3K8NA

Crystal structure of e. coli ccmg
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
DDPTNLESALIGKPVPKFRLESLDNPGQFYQADVLTQGKPVLLNVWATWCPTCRAEHQYLNQLSAQGIRVVGMNYKDDRQKAISWLKELGNPYALSLFDGDGMLGLDLGVYGAPETFLIDGNGIIRYRHAGDLNPRVWEEEIKPLWEKYSKEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli k-12
publication title Crystal structure of E. Coli CCMG
rcsb
molecule keywords Cytochrome c biogenesis protein ccmG
total genus 48
structure length 153
sequence length 153
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3k8nA00
2C80A 4JE1A 1SK2A 4DSSB 2VM2A 4V2LA 4MCUA 4HZ4A 3GSTA 2YWMA 2VOCA 2LUSA 2CZ3A 4MJAA 5B8BA 2LJAA 6GSXA 2B3SA 3IR4A 3APSA 2H6ZA 3HVXA 2O7KA 5AISA 2WJUA 4HEA2 2LSTA 1V58A 1XXUA 3I9V2 3GKKA 1G6YA 3GKMA 2VCQA 2IFQB 4ACSA 2LNTA 3LYKA 4IGJA 4KSOA 3GTUB 1TRWA 3IBHA 2NTOA 3F8UA 1UC7A 4OO5A 5DQSA 1TKDB 3F4TA 2F9SA 1S3CA 1GUKA 3ZIVA 4F0CA 3HZ4A 3GIXA 4V1Ag 2IL3A 4E8EA 1PQNA 3M3MA 1R5AA 3EU4A 2OE1A 4KDXA 5GSSA 1PA3A 4IW9A 3FRCA 4YAVA 2MMAA 3R2QA 1UVZA 1OE7A 2V6KA 2RM6A 4ISDA 3FZ5A 2P5RA 4XS1A 2JU5A 2WZ9A 1T00A 1M99A 4MJEA 4K7IA 3HVSA 3WGEA 1WWJA 3GL3A 1V98A 5IMDA 2YJ7A 2GZPA 7GSSA 2CT6A 2OJLA 1SKWB 4J2FA 1FVJA 2VCZA 3P90A 1SYXA 1SJZA 2M80A 1J9BA 3GX0A 3I6AA 1B9XC 2PN8A 5C00A 2CA8A 3ZREA 4OFMA 3HXSA 1CQGA 3CRUA 2XPDA 1B8XA 4I97A 2IPAA 1GSEA 5JWOB 3TKSE 4XS4A 3H79A 2RUFA 1ABAA 3HY2A 3UAPA 1PSQA 2V41A 1FAAA 2AHEA 1Z5YE 3IPZA 3W8SA 2X8GA 1EGOA 1PL1A 1FOVA 1YKAA 4DSSA 1EEMA 3VPTA 3TOUA 3EYTA 5F0GA 2H6XA 2FLSA 1A23A 3RHCA 4KX4A 4ZB6A 1IYIA 1TU8A 5DVBA 1B9YC 2C3TA 4HUAA 4WETA 1PKZA 5CNWA 3VI5A 5D96A 1PN9A 1KEBA 4TXVA 2PPTA 1OC3A 2ON7A 1A2MA 2H73A 3RBTA 2IFQA 5AIVA 1MDIA 3GTUA 4TW5A 1M2BA 4IHUA 4NPBA 20GSA 2I3YA 2ZUPA 3DVXA 1GRXA 5JCUA 5J3RA 2FY6A 2H71A 1GTAA 1PX6A 5A4UA 4MDCA 1TRSA 5G1LA 3EC3A 3KTBA 3TJKA 4YQUA 1T4ZA 1M9BA 1GWCA 2HSYA 1T4YA 3FK8A 1GNWA 3ME8A 1XW6A 1ON4A 1HYUA 4TR0A 5D9VA 2FWGA 4ECJA 4WF5A 1JFUA 3A2VA 1VF2A 5HR1A 4HDEA 4EDYA 1SK1A 2OADA 2E2MA 2WRTA 4OFNA 2MZCA 1T8EB 