3ILUB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, hydroflumethiazide
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iluB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iluB02
4RK9A 4ZS9A 4IO3A 1B6HA 4DXBA 1TFAA 1HSLA 3PU5A 3T96B 5CMKA 3MP1A 4RJZA 3FASA 1Z7NE 4GIZA 2OWTA 3TUSA 1A7LA 4ELPA 2P1SA 1FTKA 1SW2A 5IAIA 3DP4A 3SEYA 3IOTA 4QRZA 1JQFA 5L8DA 3S9NC 2REJA 1US5A 4OMBA 1Y9UA 1VFDA 4IO7A 4NF4A 4ZZAA 4YKKA 4H8JA 3V83A 1PBQA 1QJMA 3SEUA 3HCQA 4R9GA 1P99A 3UORA 1MXVA 1T0KA 3JYRA 3N6UA 4R6HA 1B3HA 4ELQA 1GGGA 2PBWA 5I57B 1AOVA 4EQ9A 2VD3A 4LONB 4RYAA 3CFZA 1B05A 2CMOA 3Q29A 1D9YA 3W9WA 1EZPA 3EQ1A 4GQOA 5CI5A 1URGA 3C35A 5TU0A 3LC8A 2QJEA 3C33A 1POY1 1LFGA 3VVEA 3MPLA 5JTYB 4FE8A 1Y4TA 5AA2D 3P7IA 1LFHA 2ZNSA 3SESA 2QMWA 1N3WA 5CRYA 1TT1A 4OERA 3RPWA 3OELA 4DXUA 1MQIA 4DDDA 1ANFA 2M8CA 5I57A 2E1SA 3QUFA 2F6GA 1XOCA 3IR1A 1JW1A 3PPPA 3FJGA 2I49A 3TAJA 1UQWA 4KFQA 5DVIA 3UN6A 3N94A 1ZBMA 4FIMA 2WKYA 5ITOA 5AE4A 3FGSA 4FJPA 2CZLA 5KCJB 4NF5A 5TP9A 3FVKA 3IX1A 1R9QA 3D4CA 1ZKBA 3IB2A 2DVZA 1B32A 1B1XA 1Y3NA 2GFEA 3H6VA 4OEUA 1PC3A 1MDQA 1CE2A 5L9MA 1NNKA 1LAXA 2RC9A 1BIYA 4RA1A 4IB2A 2OLBA 5CBSA 4LQ5A 3I5OA 5H8NA 5FHOA 3CR9A 1PBPA 4PFWA 2H9BA 1MXWA 4AB5A 2Q2CA 1PEBA 3ECRA 4XXUA 4QFNA 4OVJA 4KCDA 5K2XA 1B7UA 4P0IA 2PT1A 3OSQA 1H3DA 1Q35A 4GXSB 4JSOA 1D3KA 4YMBA 4HS7A 2XXQA 1MPBA 4O3CA 3K6XA 4WEPA 4YB6A 2DE2A 2IEEA 2RC8A 4H5GA 4MH5A 5H8FB 3TCHA 4OWDA 2ZYMA 5H8HB 2I0BA 1B4ZA 1BLFA 1Y4CA 2Q89A 4RPOA 1M5FA 2UYFA 4IY6A 2V84A 1NNFA 3K1PA 1OIBA 2F97A 2F35A 2OCUA 2F5XA 2F7BA 3V5AA 1O64A 4EQBA 2ONSA 1F9BA 1MY1A 2G29A 2Q2AA 2UVHA 1LFIA 3TTRA 4F19A 2Q8JA 3PUWE 3E9XA 2DQVA 3CG3A 4PETA 3BFTA 4R72A 4OFLA 1MY3A 5H8FA 3WAEA 1S7YA 3IJOB 5H8HA 2NOOA 2VD2A 2P2AA 3JV9A 1FTJA 1M5CA 5AA1A 1I6AA 2VP1A 4ESWA 3BKIB 2GH9A 4X48A 2I58A 3GBAA 1QKBA 2IA4A 2ZNUA 1WDNA 3HPIA 4MBPA 3H4ZA 3F11A 1LAFE 