3IOSA

Structure of mtb dsbf in its mixed oxidized and reduced forms
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
TVPAQLQFSAKTLDGHDFHGESLLGKPAVLWFWAPWCPTCQGEAPVVGQVAASHPEVTFVGVAGLDQVPAMQEFVNKYPVKTFTQLADTDGSVWANFGVTQQPAYAFVDPHGNVDVVRGRMSQDELTRRVTALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An extracellular disulfide bond forming protein (DsbF) from Mycobacterium tuberculosis: structural, biochemical, and gene expression analysis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Disulfide bond forming protein (DsbF)
total genus 40
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3iosA00
3HZ4A 1O7UA 2H6ZA 2LRTA 2YV7A 3GSTA 5AIXA 4PX1A 4F2IA 2QKEA 3ZZXA 2GT6A 1B9XC 1J9BA 2P5RA 5GZZB 4XCSA 1USBA 4O92A 3FZ9A 4I5QA 4MPFA 2P5QA 2YZHA 4HU9A 4K0GA 3LG6A 5CYYA 2PMTA 4HEA2 2FWEA 5ECQB 1F37A 2YNXA 2MMNA 2C0FA 4GXZA 3W8SA 17GSA 2PWJA 5DALB 1OC3A 3HJPA 1OYJA 3WT2A 2RLIA 1XOAA 2DJ1A 3CSHA 5ECSA 5IO0A 3F4SA 4OFTA 4G10A 1FAAA 2XPEA 4O32A 1YY7A 4N30A 16GSA 3KTLA 2GTUA 2K8SA 2E2GA 5IMVA 4MZBA 2VM1A 3Q19A 2CT6A 1JZWA 1PQNA 2H66A 3MNGA 2IN3A 1X5DA 1HNBA 5AN1A 2VUPA 2C3TA 3F4TA 1GUMA 4JBBA 4V2NA 5G2ZA 1V9WA 2H73A 3DMLA 2L5LA 3GSSA 4PNFA 4BWSA 1OC9A 4NHWA 3GX8A 1EGOA 2GZYA 3WGXA 3IK7A 4EF0A 1G6WA 2GSSA 2B7JA 5CAXA 3DIEA 2MZCA 2VO4A 4D73B 1O81A 1TK8B 3GKMA 1J0FA 3GH9A 2VCWA 1Q4JA 3ZITA 2WB9A 3A3TA 1NM3A 4EL1A 3L4NA 3VPTA 1MD3A 1SK2A 1G6YA 2I1UA 3BBYA 3FRCA 3NIVA 4N0ZA 1G7OA 3GL5A 3IE3A 2CA8A 3IBHA 2I4AA 4OFMA 1WJKA 3L78A 2V1MA 3KMOA 4DSSA 2KOKA 4ILFA 4ISDA 3RAZA 1R5AA 1YEPA 5A4WA 3EC3A 4J57E 2L59A 4FYCA 5ECNB 3WYWA 1PMTA 2KP1A 3GHAA 5DVBA 2WDUA 4Q5FA 1BG5A 1V58A 5IMCA 1VF2A 4NMUA 1Z5YE 2VAFA 3HKRA 1A0RP 2YJHA 1SD9A 5G30A 8GSSA 3KGKA 3F9UA 3H4KA 4PQ1A 3QMXA 1TJDA 3EU4A 2V32A 3D22A 1PX7A 3C71A 3MWHA 1K3OA 1H4OA 4HZ2A 2J23A 3UOMA 2AAWA 1WRYA 2LNSA 2M72A 3C1RA 2VL3A 3W6GA 2C0DA 2N5AA 2LS5A 1XVWA 3ZFLA 3ERGA 4OWYA 5G1KA 1A8YA 4BL7A 2O87A 1DSBA 3ZVJD 1JZOA 4IBPA 3LXTA 2VLUA 2A2RA 5JCUA 1EOHA 1GSSA 1GULA 1F9MA 