3GMFA 3HJPA 4MP4A 5EY6A 4KAEA 1DE2A 3GH9A 2A4VA 2RUEA 2H74A 2DJ1A 4EC0A 1OAZA 2O8VB 1K3OA 1OKDA 2LQOA 2D2ZA 3IE3A 1MEKA 3Q19A 1F6MC 3DEXA 3QAWA 3GA4A 2YPMA 4X1UA 5HR0A 14GSA 4TVEA 1MDJA 5IMZA 4FYCA 5IO2A 1NHYA 3ZRDA 1JZWA 4MF5A 5G2ZA 3C71A 3KM6A 3U5RE 3F6DA 2IIYA 3KJYA 2C3QA 3CSJA 2X8CA 2M46A 3APOA 1V2AA 2DMMA 1EOGA 3WGDA 1DBYA 4RQRA 1I5GA 4KCEA 4F82A 4BWSA 3ZVJD 1GUMA 4POBA 2VO4A 1A8YA 2EC4A 2OA7A 2HE3A 22GSA 1Z3EA 4PQHA 1V57A 1AXDA 2AUVA 4TR1B 1C72A 3A5WA 2LQQA 3L78A 5IMFA 3IXRA 1XWBA 3FR6A 1TK5B 4IVFA 13GSA 3GKXA 1HD2A 2L5OA 1XBSA 4TOPA 3TB2A 1V40A 16GSA 18GSA 5JWQB 2MYGA 1F9MA 4MF6A 4RI7A 3WYWA 5DAKA 3IC4A 1B4QA 3E0UA 2J9HA 3VWUA 3KCMA 3ZITA 2YOIA 1XIYA 3L0HA 1V9WA 4IJIA 1SL2B 3ZFBA 1BQ7A 3FZ9A 3FEUA 3TKSA 2CQ9A 2NVLA 3BOAA 2YN1A 5DBQA 3KP9A 3F3RA 2HLSA 4IKHA 5KN2A 1FB0A 3CMIA 2PU9C 3WT1A 3QAGA 2H19A 3ZFLA 2DMLA 4Q5RA 3VURA 2PVQA 3UBLA 5ECNB 6GSUA 5ECRB 3O6TA 2PGTA 1X5EA 4Q5NA 1R26A 1LBKA 3CXGA 2A2RA 3QMXA 1QFNA 5LNKe 4PQIA 5D9WA 2H0IA 1PX7A 2VLVA 3FY7A 2WGRA 4K0NA 1GUHA 3M1GA 2HNLA 2FUG2 2HT9A 1YEPA 1ZMAA 1OC9A 6GSVA 3IAM2 2WFCA 3LG6A 3IDVA 2VM1A 4KNDA 1A0FA 2H75A 5GZZB 4EKZA 3IHQA 4BVYA 3LGCA 4I2TA 3EURA 3LORA 2K8VA 3ZMKA 1T3BA 4G19A 4O32A 3HD5A 4L5LA 3J7Yk 1T1VA 1F37A 2FA4A 3DGQA 2G0FA 5IQYA 1DUGA 1R7HA 2AV4A 5DALA 5F05A 1I9DA 1TRUA 3BD2A 3KIJA 4N0ZA 4XTSA 2L4CA 4MK3A 1AC1A 4CW9A 3RPNA 3UJ1A 5CO3A 4EDZA 4G9HA 2JZTA 2LRNA 4IQAA 5CRHA 4XCSA 4NWYA 1GLPA 2AB6A 1K0AA 4MZWA 2YWIA 2L57A 4PGTA 1SK0A 3D4TA 4ZL8A 3RDWA 5ECHB 5F07A 3HHVA 2VL2C 4FH8A 3TKQA 3W6GA 3UEMA 4LMVA 1N2AA 1Q4JA 2KHPA 1JZRA 3IOSA 3AY8A 4EL1A 1XWCA 1HNCA 3DMLA 4WBRD 3MNGA 17GSA 1TJDA 4NHWA 4OMVA 1Y25A 4XRAA 1YKCA 3DVWA 2E2GA 3D21A 2V1MA 4HJ2A 5ECSA 3TRPA 2DBCA 3GUSA 3H4KA 2O87A 3HKRA 5IPHA 1O6JA 3A3TA 3MSZA 1QQ2A 1U6TA 2CVDA 4J56E 3SWLA 1XOAA 1GSFA 4H86A 3VFIA 2GQLA 4DVCA 3D0ZA 1Z7RA 3HA9A 2PMTA 4LL1B 1A8LA 4LLRA 3F4SA 1O7UA 4JR4A 1WMJA 3ZYWA 2AAWA 4POKA 1G6WA 1YF0A 1RQMA 4YAPA 4JZQA 3CRTA 2RIIA 3F0IA 1QMVA 4GXZA 3CBUA 