3IV4A

A putative oxidoreductase with a thioredoxin fold
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
NLYFQGVAIKLSSIDQFEQVIEENKYVFVLKHSETCPISANAYDQFNKFLYERDMDGYYLIVQQERDLSDYIAKKTNVKHESPQAFYFVNGEMVWNRDHGDINVSSLAQAEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a putative oxidoreductase with a thioredoxin fold
rcsb
molecule keywords Putative oxidoreductase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 36
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF11009 DUF2847 Protein of unknown function (DUF2847)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3iv4A00
3GL3A 4AJ8A 3J7Yb 5IPHA 1A24A 4GSSA 1X9SB 1F9MA 4YAVA 2LS5A 20GSA 4EXJA 1R5PA 2HT9A 2R5GA 3TKSA 2GZYA 2Z9SA 1NW2A 4GTUA 1UC7A 2YJHA 3IK9A 1ABAA 1GUMA 4XIHA 3P8WA 4BVYA 1O73A 2JACA 2YWMA 4O7HA 1MD4A 1SYRA 3CSHA 4K2DA 5DJMA 5DALB 5DCGA 3W6GA 3UAPA 4MH3A 1T4ZA 1TU7A 4KNDA 4LLRA 2M80A 4WETA 2N5AA 2YWOA 2H6ZA 3HDCA 4WF4A 1RW1A 3I6AA 2LNSA 1M2BA 2CQ9A 1WIKA 3APSA 5D73A 2PVOC 2HRNA 1PGTA 1ERTA 1OE8A 1DSBA 4FYBA 4POBA 2H70A 3GTUA 3GSTA 4WBRD 1EEMA 2HSYA 3SWLA 3DRNA 2GQMA 4L8EA 3CTFA 2DBCA 3FZ5A 3D4MA 1XZOA 3J7Yk 1PRXA 5J9BA 4K9ZA 3QPMA 5JCUA 3ZTLA 1MD3A 4Q5QA 3S9FA 3E9JB 3L9SA 1O81A 4MP4A 4MPFA 3QDNA 3P7XA 1U6TA 4KW6A 3VLNA 1J9BA 4RI6A 1WE0A 2E7PA 4F0BA 1VF1A 4HU7A 2FWFA 3VK9A 3EMPA 2MMAA 1OYJA 2ZUPA 4NPBA 4IW9A 3ZITA 5B6NA 1TXXA 1X9WB 3MNGA 2HXKA 4EC0A 1ZGNA 3EWLA 1FVKA 5ECHB 3H8QA 1V57A 3H79A 1HYUA 4BA7A 1Z7RA 1VF3A 1Z3EA 4XS4B 1BAYA 3KEBA 2VLUA 4MJEA 4I2UA 1BEDA 4EF0A 1YF1A 1TRVA 3DXBA 1BQ7A 3KTBA 4FYCA 1B4PA 3KH7A 1EWXA 4MJBA 5IOXA 5B8BA 3LYKA 3ERGA 3ZFLA 5IOWA 1EP7A 2L5OA 1X5DA 2N5BA 4F82A 1PKZA 4MH2A 1QK8A 4TOPA 4GCIA 1G7EA 2E0QA 2GQKA 5CRHA 4DVCA 4IS0A 3UVHA 1M9AA 3L9UA 1FO5A 4X1UA 3EU4A 4ZIJA 1GH2A 4N11A 4FO5A 2CZ2A 4ZBAA 2YCDA 1EGOA 1XIYA 1X5CA 3BJ5A 1XWKA 5ECMB 5LNKe 2IWTA 3GHAA 3EC3A 3DIEA 3HJOA 5DQYA 5ID2B 4GQFA 3WD6A 2DMLA 2GSRA 4I8BA 2M46A 2GZPA 2FNOA 4J57E 2AJQB 2OADA 2LRNA 4JE1A 2WJUA 3R2QA 2H0HA 2JU5A 1A2LA 