3ILUB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, hydroflumethiazide
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iluB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iluB02
4NF4A 4H0WA 4XTCQ 1MG1A 3CVGA 1AIVA 2VOZA 2QS3A 4F3BA 1EZOA 3VDFA 5TP9B 4MF3A 1JNFA 2H5YA 2ZNUA 3TQLA 1AOVA 5I2NA 5ITOA 5TPAA 4QSCA 3S9EA 5FHMA 1F9BA 1A8FA 1PB9A 3FXQA 2HAVA 1SW2A 5AA2B 3PUVE 3O29A 5AA3A 4YB5A 4XKPA 3R6UA 4H1XA 4LA9A 1NNKA 3IL1B 5TP9A 3RPWA 4LZ7A 1N3WA 2R71A 1OLCA 4R72A 4PFUA 5JK4A 2RC8A 3IOTA 1MXWA 2ONKE 3DM0A 1MQHA 4RNSA 4EF2A 2UVHA 5AA2A 3PPRA 4F22A 2ZNSA 4I1DA 5L8DA 4KYDA 1VFDA 2F7AA 3ZS6A 4DLDA 5I59B 1IXIA 5I84A 3IJXB 3PUXE 5AA1A 2O1LA 1CE2A 3IB1A 1FQDA 4EUOA 5KZTA 2XX9A 1MH3A 2ZYNA 1GVCA 2A5TA 1B51A 5L9SA 1OQGA 3Q28A 3H6UA 1O63A 3TUSA 3V8XB 2F36A 4ZS9A 1LGBC 5ITPA 4GRKA 2O51A 3H3GA 3JV9A 4F3SA 1IXHA 1N04A 3G7WA 4QSDA 4UA8A 5CMCA 3OSQA 3VVEA 1D9VA 4FEDA 4H5FA 3PD8A 2F34A 1MXUA 1B3GA 3FV1A 5CMMA 2Z8FA 3LSFB 3MP8A 2DXYA 5CBRA 3IB0A 3WAEA 2ONRA 1RYOA 4IO6A 3TODA 4K3FA 3OO9A 4G8HA 1Z7NE 3LUYA 4ISUA 1N0TA 1A99A 3MZ1A 3BBRA 3RT8A 3C33A 4G77A 1GTKA 2V84A 3N94A 3S9LC 3DP6A 1XC1A 3Q29A 4AQ4A 2QL3A 1I6AA 5LOMA 4OMBA 1WODA 3RTWB 2VGQA 4H5GA 4H8IA 3EHUA 4LONB 5K2YA 4XXUA 3TTLA 4DCXA 3TPAA 3VLUA 4G8MA 1N3XA 3G3KA 1ZU0A 5B7DA 3FASA 5DVIA 3BFTA 4M4GA 1ELJA 4U4SA 3MVYA 5H8SA 3CG3A 5KCJB 2ZYMA 1IZ1A 2XD2A 3ECRA 3KGCA 2GHAA 3RNNA 3IOWA 3I6VA 1D4NA 3QXMA 2OBGA 3GLBA 3W15C 4YKJA 3FJMA 4MFIA 4OTEA 2HXWA 3C9HA 3GXAA 4KYSA 3EQ1A 1QULA 1DSNA 1FTKA 4IY5A 4PQJA 3KEIA 3IOVA 5KCJA 1I6QA 2Z8EA 1R9LA 1SBPA 5HPQA 2H99A 3SETA 2REJA 3OSRA 3H6VA 3ZKKA 3KN8A 3VLVA 2GH9A 1Y3NA 1TFDA 1US5A 3CSBA 1P1NA 1URSA 2QMXA 5H8HA 4IO3A 2AL5A 3OEMA 2OCUA 2F5XA 3MQ9A 1B52A 3HHGA 4GWOA 1O7TA 4YMBA 1MM7A 5CC2A 3TQWA 1DPEA 3RN8A 3EN3A 1Y20A 2DQVA 5KDTA 1S7YA 3UGWA 2HZKA 2DWAA 4NF5B 1P1OA 2ABHA 4XKRA 3ZSFA 1ATGA 3HHFA 4P11A 3C32A 1SQYA 3KBRA 3TTNA 4KD5A 1I69A 4KHZE 1N84A 4PE5B 3BFUA 3OO7A 3T9UA 2R6GE 1XT8A 4NF5A 4LQ2A 3K1PA 2I48A 3MP6A 3FJ7A 2V3QA 2FA7A 2I49A 1BLFA 2PX1A 2HQ0A 1PB8A 4G8NA 5TU0A 4O3BA 