3IORA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c95
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
390
structure length
390
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding protein, huntingtin fusion protein
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli k-12, homo sapiens
total genus 122
structure length 390
sequence length 390
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iorA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iorA02
4XKQA 2QMXA 4F1UA 4G68A 1EU8A 5I2KA 3TTRA 1N04A 1XS5A 2OJTA 4U22A 4ESXA 3CFLA 4R9GA 4GIZA 3FXRA 1GVCA 3KOTA 2DP8A 5TU0A 4FE8A 1Y9UA 5KDTB 1JW4A 3USDA 1II5A 5I58A 4IO5A 2Z8EA 3H3GA 3KZGA 1DMBA 4G68B 4ZEKA 3SEVA 5I2KB 3OSRA 3O29A 1NH8A 4N6PA 3FVKA 1USYE 1TT1A 4JWYA 5H8SA 1JVXA 3EQ1A 3MZ1A 4ESWA 2F8DA 1Y1ZA 2Y7RA 1IXIA 1B58A 4RPNA 3ECRA 3HCQA 5I59A 5I58B 1QUKA 5DVIA 3QK6A 4RY1A 2F35A 5JK4A 3K1NA 1JETA 4ZEFA 4QSDA 4F31B 1D4NA 3L6HA 4DZ1A 4K3FA 4EF1A 1POY1 1SW5A 4NF4B 2O68A 4H67A 1UTHA 1JQFA 3UGWA 1UIVA 3T9XB 3KEIA 1UIUA 3IL1B 1SYIA 5I59B 3D4CA 2ZNSA 4F2QA 2Y7PA 4UACA 3TZAA 4IY5A 3R7XA 4WKMA 2QSXA 4YB5A 5DTBA 3K6UA 4NF5A 3RPWA 3K6WA 2DXRA 4ECFA 5I56A 4L17A 1UTHB 2NVUB 1QUIA 4BDRA 1H44A 4G8MA 1B3EA 2O1MA 1RYXA 1JW5A 4PFWA 2OLBA 3OO6A 3WAFA 3SEUA 3MVZA 4GD5A 3PGFA 2V84A 3FGSA 1IXHA 4FJPA 5CMKA 3S9MC 2O7UA 3H6TA 2OZZA 5IAIA 3TTKA 4NF5B 3LSLA 3EHUA 4LZ7A 4OWDA 4R6KA 3FXQA 3QYTA 4PQJA 3ILTB 3S9LC 2ZXTA 5I56B 3AXFA 2QS1A 3VLVA 1JEUA 2F6PA 2UYEA 2UVJA 3OO8A 1N0TA 2YPNA 2IA4A 3ZKLA 3H6VA 4LP2B 3C31A 1XVYA 1Y4CA 1DSNA 3H6WA 4BDNA 4OYVA 1ANFA 3RTFB 3KG2A 1MDP1 4KCDA 2F7CA 3KSXA 4ZS9A 1ZBMA 3FV1A 2Q8JA 5L8DA 3ZSFA 4H6DA 4H8IA 4ZDMA 1WVJA 1BTJA 4P0IA 4OENA 1JEVA 1NH7A 1LBBA 3PMWA 3Q28A 5CRYA 4G8HA 3VXCA 3VLWA 2I6EA 5AA3A 4I62A 2ZYOA 1GTKA 5JEIA 2I0CA 3G7WA 4FEDA 1ZLQA 1MXYA 3O6IA 2P1SA 4NWDA 4LZ8A 2G93A 4O3CA 3G3HA 3M8UA 5EHSA 1A8EA 1FTOA 4OQOA 2QS3A 1BP5A 2A5SA 3FVOA 3U94A 