2KUCA 3WT2A 4L5LA 4GSNA 1M2DA 2I4AA 2GQLA 4POKA 4EUYA 4IP1A 2IL3A 3HVVA 5F07A 4BPYA 5AIXA 4IBPA 4NHWA 1NM3A 2F51A 2HZEA 3GX0A 2CT6A 3ZVJD 3OR5A 4KSOA 1QFNA 4YH2A 3VI7A 3F4TA 1GSUA 1BX9A 3ERFA 4EVMA 3DYRA 1TRSA 1TU8A 1WWJA 2JSZA 4HU9A 1KBNA 4WXTA 2H01A 3IE3A 3NOFA 2GSSA 4NXIA 4ECIA 22GSA 5LCZA 3IK7A 4MF5A 4BVXA 3KP9A 1R7HA 3O3TA 3CSJA 3VWUA 5AGYA 4TRXA 1OC9B 2FWGA 1YQ1A 2FD3A 5GAND 5INYA 3UOMA 4D73A 4ECBA 2IMIA 1F37A 3F9UA 2A2RA 5F0GA 1JZWA 2R4VA 2DJKA 2V32A 5CREA 2WDUA 2G0FA 1THOA 2FWEA 1R4WA 2EIOA 5JWQB 4IHUA 4KB3A 1T00A 4WF5A 5AISA 1H4OA 2MMNA 1ZZYA 3EVIA 3IC4A 2G2QA 1XXUA 2PU9C 1FW1A 4MZWA 4KH7A 2VM2A 3TJKA 2PVQA 3VWXA 2LNTA 3D0ZA 5ECLB 2LQQA 2WCIA 2K6VA 2VL2C 5DCHA 3QR6A 5JCGA 5E59A 5HQPA 1BJXA 3CMIA 1XWAA 3A2XA 1MTCA 2O85A 4TR4A 2CVKA 3M9JA 4HOJA 4PNFA 3QCPA 2DJ0A 1MDJA 2X8HA 3W8JA 1PL2A 4NHZA 2IFQA 2V1MA 4NWYA 2I9HA 1PA3A 3GV1A 4JR6A 3O6TA 3TKSC 2I81A 1A8YA 1XW5A 5IIZA 3D5JA 1ILOA 1SL0B 1B48A 1DUGA 3AY8A 2GSQA 4K0GA 2MBTA 1O6JA 5HFGA 4YQMA 2YWNA 3M1GA 5IMFA 2YNXA 4OO5A 2GVPA 5ECRB 2B6MA 3A5WA 4O32A 1G0TA 1ERWA 1Y25A 1ACVA 5IMDA 1ZYEA 4N0VA 5L71A 3ZFBA 3IDVA 2WFCA 3DVXA 1OC3A 3DKSA 2WULA 4OFNA 14GSA 3TDGA 2RUFA 3FZ9A 4QQ7A 4TR3A 2OKAA 1NSWA 2EIRA 7GSSA 2OA7A 4RUVA 2KLXA 2PGTA 2MMZA 2LJAA 2O89A 3U5RE 1ZCPA 2YV9A 1UA5A 1SKRB 4H86A 1AQXA 1EOGA 4ZB6A 3LG6A 5D9TA 2DSAA 1FOVA 3RPNA 1XCCA 1GUKA 2GDRA 2J9HA 1TK0B 4RI7A 5KN3A 2C0GA 4JEDA 2MYGA 1LU4A 4ZL8A 2KP1A 1M7TA 3E3EA 3TJFA 3TKRA 3V1WA 2AYTA 6GSSA 4K8MA 3HHVA 1XW9A 3IOSA 3WT1A 1YKCA 4BWSA 2X8CA 4OD7A 3GN3A 1F2EA 4NV2A 2YP6A 4IP6A 1FB0A 3KGKA 2VL2A 2H75A 5B7CA 3Q6OA 3ED3A 2C3NA 4L0WA 3TRXA 1SL2B 2DJJA 2HE3A 2X99A 2LQOA 4PUAA 4DEJA 4ZB8A 3CBUA 4IN0A 3GRXA 3IPZA 1YF0A 2VCXA 1HQOA 3D6IA 5EL8A 4ZBBA 1KNGA 4MZBA 2A2SA 4PQHA 1EV4A 2P0GA 4KX4A 4KE3A 2LSTA 3DD3A 5CAXA 5CP1A 5ECIB 4WEYA 2P5QA 1WOUA 2LUSA 2VD0A 2L5LA 3IRAA 2REMA 3IA1A 2MMOA 2NPBA 4L0UA 3IR4A 3QAGA 5CRGA 2CVBA 2K8SA 1LBKA 3LORA 4AJ7A 1TI1A 1SL1B 3DWVA 5ECPB 4F2IA 3KD0A 2CX3A 4POMA 3TKSE 3GNJA 