3IORA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c95
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
390
structure length
390
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding protein, huntingtin fusion protein
source organism Escherichia coli k-12, homo sapiens
molecule tags Signaling protein
total genus 122
structure length 390
sequence length 390
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iorA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iorA02
2QS4A 1SI1A 2DS9A 4YB5A 2B65A 4G68B 4I9DA 4HCWA 3LR1A 3SESA 1B51A 3U72A 3QAXA 1GV8A 1N3WA 2F8DA 3PMVA 5AA3A 2Z22A 1P1NA 3Q25A 4I1DA 4YMAA 2YPNA 4QRZA 3FXRA 5JTYA 2V84A 2Y7IA 2H5YA 3FJMA 4KR5A 5I84A 4KYDA 1ZU0A 1EH3A 4GFRA 2Q89A 1B3GA 1EU8A 3PUXE 2DWJA 3LUYA 1MXZA 3FD3A 2QL3A 1LCTA 3N6UA 2Y7PA 4ELQA 5IAIA 2GHBA 1GR2A 4JWXA 2UYEA 3FVNA 1LB8A 2RINA 5H8NA 2RCBA 1WODA 3FVKA 3SEWA 2KLFA 5HM4B 1D9YA 2G29A 4OMBA 3B7DA 4THIA 4OZ9A 4R9FA 3FGSA 2I48A 3S9LC 2NVUB 4L17A 1Y3QA 3LSFB 4JB7A 4ZDMA 3U8QA 3UGWA 2QSXA 4XKNA 4BDLA 2Z23A 4DIGA 5HBCA 1DPEA 4NEDA 2DVCA 2O6AA 1XC1A 5FHOA 3K6WA 2OZZA 3RT8A 2Q2CA 5CMKA 4XKPA 2XXUA 4WEPA 4DXUA 1OVBA 3H6TA 1N3XA 3H6VA 5A5XB 3PPPA 1IXGA 4I62A 2ZYMA 2F7CA 3M3KA 2F7BA 1DPPA 2F34A 1Q1KA 4OYVA 3T93B 2FYIA 1SYHA 2DWHA 2Y84A 2XXQA 1B6HA 1PB8A 3QIMA 1B52A 3WAEA 1HSEA 3HCQA 4BDMA 4F3GA 4ZEKA 3A3UA 2HEUA 2ABHA 5JK4A 1LFHA 1AH5A 2D21A 4GIZA 2NUVA 3KOSA 1S50A 4OFJA 5I57A 4U2RA 5I57B 4LVQA 1A54A 1SD3A 1B7UA 4U4XA 4R6HA 5I58A 3IJXB 3UK4A 1Y3PA 3C9HA 5I58B 4ELPA 3FV2A 4AQ4A 3CI8A 1AOVA 1LFGA 2XXPA 4H6DA 4H67A 4P0IA 1UTBB 2VGQA 3VDFA 3CR9A 3HO7A 2CMOA 4RY1A 2I0CA 1JEVA 4JWYA 1M5DA 1HSLA 1RKMA 4E0XA 3LC8A 3ILTB 1M5EA 1TT1A 3O28A 2ESNA 4R75A 2ANJA 4H5GA 3CIJA 4R9GA 1FQAA 3OEMA 5HPQA 4O3AA 1B3HA 5KCJA 2LAOA 2XX7A 4H1XA 1AL3A 3M8UA 2OJTA 4C1UA 4IY5A 3IR1A 4BDOA 3QUJA 3OD7A 2NWJA 1UIUA 3TCHA 3H03A 3GLBA 3TTMA 3RN8A 1VFEA 1ZMGA 1IQ7A 4ZEFA 4YMBA 1L5TA 