3K6XA

M. acetivorans molybdate-binding protein (moda) in molybdate-bound close form with 2 molecules in asymmetric unit forming beta barrel
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
340
structure length
322
Chain Sequence
b'IPTTENLYFQEVLTVFHAGSLSVPFEELEAEFEAQHPGVDVQREAAGSAQSVRKITELGKKADVLASADYALIPSLMVPEYADWYAAFARNQMILAYTNESKYGDEINTDNWYEILRRPDVRYGFSNPNDDPAGYRSQMVTQLAESYYNDDMIYDDLMLANTGMTLTTEENGTALIHVPASEEISPNTSKIMLRSMEVELSSALETGEIDYLYIYRSVAEQHGFEYVALPPAIDLSSLEYADNYSKVQVEMVNGEVVTGSPIVYGVTIPNNAENSELATEFVALLLGETGQQIFIENGQPPIVPAIAEGKDSMPEELQALVV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Apo and ligand-bound structures of ModA from the archaeon Methanosarcina acetivorans
pubmed doi rcsb
molecule keywords Solute-binding protein MA_0280
source organism Methanosarcina acetivorans
molecule tags Transport protein
total genus 96
structure length 322
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6xA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k6xA01
4KD5A 4JSOA 3UORA 4EF1A 1N7XA 4U4XA 2Z8EA 3B6WA 1SW2A 5IAIA 4ESXA 2QJEA 1B0HA 1UTBB 4ZS9A 1Y20A 5H8SA 3KSXA 2OZZA 3RT8A 1IXGA 4MF3A 1I6AA 3PUVE 2NVUB 1USYH 2DSFA 1B3HA 4QFOA 3A09A 3QAXA 1US4A 1ZJLA 4E0XA 4GL0A 3GZGA 5CMCA 3CG3A 4JDFA 4XKRA 1A54A 4OXVA 2V84A 4YKIA 1SW5A 3OELA 3TYHA 4NF5A 3CSGA 1MRPA 2XXHA 4ELRA 2IA4A 3IO4A 1VR5A 4JBZA 4NF5B 4Q0CA 3RUMA 2Z22A 3RLFE 3SESA 2IEEA 1AL3A 1IZ1A 1II5A 1SI0A 1IQ7A 1MY4A 1FTKA 1VSOA 4I62A 3G3FA 3K0VA 4F1UA 4GIZA 4OEUA 4C1UA 3R26A 1QKAA 3W9VA 2I3VA 3N26A 3EN3A 1L5TA 3TCGA 1KWHA 2XD2A 3H6WA 3KFMA 1Y3PA 1P1OA 4OFLA 1BTJA 3RY3A 4GVOA 4L17A 4GXSB 1A99A 3MVXA 3O6HA 4R72A 3U8QA 3TTMA 1SDXA 4H65A 1XVYA 4KYSA 2D5WA 4FEBA 3SEVA 1B6HA 3IX1A 4H67A 3PU5A 4GL8A 4F29A 3B7DA 5DVIA 1Y1MA 1IEJA 3E3KA 3BKIB 3VXBA 4ND9A 4OETA 3PPRA 1LSTA 