3JZJA

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
ELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
source organism Streptomyces glaucescens
molecule tags Transport protein
total genus 137
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3jzjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3jzjA02
1D3KA 4MFIA 4EXKA 3PUXE 4NF6A 1B5IA 1NFTA 3MVZA 1NMUA 1FQBA 5KZTA 1ATGA 4F22A 4GXSB 2QRYA 3EN3A 2HAUA 3OXNA 1N04A 4NMYA 4JWXA 2FNCA 1XVYA 3VVDA 5I57B 1XHYA 2YPNA 2ZMBA 1M5EA 3MUQA 3S2VA 4OTEA 4XKPA 2I4CA 1OQGA 5DVJA 2WKYA 3PGFA 1J1NA 4QSDA 3H03A 4R6KA 1OLAA 4M1VA 4H5GA 4RYAA 3LSXA 5DTBA 5I2KB 4YU0A 3UP9A 4I1DA 4BLAA 2GRVA 2V3TA 1FTMA 4KCDA 4BDNA 5H8HB 4OYVA 2ONSA 1O63A 4IB2A 4MLQA 3UGWA 5AA2D 1VE4A 1NL5A 3PMVA 4HCWA 4GVOA 4GXAA 3MC2A 4FEBA 5TP9B 2PT1A 4RK9A 2AL4A 3K1NA 2HQ0A 3VXBA 3ODBA 1P99A 2RC7A 3CFZA 1N84A 1GTKA 4ZE8A 1ZTYA 4X48A 3A09A 5KDTB 1SD3A 3O2AA 3RTWB 4NWDA 5H8QA 4JSDA 1CE2A 3ZKKA 3EPEA 2XXPA 1A8FA 3OELA 3BBRA 3D4CA 1JNFA 3JV9A 3T9VA 2O1LA 4O3AA 4YB6A 3K00A 4GIZA 4G8NA 2V3QA 3O66A 3OMBA 3ZKLA 1IIWA 1B32A 3S4UA 2I48A 3MJNA 1MQGA 3V8XB 4NF6B 4R9GA 1B3FA 2NOOA 2V84A 2VD2A 1FQDA 2I49A 4G8HA 3TDJA 4C1TA 3C36A 1Y4TA 3MVWA 4LQ2A 3CVGA 1Y3QA 3SDFA 2X26A 3FVKA 1OLCA 2O51A 1QUJA 3T66A 3QSLA 4C0RA 1M5CA 3TQWA 5I56A 1NNTA 1QUKA 2XD2A 2KLFA 2H98A 1JW4A 2OWTA 3PUYE 1BIYA 3H6UA 1UIUA 1MY0A 2XHDA 2XX8A 1JW5A 4F3PA 4IO2A 1GGGA 4EF1A 1JEUA 2O68A 5B70A 5J1DA 5IKBA 5JEIA 5HBCA 4H6DA 2E1SA 2G93A 4TOZA 3GZGA 2Q88A 4NEDA 4BDLA 1FTLA 3IORA 2ZNUA 4E0WA 2QL3A 2F36A 3RQTA 2OWSA 4UA8A 1NH7A 5AA1A 3H6WA 4KPTA 4Z0IA 3FASA 4DE8A 4LA9A 5H8QB 4F2OA 1JQFA 2DP8A 3FV2A 4K3FA 2F34A 2XXIA 3PUZE 1UQWA 2XXYA 1MQHA 1NNFA 4XTCQ 4RY1A 1B9JA 2F7BA 3OOAA 3OENA 4GD5A 2PT2A 3TAJA 3RNNA 4OENA 3M3FA 2B3BA 4U21A 4KYSA 4XIGQ 4ZZAA 3LBSA 3G3GA 1H3DA 1MS7A 4WEPA 3QUJA 4FE8A 4KYEA 4YZZA 4JDFA 4F39A 3K4UA 2DVZA 4NE4A 3U72A 1LB9A 3EHTA 5M2VA 3W15C 2VHAA 4KI0E 4YB5A 4IY6A 3MPKA 4IO3A 3PPPA 3FIRA 4ECFA 1KWHA 3A3UA 3DM0A 2HEUA 3EHSA 1AL3A 5IAIA 1IXHA 1XS5A 3TTMA 4OMBA 1SQYA 1URDA 4I62A 4YKJA 1Q1KA 5DEXB 5I84A 5F1QA 2ZYKA 