3IV4A

A putative oxidoreductase with a thioredoxin fold
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
NLYFQGVAIKLSSIDQFEQVIEENKYVFVLKHSETCPISANAYDQFNKFLYERDMDGYYLIVQQERDLSDYIAKKTNVKHESPQAFYFVNGEMVWNRDHGDINVSSLAQAEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a putative oxidoreductase with a thioredoxin fold
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule keywords Putative oxidoreductase
total genus 36
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF11009 DUF2847 Protein of unknown function (DUF2847)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3iv4A00
1YKAA 1K3OA 2P5QA 3GIXA 3ISOA 3QAVA 3CXGA 3HVVA 1AXDA 4EL1A 1PKZA 4IP6A 5CNWA 2OBIA 3H8QA 3P7XA 5CP1A 1MEKA 1TI1A 3LXZA 2VCTA 1JZDA 3M9KA 1U3AA 1G7EA 1THXA 2FWGA 2OE1A 2DJ2A 3F3QA 3C8EA 4HU9A 4Q5RA 1JLVA 2R3XA 4V2MA 2AJQB 3ZVJD 2VLVA 2F3MA 2XBQA 3I9V2 1AAZA 2DJJA 5ECPB 4V1Ag 5JWRB 1UN2A 1H75A 5HFKA 2WGRA 1M99A 5B8AA 1K3LA 4Q5FA 3FEUA 2H1BA 1XVWA 2NDOA 2GQKA 1U88A 1F37A 2B3SA 3H79A 2M46A 2E0QA 4K7NA 3D4TA 1J0FA 3IBHA 3PGTA 1OC3A 3FK8A 5GZZB 2AUVA 4BA7A 2OE3A 2MZCA 1T7PB 2K8SA 3GH6A 2MYGA 3F0IA 4KNDA 4MZBA 19GSA 1HYUA 1QFNA 4ID0A 4RI7A 3TJBA 4N11A 1XW6A 3LFLA 3U5RE 1QGVA 1LBKA 1CQGA 4NWYA 3NIVA 2OA7A 3F8UA 3TRPA 3TGZA 2DC5A 2R5GA 2JSYA 3HDCA 3Q18A 2JL4A 3DXBA 3H93A 4GWRA 3FRCA 3CSJA 3G7YA 2C0GA 1GTIA 2IJYA 4ECJA 3EVIA 2MMOA 2WCIA 5G1KA 3RHCA 4PQ1A 1GUMA 1N8JA 3Q6OA 1EZKA 3ZLPA 5HFGA 1XVQA 3TKRA 1MD3A 1DBYA 1M9AA 2CT6A 1SKSB 1WWJA 2VL3A 5GSTA 1U6TA 2IFQB 5ECNB 5IQYA 4MLYA 1BEDA 3GNJA 1A0RP 4OO4A 4CW9A 1WE0A 2HNLA 3D4MA 2DJ3A 4N0VA 1SD9A 2DMMA 3O76A 4GLTA 5EPFA 3FW2A 2VL9A 4EE0A 1T4YA 3QD9A 1A0FA 5CAXA 20GSA 3F6FA 4PXOA 5AIXA 2NTOA 2VL2A 2RM5A 2RLIA 5JWQB 2IWTA 4HZ4A 3GKNA 4HJ2A 4L0WA 3GKKA 1Q4JA 1SKWB 2H76A 2B1LA 2B5EA 3EC3A 2YANA 3IV4A 4DEJA 3HVXA 2LRTA 1X0RA 5GAND 2RIIA 1DSBA 3SBCA 18GSA 2CAIA 4RQXA 1TRVA 3LQ7A 3HVSA 3KP8A 4X0XA 1JZWA 3UVHA 22GSA 2N5AA 3HJPA 3GYKA 2GVPA 1EV4A 4KSMA 2PU9C 2H0HA 4I2UA 3A2WA 3US3A 2JZRA 