5CBSA 3I3VA 4ONYA 4DCXA 2V3QA 2X7QA 1QKBA 3VLVA 3IL1B 3TQLA 2AL5A 3I5OA 5F7VA 1JW1A 1MG1A 4G77A 2ABHA 5ISUA 4QSDA 1JQFA 4H8JA 5CRYA 3MC2A 4HS7A 4KR5A 4IGRA 3G7WA 4G4PA 3IOVA 1PB8A 1N3XA 2O51A 1US5A 3V5AA 2F6GA 1MS7A 4KYDA 4GFRA 4GXAA 2R71A 1PEBA 4R74A 4FECA 4HTGA 2I58A 4PP0A 2DXRA 4R73A 4AQ4A 4JWOA 1B4ZA 5FHOA 3B6TA 5H8QA 4EXLA 1NL5A 2Y7RA 4DXBA 3FATA 2PMSA 3TMGA 1LFGA 2O6AA 4AB6A 3K1NA 1QUJA 3KJTA 3OO9A 4O3BA 5H8QB 4NF6A 3RGYA 4O3AA 4NF8A 4YICA 5ICTA 3DELB 3MPLA 3MW0A 1A55A 1MDQA 4NF6B 4NF8B 4XKQA 2ONSA 3QUJA 2XX8A 3CR9A 1MQJA 3PMXA 3O97A 2I6EA 3S9MC 3KN3A 4YKJA 3BFTA 3ZKLA 4YB7A 2HFBA 5CMMA 1SYHA 3L6GA 3TTKA 4PETA 1OMPA 3FVGA 3RTFB 2F36A 4JWYA 3B6QA 5ITPA 3S9LC 1WVJA 2FYIA 2RC8A 5ELVA 4QF9A 5DEXA 1UIUA 3TCFA 2I4BA 1B3FA 2ALUA 4RPNA 3MQ9A 1JETA 5DEXB 3O6IA 4Z7EA 1LAHE 3FXUA 4E0WA 1H44A 4C1TA 3O28A 2Q2CA 1JNFA 4LZ5A 1HSEA 2XXIA 3DP6A 1B3EA 1QULA 1NKXA 1D4NA 3IOUA 4QFNA 4RK9A 3EHSA 2FA7A 4F19A 3HCQA 1LGBC 3CI8A 3KOSA 3K1PA 4K3FA 3UK4A 4F3SA 3ECRA 4HCYA 1NNTA 3K02A 1Y3QA 1WDNA 5HM4B 4R6HA 4RYAA 3VLUA 4QSCA 2RCAA 2HCAA 2DE4A 2GFEA 4EXKA 1OIBA 3I6VA 3G3HA 3LBSA 3MVWA 3KEIA 4YAHX 3C32A 3U1OA 4ELPA 4F3PA 2VD3A 1PBQA 3IB2A 1BP5A 1POTA 2ESNA 3IJOB 2H25A 2W7YA 2XHDA 2Q88A 4TLLB 5DVJA 4RK2A 3QUFA 1QW0A 3OO7A 2ZYKA 3FVOA 3O2AA 3UIFA 2F8DA 4P11A 2Y7PA 5AA4A 1MM6A 5CMKA 3M8UA 5JTYA 2BJJX 3MVYA 3RPWA 4NEDA 2F6PA 2Z8DA 3KJ7A 4ZEKA 2XXPA 5AA4B 1IXCA 5I84A 5JTYB 1N76A 1SBPA 2A5SA 2G93A 1TFDA 2X7PA 2H99A 3U72A 2DYXA 4BDRA 1PC3A 2I48A 4OQOA 1N04A 3JYRA 2HAUA 4NMYA 4P0GA 3Q26A 2DS9A 1GGGA 3OO6A 2QS3A 5CBRA 4DIGA 2H9BA 4R6YA 1EZ9A 1B3LA 1USYE 3OOAA 3IB1A 3EHTA 1B9JA 4F39A 4AB5A 1AOVA 4ZDMA 1XC1A 3ILUB 5I2KA 3L6HA 2DWAA 1I69A 1HSJA 3H6TA 3FD3A 3S9EA 4EDPA 1NH7A 4IO7A 4IY5A 5I2KB 3K6WA 3O66A 4X48A 1QJMA 2R9JA 3PPNA 5BUUA 4BDLA 2GH9A 2Y7WA 2QS1A 1B7ZA 