3QUJA 3TTMA 1VFEA 3FVGA 3KGCA 3KZGA 3UP9A 5I58B 4LP2B 4YICA 1R6ZA 3RUMA 4U21A 1O63A 3PUYE 3C31A 3T9HB 1DPEA 2ANJA 4NF6B 4F18A 1SW1A 3Q28A 4H67A 3DLNA 1JVYA 1MM6A 2E0SA 1SYIA 4NWDA 3MVXA 2RKMA 5EHSA 1B5IA 4UA8A 1XVXA 2XXRA 1FQEA 2Q88A 2XXWA 5KZTA 3HHGA 4JWXA 3G3GA 3IJXB 4RK2A 4YAHX 2DP8A 2QMXA 3PMWA 2XD3A 3E3KA 1NNTA 5I58A 1DMBA 3GBBA 1AL3A 1B46A 4NF6A 3HN0A 5A5XB 2ONRA 4G68C 4ND9A 5B70A 4LA9A 1NMUA 2ZYNA 4DCYA 2HEUA 1US4A 3KOSA 3T22A 4EXKA 1B2HA 3G3FA 1OVTA 1LGBC 4KI0E 2DWJA 1N3XA 2QS3A 3QAXA 5CMMA 2XXPA 4OEVA 2QS1A 4ZEKA 1MY4A 3WAFA 4F1VA 3PPRA 1TFDA 1URSA 2NWJA 4QSCA 4XKRA 5BUUA 1LCTA 1D9VA 2UVIA 3VVFA 3QSLA 1LBCA 4IO2A 5A5XA 3GZGA 3SERA 2I48A 3TODA 1IXHA 3K01A 4MLVA 2RC7A 4ZEFA 2X7PA 2HAUA 4NF8B 3DP8A 4G8NA 2XXTA 1NFTA 3Q27A 3FV1A 1QVSA 5EYFA 3O29A 5BWJA 2DVCA 5I2KB 4OQOA 3LSWA 3QK6A 4BDMA 4O3AA 4F3GA 3TEPA 1D4NA 2XXXA 3ONMA 4IO6A 3VLVA 4G2ZA 3E4RA 2QL3A 3A3CA 1ZJLA 4H65A 4R2BA 4IGRA 4TLMB 4F31B 3G7WA 3A3UA 2HQ0A 1R9LA 4BLAA 3BBRA 2Y7IA 1M5DA 2O7IA 3VVDA 2Z23A 3TQWA 5FHNA 3VV5A 3TFLA 1ZIUA 3KJTA 4E0XA 2H25A 2DS9A 4K3FA 1CB6A 1ATGA 5EHMA 1A99A 4EF1A 5CC2A 1AH5A 3I6VA 3KSJA 1BKAA 3TKDA 3MZ9A 2XXIA 1GV8A 1YAEA 1MXXA 4YKPA 4ISUA 2DWHA 1QUJA 2DXRA 1SDXA 1B0HA 1VR5A 3OEMA 1DTZA 4PP0A 5ICQA 3KFMA 3EHSA 1MXZA 4U1OA 4EDPA 4U2RA 4QFOA 5ELVA 2QS4A 4G77A 3W15C 3DP6A 1P1WA 1IQ7A 3O6HA 4BDRA 5I84A 4F2QA 1JEVA 1B3GA 2UYEA 3DM0A 2HCAA 3CI8A 3PUVE 4AQ4A 4TOZA 4QFKA 2R6GE 3PPNA 1MQJA 4U4XA 2PX1A 4F29A 2XHDA 3PMVA 4MLQA 2O6AA 2F8DA 1FQDA 3O97A 1DTGA 4NMYA 2PYYA 1QKAA 1SW4A 4E0WA 3PUXE 2P0SA 3W9VA 1UIUA 3MVZA 4NF5B 1FTLA 5TP9B 2Y7WA 3D4GA 1FQFA 1XT8A 4OZ9A 4LATA 3SETA 1RKMA 3KG2A 4GF8A 3O28A 3OD7A 3H3GA 1SW5A 2DSFA 4PFTA 3MWBA 1RYOA 1QUIA 4TLLB 3FUZA 1NKXA 3FJ7A 3USDA 1LB8A 2PMSA 3MZBA 2O84X 5H8NB 3VXCA 4R74A 4GFRA 1PDAA 3LSLA 3OXNA 3Q25A 5CM6A 1A54A 4IY5A 4H6DA 2O69A 3IB0A 3IAZA 2B3BA 4IO5A 