4DXCA 3I5OA 4EQ9A 4Z0IA 5ITOA 1L5TA 3B6QA 5DT6A 1SW4A 5CBRA 1A55A 1VFEA 1LB9A 4GOTA 3T9HB 4RXLA 1H43A 3H06B 2I0BA 2A5TA 1NFTA 1MY1A 3RT8A 3SERA 3IORA 1MPDA 3ZS6A 4YKKA 4KPTA 3E9XA 4QSCA 3PPQA 5F7VA 3UP9A 5L9SA 1HSEA 3A3UA 4C1TA 2PVUA 5ISUA 4P0GA 4WEDA 3Q25A 2PYYA 5HBCA 1LAFE 3O97A 3KN3A 4KR5A 1H3DA 2E0SA 1SW2A 3FIRA 2RC8A 2I3VA 2Z22A 3MW0A 3O9PA 5ELVA 2A5TB 2BJJX 3TEPA 4OFJA 3K1PA 1NNTA 4AB5A 1BIYA 3BKIB 5AA2D 4EQBA 2X7QA 4U23A 4R2FA 1AOVA 2XXXA 1B5JA 3PPOA 4NTLA 3VE1B 3SETA 3T9VA 1P1WA 2I4CA 1FQBA 4HW8A 3RLFE 4HCWA 5I84A 4KFQA 1DOTA 3MP1A 3MVYA 4MLVA 3PMVA 3K6XA 5DVFA 1FQAA 3VVEA 4I9DA 2E1SA 3GLBA 1MRPA 2X7PA 3QIMA 3TQWA 2R6GE 4LATA 3N26A 3TFLA 1LB8A 3S4UA 3V8XB 1MXWA 2O1LA 1GGGA 4G4PA 4QHQA 2RC7A 4DLDA 3E3KA 3IAZA 4XTCQ 1WDNA 1B5HA 1B2HA 2RKMA 2PX1A 2DXYA 1RKMA 1VR5A 2OWSA 1URDA 1QULA 3GXAA 3FATA 4YZZA 3CSBA 2V3UA 1D3KA 3LSXA 4F2OA 4KI0E 3U92A 3S9NC 1MXXA 4OMBA 4OVJA 1R9LA 4F18A 3C36A 1ZKBA 1B7ZA 3W15C 2I3WA 4JB7A 5CMMA 3MVWA 3C4MA 2OWTA 3FJ7A 2V93A 3KJ7A 1S7YA 4F19A 3MPKA 2DSFA 3O28A 3Q27A 1O64A 4RPOA 2V3TA 4JBZA 1NKXA 3UIFA 1B05A 4EF2A 1YTVA 1MPCA 3UK4A 2XXRA 4F1YA 2THIA 5DYHA 2ZNTA 1FQDA 3DM0A 4FEBA 3WAEA 2M8CA 2OK2A 3O66A 5J1DA 1MY0A 2Z8DA 4FATA 1IQ7A 4OTEA 1A7LA 3SKPA 3EF7A 4JXIA 3FVGA 4QFNA 1B7HA 1P1NA 2XXQA 3EHTA 1OVBA 5I2NA 3KFMA 2AIXA 3PD8A 4Q8RA 3MZ9A 5TP9A 3PUVE 4FAJA 1FTJA 3V89B 1EZOA 4DCYA 2D5WA 3KGCA 3VXBA 1MQIA 4R6YA 4IGRA 3B6TA 3C34A 5FTIA 3PUZE 1N7WA 3IR1A 3O2AA 2GH9A 1S50A 3TUSA 3JYRA 3TTMA 4WXJA 2F78A 3CFXA 1MY2A 3EN3A 1OLCA 5FHMA 5I2NB 5ICQA 1VE4A 2B3BA 5TP9B 3T9UA 1LCFA 2AL4A 4BDLA 1URGA 4U2RA 4H5FA 5AA4A 3CG3A 4Q30B 3T96B 4QFOA 3SEXA 1N76A 4OXVA 3TODA 4JDFA 1Y1MA 1A99A 2O69A 1DPPA 2DE3A 2QMWA 2XD3A 1GR2A 4LQ5A 3UN6A 4EQ7A 5AA4B 1A54A 2DWJA 4LVQA 1S9TA 4FIMA 1SW1A 4IB2A 2O7IA 4AQ4A 2F6GA 2ESNA 3KJTA 5KCJA 2AYSA 1QW0A 4KYSA 1CE2A 3PUXE 3C35A 1POTA 1LCTA 2HAUA 1QJMA 5B70A 1DPEA 3OD7A 1NL5A 1TFAA 3C9HA 4OHNA 1IITA 