3K6XA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in molybdate-bound close form with 2 molecules in asymmetric unit forming beta barrel
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
340
structure length
322
Chain Sequence
IPTTENLYFQEVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina acetivorans
total genus 96
structure length 322
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6xA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6xA01
3V83A 3QUFA 3T93B 1OLAA 3RTWB 1B52A 4EDPA 3PPPA 1VE4A 1PC3A 3C35A 1ATGA 4R2BA 4KQPA 2D3IA 5I56A 4ZEBA 1LFGA 2B65A 5A5XA 2F7AA 2NOOA 5CMMA 1GV8A 1N04A 5DYHA 1M5CA 3TTRA 5I2KB 2RCAA 3OO7A 2XXYA 3O6GA 3B6QA 5EYFA 4YZZA 1R9QA 4RY1A 1LB8A 3S2VA 4FEDA 4DXBA 4F3PA 1I69A 1LSTA 4G77A 4AQ4A 5CMBA 3VXBA 1O64A 4C1TA 2V3UA 1QULA 4ZEDA 3M3FA 4XKRA 4JB7A 1MPBA 3CG1A 4HTGA 3TQWA 5BUUA 3KSJA 4DLDA 4KPTA 1SW5A 2F36A 2THIA 3G3GA 2O69A 2Z8EA 4U22A 4IGRA 2I3WA 4R6HA 3KN7A 1XHYA 1ZKBA 3JYRA 1P1OA 4Z0IA 3TTNA 3OSQA 2RINA 3C34A 3DP4A 5F1QA 3UIFA 5CMKA 4N07A 3TUSA 4LZ8A 1AIVA 2XX8A 1P1WA 3OMBA 2F34A 2XXUA 3QXMA 1SQYA 4OXVA 4RA1A 4QSEA 4E0XA 1J1NA 3SEVA 2NVUB 3HO7A 2F5XA 5CRYA 4BDLA 3FXRA 2UYEA 5KCJA 4QFKA 1O63A 1H44A 1UIUA 3VXCA 3K2DA 3TMGA 5KDTA 4YB5A 4FJPA 1Q35A 3MVWA 3T96B 4U23A 4NF5B 1P1NA 1FQBA 4IO3A 4KHZE 4L17A 3UGWA 4NE4A 1SDXA 5JTYB 4H0WA 2Y7PA 4H65A 2ESNA 5AA4A 4XTCQ 2DE4A 2O1LA 3R7XA 4X48A 3DLNA 1HSEA 1MXXA 1MQDA 2HAUA 2F97A 3K1PA 1MH3A 4NF6A 4ZZAA 4U1OA 3FZVA 1UTHA 5K2YA 5L9SA 4H5FA 1QW0A 3FIRA 3KG2A 3PPOA 4IY5A 4NTLA 1MM7A 1M5BA 2FA7A 3A09A 4QFPA 2B3BA 5DTBA 1N84A 4PFUA 5I56B 4JBZA 4IY6A 3K1MA 5A5XB 1F9BA 1POTA 5HPQA 4F29A 4EF1A 2CZLA 1URGA 1MQIA 2QMXA 3R6UA 5IAIA 3FXQA 3G3IA 