1SBPA 4KD5A 3RTWB 3EHUA 3FZVA 2UVGA 2H99A 3M3KA 4RPNA 4M4GA 4N13A 4KYDA 3RNNA 3KBRA 2BJJX 2O7UA 1B3LA 4OFOA 1N7XA 2XX9A 3IO6A 4JXIA 3K6VA 1LBBA 1H43A 2V3UA 1AMFA 4ZE9A 2I0CA 3MPKA 1MM7A 4POWA 3MC2A 4P11A 3AXFA 3TTNA 4R9FA 4DIGA 2V3QA 1JNFA 4XKNA 5CMCA 5DT6A 2RINA 2XXHA 1XC1A 1FQCA 3H6TA 4ZEIA 1MXYA 2H4IA 3TELA 3OMBA 2ZNTA 3C34A 4JDFA 1B9JA 3O6GA 3OSRA 5AA4B 4OENA 1NH7A 1Y3PA 1TXFA 1PB9A 1PB7A 1LAHE 4G68B 1B3FA 3MW0A 1P1OA 4I1DA 3K4UA 3H6UA 4ZZEA 3LSXA 3T9UA 4WXJA 4EF2A 1B7ZA 1II5A 3MP8A 3FVOA 4ZECA 4ELOA 3MP6A 3CVGA 5DTBA 1A55A 3UGWA 2UVJA 1LB9A 3PPOA 3U92A 5AA4A 1UTHA 3PD8A 3LUYA 4XKPA 4KYEA 3H6WA 5HBCA 2XXVA 4M1VA 3KN3A 4U23A 4G68A 1A40A 3ODBA 4KYSA 5L9SA 1ELJA 1FQBA 1HSEA 3GLBA 2AYSA 5B7DA 4R6KA 3CSGA 2HAVA 4NTLA 4OXVA 4EQ7A 2X7QA 1SYHA 1L5TA 2ALUA 3IOUA 5I2NB 3KSXA 3IO4A 2G93A 5DVJA 4OETA 4R6YA 2UXAA 3VE1B 1XS5A 1O7TA 1MG1A 4OYVA 1YCJA 1EH3A 3G3KA 5I56A 5HPQA 1YTVA 3MVYA 4BDOA 4EXLA 1B3EA 2H98A 4KQPA 3K1MA 3C32A 2KLFA 4RNSA 1MDP1 5DEXB 4I9DA 3RY3A 4Q5TA 2I3WA 3QIMA 5I2NA 5FTHA 4ESXA 3S9MC 3TTKA 2F78A 1FQAA 2F34A 1IXIA 4YB5A 4ZE8A 4FECA 1H45A 4NWCA 3O6IA 3K6UA 1USYH 4RXLA 3S9LC 5HM4B 1B1HA 3FD3A 5M2VA 2O68A 5F1QA 4BDLA 1MS7A 4NE4A 3FXQA 3RT8A 2A5SA 2YJPA 2ZXTA 2ESNA 4H1XA 5DEXA 4F3PA 5ICTA 3OO9A 2YPNA 3I3VA 4F39A 3R26A 3FXUA 4IGTA 4JB7A 1DPPA 4GXAA 3N6TA 4OFJA 4JWOA 1B4HA 2RCAA 3IOWA 3B6WA 2OJTA 4KHZE 4PE5B 1EU8A 2DE3A 2YLNA 1HSJA 3TDJA 1B7HA 3R6UA 4H5FA 2OK2A 1DOTA 2D3IA 1DSNA 1IIWA 4Z7EA 3T66A 1FTOA 1H76A 4ECFA 4NEDA 4JBZA 2AIXA 3U93A 4X9TA 3HV1A 1MQHA 1R1NA 1I69A 3S4UA 1ZU0A 2XXUA 5I59B 4YKJA 3VLUA 1JETA 3R7XA 1NL5A 3FXRA 4C1UA 1MQGA 2PVUA 1QULA 4XKQA 1FTMA 2X26A 2ZMBA 3UK4A 2AL4A 4UACA 1AIVA 1IXGA 3H7MA 5J1DA 2NUVA 3C4MA 1MH3A 3U94A 4RY1A 3FIRA 3QXMA 5I59A 4KPTA 3CG1A 3BFUA 4JWYA 4OTEA 1TWYA 3LR1A 4DE8A 4KR5A 5TPAA 1ZLQA 1OLCA 2GHBA 1MY0A 3K6WA 4R75A 1NNPA 3C9HA 5FHMA 