3JZJA

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
ELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces glaucescens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
total genus 137
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3jzjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3jzjA02
4RK9A 3FVGA 1M5CA 1MXZA 3MVXA 3MWBA 3C36A 4GXSB 3TTRA 3V83A 3K1PA 4PFWA 1YAEA 4H8JA 1B46A 4P0GA 1PB7A 2FNCA 4DXCA 4BDMA 3KGCA 5DT6A 2DVZA 4BDQA 4Q0CA 3IR1A 2D3IA 1Y1MA 4OXVA 5H8SA 1LB9A 1JNFA 5K2YA 3TODA 2OLBA 2NXOA 3ILTB 4KQPA 4WKMA 4AB5A 1NL5A 2D5WA 1PB9A 2REJA 2RINA 1SQYA 1F9BA 3DP8A 1KWHA 1LAGE 3LSXA 3S9LC 1O7TA 2ONRA 3LUYA 4XKRA 1B7UA 1MXWA 2XXWA 4OMBA 5HM4B 2BJJX 5HBCA 1FQBA 3KOSA 1GR2A 2CZLA 2XD3A 3O2AA 1MS7A 4RJZA 5CBSA 4OERA 1MPCA 3OELA 3O66A 3MZBA 4ZE9A 5H8NB 4LVQA 1IXHA 4OYVA 4EQ7A 5JEIA 1JQFA 1H3DA 1B3LA 1JW1A 1M5EA 1VFDA 3IAZA 2OWSA 2UVIA 3CFZA 3FV1A 3MP8A 2F7BA 3B7DA 4PFTA 5F7VA 3V8XB 3O6GA 1LGBC 4FORA 4DLDA 3OEKA 2HXWA 4NF8B 3DP6A 3PPOA 4H6DA 4G4PA 3OOAA 4DE8A 1BP5A 4OWDA 4G77A 4MLQA 2Y7RA 2B3BA 5L9SA 1B3HA 5H8HA 4EF1A 1Y4TA 4EXLA 1TXFA 1P1QA 4F2OA 1CE2A 1EZ9A 1R9LA 3JV9A 3THIA 5BUUA 4FAJA 1D3KA 1XS5A 3TZAA 1N7WA 1M5DA 5CRYA 3PU5A 1SW4A 4IO3A 5F1QA 3QIMA 2DSFA 2F97A 2R6GE 2V84A 5DTBA 5H8QA 3HHGA 5TP9A 4ONYA 3RN8A 3M3LA 4YMBA 5AA4A 3LC8A 1FQFA 2O51A 4ESWA 1B2HA 4Q30B 5DEXA 5KCJA 4BDLA 3U72A 2QRYA 1N7XA 2F36A 4G8NA 1ZJLA 2OZZA 3TQWA 4OTEA 4LZ5A 1B1XA 2QS2A 4JBZA 2ZYOA 4L17A 1IITA 1IXIA 2Z8DA 4YZZA 4JWOA 2V3QA 1BLFA 2DOJA 3KG2A 4FE8A 4HCWA 4NF5B 2QMXA 1ZU0A 1IIWA 1SBPA 2DQVA 2GHBA 3H6UA 3I6VA 1VSOA 3E9XA 1BTJA 4FEBA 4G68C 4RPNA 3IO4A 4XTCQ 3SEXA 3TCFA 1PDAA 5H8HB 3VVFA 1M5FA 4O3AA 3WAFA 3FIRA 1OMPA 3CSBA 3K4UA 3IB2A 3PUYE 4FATA 5HPQA 2G29A 5I84A 1MPBA 4F3BA 1QULA 3O29A 1B1HA 2QSXA 2FYIA 1MH3A 2GFEA 3IL1B 2F5XA 3MVZA 1HSJA 2HCAA 2VOZA 1OQHA 3SEVA 1UIUA 5I2KA 4OEUA 1MY2A 3FGSA 4WXJA 1EH3A 3B6TA 4ZEIA 1P1UA 5AA1A 2Q8JA 1Y4CA 1LLSA 2VD3A 3HN0A 3OENA 1GV8A 1Q35A 3W9WA 2X7PA 3K6WA 4G2ZA 4GD5A 4MF3A 4N13A 3HPIA 4KR5A 1QVSA 1B3EA 4R74A 3IOVA 1LB8A 4ZEFA 1SW1A 5ELVA 4H5FA 3OD7A 