3K6XA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in molybdate-bound close form with 2 molecules in asymmetric unit forming beta barrel
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
340
structure length
322
Chain Sequence
b'IPTTENLYFQEVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule tags Transport protein
total genus 96
structure length 322
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6xA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6xA01
4P0IA 2O68A 1B9JA 3A3CA 1MY1A 1UIVA 3SERA 1LLSA 4ESWA 5I57B 3ECRA 1XT8A 3PU5A 2UVJA 4DE8A 3R6UA 3IL1B 4GXSB 3PMWA 2F7BA 2H4IA 3O6IA 5ICTA 1SVXB 2I3WA 5H8SA 1GV8A 3HSTA 3RY3A 4R74A 1GTKA 5F1QA 4QRZA 1WVJA 1MG1A 2PMSA 3QK6A 2Y7KA 3LSWA 2ZXTA 3BFTA 1LCTA 4H65A 4X1BA 3FUZA 1MY0A 3E4RA 1R9LA 2FYIA 4E0XA 1MQDA 4NWDA 4H0WA 3MZBA 1UTBB 1MQHA 3T66A 4IO3A 4YKKA 1UIUA 3GBAA 5A5XA 2F6GA 4IB2A 3OO6A 1B40A 3FVGA 1LSTA 4EXLA 4NTLA 1Q1KA 5ICQA 4GFRA 4KCCA 3C36A 4C1UA 2XD3A 4R9FA 3M3LA 3QUJA 1LCFA 1PB8A 1VSOA 1B5IA 4AB5A 3I6VA 5DEXA 1N0TA 3IOWA 3T9XB 2OWTA 1JVXA 2Q88A 3WAEA 4U23A 3MPKA 1MPCA 3FXRA 3K2DA 2DE2A 4XKPA 3CG1A 4OFJA 1ZLQA 2DVZA 2A5TA 3O29A 4JSOA 4X1DA 4EUOA 2DYXA 1FTJA 3MPLA 2DVCA 4JWXA 4G4PA 3MW0A 1AIVA 5KDTA 4FORA 4LUBA 1FTOA 2Q8JA 4WKMA 4F3BA 5KZTA 4F2QA 4UA8A 4ZEFA 2V3TA 4RNSA 5TU0A 2VD2A 1MXVA 3IB2A 3OOAA 2O6AA 3CFZA 1EU8A 2ZYMA 1D4NA 1ZKBA 3G3HA 4M4GA 5H8NB 3E9XA 4X9TA 4OMBA 1IITA 3U93A 2XXIA 3C32A 3UK4A 1B46A 4QHQA 3KSJA 1PDAA 3SEYA 4JDFA 1P1QA 4Z0IA 1S7YA 2XXXA 4R2FA 1NKXA 2E1SA 3AXFA 4OFLA 1NNKA 3K6WA 3TZAA 2DS9A 1JVYA 3TAJA 2HEUA 5ITOA 2I4BA 2B65A 3DP4A 1ZU0A 4YMAA 4EF1A 3OELA 3G3FA 3VE1B 5TP9A 3USDA 5H8FB 2V25A 1B3HA 1MXUA 3UGWA 3TTNA 1AMFA 1O7TA 