3FXRA 1R1NA 2HZLA 4ZE9A 1ZLQA 1B2HA 4MH5A 2WKYA 5AA1A 3GBBA 3MJNA 1AIVA 1FQBA 1B0LA 2DVCA 1XOCA 3UGWA 3IJXB 3E13X 4F1YA 3MZ9A 2QS2A 1Y4CA 4RY1A 3CFXA 1TXFA 1TFAA 3LSLA 3A3CA 5I2NA 1GVCA 1CB6A 4F3BA 4KCCA 1DMBA 3TTLA 4IO5A 5I2NB 3LSWA 5L8DA 1I6QA 2UYFA 3TZAA 3T9HB 1LAFE 4MLVA 1IUDA 1H3DA 3U92A 2NWJA 1Y3NA 4X9TA 3CG1A 1FQFA 4GRKA 1IXIA 4TQUQ 1S9TA 4MBPA 4PQJA 4F1VA 1LBCA 5DTBA 3OEKA 3PPOA 2XXTA 4DZ1A 3F11A 1DTZA 2D21A 3MP1A 2VP1A 1MQGA 3PUWE 4BDNA 4QFLA 1S50A 3O29A 1SVXB 1URSA 5I58A 1TT1A 1VFEA 3C34A 1VE4A 1MQIA 5I58B 2F97A 4RJZA 3HHGA 3FIRA 4PFTA 3TPAA 1OQGA 3IORA 3KN7A 2O7UA 3KOTA 5TU0A 2XX9A 1TWYA 1ATGA 3KZGA 3UP9A 1B1XA 2X26A 1QUKA 3HO7A 3MWBA 2B65A 2XXYA 3GXAA 4MFIA 1IXHA 1Y4TA 1JVXA 3PUYE 4LZ7A 4F31B 3SEYA 2DOJA 3PUXE 5JK4A 3SEUA 3FVNA 2ONRA 3T66A 1JW4A 2ZYMA 2F78A 4EQ7A 2DVZA 2ZYOA 1MXXA 3PD8A 4LQ2A 4BDMA 2I0CA 4GF8A 2PVUA 2H4IA 4WEDA 5TPAA 3ZS6A 4U4SA 3W9WA 1B51A 3H06B 3TKDA 1NMUA 1LFIA 4OMBA 3PV0E 2XX7A 1FTOA 3EQ1A 1MDP1 5TPAB 3V8XB 4GLIA 3T93B 2V93A 3OSQA 5K2XA 3CFZA 1OQHA 5J1DA 3BBRA 3K4UA 5FTIA 3V89B 3EF7A 1RKMA 1WODA 4NF4A 1POY1 4G68A 1FQDA 1M5BA 2OBGA 2CMOA 1OLAA 3RN8A 1MQHA 4RXLA 3C33A 3ZSFA 2ZYNA 2QL3A 1RYOA 4NF4B 4G68B 1XS5A 2ZNTA 2PX1A 1VFDA 3K6XA 4ZEFA 2P2AA 3MUQA 4QFKA 2VHAA 1MQDA 3FV1A 4IO2A 1Z7ME 4OENA 1MY0A 2DXYA 1DTGA 2HAVA 5TP9A 2ZNUA 3QK6A 3E9XA 4WKMA 2UVJA 1XHYA 1P1NA 1JVYA 4FJPA 4DE8A 5TP9B 2QRYA 4Z0IA 3N6UA 5I57A 2OWSA 2A5TB 2XXQA 2UVHA 4QHQA 2REJA 5H8FA 2F7BA 5I57B 1EZOA 1ZMGA 3JZJA 3VXCA 2G29A 1NFTA 3ONMA 1QVSA 5H8FB 2XXXA 1B52A 4C0RA 3H7MA 3Q28A 2O1MA 3PMVA 1MXVA 1FW0A 2PT1A 3SEXA 2XXVA 2VOZA 3MZ1A 4Q5TA 1IITA 4XIGQ 4FEDA 1DSNA 3OENA 1MH4A 4KHZE 3EHUA 2OLBA 4OZ9A 5I59A 1PBPA 1A8EA 1R6ZA 1XVXA 3TODA 1BKAA 2REGA 1OVTA 1ANFA 4RPOA 4YKKA 5I59B 4R75A 5KDTA 2HXWA 3ILTB 3KSJA 4DDDA 1B5IA 2DWHA 5FTHA 4IGTA 