3GL5A 4BA7A 2DJJA 5DQYA 4AJ7A 3KP8A 2GSQA 2OE3A 2R2JA 1K0CA 1F2EA 1H75A 2H1BA 1AAZA 4GSNA 2GQMA 3KTLA 1F3BA 3D5JA 4HU9A 2C1YA 2GTUA 4GSSA 1ERUA 2GGTA 3G9BA 1EP8A 5ECLB 1M9AA 2KP2A 2JL4A 1R5PA 1B48A 1GSSA 3N9JA 4TXOA 1PKWA 4OWYA 2N5AA 2CAIA 3CTGA 3WD6A 4K6XA 4BL7A 2KP1A 4PQ1A 3EE2A 4MMMA 2FWHA 2PERA 2E0QA 4ZBAA 3TJGA 1GSDA 3LYPA 2RLIA 2OBKA 3TJBA 4WKWA 3KD0A 4F9ZA 2FWFA 1TTZA 2OE0A 1E6BA 1O73A 1RK4A 3MAKA 1YY7A 4OD7A 4FO5A 3UVHA 3CSHA 4EF0A 1MTCA 1YZXA 1FW1A 4ML1A 1WPIA 3UIWA 4IP1A 1Y6EA 4QQ7A 5ECKB 4LA1A 4O92A 3PR8A 2OACA 1KBNA 2V2GA 2ALBA 2G2QA 5ECQB 4JBBA 1NW2A 4G2EA 4L8EA 6GSWA 3M9JA 2ZNMA 3FR9A 3A2XA 4ZILA 2HRNA 3E3EA 1IYHA 5JCWA 2C0FA 3JCML 5E59A 1MDKA 2CVBA 2H0HA 1U3AA 1X9MB 3WGXA 4DSQA 1O8XA 1K0OA 1SYRA 1K3YA 2L4QA 5EPFA 3QDNA 5F8BA 3CSIA 2IWTA 1BX9A 3UVTA 5ELAA 2V32A 1J08A 1WOUA 2GVPA 3BBYA 4HS1A 5FHIA 1O81A 1M0UA 1ACVA 4JR6A 1TK0B 5ECOB 1E2YA 2LV3A 5D9XA 2HZEB 4MZBA 4F2IA 3DD3A 2BMXA 3LXZA 2LRTA 1B4PA 3C73A 1NHOA 3UOMA 2A2SA 2R5GA 4MZCA 3HDCA 3RAZA 3U6VA 1SL1B 3HJOA 1W4VA 4PURA 1XWGA 2PVOC 1ERWA 4YH2A 4MH2A 4N0VA 4I5QA 3H93A 3FW2A 3HVVA 1GTIA 1VGLA 1Z6MA 4TR3A 3F63A 3IK9A 5AIXA 2YNXA 5D9TA 3L9UA 5ID2B 5HR2A 1GL8A 2R6KA 5B6MA 4OCEA 5EL8A 3NOFA 3FKFA 1GNEA 4ZL9A 1T7PB 2LKUA 3ZZXA 4IQ1A 1SL0B 4HQSA 5COHA 3SBCA 4K2DA 3ZVJA 1QGVA 2B5EA 4J57E 3W8JA 2XHFA 1OYJA 4PX1A 1QUWA 4NV2A 2H70A 2LEGA 1OKTA 3VK9A 3EVIA 3KGKA 2JSYA 5JCGA 2K8SA 1Z7PA 2C0DA 1VF3A 1GP1A 2WDUA 4XRDA 4YQVA 1JLVA 1M2AA 5GAPD 4LMWA 4ZBBA 2KLXA 2H8LA 4K7NA 4ZBDA 5CRDA 5IMVA 2CVKA 2CX4A 3KMNA 8GSSA 3KEBA 1BG5A 3QR6A 2FD3A 2IMEA 1SENA 1G7OA 2XPEA 5J9BA 2K18A 1N8JA 1JLWA 2P31A 1VRSD 5ECPB 5B7CA 1AQVA 3VPQA 2QGVA 3GH6A 4KUNA 5ECIB 3DXBA 3IA1A 5IM9A 2FCHA 4CDOA 3G7YA 4EVMA 3G7JA 2REMA 1FHEA 4D73B 3CTFA 4NAXA 5IIZA 1TI1A 2L5LA 1YDKA 3UARA 1YQ1A 2CX3A 2WS2A 3D4MA 1XW5A 1RW1A 1XWAA 2F8FA 1THOA 4KSMA 2B5YA 2HZFA 2YWOA 4KGIA 1M2DA 4NXIA 2JADA 2B1KA 1O85A 2EIOA 3ZLPA 3EINA 3TKSC 1XOBA 3LWAA 5B6NA 5G31A 1A2JA 5IOXA 2DJ3A 4GCIA 4V2NA 