3ZKKA 4BDRA 1FTJA 4TLMB 3KSXA 2QS4A 2R6GE 5FHMA 4NF4A 1SW4A 3FVOA 1OQHA 3PUZE 2Z8FA 3VV5A 1A7LA 4HCYA 2H98A 4EQ9A 2I0BA 2HAVA 4R9FA 1LLSA 3V5AA 4R6KA 3HHGA 4I9DA 4XKNA 3ILUB 2XXWA 1MQGA 3PU5A 3A3UA 4RPNA 2X7QA 4DZ1A 1LAFE 3TDJA 1MPCA 5LOMA 3FXUA 4ELOA 3T66A 1SI1A 3IK6B 2UVIA 4IO2A 3HV1A 5H8FA 2VD3A 3CSBA 4GXAA 2I0CA 4WEPA 2PT1A 2I3VA 4BDOA 4OENA 1FTKA 2RF1A 1USYH 4H8IA 3CRBA 4R75A 3Q25A 2F78A 2XXTA 4F22A 2P1SA 4GVOA 3FVNA 1XVYA 4LQ2A 1PB7A 3LSFB 3OO6A 1DTZA 1A54A 3TEPA 5KCJB 3Q28A 3H06B 3O97A 1H43A 3E3KA 1XC1A 5DVIA 5H8QA 5H8SA 1P1UA 1GR2A 1A40A 1B3FA 3T9HB 2NXOA 2NWJA 3SDFA 4ZEIA 4EQBA 3RPWA 3T9XB 3TAJA 2Z22A 3IAZA 3IJOB 5AA4B 2B3FA 1XVXA 3LBSA 3PUVE 3ZSFA 4FATA 1ZLQA 2XD3A 4PETA 4O3AA 3MVXA 1O7TA 3UA8A 2ZXTA 2RC9A 2GFEA 5FTHA 2PX1A 4NF6B 1LBCA 1SYIA 2A5TA 1USYE 5CBRA 1POY1 2G93A 4IO5A 2REGA 1UTHB 3C31A 3O9PA 4FECA 4QFOA 3RLFE 1A99A 4R2FA 4LZ5A 3KJ7A 5ICTA 2E0SA 1FTMA 3OEKA 4GWOA 4P0IA 3U8QA 4DE8A 4MFIA 2XX7A 4ZS9A 4E0WA 3S9NC 1B3HA 3DELB 3CVGA 4FE8A 3I6VA 4OMBA 4DCXA 4X9TA 3FASA 4OESA 4JWXA 1MH4A 5AA2A 4ND9A 3K6VA 4JSDA 2V84A 2O51A 4NF4B 3ILTB 3CR9A 1JVXA 5IKBA 4QFLA 2I58A 5I59A 5L8DA 4RXLA 1A8EA 1B51A 1SYHA 1B40A 2H4IA 3PV0E 1Y3QA 5J1DA 4KD5A 4RJZA 1PBQA 2QL3A 4H5GA 3ECRA 3UP9A 2DWAA 4FAJA 4M4GA 4H1XA 3T9UA 4TOZA 2YLNA 2XXQA 1UQWA 4ZE8A 4U4XA 1B3LA 4GF8A 2G29A 5H8FB 4F3GA 3MP1A 3HHFA 4R9GA 4GFRA 2QSXA 3C36A 1MXUA 3D4CA 4GIZA 4LONB 4TQUQ 2XD2A 3BBRA 2DWHA 4ZECA 5I57B 2O84X 1B5JA 2ZNSA 2VP1A 2XX9A 2ALUA 3E9XA 4OFLA 4Q8RA 4F3BA 4R6YA 4ZDMA 1N7XA 1D9VA 4TLLB 1I6AA 3EF7A 5H8QB 1D3KA 3IB0A 2HEUA 1IXHA 3VDFA 4LP2B 3SEYA 2NUVA 5AE4A 4R72A 5ELVA 1FQFA 4F2OA 4DIGA 4GXSB 2V3TA 3O28A 3B6WA 1Y20A 1B46A 3FGSA 4OFOA 2QS2A 3O29A 3T9VA 4JDFA 