1KNGA 4POBA 2H76A 3FYGA 5IIZA 3C7MA 2YPMA 1TI3A 2JZTA 2HZFA 4ZXGA 3QPMA 4AJ6A 1V2AA 1O8XA 5B8AA 4K2DA 4QL7A 13GSA 2MYGA 2GS3A 5D96A 3VWXA 2A2SA 1YZXA 2O8VB 1MDJA 1ZCPA 1K0CA 1Z9HA 2LNTA 1XBSA 1NHOA 2PU9C 3EVIA 2VCXA 2E7PA 4H86A 2F3MA 4KDXA 1SU9A 2X64A 4K8MA 3LQ7A 4IQ1A 4IP1A 1X0RA 4EXJA 3A5WA 3D0ZA 5GAPD 2H6YA 2JSYA 2C4JA 3I43A 3AY8A 3VWUA 3GA4A 6GSTA 1U6TA 2H75A 3PGTA 1M2AA 1UN2A 4TXOA 2H1BA 1T1VA 2GQLA 2VL2C 3QFBC 3BD2A 3ERWA 1ML6A 4RI6A 2MMOA 3CSIA 4F82A 2P0GA 2HT9A 4YH2A 2H1DA 2WZ9A 4N10A 2CAQA 1BYEA 1AQWA 4WETA 5HR2A 1XWCA 3DVXA 1HYUA 3I9V2 3MAKA 4ECBA 2FCHA 2PGTA 3KH7A 1NSWA 5D9TA 2KUCA 4CHSA 3ZMLA 3H93A 3EWLA 1NHYA 2A4VA 3UEMA 1E2YA 1XWKA 3LEFA 4WXTA 3TKRA 3WGEA 1JLWA 4E8EA 1OKTA 3FEUA 2GT5A 2AJQB 3HVVA 1IYHA 4MPGA 1MEKA 1WE0A 1S3CA 5ID2B 4GTUA 5AISA 3D5JA 3TKSA 1FHEA 2K8VA 4JEDA 1SKRB 4ZL7A 1IYIA 1M0UA 5ECMB 2GSRA 3FZ5A 2CAIA 3D4MA 4RQXA 4TR1B 1HNAA 2PUKC 1GTUA 1XFLA 4LLRA 5D9VA 2B3SA 3HXSA 1DE1A 3G9BA 4MK3A 4HUAA 3GKKA 5J5NA 4XS6A 2VCQA 4GWRA 3FW2A 2R37A 1SKWB 2I3YA 2CX3A 2GVPA 2HI7A 3GFKA 3ERFA 3PINA 2V6KA 2HSYA 4POKA 3KIJA 1T00A 1YF0A 1YF1A 4V1Ap 3CMIA 5HFKA 1XWBA 4BA7A 4HQSA 1HNCA 1PKZA 2PVQA 3G7IA 3GH6A 2LRCA 3F8UA 3KCMA 4JR4A 4KUNA 4MF7A 4KSMA 2L5OA 1QFNA 4GSTA 4OFNA 1HD2A 5DALA 1EEJA 3TCOA 2H74A 5LD0A 4ZBDA 1S3AA 5EPFA 1TXXA 3MDKA 4ZB6A 2YOIA 1R26A 3VI5A 4HOJA 3QR6A 5D73A 5F07A 5EVOA 4IJ3A 2LRNA 2YWOA 3IR4A 1Z6MA 2H0GA 4EKZA 4CDOA 2VM2A 3E3EA 4AF2A 4FYBA 2AV4A 2M46A 2YN1A 1VRSD 2C3QA 4ZL9A 4Q5QA 3US3A 5HR0A 3KTBA 2IMEA 5INYA 2TIRA 4EDZA 4MZCA 2H30A 4L0UA 4OMVA 5F06A 4WF4A 2YP6A 2R6KA 3IK9A 3CTGA 2K6VA 2RM5A 3UL3A 1FG4A 1QMVA 4ULXA 3HD5A 4HI7A 2ON5A 4K6XA 5ELAA 4D73A 3LORA 5H5SA 5F0GA 1AAZA 1GSYA 1OE7A 3M9KA 4HU7A 2YJ7A 2WS2A 3OR5A 4ZB9A 3VPQA 3M1GA 5E59A 4PURA 1WOUA 2NTOA 3TJBA 1TI1A 3FZ4A 1G7EA 5H5QA 1T7PB 1GLPA 3QDNA 4NXIA 2C8UA 4IW9A 4POMA 3BCKA 1B4QA 2B7KA 1PN9A 5B6MA 2HLSA 4HS1A 1K0AA 3IOSA 1SENA 4NV2A 2AHEA 1EV9A 5KEJA 3QAVA 2LEGA 1M9AA 3WD6A 3G7YA 4TR0A 2H0HA 4MDCA 1M99A 3L0HA 3GRXA 