4LA1A 1Z7RA 4F0BA 2B1KA 2REMA 3LGCA 4GQFA 4MJBA 1XW5A 2GQLA 3F4SA 4KDYA 5KEJA 1OE7A 3L4NA 5CO3A 1JHBA 1SL1B 3IC4A 5F0GA 4NV2A 1O81A 4NPBA 5IMAA 3I69A 3F4TA 1EP8A 2B5XA 2GSTA 1Z3EA 4MZWA 3KTBA 5A4VA 1PGTA 1R4WA 4L0UA 1R5PA 3CRTA 4ZIJA 2WZ9A 4WF4A 1A2LA 3KEBA 4POMA 2EC4A 1M2AA 6GSTA 1QK8A 2H72A 3WT1A 2C0FA 2OACA 1YF0A 2LJRA 3VLNA 1T00A 3TJGA 2WRTA 2CVBA 4ZB9A 1O8WA 3FHKA 3ME7A 17GSA 1W89A 2PWJA 3GX8A 1GTBA 3C71A 2H70A 2JZSA 3ERWA 2OE0A 1XWKA 4N30A 2L5OA 2LKUA 4KUNA 5G5EA 1ZOFA 1XXUA 4ILFA 4CHSA 2N5BA 1LU4A 4XS4B 2VO4A 3GKXA 3CYNA 2VCZA 3FYGA 1TU7A 1LJRA 5D9WA 2RUEA 5DAKB 3ERFA 2PUKC 5DDLA 1XOAA 1TW9A 4PX1A 5IO2A 1GNWA 1TDIA 3TRQA 2HRFA 2F51A 4QL7A 2H01A 2A4VA 3E9JB 1YDKA 4XHMA 3D5JA 2E2GA 2J23A 1G0TA 1H4OA 3BD2A 3TUEA 3TJKA 1PD21 4MJAA 5IM9A 2PVOC 3IPZA 3VWXA 1TU8A 12GSA 3GH9A 3V1WA 3QMXA 1A8YA 5DALB 14GSA 2NVLA 2JSZA 2PMTA 3FZ9A 2CX3A 3KCMA 1G7OA 2KLXA 1SJZA 2OADA 1UVZA 4YQUA 2PVQA 4I97A 1W4VA 3QCPA 5E59A 2FWFA 5L71A 2MMNA 1ZMAA 2B7KA 4MPFA 3PH9A 5F05A 5B6NA 3W8SA 5D9VA 5H5SA 2PGTA 3M1GA 4ZB6A 1SYXA 1OKTA 2HZFA 3DIEA 3HJOA 4O7HA 3CSIA 1FW1A 3LEFA 1ERWA 4IBPA 4IN0A 2R6KA 3G9BA 1I9DA 2DJKA 3C1SA 2H30A 2KP2A 3G7IA 4ISDA 5HFIA 1N2AA 1GWCA 1B4QA 5J9CA 2YZHA 2XPDA 4RUVA 2I81A 2TIRA 3UOMA 1AQWA 3KH7A 2B5YA 1TRUA 4XRDA 2YWNA 2K8VA 2IN3A 2AB6A 2JZTA 1KNGA 4HI7A 1AW9A 1C72A 1A2JA 1ST9A 5DCGA 4MJCA 3HZ4A 1GSQA 4GXZA 1NHOA 3RAZA 2GS3A 4GF0A 4L8EA 4NHZA 3ZRDA 2L6DA 2H0IA 2VCQA 2BJXA 1X5EA 2FCHA 1B48A 1OKDA 2M80A 2C3NA 3VWVA 3VK9A 3UL3A 4OFNA 3O6TA 1ZYEA 4TXOA 2ZCTA 5ECRB 4I8BA 1EEJA 5ELGA 4ZXGA 3GTUB 3O3TA 1B9XC 3TKSE 3ZMKA 1G6WA 1AQVA 2HSHA 3KIJA 1MDKA 2FD3A 1HD2A 3GSSA 4O32A 2O89A 4ACSA 5IMCA 3HA9A 3DVWA 1WRYA 5ECSA 1O7UA 4WBJA 4GSTA 1JFUA 1GTUA 4AF2A 1GSFA 4TR1B 1OC9A 2YCDA 3DD3A 4DVCA 2VLTA 4OMVA 1OE8A 2O8VB 3WD6A 2QC7A 2DSAA 1URMA 1VGLA 1S3AA 1YEXA 3CBUA 3TRXA 1NHYA 4XS6A 3A2XA 2LJKA 2MMAA 2CQ9A 3EMXA 5INYA 1YF1A 3KD0A 3L9UA 4IVFA 4EC0A 1WIKA 5KN1A 3DKSA 2VCWA 3F3RA 4MF7A 6GSYA 1EOGA 5AGYA 4IGJA 2EIQA 1USBA 