1OQHA 3KN7A 3IL1B 1JW5A 3UA8A 4ZDMA 2D21A 1A8FA 1Y1MA 4IO4A 3RN8A 2D5WA 2Z8DA 3S2VA 3VDFA 2QRYA 3SEWA 3PD9A 4QFPA 5CMBA 3FJMA 1KWHA 2Z22A 3THIA 1MPDA 2HZKA 4PFYA 4LZ5A 1Y3QA 2Z8FA 3SEVA 2XXYA 1PB8A 4LZ8A 3U1OA 1S9TA 4OESA 3VXBA 3K02A 1OLAA 1Y20A 2O1LA 3ILUB 3HSTA 3A09A 1B40A 4MFIA 4EUOA 5FTIA 2ZYKA 3U8QA 2GRVA 3PMXA 3Q26A 5DYHA 4KCCA 1P1NA 4THIA 3N26A 3FV2A 2XX7A 1M5EA 2O1MA 4ONYA 4G8HA 3RTFB 1H44A 1SI1A 3TYHA 4F2OA 2W7YA 4JSDA 2V93A 1GTKA 2O51A 2R9JA 3H03A 2F7AA 3JZJA 4C1TA 2I4CA 2I6EA 3KOTA 2XX8A 1GVCA 1MQDA 1N76A 3MAMA 4Q8RA 3ILTB 1QUKA 2NXOA 2OBGA 3T93B 1EZOA 4N07A 4BDQA 5JTYA 4R73A 5ITPA 3VFJA 1OMPA 4LQ2A 3IOVA 5JEIA 3CFLA 3OENA 1J1NA 5H8SA 2B3FA 3V89B 5AA2B 1BP5A 5K2YA 3L6HA 3CIJA 1WODA 4ZEBA 2Q9TA 3G3JA 1B52A 1OVBA 1VE4A 1ZTYA 3CRBA 5H8QB 3FATA 3TTLA 5KCJA 3CFXA 2RF1A 1LLSA 4GLIA 1P1QA 2FYIA 1B5JA 3OO6A 2DWAA 4ZEDA 5LOMA 4GVOA 4GWOA 3RQTA 1USYE 4QFLA 2R71A 1I6BA 4YKIA 1UTHB 4GD5A 1A8EA 4YZZA 3EN3A 1XVYA 3G3HA 4G8MA 4DXCA 4H0WA 1IXCA 3MUQA 2A5TB 4I8CA 2F36A 5AA2A 2B65A 3ZS6A 3DELB 3G3IA 4FATA 2GHAA 1MY2A 4X1DA 1MRPA 3LBSA 5H8QA 2Y7PA 2FNCA 4Q30B 5DVFA 4TQUQ 4FEBA 2QPQA 1IEJA 3B6QA 1POTA 4F1YA 3RLFE 1URDA 3T9VA 4L17A 1UTBB 2RCBA 4AB6A 1JEUA 3IORA 4YU0A 3MZ1A 1BTJA 4I62A 2A5TA 4QSEA 5I56B 2VGQA 4BDNA 2THIA 1Z7ME 5F7VA 2V3TA 3TPAA 1LSTA 2I3VA 1EZ9A 1SI0A 2DXYA 3TCGA 3PV0E 1N7WA 4Z0IA 4N6PA 4YB7A 4U1ZA 3O9PA 5JK4A 4F22A 4WEDA 1FCKA 3TMGA 4F1UA 1IZ1A 1JVXA 3PGFA 3N5LA 5IKBA 4H8IA 1UTBA 3MQ9A 4DLDA 1Y1ZA 4GL8A 3O2AA 4HCYA 3LSFB 3EPEA 1P1UA 4G4PA 4U4SA 4C0RA 1MXUA 4U22A 3OO7A 3L6GA 4HCWA 4YMAA 2HXWA 3K00A 3M3FA 2DWIA 2F7CA 4GRKA 4PFUA 4LZ7A 3ZKLA 1LCFA 4PQJA 2Y7KA 1MH4A 2VHAA 2V25A 1GR2A 4DZ1A 3MVWA 3OEKA 2FA7A 1B51A 3H06B 3TZAA 3ZSFA 1M5BA 5KDTB 1B5HA 1RYXA 2Y84A 3OO8A 2ABHA 3SKPA 1WVJA 3RGYA 1SD3A 3CSBA 4F3SA 4X1BA 3O66A 3OOAA 2QS2A 1JW4A 4OHNA 3TQLA 2AL5A 2QSXA 3IK6B 1LAGE 5CBRA 