4C0RA 4P11A 3JZJA 1AH5A 4K3FA 1NFTA 1B9JA 1PDAA 4N6PA 2A5TB 1QVSA 3QIMA 4Q5TA 3AXFA 1H3DA 3MWBA 4BLAA 5JK4A 3SEUA 2FYIA 4O3CA 1NNKA 3SERA 1N3XA 1PB9A 1NH8A 1JW4A 3DP6A 3EHUA 1DTGA 1LB9A 3M8UA 3TTKA 1IITA 4NEDA 4U4SA 3N94A 3EHSA 2DE2A 2AL4A 3JV9A 5L9OA 2HCAA 4AB5A 1MY2A 3S9MC 4THIA 2CMOA 5AA1A 3QUJA 3KN8A 1M5EA 5AA2B 3OD7A 3SESA 3FV1A 1XT8A 3P7IA 4NWDA 3PGFA 1MDP1 4KCCA 2F35A 5I59B 3H7MA 4QSCA 3TCFA 4H6DA 2BJJX 2PT2A 1JVYA 3QAXA 3K02A 4F1YA 3I3VA 2DSFA 2V25A 3H6UA 3UORA 3OELA 2UVGA 3UN6A 2AL5A 2WKYA 3MVYA 1SI0A 4GL8A 2Y7KA 4OVJA 1T0KA 4YU0A 4MLVA 1B7HA 3PPRA 4ELQA 3IX1A 4KYDA 3E4RA 3GBAA 1IUDA 4X1BA 3Q27A 1EU8A 4I8CA 4F19A 2QPQA 1ZJLA 1MXWA 2Y7IA 3G3JA 1PB8A 2QJEA 3IL1B 1B05A 4ESWA 4GRKA 2QMWA 4OEVA 3H03A 2RKMA 2H99A 2DWIA 2W7YA 4U2RA 5AA3A 3OXNA 1EZPA 2Q89A 1IXCA 2Z8DA 3EQ1A 1SBPA 1B0LA 3FJ7A 1H45A 3IO6A 1QUIA 4AB6A 3G7WA 1VSOA 2O1MA 2I4BA 4MBPA 1PEBA 1AL3A 2D21A 1LAHE 1Y3PA 4WXJA 3VLUA 2O7IA 4RPOA 1P99A 5H8NA 2XXPA 3GXAA 3CFLA 5L9MA 3C32A 1IQ7A 3TQLA 2F6PA 2ONSA 5TPAA 1IIWA 1Y9UA 4LA9A 1ZBMA 1BTJA 4OZ9A 3K6XA 1EZ9A 3PD8A 4O3BA 3VE1B 1DSNA 3CFZA 2I49A 2UVJA 3EN3A 4IB2A 1NNFA 4P0GA 2DQVA 4YMBA 3T22A 3S9LC 5I84A 1ZTYA 3TODA 1S7YA 4ECFA 5TP9A 4LQ5A 4F31B 3V89B 3TKDA 3A3CA 5HBCA 1FQEA 4KR5A 3IORA 4OWDA 5AA2D 1FW0A 3KGCA 4G68A 2OK2A 1FCKA 1QKBA 2ZYKA 1JNFA 1MY0A 2XXXA 4YKJA 3C4MA 4KYSA 4PQJA 1R6ZA 4PP0A 2R71A 3RN8A 4PFTA 4YICA 1BIYA 2ONRA 1MDQA 4F3SA 3HN0A 4ZE9A 2Y7RA 1Y1ZA 2P0SA 1MG1A 3RY3A 3U94A 1SW2A 1URDA 1BP5A 3OO8A 1OIBA 3IB2A 2Q2CA 3FD3A 2Q2AA 4XKQA 4YKPA 4I62A 3N26A 4C1UA 3FUZA 4RNSA 3RNNA 4RK2A 1B2HA 1Y4CA 5KDTB 5H8HA 2OWSA 2PMSA 2PBWA 2I6EA 3RTFB 4ZZEA 4IGTA 3RUMA 4YAHX 3PD9A 1GVCA 3LUYA 4X1DA 4LVQA 3CSGA 3HCQA 2DS9A 