G8NA 3VLUA 4R2FA 1MM7A 2DVZA 3TTKA 4N07A 2G93A 1DSNA 3PPQA 5CMKA 3HN0A 4H5GA 2CZLA 2XXPA 3GLBA 1XT8A 1MY1A 1SD3A 1FQFA 4QRZA 4PFUA 4FJPA 3B6TA 1CB6A 1YAEA 4IO3A 4LUBA 4U4SA 3HO7A 4OENA 2Q2CA 4ZEIA 1KWHA 3KJ7A 4U22A 3R7XA 4R75A 2XX9A 2I48A 2RC8A 3TTMA 4ELPA 3VVDA 4U21A 1A55A 4QSEA 3EQ1A 1Y3NA 2NVUB 5FTHA 4PP0A 2DWIA 3RN8A 4RJZA 1JETA 3LSFB 5F1QA 3JV9A 4I8CA 2V3TA 1R9QA 5H8HA 1GR2A 1B5JA 4FATA 2XXXA 4R6YA 4YB6A 1JVYA 2O1LA 3K6WA 4ZEKA 4KD5A 3GBBA 3O66A 5I2NB 2UXAA 3PPNA 1OVTA 4EQ7A 3RTFB 4F39A 4QSDA 1UTBA 2NOOA 3HPIA 3ZKLA 3T9VA 1SW4A 2OZZA 1B0HA 3V83A 1US4A 1I6QA 3SEYA 2RCBA 4OFOA 5EHSA 4X9TA 1FTKA 4KYSA 4QFOA 4R9GA 4BDRA 2H4IA 3C9HA 3LUYA 1N3WA 5I57B 3MUQA 4XIGQ 1DOTA 1Y3PA 4XTCQ 4ELRA 1P99A 2M8CA 5KCJB 4R9FA 3H06B 5A5XB 1SQYA 3KBRA 4U23A 2ZYNA 1LFGA 1M5DA 1M5CA 3KOTA 3MPLA 1P1NA 4DDDA 2E0SA 3H4ZA 1IXGA 4F29A 4EF1A 3A09A 2PT2A 3RPWA 3RTWB 1SYHA 4N13A 2VHAA 1N0TA 1B7ZA 4PQJA 3ZS6A 3H6TA 1TXFA 3KN7A 1LBCA 3MP6A 3U93A 5TU0A 3Q29A 1JW5A 1B7UA 2E1SA 3S9MC 1M5FA 1IZ1A 1FQEA 4ESWA 1AH5A 3IR1A 2Z23A 4FIMA 4NF6A 4F3PA 3HSTA 5L8DA 2H5YA 1N76A 4ZDMA 2H9BA 3SEUA 5CMCA 2XHDA 1MY2A 5CBSA 4H0WA 4YKPA 3PPOA 1IUDA 2DWJA 1PBPA 2Y7RA 1A99A 2UVHA 1DPEA 3K4UA 5HBCA 4YU0A 1EU8A 4ELQA 2F34A 4FEDA 5AA2B 5H8QA 3HHFA 3ILTB 5H8NA 4O3AA 4LQ2A 4OYVA 5AA1A 4P0IA 4H8JA 2CMOA 2O69A 1RYXA 1R1NA 2GRVA 3MBPA 1SBPA 3KGCA 1I69A 3HCQA 3IB0A 4ECFA 1TFDA 4K3FA 1P1OA 3QK6A 2X26A 3M3LA 1DPPA 4YAHX 1B32A 1JW1A 3U92A 3QXMA 2Z8FA 5IKBA 3IO4A 4TLLB 4EXLA 5DT6A 5H8NB 2BJJX 4F2OA 3SEWA 3EPEA 2QS4A 4ZEFA 3RGYA 1NNKA 1LCTA 2V25A 3E3KA 4GFRA 4HCWA 1A8FA 3OEKA 3N6TA 1MXZA 1NMUA 1B4ZA 2DYXA 1PB7A 1YCJA 1PC3A 4RK9A 3H6WA 4DCXA 1PB8A 5K2YA 1T0KA 3G3FA 3QUFA 3QYTA 2B3BA 1B7HA 4O3CA 4Z0IA 3ZSFA 4G2ZA 4EDPA 1LB8A 1URSA 4H5FA 4X1DA 5FHNA 3HHGA 5ICQA 1TFAA 1Y3QA 1EZOA 1S50A 3K6XA 3CFXA 3MAMA 1IXIA 2PYYA 4FORA 5FTIA 3FV1A 3UP9A 3PD9A 1A54A 1XHYA 3DELB 2GHBA 4F22A 2AL4A 1MPCA 4G68C 4NF8A 1URDA 3T22A 3SDFA 4KYEA 2UVJA 1QVSA 4IY5A 3T9UA 3FJMA 3TEPA 2THIA 4RYAA 2RF1A 1JVXA 1B5HA 5DVFA 2Y7KA 2IEEA 4OHNA 4F3SA 4H65A 3K00A 4KYDA 3C36A 4DZ1A 3TTLA 3VE1B 1B3EA 3OMBA 2H99A 1B9JA 4AQ4A 5F7VA 1FQBA 4G68B 4JBZA 4ZE8A 4EUOA 3OENA 4NF8B 3QIMA 3U94A 1LFHA 3KFMA 4POXA 3DM0A 4QFNA 4C1TA 1MXWA 2QRYA 3E13X 3FXRA 4ISUA 3CR9A 3IO6A 2XXVA 3TTNA 1SW5A 3B6QA 2F8DA 1ZKBA 3EHSA 2FNCA 1SW1A 3RQTA 2I3VA 3OO6A 3CG3A 3KSJA 4RY1A 1Z7ME 4NE4A 1ZBMA 1QUKA 2P1SA 3BKIB 1P1UA 3O6GA 3JZJA 1II5A 3PUYE 4POWA 3TYHA 2XX8A 4BDNA 4OEVA 5I56A 4G8HA 3KG2A 1UQWA 2XXWA 1BLFA 1USYE 4JWXA 1LCFA 4ZZAA 1LLSA 2I4BA 1BKAA 2I58A 3FJ7A 4JWYA 3K02A 2VD2A 1SYIA 3BFUA 4F3GA 1FQCA 4IGRA 3RNNA 4AB5A 1LGBC 1FW0A 1HSJA 1DMBA 3SEVA 1PBQA 1Y4TA 5ITOA 1Q1KA 1DTGA 3PV0E 2OK2A 2Q89A 4R6HA 1I6AA 2FYIA 5I58B 4G77A 3UK4A 3IB1A 5B7DA 3H6UA 4LQ5A 1B51A 3OD7A 3WAFA 3G3IA 3H3GA 4NF4A 1ZU0A 1OQGA 5HPQA 2P0SA 2AYSA 1O64A 2ZNUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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