2ALUA 2I49A 1PBQA 1ELJA 4FAJA 1MXWA 3U92A 3C34A 3IO4A 1MDP1 1SBPA 1B3FA 5ISUA 4GXSB 4YB7A 5CI5A 3UIFA 4PFUA 4XKRA 1YTVA 4IGRA 4PP0A 3PUZE 4GL0A 3V5AA 3GXAA 3IL1B 4Q30B 4GQOA 4P11A 2OBGA 1WVJA 2DE2A 5B70A 4QFOA 1ZTYA 3K4UA 4MH5A 1PB7A 3PD8A 1R6ZA 4LA9A 5H8QA 5H8QB 4KHZE 1H43A 1KWHA 1B7ZA 4QSEA 3EQ1A 4TLLB 3KFMA 4GVOA 1JQFA 3T22A 1MY0A 3S9MC 4FEBA 3OXNA 2REJA 4H0WA 1MXVA 3C36A 3PGFA 4OTEA 2V3TA 1LFIA 2UVGA 3HV1A 1BIYA 2E0SA 4FECA 1XS5A 3IOWA 1NH8A 1MPCA 5B7DA 4G77A 2QMWA 4KYSA 2HCAA 2RC8A 3EHTA 3C35A 3MVZA 1PB9A 1TFDA 2PX1A 3R6UA 4OVJA 1VR5A 2NOOA 4KQPA 4OETA 4G68C 3DP4A 1XT8A 3PMXA 1B5HA 1DMBA 3KN3A 2IA4A 3QUFA 4YKPA 3UP9A 3LSLA 1H44A 3K6VA 3HSTA 3IJOB 4QF9A 1IIWA 1MDQA 3MAMA 4BDRA 1Y9UA 1NNKA 1OQHA 4ESXA 3FATA 1MQJA 3FXQA 4IO4A 1M5BA 4BDNA 4U21A 4NWDA 1MRPA 3KOTA 2DQVA 1VE4A 3T9XB 1B2HA 3TQWA 4I8CA 5I56A 5I56B 1NH7A 2Z8DA 4EQBA 4EUOA 2HQ0A 4GLIA 1SW5A 5AE4A 3ONMA 1B58A 1A55A 3R26A 1MQDA 2ZNSA 4EDPA 3HN0A 4LQ2A 3C31A 2H98A 1IXIA 4H65A 4XXUA 3U94A 3E4RA 3E9XA 4RXLA 3TELA 1SW4A 2ONSA 1QJMA 5K2XA 3RLFE 2HZLA 1VSOA 4LQ5A 4RPNA 4TOZA 4F39A 3V8XB 3OO7A 1Z7ME 2RF1A 4HTGA 2P2AA 5L8DA 2I4BA 3FZVA 4F1YA 3RTFB 3E13X 3IORA 1ZLQA 1IEJA 2QS2A 3OO9A 4MLQA 1B9JA 1I6AA 1Y4CA 1ZKBA 4N13A 4M4GA 5DVJA 4IO3A 2XXRA 2E1SA 3N94A 4ELRA 3MQ9A 2Y7RA 4DE8A 3TQLA 4R73A 2THIA 4G8NA 3HHFA 2XXYA 2O1LA 5I59A 5I59B 2F7AA 3VVEA 4IY6A 1B4HA 4UACA 4F3BA 2DYXA 1MG1A 4WEDA 3H7MA 2O68A 1D4NA 3KJTA 3IB1A 5CMMA 1ZJLA 3ECRA 1TXFA 2I0BA 4U4SA 5JTYB 4R2BA 2FNCA 3P7IA 4X1DA 1DTZA 3UN6A 5CBRA 5EHSA 1CB6A 1NKXA 3PD9A 2HAUA 1MQHA 3SEUA 2V3UA 1LCFA 3OEKA 1NNFA 2W7YA 3MPLA 1POY1 4IB2A 5H8NB 1MH4A 2OWSA 2DP8A 5FTHA 4GL8A 3A09A 3THIA 1DTGA 3CSGA 2P0SA 1EZOA 4YU0A 1MY4A 3H6WA 3FASA 1XHYA 3G3FA 1N7XA 4FJPA 2XXIA 4OERA 4DCXA 2DE3A 3B6QA 5DEXA 5DEXB 3OO6A 1A40A 3ZS6A 2YLNA 4POWA 5EHMA 1B5JA 2R71A 4O3CA 2H99A 4ELOA 3O6HA 4Q8RA 2O7UA 5ITOA 4RA1A 3QSLA 2R6GE 1II5A 3C32A 4O3BA 3H6UA 2H4IA 1LB9A 