3VXCA 2QSXA 4NF8B 4GRKA 3D4GA 3MZBA 3FVGA 5ITPA 4U1OA 5L9SA 1F9BA 1ZU0A 4N6PA 3RT8A 2I6EA 3FXRA 4R72A 1SW5A 4KD5A 4ZEDA 4HCYA 5CMKA 1N7XA 2O6AA 4FEDA 2H25A 3FD3A 2O7UA 4R6HA 4H0WA 3MAMA 1IITA 1MXWA 3K6VA 3Q27A 1MY1A 3G3FA 2V93A 3U8QA 5H8NA 4IO4A 3MP8A 4X9TA 2FA7A 1IUDA 4QFOA 4ZECA 3K1MA 3KN3A 5CMBA 2OLBA 3HHGA 3CRBA 5CI5A 3KN8A 4IGRA 3BKIB 3HSTA 2Z8EA 3CFXA 1PB9A 3FATA 5H8SA 3H6VA 3CG3A 2R71A 2DWIA 4MF3A 5I57A 1IZ1A 3TZAA 1UTHB 4H8JA 3O6IA 4L17A 2OJTA 4FECA 1Y1ZA 4Q0CA 4PETA 1LLSA 5ICTA 4G2ZA 1FQEA 1RKMA 1YPNA 4QF9A 3MQ9A 3DP8A 4PFYA 1MXUA 1M5BA 3RPWA 4H67A 1BP5A 1H76A 3OSRA 5I2NB 2ZYMA 3FZVA 3MVXA 1N0TA 2G29A 4OFJA 1P1OA 5FHOA 4HW8A 3FVNA 3Q25A 5K2YA 1D4NA 4RXLA 5L9MA 4GOTA 4G68A 2F7CA 3ONMA 5KDTA 4H5FA 2Z23A 3O9PA 2BJJX 4ZEBA 1SW1A 3GBBA 4OESA 4FIMA 1R9QA 1NKXA 3HCQA 2NVUB 1DPPA 2Y7RA 1B52A 3T96B 1B3EA 2XX7A 1B7HA 5I59B 3OO6A 2RKMA 1ANFA 2PBWA 3CI8A 2D3IA 3ZSFA 4BDRA 3TTNA 1A7LA 3MP6A 5TPAA 4R9FA 4KHZE 3H4ZA 2PYYA 4AQ4A 5KCJB 1B1HA 2QS4A 3JYRA 2F35A 1TT1A 1HSLA 1VR5A 4Q8RA 4DZ1A 1ZIUA 3TPAA 3THIA 3U93A 1YTVA 1LFGA 5CC2A 4F31B 1MDP1 1MH4A 3C4MA 1UTBA 2UVJA 1NNKA 2RC9A 1Y3NA 3SETA 1I6AA 4Q5TA 1Y3PA 2XXQA 4N07A 3N6UA 1MRPA 1QULA 2ALUA 3RGYA 2VGQA 4NTLA 3PPRA 4AB5A 1MQIA 1N76A 4F2QA 1H45A 2IEEA 2AIXA 4ESWA 3S9EA 5A5XB 4G68B 2ZNTA 1OVBA 4YB7A 4NF5B 2F7AA 3QXMA 1IXIA 5HPQA 5CBSA 4P0GA 3FJMA 4R75A 4H65A 4LVQA 2CMOA 1R9LA 5ITOA 3ILTB 4R74A 2I0BA 2DWAA 4KYDA 3Q29A 4E0XA 1M5DA 1US5A 4F18A 3G3KA 4G77A 4LZ7A 4TQUQ 3VDFA 2XXHA 4GFRA 3MW0A 4DXUA 4YKPA 1AH5A 1POTA 3M3KA 4POXA 4R73A 1PBQA 5TPAB 2XXTA 3EHUA 4LQ5A 1SDXA 1HSJA 3LR1A 1LB8A 2X7PA 4FAJA 3B6TA 1MM7A 4IY5A 1WDNA 1B4ZA 3KOSA 4G8MA 3S9LC 3TUSA 3OSQA 2REGA 4ND9A 1SBPA 2F5XA 2RCBA 4GL0A 4R6YA 1EH3A 3PPNA 1P1QA 3T9XB 1UTBB 2DSFA 1QVSA 4PP0A 1GV8A 4IGTA 1BKAA 3QUFA 2H99A 3OO9A 4Q30B 4G68C 4F19A 2ONRA 3ZS6A 3QYTA 3MVYA 2ABHA 1VSOA 5TU0A 4ELOA 2B65A 2M8CA 3KZGA 5EHSA 3SERA 4OVJA 3O6HA 3I5OA 3GBAA 2VOZA 1JEVA 1WODA 5DEXA 1D9VA 4NF8A 3H7MA 3AXFA 1ELJA 1PEBA 2OK2A 4RA1A 4MLVA 4ZEIA 3ILUB 1EU8A 2Q2AA 2Y7WA 4JSOA 1B6HA 3V5AA 3C33A 1OVTA 1S50A 3DP6A 4F3BA 3IAZA 4O3CA 