3E4RA 3VE1B 1B0HA 3KJTA 3M3KA 3LSLA 2OLBA 4G68C 2UVGA 2W7YA 4RJZA 1SDXA 4LQ5A 4JSDA 4R2FA 4QHQA 3B7DA 4THIA 2AL4A 4U4XA 1Y1ZA 1LSTA 5M2VA 4ELQA 1YTVA 3TFLA 1I6BA 2XD3A 3HO7A 3H4ZA 1B7ZA 1Y1MA 2Q88A 2UYEA 1UIVA 2Y84A 3DLNA 4NTLA 3VVDA 1XHYA 4EXKA 1OIBA 2F7CA 3GBAA 5A5XB 4OENA 2QMWA 4IB2A 4ELRA 1MH4A 3W9WA 1B46A 3L6HA 2Y7KA 4Z7EA 3DELB 4NEDA 4C0RA 5I58B 4JWXA 2VD2A 1QJMA 2XXPA 4XIGQ 4RXLA 4DXCA 1SYIA 2DVZA 3K01A 2QRYA 5CRYA 3RY3A 4KYEA 2I58A 2DOJA 3OENA 1FCKA 5F1QA 5FHOA 4R73A 4FE8A 3K0VA 2LAOA 3VV5A 4RPNA 1JW5A 3FVKA 2NUVA 1USYH 2X7PA 4LZ8A 3MW0A 5I58A 3FVNA 4QSEA 4U1ZA 3SKPA 5CI5A 2Q2CA 3TCHA 2O6AA 2NOOA 5BUUA 3K2DA 2KLFA 3D4GA 3UA8A 1ZIUA 2HEUA 3FATA 3RQTA 3EPEA 3IR1A 3EF7A 3O66A 5CMBA 5I2NB 2B3FA 4ZECA 2Y7RA 4MH5A 3SESA 3KOSA 5CMKA 1B05A 4PFWA 1M5BA 3JZJA 4DE8A 2DSFA 1LCFA 1QUJA 5I57B 3SEYA 1Z7ME 1YPNA 3VLWA 2ZNTA 3CFLA 1II5A 1PB7A 3IAZA 3SEWA 5B70A 1LAGE 3Q27A 3PUWE 3QYTA 2Z23A 3PMVA 1FQFA 1Y4TA 4JDFA 2YPNA 4OZ9A 4LUBA 2X7QA 1NL5A 4M1VA 3VXCA 3S9NC 4LVQA 3CIJA 4NF8A 5I57A 2DWHA 5IAIA 3D4CA 4ESXA 3THIA 2A5SA 1BTJA 4U22A 4HCWA 4QRZA 2RINA 5I56B 1JW1A 1S9TA 2Q2AA 2F6GA 3P7IA 3OELA 2RKMA 1SW5A 3CRBA 3N6TA 1QKAA 1TFAA 3GZGA 3OEKA 4ZE8A 2A5TB 3IJOB 2F35A 1B1HA 1TT1A 1P1WA 3H6WA 3MPLA 3MBPA 2XX7A 4ZZAA 1P1UA 5H8FB 1RYXA 5I56A 4LZ5A 1B1XA 4TOZA 1ZMGA 2GFEA 3ODBA 4OQOA 4TLMB 1YAEA 4DCYA 1HSLA 2Q8JA 1B5JA 3KZGA 4ZE9A 1DMBA 3PPPA 1UTBA 1UTHA 4JBZA 3T22A 4KFQA 2I6EA 3K00A 4GLIA 4R2BA 5H8FA 3S2VA 1EH3A 4BDQA 4H6DA 5HM4B 4F2QA 4X48A 2RC9A 4G68A 1A55A 5CM6A 4QFLA 4RY1A 1ZLQA 4EXLA 5BWJA 4GXSB 3PPOA 2VD3A 3PMWA 1H76A 1LB9A 1USYE 1NH8A 3JYRA 2O69A 2ZXTA 2I0BA 5ICQA 4NF6B 4F29A 4FORA 3FXRA 3RUMA 2UVJA 3OMBA 4OHNA 3T9XB 4X1DA 3E13X 3PGFA 2P0SA 1JQFA 3K02A 3PU5A 3O9PA 3Q25A 4RA1A 4F1YA 3EHTA 2M8CA 2CMOA 5H8NB 4ZEIA 4NWDA 1DPPA 2ANJA 4NF6A 3QUFA 1EZPA 4ELOA 2NXOA 1M5FA 4HS7A 2DXRA 5H8QB 1B0LA 1L5TA 1NH7A 2DWJA 3OO8A 4F31B 2QS2A 2HCAA 2AYSA 2O68A 3SEVA 4FIMA 4OESA 2OZZA 5H8NA 4OFJA 1NNTA 3PPNA 4GL0A 4MLVA 3CFZA 2PT2A 1EZ9A 1A54A 2H9BA 5H8QA 5H8HB 5IKBA 4OVJA 2XHDA 1PBPA 2ALUA 1BIYA 