5H5QA 1K3OA 2YOIA 5KEJA 3MWHA 3LWAA 2VUPA 1ML6A 3LXZA 5IMZA 4MMMA 2CA8A 2GGTA 4G10A 3KCMA 2V41A 2J23A 1I9DA 3IHQA 2VCQA 1C72A 1FVJA 2DJ2A 1V58A 3TRQA 4IQAA 3UIWA 8GSSA 3QFAC 4BL7A 2C80A 1RK4A 2O7KA 1GLPA 2K18A 2PERA 2B7KA 1ON4A 6GSTA 2KOKA 4E8HA 2P31A 2ON7A 3BBYA 3C73A 4EL1A 11GSA 2DJ3A 1XOAA 1SENA 3HVSA 3F6DA 3TB2A 9GSSA 1VF4A 5ABRA 2H0GA 5G5EA 5GZZB 2HZEB 1XOBA 2NDOA 17GSA 4IELA 2OE0A 3ZREA 4GSTA 19GSA 1K3LA 3E0UA 4TXOA 1ERVA 5CRWA 3W8SA 2HZFA 1Y6EA 2H1GA 4HDEA 5J4UA 2FWHA 4MK3A 1T3BA 2XBIA 3TUEA 4JU5A 4KDYA 5JWRB 1T7PB 5D93A 2XPEA 3LFLA 3JCML 2N5FA 3KP8A 4Q5FA 2R3XA 4J56E 4HQZA 4PURA 1HNAA 1YKAA 3G7IA 3GH6A 4O92A 1XBSA 4HJMA 2GT6A 3KZQA 2LJRA 5IMCA 1GL8A 4D73B 5FWGA 3O76A 3CSIA 5HFKA 3FR9A 1I5GA 4E8EA 2XHFA 3H1NA 2F3MA 4DSQA 3F3QA 3QAWA 3KMNA 1NHYA 4ECJA 3BOAA 4ECCA 2O8VB 2TIRA 2L6CA 3LXTA 5KN0A 1JLVA 2QC7A 2PN8A 2VLVA 3WYWA 1O85A 2RLIA 2KHPA 3TRPA 1G7OA 2CX4A 4KUNA 3KTLA 3RHCA 3HYPA 4KSMA 1G6WA 5GAPD 5G5FA 1YDKA 1GUHA 5D9VA 1SKSB 2OE1A 2R37A 3PINA 3FHKA 3DGQA 5HR2A 1A0FA 2TRCP 2WZ9A 2IN3A 1JZDA 1TKDB 5COHA 4PUFC 3M8NA 4KCAA 1X9MB 3TGZA 1WRYA 5FT3A 2YJ7A 1RQMA 4XS1A 1SD8A 1GLQA 1O8WA 1TOFA 2M72A 2L4QA 4QL9A 1XWBA 13GSA 2IFQB 2YPMA 4JR4A 3FEUA 1SKWB 5AN1A 4HS1A 2L4CA 1GTUA 3EU3A 3UL3A 2K9FA 4MJCA 4CW9A 2X8GA 1BYEA 4F0CA 1SU9A 1KTEA 3GX8A 3US3A 1M9BA 1EV9A 5D9XA 2VCWA 3GKKA 5ELGA 3ZIVA 2H1AA 3DMLA 3ZZXA 3FKFA 2KP2A 1TK5B 4TR1A 1PKWA 2I3YA 2ZCTA 2ON5A 4GWRA 1FHEA 1HNBA 2CV4A 1K0CA 10GSA 3HVXA 3APQA 1TI3A 1JZRA 1Z5YE 2HI7A 4KDUA 1Z7PA 1F6MC 1TRUA 3FY7A 4XS4A 1OC8A 2QSIA 4XRAA 4AJ6A 3RBTA 3P2AA 1SJIA 5D8IA 1U3IA 1B8XA 4K0NA 1X5EA 3FZ4A 1EOHA 3I69A 5A4UA 5IQYA 4P3YB 3BD2A 4TN8A 3ZYWA 5DAKB 4GF0A 4K1FA 3IV4A 4MDCA 4ML1A 3MSZA 4MLYA 2VCVA 1E6BA 3HD5A 2E2GA 5HR1A 5CYYA 3HCZA 1PL1A 3ZVJA 3UMAA 2H6YA 3CRUA 4K7OA 1XVQA 2YV7A 3QFBC 1T8EB 3UARA 2PBJA 3ZL5A 1MDIA 2GLRA 4QL7A 1R5AA 2R6KA 1PSQA 2LEGA 1QGVA 4HUAA 2IJYA 3L0HA 3GH9A 1CQGA 2JSYA 1IYHA 4EE0A 2IIYA 3GA4A 3GURA 4EKZA 2YN1A 2CAIA 2YANA 3F0IA 2I1UA 5ECQB 