4YAVA 2N5FA 2MBTA 4JR4A 5GSSA 4ULXA 4IJ3A 3ZREA 4ML1A 1Z6NA 5D9XA 5G1LA 2HXKA 2M72A 4G10A 4EKZA 4LLRA 3APSA 3F4RA 3F6DA 2LUSA 3LYPA 4G2EA 4LMVA 1X9SB 1AIUA 2LS5A 1F6MC 4NHWA 1EOHA 2YV9A 1BJXA 4LL1B 4WXTA 2LTKA 4IJIA 3KH9A 3D0ZA 1ABAA 1Z9HA 4TW5A 1EGRA 3TKSC 5CRGA 2A2SA 3ZIJA 3W6GA 1XOBA 1G6YA 4HOJA 4KW6A 1GSUA 1OYJA 5EY6A 4IP1A 1IYIA 2H71A 2TRXA 2X8HA 2YOIA 3MWHA 4JE1A 1Y6EA 1TK8B 4K7IA 4PURA 2ZNMA 4IQ1A 1XPVA 2WDUA 3GKMA 3AY8A 4TR0A 4OD7A 4ML6A 4V2LA 5LD0A 1X9WB 1T4ZA 3S9FA 1K3YA 4K0NA 3GRXA 1BAYA 4Z7XA 3M8NA 3HD5A 2VUPA 2FUG2 3QOUA 2CVKA 1OAZA 2RUFA 2H6XA 1M7TA 1ACVA 4ZL7A 2LJAA 1T1VA 3DYRA 3DVXA 4ZB8A 1YZXA 1YEPA 2FNOA 4PUFC 3HY2A 1Z6MA 1B9YC 4HS1A 3CSHA 1AQXA 3H1NA 1WPIA 3ZMLA 3EE2A 2O7KA 3DEXA 4KCEA 3E0UA 2YJ7A 1BG5A 4G9HA 1O8XA 3ZVJA 4ECIA 3I43A 5DJLA 5IMDA 1ON4A 2HT9A 3TOUA 4NXIA 4NV5A 2FHEA 3QFAC 1THOA 3QPMA 4OO5A 1WJKA 2L57A 1GUKA 5ENUA 1S3CA 4PNGA 2JACA 4MA9A 3ZTLA 1GULA 1ERTA 4POKA 3Q74A 2C4JA 1K0NA 2CAQA 3LYKA 3VWUA 2CZ3A 3BCKA 4LL4B 2IMKA 3SWLA 1FVKA 5AN1A 1V2AA 4D73B 3D22A 4FIWA 4PQHA 1KBNA 1FG4A 3IOSA 3C1RA 4MH2A 1GLQA 4BVXA 1PL2A 3MAKA 2GTUA 1K0MA 2DMLA 2C1YA 2LQOA 3UJ1A 1TRWA 5JCWA 4AJ6A 4I5QA 4BWQA 2IFQA 3FR9A 4IELA 4MJEA 2VIMA 4Q5NA 3ZZXA 3ZITA 4HUAA 1XCCA 3QR6A 2C80A 1V40A 5ID2B 5J5NA 3L0HA 4JEDA 1PL1A 2K9FA 1A8LA 1BYEA 3IHQA 3RHBA 1V57A 1Q98A 4TN8A 4XCSA 2AAWA 5JWOB 2LRNA 1XWBA 4DSRA 3PINA 1AUCA 5F8BA 2HZEB 1RK4A 1V58A 1Y25A 3K8NA 4FYBA 3TJJA 3HYPA 4KCAA 4TKYA 3TDGA 3C7MA 1EP7A 1I5GA 3LJRA 3TCOA 2P0GA 2KUCA 5CRHA 1WOUA 1J9BA 4BPYA 4KSOA 1O85A 3L78A 2E2MA 2H1AA 3KTLA 2YWIA 1PRXA 2V32A 1K0AA 3P2AA 3JCML 3KZQA 5AISA 3ERGA 8GSSA 5A4WA 3DMLA 4RQRA 2DIZA 2NPBA 3HCZA 1XW9A 1F2EA 1OVNA 2AHEA 4EF0A 3NOFA 2YV7A 5HQPA 6GSSA 3FR3A 1DE1A 3LSZA 3Q19A 2C3TA 2YWMA 4X43A 1RQMA 3U6VA 3D6IA 4ZBDA 2VL2C 4FYUA 4EUYA 1GSEA 3BCIA 1ZGNA 4JU5A 4I2TA 3QAWA 1SK2A 2YZUA 5EL8A 3MSZA 2H1DA 3VPTA 5CRDA 1MDIA 2F8AA 4GQCA 3CTFA 4BL7A 2GLRA 4X1UA 5ECKB 4JBBA 2HRNA 4F82A 1R5AA 2O85A 4GCIA 3GFKA 3UEMA 2OKAA 5J9BA 