1FG4A 5KN3A 2LNSA 4GSTA 1DE1A 2O85A 4PNGA 4PNFA 2GT5A 4WXTA 1SKRB 4RI6A 5KN0A 19GSA 4ZXGA 2N5FA 5A5KA 3HCZA 1XWKA 1PD21 3IK7A 4GTUA 2M72A 3ED3A 1GSQA 1X5DA 3GYKA 4K8MA 3G7IA 3HJMA 4MPFA 5IPGA 2F8AA 4IBPA 4F03A 1K0DA 1S3DA 5IMCA 4ILFA 6GSYA 1AQWA 2N5BA 3EWLA 1TU7A 4MLYA 3HYPA 3ZL5A 1GULA 3NZNA 1X5CA 4TR1A 4K1FA 5B8AA 2I4AA 3A2WA 4BVXA 1EP7A 3FR3A 4MJBA 4OFTA 3TKRA 2GLRA 5CREA 3UBKA 4E8HA 5IMAA 4PUFC 5IO0A 1X9WB 4KW6A 3LXTA 4NMUA 5DJMA 5CAXA 3EMXA 4WR5A 2GDRA 5IOWA 4EXJA 3TJJA 5JWRB 3GHAA 1ZYQB 4JRRA 1NM3A 3ZIJA 4KA0A 1GTUA 2H0GA 2WB9A 4MH3A 5FT3A 1Z6NA 2R37A 1THXA 2FHEA 1XPVA 2X64A 3KZQA 2GSSA 1KTEA 1PGTA 4AF2A 2H1DA 1QXHA 1EOHA 4ML6A 5CP1A 5HFIA 5LCZA 3MWHA 4EUYA 5G5FA 2FWEA 2VLUA 3WT2A 3P2AA 3RPPA 5ELGA 2HYXA 3VI7A 5L71A 1AW9A 1ZGNA 5AN1A 2P0GA 3TGZA 1PMTA 2HRFA 2MMZA 4EE0A 2O89A 5CRGA 1A24A 1K0BA 5KEJA 4K7OA 2IN3A 4GWRA 2PBJA 2F51A 1HNBA 1BJXA 2JACA 2MBTA 3FYGA 4IP6A 3VWXA 2YP6A 4KDYA 1KNGA 2C0EA 1LU4A 4IN0A 2H1GA 1J0FA 2YV7A 1WIKA 3C1RA 4AJ8A 2Z9SA 4HJMA 3LQ7A 4K9ZA 2L6CA 1AIUA 2YCDA 3DYRA 4PUAA 2BTOT 2YJHA 1GTBA 4V1Ap 5G5EA 2ES7A 1F3AA 4IJ3A 1SD9A 4TRXA 4ULXA 3VLNA 1U87A 3D22A 4AJ6A 3BCKA 5DCGA 2PUKC 1UA5A 3UMAA 3V1WA 5D73A 2H01A 2B5XA 4K0GA 3Q6OA 3ERFA 2FGXA 2PWJA 5GSTA 6GSSA 3M8NA 2CV4A 1G7EA 3DRNA 3N5OA 1ZCPA 1WRYA 3ZMLA 1X9SB 3I43A 4KE3A 1OE8A 1O8WA 1TP9A 1K0MA 2AYTA 2DJKA 2X8HA 2WULA 4WBJA 1A2LA 3GFKA 1URMA 3H1NA 3ISOA 3C7MA 2VAFA 2C0GA 5AGYA 3F3QA 2VL3A 2VL9A 4O7HA 2X99A 3Q18A 1TXXA 4TKYA 9GSSA 3ME7A 3ERGA 2DSAA 4L5OA 4X43A 4L0UA 3F4RA 2QSIA 3P8WA 1OC8A 1U88A 3IAS2 4POLA 3CYNA 5DDLA 1FVKA 2NDOA 3VWWA 4BWQA 2VUPA 3Q74A 3TOTA 3QAVA 2B6MA 2IMKA 3TRQA 1SD8A 4N11A 2XBQA 2VCWA 5D8IA 2OBIA 2VCXA 2CZ2A 4NHZA 1ZOFA 3LFLA 3FZAA 1FB6A 2L6DA 5A4WA 3US3A 2L59A 1BEDA 4QL9A 3QPMA 4GLTA 4EO3A 2TRCP 4XIHA 5G1KA 2TRXA 5J5NA 5C04A 3HZ8A 4FYBA 2KOKA 1PRXA 2LRCA 3KMOA 3LEFA 1ML6A 5INYA 3ERWA 4FIWA 1EZKA 2NPBA 3I69A 5EVOA 1Q98A 1A0RP 4KB3A 3F6FA 1SJIA 1H4OA 3M0FA 2LJKA 1EV4A 2YANA 4I6XA 3BJ5A 1EV9A 