3GKXA 4PQIA 1OAZA 2B5XA 4TKYA 4V2MA 1SJZA 3LEFA 3GSSA 1USBA 2HYXA 3FR6A 4POLA 1K0AA 4GQCA 1X0RA 5J9CA 3FR3A 1OE7A 6GSUA 2DIYA 2IMDA 1VF2A 2JZRA 5EVOA 4WBJA 2AAWA 3TKQA 3HY2A 2OBKA 5ECKB 3EMXA 18GSA 2H71A 1OKDA 6GSXA 1TJDA 1N2AA 2YZHA 2GTUA 3EYTA 3GKNA 2VD1A 3EE2A 1SD9A 1WJKA 3F3RA 1B4QA 4I2TA 1YEPA 2PUKC 3GTUB 4MF7A 4NMUA 4ZXGA 1GNWA 1YEXA 4RQRA 2E2MA 5HFIA 2LRCA 3K8NA 2B5YA 1LJRA 2MZCA 3IAS2 1HD2A 2AHEA 1YY7A 2C0DA 3H4KA 6GSVA 5C04A 1ZL9A 5JCWA 4Z7XA 3ZRDA 3RPPA 1F3AA 3U6VA 3M0FA 4N0ZA 2R2JA 3UVTA 3I43A 4MA9A 1AIUA 1TDIA 2VO4A 4TVEA 4TXOB 1OC9A 1PD21 5IO2A 4CDOA 2FUG2 1Z6NA 2HLSA 1EP8A 6GSYA 1T4YA 5HR3A 3TJJA 2GSTA 1TP9A 1AW9A 3RDWA 3N9JA 4MCUA 2K8VA 3KXOA 2MBSA 4EO3A 5C00A 3HA9A 5IMAA 2CAQA 2H72A 1SYXA 1A23A 4KGIA 2OE3A 5EY6A 5KN1A 3KH9A 4OCFA 2C3QA 2LJKA 4KAEA 3C1RA 1M0UA 5ECSA 3GL5A 4OFMA 4NV5A 4EDYA 1GTBA 2PMTA 2BMXA 3C1SA 2GZZA 3WGDA 3IXRA 3TCOA 3GMFA 2LTKA 2PWJA 5D96A 4CHSA 3M9KA 4IJ3A 1YJ6A 3VPQA 1HNCA 4Q5NA 4K6XA 2DLXA 1UN2A 1JZOA 1J08A 1Z9HA 2VCTA 3VURA 4V2LA 4JZQA 1THXA 1JHBA 1ST9A 1T1VA 4ZILA 5CRDA 4WR5A 4G9HA 3QAVA 3M3MA 3Q74A 4PGTA 2VLTA 4YQVA 2V6KA 1K3YA 4TXVA 3KIJA 4IVFA 2CVDA 2VOCA 4IJIA 4V1Ap 1A0RP 3N5OA 2AUVA 4I6XA 5B6MA 1O7UA 2NTOA 3P90A 1XWGA 1GSQA 1GNEA 2JZSA 1U3AA 4ZB9A 5G1KA 5A4WA 1OVNA 2EIQA 3CTGA 4OCEA 4N30A 2EC4A 5E4WA 1U87A 2XC2A 4DSSA 1AQWA 5ENUA 3FZAA 2H0IA 2JZTA 1TK8B 1K0NA 1K0DA 1M99A 1QMVA 1EEJA 2H6XA 4XTSA 5A4VA 1FAAA 4MF6A 2OJLA 1A2MA 1K0OA 2XBQA 4G19A 1GWCA 1S3AA 3F8UA 2FCHA 2XPDA 4ISDA 3KMOA 4HJ2A 2V6OA 2IMFA 3F4SA 2L6DA 3KM6A 3H93A 5IMVA 1Q98A 2FY6A 4GRFA 3ZIJA 1AC1A 4TR1B 1DE1A 2RM5A 3BCIA 1QXHA 1FG4A 12GSA 5H5SA 1V40A 3HZ4A 2V2GA 3A2VA 1KEBA 4JBBA 1J0FA 1K0MA 1F3BA 4KDXA 5DBQA 3RAZA 3KJYA 2ES7A 4IGJA 4AGSA 1IYIA 3LJRA 4ZBDA 1V98A 3D21A 3CXGA 3GUSA 1G6YA 3GKMA 1TRWA 4OMVA 1JLWA 5GSTA 3UEMA 2LKUA 2A4VA 1XPVA 1BG5A 1ERUA 3UJ1A 3FYGA 4LL4B 2C4JA 4IKHA 5B8AA 2B3SA 2B5EA 4YQUA 2PPTA 5FHIA 5D9WA 1A8LA 2H1BA 2H76A 3TOUA 1SJ6A 2NBSA 4NAXA 3ZMKA 1Q4JA 3D4TA 1XW6A 4FIWA 