2Z8EA 1NH8A 3B7DA 2OZZA 1XHYA 2HZLA 4ELRA 2LAOA 1Q1KA 1VSOA 3K0VA 2REGA 1OQGA 3HHFA 5KDTA 1FW0A 1B0LA 2DOJA 3KEIA 3SEXA 3EF7A 4F3BA 4QHQA 3E13X 4QF9A 1IUDA 3MBPA 1B58A 2NVUB 3FVNA 3S9EA 4LVQA 3MJNA 3K1NA 5L9OA 2HFBA 2I4BA 4POXA 1N04A 3ZKKA 3PPQA 2VOZA 4HW8A 2XD2A 2PT2A 4FEDA 4R2FA 2OWSA 3RT6B 3UIFA 3KJ7A 3U72A 2ZYOA 1IITA 3GXAA 4FAJA 2Y7RA 3V8XB 1S50A 4XTCQ 4WKMA 4XIGQ 4P0GA 1QW0A 1ZMGA 2DE4A 3C36A 4LUBA 5TPAB 1N0TA 3M8UA 4O3BA 3HO7A 4Q0CA 4DCXA 1YPNA 1N84A 4FORA 3SDFA 3VLWA 4HTGA 2H5YA 2DYXA 3KN8A 2ONKE 4GL0A 3QYTA 3K2DA 4GOTA 3M3LA 1SVXB 4NF8A 3B6TA 4MF3A 1I6QA 3T9XB 5AA3A 1UIVA 3IB1A 3EHTA 5ISUA 4QSDA 3PUZE 1SQYA 1MPCA 2F6PA 5I2KA 3TCFA 4NF4B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RK9A 4ZS9A 4IO3A 1B6HA 4DXBA 1TFAA 4IR8A 4MJOA 1HSLA 3PU5A 1LEVA 3T96B 5CMKA 3MP1A 4RJZA 3FASA 1Z7NE 5LDZA 4GIZA 2OWTA 3TUSA 4H46A 1A7LA 4ELPA 2P1SA 4KXPA 1FTKA 4G61A 1SW2A 5IAIA 3DP4A 4HE0A 3IOTA 3SEYA 4QRZA 1JQFA 5L8DA 3S9NC 2REJA 1NI9A 1US5A 2OWZA 4OMBA 4PDDA 1Y9UA 4GX6A 1VFDA 4PF8A 4IO7A 4NF4A 4ZZAA 4YKKA 4H8JA 3V83A 1PBQA 1QJMA 3SEUA 3HCQA 4R9GA 1P99A 3UORA 1MXVA 1T0KA 3JYRA 3N6UA 4R6HA 1B3HA 4ELQA 1GGGA 2PBWA 5I57B 1IMDA 1AOVA 4EQ9A 2V4CA 2VD3A 4LONB 3BIGA 4P8BA 4RYAA 3CFZA 1B05A 2CMOA 3Q29A 1D9YA 3W9WA 2VPOA 1EZPA 3EQ1A 4XFEA 4GQOA 5CI5A 1URGA 3C35A 5TU0A 3LC8A 2QJEA 3C33A 1POY1 1LFGA 3VVEA 3MPLA 5JTYB 4FE8A 1Y4TA 5AA2D 3P7IA 4P9KA 1LFHA 2ZNSA 3SESA 2QMWA 2Y5LA 1N3WA 1NUXA 5CRYA 1TT1A 4OERA 4GWXA 3RPWA 1NV6A 3OELA 3FBPA 4DXUA 1MQIA 4DDDA 1ANFA 2M8CA 5I57A 2E1SA 3QUFA 2F6GA 2Q74A 1XOCA 3IR1A 2B4MA 1JW1A 3PPPA 3FJGA 2I49A 4UABA 3TAJA 1UQWA 4KFQA 5DVIA 3UN6A 2WEFA 1ZBMA 3EKIA 3N94A 4FIMA 2WKYA 5ITOA 3KBZA 5AE4A 3FGSA 4FJPA 2CZLA 5KCJB 4NF5A 5TP9A 3FVKA 1KZ8A 3IX1A 1R9QA 3D4CA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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