5H8NA 1R9QA 1Y9UA 5KDTB 1F9BA 3Q27A 1UQWA 2R6GE 5H8NB 2RF1A 4NWCA 3SKPA 3LUYA 2O68A 4POWA 3OEMA 4YZZA 1B4HA 4R2BA 1NH8A 5DT6A 1P1QA 4N07A 3K1MA 2DQVA 2I0BA 4Q30B 3QSLA 5EYFA 3S4UA 1O63A 2DWJA 3HV1A 1DPEA 4KFQA 1LAXA 1Q35A 3MAMA 2V25A 1YAEA 2P1SA 4BLAA 4KI0E 2QMWA 1LCTA 4NWDA 4YU0A 5L9MA 2UYEA 3DP8A 4MLQA 3TTRA 5FHNA 4DXCA 3O6GA 1YTVA 1BIYA 2CZLA 4TOZA 5EHSA 1FTMA 3PMWA 5H8HA 5M2VA 3IO6A 1PB7A 5CC2A 2Y7KA 5L9OA 4FORA 4U22A 1NNPA 2THIA 4R9GA 3USDA 1IIWA 4YKPA 4EF2A 5H8HB 4G2ZA 1URDA 4DCYA 3TUSA 4WEPA 3K01A 2GHAA 3ZKKA 4QRZA 1B1HA 2VGQA 4H6DA 3IOTA 1MPCA 4EQBA 1MXYA 4THIA 3C35A 1Z7NE 3E4RA 1MXUA 5CM6A 3DP4A 5DYHA 1YCJA 1A8FA 1FQAA 1MPBA 4ECFA 4LVQA 2V3TA 3H4ZA 2GRVA 5KCJA 1URGA 1PB9A 3MP6A 3W15C 2ONKE 4DLDA 2O7IA 4N6PA 3R6UA 2I49A 5AA2A 3KN8A 1ZTYA 1ZIUA 2DE2A 5KCJB 4GWOA 3MP8A 2AIXA 4RA1A 1N7WA 4LZ8A 3T22A 1AH5A 4G8NA 5AA2B 3U94A 3M3LA 1M5FA 4PFWA 2XXWA 1SI1A 5B7DA 1EH3A 2E1SA 3PD9A 5BWJA 1EZPA 3IOWA 3K6VA 4M4GA 1LBBA 5AA3A 2H98A 1EU8A 3WAFA 4N13A 2HEUA 4LQ5A 2PBWA 3M3KA 4YMBA 4H5GA 4IB2A 4QFPA 3VVFA 2ZNSA 5CMBA 1T0KA 3FGSA 4U21A 4XKNA 1B58A 4I8CA 1QUIA 4PE5B 2XXUA 4ZE8A 1H43A 2QSXA 2O84X 3N5LA 3MVZA 4GD5A 4RNSA 2I3WA 3FJGA 2F35A 1N3WA 1M5DA 3EPEA 3TAJA 3RQTA 1N0TA 4OWDA 1B3GA 3RNNA 3S2VA 2B3FA 4OESA 4U1OA 2M8CA 4NTLA 2KLFA 3IAZA 3OMBA 4ELQA 1FQCA 2NUVA 3MZBA 5ICQA 3VDFA 3SERA 5AA2D 3O9PA 2P0SA 5F1QA 3A3UA 1OVBA 1FCKA 3TEPA 4JXIA 5K2YA 3K6UA 2UVGA 3G3JA 3IR1A 4Q8RA 3UN6A 4I1DA 4XTCQ 1N84A 5A5XA 3H6UA 1ZBMA 2Q8JA 1H76A 3CSBA 1SQYA 2NOOA 5A5XB 2DE3A 3H03A 1OLCA 2RC7A 4EUOA 1Q1KA 3UA8A 4ZECA 3D4CA 4OFOA 1DOTA 4R6KA 4ESWA 2F7AA 4HCWA 3IB0A 1O7TA 3FV2A 4QSEA 1RYXA 3R7XA 2YJPA 3Q25A 1B7UA 1B05A 3K00A 3DLNA 3AXFA 2HZKA 2AL4A 1B5HA 1GTKA 2H5YA 3MPKA 2QPQA 1SD3A 4IO3A 4KYEA 1MY1A 5HPQA 3H3GA 3WAEA 1SW1A 4BDOA 1LCFA 5I56A 3MBPA 1P1UA 