5BUUA 4IO2A 1NMUA 2UVHA 1QULA 3LSWA 5IKBA 2UYFA 3PMWA 4EXKA 2PT2A 1LBBA 3PPRA 1A8EA 5I2NA 5I2NB 2XX8A 3U93A 3PPOA 2WKYA 3K1PA 4IO6A 2F6GA 3MZ9A 2G93A 4ZEIA 1D3KA 2F35A 2QPQA 1MY1A 1B5IA 3DLNA 3OMBA 1JEUA 4G8MA 2V3QA 4RK9A 1MS7A 3S9NC 1NNTA 2QRYA 3H3GA 3K1NA 3EHUA 3G3JA 4C1TA 4ZZAA 2Q2AA 2H9BA 3CFXA 1URDA 4BDQA 4JDFA 4NE4A 5JEIA 1I69A 5KCJB 1QUKA 2RKMA 4ZE9A 1WDNA 1IUDA 2ZNTA 3V89B 1N76A 3VE1B 2XXTA 3O6GA 3E3KA 3FVGA 3LSXA 1BP5A 4HCYA 1LAFE 1OLCA 2XXHA 3PUWE 3ZSFA 2Z8EA 1RYOA 3MP1A 3ZKLA 3G3KA 3QXMA 2D3IA 3AXFA 1PBPA 3GBAA 2OK2A 4GF8A 1OLAA 3H06B 1H45A 3IB2A 4IGTA 3RGYA 3VVDA 4AB6A 4YKJA 2B3BA 3BFUA 1FTKA 3TODA 4TQUQ 1MXUA 3DP6A 5CC2A 3FVOA 2PBWA 2DXRA 4EF2A 1PDAA 1B46A 4KFQA 2VHAA 4MFIA 3B6TA 1B05A 3KN7A 4PE5B 3MVYA 1CE2A 4H5FA 2IEEA 4M1VA 3TTKA 1OVTA 1EZ9A 3C4MA 5L9MA 4DXCA 1NNPA 4LONB 2YJPA 1LAGE 1MPDA 4LZ7A 1XVYA 1FW0A 3FJGA 1OQGA 3SEXA 1QKBA 4N6PA 3TYHA 3HPIA 4OWDA 2I3WA 5M2VA 1MY3A 2X26A 4NMYA 4GD5A 2F36A 1LGBC 1SYIA 3U1OA 3K0VA 3GZGA 3CG3A 3N6TA 1B4ZA 4U23A 2V93A 3BFTA 3SEVA 1D9VA 1BTJA 5TU0A 1NFTA 1JVYA 3PUYE 1MPBA 3K6UA 1I6BA 3PPNA 4FEDA 4DZ1A 5CM6A 3FUZA 3CSBA 4OHNA 2Y7WA 2XXVA 3OO8A 3PU5A 4PFTA 5FTIA 4RNSA 3VLWA 3G3HA 5DT6A 3G7WA 4R6KA 3TEPA 2OLBA 3USDA 3CRBA 4YKIA 3VFJA 1SQYA 3Q27A 4OFOA 4JSOA 3JYRA 3IOVA 2OWTA 1J1NA 2O69A 2DXYA 4NTLA 3V83A 4EXLA 2GHAA 1Y20A 5AA2A 4OESA 3RUMA 3TDJA 5AA2B 3VXCA 1N04A 3O2AA 4DLDA 2ZXTA 2XD3A 4F3PA 4ZE8A 3TKDA 4LUBA 4QFKA 4H8JA 3WAFA 4NF8A 4X1BA 1MXYA 4NF8B 1Y3NA 4GXAA 3N5LA 2QMXA 3OENA 5AA1A 3ODBA 1US4A 2H25A 3MP8A 1PEBA 4QHQA 4XKQA 2AL4A 3O66A 1YCJA 3TTNA 2GH9A 3TAJA 4GWOA 5I2KA 1LBCA 5ITPA 1TFAA 4OENA 1IITA 4FE8A 4OQOA 4C0RA 2UVJA 1O7TA 4PFYA 2DWIA 3RPWA 1SW2A 3RY3A 1URGA 4GRKA 2DWAA 2O51A 1LAHE 1GGGA 4PETA 1HSJA 4U22A 1UQWA 3MVWA 3KSJA 1JNFA 3SETA 3W15C 2F5XA 3H4ZA 1SVXB 2O1MA 4G8HA 4FIMA 1QUIA 4KCDA 3IOTA 2Q88A 4NF4A 4U1ZA 3PV0E 1B1HA 2QS3A 3R7XA 5J1DA 4OFLA 1B3LA 3LBSA 4PFWA 3K01A 3TZAA 