1PL1A 2LJRA 4O7HA 4ZIJA 1H75A 1U3IA 4PUFC 3ZFBA 1YKAA 4DVCA 3TRPA 4WF5A 5ECRB 2I81A 1QQ2A 2FWFA 2X8HA 2OE1A 7GSSA 3H79A 4IP6A 3L9SA 2KLXA 4KB3A 1GSDA 2AYTA 3APSA 5E4WA 1AQXA 1SJIA 1Z7PA 1SK0A 2HFDA 2DJ3A 3TDGA 3JCML 4MA9A 4K0NA 1ERVA 3F6DA 2G0FA 1XW6A 3GNJA 3HJMA 3QAGA 3UARA 1Z7RA 5ABRA 4X0XA 3FY7A 4GF0A 2VLTA 1A2MA 2R3XA 1FOVA 5COHA 1GSUA 3CBUA 4K9ZA 4TXVA 4K7IA 6GSVA 1OKDA 4KGIA 4F03A 2NDOA 5JCWA 2H71A 3N9JA 3ZTLA 4GQCA 1GSEA 3F0IA 4NV5A 1K0NA 1URMA 3IAS2 3KP9A 3M9JA 2LV3A 2VOCA 1T4ZA 2YWNA 3EE2A 5D9XA 2C3NA 5A4VA 4V2MA 3HVSA 4XS4B 1OC8A 5HFIA 5EY6A 5ELGA 1YEXA 1TK5B 1LJRA 2DBCA 4IKHA 2L6DA 2EIOA 1FB0A 1K3YA 6GSWA 4Q5RA 4QQ7A 4FYUA 2JL4A 1FO5A 1E6BA 4X43A 1X5CA 4K7NA 3V1WA 3ZIJA 3LWAA 2FA4A 2YV9A 1T4YA 1GTAA 4MF5A 1V40A 5KN3A 1R4WA 3TJKA 3GX0A 1A0FA 2K18A 3KEBA 4TVEA 5DCGA 2XC2A 3LJRA 5CRGA 1MTCA 3O76A 4HZ4A 1X9SB 4WBJA 1PGTA 9GSSA 2IJYA 1X9MB 5CRWA 2LJAA 2HZEB 4MJAA 5CREA 3RHBA 2IL3A 1B8XA 5DJMA 2JADA 2RUFA 1OAZA 2GSQA 1ZYQB 4TW5A 6GSXA 4FIWA 4DSQA 4RUVA 5CNWA 1AXDA 3UMAA 2XBIA 3DKSA 4GCIA 2TRCP 3IXRA 3K8NA 1SYRA 2ZUPA 1OC9B 4NHZA 4I2UA 5EL8A 1S3DA 1EV4A 3TRQA 4GSSA 4ECJA 3BCIA 1SK1A 2CQ9A 1AC1A 3F63A 1WIKA 1Y25A 2IWTA 3KP8A 2YANA 4KCEA 5IMAA 4MMMA 1XXUA 3A2XA 2WCIA 1ZYEA 1R7HA 2KP2A 1XVQA 4E8HA 3RBTA 5J4UA 3ZRDA 2V2GA 4EE0A 5D8IA 2C80A 2Z9SA 1T8EB 2OJLA 3ME8A 5ID2A 2GGTA 5LNKe 3D4TA 4N0VA 2R4VA 2FGXA 1TDIA 2LTKA 1YQ1A 2F8FA 4ZB8A 4DSSB 3QOUA 3CSJA 1GUHA 2O7KA 3L9UA 1O8WA 2X8CA 3IDVA 3HCZA 1XWGA 1A8LA 4HJ2A 5HR3A 1A23A 2G2QA 2AUVA 3DYRA 1ZZYA 3HZ8A 3LFLA 3W8JA 4XHMA 1ST9A 4TR4A 1DE2A 2VLVA 4MCUA 1T3BA 2LSTA 3ME7A 2OBIA 2B5YA 1DUGA 5FWGA 3UBLA 3GMFA 2GQKA 1O73A 3GKNA 3GTUA 2WFCA 3KZQA 1I5GA 3EURA 3APQA 4KE3A 2NPBA 4ZILA 3C8EA 5G1LA 5JWOB 5B8BA 3GUSA 3TGZA 2DSAA 2H6XA 2DMMA 4WR5A 3ZVJA 1PD21 3UIWA 1N2AA 1EZKA 1TOFA 1GLQA 1XW9A 5DAKB 2BTOT 4IGJA 11GSA 2B1KA 3TKQA 2IFQA 2V41A 3UJ1A 3DVWA 5DQSA 3DRNA 5G31A 1O85A 4OCEA 5IQYA 4Z7XA 3Q18A 4HJMA 2WJUA 3NOFA 5ECOB 2ZCTA 4K7OA 3ZL5A 2H72A 5GAND 2H0IA 3RHCA 1Y6EA 