1POY1 3CRBA 4DCXA 2PT1A 1BKAA 3VLWA 3HHFA 1B05A 2DYXA 1LAHE 1LSTA 1PBPA 2P0SA 1LCTA 3EQ1A 2ANJA 2HAVA 3TEPA 1EZOA 2O68A 5I57A 1TWYA 3M3FA 2ESNA 4X9TA 3QSLA 1WDNA 2XD2A 1HSEA 3GBBA 1YPNA 3PUZE 1GVCA 3FJGA 3UGWA 4JWYA 3VVEA 4F3GA 2NOOA 2ZXTA 3IORA 1FQAA 1SW2A 3GZGA 5KCJB 5FTHA 3W15C 1Z7ME 1N3WA 4LUBA 4F3PA 1B0LA 4FJPA 4BDOA 5AA2B 3KN3A 1TFDA 3FVNA 5I57B 4H1XA 1MY3A 2AIXA 2DWJA 3OSQA 4OVJA 4ZDMA 4KPTA 5DYHA 3G3HA 3KZGA 2XX9A 3N6TA 2G93A 1R6ZA 2ZYMA 2THIA 4AB6A 3HSTA 4F3SA 2XXQA 2V93A 1QUIA 3R26A 1N84A 2I6EA 3QYTA 3H4ZA 4EQBA 3BFTA 4YMAA 4POWA 4GF8A 2PMSA 2X7QA 3G3GA 4Q8RA 1Y3QA 5CMBA 3H06B 4JXIA 4G68A 2YPNA 3KJ7A 4E0XA 2HQ0A 3RTWB 5IAIA 3K6UA 4HW8A 3LSLA 3I5OA 1AH5A 2PT2A 2V3UA 3I3VA 3U93A 4X1BA 1DPEA 2AL4A 2VP1A 4OESA 2XX8A 5CC2A 2M8CA 3PPNA 4H65A 3UN6A 3PUXE 1ZLQA 2QS1A 3Q29A 2HEUA 3ZSFA 5TU0A 1B9JA 4PQJA 2I48A 1L5TA 1XVYA 4RNSA 2UVHA 3M8UA 4U4SA 5H8QB 1MY0A 4GQOA 2PYYA 3D4CA 1XC1A 3AXFA 2PX1A 1US4A 2OBGA 5CI5A 5AA2D 4G8MA 4TLLB 1XOCA 2F34A 2RCBA 3GBAA 3UORA 5M2VA 5I58A 1PEBA 3PUWE 2XXRA 1IQ7A 2H99A 5I56A 3ZKKA 4ESXA 1QUKA 4NMYA 3OO7A 3GLBA 4NF5A 5JTYB 3RLFE 4BLAA 3K01A 2I0CA 3TCGA 5L9OA 3HO7A 1MDP1 2F8DA 1JVYA 1URSA 2IEEA 2NUVA 4MFIA 4YU0A 1FTKA 4OENA 3TDJA 3S4UA 1JETA 3T9VA 4PP0A 4ZEKA 1LCFA 1OVBA 3C32A 3H3GA 1USYE 3VE1B 1MM6A 1QW0A 4YB6A 2UVGA 3N6UA 5AE4A 1B4HA 5JTYA 5CBRA 4F1VA 4WEPA 1POTA 5AA4B 4XKQA 3TELA 3VFJA 1B4ZA 2I0BA 4RPOA 5A5XA 3QUJA 1DTZA 4YKKA 3C35A 3OSRA 2XXIA 3JZJA 1MQIA 4POXA 1JEVA 3MPLA 1GTKA 1NNFA 1MPDA 3EHSA 3TTMA 4YAHX 3GXAA 2I3VA 1IEJA 1A8FA 3PD9A 2W7YA 2ZNSA 3U1OA 3Q28A 4LATA 1MQJA 1A8EA 2ALUA 4ELPA 3VLVA 2XXHA 1B3FA 3FJMA 3K2DA 5TPAB 4GWOA 4IY5A 5AA3A 3A3UA 1MRPA 2GRVA 3A3CA 5CMMA 4BDRA 4I62A 4JB7A 1DOTA 1P1NA 1P1WA 4U23A 3MC2A 2Z8EA 4LQ5A 3UIFA 5CMCA 1UTHB 4QSEA 3SEUA 5I2NB 3QAXA 1IXGA 3PMVA 1QJMA 3FASA 3V5AA 1XVXA 1XT8A 2UXAA 3DLNA 4U21A 3L6HA 4HCYA 1O63A 1UIVA 1VE4A 4OFJA 3MAMA 4GVOA 1II5A 2X26A 1WODA 2Z23A 3Q25A 4JDFA 4JSDA 5I58B 4YICA 3P7IA 5I59B 1OLCA 3PMXA 2Y7IA 4ZE8A 3IJOB 4TLMB 2RC8A 1I6BA 3O9PA 4R2FA 4C1TA 3MZ9A 3UK4A 2B3FA 3FXUA 1R1NA 4PFYA 4R72A 1NMUA 1JVXA 