3M3LA 1FTMA 2GRVA 3PUVE 5H8FA 3DELB 2R9JA 5K2YA 2ONRA 3D4CA 1P1OA 1B7HA 5DYHA 5H8HA 3Q26A 1BLFA 3CFZA 4G68A 3K02A 1JW5A 2ONKE 3EF7A 1YPNA 1FTOA 1FTLA 2AIXA 1GTKA 1Y1ZA 3IOUA 2O7IA 2RC7A 3MWBA 4WKMA 4LZ5A 3EHSA 4RJZA 1P1WA 1QVSA 1MH3A 4RK2A 3OELA 5AA4A 3MP6A 1R9LA 2Z8FA 1S7YA 1P1QA 5AA4B 1A7LA 2ZYNA 3K1MA 3TFLA 4K3FA 3UA8A 4QSCA 1P1UA 4TLMB 2UVIA 2HXWA 3MW0A 1PC3A 3MVXA 5FHMA 3JZJA 1QKAA 3DM0A 3S4UA 3S9EA 4Z0IA 1MM7A 1UTHA 1UTHB 4ZS9A 3MPKA 3G3IA 2HFBA 1IZ1A 3OSQA 1FTJA 4F3SA 3KG2A 4LP2B 1H3DA 1S9TA 2DE4A 1EZPA 5CMBA 2XXWA 1FQDA 1FQBA 4NWCA 4MBPA 4YICA 4F2OA 3SERA 1N7WA 4F1VA 2ZYOA 4KPTA 1GVCA 3RQTA 4IO7A 3CVGA 4AB5A 1P99A 4KYEA 1I6QA 1O64A 3TMGA 1QW0A 2RCAA 5A5XA 3O29A 3K2DA 2VOZA 1QUJA 5BWJA 1SI0A 1F9BA 2XHDA 3HHGA 3KSXA 4OEVA 3ILUB 2OCUA 1FQCA 2BJJX 4NF5A 3N26A 4NF5B 3M3FA 4JSDA 3EPEA 4R74A 1DSNA 4QSDA 1MXXA 1OIBA 2F6PA 4YZZA 1FCKA 3T66A 2PVUA 3EN3A 1XOCA 3KBRA 3Q28A 3T9UA 2X7QA 1M5FA 3O6IA 1JVXA 4KD5A 1JW1A 1UTBA 1IXHA 2GFEA 3VV5A 3VLVA 1IXCA 4F19A 2PMSA 1B3EA 1RYXA 2Q8JA 4RPOA 4LZ8A 1USYE 4QFLA 4ZZEA 4ONYA 1OMPA 2D5WA 4EF1A 4ISUA 2RC9A 2DVZA 4FORA 1ANFA 4YAHX 2NXOA 1R1NA 1A99A 1DOTA 3QK6A 3IAZA 1LLSA 4ZEDA 4PQJA 3FV1A 3A3CA 3MUQA 5ICQA 4F1UA 5KZTA 1MY2A 4ZEBA 1Z7NE 1B1XA 4R6YA 5CRYA 2I6EA 4OEUA 4F31B 4Q5TA 3I5OA 1R9QA 2QS1A 2V25A 3PPQA 3S2VA 3T9VA 3ZKKA 4EQ9A 1UIVA 3BBRA 2VD3A 1XVXA 3W9WA 1SDXA 4XTCQ 1AIVA 3O97A 2F97A 3K6XA 5ELVA 4H8IA 5EYFA 1VFDA 3IO6A 3CFLA 5F1QA 3I6VA 3K00A 4HS7A 3KEIA 2XX9A 1JW4A 4F2QA 1Y1MA 4HW8A 2XXXA 2F78A 3MZBA 2ZNUA 4DDDA 1B32A 3TTRA 2X7PA 3TPAA 4GOTA 2M8CA 4JWOA 5DTBA 2I3VA 3IX1A 4R72A 1O63A 1LSTA 2ZMBA 5KDTA 1B0LA 4Q0CA 5DVIA 1AMFA 5KDTB 1LAXA 4QFNA 1N84A 3VVFA 5AA2D 3RNNA 2B3FA 1ATGA 3MZ1A 4N07A 2AYSA 3F11A 4KI0E 4FATA 4KCCA 3MC2A 4QFPA 4ECFA 5CBSA 4LATA 4OXVA 3IB0A 3MBPA 4JBZA 4MF3A 4F22A 4UA8A 3O9PA 1N0TA 1JETA 3I3VA 3SEYA 3TCFA 4NF6A 4NF6B 1US5A 3D4GA 4DCYA 4YKKA 4G4PA 3UORA 2P1SA 1URSA 5L9OA 3KGCA 3W9VA 