3PU5A 4MLQA 5KCJB 1LFIA 1RYOA 1ZMGA 1B3LA 2WKYA 1B4ZA 4Q0CA 1KWHA 3RGYA 5H8FA 4H1XA 3R26A 1IEJA 2UVIA 4PETA 3PMXA 2YLNA 2NOOA 4MBPA 2I48A 3U93A 3C33A 1FQEA 2D21A 4EDPA 4QFKA 2B3FA 2P0SA 3SEYA 2Z8FA 3LSFB 3P7IA 4H0WA 1FTLA 1TXFA 3SESA 2P2AA 2GHBA 5DVJA 3PPNA 3TYHA 3VDFA 1XHYA 1ELJA 1WODA 1B3HA 3PPRA 5B7DA 4YAHX 3TELA 3OO7A 5H8FB 2O51A 1IIWA 1ATGA 3Q26A 1M5FA 5ICTA 5CM6A 2NUVA 1HSLA 1B40A 1EZPA 3MPLA 3W9WA 4YU0A 3VVDA 1ZJLA 4MFIA 5ITPA 4IGTA 2Y7KA 3MQ9A 1O7TA 2FNCA 2F36A 4EXKA 3S2VA 5CBSA 3MUQA 3L6GA 1MY3A 4YKPA 1EZ9A 1YAEA 2HZKA 4U4XA 3FUZA 5EYFA 3CVGA 1SBPA 3HHGA 3A3CA 5CC2A 3K02A 4GVOA 4R9FA 4PFTA 2G29A 2DE2A 4YKJA 5CMBA 4JWXA 2Q9TA 1N3XA 2QL3A 2D3IA 1OVTA 1LGBC 3T93B 1YPNA 3FJGA 2I4BA 4XXUA 1B5IA 3IX1A 4F3PA 5H8NA 5IKBA 4LQ2A 4JSDA 4IO3A 3FD3A 2Q89A 1TFDA 1Y3QA 2RINA 4N13A 3HN0A 3GZGA 3MP8A 4M4GA 4Z7EA 1LFGA 4BDQA 2B65A 1LFHA 2HCAA 3H03A 2XXYA 2VGQA 3OEKA 3KSJA 3U1OA 4F39A 2DVCA 4XKPA 2ZMBA 2LAOA 3G3FA 4MF3A 3TCGA 4RNSA 5H8NB 4G68C 1IZ1A 4F3GA 3PV0E 4F3SA 2QRYA 4R6HA 1MM7A 3FJMA 3IOUA 2RC9A 1PDAA 3VLUA 1B0LA 1OLAA 3OOAA 1I69A 5BWJA 4YKIA 3DP8A 2PBWA 3IJOB 3E4RA 2I49A 3RY3A 1PB9A 4KYEA 1XVXA 2R71A 3KOSA 3OMBA 2RF1A 2UVGA 2Q2CA 5JTYA 1MH3A 3D4GA 3B7DA 1R1NA 2Y7WA 3GBBA 3IK6B 3IJXB 4EXLA 4IO2A 2VOZA 1PB8A 3TPAA 2W7YA 3K1MA 4ZEDA 3QAXA 4ND9A 1QKBA 3QUJA 1LSTA 4PFUA 3IOVA 1MXVA 1LAGE 3W9VA 5JTYB 2OCUA 5CMCA 3M3FA 3IOWA 2R9JA 1B52A 3TKDA 1I6QA 3TAJA 1OQHA 3OENA 4GWOA 3IOTA 1Q35A 1EH3A 2IEEA 3ODBA 4GXSB 1AIVA 1AL3A 4GL8A 2HZLA 2RCBA 4RJZA 4QFLA 4MH5A 2QPQA 4IO4A 1QUJA 3FVNA 4XKNA 1PEBA 1SI1A 4C1UA 1FCKA 3CSGA 4HCYA 1DTZA 4OEVA 5KZTA 3K01A 1Z7ME 3RNNA 3G3GA 4G8NA 4R73A 3H4ZA 2XXWA 2H25A 3A09A 3MJNA 3DELB 5L9OA 1UQWA 4ISUA 3RTWB 3VFJA 2UYFA 1B1HA 4BDMA 4POWA 2FYIA 1SD3A 4GXAA 4Q5TA 4I1DA 4U21A 4YICA 2XX8A 2F5XA 4ELOA 1ZTYA 1Y3PA 4F29A 1PBQA 4PP0A 4POXA 3LBSA 2GHAA 4DXUA 2O84X 4NF6A 3M3LA 1ZU0A 3FXUA 3RN8A 3QSLA 3N5LA 1OQGA 2DQVA 4ZZAA 3N94A 