3K00A 3MUQA 4IO2A 4ELQA 5KDTB 4P11A 3SEWA 1PC3A 2ZMBA 3Q26A 4R6YA 3IJXB 5EHSA 1DPPA 3SETA 1B32A 3CFLA 2ZYKA 2H5YA 3EN3A 1LAFE 3OO9A 4OFOA 3RT6B 3SKPA 2UYFA 4H8IA 3Q27A 4FIMA 4QHQA 1Y9UA 4IGRA 4IO4A 3EHUA 4R2BA 2Q89A 1EZPA 2I58A 3DM0A 5DVJA 3TFLA 1OLAA 2OJTA 5LOMA 3CR9A 1QKBA 1URDA 3KSJA 3PPRA 4ZS9A 1B5HA 1SVXB 2H98A 1RYOA 2Y7KA 3C33A 2O1MA 3E3KA 2P1SA 4OEVA 3SESA 2DE4A 1MQDA 2I4CA 3DP4A 1B40A 1VFEA 2F6GA 1ZKBA 3E4RA 3FV2A 3KN8A 3EHTA 3O6IA 3OMBA 4H5GA 3G3IA 3U94A 2NWJA 4F2QA 1MH4A 2E1SA 2H9BA 4DXUA 5IKBA 3K6VA 3MVYA 2F78A 4YKIA 4IGTA 4LP2B 4OQOA 2AYSA 4R6HA 3SDFA 3T22A 5FHOA 3TYHA 4F19A 4GIZA 4QFPA 1Y3PA 1I6QA 3G3FA 4NF8A 1SI0A 1VR5A 3M3KA 3KBRA 1ANFA 4ZZAA 3HCQA 2RKMA 3BKIB 4Q5TA 3ONMA 3TKDA 2HZKA 2Z8FA 1TFAA 4G68B 4LZ8A 5BWJA 1S7YA 4RXLA 3U92A 2OWTA 3FATA 4KI0E 3V89B 1O64A 4QFOA 3CI8A 2DVCA 3KN7A 2HZLA 1D9YA 2RC9A 1NH8A 3QXMA 3C4MA 4BDNA 2Y7WA 3VV5A 1P99A 3OO8A 4NTLA 2UYEA 2ZNTA 4EDPA 2IA4A 2Y84A 3IK6B 3VDFA 1PBQA 2DWAA 3ZS6A 2WKYA 1B58A 1S9TA 3CSGA 1N3XA 4R9FA 2DS9A 1SDXA 3PUVE 3QUFA 1CB6A 3S2VA 3UP9A 2H25A 3H7MA 5L8DA 3IB0A 5TPAA 5AA2A 2Y7PA 4HS7A 2XXYA 4UA8A 1US5A 1B6HA 5H8FA 3IOUA 2HAUA 4EF2A 1SW5A 2O7UA 1P1OA 3N94A 2R9JA 1BIYA 4IY6A 2GH9A 3RTFB 1NNKA 4ZECA 3ZKLA 2ABHA 1B7ZA 5ITOA 1FQDA 3CFXA 5B7DA 3K1NA 4ISUA 1MQGA 1TT1A 3EF7A 4GXAA 3PPPA 1HSLA 4X48A 3CVGA 4AQ4A 2VHAA 4WEDA 2ONSA 4C0RA 2HFBA 1Z7NE 2Q9TA 3O6HA 1SYIA 1MXYA 1QUJA 2A5TA 2UVJA 4UACA 3RNNA 4F22A 2Q88A 3PD8A 2D21A 1AL3A 1I69A 4F1UA 2XHDA 3K02A 4KYSA 5DEXB 4KYDA 2DWHA 4QF9A 1H43A 3TTLA 3USDA 1DMBA 4DZ1A 4DCYA 2Z22A 3K6XA 4U1ZA 4DIGA 1UTBA 3BBRA 4QRZA 3FXQA 5ICQA 4JSOA 4QSCA 5H8NA 3MP6A 3LR1A 2NVUB 3G7WA 2YLNA 1GGGA 1I6AA 3MP1A 1Q1KA 4EQ9A 5I59A 2OCUA 4G8HA 1SD3A 4M4GA 4KHZE 3MPKA 4MH5A 1XHYA 4O3CA 3TPAA 3C31A 4U4XA 5I56B 3CIJA 1M5BA 2O1LA 5EYFA 4NF4B 1NKXA 4KFQA 3H03A 3PPQA 4LONB 1B5IA 4GL8A 1MY4A 4KCDA 5B70A 2ZNUA 3RPWA 1N0TA 2XXXA 1Y1ZA 4XIGQ 3T9XB 4LQ2A 5ITPA 1IXCA 2DE3A 1B52A 3DELB 1DSNA 4HTGA 2F6PA 1UTHA 4R73A 4ND9A 1OIBA 2DP8A 1DTGA 1LBBA 3W9VA 4KYEA 3ILUB 4NE4A 1YCJA 4F29A 2LAOA 4RK2A 4RY1A 4FECA 4TQUQ 3TTKA 5FHNA 1YTVA 