2CZLA 1GR2A 3MUQA 1MPBA 3V89B 3OXNA 1H43A 2V3TA 1SD3A 5DVFA 3FUZA 3C4MA 5DYHA 3TCFA 1B9JA 4TLLB 1MDP1 4U1OA 5KDTB 1B32A 3MZBA 4GVOA 5AE4A 3H03A 4OFLA 3O97A 3PUZE 5F7VA 4QFOA 3FV2A 3QAXA 1B6HA 1ZJLA 3GBBA 2Q89A 2PBWA 4EQBA 1SI1A 4ZEFA 3U94A 1POY1 3AXFA 2V25A 3G3HA 1FTOA 4YU0A 3VVFA 2THIA 1ANFA 1QW0A 3A3CA 4E0XA 2Q9TA 2XXTA 3HV1A 1P1QA 4HTGA 4YMAA 1MY0A 1XOCA 3R26A 2IA4A 3FD3A 4F1VA 3RLFE 2VP1A 4XKQA 1MXZA 5FTIA 1MY3A 4N6PA 1MXXA 4ZDMA 3K1MA 5DVJA 2GRVA 2RC7A 4L17A 2RCBA 4F3GA 3MAMA 4KPTA 1Y4CA 4AB6A 1MDQA 1D3KA 3HCQA 3O2AA 1FTJA 2OK2A 4Q5TA 1MY1A 4GL8A 4OEVA 4IO7A 2NVUB 5AA4B 3LSWA 1IUDA 1MQDA 3TCGA 3FIRA 1IXCA 2ZYOA 1LBBA 2XXXA 1XVYA 3KFMA 1LCTA 4U23A 3TTKA 1KWHA 3S4UA 3A3UA 3T93B 1RKMA 1POTA 3M3LA 1B7HA 4N07A 4UACA 4C1TA 5AA4A 1QUKA 1GGGA 5JTYA 2OWTA 4FJPA 2F8DA 1IEJA 1NFTA 2WKYA 3C34A 3VXBA 3DP8A 1B3LA 2O84X 3RTFB 3O6IA 3SDFA 3USDA 4KCCA 3UK4A 2QJEA 4FATA 3O6GA 4JWYA 2YJPA 3ONMA 2XXWA 4KI0E 4PFYA 1EU8A 4DZ1A 2Y7PA 2HFBA 1B40A 1ZBMA 1N7XA 1YCJA 4O3CA 4WXJA 4EDPA 1HSJA 4IO4A 4E0WA 1T0KA 2P2AA 1QKBA 3W9VA 2D3IA 3TAJA 2RCAA 2FNCA 3MWBA 1MXYA 1SW4A 2XXIA 1VR5A 1S50A 4JXIA 3U72A 3U92A 2I3WA 4BDRA 4YKIA 4RK9A 1AMFA 3IO6A 3N6UA 1ZKBA 4POXA 3VFJA 4PETA 2OWSA 3L6GA 3F11A 5L9MA 3OD7A 3B6QA 3I5OA 1LLSA 3HPIA 4FECA 5K2XA 4I8CA 3DP4A 3FVOA 4ZEBA 4ND9A 1NNPA 3S9MC 2DE2A 4KR5A 2UVIA 4NF8B 3CI8A 3HN0A 4OEUA 3CR9A 3C36A 3FGSA 3PV0E 1PC3A 2VHAA 4YAHX 3CSGA 2DS9A 4OERA 2IEEA 2DE3A 4IO5A 3KN3A 4OWDA 1FQEA 3U93A 2HZLA 3N26A 1GV8A 2D21A 1NNFA 2D5WA 3HSTA 1FW0A 2XXVA 1IIWA 4GXAA 3C35A 3K6VA 1FQBA 2Z8DA 3IB2A 4POWA 3B6WA 3T9VA 4IGTA 4R6KA 3ZKLA 1IITA 1B3FA 1OLAA 2H98A 3K4UA 4R74A 4QF9A 4DDDA 2XX8A 1O64A 3O28A 1N7WA 3U8QA 1UTBB 1UTHB 1CB6A 3SEXA 4WKMA 3H7MA 1HSEA 1AL3A 2X26A 3FXUA 4KQPA 3SEUA 1DTZA 3T66A 4QFNA 3K6UA 1QUIA 2F78A 4G68B 2QPQA 2G93A 5FHNA 2XXQA 4U2RA 2PYYA 1MY4A 4ZEDA 1R9QA 1MQJA 1R1NA 3IOUA 1XS5A 3G3FA 2XXHA 3IO4A 2V3UA 2YLNA 3KG2A 3TEPA 4IGRA 4JWOA 2E1SA 3FZVA 2UXAA 2RF1A 4ESWA 1WVJA 4HCYA 4QFKA 3R7XA 1MXVA 3IORA 1LAXA 1MQGA 2AIXA 3FJGA 3EHSA 4X1BA 5I59A 4Q0CA 2G29A 3K6XA 