2ZYMA 4QFPA 3UA8A 3OSQA 4ELPA 2H98A 1P99A 1Q1KA 3K2DA 1US5A 3SEWA 4XKRA 2ONSA 4X1BA 1MQHA 4U1OA 4NF6B 1N84A 2PMSA 1BLFA 4XIGQ 4KQPA 2GFEA 2DWHA 2AL5A 2VP1A 1Y3NA 1B3GA 2Q2AA 3PUYE 1QKAA 1FTMA 1M5CA 5TPAA 2PT2A 4LA9A 4DDDA 3MBPA 2VD3A 2X26A 2VD2A 4X9TA 2XXUA 1LLSA 4GFRA 3T22A 2PT1A 1MDQA 1OMPA 2XXVA 1MM6A 5H8HA 4TLLB 4M1VA 3LSWA 4ZEIA 2ZYNA 3OELA 1MH4A 1BKAA 1NNFA 4YB6A 2H4IA 4OERA 4X1DA 2UVHA 4ZEBA 3VV5A 4IO7A 3FASA 3G3JA 5TPAB 3KN7A 5F1QA 1P1QA 1B3FA 2ALUA 2QJEA 1P1UA 1MXUA 5I57A 4NF4A 1IXCA 5H8HB 5EHMA 1N7XA 3CFZA 1M5BA 4TLMB 3RUMA 1TWYA 3VVFA 4O3AA 1PBPA 1MQGA 3H7MA 3IO6A 2ONKE 1NMUA 5FTHA 1A40A 3U8QA 1B0HA 1MY4A 5K2YA 3DP4A 1P1OA 1VSOA 4E0XA 1I6AA 1LBCA 5I57B 3IB2A 5AE4A 3JV9A 3BFTA 3Q29A 2F97A 5LOMA 1IUDA 1B51A 3LUYA 2XD2A 4OFOA 2DWAA 1SQYA 3LC8A 4F3BA 3M3KA 1JVYA 2DYXA 4BLAA 1US4A 4RA1A 1J1NA 4FORA 3I3VA 1CB6A 4P11A 4ZE9A 1B32A 1AH5A 4OETA 1B6HA 4C0RA 3BFUA 4ZZEA 4H5GA 2HEUA 1Z7NE 4DCXA 3MP6A 3RQTA 1JW1A 4ELQA 1URSA 4ONYA 1O63A 4TOZA 4AB6A 3SDFA 2ABHA 5H8QA 1SYHA 3B6WA 3CIJA 3GBAA 1MG1A 4I8CA 4X48A 2FA7A 5L9MA 4ZECA 2XX9A 3OEMA 4GQOA 2O6AA 3HPIA 4FECA 1MPBA 2REJA 3IB1A 3V83A 2H99A 1QVSA 4NEDA 4KCCA 4NF8A 2XXIA 3THIA 3MAMA 2YJPA 3V5AA 2DOJA 2V3QA 3CI8A 4LONB 4RYAA 2DS9A 3CG1A 4OZ9A 3DLNA 3TTNA 2KLFA 5H8QB 2HXWA 4F1VA 1PC3A 3FV2A 1MS7A 4QRZA 2F34A 4U4SA 3K0VA 3O6HA 2Q88A 4PE5B 4NF8B 4HTGA 1R6ZA 2V25A 4THIA 3TMGA 3TTLA 3C32A 3F11A 3QXMA 3CR9A 3EPEA 4O3BA 3U72A 1IXGA 3MWBA 5HM4B 3H6UA 1USYH 3QUFA 3MZBA 4DE8A 3O6GA 1AMFA 4F22A 1YCJA 5DEXA 3ILUB 3HSTA 2ZNUA 3ONMA 4R2BA 2QS2A 3T66A 1NNPA 4DXBA 3HO7A 1B46A 1LAHE 3EHSA 3K00A 2HAVA 1R9QA 1DTGA 1I6BA 3IB0A 1F9BA 1OIBA 4H8JA 1MXZA 3MC2A 2XXHA 4YMBA 5DEXB 1UTBA 3N6UA 4R75A 5CI5A 4E0WA 4OEUA 1NNKA 3I6VA 2XXPA 2ONRA 3HHFA 1D9YA 2GRVA 2ZYKA 5FHNA 3TCHA 1UTBB 1SI0A 2NWJA 3BBRA 4OESA 4LUBA 2XX7A 4ZE8A 3OO9A 1B7UA 4BDOA 5AA1A 4QSEA 3MVXA 1VFDA 4EUOA 5HPQA 2ANJA 2DE4A 4JSOA 1D9VA 2OBGA 2XHDA 4IO6A 