3EINA 1DUGA 3L9SA 3FR6A 4MF5A 2H74A 3KMOA 4KA0A 4KAEA 4N0ZA 1Z5YE 5CREA 5IPHA 4BVYA 4TRXA 4LMWA 2G0FA 4AJ8A 4L5LA 1ERVA 5CRWA 3BBYA 3GMFA 2F9SA 4XS4A 2V41A 4MCUA 5DAKA 11GSA 1YQ1A 4IQAA 3GHAA 2HI7A 3QDNA 1GSYA 4ZBBA 4DSSB 3IDVA 3ZL5A 3TB2A 2KOKA 4MABA 2HYXA 1GSSA 3KP9A 2VCVA 2IPAA 4XS1A 1F9MA 1FO5A 4WETA 5IPGA 2L4QA 1SENA 1ML6A 1F3AA 4KDXA 4NAXA 13GSA 3TKQA 5IMZA 2PN8A 4HDEA 1TK5B 3EU3A 4MP4A 4H86A 3C73A 3UIWA 1SKRB 5DALA 1XFLA 4F9ZA 1ERUA 1KEBA 1QMVA 4KDUA 2TRCP 3F63A 2ES7A 4HQSA 2C0EA 1ILOA 1GL8A 4P3YB 4FYCA 4E8EA 2H1GA 4GSNA 3IXRA 6GSWA 4POBA 4IS0A 1A2MA 1R7HA 3IAM2 4PQIA 2Z9SA 2OJLA 1SJ6A 3VWWA 2AYTA 2H8LA 3D21A 3GUSA 4KX4A 1FVJA 3P90A 2DJ0A 3HKRA 3GSTA 4ZL8A 3IE3A 2H0GA 2J9HA 2XC2A 2H75A 3M3MA 2B6MA 4WR5A 4ZILA 1PQNA 5ECQB 4K2DA 1VRSD 2CX4A 3WYWA 2I9HA 1PA3A 2L59A 5FT3A 5HR2A 5ELAA 1XWCA 1ZYQB 1E2YA 2GDRA 2DIYA 1SYRA 5IO0A 2R4VA 2QSIA 2VD1A 2VCXA 3APQA 5D93A 3VI5A 4K1FA 2R2JA 4FO5A 3HHVA 4HJMA 5ECMB 3GL5A 1ZZYA 1PX6A 5D9TA 5LNKe 2C8UA 2V6OA 4HEA2 2LEGA 5DJMA 4K8MA 1HNAA 4V1Ap 4IW9A 2MBSA 4HU7A 2R37A 5IMVA 2LNTA 2L5LA 1EWXA 2DLXA 2LQQA 4OCEA 9GSSA 2KP1A 3UVTA 5B6MA 3E3EA 5FHIA 4O92A 3GN3A 4BWSA 6GSXA 4EVMA 4WBRD 4XTSA 3GTUA 5G30A 1XIYA 2X99A 1K0CA 4IHUA 5H5RA 3KXOA 5DQYA 4KE3A 3EMPA 4WF5A 3TOTA 3OR5A 2C3QA 1T8EB 4MDCA 1QQ2A 3KMNA 1TI3A 3TKPA 5ABRA 4YQVA 3ZFBA 1K0BA 3J7Yk 1V9WA 2WS2A 4XIHA 2GGTA 4PUAA 5FWGA 2B7JA 1O73A 2IMEA 2XHFA 1PSQA 4TR1A 3I6AA 4TVEA 4QL9A 4HZ2A 3NZNA 4K7OA 1TP9A 1E6BA 1QXHA 4RI6A 2HE3A 1GUHA 1MTCA 5KN2A 1CQHA 3N5OA 3A3TA 1VF4A 2G2QA 2GSRA 4TOPA 2ON7A 3L9VA 2DBCA 3CTGA 5A4UA 4TR3A 2CVDA 5G2ZA 3RPNA 2YN1A 2D2ZA 3LXTA 1MD4A 2DJ1A 4V2NA 5KN3A 2GT5A 2XBIA 1K0OA 5JCGA 3IK9A 2PBJA 4AGSA 1EEMA 2GZZA 2GZPA 3ZIVA 5HR0A 5C00A 1SD8A 4E8HA 4OWYA 4POLA 3TJFA 1VF3A 3HZ8A 1S3DA 2C0DA 3RPPA 2H6ZA 2IMIA 3IAS2 1VF1A 4EDZA 2P31A 2JU5A 1YJ6A 2QKEA 4GSSA 2FWEA 4IKHA 4OFMA 5A5KA 1M0UA 1DE2A 3A2VA 3IK7A 3R2QA 2I1UA 5F07A 1XBSA 2YP6A 3MDKA 4J2FA 7GSSA 3RBTA 4JR6A 1PKWA 4EDYA 1Z7PA 2K18A 4KB3A 1GNEA 