1MS7A 3UP9A 4GQOA 4KCDA 1US4A 2O1MA 4G2ZA 1URGA 1XVXA 3G3IA 2DE4A 1WDNA 1TXFA 2PT1A 3FVGA 4LP2B 1LBCA 1OVBA 1B3HA 1FQCA 1JETA 1A40A 3MJNA 1FTLA 4GF8A 1QVSA 2O7IA 2DWIA 3K6WA 4OETA 4RK2A 3I3VA 3LSXA 4JSOA 1Y3QA 2B65A 3KOTA 1LAFE 2B3BA 2QS4A 1JVYA 3PPQA 1OVTA 3H6TA 4IO2A 4DIGA 3RT6B 1JEVA 2H4IA 2DYXA 1ZTYA 2P1SA 4YICA 4OXVA 4U21A 1P99A 4Q30B 1LAHE 1NMUA 1IXGA 3MC2A 1MPCA 3KSXA 1PBQA 2F6PA 1DOTA 3KSJA 3CFXA 3MVZA 3UORA 3QK6A 2H25A 1JVXA 5I2KB 1IQ7A 5L9OA 4PFTA 4H67A 4DXBA 4YB7A 4YB6A 3T96B 3TDJA 3ILTB 1A7LA 2ONSA 3CG1A 3LC8A 3U1OA 3KN7A 4ECFA 3OO6A 1B5HA 1H3DA 5FTHA 2ESNA 4BDMA 2XXYA 1B2HA 2O7UA 4HW8A 1SI0A 4JB7A 4F18A 3ILUB 5AA2D 5I2KA 3LR1A 4BDLA 1LFIA 2DP8A 1MPDA 4EQ7A 4R6YA 4OFOA 4R75A 3MVXA 3TZAA 4BDNA 2Y7IA 4RPOA 3E3KA 1MM6A 4YKPA 5ICTA 2PMSA 4I9DA 4DXUA 4LATA 1PEBA 4GOTA 1JW4A 4NMYA 3QIMA 4YZZA 4H8JA 1M5DA 4R9GA 2V93A 2F97A 1H44A 4AB5A 3O6HA 4BLAA 5CBSA 1M5CA 1URDA 4TQUQ 3TYHA 1B3EA 1B4ZA 1VSOA 2QS1A 3UIFA 1LFHA 3QSLA 1VE4A 4FAJA 4F3PA 4Q8RA 1NKXA 1UQWA 1H45A 4ZZEA 1N76A 3OOAA 5EYFA 1SW1A 4NE4A 3TELA 2REGA 5EHMA 4FEBA 1B7UA 4O3AA 3K1NA 1BP5A 1PDAA 5JTYB 1Y9UA 3M8UA 4Z0IA 3KJ7A 4OYVA 3TKDA 3N5LA 1FTMA 2I3VA 2GHBA 4EF1A 3M3FA 2XXUA 4F2OA 5EHSA 4F39A 3PD9A 4NWCA 4ONYA 3TTMA 1VFEA 4I62A 2Y7WA 2F7BA 4C1UA 2UYFA 4ELPA 4F19A 1BKAA 3B6TA 2E0SA 1DTGA 3PUYE 3IK6B 1B5IA 2FYIA 5DTBA 4ZEKA 3UN6A 4WEPA 1A8EA 2HAUA 4XKNA 3A09A 3E9XA 2BJJX 5J1DA 1B58A 1M5EA 4P0GA 2PVUA 4X9TA 5DEXB 2QSXA 1UIUA 3MP1A 3G3GA 4R9FA 2I0CA 3MZ9A 4BDOA 3TTRA 4P0IA 2I4CA 2XXRA 3C31A 4RYAA 1MQIA 2Z22A 3H06B 1LFGA 1B4HA 5JEIA 3WAFA 2OJTA 3IX1A 4MBPA 3MVWA 3G3JA 1FQAA 1TWYA 2NWJA 1JEUA 2R9JA 5DEXA 5A5XA 4IY6A 2ZYKA 4MLQA 3Q26A 3PMXA 3V5AA 1SYHA 3LBSA 3QUJA 2DVCA 3SERA 4PP0A 1MRPA 2ZMBA 3BKIB 4R6HA 4WEDA 1SVXB 5ELVA 1AH5A 3TMGA 4GD5A 4F1UA 5ISUA 3RGYA 4NF4B 1Y3PA 4N13A 3V83A 4G4PA 4GIZA 4H65A 2I4BA 4GFRA 4YKKA 5TPAB 3MPKA 1LB8A 1Q35A 1OMPA 1Q1KA 5HBCA 4QFPA 1R6ZA 4EQ9A 5DT6A 1MY2A 1OQHA 1D9YA 1J1NA 3T9HB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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