3HHFA 3IOUA 3SEXA 1I6BA 4DXUA 3MP1A 3ILTB 5K2XA 1LFHA 4Q30B 2RC7A 4ZE8A 5M2VA 1NL5A 4TOZA 1AL3A 1IXCA 3RNNA 4F31B 3RT8A 3K0VA 4F18A 4O3AA 2ONKE 1P1OA 2NOOA 1FQEA 1M5EA 3V8XB 1PBPA 3IJXB 1P1UA 4QSEA 4OWDA 3FGSA 3PPPA 5I56A 4ONYA 2O7UA 1NH7A 3H3GA 3CFLA 1LAFE 4RXLA 4BDMA 4QSDA 3TCFA 5JEIA 2F97A 4KFQA 5AA3A 3H06B 2GHAA 4LATA 3B6WA 3V5AA 1F9BA 1LFGA 2XX9A 5FTIA 2DWIA 1MQJA 2Y7PA 5DVJA 5A5XB 4UACA 1SBPA 2OCUA 3O97A 1B5HA 1D9YA 1A8EA 1FTKA 1NNTA 1OLCA 2Q89A 3GXAA 4U1OA 3JZJA 2RCAA 4OVJA 1EH3A 4THIA 3SKPA 3FV1A 3HPIA 1B4HA 4WEPA 3JYRA 1MQGA 2M8CA 4NF6A 2F78A 2H9BA 4BDQA 1DTGA 2H25A 1LB9A 1ZJLA 3KG2A 5I59A 2A5TB 1B58A 2QS3A 3I3VA 4KHZE 3K6XA 5DYHA 3T9UA 3RLFE 1Y4TA 3MP6A 3CSBA 3RN8A 2CZLA 2UYEA 1R1NA 3D4CA 2QMXA 2B3BA 5KDTB 4KR5A 1H44A 4G8NA 2Y7IA 1O64A 1DPPA 2D3IA 2FNCA 3RT6B 3CIJA 1PC3A 1A40A 1GGGA 3FXUA 2UVGA 3MC2A 4GLIA 2P1SA 4IO2A 1FQFA 1MDP1 3MVYA 3OO9A 3KBRA 1LAXA 1HSEA 3HHGA 2G29A 3M3FA 3CI8A 1N7XA 3E3KA 4ECFA 4ELRA 4XKQA 2HCAA 2LAOA 3T22A 1A99A 4P0GA 2AL4A 5FHOA 4F29A 1BP5A 3B6QA 3VFJA 2CMOA 4FIMA 4R9GA 2D5WA 1DTZA 3VVFA 3PD8A 2NWJA 2WKYA 2Q9TA 1MXXA 3KJTA 4ZZEA 4I62A 1DOTA 1H76A 3SEUA 3N6TA 4FE8A 5TP9B 4ZDMA 1DMBA 2UVHA 3ONMA 2XXRA 3H6TA 4H5GA 4KYSA 3L6HA 3H4ZA 4O3CA 3PMXA 1R6ZA 2I3VA 4F2OA 2REJA 3FVOA 2HAUA 4FECA 4N13A 4FJPA 1SW1A 1SW5A 3MZ9A 3HO7A 3S9MC 2NVUB 4F3PA 4PFUA 5CMKA 1SI0A 4KD5A 2HAVA 4U1ZA 2Z23A 4YKPA 3H6WA 2ANJA 3DP6A 5I56B 2AL5A 4FEBA 5DTBA 2BJJX 4WXJA 4K3FA 3CR9A 1QKBA 3O2AA 3TPAA 2OWSA 3MVZA 3Q27A 1VFDA 3OSRA 2XXTA 4IGRA 4QFNA 2OZZA 5ISUA 3KOTA 1Y3QA 1IQ7A 4DLDA 4R6YA 3KJ7A 5CM6A 1A8FA 2Z8FA 3CSGA 5EYFA 3MZ1A 4XKNA 4PE5B 2H98A 3LSXA 3ODBA 3T96B 4DXBA 4DIGA 4FATA 1D9VA 4YICA 3OEMA 4NF6B 3QXMA 4LZ7A 3D4GA 2ZNTA 