1SVXB 1XC1A 2Y84A 4PFYA 1XT8A 4JWOA 3K6VA 1B4HA 1SDXA 4N07A 4GRKA 3HV1A 4KHZE 4IY6A 2VHAA 4GF8A 3G3IA 2REGA 2H9BA 5FHOA 3KN8A 3S9EA 4LZ5A 1Y20A 2QS4A 3IO4A 1GV8A 4OFLA 1B1XA 3KBRA 1MQDA 4YMAA 3N6TA 3K4UA 3PPPA 4YB7A 4TQUQ 4G2ZA 3G3KA 1M5EA 3PD9A 3TDJA 4KD5A 2F7BA 3R6UA 3JZJA 2RCAA 5M2VA 5AA2A 2I58A 2H5YA 4DIGA 1LAXA 4R74A 3TCFA 1H45A 2F7AA 4GLIA 1FTKA 1FW0A 1H76A 5A5XA 4GL0A 2UXAA 3UORA 1XOCA 4HS7A 5K2XA 3DP6A 4KYDA 4QF9A 4U1ZA 3FZVA 4NWCA 1Y4TA 2Z23A 2NXOA 1FQCA 4H65A 5AA2B 2HFBA 3RT6B 1T0KA 1A8FA 3LR1A 4NMYA 3PUWE 3ZKKA 3E13X 1M5DA 1JNFA 2HQ0A 5A5XB 2XXTA 4RK2A 1PB7A 5BUUA 2CMOA 4R72A 3CRBA 4ELRA 4NE4A 1FQFA 1HSJA 3OXNA 2Y7IA 4WEPA 4RK9A 1MQJA 2DVZA 1ZIUA 1B9JA 3TQLA 2DWIA 4UA8A 1N3WA 2CZLA 5KDTA 4G77A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHMA 4XKQA 2QMXA 4F1UA 4G68A 1EU8A 5I2KA 3TTRA 1N04A 1XS5A 2OJTA 5A5LA 4U22A 2GQ1A 4ESXA 3CFLA 4R9GA 4GIZA 3FXRA 4P9KA 1GVCA 4AS4A 3KOTA 2DP8A 5TU0A 4O7IA 4FE8A 3LUZA 1Y9UA 5F24A 2QFLA 5KDTB 3MYUA 1JW4A 3USDA 1II5A 5I58A 4AS5A 4IO5A 2Z8EA 3H3GA 3KZGA 4H45A 1DMBA 4G68B 4ZEKA 3SEVA 5I2KB 3OSRA 1NUZA 4PDHA 3O29A 1NH8A 4N6PA 3FVKA 1USYE 4JVIA 1TT1A 4JWYA 5H8SA 1JVXA 3B50A 4N81A 3EQ1A 3MZ1A 4GX6A 4ESWA 2F8DA 1Y1ZA 2Y7RA 1IXIA 1B58A 4RPNA 4DI3D 4GBVA 3ECRA 3HCQA 5I59A 5I58B 1QUKA 5DVIA 3QK6A 4RY1A 2F35A 5JK4A 3K1NA 1JETA 4OVRA 4ZEFA 4QSDA 4F31B 1SPIA 1D4NA 3L6HA 4DZ1A 4K3FA 4EF1A 1POY1 1SW5A 4NF4B 1NV2A 2O68A 4H67A 1UTHA 1JQFA 3UGWA 1UIVA 3T9XB 3KEIA 1UIUA 3IL1B 1EYKA 1SYIA 5I59B 3D4CA 2ZNSA 4F2QA 2Y7PA 4UACA 3TZAA 4I3YA 4IY5A 3R7XA 4WKMA 2QSXA 4YB5A 2PFZA 5DTBA 3K6UA 4NF5A 3RPWA 3K6WA 2DXRA 4ECFA 5I56A 4L17A 1UTHB 2NVUB 1QUIA 2XWKA 4BDRA 1H44A 4G8MA 1B3EA 2O1MA 1RYXA 4P1LA 1JW5A 4PFWA 2OLBA 3OO6A 3WAFA 3SEUA 3MVZA 4GD5A 3PGFA 4PC9A 2V84A 2HPGA 2VT5A 3FGSA 1IXHA 4FJPA 5CMKA 3S9MC 2O7UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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