1B32A 4F2QA 4OEUA 1DOTA 1A55A 4H67A 2HZLA 2IA4A 4OHNA 2QRYA 4FIMA 4RYAA 4OYVA 4NWCA 3V8XB 1B3GA 1DPEA 1MY3A 3MJNA 3MZ9A 1YCJA 4ZEKA 2A5SA 1TFAA 2QS1A 4BDQA 1MQJA 3QSLA 1H76A 1WODA 3N6UA 2Q88A 1RYXA 3S4UA 3ZKLA 3U92A 2ZMBA 4HCWA 4F39A 1IXGA 1MXVA 1VFDA 3KOSA 3VVFA 1JEVA 3FATA 4ELPA 5BWJA 1OMPA 2OZZA 4G8MA 3GLBA 4HS7A 5H8NB 3LSLA 1R1NA 4EF2A 1HSLA 1LGBC 2X7PA 2P2AA 5TPAB 3H4ZA 2GRVA 3K6UA 1NNPA 1B4HA 4QRZA 3MAMA 2QS3A 1AOVA 3TTMA 2DVZA 4POWA 2XXRA 1EZOA 3BFUA 3G3FA 4XXUA 4ELRA 2RC8A 3MVZA 3FVGA 1LFIA 2M8CA 1DMBA 1B6HA 3K01A 5TP9B 2OBGA 2DE3A 5DEXA 3M3LA 4I1DA 4WEDA 3PUYE 5M2VA 4YB7A 5TU0A 3QYTA 3IOVA 1B4ZA 4G68B 1MXYA 1TT1A 5DVFA 5ITPA 1US5A 2H25A 1OVBA 3R26A 1US4A 1B7UA 3MP6A 3CI8A 1D9YA 4POXA 4G68C 3USDA 3PUWE 4EXLA 4U21A 1HSJA 3G3KA 1CE2A 1MS7A 2VGQA 5I58A 1TXFA 1IEJA 4OETA 4LZ7A 4MF3A 4F1UA 5I2NA 1N0TA 1NMUA 3MW0A 1JEUA 3TCGA 5FTIA 3VVDA 5H8HB 4DXUA 5ICQA 1MQHA 1S50A 1TFDA 3MP8A 1URSA 2YJPA 3EHTA 3U93A 3TYHA 3MC2A 4QF9A 3LSXA 3G3HA 1B7ZA 1RYOA 4HW8A 3K6WA 3K1NA 3KN3A 1P1QA 3FJMA 4Z7EA 1SW1A 1ELJA 3EPEA 2HZKA 4XKPA 4EQ7A 3FV2A 2ZYMA 4MLQA 3RQTA 3L6HA 3WAFA 4WKMA 4OFJA 1D4NA 4DDDA 1JQFA 4GQOA 1B5HA 3PPNA 2F7BA 4BDMA 2H5YA 1MRPA 2PVUA 3IO4A 1NH7A 3Q29A 2PYYA 3FVKA 4F1VA 2UYFA 5CC2A 4JWYA 1UIVA 1OLCA 4UACA 4FORA 1LCTA 1YPNA 4ONYA 1BLFA 1AMFA 5B7DA 1FQDA 4YMAA 4EXKA 3VLWA 4G8NA 1SVXB 4R74A 2I48A 3PMWA 3W15C 5EHMA 4EUOA 2OJTA 2DOJA 3MQ9A 5K2XA 3MPLA 2X26A 2Q9TA 3LSWA 2Q8JA 1R9LA 1N76A 3H6TA 5DEXB 1QUJA 2REJA 2GHBA 4UA8A 3IB1A 1S9TA 3LC8A 3H3GA 1II5A 1OVTA 1B0HA 2VHAA 3I5OA 3OENA 5CMCA 4JWOA 1MM6A 1Y3NA 3VLVA 5ISUA 1FTLA 3U72A 1YTVA 3SEWA 1UTBA 5FHOA 1BKAA 1WVJA 2XHDA 3C9HA 2DXRA 5I58B 3BKIB 4G4PA 3IOWA 3N5LA 3OSRA 1M5FA 3K00A 5I2NB 