3FUZA 4AB6A 2DQVA 2YJPA 4ZS9A 1LSTA 3TTRA 3ECRA 4QSCA 2HZLA 3K6WA 4XXUA 3FVOA 3IJOB 3G3IA 4F1YA 1FW0A 1AIVA 1A54A 1FTKA 4YAHX 2HAVA 4OETA 2Z22A 2GH9A 4WEDA 3I6VA 3OD7A 1MPDA 1LCTA 3GXAA 3F11A 4QSEA 4JWYA 2NXOA 4GWOA 2V25A 3CG1A 3TELA 3U94A 1B05A 3LSWA 4GLIA 1YCJA 4U2RA 1MDQA 5F7VA 1UTHA 1LBBA 1HSEA 4JB7A 3KFMA 2RINA 2O7IA 2ONKE 3C35A 1NNPA 1LCFA 4IO5A 4OERA 4EF2A 1MXVA 1XC1A 1ZMGA 3VLUA 4DCXA 3IB1A 1A99A 1QUIA 3FJGA 3M8UA 2F6PA 4QFLA 2Y84A 2QS3A 1IEJA 4X1BA 4U4SA 3DELB 3RT6B 1XVXA 3UN6A 5I2NA 1B0LA 5DVIA 2RCAA 1YAEA 4ZDMA 1OQHA 3C9HA 4JXIA 2XXVA 1QW0A 1XT8A 1II5A 1US4A 1NH8A 2REJA 4F3GA 1EZOA 4YKKA 3KBRA 3S9MC 2GFEA 2XXXA 1ZKBA 4OFLA 3SEUA 4ONYA 3PUVE 1FQCA 1B7ZA 1H44A 1QKAA 3K6UA 3TFLA 4ZZEA 3S9NC 3E13X 2XXUA 5LOMA 1LBCA 5JTYB 2NWJA 5I59A 4KR5A 2Q89A 5AA4B 5BUUA 1Y1MA 1FTOA 4YKIA 1MQJA 2GHAA 3Q28A 1LFHA 1BTJA 1ZJLA 4EXLA 1FQFA 3TMGA 4ZE9A 3CSGA 5KCJA 1QJMA 3TCHA 5CBRA 3W9WA 1DPEA 1TXFA 4HS7A 3QK6A 1L5TA 4RJZA 1URGA 4U4XA 1P1UA 3MZ9A 1H43A 1JVXA 3IOUA 4QFNA 3IOWA 5FTHA 1Q35A 2XX9A 2DXRA 4G4PA 2I0CA 4MBPA 2QMXA 5BWJA 1SW4A 2DXYA 3N6TA 1LGBC 2HZKA 3TQLA 1TFAA 4Z7EA 1SI1A 2DVCA 2RC8A 3KJ7A 4EQBA 1MQDA 3KGCA 2GHBA 2F6GA 5AE4A 1EZPA 2I3WA 3KSJA 3R26A 4FATA 5H8FA 4ZEKA 2QS2A 3W9VA 2RF1A 2THIA 4OZ9A 2R9JA 4EQ9A 2F78A 1OMPA 2IA4A 3E4RA 1CB6A 5ELVA 3UORA 1MG1A 1B3HA 4LP2B 1DTGA 4H8IA 3P7IA 1JW1A 1O7TA 5AA2A 5AA3A 5A5XA 1PBPA 3R7XA 4NF5A 2YLNA 4P11A 4QRZA 1A40A 3KN7A 1VFEA 4ZEFA 4GF8A 4LATA 2CZLA 3M3LA 5DT6A 3MZ1A 2DWHA 3T9UA 3VFJA 3LSLA 3RY3A 3KG2A 1PB7A 2UVHA 4DIGA 4EDPA 2VP1A 3SEXA 2Y7PA 3U1OA 2OCUA 3OO7A 5B7DA 4OFOA 2OZZA 4C1UA 3IO6A 2UVGA 5L9OA 3T9HB 4DDDA 1R1NA 1WVJA 1IQ7A 2DYXA 1POY1 1B7UA 2Q9TA 4JBZA 1AMFA 1LAHE 1MM6A 2P0SA 3IK6B 2UXAA 4H1XA 1IXGA 2ZXTA 2Z8DA 1FQAA 5JK4A 3HV1A 3V89B 5H8FB 4XKQA 4DCYA 3T93B 3SKPA 3SEVA 2DWJA 4IO7A 3IOTA 2DE2A 4EQ7A 2PX1A 3L6HA 4PE5B 2O1MA 3CIJA 3H6TA 2Y7IA 5FHMA 4GL8A 5AA2B 3B7DA 2AL5A 3VLWA 3KEIA 2DE4A 3IL1B 1BLFA 3PPQA 5K2XA 3N5LA 1MH3A 3H06B 1RYXA 4PFTA 1SI0A 2UYFA 2HFBA 2F8DA 4OEUA 4ISUA 4M4GA 2OBGA 1B1XA 2FYIA 4TLLB 2ANJA 3B6WA 1SVXB 2W7YA 2O84X 1PB8A 4YMAA 