5H8FB 1FTLA 2F7AA 3VXBA 4H0WA 3IX1A 4M1VA 4E0WA 5TP9B 1B0HA 4OFLA 5KZTA 1B7HA 1H44A 1S50A 4ZZEA 4LZ7A 4F31B 4YB7A 2DE2A 2PBWA 3PV0E 2CMOA 3VXCA 2REGA 3QK6A 2Q2CA 1RYXA 4R9GA 1MM7A 1H76A 4GLIA 2O7IA 2VGQA 2P2AA 1LFGA 3MJNA 3MZ1A 4GRKA 5DVIA 1MXVA 1QKAA 1Y20A 2VD2A 4PE5B 3JYRA 4X1DA 1MG1A 5K2XA 1ZIUA 4EUOA 4LA9A 2YJPA 1EU8A 3IB1A 1ELJA 3IO6A 4NF6B 2ONKE 4QFKA 2KLFA 4I1DA 3E13X 4QFLA 5CMKA 1LAXA 3ODBA 4DDDA 3KFMA 5ICTA 4F18A 2V25A 3FD3A 3KEIA 3EPEA 3MQ9A 4QFNA 4U1OA 2QS4A 2RC7A 3WAEA 1JEUA 1AMFA 2QJEA 3FVOA 2PVUA 2XXUA 3PMWA 5FHMA 2V3TA 4R6KA 5CM6A 3K1MA 3L6GA 3N5LA 4OHNA 1LFHA 2ZYNA 1URGA 1ZTYA 1H45A 4ELRA 1A54A 1NNPA 1NNTA 1OQGA 1FQEA 1R9QA 1A55A 1B5JA 2A5SA 3FJ7A 3MW0A 3PGFA 5EHMA 5FTIA 4ELOA 3TUSA 4YKJA 1D9VA 3MBPA 1B3GA 3HV1A 1USYH 2XXPA 4N6PA 4THIA 4IO6A 3C34A 3KOTA 1A99A 4QSDA 1RKMA 3TAJA 2DWIA 2DXYA 1NFTA 2A5TB 2B65A 4MLVA 3F11A 3C9HA 1MDQA 5J1DA 2RF1A 1JW5A 3H6TA 1MY1A 1SYHA 3RQTA 4F1YA 1SI1A 4IO7A 3T66A 5KDTA 3TCHA 2I4BA 2O84X 4MBPA 4U22A 3FUZA 3LBSA 3RY3A 3S9MC 4DXBA 3OEMA 3H6VA 4KD5A 4RYAA 1UTBB 3U8QA 5DVFA 2R71A 3LSWA 3S9EA 4XXUA 2FA7A 1D4NA 3BFUA 2I49A 4FEDA 4PFUA 4Z7EA 3S9NC 4RA1A 3N26A 2QPQA 2RCAA 3T9UA 4NWCA 3UA8A 4F39A 4OETA 3R7XA 4EXKA 2F35A 4ECFA 3FVKA 1N04A 3IOWA 5JK4A 2DXRA 4JWXA 3VVDA 3T9HB 1FTMA 4NWDA 1WVJA 3T93B 1FQCA 5I2NA 3TQLA 4GL0A 1AOVA 3KSXA 1MXXA 1PB8A 2I3WA 2QL3A 4C1UA 3FZVA 5A5XB 4YKPA 1LFIA 1ATGA 1JW4A 1FTJA 2QS3A 1A7LA 2GHAA 4U2RA 3G3KA 3OXNA 1A40A 5L9MA 3G3JA 4I9DA 4Z0IA 4O3BA 3VLUA 1Y3NA 1MQHA 2XXTA 4KCCA 1FCKA 4ZEDA 1IZ1A 1T0KA 4H67A 4GFRA 1ZBMA 1IUDA 3B6QA 4ZEBA 2E0SA 4PETA 4GOTA 1FTOA 3H6WA 1N76A 3SERA 2O6AA 4OZ9A 1AIVA 4N07A 3CG1A 4XKNA 2O69A 2OK2A 4P0IA 3LSFB 4IB2A 4K3FA 3RUMA 3TMGA 1MXUA 3T96B 1LBCA 3IOTA 4IO5A 1ZMGA 3TTNA 5I2KB 1B51A 2Q2AA 3SEYA 1UQWA 1OVTA 4NF6A 3A09A 3O97A 2QMWA 2F7CA 4R75A 3RT8A 3K0VA 1NH7A 3ECRA 3RGYA 3CG3A 4NF4A 4XKPA 3FXRA 5ISUA 3R6UA 4YB5A 2AL5A 1J1NA 3B6WA 4I8CA 3OO6A 2H4IA 3MVWA 1FW0A 3KJTA 4NEDA 4TOZA 3O28A 3D4GA 2XXVA 2XX7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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