3BBRA 1BTJA 1B7ZA 3N5LA 1BIYA 1SQYA 3PPQA 4EF2A 3G3GA 5I59B 4F3SA 5FHNA 4LZ8A 4G8HA 3L6GA 2UXAA 3K1PA 1ATGA 1NNFA 4NWCA 1VFEA 2IEEA 3IR1A 4KYEA 3IAZA 3MJNA 1Q35A 2PT2A 3RUMA 3PPNA 2I48A 4EQ9A 5HBCA 3M3KA 1IXIA 3EF7A 4XXUA 1NFTA 3CVGA 3PUVE 5CBRA 1QUKA 5H8QB 3I5OA 2XXQA 2V93A 1VR5A 3SETA 2ZMBA 1OVBA 4U22A 3VLVA 2I58A 4E0WA 1B3EA 4GRKA 2VHAA 2REGA 2YLNA 1TXFA 1Y20A 1P1NA 3LR1A 4XKRA 3TTRA 4OYVA 2HQ0A 1B5JA 3ZKKA 1MRPA 3A09A 5L9MA 3MAMA 4TLMB 3QSLA 1Y3PA 4I9DA 5I2KA 3OD7A 4BDRA 3G7WA 4POXA 5BWJA 1ELJA 3TQLA 1FQCA 2V3QA 1PEBA 4PFTA 4GOTA 2Z8DA 4G68A 3TTKA 1IUDA 5CMCA 3UIFA 3TMGA 3IJOB 4F1UA 5AA4A 1M5CA 3P7IA 3EHSA 5JK4A 5CBSA 4G68C 2ZNSA 4YU0A 4U4XA 2O1MA 3PUXE 1USYH 4YB5A 1JNFA 1OQHA 4ZEIA 1A55A 2VGQA 2OBGA 3UP9A 2QPQA 3FJMA 4ZE9A 4F1YA 1B1XA 3IO4A 1H45A 1MXZA 4HW8A 1SD3A 4HCWA 4MF3A 4R72A 1LFIA 2A5SA 1XC1A 2O69A 4KCDA 1Z7NE 3GBBA 2GRVA 3O6GA 2DWAA 1SYHA 4EDPA 4JWYA 3VV5A 1WODA 2QS4A 4LZ5A 1EZ9A 1B51A 4OTEA 4AQ4A 2DXYA 2I0BA 1I6QA 1OQGA 4DCXA 4EXKA 2DWJA 3R7XA 2H5YA 3LSLA 3Q25A 2DXRA 4KPTA 1MH4A 4ELPA 4MH5A 4OESA 4PFYA 2RKMA 1CE2A 3B6TA 4OXVA 2XXYA 1OMPA 3QYTA 4H5FA 3DELB 4JSDA 4HS7A 3QIMA 5H8HB 4BDNA 4YMBA 2ABHA 4X48A 2O7IA 1XVXA 4ZEBA 3JV9A 4GF8A 4N6PA 3U92A 2PVUA 2XXVA 4TQUQ 2UVIA 3IB1A 1FTLA 3MP8A 3TTLA 3V89B 1QW0A 3TQWA 2X7PA 3C9HA 1B6HA 5AA2D 2HZKA 3MVXA 4RK2A 4GVOA 1M5DA 3C35A 4DXCA 2DSFA 4NF8B 3N26A 5BUUA 2PT1A 5F7VA 1POTA 3DP8A 5CMBA 1N3XA 1LAHE 1H3DA 4RK9A 1QULA 3UA8A 4KQPA 3EHTA 4JBZA 5TPAB 1SW4A 4ISUA 1B3GA 3FATA 4L17A 1N7WA 4U2RA 4U21A 3PUZE 1ZTYA 3O28A 4ZEKA 4I8CA 1USYE 1SI1A 3TKDA 3LBSA 1M5BA 3VVDA 1NH8A 1HSJA 3TEPA 1RYOA 3OXNA 3PUWE 1FQBA 2F8DA 3IOTA 5H8QA 3OSQA 3FVNA 3SESA 1OIBA 5I2KB 1URDA 4IO7A 1Z7ME 5FTHA 3LUYA 