4MJEA 4L5LA 2VD0A 1BEDA 1WP0A 2IMIA 1F6MC 2RUEA 2WULA 2ES7A 4OD7A 4KSOA 4EDYA 4I2TA 1F3AA 4OO5A 2B5EA 1HQOA 2IPAA 2RIIA 4NWYA 3RPPA 1UC7A 4XS1A 4P3YB 1GP1A 1EGRA 2VCTA 3H8QA 2F8AA 3FR9A 5KN1A 2L4CA 1XPVA 1OE8A 4KDYA 2JSZA 3CTFA 1GL8A 1EEMA 2CX4A 1ERUA 2FLSA 5CRHA 5HFGA 1K3LA 3F3QA 2VD1A 1AQVA 3E9JB 2MMAA 1KTEA 1FVKA 1GRXA 1THOA 2YWIA 3VLNA 3CYNA 2GZZA 3LXZA 1LU4A 1ABAA 2DJ0A 3QCPA 1BJXA 1GSFA 5CO3A 4Q5NA 5ECKB 4DSRA 2JU5A 5CRDA 4G9HA 5B7CA 4LMVA 4PGTA 5KN0A 2K9FA 2EC4A 2OE3A 2OBKA 4K1FA 5A4UA 5GSTA 2GZPA 3FZAA 1GNEA 1A24A 4YAVA 5IOXA 5IO2A 3TKPA 1QK8A 3TB2A 3TJJA 3H1NA 2DLXA 4L0WA 1RW1A 4WKWA 3KMNA 3ISOA 5B6NA 5ECHB 4MJCA 1ILOA 4MJBA 2ZNMA 4AJ8A 3NZNA 5H5RA 1TRUA 1TW9A 1ZL9A 5AGYA 5C00A 1YJ6A 1V98A 2REMA 1Z3EA 2YZUA 4JRRA 2FY6A 1WPIA 1EWXA 2IMKA 2OA7A 2XPDA 3UBKA 1XWAA 3WT1A 5G5EA 1AW9A 5DBQA 3FR6A 4CW9A 1TU7A 1ERWA 4YAPA 2FNOA 4ZBBA 5G5FA 3M3MA 1K0DA 4NPBA 1G0TA 4WBRD 4RQRA 2QSIA 1F3BA 3VWVA 4XRAA 3IV4A 1RQMA 4I97A 2L6CA 1SD8A 1TRSA 2LKUA 1JLVA 1O6JA 6GSSA 1AIUA 2IMDA 4KAEA 3WGDA 3CRTA 2ALBA 3GN3A 2DIYA 4EUYA 3BOAA 1N8JA 5ECPB 4PQIA 3RDWA 2HSHA 2WGRA 1U88A 2DJJA 3C73A 4TN8A 2DJKA 5D9WA 2CVDA 3C1SA 4RI7A 3VURA 2RM6A 2GQMA 4TKYA 3BJ5A 3F4RA 3PR8A 18GSA 5IMFA 2WRTA 2XHFA 2FD3A 4LL1B 5IPHA 4I8BA 1CQHA 1DBYA 3VFIA 4ML1A 3IC4A 3IHQA 2FWHA 3LYKA 3A2VA 3P8WA 4GQFA 1JZDA 1XCCA 3CRUA 4MH3A 4XIHA 2OADA 3GL3A 2CZ3A 2MMZA 4F0CA 2HZEA 3QD9A 2QC7A 2CVBA 3TKSC 1GTBA 4ECIA 1M9BA 1B4PA 2P31A 1M2DA 2VL2A 4MH2A 1UVZA 2F51A 5ECIB 4BWQA 3DEXA 3KXOA 3Q6OA 4J2FA 2YCDA 4KDUA 3TUEA 1W89A 5DCHA 1BX9A 1FW1A 2DJ2A 1QUWA 2FA8A 2B6MA 2N5BA 1NW2A 1BQ7A 2VIMA 5JWRB 1V57A 1JZRA 3DXBA 3DD3A 2PVOC 1JHBA 5DJLA 2H1AA 4BVXA 4YQMA 3TJGA 4JE1A 5HQPA 4MP4A 2KHPA 2GLRA 4IQAA 5L71A 3I69A 3DGQA 4ZL8A 2TRXA 1ZOFA 19GSA 4LMWA 3P90A 1I9DA 3KJYA 2LQQA 2LUSA 2J9HA 4FH8A 3ZYWA 2MBTA 2GSTA 3DWVA 5ENUA 2DC5A 5J41A 1PL2A 3GURA 4IELA 1ON4A 4JR6A 4KA0A 3HHVA 4L8EA 1VGLA 3EMPA 3FHKA 2C0GA 4EO3A 4N11A 5IOWA 4L5OA 2FUG2 3ZREA 5IMZA 2L4QA 1X9WB 1WWJA 1GNWA 2PN8A 