1USYE 4DXCA 2I58A 1PC3A 3PU5A 2A5SA 1Y4CA 3DLNA 1B40A 1Y9UA 3OEMA 3E9XA 2A5TB 4YICA 1DOTA 4QHQA 4KFQA 5CMMA 1S7YA 3C31A 2I3VA 2PMSA 5FHNA 4JWOA 4NF4A 1S9TA 3MPLA 1T0KA 3Q26A 2Z8FA 1DMBA 3E3KA 4MH5A 4IO6A 2QJEA 1RYOA 2QMWA 1MPBA 1TFDA 2UVIA 5DVFA 3SEWA 3HN0A 4OHNA 1B51A 4OEVA 4RK2A 3IOVA 1Y20A 1FTJA 4FJPA 1SYIA 1MXZA 5FTIA 2H5YA 4F1UA 3HHFA 4POWA 2XXRA 4OQOA 1MY3A 1N7WA 1DTZA 1A8EA 1B4HA 5CM6A 4XKNA 3MP1A 1GVCA 3VVFA 1R6ZA 3TTLA 2DS9A 2O69A 3G3JA 3SEYA 1B3GA 1Z7NE 3HPIA 3TODA 2PVUA 3HO7A 2B3FA 1QKBA 3VE1B 3KSXA 5JTYA 3DP4A 4KCCA 1LFIA 1LAGE 5AA4A 1N3WA 4PQJA 1UIVA 4X1DA 1P1NA 4THIA 1IXCA 2ZYOA 4OXVA 2DE3A 2V3UA 1A55A 1LAXA 2ZYNA 2P2AA 3A3CA 4HTGA 4BDQA 1JVYA 4LONB 3UIFA 2I4BA 2LAOA 3FV1A 3KOTA 2QS1A 3U92A 3OEKA 4NF4B 3K01A 3RUMA 3IB0A 4KQPA 3TEPA 2P1SA 1FCKA 3K0VA 2F97A 4PFWA 3QIMA 2UYEA 2QPQA 3K02A 2ESNA 3L6GA 5EHMA 4UACA 4TLMB 3LSFB 3RN8A 1URSA 5I56B 1B0HA 4LZ8A 3IR1A 1B46A 1SYHA 5HM4B 3V83A 3N94A 2Y7KA 3C32A 1Z7ME 3TTKA 2ZNSA 3MBPA 4OWDA 1MPCA 2R6GE 1ZLQA 2E0SA 1GR2A 4LZ5A 4GQOA 2NUVA 3T22A 3TYHA 3CR9A 2XD3A 3UA8A 1I6BA 3WAEA 4NWCA 4F1VA 3BFTA 5L8DA 2X7QA 3EQ1A 4BDMA 1TWYA 3B6QA 4EUOA 4O3BA 3LC8A 4N13A 3RTFB 3VVEA 1MY4A 3IB2A 4DLDA 4P0IA 3WAFA 1I69A 1JETA 1D9YA 3FXQA 4DXBA 4YMBA 3VV5A 3RLFE 1SW2A 3TCGA 2VD3A 3K1PA 1EZ9A 4RNSA 4RPNA 4U23A 3I3VA 3O28A 3USDA 3FGSA 1DSNA 1O64A 1XOCA 5I58A 1B3LA 2H9BA 3CSBA 3PMXA 3O29A 3EF7A 4R2BA 3PMWA 4F3SA 3TCFA 1B5HA 1P1WA 3PD8A 3JZJA 4ESXA 5CRYA 1I6QA 4FORA 4WXJA 2D21A 3GLBA 4QFKA 4ELRA 3IO4A 3PPOA 1USYH 2AYSA 3H3GA 3N26A 4I8CA 1M5FA 3IJXB 3OO8A 3LUYA 1OIBA 2Q2CA 2XXWA 4R2FA 5I2KA 5ICQA 4I9DA 3SESA 3PD9A 3TKDA 5H8HA 3K6XA 1ZBMA 1MY2A 3PV0E 1MXYA 3FJ7A 5ISUA 1MXXA 2H4IA 1VFDA 4ELQA 4ELPA 5CMCA 3BFUA 1AOVA 4QFPA 3MWBA 3C34A 1B58A 3UK4A 5TP9A 2HXWA 4WKMA 3CFLA 1B2HA 4XKRA 2Q8JA 3R6UA 1B5JA 1PDAA 3O97A 4U1ZA 3PUWE 3IX1A 3O6GA 5EYFA 5DYHA 4PFUA 3K2DA 3G7WA 3QAXA 3VLVA 3FXUA 4F29A 1N3XA 2HCAA 3G3HA 4LUBA 1LAFE 4U22A 2DOJA 2D5WA 3KJTA 4RPOA 2A5TA 5H8NB 4BDOA 5I58B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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