2WGRA 3RHBA 5G30A 5G2ZA 1V2AA 4HZ2A 2H73A 2X64A 5DALA 5IPGA 3TOTA 3GFKA 4G2EA 4GXZA 2C3TA 2VAFA 5J41A 3I9V2 5KN2A 1N8JA 4LMWA 2NVLA 1MEKA 3VI5A 1GSDA 2RUEA 3C71A 1W89A 4JRRA 3FW2A 5H5RA 5CNWA 1AUCA 1PX6A 3LQ7A 1B9YC 4WKWA 1E2YA 3HJMA 2DJ1A 1CQHA 2DMMA 4LL1B 1AQVA 3LGCA 2HRFA 5DVBA 1S3CA 2C1YA 3CRTA 3G7JA 1SK0A 1WPIA 4OFTA 3G7YA 2ALBA 2RIIA 4X43A 4N10A 1B9XC 5HR0A 6GSWA 3GIXA 2LV3A 1A2JA 2FLSA 3APOA 3ME8A 2WRTA 4MJAA 5J3RA 3NIVA 5ELAA 3PGTA 3A3TA 1PMTA 4V2NA 2F8AA 1R26A 4TR0A 2LRTA 4OO4A 4LMVA 4F9ZA 2BTOT 3IAM2 5DQSA 2HFDA 3HXSA 3WGEA 5A5KA 4MPGA 3MDKA 2H74A 4HI7A 3C8EA 5EPFA 4ULXA 3Q19A 3VWWA 4XS6A 3VWVA 4BWQA 3CYNA 4K7IA 5F8BA 2AV4A 3VFIA 5G31A 2L59A 3QMXA 3NZNA 4KCEA 2L57A 4Q5RA 4ACSA 4ID0A 2H1DA 3F6FA 1GSYA 2F9SA 1MDKA 3FK8A 4K7NA 4XHMA 2FA4A 2HSHA 2HNLA 2VIMA 4AF2A 3WGXA 4HEA2 3UBKA 1M2AA 1GSSA 1QQ2A 4MABA 1O8XA 5CO3A 5DJLA 1EGRA 3GYKA 1JFUA 4I97A 4PX1A 2GT5A 2O87A 4XRDA 1GULA 2H30A 1K0BA 3A2WA 1ZMAA 4LA1A 4FYUA 4TW5A 5F05A 1GRXA 5ECOB 3EURA 5ID2A 2WB9A 4J2FA 2OACA 2B7JA 3ISOA 2YWIA 3TKPA 1Z6MA 2BJXA 2C0EA 3EINA 3PR8A 2IMEA 4ZL9A 1OKTA 5F06A 3HKRA 16GSA 2FHEA 3ZLPA 2FA8A 1SK1A 4I5QA 2IMKA 4DSRA 1VGLA 5DDLA 1PN9A 5GSSA 3ZMLA 3DEXA 2D2ZA 3ME7A 4PNGA 2OBIA 1TW9A 1GTAA 1DE2A 4EDZA 4ILFA 2VCZA 1WMJA 1WP0A 3PH9A 3HZ8A 3MAKA 2WS2A 4PQ1A 2TRXA 3TJBA 5AIVA 3UBLA 1ZYQB 3FRCA 1FB6A 1QUWA 3LSZA 4GLTA 2QKEA 4PXOA 4DSSB 1UVZA 1GTIA 2RM6A 3QOUA 2VL3A 4X0XA 4ML6A 2P5RA 5IM9A 1AXDA 1VRSD 3L78A 3L9VA 4HQSA 5IO0A 4OWYA 3F4RA 2IPAA 2VM1A 2JL4A 3BCKA 2JADA 2AB6A 2ZNMA 1YZXA 1XVWA 2B1LA 1PQNA 3F63A 3L4NA 3TJGA 1SK2A 3ERWA 2QGVA 3HJPA 4F03A 2H8LA 3LYPA 2H66A 1H75A 4ZL7A 2DIZA 1DBYA 3IBHA 1TTZA 1S3DA 3C7MA 4HZ4A 4XCSA 1AAZA 2F8FA 2FGXA 2H19A 2VL9A 1PX7A 2CZ3A 2C0FA 4O5RA 5LD0A 4V1Ag 4IQ1A 5G1LA 5DAKA 3Q18A 3G9BA 2B1KA 4YAPA 1W4VA 1URMA 2GS3A 1U88A 3D22A 1GSEA 1GSFA 3QD9A 2C8UA 4WR4A 4MZCA 1EZKA 5ECNB 5J5NA 3DVWA 4L5OA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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