3G3GA 1FQFA 1USYH 2PT1A 2HAVA 3CG1A 2I4CA 1B0HA 4ZECA 3TTLA 3MJNA 2FA7A 2DSFA 3SKPA 2A5SA 3T96B 4WXJA 2I58A 1B40A 3FXUA 3B6WA 1NL5A 2AL5A 4Z7EA 5FHNA 2A5TA 2Q9TA 2A5TB 1BKAA 2XD2A 3GBBA 4G2ZA 1A8FA 3L6GA 1T0KA 3KJ7A 4P0GA 3JV9A 4BLAA 4MLVA 4IO5A 1ZIUA 3DP8A 5CMCA 2HZKA 2QJEA 4POXA 5DVFA 3QYTA 1MQIA 1MQGA 2PYYA 4YB6A 1Y4TA 4XIGQ 2CZLA 4ND9A 3VXBA 2ZYKA 1M5CA 5I2KB 3SDFA 3OSRA 5ICTA 3RT6B 3KZGA 3C33A 4X48A 2DOJA 3IK6B 4X9TA 4DXBA 3RTWB 4R2FA 4F29A 5TPAA 3BKIB 5TP9A 5TPAB 5TP9B 3TUSA 1Q35A 4ESWA 4JXIA 5F7VA 5H8SA 1YAEA 4RYAA 3T9HB 1ZBMA 4NF4B 2REGA 1SW1A 3Q29A 2Y7KA 2UXAA 3FIRA 3KN8A 4E0WA 1H76A 5H8FB 3FJ7A 3OOAA 2O84X 1FQEA 3TCGA 1TWYA 5LOMA 1MM6A 2VP1A 3L6HA 3VLUA 4U1OA 4F18A 2VD2A 4EQ7A 5H8HB 1POTA 5L9SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QS4A 1SI1A 2DS9A 4YB5A 2B65A 4G68B 4I9DA 4HCWA 3LR1A 3SESA 1B51A 4X04A 3U72A 3QAXA 1FBHA 1GV8A 1N3WA 2F8DA 3PMVA 5AA3A 2Z22A 1P1NA 3Q25A 4I1DA 5EQAA 4YMAA 2YPNA 4QRZA 3FXRA 5JTYA 2V84A 2Y7IA 4PBHA 2H5YA 3FJMA 4KR5A 5I84A 4KYDA 1ZU0A 1EH3A 4GFRA 2Q89A 1B3GA 4XFEA 1EU8A 3PUXE 2DWJA 3LUYA 1MXZA 3FD3A 1G0HA 2QL3A 1LCTA 3N6UA 1IMFA 2Y7PA 4DI3D 4ELQA 1DBZA 5IAIA 2PFZA 1KA1A 2GHBA 1GR2A 4JWXA 2UYEA 3FVNA 5IM2A 1LB8A 2RINA 5H8NA 2RCBA 1IMAA 1WODA 3FVKA 3SEWA 2KLFA 5HM4B 1D9YA 2G29A 2QVUA 4OMBA 3B7DA 4THIA 4OZ9A 4R9FA 3FGSA 2I48A 3S9LC 2NVUB 4L17A 1Y3QA 3LSFB 4JB7A 4ZDMA 3U8QA 3UGWA 2QSXA 4XKNA 4BDLA 2Z23A 4DIGA 5HBCA 1DPEA 4NEDA 2HXRA 2DVCA 2O6AA 1XC1A 5EYGA 5FHOA 3K6WA 4GX6A 2OZZA 4GWYA 3RT8A 2Q2CA 5CMKA 4XKPA 4FBPA 3T0JA 2XXUA 4WEPA 4DXUA 1OVBA 3H6TA 4O94A 1N3XA 2OWZA 3H6VA 5A5XB 3PPPA 1IXGA 4I62A 2ZYMA 1NUWA 2F7CA 3M3KA 2F7BA 1DPPA 2F34A 1Q1KA 4OYVA 3T93B 2FYIA 1SYHA 2DWHA 2Y84A 2XXQA 1B6HA 1RDZA 1PB8A 3QIMA 1B52A 3WAEA 1HSEA 4IR8A 3HCQA 4BDMA 4F3GA 4ZEKA 3A3UA 2HEUA 2ABHA 5JK4A 1LFHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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