5J9BA 3O6TA 3HVXA 1K0OA 3TKSE 1LBKA 3F3RA 2GDRA 5JWQB 1BAYA 5KN2A 2DMLA 4ECCA 4YQVA 1C72A 2EIQA 4EC0A 5GSSA 3SWLA 1ZMAA 4V2LA 4JU5A 3HY2A 4ACSA 5IPGA 4XRDA 1GSQA 3P2AA 2YWMA 1K0MA 2OE0A 2VCZA 3GV1A 2CVKA 1ERTA 2HYXA 1U87A 1PKWA 4NAXA 4DEJA 1SL0B 4MABA 2L57A 1XOBA 4KNDA 2FWGA 4MF6A 1SYXA 1B48A 3LGCA 1PA3A 4I6XA 1TKDB 4IVFA 1PSQA 1GWCA 1J08A 1JFUA 2M80A 4KX4A 3LSZA 3KH9A 5DAKA 1TRWA 5F8BA 5IMDA 1GH2A 1MDIA 1QXHA 1EOGA 1EP8A 3IRAA 3IA1A 2BMXA 3EMXA 3IAM2 4BVYA 3GYKA 4KW6A 1Z6NA 3QAWA 2R5GA 1TRVA 4OO4A 3J7Yk 2C0EA 2PERA 4IJIA 1ZGNA 2LJKA 2R2JA 3FR3A 5CP1A 3O3TA 3VK9A 3UAPA 3U5RE 1M2BA 4TR1A 3KD0A 2N5FA 3U6VA 1XW5A 3CXGA 4ML6A 1SJZA 14GSA 3UVTA 1U3AA 2QGVA 1VF3A 4IHUA 1B9YC 1MDKA 2B5XA 1ACVA 3ZIVA 4IN0A 4YQUA 3G7JA 4X1UA 4KCAA 2F9SA 3M8NA 4ID0A 5J3RA 3TOTA 1UA5A 1SL2B 3VWWA 4LL4B 5AIVA 3TRXA 2LQOA 1PX6A 1GTIA 5C04A 2EIRA 2VL9A 1VF4A 4V1Ag 4PXOA 1AUCA 3RPNA 3GIXA 3HYPA 3Q74A 1TTZA 20GSA 22GSA 2O89A 4F0BA 4PUAA 3HJOA 4POLA 1THXA 4AJ7A 3QFAC 5FT3A 3PH9A 2H01A 1SJ6A 2X99A 4HDEA 3A2WA 12GSA 4GSNA 2JACA 1KEBA 1SKSB 1M7TA 5DDLA 5J9CA 3APOA 1FB6A 3HDCA 4FO5A 5D93A 1W4VA 1GUKA 3EU3A 2HNLA 2I9HA 4G19A 2ON7A 4OCFA 2PPTA 4JZQA 3D21A 4LA1A 2MBSA 2PBJA 4AGSA 2HE3A 2IMFA 4MLYA 4TRXA 1F2EA 2B1LA 4O5RA 1TP9A 2D2ZA 1XZOA 3N5OA 6GSYA 3M0FA 2CV4A 2IIYA 3FK8A 3J7Yb 1A2LA 2H19A 3TJFA 1KBNA 1VF1A 4GRFA 2HRNA 4TXOB 2HRFA 2AB6A 2DIZA 3FKFA 3P7XA 1PRXA 1R5PA 1TU8A 2H1GA 4G2EA 3EINA 2VCVA 5ECLB 2JZRA 1TK0B 2X8GA 4TOPA 3L9VA 10GSA 4ZBAA 5IM9A 2CZ2A 5FHIA 3VI7A 3HA9A 1WMJA 3D6IA 4PNGA 2NVLA 3GTUB 3I6AA 1OVNA 4TR3A 1FVJA 2FHEA 3IPZA 2C1YA 3UVHA 1Q98A 3EYTA 2OKAA 4IS0A 3MSZA 2V6OA 3ZLPA 2O85A 4WEYA 4BPYA 3GKXA 3KM6A 3ED3A 2JZSA 1SL1B 1A2JA 1EP7A 4GLTA 5A5KA 6GSUA 1MD4A 4WR4A 2IFQB 3S9FA 3E0UA 1QGVA 4F9ZA 4QL9A 1YDKA 3F6FA 1YKCA 5F05A 2NBSA 2OACA 5HR1A 3ZMKA 4XTSA 1XIYA 1K0BA 3LYPA 3R2QA 5JCGA 4HQZA 2H8LA 1RK4A 2E2MA 2BJXA 2HXKA 2H70A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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