3OMBA 4I1DA 5FHMA 4G68B 4RPOA 1YCJA 2YPNA 4G8MA 1NMUA 1LBBA 5KCJB 2QL3A 4FAJA 5AA4B 1M5FA 4ESXA 2QS2A 3KGCA 1EZOA 2F6PA 2I0CA 1B0HA 1I6AA 2ALUA 3C31A 2F36A 4FEDA 2Q2CA 4KI0E 1R9QA 3HV1A 3V83A 4YKIA 5AE4A 1RYXA 2O1LA 3RQTA 4H8JA 4F3GA 2XXUA 2V84A 4WEDA 2R71A 3O6HA 4ND9A 1MDQA 2VOZA 4YKJA 3OEKA 4QSCA 2I6EA 1Y9UA 1JETA 5CC2A 2AIXA 2VD3A 5I58A 3K4UA 1ZIUA 4MFIA 5JTYA 1LAGE 3DM0A 1XVYA 2ZYNA 4F39A 2V3UA 4LQ5A 4EQ7A 3CG3A 3W9VA 3K01A 1B3LA 5HPQA 2NXOA 1NNPA 3H6UA 1JW1A 2B3FA 2DOJA 1IXGA 3EPEA 4QFLA 1B4ZA 3IB0A 4LVQA 3FD3A 2PYYA 4H67A 2QRYA 3K6UA 1Y4CA 1H43A 1SYIA 4LA9A 4JWOA 4H8IA 4LONB 1QVSA 5K2YA 3SEWA 4ZZAA 4LQ2A 1MY2A 1T0KA 4YAHX 2P0SA 3DLNA 1TWYA 2R6GE 2ZYOA 5H8HA 5LOMA 3PD9A 2XXPA 4KYDA 4GXAA 3OO8A 1B7HA 1JEVA 1B32A 1MXYA 5EHSA 4NF5A 5CMMA 3B7DA 1BLFA 2RCBA 3OO7A 1AOVA 2I49A 1XS5A 1VE4A 2XD2A 4PP0A 1YPNA 1JW5A 4TLLB 1TFAA 4R6HA 5I84A 2RF1A 4G77A 4NEDA 2KLFA 1L5TA 4NF8A 3KOSA 4N07A 5AA2B 5HM4B 4LP2B 3RPWA 4GQOA 2GHBA 1DPEA 1US4A 1IXHA 3H6VA 2F35A 4NF4A 4PQJA 1A54A 4R73A 1SDXA 2RC8A 2DQVA 1FCKA 1B05A 4MLQA 4F22A 4YB7A 2NUVA 3G3IA 2GFEA 4OEUA 4C1TA 3G3JA 3R26A 5TPAA 4MLVA 2ZYKA 3Q29A 3RTWB 3FJGA 4C0RA 3Q26A 3QAXA 1B52A 4GIZA 1GVCA 3T9VA 3TYHA 4H6DA 4PETA 3KFMA 1JQFA 1URGA 3THIA 1YTVA 1UTHA 2GH9A 1Y1ZA 2FA7A 1A7LA 4XIGQ 3U8QA 4AB6A 2E0SA 2YJPA 3PPRA 1XOCA 3VXCA 1IEJA 4JB7A 1MQIA 3ZSFA 1US5A 2QSXA 2ESNA 4Q0CA 2THIA 2VP1A 4OFOA 3PUYE 3UN6A 2O51A 3K1MA 3TODA 1EZPA 3TELA 5B70A 2X26A 3KN7A 5KCJA 1GR2A 3BKIB 2OK2A 2XX8A 1P1WA 2DE3A 2G93A 2IA4A 3O66A 4U4SA 3MUQA 4G2ZA 1IZ1A 1QKAA 5L9OA 4HCYA 4QFPA 3O9PA 2RINA 3KSXA 1YAEA 4GD5A 3HCQA 3IX1A 1S50A 3WAFA 1URSA 4IY5A 1MY3A 5I58B 1QUIA 3S9LC 3PMVA 1POY1 2OLBA 5JTYB 4ELQA 4RJZA 3VLWA 2XHDA 2ZNUA 