2HQ0A 3OO8A 3HN0A 4IO4A 3FASA 5I56B 2RINA 2Q2AA 1GR2A 3OSRA 3QXMA 2F5XA 3VE1B 2NXOA 1ZKBA 3RT6B 1JEVA 1P99A 4IY6A 4FE8A 3TCHA 3C31A 4KPTA 4XKPA 4M1VA 1CE2A 5HBCA 1JW5A 4YMAA 2E0SA 1GV8A 1ELJA 3SEWA 3H6VA 4P0IA 2UVIA 2A5TA 4TLMB 4LA9A 4BDQA 3PPPA 4WXJA 3C4MA 1A40A 4ZEDA 2GHBA 3T96B 3CFLA 3FVKA 4KCDA 3VV5A 3SETA 1LFHA 4OFJA 1O64A 2I4CA 1D3KA 3BFUA 1A7LA 1Y1ZA 3V83A 4G68C 1HSLA 3M3FA 5FHMA 1LB8A 4OHNA 1D9VA 4G8HA 2Y84A 1NNKA 3LC8A 4OVJA 2F7CA 2FNCA 3N6TA 3PUZE 5KZTA 2YPNA 3VVDA 4H1XA 2Q89A 3THIA 3HPIA 1DPPA 3LSXA 4X1DA 3HHFA 3TELA 2F34A 3SDFA 2UXAA 4POXA 4FATA 4U1ZA 1H45A 1SW4A 1LAGE 4HW8A 1S7YA 4U23A 3CVGA 3ODBA 4F22A 1NNFA 4U2RA 1B5JA 4LATA 4H0WA 3OXNA 4JSDA 1MH3A 1B46A 4H8IA 4ISUA 3TTNA 3D4GA 3FXQA 2ZXTA 4UACA 2O1LA 2Z23A 3C9HA 4F18A 4XXUA 5CI5A 3KGCA 1B7HA 2XD3A 3Q29A 5AE4A 3G3IA 4ZZAA 4YB6A 1MM7A 4OYVA 3FJMA 4UA8A 1M5CA 2QS4A 1AMFA 2D3IA 5B70A 5L9SA 1R9LA 3TDJA 1MPDA 2DWIA 4OERA 2Y7IA 3VLWA 2OCUA 4G8MA 3KG2A 3CIJA 3RTWB 2PT2A 2RKMA 3VFJA 3T9XB 3HSTA 2DP8A 4LONB 3N94A 5DVFA 3IK6B 1FQEA 1XT8A 1SYIA 4ZEIA 1JEUA 2AYSA 1B40A 1ZU0A 4JWXA 1YPNA 4ZEBA 1PDAA 4PFUA 4R9FA 2O69A 3OD7A 4ZZEA 2B3BA 3JV9A 4OEVA 4KQPA 4LUBA 3LSFB 4F2OA 2VD2A 3C36A 4ELOA 1M5EA 2OK2A 4GOTA 4H5FA 1B32A 2RCBA 3G3KA 1MXWA 4JB7A 1BLFA 1I6BA 4PFYA 3QIMA 4YB5A 3KBRA 3DM0A 4NE4A 4GQOA 1MY2A 3QYTA 1MY3A 3CRBA 2Q9TA 3K2DA 1J1NA 3G3GA 4FAJA 5LOMA 4LP2B 4FIMA 1FTJA 2ZMBA 4EQ9A 5IKBA 4I9DA 4F2QA 2V3UA 3LR1A 3TFLA 4R2FA 1FTLA 3U93A 1UTHA 3FUZA 5EHMA 3FZVA 1LLSA 2Z8FA 4DXUA 5JEIA 1UTHB 2OJTA 2OWTA 4OTEA 1LB9A 1MXZA 3GBAA 4IO6A 4X1BA 3TQWA 2QMXA 3FJ7A 3PPQA 3VVEA 3T9VA 3T9UA 4F3GA 1D9YA 2ANJA 1P1WA 3GLBA 3PGFA 4O3CA 5ITOA 3S9NC 2LAOA 2RC9A 1UIVA 2XXRA 3P7IA 2PYYA 1UTBA 2YLNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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