3IRAA 4Q5QA 2GZZA 3APQA 3PINA 2MMOA 2YV9A 1SJ6A 2IJYA 1EWXA 4ECBA 5DAKB 3C8EA 5HFGA 4MABA 2IMIA 1GSUA 4G10A 4NV5A 2H66A 2ZCTA 4QL7A 2TIRA 3MDKA 1DSBA 1ZZYA 1SU9A 5ECMB 2GS3A 3QFAC 2DJ0A 3TUEA 3TKPA 1Z9HA 1XVQA 2CAQA 4MF7A 2DC5A 5A4VA 3GURA 5GAND 1NSWA 3GX8A 2J23A 1YEXA 1K0NA 3QOUA 2H76A 2H30A 4ECCA 4CHSA 3S9FA 2P5QA 4I8BA 2MBSA 4GQCA 1XVWA 3DWVA 2YWNA 3LSZA 1HQOA 5J9CA 2DIYA 2XC2A 4Z7XA 1OC9B 1ERVA 3KH7A 4IS0A 1PL2A 1XZOA 1TK8B 2NBSA 1YF1A 2DIZA 5ABRA 3RHBA 5KN1A 4GQFA 2H6YA 4OO4A 4WEYA 3GN3A 2EIQA 4GF0A 1VF4A 4TN8A 4P3YB 1YJ6A 2FNOA 2QC7A 1M7TA 3OR5A 2C4JA 1GH2A 5G30A 4XHMA 2R4VA 3GSSA 5DALB 5H5SA 1U3IA 4HI7A 2HZEA 2F3MA 3E9JB 2AJQB 4Q5FA 1HNAA 4ECIA 2LJRA 3ZTLA 1TOFA 1ZYEA 3EU3A 4MJCA 1W89A 4BPYA 4GRFA 2C3NA 2I81A 4L0WA 3DIEA 5DJLA 1ILOA 2H72A 10GSA 3M9KA 2XBIA 5HQPA 1R4WA 4ZB8A 1MD3A 2H1AA 3NIVA 5ID2A 2MMNA 4RQXA 5CRWA 5D93A 2HSHA 1MD4A 1X0RA 2VCTA 4WR4A 3TDGA 5J4UA 2JZRA 4YQMA 5H5RA 1ZL9A 1AUCA 1CQHA 2I9HA 1WJKA 4ZB9A 4I2UA 1JZOA 1VF1A 3PGTA 4DSRA 11GSA 12GSA 5H5QA 3TCOA 3K8NA 2IMDA 1ERTA 1K3LA 2BJXA 1WP0A 2RM5A 1JHBA 1TW9A 4JEDA 3UL3A 4JU5A 4F0BA 3O76A 2YZUA 4LL4B 3H8QA 5HR3A 5CYYA 4HU7A 4X0XA 3GKNA 4IELA 4PXOA 2I1UA 1FO5A 1LJRA 4ID0A 3O3TA 3TRXA 3L9VA 3KXOA 4XS6A 3D6IA 2VD1A 2HFDA 2VCVA 4ZIJA 4KH7A 4KDUA 4DEJA 2B1LA 4HZ2A 2EIRA 1TDIA 1S3AA 4ZL7A 3L9SA 3BCIA 2DLXA 3QD9A 5ENUA 3EMPA 1JZDA 4HOJA 1EEJA 3C1SA 2B7KA 2GSRA 1BYEA 4D73A 2LS5A 6GSTA 3KH9A 2GSTA 1G0TA 3GRXA 5HFKA 4RUVA 2VLTA 4O5RA 2K6VA 3F9UA 2B7JA 2QKEA 2JSZA 2GZYA 5F06A 3QFBC 3L4NA 3DKSA 1TRVA 1USBA 1GLQA 2VL2A 4TR4A 4N30A 2IMFA 2HI7A 2K9FA 1EGRA 2JZSA 3GV1A 3FHKA 2KUCA 1XCCA 1GSYA 1WE0A 3LJRA 1SKSB 4POMA 4AGSA 3GNJA 2WCIA 2C8UA 5E4WA 4FYUA 1TI3A 3PH9A 3P7XA 1QK8A 2V6OA 4TXOB 1XW9A 2LTKA 2DJ2A 3FZ4A 1BAYA 3QCPA 2HXKA 3IV4A 4MPGA 2ON5A 2YZHA 2GQKA 2OKAA 3VWVA 1OVNA 1ST9A 3J7Yb 4MA9A 2VD0A 5DCHA 5J41A 2FA8A 5LD0A 4XS4B 4N10A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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