1B1HA 1N04A 5I2NA 3BFUA 4DCYA 3S4UA 1Y3NA 2HFBA 1B3FA 2XX7A 3FVKA 4IO6A 5DVFA 4DZ1A 3SDFA 3PV0E 2H99A 4YB6A 1QJMA 1MXWA 1B2HA 4IGTA 1SW2A 1RKMA 5B7DA 4Q8RA 1HSLA 1OLAA 1MPBA 4MBPA 3SEVA 2Z8EA 3FIRA 2D21A 3MWBA 1ZBMA 5IAIA 3ZKLA 5AA1A 5CRYA 1DSNA 1TT1A 4ZECA 5DT6A 4OERA 1MPDA 2R9JA 3RTFB 3C33A 4OEVA 2Z22A 3EQ1A 4NE4A 2DP8A 2DWHA 3A3UA 1II5A 1JEUA 1JW4A 4IY6A 4GL8A 4NF5B 5I57A 3TDJA 1B7UA 1S9TA 3FJ7A 3VVEA 1P99A 2F7AA 5ELVA 4Q5TA 2W7YA 4BDOA 4DDDA 1ANFA 2P2AA 3G3KA 4Z7EA 2HXWA 2O84X 3K02A 4IO5A 1TFDA 3H7MA 2PX1A 4NF4B 2XXHA 3IO6A 1ZMGA 4GL0A 4OENA 3TFLA 1N3WA 3RGYA 2Q2AA 2ONSA 1MH3A 2F5XA 3LC8A 2Y84A 1N84A 3T93B 3T9HB 4R6KA 3TCGA 4ELOA 5DEXB 2XXWA 4POWA 3ILUB 4RPNA 2PBWA 1UTBA 4OQOA 4QFOA 5AA2A 2F7CA 3FXQA 1FQDA 4OHNA 3LSFB 2Y7WA 3GLBA 4H1XA 3IORA 4F1VA 1UTHB 3Q28A 3U72A 2DE4A 4GWOA 4F19A 3VLUA 3FV2A 2I4CA 3U1OA 1J1NA 1Y1MA 2AYSA 5CI5A 2OJTA 1I69A 1PB7A 4P11A 3F11A 4QFKA 1XHYA 3K00A 1MY4A 3S9EA 3TTMA 2F34A 4BLAA 2RC9A 1B0LA 1D3KA 3MVWA 1KWHA 1QUJA 4R2BA 3QUFA 3H03A 3EN3A 3OENA 2QJEA 3KZGA 4R75A 1CB6A 2QS1A 2UYFA 3N94A 2Y7RA 4RA1A 4ZS9A 3FASA 3W15C 2ONRA 3KEIA 4PFWA 2X7QA 3MQ9A 4HTGA 3KN3A 4YZZA 1N76A 1AH5A 3C4MA 5EHMA 4OETA 2HZLA 3W9WA 1FQAA 3K6VA 5IKBA 3M8UA 3VDFA 3TCHA 3PGFA 1WDNA 4M1VA 3PPOA 3VXBA 5L8DA 1LGBC 3S2VA 1LB8A 5H8NA 4IO4A 5I2NB 5L9SA 4RY1A 5ITPA 4BDLA 3FZVA 1IIWA 3K1NA 4QF9A 4O3BA 1MM7A 3IOVA 3S9NC 3N6UA 3C34A 1MS7A 3CFXA 1FTMA 3EHUA 3GZGA 1PBQA 3IK6B 4OZ9A 3TUSA 3E13X 5DVIA 3MBPA 4EQBA 3CRBA 3HN0A 4RYAA 1MM6A 3ZS6A 4XTCQ 1OVTA 3U94A 3KN8A 4ZEDA 1LBCA 1O63A 2QMWA 4NMYA 1BKAA 1UQWA 1FW0A 3UORA 5H8FA 5J1DA 1PB9A 4JXIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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