1HNCA 2GQMA 3DGQA 1FAAA 2LV3A 4KGIA 5DVBA 1FHEA 5HR3A 5DCHA 5EVOA 1M9BA 3GA4A 1B8XA 5G5FA 1U3IA 3WGDA 2V1MA 4ECCA 1O6JA 3VFIA 4YAPA 3VPQA 4Q5QA 5J41A 2YNXA 3WT2A 3LORA 3GURA 2VD0A 1PN9A 3H4KA 1RW1A 2VOCA 4MF6A 6GSUA 2H66A 1PMTA 3IRAA 1SK0A 1FB6A 3P8WA 1JZRA 2WULA 4K9ZA 3FZAA 1GSDA 2IMDA 3UBKA 4KH7A 3APOA 3ME8A 3CMIA 5ECLB 2CV4A 4N10A 4G19A 2RM6A 3EU4A 3IA1A 1SL2B 2P5RA 3EYTA 5C04A 3GL3A 5B8BA 1JLWA 4GRFA 3ED3A 2FLSA 2E7PA 1KTEA 2I3YA 4K6XA 2BMXA 1FOVA 2CA8A 1YY7A 2QGVA 2FGXA 1WMJA 2GSQA 3MNGA 2H6YA 3FZ4A 4JZQA 2V2GA 4OCFA 2KHPA 5D8IA 1SU9A 4EO3A 1PX7A 4WR4A 2HLSA 1GLPA 3M0FA 1YKCA 3FY7A 4OFTA 2X8CA 4F03A 4MMMA 2YPMA 2FA8A 4DSQA 1UC7A 1A23A 5B7CA 5DQSA 4WKWA 5F06A 5CYYA 4EXJA 5HR1A 2FY6A 1TTZA 4D73A 3UARA 2CZ2A 5COHA 4TR4A 3KGKA 2VLUA 4F2IA 5J4UA 3WGXA 2BTOT 1TKDB 4L5OA 1TOFA 3KJYA 1TJDA 1V98A 1X5DA 3KM6A 1R26A 2V6KA 4ECBA 1NSWA 2A2RA 2O87A 5IIZA 1OC8A 2VM2A 1TK0B 3DWVA 5G31A 4ZL9A 1XZOA 4WEYA 5ID2A 1M2DA 2YJHA 4PNFA 1HNBA 5D73A 4HQZA 3GX0A 3QFBC 1VF2A 2FA4A 1F3BA 2VAFA 2EIOA 3LG6A 1ZCPA 5E4WA 3HJMA 2X8GA 1B4PA 2HZEA 16GSA 1TXXA 2L4CA 1AC1A 2GT6A 2L6CA 3W8JA 5LCZA 3M9JA 3BOAA 4TXOB 1IYHA 2VM1A 3EWLA 1XWAA 2WFCA 4FH8A 5D96A 5ECHB 2H19A 3RDWA 1T3BA 3ZFLA 3HXSA 1HQOA 1K0DA 3PR8A 3F9UA 2LRCA 3J7Yb 3UAPA 4YH2A 10GSA 2PPTA 2AV4A 2ON5A 2YWOA 2GSSA 2FWHA 1XWGA 3QAGA 4JRRA 2IL3A 4K0GA 1QUWA 1OC9B 1GTAA 3TKSA 2OBKA 3IR4A 4AJ7A 2ZUPA 5IOXA 1EV9A 5ECIB 3BJ5A 3VI7A 5ECOB 2PERA 1GRXA 1NM3A 2F8FA 5H5QA 3G7JA 5IOWA 2H73A 3VURA 2MMZA 3FZ5A 1J08A 3ZYWA 5GAPD 3LWAA 5DBQA 2HFDA 3UBLA 2LNSA 4XRAA 3WGEA 5J3RA 1SJIA 2LSTA 2WB9A 3DRNA 4I6XA 1A24A 1BX9A 4PGTA 1GH2A 3UMAA 5AIVA 2K6VA 1JZOA 5IMFA 1MDJA 3FKFA 3N9JA 3EURA 1SL0B 2GZYA 2WJUA 4YQMA 4TXVA 1M2BA 4MPGA 1X5CA 2IMFA 2XPEA 4J56E 4NMUA 1NW2A 3A5WA 1X9MB 4O5RA 4ZBAA 6GSVA 1U87A 3CRUA 1GP1A 2ALBA 2JADA 5KN0A 4MZCA 4MH3A 1BQ7A 2IIYA 1FB0A 2I4AA 4F0CA 2X64A 2EIRA 4J57E 4QQ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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