1Y4TA 1RKMA 3M3KA 2O6AA 1B5IA 4FEBA 3BFTA 3RT6B 2DXYA 3MPKA 1FQAA 2RCBA 3OEMA 1KWHA 1Y1MA 4RK9A 1SD3A 3N6TA 3U1OA 1VR5A 3TFLA 4KCDA 4R73A 1L5TA 4KI0E 5JEIA 4YB6A 3PMVA 3WAEA 1B3EA 3IJXB 2RC7A 4YKKA 3OO9A 2OWTA 2E1SA 2FNCA 2HFBA 2YPNA 4PE5B 2H9BA 5DT6A 3TPAA 2I4CA 4ISUA 4F18A 1Q1KA 1YAEA 3KJTA 3MBPA 1Z7NE 2F8DA 1LBBA 4G2ZA 1ZMGA 2F6GA 5CM6A 2D5WA 3W9VA 3Q26A 3SEXA 5KZTA 2VD2A 2DVCA 3IR1A 1XS5A 4PFYA 2VOZA 4QSDA 1MY4A 1N3WA 4NF8A 4DXCA 2O7UA 4KYEA 1QUKA 4IO4A 2XXVA 1FTOA 2O68A 3B7DA 3MZ1A 1MPDA 4IO6A 2ANJA 3ODBA 3THIA 1GTKA 3F11A 1NKXA 3H6VA 2OCUA 3MUQA 3UK4A 2IEEA 4U1ZA 3B6TA 1ANFA 2UXAA 4PFWA 5HM4B 3K4UA 2V3QA 3W9WA 5I57A 3KZGA 3DP8A 4BDNA 4QHQA 4OTEA 3QK6A 3O6IA 5DVJA 3PPQA 4Q0CA 1QJMA 1JW1A 3PMXA 1PBPA 4GL0A 4QFNA 2GHAA 2ZNTA 1DPPA 4Q30B 1A8FA 2Y84A 3TCHA 1UTBB 1IXIA 3RGYA 1B58A 3ZS6A 3TELA 3HPIA 1TWYA 4MH5A 4ZEFA 1GGGA 4G8HA 3D4GA 1QKAA 4KFQA 1NL5A 4JSOA 1N7WA 1I6BA 4H8JA 2AIXA 1M5DA 3GZGA 2V93A 3O66A 3VFJA 4XIGQ 3TTLA 1ZIUA 3RT8A 4IO7A 3IOTA 4GLIA 3VVEA 5I2KA 1LFHA 1Z7ME 3SKPA 2DYXA 4DCYA 4LATA 5EHSA 2ZYNA 1FQCA 4M1VA 3LR1A 3KFMA 4NMYA 4JXIA 1IZ1A 3IOUA 3KBRA 3O2AA 1I6QA 1JETA 2DWJA 3S9EA 1B1XA 2HQ0A 3TZAA 3GBBA 3CIJA 4GD5A 3MZBA 3E13X 5CI5A 2ABHA 1VFEA 2XXHA 3K0VA 3CFXA 4LUBA 1LCFA 5F7VA 3ONMA 1EH3A 3CG3A 4NF8B 1MXZA 2ZNUA 4ESXA 3L6GA 1JW5A 4OERA 2OLBA 3DM0A 3H6WA 2R9JA 4GOTA 4YKIA 1NNTA 1CB6A 3O6HA 2Z23A 2DP8A 1OQGA 4OQOA 3C33A 1WDNA 4NF5A 3KOTA 5B70A 2KLFA 5CBSA 2AYSA 3FJGA 3OOAA 4N13A 5JTYA 2LAOA 2ONKE 1XOCA 1MY1A 2ZYOA 2UVHA 2HXWA 3HSTA 1LAGE 5FHNA 3KEIA 5ITOA 1B1HA 3SETA 2F7CA 1ZU0A 1LAXA 2XXIA 2Y7WA 2GH9A 3PUXE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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